XLOC_002705 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002705
Unique NameXLOC_002705
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000048:186427..212167-

Legend: gene
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>XLOC_002705 ID=XLOC_002705|Name=XLOC_002705|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=25741bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048:186427..212167- (Clytia hemisphaerica)
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CGTCAAAATTCGAGGGCACGTCAAAATTTGAGAGCACGTCGAAATTCGAG AGCACGTCAAAACTTTGGGCACGCAAGCACGTCGGGCACGTCAAATTTCG GAGGGCACGTAGGCACGCCAGCAGGTCAAGGCACGCCAGCACGTTAGGCA CGTAGGGCACGAAGGCACGTCAAAAAAATGAGGGCACGTAGGGCACGCCA TTTAGCAGACTCAAGGGAATTATAACTTCCTGGAACTAATACCCCATGCA CAGACATTGTTGATATAATAAGTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTGGTTATCGTGAACGAAAACAA TAAAAAGTGCTTACCCAGACAACGTTGTTTTAACGTTCATCTAACGTTAT ATGGACGTTTTGAACGTTAGATAAACGTTGAAACAACGTTGTGAGAACAA GATGTACACGCTATTTTTTATAATAATAAACTTTATAAGAATATTTATGA TGGAATTGGCCGAAAAATTAAGAATAGGGTAAGAATACCACCATCATGAA ATTTGGCAACTGACTTTAAGCCATTTTTAGGACATTTAACCATTAAATTG TCAATCATTACCCATGAATGCTTAAAGTTTTAACAAAAATGCCAAATTTT TGCTTGAAGTATGTATGACTTGCTAGATTTTGACTGAGTTTAGATCTAAA TCTAAGAATACCGTAAGAATATTTCAGTATGATTTTCCCAAAATGTTTAG AATATTCATGATGAATTGGAACAACACCATTCTTATAATAAAAAGCGTGT AAAACATCATTTTCCAGATGAGATGGATTTCCGTTTATCATTTTTATCGA ATTCTTCTTTCTTTATCTTCCTTTCATTTATTCAGATAATGATCAACAAC AAGCGAGTCCACGCAAACATTTTGATCACAATAGAAGAAACGGACAGGTT AACTGGAAAAAAAATTGCTTAGCTTTTGGAATCCTTGCCGACCAGTTCGA CTTTTCCTCTATAATTCTTCTCTGCTCTGGCACCAAATCGATAAAAATTC AAAATTCAATGTGGAAATCATCCTCGTTTTCACAAAAATTGTCAAAAAAT TCTAAATATATATATTTTTTGCGAGGAATAATTTCGCAAAAATTGCGTAA AAAAGGTAATGTTACAGTATTTTTCAGATTTTTCAATTTGCCAGAGAGTG AATCAATGTTTTGATTTACCCTTCTTTTCTATCGTTTTAGAGGAAGTTAT ACATAACTGGATATAATTTGACGAGGGCCATTCTCGACAAAGCTTTCGAA GGGCATTGTTAGTATCTTCAATTACTGTTTATATTCTTAATTTGAGTGTA CGTGTTTTTGTACCCACCTGGAGGTCCTATAAATTAACCGTTATCCGTTC GTTTGTCCCTCCGTCCGTCCCTCCGTTACAAGCTTTTCTCAAAATTGGCT TATTAGTTTTTTCTGATTTAAAAAATATGATCGAGTCCAATTTTTTTGGA AAATTCTTTCTGGCTGAAAATGACGGGAATATGCCAGTAATCGCCGTTTT TGCAGATTTTCATTGGGCTTGTTCCTCATGTTTCTTTGTTTATTTCACCC