XLOC_004515 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004515
Unique NameXLOC_004515
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000081:634887..712121+

Legend: gene
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>XLOC_004515 ID=XLOC_004515|Name=XLOC_004515|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=77235bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081:634887..712121+ (Clytia hemisphaerica)
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TGGAACGCATATATATTTTATTGAGAATTAGCAGGTATTTTGTTGATAAA AGGCAACGGGTAAAGACACATTCTAGTATGGCTAGATAACGGTCTTGAGT GTTTTTATTCCTGAGTAGCAGTATATTTTTGTGCTAAAGATTTGTTGGTC CGTTCAATAGAGACGGTGCATGAACACTGCTCAATGAAGGTTGTTTGAGT TCTTTTCAACTGGGATTGCTCATTTTAGCTCAGCAAGCGTCCCGTGTTTA GGTATTGAAGTGGCAATTTTGTTTATCAATCTGTATGGCTCTTTCTAGAA AACTGGCGCCTTGCCTCTTATCATATCATTTGAAAGATAATTACTAATGA TTGGTGCCAAAATATAGCTGTTGGAATCTGCCTAGAGAACGTTCTCAAAT AATCTAAGAAAGTGTTATCTGCTACTACTGCTATTTTCTAATACAAGTGT TTTCTATGAcgaatttttgtgtttttttttgtatattgAGCTAATACTGT ATTTTGGGTGTCGGAATTGGGTTTTGTACCATGTGGGCTTTGATCAGCTT TTTCTCTCCGTTGACAAAAAGGACTCAAGTCATACGACGAGTAACCATTA AAAATCATAATTGAATTATCAACCTAAATATTTGAATGATCTTAAGAATT TAGATACATACAATATACATAACTATGAGTGATCGGCCTTCTATAAAAAC CATTTTGGACTTGACTTATCGCAAGGAAATATATCTTGATAGTGTTAAAA TGTTGAACAAGTAGAATTATATAAGGGCAGTGATAACTTCCTGgatttat cgaaaaatttaatCCTCAAATACTTTGAATCCCATGGCGATCTTTCATCT TGGAAGACTCAGCTTTGATCAGGAAATCTTAACTTCTTTGTGACACTGTT TCCTCAAATGTATGTATGTGTGTGAGCGATAATCATTTTCATCAGTCTTT GAAAATAACTAAGCCGATGTTATTGAAAGTCTTTAAAAGCACATTTTTTT CAGAGATTTGTCATACTTGAGGGTTGTTCAGAGACCTAAGATTCAAATTC TGAATCTTCACTCCACTGCCAAACTGATGTTATTGAAAgtctttataagc acattttTTCGGAGATCTGTCATGGTCATACTTAAAGATTCGTTCGGAGa cctcaaaaatttgaaaattttgaatcttcacttttcgattttaaagctta taaatttgaaaacagtgGTGAAAGTTTTGGAAGCACTTGTGTAACGTTTT GAACAGAGATTTTGGTTTCCATCGAaagaataaaattttcttttcaaaac tttttttttttatttatctatAATAGGTTCTAAACGAAACAAATATACAA ACACTAAAGGTTCCTAGCCTCCCAGCCTCCCGCTAAAAAACCCTTTTCAA AACTCTTTGATTATCCTCTACATGTGCTTCTGGATTTTAGTAAGAGTAGA TATTCATAATTAGGATTCATGGAGTTTAACAACGAAAGTATTTTCAAGGC TTGATAATCCATCACTTCATgcaatgaaaagaaaactggcCACGAGCCCA TTCAACTGATCCCACTGCGTTTtggaattcaaattttttaatttactttt tcttCCAATGTACATTTTAgtttcgaattttcttttttaatctcAAAAGA GAGAAGTAGagaacgtgtattttttattgtaattttttatgtaaaaaacc CTTTACAGTATTCTAATAATGCACGTAAATTTGATGGTATGAGGTTGAAA ACAATAAgagttacatgttttttaagCTGTCAAACATTATTTATACATGT TATGGTTATTTTATtatcttttcactttttttacatGTTCTGTACGTGAC GTCAACTTAAAACATGATATGATTGACTTACTTTTACTCCTCTTTCAATC ATTCACTTCTGTAAAAGTGACTTGAGTCTGGCTTAAATGAATTCATTCAC AGTAATGTTTTTACTATATgtaaagaaataagaatttctgtccaactata ttcactcaggagatttgggtggcagagcagcatatgcatttagtccttat taggactcgtcagcactgcattcatactgcaccctggctggCTAGATCGA TTTATTTAGATGGAAGATGAATTCCTTATTTTAGTAGCTCTTTAAATAGG ATATGGAGTCTTTTTTTCTGCTCAAGACTGAGGACCTAATGAAGTGTAAC TCTTGGCAACTAAAGCATGATCTTGCATGGAAGAATTTATACTTCTTATG TATTCTTTGGGTAAACTTGAGTATTGGTGGTATATGGTAAACATATGGCT