XLOC_004727 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004727
Unique NameXLOC_004727
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000085:89302..110642-

Legend: gene
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CGGCCTTAAACCAACTAACTAAGTTTTTCGACTTTAAAAGCTTTCCGATA GTCGAATCTTCCAAAGTGATGTAGATTCTAGGGGGGGGGGCGTACGGGTT TGACGGTGTAACGGTATTAACCCTTTTTTCTATCGGTGTTTCGGTGTTTG AAGAAAAAAGTGACGGTATTTCGGTGTCAAACATGCCATGCGGTGACAAA ATTAAGGAATTTACCAAACTTTGCTGTCGGTGTTGACGGTAATCCAAGAA ATATGCGTCGGTATTTCGGTGTCTGCGACCCCCGTACGCCCCCCTCTTCT AGTTACCTTTGATGAATTAAGTTGATTGGAGCAAAATTTGATCGAATTCA TAGCAAAGCTTAAGATCTCTTTGAAAAGACTTAATCTTCCTTTCAGGTGA ATTCTGCAGGAATAGTGATGAATGGTACAGCAGAATCAACTCCTCTTCAA GATTACGATTTACAAATGAACATCAACGTCCGGTATCAGTTTTTCATTGT ATAGTGAAAGTGAAAGTTATTATTTTTTACTTTTTTTTAAAGCTATAAAT AATCCGATTGAGGGGCTAAGATATGGAAGAACTTGCTGCTGGCGGGAGTC AATGGTTATTTTCTATTTTCTATTGGACATCATTACAGGCAAAGTGATTA ATCGATCTTCTAACTCTCTCACTTCATTCCATTTCAGGTCAATTTTTTAT TTGACGAAATTGGCCATCCCTCATTTGATTAGAAGTAAAGGTATCAAAAC TGCCAAAAATCTTCCATCTTACTCAGTTCACGAGTCTTATCGTCTACGAG AAAAAACTTGGACCGATGGTTTAAAAACGATTGTTTTCTTCTTCAGGAAA TATTGTGAATGTATCAAGTGTTACAGGATTACGTTCGGTGAGAAATTTAA CATTTCCTTCAAAGCAAAGCACTGAATCGCACGAATCCTTAATATCTGTG CATGTTCACAAAAAAGTAACCTTCAAATGTTAAGATTACAAATGCGAATA ACATTTGATAGAGTTTGAATGATATTGCTATTTTGTACCCATTGAAAAGA TCATCGTGGATGGAATATTATCATGTGGCATTTTTGGAGTGATCCAAATT TCTTCACTTTCAGTTCTCTTTCAGTTTTGATTCTCCTCGTGAATCTTTTT TTTTGAATGAGCACAAAATCCCAGACTAACCCGCACTAAATTATTCGTCG CATTTGTTATTTGAATGACAGCTGTACTTTAGTCTAATATTATGTTATAC CAGGTTATGCATGATGTTAACGATTGAAGTCAGATTTTTACCTAATACAA ATTTTGTTAAATTTTTATCAGTTCCCTGGTGCTTCAACATAATTGCATGT CAAAAGCAGCAATTGATCAATACACAAGAACAACAGCTTTGGAGCTTGCA CCACACCAAGTCAGATGTAATGCAGTCAATCCTGGAGTCATTGTAACACA ACTCCATAGAAGAGCTGGAATGTCGGAAGAGGACTACCAGAAGGTTTGTC GAAATGTGTCGAAAAAAACTTGACACTGTCTTCTCAGAAATTAGTATGGA TTTTAAGTAAAACAAACTTTTGATGAAGACTTAGTTGCATTAGCTTACCT CTGTTGCATAAGTACAGTAATCAAAATTTTTATTTCTTTGACATTACAGC ATTGACCAAAATCAGTAATTTCAGAATTGGCTTTTACGGAGACTGTAATA TTCAAAACAATAGAACCACCATCGTTATTTTCACGAGGATAAGAAAACAA AAATTCAAAACTGCATTACGAGGATAGGGATCAAGTTAATTTTTTTCATT CTCCATTTTATTGCAGTTTCTAATAAAATGTCAGTCAACACATGCATTGG GACGTGCTGGCAATGTTGATGAAGTAGCATCGGTCATTGCATTCCTGGCT TCAGATAGTGCTTCGTTCGTCACTGGTGCAACCATTCCTGTGGATGGTGG AAGACATGCTATGTGTCCAAGATGAGGAGCATTTGAAGATTTGTTTGTAC AAAATGAAAAAGTGACATATTTCTTCTTGAGGAAGCTGCAAAGCTTCCAA TTCGAGTACTTTTATTAATTTGTAGGAGGTGGACTGTTTCGACATATTTC TTCTTGAGGGAGCTTGAAACTTTTAAGTTCAAGTACTTTATTGATTTTGT AGAAGTGAATTATGGATGTGACTCAATGGCTCAAGGAACCTAAATTGGGA GAATTTTTGGAGACGAAATTTTAATGTTTCATATTATTGAAGCTATAGTT TTTTATGTAATATGTAGTTTTTTTTTTTAATTTTGATAATTTATTTAAAG ATTTGACATTGGAAAATAAACAATAGAAAAATAAACTAGAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008446TCONS_00008446Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008445TCONS_00008445Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008444TCONS_00008444Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008443TCONS_00008443Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008442TCONS_00008442Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008441TCONS_00008441Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008440TCONS_00008440Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008442-proteinTCONS_00008442-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000085supercontigsc0000085:89302..110642 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
138.13 143.8 86.09 72.01 21.61 16.62 32.1 30.74 38.42 42.03 35.64 43.92 41.85 47.42 52.67 60.73 52.7 55.32 22.16 23.45 35.99 37.98 70.89 64.32 45.83 51.86 47.02 43 48.35 41.86