|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000076:55122..67467+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_004142 ID=XLOC_004142|Name=XLOC_004142|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12346bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076:55122..67467+ (Clytia hemisphaerica) CACTCGTGGGAAAGTCGCTCACACCACACACCTGGATGCCTTTATTAAGA
ATATGATTTTTGGCCTGCCTGAGGAAGTTTCTTGCACCTAAGAGTAACTA
TCTACTTTAAATCCAAAGCATGCCTATTTAATTATGGGATTAAATTTGCT
ATTCATAACATTCATGTTGTTGCCATTAAAAggtaagatttttttgtttt
ttttctttatttttatttgattccagaaaaaaagtttactCTTGTCAGGA
GAATTCACTTTCAGCACTACAAAGTGGCATTCGAGTCATCAGGTTCCACA
TAGACCCTTCTGTATCTCAATGGTAGAGACAATATCTGGGAATGCCCTAT
Tttcatttgttgttgttgttgttctttaggttgcaccatttgtaattagg
cttctaaacttggtgtcccttccttcgggtaaatatatgttttgaattga
aaaaaattgaattgagtCTCGCTCAAGCCAATCTGGAAAGTAAGGCATGT
ACGCCGGATATCTCTGGCGCAGACTTTTGGATTTCATAGGCTTACACAAA
GGCTATCTCTGGCgtaaatattcttttctttCCAGACTGGCAGGATTTTA
AAAATTCATCTACGCAATCAGAAACAAatcgctaccttaattcaaaaggg
gcctaagtccaggtaccccccagttcaaaaggggcctaagtccaggtacc
ccccagttcaaaaggggcctaagtccatttttatgaaatttgagatcttt
agtttttctcaatctctggCTCTTGCTCTCTTTTGATGTACATAACAAGt
agtttttaaagttaaaaaggttCAAAACTTCATACTGAAGCTCTGANttc
aaaaggggcctaagtccaggtaccccccagttcaaaaggggcctaagtcc
atttttatgaaatttgagatctttagtttttctcaatctctggttcattt
gctctcttttgatgtacataacaagtagtttttaaagttaaaaaggttca
aaatttcatactgaagctctgataaaagtgatgtttagttcaaaagaggc
ctaagtccatcatctttttacaattaagggcctaagtccatcaacttttt
acaataaaaaggcctaagtccaccaaaataagtttgttAAGNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAAAGTTTAattgagtttttctttatttt
actgagattgtcttttctctttatcttgAATCTAGGTGTAAGTGGTTTTA
TTTTGGAGTGTCATATGTGTAGGTTTTGAACTCTAAAAGGCAGAAATTAA
CCCTTAcgcgtttttcaaaattcatgtttaattcaaaaaaggcctaagtc
cactcTGCAAGATTTACTAAGTTGCACCTGTTACATACAAAAATACATAC
CTTTCAAACGAATGCCTTTTCATTGGAAAAACAGCTTATAGCTAtggctt
tcagaaaacatttacttcaaagctttaccatcaaaaatggtttcagaatc
aaggaaaaactttaattgcaattttctcaaaatgaccataatggacttag
gccccttttgaattaaggctcACAGGACTTAGGCCACTTCTGAATTAAGG
TAGCGAAATGaggtttttttaaatgattgacTTACTAGCTAGTTAAACAG
TCACgaaaatccttgcatttgcacaggGTTCGACATGCAGCAAATGCAAC
GGGTTGAAAACtaaagtgacgaaaaaaacCCGTGCAAATACACACTAGAT
