XLOC_002108 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002108
Unique NameXLOC_002108
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000031:119638..142723-

Legend: gene
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>XLOC_002108 ID=XLOC_002108|Name=XLOC_002108|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=23086bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031:119638..142723- (Clytia hemisphaerica)
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AGTAAGTCATTAATAGTATATGGCAAAGTACTTTGAAATAATTAATCATT AGGGATACGCGCCAATTACTTGCTTTATATCCTTTTTGCAGATATGATAA AATCAAAGTCATCAATGAATTTTCTGCAAACTTTTTAAGCCGCCAATGAT TTTTGAGTGGTGTAACTTACTCCGGGATTGTAGATTTCCAAATCTGAATT TTAACATTAGAATTTAACATTTCAAGACCTTAGGATGTCAGGATTTAAAA TTTCAAAAGTATTTCAATAAGGCTGAGAATATTTACCTGGAAAACCATAA ACTCCATAATCCAAAATGTTCATTTTCTTTCCAATATGATTGTATTTTGA CTTTAAAAAACAACATTAAAGACAGTAATCGTACATAAAAATCACCCTTT TTTCCATAGAGCGTCTTCCAGGAGATGGCCAAGAAGAGGATAATAGCTAC ATAGAAAGTGAAGGTGAAAAAACATTTTTTATAAGAACATCCAAAATTGT TGAAGCCTTCCTATGTTCTTATTTTTTCGAGTTTTAAACCTAAAAAAGTT CTTTTCTTGTTCTTAATTTCACATTTTTTAGTGTTTTTGAGCAATTTACT AAGAAATTGGAAGTTTTAGAGCTCTTTAAGCCTTAAAATGTTCTTATAAC TTGTTCTTAATATTTTAGCCATTGAAGCCCTATGCTCATATATTGTTTGT TTTTATGAAAGACATGTAGCCTTTGAGAGGTTATTTTTTCCTCCTGCTAA TAACTTTGCCGAGAAGTATAACCTCCTAATGCTATTTTATATGTACACAC CATGAAAAAGTTTAGATTTGAATTTACATAACTTTCCTTAACAAAAATGA TTCAAGATTTTCCTCTGGTCCTCAAAATATTCACATGATTCACGTGATTT GTTTCGTTTCATAGAAATCAACCCAACAACAGATATACTTAAAACAAAGA AAGGTAAATTTAGACAACAATACCTCCCGTCGCTATGGTCGCTATTAAAT GACCTGGAGCTTTTGTGAGATACTCAATTACTTGGTCATTTGAAGTATGT AGAGATCTTTAGAAAAAGTAACAAAATTGTTTTATTACTGGTTCATGACC AACCCAATCAAATAAGAACTCGTCAAAACTGCAACTAGACATAACGTTGG ATAAACGTTGTTTTGTTTGGCATAAAGAACTTTGTGATTTTTAATTGTAT GTTTGGACCGTTTCTTTCCCAATTTTAGATTTTCGTCCACCAATGATGAA GTCACCCTCATTACCAGGTATTCATTGTTTCATTCTTTGGTTGTTGAAAA GTAAGTTCCAGAACAGATATTTTACGAGATCTAGTCTTCCTTATCTTTAA AATGTTATGATTCTTATTAACAGCTGAATTTGAGGAAAATCATTCTTGTA GGTCGATTCTCAAAACATTTTTTCAAAATCAACTGTTCACAGTACCCTTC ATGCCTCATTTCTCTTTTTTTTACAGAACAATACCATCCACCAGGTATGC AAAGAAATCTTTGTTGGCGCCCGATGAACAAAACTGAACTCTTGCATTTC TTCTTCTGTTTTCACACCTTTTTGAATTTGAAACACTTCTATTGTCTTCT