GCTGGTGATGGAGATTTTAAAAGGCTTGGTTGGTTTTCATGGTTTTTATT GTGCACTTTGCGTTTTGGCTCAGCCAGGTCTTACTTTTACAAAGTTTACa gttttaataattttcaagtAGTCTACGTAAATTCTACGTTGGAAAGTTAG TCGATAATGAAAAGTGTTAAGATACATAGCAGCAAGAAACAAATTAGTGA GAACGTTGTTTGTCATTTGATctcattatttgattgacaggaAACTCACC TCACTTCGTAAATTTAGTTCATTCTTTTCTCTAACTTTGTgagtttttga gcactttcaaatGGTGTATTccttatatatatttttggttttttggtgGG ATCGGAAAGTTTACTTGTGTGACTCCTAttttgacgttttgttttttctt tcgtATTTACATTTCGTTGtcgaaaaaatgaattttctgcCCATTCCTGT CTCTGTTTACTGTTTATGATAGTTATTTGGAATGAATTGAATGCAAGAGC TTGAGGCCCCCTCTTTCCATACATTCTATTTCGTGAGCATATTACAGAAG TTCATTTCCATTCCATAAAATCTGATGGCAACTTAAGTCACCTAAGACAC GTTTGAAACAAATCtctaaatgtttttcttttgtacTGCAAGGACAGGCT TTTGTAATcgcaaaaatctttgaaataaaagatATGTTATTaagtaaaaa gttttgtataCATACCATCTGGGatatttatttgcttgttttcaattttc ttgatttcaatTGTTCACTATCCAACCTAAAGTTTAAGGAAAATGACCAT TACTTCaacatttgcaaaattttgatcctaatttaattttttttttgcga taCTGAGGTATATTTGAAATTGTACCACGAGTAAAAACTAAttagtcaaa attggtcaaaacggtggtttttgttattttgccatCATTTGTTGTtggaa atatttcattttttcaagattaTACGTAACACTTTGGAACGTTTACTTTC ACAACTGATACTGATCTTACCTACCCATACTTGGAGTTCTTCCATTTCTT CTATTTCCCCTTTTTTTGGTATTTGTCTTAATCTCTGTTTTTTACCATAA TGCtctatacctgaaaaaaaatgtttcaaatgttATTGATGAGTGTTATC GTTTTCGCAGAAAAAAAGAAGGCACAGATTGGGAAAACTCCAATAGATTT TCTAGTTTGAAGAACTTTGTTTTCTAAAAATCACACCTTGACCAGTTTTT TTTGCCTGTTTATGCTGCATGGGAGGTTTGATAAAACATTTCTGATgaca aatttcaataaaatactTTAACATAATAGTTCATACAAAAAAACATCAAC ACCTGATAAACTAGGAGCATTTAACTGTCAAACAATCTATGATCAACCAA AGTGACTTTTGTACTAAAGTACCAAAAATCTGATTGCCAGATGCAAACTA CTTAAAAGGAGAATACAATCAATTCTTGGCTATCATTGGCTAAATGGGAT ACTTGAGAATGAGACAGAAAATTGTAGCACGTAAAGCCATTACTCCACCT GCTGACGAATTTGAAGGTAAGTTTGACCATGGTTAAATACTATCATTTGA AGATCAATAAGAAGAATAGGTCTACTATTACTTGTTGGATGTAGTCTTAA TTTGGAATTACTAAATTTTCGATGATTGTTTTTATGGCCTTCTACATCGG TGCTATTGATATCTAAATGTTGATAACCCTCGGGAATTcagtttaaaaag aaatacgGAAGAGAGGATACCAGGGACACATATTTCTTCTTGATTTGAAA AAGTATGGGAAATCCTGTTATATAAAGAACTCTACCATTTTTATAGATAT TGGACTCATTCTAAAAGGAATTTAAAGTGTTTTAGTGTCAGGACGAAATT ACTTGTTACCCTTGTAATTTGATTGCTGGTATTTTTCTATAAACTCTTAT TATTATTAGGTTAGTTTAATTATGATAATTAGTAAGTCAAAAAGGTTGAA TCCCTGATaataaagtatttttttctataCGATTCTTTGATCCATCTGTA GATTTTTAAGTCTTTTATCTAAGGCGCCTTAAAATGCCTGTTATCCGATT TACTTGGCTGTCAAAAGGCCAAATAAATCGGCACAGGATACAGCATCCAA TTAGAGTAATTAGTAGTTAATGAGGCACCTTTTGAAATTCACTTAATCTC GTATCCTGATCTGCCCTTTGAAAATCGATttatgtttgttttgttttttc agatAGCCTGATTTTAAGTCTCAAGGGGTCTTTTTACCGGGGCAGGGGAA GGGATAAAGatttcgctttcgctttcgaatatttttactttcatGTTTCC TTTTGTGAAATTAGCCCATCATCGAAAATGAATCATCGTGAAGATGAATT CCCAAAGTTAATTTTCTCCGAAGTGTAATATGGGTTTGGCTTTGTCAACC AAAGGCTCATATCTCGACTTATTAGGGCAAGTCAATCAGACGTTAGGGTG GCAAGCAGAGATAACGCTTAAGAAACGAAATATAGAGTAAAATAGATTCC CCTGAATTAACAGTGTTCTACATCTGCATATTATTTGAACGTCATTTTCC TGCTTGGCATTAAACAGGCAGTAATGTTCTCTAAAGAGTTCGTTGATTTA TTGCAAATGCAAAAAAATGAATGTCCTACGGCGACCTGGGAAACGACAAG GTGCTTGAAaccacaaaaagaaaaatctaatAAACGAGAGGtgattaaat