CACTGCGACCCGTTGCATTTACACAGAGTGGAAAAATGTTACACTTGATT
ATAAAAATatgaacagatcaaaattttaacctgtagacaaaaattttcta
aaaaggcttaaagaatcttctaaagagaaaatgaaaatgccaattcGTCT
TCTTTTTAtgccattttcattttaaagttgagatttgttaattttcgcgc
attttGCCTTACacgttctagctcatttgcacagggtcggaaaaaaaccg
tgcaaatgcaaggatttccggGACTGTTAAAGATGACATTACACACTTAA
TTCAAATAACGTgcagtcgggtaacttgcatcagtggaggctaatatgca
tagccctcaaatgaatgacctggggctggtccttaaaatacaaagttaaa
tcaaaagaaaaatgatagagtagagctgcgaagCTGCGTAgctcatttgt
tttgaaattttgctgctttgattggtcagtcatttcagggctatgcatgt
tagcctccactgatgcaagttacccgacttcacggtagctGATAAGCGCG
TAATGGCACCCTTGAAAAATTCTACAATTTTAATACACCTAGGACTTACC
ATTATTAAACCCTCCTTGTTTTAAATATGTGTTTACTTCGCAGGTTTTAA
AGGAATTAtaacattttataattttttttcaaaattagcaCAACCTGGAT
TCTGGTCGTCTTCATCACCAATATTTTTATGAAGGACAAAATTTAGAGTT
TAAATCTATTGTTGACAATTTTAAAGTTTAATGTTTTAAAAGGGTGTGGT
TGTGATTTTATAATTAGCATCAATTTGATGTTATAATGTATTCCTTGGAG
ATATCTATATGTGGGTgacataaaaaaattttctcggaATGCCAGCAATA
CATGATCAACAAAAATTGGAACCAAATGGGAGgctaatatcaaaattttg
gtcttcaattaataaaattttgaacattCTTTTTTTAGTTTGGCCTCACA
AATGCATTCGATTTAGTAACAAAGTCAATCATCCTTATTGCAAAAACATT
CAAGATTGTGAACGGACTTATGAATGTAACAACCCAGAAGATTCCTGCTT
TTCACTTCTCAAATACGACATAGAAAAACAAGAATTCTCTCATGTTATCA
GTGGCTGTTCAGAAAGTgttgttttggaatcaaaagcATGCGATCATAGG
TCAAGTAAGGAACACTTGACAGAGGATTGTGTTTTGGGATTACTGGATCA
TAAGAAAGAAATCAGTCTAGAGTGTTGCTGCATTGGAGATTCTTGCAATC
AAAATCTGAACTTTTCCATGGTGAACTACACTAAGTTGAGTGGCTTAAAG
CCCCAAACTACTTCACTCACAAAGACTGGTAAGTGGAAAAATAACACAAA
CtaaattgtttctttttgttttttgcgaAAGTCTCGCAGtcagttttgtt
tattttattttcgacTTGTGCTGAGGATGATTAATTTATAATTATTTGTG
GTTGATTTAAAGGATGATGCCTGATTAAAAAcagtttaattttcttttta
caagCAATTAGAGGAGATTAAAAATGAATTGCCTCGTTCTCTTTCATGTT
ACCTTTAAATAATTGCATTCTTTTCCGTTTTTGTGGTATTATAATCATTG
TGGTGGCTAGACACACGCCGGCTCCCTGATTTGTAGCATAAATCAAAGTG
TCTGTCATAGTTAACGAGCTTCAATAAACAATTTGTTTACACATAAAATA
ACTGTTTTGTTTCTATCAATAGAAATTACTATACCATTTTTAATAGTTTG
TAAAAGCCTCAAAAAGGCATTTTTCTATTCAGTTTCTAAATTAATTCTTC
ATTTACAAACAACTCAGAGAAAACTACCCTTTCTGTTTCTGAAATTATCA
ACTTGNaaaattttgatttttggggcctggggacgagtttttcaccaaaa
cgaggctggcagcctggacacttcaaaaaaggtcggatttggctgaaact
tggcacacttgttccttgggtgaatatctgggggtgtattttttcatttt
ttgaaaattttgatttttggggcctggggacgagtttttcaccaaaacga
