XLOC_003379 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003379
Unique NameXLOC_003379
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000061:806162..814608-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_003379 ID=XLOC_003379|Name=XLOC_003379|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8447bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000061:806162..814608- (Clytia hemisphaerica)
GGTGAACTGCACCCTAATTCAATTAGATTAAATTACTTTTAACAAAACAT
TCAAAATACAAAAAGAACTTATATGTAGGACAATTATATTTTTTATTGCA
TCGCAAATGACTTGTATTTATATTCCCTAGGCAATTATCGTAGGCAATTA
TCGCTAGATATTATATCAATTTTTTACAATTTCAATTCAACTCAATCATT
CAATTCTGAAACTTACACAAGAAGGATGTACGTGGAAGATGTTGAGATGC
GTTTTTAGATACAAGTTTTAGAGTTCAATTTCAAGTTCAATCTTTTATCA
ATCATTTCATGTACCTGTATTCACTTGCCTTCAAATTTGGCATGTGGCTA
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TTTGAACATAATCAACCAGTTACAAACGGAAGCTGACTCCAATCTTTGCT
CAAATTCCCCAACATTCAAACGGAGTCCTACGTCATTCAACGGGAACCCG
CCCATTCAATTTCAAACACACGGAATCGTTCATCAATCCAAGCGAACATC
CGTCTTATCAATCGGTGATCCATTCAGTCAATTTGGTGATCCACTCAACA
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CAAGGATGACATGCCTGAGGAACTGAAAACGATACCTCAAGATACCACTC
AACTCGAAATCGATATCATGGTTGCAATCGAGGATATTGATGACTTGATT
GACGAGAATGCATCCTTTGATGACGTCACTACCTCGAAGCTCGAGCAACA
TCGAACCAATCTTCGACGATTACGAAATATCCTCATGAGAAATCATCCAC
ATTCTGACCTGCTTTCCGAGATCAAAGTCACCTTGGATGTAAAAATCAAA
TCCTATATCAAATCAAACAAAGGCGTGAACAACAACACCAAAATCTTGCA
AGACAAAATGAAGCAAGACGAAATCCAACGAAAACAAAGATCAATCGAGT
TCCTCGTCAACAACATTAATCGAGATCTGAAGGAACTTACAGAACAATNN
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TATACTATGGTGAAGGACTCAACACCATCTACCAGCTGATCGGTGATGTA
CAAACAACGAAATTCCTGGACACCATCTGTACCGACGACCTCGAGCAACA
AGAAATCTGGTCAAAACTCATATCCTTCCTGGAGGTGTCACAACACAATC
AACACATGGAATCTATACCTTCTCGTTACCACTGGCAACCAACAATGGTG
CAGAGATGACTGGAGTTTGTCTCGACACACTCACTGCGACCTTTTCCTTC
TATCCATTGCAAGGAAAAGTGGAGAACGACATTCAGCACAGTTGGGAGGA
CTCTGGCCACGACATCAATCATCTTCCAAGACTACCACCAATGGTTGGAG
GAGACGTCGACGTGATGATAGGTATACGTTATCTTCGTTTCTTTCCTAAA
TTCATCCACCAGTTACCTTCTGGCTTGACCATCTACCAATCACAATTCAA
GAACATCGATGGATCTTATGGGGTGATCGGTGGTCCCCATGAGGTATTCA
CAAGTATCGAAAATCATCATCACTCAACTTNAGACATTCGATTACTTGGA
TCAGCTACCTTCAGTGAGGTTCGACATGACTTGTATTTCACTAACAACCC
AACTTACCAAATCAACAACGACGAATCTGAACCATCAACTTCATACATCA
CCAATCTTAATGAGAAGTTCGAATCAGTTGGTACAGACCTTAACTATCGC
TGTGTCAATTGTCGAAAGTGTTTAACCTGTAAGAACCATTCTACAGAAGA
TTCCATTAGCATCCAAGAGGAGGTCGAGCAAGACTTGATTAATCGCTCCA
TCACTATCGACCCATCCAATTGTTCATCGATTGCTAATCTTCCACTAATA
CACGACCCTCTGGTCAAACTGGCACCAAATCGAGACATTGCACTTCGCGT
TTACATACAACAGCTTAAACGTTTGGAAAAGCATCAAGACGATAAGGACG
GCATCCTCATCTCAGAGAAGAAACTGCAACACCTGGGATTCGTCGAATAT
GTCAAGAATTTGCCCACTGACATCCAAAAGCAACTATGTCGGTGTTTTTT
ACACTTTTGGCAAAAACGTGAAGTTTTTTTAAACAGGTTTTAAAATAAAT
ACAAAATGCATGGGAAGGCTACACAACGAATGCTAGATCTTCAATCGACA
TCATTCTGTGTCCCAATCTTGGAGAAGTCATCACCAATCGCCTACAGCAT
CGTCAACGACATCCATTGGAACCACATCACTGCTTCACATTCTGGTGTGG
AGACCACTTGGAGATATGTTCTTCAGAAAGTTTTCATCATCGAAGGAAGG
AGTCTGGTCAAGTCAATTCGATCAAATTGTGAAAGGTGTCGATACCTTCT
CAAGAAAACCATCGACGTATCAACGGGACCAGTATCACCTGACAACCTGA
TGATTGCTCCAATCTTCTACGTATCTCAAGTCGATTTGTGTGGTCCATTT
GAATCATACTCGTATCACAACAAGAGGGCCACTGTCAAGATCTGGTACGC
