XLOC_003723 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003723
Unique NameXLOC_003723
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000069:259458..284032+

Legend: gene
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>XLOC_003723 ID=XLOC_003723|Name=XLOC_003723|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=24575bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069:259458..284032+ (Clytia hemisphaerica)
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GCATTGTAAGGCGTGcgatgaaaatatgtataaagAAACTAAAGGGAATA CAAACTGTGAAATATGTGACCAGCATAGAATTACTAACGAACAGCGCACC TTGTGCTACGACCCGTATAAAACAGTGCATCTATATCTACCACCGAATGC TATCTACGCCCTCGTATCTTTCCTCTCTTTAATAAGTCTTGCTATACTTA TTACAATGGCATTCTTTTTTAAACACCTCCATACGCCCATAGTGATCCAC GCCAACCGTCAAATGACCGCCCTTCAACTGATTTCTCATTTCATCCTCAC AGGAACAGCTCTATATCTCGTTCTAACACCGCCTACCGCCCAAAGCTGTA CAATAACGCCCATAATTATCGGGGTCTTCATAACAATCACCTTCTCTGTC AATATCGCAAAAACGCAAAAATTGTACGTCATTTTTGGGTTAAAAAGGAG ACATGCGGGAAACCAAAAACGGGTTATCGGGCTCATAGATTGGATTGTAA TATTTGCCTTAACCTCGCTCGATATCTGTCTTCTATTCATTATAAATTAC AATGCGAAAATTGAGATCATTTCTTTATATCGgaaagatgatgatgatta CGTCAGAGAGATCACGTGTCGTAATAACGATCATTACGTCATCCAGCTTA TATACGCCATGTTTATTATAATAGCCAATGGCGTACAAGCGTTCAAGGCA CGACATTTACCATCTCATTTCAAGGAGACGAATCATTCAATATACTCATC TTTTGTGTCTGTCATTTTACTGGCCATTGTTTCTGGTCTGTATTATGTCC CACAAAGCCCTTCCAAGAAAAATACCCTAATTTTTTTCAGTATATTGGGA CTTAACTTATTGAACTTTGTCTTGatttatgtttacaaaatgTATGtgat aatttacagaccagaacggaACACTGTAATCGCGTTCAATATGCGaagga 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TCTTTTGGTTAAAACACCTCACTCCAAGAAGTGTGTCGCTTAAGCTGGTT TACTCAAAATCGTTTTATATTACATTGCATTAATTTAATTACAGttcact ctctctctaatttgatcttcaaaggaattttattcgaattaggAGAAAAA TTGGAATTACAGAGAGAAATTTAAACCATTTTCTAGCTGGAGGGGACGGA CTAATagtttagttcgaattagaaagagttGACTATTTTTGCTATCTCGT AGATATTAGATTGACTTGTTGGTCTTAATTAGTCTTTTTgtacctttttt atttttattttgtacctTTATGCTACCAACgttaaatataaaataaataa ttaacATAAAACAATAATATAAGAGTCTCTGCCAGACTAAAGAGAAACAT TAGGAGAAAATTGGCTTAAACTAGGGGAACATCACCTCCATTTTATCTAA GGAAGATTAATGAAATAAAGTCCTCACATTGTTAGAGTAACATCTACCTT CGGAGACACTGAAAATAACAAAGGTAGTGAATCTTTTAAACTTAGATAAC TGGGTGAATATGTTTAGGGATGAATAGAATTGGGGTTATTCTACTTACAG CGCGAAAGAGGATCTGAGCAATGACGTCCATCGTGAAATTGCAGAATAAT TATCTGTGATTAAATTTTTCTCAACTAAAAATATATTGTTCTTTTTACAG GCAGTAGCAGGGAGTTCATCATTCAACgtgcaacaacaacaacaactacc AGCATCACACGAACACGATATTGCCGTCAGCCGATTGACCGAATCCACTG AAAAATTGCTGAAGAATGTTCTCTTCGAAACAGAAGCCATCAAATTGAAC ACAGAACAAATCTCCAAAGACCTCAAAAGTGCTCTCGAGAAATGCAAGGT AATATTCCTATTTGTCTGACTTAATCTCTATTTCAGTTTCGTTTCTTGGT GGTTTTGTACAAATGCGGTGAAAACAAACGAAGTTAGAAAAATATCACTG GCGCATTAATCAAATTAGaattgtattcatgatatgcaccattgttaTGT CCTTTgatattacatcacggacccaacagctgattggttgtaagtgacgt aaaatctattaatacgtcacttgcaaccaattaGCTGTTGGGCccgtaga agacattgcaaaggtgcatatcatgaatagtagGAAAATCAATATCTTTC ATCAATTGAATGAAGCACTGTGCTCGAAATTGTCTTGGACGGGAAGATAG TGAAATGAATTTACCACttgatttcttttctttaagGAGTCTTCTCTATC GTTATCTGACTTggagaaaatcaatttgttgtTGACGCCTGGCAAAATCG CCAACAGTGACCTTGATGATCCAGATCTGGTTGATACCACTGATCTCGAA CGTCAAGTGGAGTCCGCGCGGCGTGAAGCGAAGTTACTGGAAGCGCgctt aaatgacgtcatcagaaagaACATGGCGAGCGAGTTGGAAACGCTTAAAC GGAATACGAAATCATCGTAAACGGAATatgtttttgttgcttttttttct tgtttatgAATGAATGTAATGATAATGActgattttatctttttctcaAT CACTCTATGaaacactttcactttcgatttcccttctttcttcttctttc ttcgtctttacttttttcttacaaatcactttaacttttgattttttaga gAATTTAAAGTACTGAAAATTGTCACATATTATTATAAACtattaaataa aatattgaaattatgaatttattcT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00006573TCONS_00006573Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006574TCONS_00006574Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006575TCONS_00006575Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006576TCONS_00006576Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006577TCONS_00006577Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006578TCONS_00006578Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006579TCONS_00006579Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006580TCONS_00006580Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006581TCONS_00006581Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006582TCONS_00006582Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006583TCONS_00006583Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006584TCONS_00006584Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00006578-proteinTCONS_00006578-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000069supercontigsc0000069:259458..284032 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
35.81 29.89 34.84 35.26 42.58 34.82 32.89 42.88 19.83 25.11 35.51 18.29 28.15 35.92 24.73 30.71 33.8 35.74 21.4 19.8 29.91 32.43 38.95 35.48 50.8 51.48 55.51 72.37 39.38 45.1