ggctggcagcttggagactttNtacttgcgaaatttgtaaacaaactgta
tgcagcggatacaaaatcaaaacaaatgtcacatgtcaaaataaaaaatc
aaaccaaatatgacgaattttgattgttcaattgttttacaagttttttt
tggacacgtgattttaattgttctttttaatgacacgtggttcgcgcaat
gtttacattttactactttaatgtccctttaaagtcTTAACCACTTTTGA
gattatattttgaatttgaacttttaaatatttcaaaagatttttctcaa
cttcagttgagctataatctgagaatgtctgtctgtatgtatgtatgtat
gtatgtctgtatgtccgtccgaaaactttagggcaggctggacacttcaa
aaaaggNattttaaaatcaattttcgtataTGATAAATTGtgggaaatta
atttttcagagCAACGTGTGAACAAAAGCCACAAAAGGTTTGAGGAACTT
TCTCCTAAGTTATCTATTTTTAAAGGCTCTTAGGACGAGGACACTATTCt
acaaacataaaaaaatgaaaaaattaagataaaaacaccccaggtattca
cccaaggaacaagtgtaccaaatttcagccaaaacggacaaagtttattt
gctacctaatactaaatatttgaaatgttacaattgggccttctaataac
gggaaaatctgcagttgagcccagtgcggtgcgcacgttcgactatttaa
agataaaacagaaaaatgagATGGATATCTTTACTCAGAAAAATACTAAT
CTTTTTTAGATGACCATTTTCAAAAGCAACGCAATGGAAACACTGTACAC
ATTCTAATCATCACATTGACTATAGCAATACCAATCGCTTCCATCTTGGT
CATCTACCTACTTTACAAACATATAAAACTTGACCGAACGGATTCAGTTT
CATCCGATTCCCTTCTTTCCAAGCAACCATTATTCCATAAACAAAAACAT
ATTTATCAAGGTCAATTCACCCAAGTATGGAAAGGTTATTACGAAGAACA
CGATGTTGCCATTAAATTATTTGCCTCGCCCGTTGGAGCTAAATGCTGGA
CTACAGAAAAAGATATCTACTCCATATTGAATATCCAACACCAAAATATA
TTAACATTAGTACATGCTGGAGAGACGCATGAAGACAGGCCTTACCATCA
TAACCTAGTTACTCAGTATATCGAATATGGATCTTTGTATGACTATCTAC
GAACTGTACCCATGTTGAGTTTTGAAAGCATTACTAGACTTATGACCTCC
ATGCTACAAGGAGTTGCATATTTACATCAAAACCTCCTCAATAAACCCAT
GATTGCTCATCGTGATTTGAAAAGTCAAAATGTTATGGTACGAAAAAATG
GTTCGTGTTGTATTGGCGATTTTGGTCTTGCAGTGGCGTTTCATGATGAC
AATGGGAAAAGTTTATCACTTGCTAAAACTCAGgtataattttcaattta
gcaTGTAAATCCAGTAAGTCAGACTCGTAATCTTATCAAATCTATTCAAA
TGTATAGTATAAACTCTATAAATCGATTTATTTGACACTGTGTTTTGATA
ATTTGACTTCATAGATATTGTGTCTTTTTAGGCCTCTAATTCACAAATAG
TATGAATAAAGCTCATTTCAAAGATCGATTATGGTTTATATATCTTCATG
CATTTATTAACCTAGCTTAAACACCACAGACCCTTAAAGCGTGAGGAGAT
TAGATTGGACTTAACCAAACAAGGTTAGATTAGGTAAACAGCTTGAAAAG
ATTGAAAGGAGTCATTGCATatacgtcaaaagagggcagtgcattgactt
tagacagtcAACTTTAAGTCACAATTACAATAGGTAGAAAAGTAGTCTGA
CTTGAGCTATAACTTTACAAATTTTCTCTTAGGTTGGATCAAAAATTTAC
ATGTCGCCAGAGATTTTACAAGGAGCTATTGCATATTACGCTGATGCATT
CCTACATTCTGACATGTATTCTGTCGCGTTGATACTGTGGGAAATATTGT
CACGCACCAATCAAACACCTTGTAAGTGCACAATCTTATCGGTTGCCTTT