CGTCTTCTGCTGTGCTACTACCACCACCATCAGCATCAAATGCATGGAGG
ATTACTCGACAAACGCATTCCTACAAGCATTCACTCGACTATCGTGCGAA
GTTGGGTATCCACGTCGACTGCTCACTGATGAGGGCAGCCAACTCGNCAC
CATCAGCATCAAATGCATGGAGGATTACTCGACAAACGCATTCCTACAAG
CATTCACTCGACTATCGTGCGAAGTTGGGTATCCACGTCGACTGCTCACT
GATGAGGGCAGTCAACTCGTCAAGGCTTGCGAAACACTTCAAATTGATTT
CCAAGACATCCAACGTCGTCTCTTCAAAGAATCCAATGTCGATTTCAACA
CTTGTCCAGTTGGAGGCCACAATATGAATGGTCTCGTAGAACGAAAAATT
CGTGAAGTCAAGAAGTCCATCCAAAAATCAGTCTCCAATCAACGACTATC
AATCATGCAATGGGAGACATTCGCATCTCGAGCAGCAAACAGCATCAATG
ATCTACCATTAGGCATTCGTGACTACGATGGAGACTTGCAATCATTGGAT
ATCATCACACCAAATAGACTGAGACTTGGACGAAACAACGACAGAAGCCN
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GGTTAGAGATTGAACTCTAGCCCTTCGGGCTTTAACTCAATGAGTCCATC
TGCAAGTGTAAGGGGGAAATATTTAGTCGCATTTGTGCGAATCTTGTTTA
CAATTTCAATTCAACTCAATCATTCAATTCTGAAACTTACACAAGAAGGA
TGTATGTGGAAGATGTCGAGATGCGTTTTTAGATACAAGTTTTAGAGTTC
AATTTCAAGTTCAATCTTTTATCAATCATTTCATGTACCTGTATTCACTT
GCCTTCAAATTTGGCATGTGGCTATCCGGTACGTTTGCCTCTTTGTTTGC
CTTTGTGCCTTTCTTTGTTTGCCTTTGTACCTTTCTTGTTTGCCTCTTGT
GCCTTTTTTGTTTGCCTTTGTGTCTTTCTTGTTTGCTTTTTGTGCCTCCT
TTTCATGCACATTTAGGTTGGGTCCGGTTTAGGTCTGGACATTAGGCTAG
GTCATTTTTAGGCATGTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTTTTCAGTTTGAACATAATCAACCAGTTACAAACGGAAGCTGACTCCAA
TCTTTGCTCAAATTCCCCAACACTCATTTCGCTGAGATTTGTTCCATGTT
AGTTCCATTATATATTTAATATATATCATGCCGTAGCATGAAGGTACAGC
ATAAAGGTGCAGCATCTAGCTACGATGTGTAACAAAGTTAATAGTTCAAG
CCCCAGTTGTATAAAAGTTTGTTGAAAAAGATCGCTTAATAAAAATAGTT
ATGACTTTATTAGTAAACATAATAAATGAAGGCTTTGCACTCTGTAACTC
GATGTTGATTTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAAAATCATCATTTGTTGATTT
GAAGCATTTGAAAGTCTTCATTAAAGCTCGCCGGACTGGTCGATTCAACA
CTACATAAATGATGGGATCTGTGACAGAGTTTAATATTCCCAAAGAGAGT
AGAGATCCAGTCAGCTCAGGGTTTGGTGCAGTTGGAATTTTACCTGTGTA
TCGTCCTTGAATGAATTCGGTAATCGTCAAGATGCAAGTTGGTAACCAGA
GGATGACAAATGTTAACGTAAACATCATAGACACCAGGACTGATTTTTGG
AGTTTCTTTTTAAAGATTTGTGCCGGATTCTGCTGTTTCTTATTCAATGG
TTGTCCATCATCTTTGGTGGTGTTGGTACATTGGATATGTGTGGAAACTG
TTAAATGGTGGATCTGTTTGAGTTGCTTATGTACATCTAAGAATATGGCA
ATATTACCAGCAATCAGGATGAATCCAGTGGAAAAGTAACTGAATGAACA
GATCGTTGCCGATTTCTCGAAATCCACCAACAGCAGTGCAAGCAAGTACA
ATGCTGGAAATATGAGAGCAGCCGGTAGGATCTTGTAAGCTTTTCCTTTG
GTGAAATTTTGGTATACAAACGGTTTTTTAACAGCCATCATACGGTCAAT
TAACAACATGATGAGTAGGCTAAAATTGATAGCGATTACTACACGGAAAT
ATATACCAGCAAAATCGTTAAACAGGACGACCTGTTGGTATGTTGCATCG
ATGATAACTAGCCCAGGGGTTTGTGCGAAACTACCTATCCCAATAAACCA
ATGAGTGCATATAAATGGTACCAAGAATACTATGGTTATTTGTTTCTTTC
CACAACGTGATTTCCAGAATCCAAACAGCAGACAGGAGTTGGTGATCAAG
ATGGTTATGGAGATGATAGATCCAAGAATGATAGCACCAATTGAAAGAAT
GTCAGTTAATACTGGTGGCTCGCTACCAGTGTTATTCATGCTGATAGATT
TTTATCAGTAAACAACAACGAAATTATGTTCAACACGTTATTTGAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00005944TCONS_00005944Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005943TCONS_00005943Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000061supercontigsc0000061:806162..814608 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.92	1.32	1.04	0.79	4.65	1.84	1.24	0.9	0.54	0.84	0.17	0.77	1.68	1.47	0.88	0.56	0.23	0.33	3.99	4.31	0.1	0.43	0.26	0.57	0.39	0.18	5.57	1.95	0.13	0.47