ACCTTAAGGGAACTTATTTTGGCGGGAACTAATTTTGGCGAATTCGGCGA ACTTAGACAAAATTCGCAAAAATTAGTTCCCGCCAAAATTAATTATTTTG CTCACTCGCCAAAATAAGTTCTCGTCAAAATCTTTGGTATTTTGCCTAAA TAACTTCTTGAGTTCACAAAAAAAGCTTCAAATAAGGCAAAATAGAACAG ATTCAAGCTGTCAGTCGCCAAAATTAGTTCCAGCCAAAATTAAAAAAAAA TCATCAATCGCCAAAATAAGTTCTCGCCAAAATTAAAAATGTTCAAGATT TTTGCTGCTCGTCAAAATTAGTTCCCACCAAAATAAGTTCCCTTAAGGTA TATAATTATTTAGTAACAGTATACTCACTAACAATGTTTAGATTGTAGCT ACAAGTTCTATCCAGCCGACTGTTCAACTATTTTTGTTTTATACTATTCA GTGTCATTGTTACTATGTTGTGTTTGCTATACTGCTTTTCTATCTTATAC ACACTATTCACCTTATAATGACGCACGTATAATTTTACACAATATTCACG TACTACGCACTTATAACATAATATGCACCCTTATTAGATCTGGACTACTC GTCCATCGCACACCCATACCAAAATTCAATGTCTGCAAGAGAATCCTTCC TCAATATTGGTACATTGACTAAGGCTGCTTCTCTCACCCAACTCAGTGTA CTAGAATGTAAGTTGATAATATGATGTAATATAATATCCTATAATGCAAA TACATAGTATTGATATTACACATAATATAATATCCTATAATGCACATACA TAGTATTGATATTACACATAATATGCACTAATAACATATAAAATTCGTCC CAGAAAAATGGTAGTCGTAATATTTTCACAAGTATATTTTGCAAGTAAAT TTAATTTTTTTTAAAATATACCTTTACACGAGCTATGACTTGACACAAAG CTTCTTTTTGCAAATAGCACATCGAGAAACTATATCTGCTACCGCATTTG GGAAGACTATTTACGTAACACCCGCAGATTATCACTTTGTAATATTTTAT ACTAATTTATAGAAATTTTATATGATTGATTTTAACGCGGATTTTAACAC GTTTTAGCACTGATCTCACTAACATAATTTTTCTACACAATTTCAGCACA ACTGAAAAACGGCAGAAGAGTGTCAGCTATAGGTATCTATGTAACACACT ACTCAACTACCCACATAATTTTTATTTTACACTTATTCCCTAAAATACTT ACATTACTAATCTTTAACCTGCACTACTAGCATAAAACATTTGAGTAGAT TTTAGGTTGTATGTATTGTCTGTCAACGATAAATTATTAAGTCGCAAAGT TATATTCATCACCTTCAAAAAAACGCACTTGTCTGGTTTTTTAATTGTCA AAAAGCCACAGAAAATCTAATATGACTTAACAACGCAACTTGTTGAATTC ATGCAGTGACTTAACTAAAAGCCAAGACCGGAAAAGTCTGAAGTCTGGAA GTGATGAAAATTATCTATCGATTATGAAAACCACCCTCCAGTTGATGGTA ATGTCTTTAGCCTAAATTAGCGAGTTCATTTTTCCCTTAAACAACATCAA TTTTTCATCTTTAGAACGCCCTACATACGAGCGTCGGCTAACTAGTCAAA GTAGCCTAGACGACCATTATGTGGAAACGGACTGTCTTCCAGTCTTTTCA CCAACCAAGAAATCTCTACCTGCCGAACCTCAAATGAATGATGACAGTAA GTATCAAATGCGCAGAATAATTATTTCATTATAGACCTCCAGTAGCGTAG ACAAGAGGGCGCAAAATTTGTGTAGAAGAGCAGATTCATATGAAAATGTA ATTATCCTTTTATATGATTAATAGATAATTACAGTGCCATAAAAATCTGC TCTCCTACACAAATTTTGCGCCTACTTGTCTATGCTAACTGACCTCTTTG CTAAAAATATGCAATCCCCTCATGCTTTTATAAACTTTTTTAAAGCCGCA CGCGTATTATTTATGTATTGGTAAGATTTTCCTACTTTAAACTTATTTAT GATGTACTAATCAATCGTCAATAGAATGATCATATCTGCTTTGAGAAAAC ATCGCCCGATCTATTCTCATTGGCATTTGGTTTATTTGTGTCAAAATGGC