CTCCTTTATTGTAACGACATGTGAATcgtcgttcgttcgttcgttcgttc
gttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcggccgggtcataccaaagactt
cgtacttagaaaaaagttgtactTAATGCCTCTAAGCAATTGAGAGAAGG
ATCAATGGTAAGTATAGTAATCCAGGGAGATAGAGTGGCTACCTTTACta
tcttcgggtagatagctatcgaaaaaggAGCGTTTGGGTTGTCTGTGACT
GCggttgcagacttacttactgCTAAGGCGATAGGTTATCAAACTTCATC
CTTGTATGTTACATTTCCCCACCGCGCTTAATATTTACGAATCTATTTCG
TTATTTCTCAATAtgaattcttctttttagtGAAATAGCCAATAGGCAAC
TTGCCATTTAGGAATGCATAAAGGCCCAATAGCTCTAAGTGACTagtaga
ccagcggccgaggtagtgaattgtgtcacttcgtaggacaccccttagat
cagggcaatttttttatattatgccCCTAATAGGATggagaattgacaaa
aaaaatttgcccttcaaatctcctgcagttttcgagtgaacagattttta
gttaatcgatagaacttataccccccctttactaacggttttttcgaagt
ctgaaaatcaaatatctgagactaCCAGTCCAACGGAGATTCAGCGTGAA
AATTAGATGAAGAAAATGGGGttgtttgttaagtttcgaccacctggtgc
cctgcgaaaaccatttttaaggccttttctgaatctTGGACGCTGGTCTA
TAGATGGACTTTTTGGTTTCTATAGCATAATGCTGGTTAGAATTGTATAT
GGGAGAATGTTTTTATTGCTTGTCACTAAGAGAAGTGTTTATTTACTTAG
CACTAAATGTGCGCCTTCTTATCTTGTCAAATTTtgtaagaaacaaaaaa
aaaagtgtggACGAGAATTGCGATTTCAGCACTTCCactttatttcattg
gatatttcaattttaaagagaTTCTGTGTTATATTCCCGGTCTCATTGGA
ACAATTTTGACCTTTTGAATCTTAAGGCTCTAATTCTGAAGTCTCATGTT
ACAACTCTACGTTGAAAAAGTAAATTAGAGTGCTTAAGAATTatgtgttt
gaaattttgcagggaattttcctttttatcaaatattattACTCTATTTT
CCTTGAACTCCCTCAATTCGAATGAGTTAGGAATTTATGTCAATGTACCA
TGAACACAAAGCTATTTGAAATCTCTCCATTAATTCAAAGATCAATCACG
AAAAATAACAACAATTGAGGCTAATCgctcttacaaaaaaattcaacacT
GTAATTTTTCTTCACTTTGTTTATTAAAATGGTCATTGCGTGCTTTCTAA
AACTACTGATATTGCAAGATTTTTGAGTTCTGTTTTGTCAGAATCTGAGC
GAAAACACAAATTTAAATAGTGCaaaatttgctgaaatttggtaaaaaac
aAGAACATCGTTAGAACTTGACAAGCCTAAGAATTGAAAAGATTTCTCTA
ATATGAATTCATAAGAAACTTTTAATTACAGTAATTTCTTTTACTTGCCA
GTTTTGAATTAATCACCAGAAGGTTTTTGTTCGATTTGAGGTCTTATTTT
TGTAACAGAAGCTATTCTTAGTttcaataagaacattttaggctcaaaat
tgTCAACAAAAAAAAAGCTCAGCCAAAATtaggacgttcttataaaaaga
gttgtatattttctttattttctgtCGTCAGAACCTCAGTGAAACTCGAT
TTATATCTAATTATTATTGAAGCTCGCAGCCTAGAACAGAATTAGTTCGC
AACCTCAAACCAGTTTATATCTTATAAAgttggtttcaaaaaaatggcag
tccgcaataacttttgatagaattcgaataagATTGTGGTTTTATGCTCT
Taacaaaaatcttcaatcttcattttctgttctttataatattccactct
tcttattcttttcaacaagcataaAAAAGGTTTCTTATTCTCTATTGATA
AATATCTTAAAGTTTCACTTAGACCTTTTTGCTTTTTGGTAGGAAATTCT
