XLOC_004109 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004109
Unique NameXLOC_004109
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000075:603103..612118-

Legend: gene
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>XLOC_004109 ID=XLOC_004109|Name=XLOC_004109|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9016bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000075:603103..612118- (Clytia hemisphaerica)
AANTGCTGGATGTTCAATCGATATTCGATTTTTCCCTTTCGATTACCAGA AATGTCCGTTACAATTTGGTTCGTGGTCTTATTCGAGTCCTGAGTTGGAT TTGGAGTTGACAAGAAATGATATTGACTTGAGTTTTTATCAAGAAAGTTC ACAATTTTGGTTGATTCGAACGGAAGCTGTTCGGAATAGTGTCAAATACA GGTAATTCTTTTTCTTAGAAAAGAATGCGCTTAAATATATCAAGAAATAC AGAACTAAAGGCTTGGGGACACGAAAAGTTTTTTTGCGTTGGTGCAATGC AACATGCTCCATCCCATCAACACAAGAAAAAAGTGCGTATCCCATGGTTT TCTTTTTTGTTTCATTGGACAAAAAGTGAGAGAAATTCTCAATTACCACG CTGATTTTGTCCCTGTGACAAAAGTGAGAGACACACAAATGTTATTAAAA GTATTGTCGATTTCACTTTTATTGTTAGACAAGAAAATGGGGTAGAGACA AAAAACCGTTTTAAGTTGGTGGGATGGAGCATGTTGCATTGCACAAACGC GAAAAAACTTCTCGTGTCCCCAAGCCTTAACTTACAATTGCTATAAGGTG TGGTGTTTCATGCTGGCGCAATCTTCAAGCAATGCAGGTGTATTGCAGAT TTTATTTCAATTTTTATTTTTTTTTGAAGTTCTTTATTTCTTGATATTTT GCTGGAATTTTTTCGAATTTTATTGAGCACTTTGTGATTCTATTTATTTC ACCTAAATTTGTCAAATATAGAAAACAAGTGCTATTAGTTCCAATTTGTT TTCTGCTGAAAAGTTTAATTTCTAAATGAATATTCCTCTACAGAATTTCA GAAAGATAATTCTACTTTAAGTGTCAGAAAAAAACGGATAACTTAAAATT CAACCTGAGGGGAGTGCTTAAATCTTTCGTTTCGCATCTTCGAATCGTTA 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TCGAATTACAGAATTATAGAGGTTCCAATTAGAGAAAGTTGTCTTTATCT TAAATATATTGTTTATTCCAGTTGCTGTCCCCACCCTCTGACAGACATCA CATTCACAATCGTTCTTAAGCGGAAAGCCGGTTTTCACATGTTTAATGTT ATCGTTCCATCACTCGTCCTAACATTCTACGCTTTGTTCATATTCGCATT CCCCGAAGAGACTGGGGAAAGAATGGGATTGGCTATGGATTGCTTTTTAA CCATTTCTATTCTTATGATGATGGTCTCGGATATGATGCCGATTGATTCC AATGTTACACCGCTATTGGGTGCTTTTATGTTGGTCAGTATGCTGTCAAT CACTTTCTCAATTTGTAAGTTCCATTTGCATAGTTTTCATTCTTAATCTT AAGCATGTGAGGCCTTCTTTTTGAAGAAAAACACACATCTTTTCAAAAGA TTACTTATTTGGTCCATTTTTTCAAAATATTTGTAATTTTGTACATTTTA AAACGCAATTTCGTGTATTTTCCTAATTTAGTTTTCCAAGGAAAATTAAT TTAGTGTATTTTCCAAAGAAAATCAAATACTTGTATTTTCCAAGGAAAAT TAATTTAGTGTATTTTCCAAGGAAAATTAATTTAGTGTATTTTCCAAGGA AAGTTAATTTAGTGTATTTTCCAAGGAAAATTAGTTTAGTGCATCATTCA AAGAAAATCAAATGCGTGTATTTTCCAAGGAAAATTAATTTAGTGTATTT TCCAAGGAAAGTTAATTTAGTGTATTTTCCAAGGAAAATTAGTTTAGTGC ATCATTCAAAGAAAATCAAATGCGTGTATTTTCCAAGGAAAAGGATGTCT GAAATTATTTGTATTTTCTGATACTGATAGTTGATACTGATAGCTGATTT TTGATAAATCGGATTCATGTATTTCTAAGGGACATCGCGACGTTATTAAA TCTCATCAATAAAATCTTGTTTTTCCATATAATGTATTTGCTAATGAGTA TTGATGGTGTAATTTTACAAGAAAAATCTTGTAAATTTTCAAAGGAAAAT CTGAATCTGAATACTGAATACTTTTTAACTTGCATTTGCTATTTACACGA CTGCCTTCACTTTAATTTTTTTTAGTTATGAATGCAGTATGTTTTAACAT