AAAAACATTATTGATAACAATGTCCATAATCAAGCATGATTCAATTGTCA ATAAAACTGATTTTTAAAGCCGGAACTTATAACAGATAACCCCAACATTT TCCACAGCGCTGCATTTTTCTTTTTTCGGGAATTGAATCAACTTTGATGT TATTTTCAGCGTCCAAAAGAAGCAGTTACTTCGACCAAGACAAAGGGTAA TATTTTCTACCTACTAGGCGACGAGACCAATTTAATTTGTTGTTCTACGG GCGCGACCGACCCAGCATTTGCTGCCAACGAAAAAATAATAATATTGAAT TTCCTATGCCACAAATTTCTAATACTAGTCATTTAAAAAATTTTACACTT AAAAAAAGTTGAAAAGAATCTAGAATCGTGAATTCTATGCACGAAAGATT TTATTACCAACTCCATCAAAGATGAATGATGAATTTTCGACCAAGATTAT TTGAAAATATTACTTAAAGCCTTATGTCTTTCCTTGATTAATGAAAATCT TATTTTTATTTTACCGACCGACCGACTCATATTTTGATATGCGCGTAGAA CAACAAATTAAATTGGTCTCGCCCTATCACTCTTTGTTTAAAAACCTTCT ATATTGGCTTTCAAAGTTAAAGTATGATTATTACGACGTAATACGCTCTA CCACCCCATATCGATACTGTGGATATAAGCATTACATGATTTTCTTTTTG TACCGGGTGACCAAGAAAAAAATATAAGGGTTTGGAGAGCTACTTTGTCC GAAACAATATGAATTTTTACTAATTTTTTTTTCCATTGTAAAGAAGAAAG GCAAACTTAAGATTTGGTGTATAACTTTTTCATTTAGTTCAGCGGCTCTC AAGTTATAAGCTTTTGAAGTCAAAATTCACTTTTGAAAAATGTTAAAAAC CAAATTTTAAGTTTATCTTTCCTCTTTACAATAAACGGAAAAAGTATCTA GTGAAAAATCAAATTATATCGGACACAGTTACCCTTTAAACCCTTATACC TTCTTTTGGGTCACCCTGGGGTAAAAGCAAAGNTGAAAAATCAAATTATA TCGGACACAGTTACCCTTTAAACCCTTATACCTTCTTCTGGGTCACCCGG TACAAGCAAAGTCGACGTCATTTGAATCGTCTCCTTTGCAATTTAGAAAA GTAATTTATTGGGGCTGATGAAACTGGTTTAACGTCTTGGTTTTAACGCG ACACATTTATTTATTTGATATCATTAGAGTGAATTGAGTCAATGAAATGT CATCAATTTGAACAGTCGGACATTTTTTGTTATATTGGCTCACAAAACAC TTTTTATTCCATTCTTTTTCTACAGATGTGGTTACGTGGATTTTGTTACT CCAGAAGCAGCTGAAAAAGCAATGAATGACGTAATTATATATGCGTGCTT CGATATTTTTTTCCTACTTTTCCTATTCGCACTAATGATAGTTTGTGACA TTTTCAACTACACTCCTATTGTGTTTAGCTTTAGATGTATTATAGTCCGA TTCAGCAAAATCCAGTTAGGCAATATCTTCAAGCAAACCTCAAGCAAGCT GCCTGTTTCTAACTGATATAAATTTCACCCACGAAACAAAAAAAATTATT TGCAGGTCCAAGCGGGAATATTTGAAGACTTTGAGTTTGAAATAGTAATT CTGTGCCATATTTAACCGATATTCATTGCGTTGAGATGATATGCTTTATA TTCATCATCTTTCGACTTACGCCGGAAAACCTGAATAACCTTCCCGACAC AATACCCGATCTTGCATGGACGTCTTTTTTTCCTCAATCTCTAAGCCTGT TTCTCTTTTCAAACTTTAAGTGAAAGCTAATTTCCTCGACCTGATGGTAA CCAGAATAGAATTGGATGTTATTTCTTCTTTTGCTCTGAAAAGCGACCTG CAAACTAAAGTCCTCTACTAGTGAGGATGTGTGGGTAGATTGTTGTAGCT TTTCAGTCCCGTAAGTTGACTATCATATTCCCTTACCATGGAAACCCCGT TATTTTCTCTAGTTACATGGTTCGCAAGTAGATGGTTGTATTCTGAAAGT TGTATACGCAAGACGGCAACCTTACCACGTTGATGACAACAGATACACAA