tttgcaaattaCATCGTTTTTCTATTTGGTACAAGCTGATTAAGTGGTTA AGATGTAATTGGATCTACTCTAACATGACATTCTGTGCCAGGGggtaatg aaaaaaatttgtttggaagatacaagaaaaacagtttttgtttgaattca aAAGAGATTATGTCCGAGTATAGAGTTTAATTAACAAAATTAAATCTTGG AAGCATTTGAGGAGGCCCTACTAATCgttatttcttttgaaagggCTAAA ATACCTTGATTAATTAATCGAATTATTAAAATGTAGAGCTCGTTGATATT GCTatataattaataaaaatatgGCTTCCTTTTtgaatcaaaatggtagc tttTAATGCTCTCTCAGCAGTCCCCCTAAGCGTTTTCCTGTTTGGATGTG AAACTCTTAAAATCCATTCTGGCACAATTTCTAACAACATGAGCGACcat tcaaaagaatttttcttcaaaatggaGACTGACCTAGAATGGCGAAATTC TAAACACAGCATGACCTAGTATATAAAGCCTTTATAACTGTTGAGTGCCT CCGGAAGGAAAAGCTTGACTCTGATCCAAAGAGCAAATCCTTTTAGAATC AAACCAATCACAAGCGATGGTTTACTACGGTAATACAAGGTAGAATGGAA ATAGAAACTGAGTCAGTTGAACTCGGATTCGATTGTCGTTTTcaataatg ggctcttccagaaaaaaaccattcatgggggaggggggggctggaggata tattgtccccctttgaaaaaaccctgaaaaactgccatggGGTGAATCTg cgatgtccaggggtaaatattTGTGTCCAGGGGGGTCAATTTGATGCTTA TCCAGGGGCAAaacgtgtccagggggtgaaaaatcgaaatgtccaggggg tagaTCACAGACAAAATAACATATTCTCCACCCCCATGAACGAATTCTTT CTGGAAGGGCCCAATTCTGAGTAAAATACACtcattttttgataagcata cgggaaaatcgggTCGATGCTTaggaaaatctcattttcagccataattt atgcttatttatatgcttagacTTTAATTTCTTGCTTTTCTTTGGGTTCa tgataatttcaaattttatagtCGGAACATTGATTTGGTTCAAAAAAGta agttttctttgtaatttggtGTCGCAGGCAAAAACctttggtctaagaaa gctaaaacagccttaaaagtaaccctaaaaaggtcagcgttttagaaaag ctgcatGCTTTTTACCGAAattgagcctaagtatgctttataaacgttat gcttataaaaagaaaagagtgTAGACCATTAAATTTCAACTGAATGAACA ATTTAATAACACATCagaaatagaaattcaaatttgagaACTAACAGTTT CACCTTTGCAGAATCATCAGCGAAAAAAACTTGCACTTAAAAATTTGAGG CTTAAAGCCCAAAAAGTCATCCGAAGACTTGAGACCTTTGACGTTCTCAT AGAaggaaaaatgtataaaaaggCAAAACAAACACTCCTTAAGGTGAAGc gtaaatctttaatttttctttgcttCAGATGAGGAGAACGAGGAAGGAGG AGAGCCAGACCTCCACCAGTGTGGACATTGTCGACAAATGTTTTTTAACT TCACCAAATACATCACACACAAATTACAAAAAGCCTGTTGGAACAGTGAC GAACAACCTACACCCACAAATGAGGACGAGGAGGGCGAGACACCGCCCTG GCCGCCCTCTGCAGCTGCAGGCAAAGATGGGAACGGAATCGCCTCGCCAC CCGGCGATGAATCAGGGGTTATTGAAGATACGGAGGATATGGAGACAGAG GTGACTGTGAGTGCTTTTTTTAGCTTGAATATGGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008012TCONS_00008012Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008013TCONS_00008013Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008014TCONS_00008014Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008015TCONS_00008015Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008016TCONS_00008016Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008017TCONS_00008017Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008018TCONS_00008018Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008012-proteinTCONS_00008012-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000081supercontigsc0000081:634887..712121 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.16 1.94 0.9 1.83 64.62 46.57 79.89 94.21 27.48 45.11 25.48 21.56 22.82 18.06 5.6 9.26 56.41 57.65 10.03 9.92 30.99 29.37 4.34 4.36 9.19 6.78 2.09 0.51 4.51 6.14