GCACCGTTCCGTTGCTGTACCAAATTGGCTTCATCATATTATTTTCAATC GAATACTACCTCTGACTGTCTTCAAATCATGTTTAAACAGTATTCGAAAA TCTGGAAACTGTAGTAAATACGCGTGTTGCGAGGGTGTGTTTGCTGCCTC GATACGTCGTAAACAGAGCTCTACAACTCGATATTTTGAAGAAATGGACA GGTTAGAGGAACTGAAAAAATACGCAGCGAAATTCACTCCTGCGCATGCG TATGAGGCGAATACAGTTTTAGATACGAATTCCCTTGATGAAGAGTTTGT TGAAACGTATGAATTCATTCAAATGTATTTTCCAAAGCCACTATCCAATG ATGAGGCGGTTGGTGGAAATGATGGTAACCCGCCCACTGACGCCCCTTCC TTCAAGTCTCAAAACGAAAGGGATAAAGAGAATGTAGAAACACTTCTTGA AAATGTTTACGGTGAAGAGGAGTCTGAATATATCTTAGATTTTTGGAGAT GTGTTGCACAAACTACAGACCGTGTTTGCTTGATCTTTGTCTCCGTTTTA TACGCTTCTATTTCTATAGGACTTATGTATCAAGTACCGAGTGTCAGCTT TACTTGATTTTATTTTGTAGTAAGTGATGGTTGGGAAAATTAAATTTTGC GAAATTTTGGCAAATCAGCCAAAATTTCTTCCCTTAAGGTATACCAATAA GAAACTATTTTTGTTAGAAAGCCCTAAAGAGGCCTAAAAGAAAATGAAGG AATTAAATACCAGTTGGTCGAAGATTACTTGAAATTTCTAAAATCCAGTG TAGTTTTCGAAAGTAAGGAATAGAATGCGCTGAAGTTTTACCAAACTTGA CTCAATTTATTGTTGACATTATTTTCTAGGTTATATATATTTTTAGGGTT TTCTTATGTAAATAGTTTTTTTCTAATCCTATAAACTGACACAAGATATT TTTCTCATGTAAATCGACAAATCTAAAAACTATTTTTTCTAAAAATGTTA GAACAAGTTGTTCCGTAAAGTAAATTTGAATTGTAAAATGTTACCGGGAA TTCAAAGGTAAAAAAATGTATAAAACTGCACGGTTATTGTGATTTTCCTC TGATTTCATTTAAATCTTTCAGGGGTACTGCGTCATAACGTATCAACCGT TTATCAACACCTGCACCATTTCGATCAAAATACCACGAATTTTTATCTCT CCCTCCTTCTTCAGTCGAACAACAACAACAATTTCTCTTACAATCCACTG CAAAAGAAACTACGTTTACACTCAATAAAATCAATAATAAAACTTCAGCC ACCAATAAAACTACTAGTAAATTCATCTCCATACGTATTCTTGGGAGTGT CTCAAGCGAACATCGAACATCAAAATATCCACTGGTAACATTAGCTGCTA AACCATCATTAAAAGTCGCCAGGTTATCGTAATCTTCAAAATGTTGAACA CCTCCTAAATTAGTTGAATGTTCGATAAGACATTCCTCATAGGGTGGAAT CATCAATAAAACATAAATATTTATCATTGCTAATCGACAGAAAATTTGGA AAAAATCAAAACCAAATTTCATACTATATATAATTTTATTACCAGTGTAG ATAGCTATGAAACCCAACACTATATTTATGATAAGTGGTAAGCTAGTCCA TTCAGGAAAAGCATAATCTTGTTTTAAAAAGAACATCGATATAGACTGTG GATCAGCATGTTTAGCCTGGATGTCGTTGACATATAAACCACCCAAAACT GTATTGAGAACAACCAATAAAAGAGTCAGAAATGTCACCACTTTTTGAAC AGTGTTCATCAATGATTCTTCCATGTTCAAAAAACTTACTCAGGATACTT CAACTGTGTGATTTCATTCAATCATAGTTTTATCCAAAGCTGAGTTAATG GTTTCTTTAAAAATCGCGTGCCTTTTAACCTTCCTCTTGAGTATAAACCG AGGATTTGTCTCCTTCTCCAAATTTTTACTTGTACCATACAAATCTAAAA ATCTTGTTTCATTGAAGAGAAAAGGGTTTTACTTCCTTTCTAAATGCGAA TAGGTTTAAGCTTATACAAGGACCCTAGAATAAGAAAGACATATTATCGA TTGAAAATGGGAACTAGCGGGTTCACCTTAGATACTACGAAAGGCACCAA TCAAACGGAAGCTCCT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00007330TCONS_00007330Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00007330-proteinTCONS_00007330-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000075supercontigsc0000075:603103..612118 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.07 0.13 0.11 0.02 0.25 0.31 0.74 0.86 1.27 0.85 0.75 0.85 0.93 0.87 1.17 0.93 2.4 2.56 0.26 0.86 3.88 3.63 1.77 2.33 1.43 2.51 28.39 17.34 8.24 6.89