AACGGCATAACAACGTTCGGCCAGGTACCCGCCTTTTCTTCAGTCTCTTA TTGAAAACTAGCTCCTCATTTCAATAAAGGGTACATTTTTAAAGAATTGA TCACTAAATACCAGTATAGATAAAACCGCTAAAATTTCTGTTCTTTTTAA GAATCGTACTATTTTACACCCCTGTCTCGCGGGGATGAAATCAAAGTCAA TTTCCTAGTGGGGCTGAAATTCAAGGGTATTTTCCCACCGGGGACGAAGT TTTTGCTTATTTATCCAGTGGGACTGGGGTCCCAGCGGGTAAGTGACACA GGGGTGTTTTGGACTTTTGATAAATGCACTGTAAGGGTGGAAATTTCAGC AAATCTGGGAATAATTGCAAATTTTGCTCGAAAATGTTGATTTTTTTTGC TTTATTAGCCCCAGGAGGGGGTAGAATCTACCACGTTGGAGTTCTTTTGC GTATATCTCGGAGAAAAATTTTTTAAACGAGGCGAATGATAAAAAGTGTT TTGTTTCCGGAATGCGGGTGAAGGAAAAAAGTTATCATGCGGCCGGCCGG AAAATAATTTTTTTTGCTATTTTTGATAATTTATGGCTCATTGAAATAGA GTTTAAGAATAACTTTTATGTATAAACACAGCATAAATTATGCCCTAAAT TACAACAAGTACGGACTACTAACGAACGAAACTTTGCGGCCGAGTCAGAA AAAAAATTTTTTTCACCCGGCCGGTTTCCGGAAACAAGAAATTTTTTTTG TTTCGCCCGACTTGAAACTTTCTGACTTTAAACAAAATCTTATTAAGAGT ATTTCTGCAAAATTTTAGGGTTATAGCTTGTCCAGATCAAGTTTTATGAC TTTATTGTGAAACATGACATATAACCCAGCTAAAATCGCTTAAAACTCAT TATTTTAAATTGTTGATAACTTTTAAACAATTTATTCAATCATCTTCAAA TTTTGACACGTGATAGGTATTGACAATATAAATTTGAAAAATTAGAGAAA AATTTTTTTAAATGATGACGTCATCATTAATGACGTCATCAAATTTTGAA AATTTAACTCATCTTCAGCACAAATTTTAAGATAAAATCTTCATGGAAAC TATAAAACCGGCAATTATGTTAAAGAAGAACCTTTTATCTTTCAGAATTT TTAAACAGAATTTAAATATCATTATTGGTTCGATTGTAATAGACATTTTT GTAAACCATATATTTTGGCTTTATGCCGACAGGTGGAAATTTTGTGATGA CGTCAGCGGTTTTTGAATGACGTCATCAAATTTTTTTTTGTTCCAGGAAA TTTGTGTCATGATGGAGAACATCTGTACCAAATTTCATGACCGTAGCTCT CCTAGATCAAAAATAATCGAGGATGGTAGATTCTGCCCCCCCCCCCTGGG GATACAAAAGGCAAGAAAGCTTGGGGCTAATAGGGTTAAAAGAGTTTAAA ATTTGAAAAAATGCACTGTAAGGGTATGAATTTCACCAATTTTTTTCTGC ACTATAAGGGTACGATTCTAAAAGCCAATTTTTTCGCCGCAAATACCGTC AGTTGGTAAACCCACTGCCCCCCCCCCCGGGTAGAGTGCATAAAAGAGAA CATAATTCATAATAACGATATACTTTTTTGTTGTTTTCAGATGATCCTGG CCGTAATAACCGACGTCATTCAGGTGACCATTTTCACCAGCGACGCGGAC CTCGACGCGACAGTGGCCAGCGATCATCAGACGAGTCACCCGTCAAACAA GATTTGGCTAAAAAACGAAAACTTGTTGAATATACGGAACCAGAGGGAGA TTTTGATTTTTGATGGAGAACTGATTCAGATACAGAGGTGGTTTTCGAGT AAGAAATTGTGAAGAAGACTAAAGAAAATATGGTGGATAGTTCTGTGATC AACCCTAGTTATATACCCATTAGGGAAATGTATAAGGTATAACCGAATCA AGCATTCGAAGGCTCCGTATTTTCTATGTTTTGAATTACGTTATCGAAAC TTGGTTGAAAATCTTGAAAACTGGCATGGATAAAGTCGTTCATGATAAAA ATTTGATGGAAAGTTATATCAGTACTCTTCGTGGAAGCTTGGTTACTTCA