ACCGaatatatttgtttttctttttcatcaaagtcGGTTATTGAGTACTT
CGGGCTATAGAACATAATTGGTTAATGGAAGCACCCTGTAATAGGTCTTG
TTTTTGTTGTGGTTACAATTTGGGTTGCCGAAATGATAATTAATGAAACG
CGTTCTAATTGCTTTCCTGAACGTAAAAACTCAAAGAATTCTATTTATAG
AGCAATGGTTTAATACTTTGTTCGAATAAATTTCGCGGCATTGTAAATGC
GAAATGTTGTCGCATGAACATATTTCATTCTTTAACAGCCCCTGATCGCG
AAAACTCCATTAGGATAGTCGAAATATATAGTAAAGCAGTATGATACCCC
AAGTAATGTAACCCTATTCTCAcaattagcgagtttatgtattcgagata
aatcgagggggacggtatgaagcaaagttgacatgtctccaaaatcactg
tccactttgctcgacgacggtaaaaacaccaagataccgtcaccctcgat
atcctccgatacataaactcggtattgccTGATGAACGCTTCCCTGCCCT
TttcgatttttcaaacctgTCCTTTTTTTAGAATCCCTTCGTTTTTGGTA
TTTGAATCTTGTTTTAGCCGCCTAAGAAAATTTCCATATTTTACTCCAAG
AAAtgaatagcctgattttagagTTTGTTACAAATTTGTTGTAAAGAGAT
TCACTTCGTGAAGAAGCGAAGAATTgctaaaagatttttgaaattagacc
aatttactcttaggttccaaataaacgggggggggggctggaaaattttt
gagattttaataaacgggggggggggctggaaaatttttgagattttaat
aaacgggggggggggctggaaaatttttgagattttaataaacggggggg
ggggctggaaaatttttgagattttaataaacggagggggggacctaatt
gccgggggggtggaaattgtacttctgaaaaaccaaaataaggtaaatag
aGACTAAAATCAGGccatttagagcaaaataaggcctggccttctctttg
acagctgaaaatattcttaaaaattaataacccccgtcctaataaggtcc
ggggggggggttggaaaattttcgagattttaataaacggagggggggac
ctaattgccgggggggtggaaattgtacttctgaaaaaccaaaataaggt
aaatagaGACTAAAATCAGGccatttagagcaaaataaggcctggccttc
tctttgacagctgaaaatattcttaaaaattaataacccccgtcctaata
aggtccgggggggggggttggaaaatgttctaaaaattaTCAAGTGGGCA
GGCCCGTTTATTTGAAACCTAAGAGAAGTTTGTTTCAATTAAGAACTTCG
AACGAAAAAATgaggaaataaaaaatgatcttgcctaaaatttttgatga
actgaagatttttttctttcaatttatttttatgttACCTTATATTTGGG
ATATTTAGGAGAACAATTAAGACCCCCCGTTACAATTCCGACTTCCCTCT
AATAGGCAGCCGAAATTATCCATGGAACATAAATATTTGTTGTGTACTGT
CAATCATtaacattagcgagtttatgtatccgAGATTAATCTAATGAGat
ggtataaagcaaagttgagaTATCCCCCACaatcgccgtccactttgctc
gacgtcGGTAAAAACAccccgtcgtctgtttaggttagcaaaggcgatat
agagccgtgcGTCAACTATCTGCTATGTTTTGCGTTgacttcacttaccg
tcgccctcgatatcctccgatacataaacttgcttttttttttaatgcgG
AGTTTTTGCGCAACTTTTCCAAAATGTTTTGCGATCTGCTCACGCAAAAA
AATCTAATCTGATTAAAGAGAGTTCAGATATCCTCCCCCCTGAATGTTAT
TTCTATGAAATATTTGTGGTAAGTCTTTCTACCTCCGCATTTCAAggatt
ttgtttatttgtttgccCTCATCATTTATTAATGTGTCTTTTAGTGGTCA
AAAGTTTGAAGacgttttttgacattttctgtTTTGAGTCATTATGTCAT