TAAAAATGTTCTCCTTAGTTCTTGGAATAGGGGTATACTTTAAAGGTTAG CCCAGGTAATATTTTTTACGACGCTTAACTTTCTAATTTAATAAACATAT TTAATTTTCTAGAAATTGACTGAAATTTCCTATCGCATTTGAAATTAAGA ATCTTTTAGAAACTTATATTTGAAATAAAAATTGGAATCACCCTTTTTTA TTTCAAATTTTTCGTGGATTTCCGTTACGAGAAAGCCTGTGAGTCTTTTG CTGTTTGTATGTAGTTATGTGGCACATTTCCCCTTTGCACTCCTTTTCTC TTTCATTTTACTTTATTTTGCACTTTTCCTGCACTTTGCACTTTTTCATG TTTTAGGTTATATACTCGGTTCTGAGCTCGGGTTGGATTCAGCTGATCCT AAAAACAATACAGGTAACCATTGATAAACATTTAGAATTTTGTTAAATCA CTGTTCACACTTAGCGAGTTTATGTGTTTGTATTTCACCGCAACGACTTT TTTGCAAAGTAAAGCAACCATGGTTGCGCCTCCTTAGACTCTATATATTT ATTGCCCCCCCCCACTTTCAAATTCATGGCGTGGGCCCTGTTTACCGTGG CATTGAAATCTTATTTTGACAGGTGGTATCTTGACCCAAAAATCGGCAAT TCTCATAGGATTATTTTCTTCATTTTCACTTTTTCTACCTTTATATTCGC TTTAGAATCACCAAAAGTACCGACATACGCTAATTCACCGGCAAGTCCGA ACGGTGAAGTCAACAGAAACAAGCGAAAAACAAGTAAGCTCACAAGCTGC TAGATTTACTGTTGATTTATCATTAAACGGGATACAAACTCCTTTATTAT CAAATTGTTTTATTTTAAAGGATGAAAGTCTTGATTTTTTGGCCTAAAGG TCTTAACAGAAACCTTCCTTTTGACCCAGTATTCAGTATTCTGATTCTCT ATTATTGGAACTGAAAGCTTTTTAAACAGAAAAATTAGATAACCTTTAAG TTCAATGTTCATTTTCAGATATTTCAATTTTGGGAAATAATTTAATCAAA AAAGATTAGAGGCTACTTTATTGACTGTATTGGATCTATAAGTCAAATAT TGAAATAATTTCTTTATGTTTAGGTGGCTACAATGCGCCTTTACCACCAA CTCCTGAGAAACCAGAATTCACCCTGGGTTCAGTTCCTGATACTCCACAG GAAGATGATAATGGTTATATAGTCACCGATTCCCCTGCTGTTTTCAGCGA TTCCCCTGCTGGCTATGTTGTGATGGATAGCGGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003787TCONS_00003787Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003786TCONS_00003786Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003785TCONS_00003785Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003784TCONS_00003784Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003783TCONS_00003783Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003782TCONS_00003782Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003787-proteinTCONS_00003787-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000031supercontigsc0000031:119638..142723 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.29 0.35 0.11 0.11 0.26 0.22 4.52 5.03 7.66 10.03 7.04 8.38 20.82 22.45 14.88 15.31 8.68 10.08 14.09 19.2 5.3 6.03 3.39 6.13 11.22 10 5.99 2.31 0.3 0.39