CTATCGTATCTAAAGAGTTGTCCAAATAAACATTCTGAAATCCAATTGAA AACAAAGGAACGTTGTCACAAGACATGTTTATTGAAAATTGATGATGAAG CGAAAATTTGATTGGTTTTTATTGTAGAATTCAGGCTTTGTTAGAAAATT AGCACATCTATTGCGGACATTATTACTAGCGATTTTACTTTTGAGGACTG CGGAGTGAAGCAATTTGGAATAACCGCAAAATTAAGGATAGTGAAAGTGC GTCGTCCTCAGTTATATAGTCAGGATCTAAACTAATCGAAAGCTAACCGT CAGCTCCTAGGGGCTGGAAATTCAAGGAGTATTTTTTTCTGTTCAAAGTC AAGATCAAAGTTATTTTTATCTACATCTTTCAAATTGAAAAGGATTGGGC ACCGCTTCATATAATCGTCCAACGATAATGAGATGTCTATTATGAAACTG ACACTATTTTTAGTCAATAACATGGAAAGATTATTTTTTAATCCATCTAT TTTCAAGATGCGAAGTTTTCAGACAGACACGCAACACGTGATGATCTGTC ATTTTTCTTGAATTTATGCAATTTTGAAAGAGTGATGATGCGTCTATATA ATTATGTTTGTCGCGAGAGAGGACTTTTGAGTTGCATATTGGAAAAATAT TTAAGGTATATGGTAAACTCAACAACTATATTTTTTATGCAAAGGGCCTC TTTTAATTGTATCGCACCTTTTTTTCAAATTGGAGATGAATATTTATCTA TACACGTACGTTTTTAAAATAAGAACATAAGGCTTCGGTAGCCAAAATCT CAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTTGTGGACTTAAAAACACCTG ATTTCTTAGGAAAATGGACAGAAGTTTTCAAGAAATGGCGGAAAATAAGA ACCTTTTTAAGCTTAAAATTCGAAAAAAGTTAAGAACATCCGAAGGCTTC AAAATTGTTGGATGTTCTTATAAAGAAAACGTGTATACATTAGTGGAAAT TTGAGTACAGCCGAGGTTGTTTGAAGCAACAACTTTTACTTCCTCACCAA ATGTGTTGAGACAAGGTTAAGTGCACATAATCAAAAAGATTTTTTAGACT GGAAAGTTGAGAATTATTCTTAAAAAATATTCTTACAGTATTCATAGGTT TGGATAAAAATTTCTACCCAAACCCCTGGGGGAGGCACTGAGGTAAAATT CGGTACGGGTACGTGCCGCTGATGATCAGGGTCCCTTTTTTAAGGCTCTG AAGATATCTGACAGGGTATCAAATTTACTAATCTTCAAAATGTGTATCTG AGAGGGTCGACTTTTCGGGTTGAAAATGAGAAATCTTTCGATTTTTGGTC CTGACAAAGTCCACTTTTGAACCCCAGTCACAGCTGTTTTCAGGTTATAT TCGAGAGGCTTCTAGTTTACTGATGAAAATCAAAATAAATATTGACTTTT CCTTTTTGTTTTGTTAAAGTAAACAAAGAGTTTTATTTCTAATACTAACC CCTGGCTAAGCTCATGGATGGTACTATTAGTCTTGTTCGAAGAAAAATGG AAAGATCAGTCAGTTTTTAACCGATAAGAATCGATTCTGAGAAACGTGAA TATAAACATTCATAGTGAAGTGAAAGTTGATTGAAGTACAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004784TCONS_00004784Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004784-proteinTCONS_00004784-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000048supercontigsc0000048:186427..212167 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
18.94 19.07 16.87 16.08 16.19 12.17 14.9 15.95 10.21 10.92 9.49 7.95 6.3 6.3 4.15 4.24 7.78 7.25 3.17 3.24 4.48 4.75 11.98 11.32 12.33 12.96 3.76 3.07 6.17 6.04