TAAATGAAGTGCGCTGGCTGGAAAATATTCTGAGGTCATTTTAATGATAG
AAAAGTAATCAGTTCTGTCTGTGCCTTCTTTGTTTTGTAgacaacttttt
ttataagcaactcgaTTTTTAGCTTCAGCCCTGAGGTTGCTTTAGCATTT
TACttgttttgtttagaaaatTGCTTTGATCACCTCTGGTATTATACCAT
ATGAAGCTTAATAAGTTAAAGGCTATCGTTTACCGTGGTTAGAACAAAAA
AATGCTTTACAAGAAAAATTTGGCTAATTTCGGGGCTCAAGCCTTatctt
gcttataaaaaatgtgtataaaaATTCATTTCAGAGACCACTAAGTTAAT
GTACAATGTTTTCTCCTTgttaaacaaaacaataaagCAAAAATCCTCAG
TCTTGAATACCGTAGATACAACAATCGAATCAAAATATTTCCgttgaaaa
tgaaaacttccGAATAATTCGAAAACGAACCAAGCTGGCCGCCTGAAAAA
AAACTCTTTCGTTCTTTCAGATGAACCGTACCAGCTACCCTATGAAAGAA
ATGTTGGCCGTAATCCCTCCATCTCCGAGATGAGACACCTCGTGGCGGAG
CAGAGCGTCCGCCCTTATTTGAAAGCAGAATGGCGCCAGGATGAGGTATT
TTTCCACAACTATTTGTTCGGGATTTCCTAACAAATCAACAAAAAGGGAA
CCTAGTTTAAATCATGATTTTTCTCAATAAACCCTTTAATTATATATAAA
CGCATAAAATGggatcttccagaaaatgtccgtacatgggggtgtcgaaa
aatttttgtccggggggtagcgaaaaatcatcaaaatttgccttgtccgg
ggggtaaatttactctgtccgggggtaatttgggttgtccggggggtaaa
tttgctcggtccgggggtaatttgggttgtccggggggtaaatttgctcg
gtccgggggtaatttgggttgtccggtGGGTCAACTGacgcttgtccggg
ggtaaaacctgttgtccggggggccaaaagtcactttgtccggggggggg
ggatcaATAATAATTATAATATAAGTCCTCCACCCGTCCcctccatattc
aaattttttctggaaaagcctaatCTCATAATGCTTAACCTTAAAATCGT
TTGTTATATTGCAAGAAATAACATACATCTCCCTGCACTTTTAATCCCAG
TTTCCTTTGCTAGGAGTATAAATgaggaaaaatgtttttcgtgagcataa
acGAATCGCGAATCGtttgataaaaatgagaattttcgaataaaaattgc
cttaaaggtgaaaaattttcctcaaatccgctaaagacggttgctcttcg
actttaaacaggcattaaaggataataatatgccgaaaatttgataattt
ttacgatttcgaggttttaaagatttccaatttttttgagtatttttcgc
gagcataaactttcgcgaattgccctgttaagaattttcaaagacatttt
ctttcgcgaaaaaggccaaaattgtgaaagtttgtacgcctaaagtagac
tACGAAAAGTTGCTGCACGACTTATCATTGTGTGTAGAAGTGTCTCTACC
TCTAGCTTTGAAAGAGAATGGCTCGaagtatgtatttgtttatctCAATT
CCCTGAAACACCAgtaccactttttgatttcacGTGAGCTTCATCAGAAT
CAAAAGTGTTTTAACTTAAAAATCAATCATTTCTCGACTTTTCAGAAACT
TGTCACTTTATGCGATACGATTGAAAATTGTTGGGACTCTGATACAGATG
CCCGGTTATCTGCCGACTGTTGTCTCATGCGAATAAAGTCGGTTGCCGAC
GAATTCTCGTTTCCCGACAACGAGAATATTGTTGGTATACTTTGTAACGA
GAAGAAAAGAGATGATATGAGACTCGATATGACTGGAGCGACGAGCAGCG
GTGTTTCGTCGATGGGGAATGATGAATCACAGAGCACTGGTTAAAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000076 | supercontig | sc0000076:55122..67467 + |
|