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The following sequences are available for this feature:
transcript from alignment at Sc0000000:1802999..1814173+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >BlTCONS00000287 ID=BlTCONS00000287|Name=BlTCONS00000287|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=transcript|length=11175bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000000:1802999..1814173+ (Branchiostoma lanceolatum)
CCGTTTCAGTGCAGGGTACAGGGTTGAGGATGAGGTCGACCGGGGCTTGT
CTCAAGCCTCCTCGGCGCTAGATCGCACCTCGTGCCGTAAGGATTACCAC
CGAGGGCCCTTTAAGGTCAGTACCGTTAAGTGTTACCACCGTCGCTATAG
AGACGTCACTTCAGTCTAGCAAGGACGGCTAGAAAGTGCAGAGAGGACCG
GCTAAGTGGTCGACTTTTCAAATTGGGCCTTTTGATTTCAAGACACGCGG
AACCGACTGTCACTTGGCCATTTGCTCGCCCCGTTCGCCAACCACTTAAG
GTCGGCTGGGGAAATATTAGCTTTCGCATGGCAAACATGAATATGTGTAG
ACATAAGCACGGGAAAACAGTTCTTGTTAAATTTGATTTTCAACAGTCTT
CTCTTCGCTCCCCTTTAGAGTGATACGAGCGCATCCAAACGGTTTGTTAG
ATTAAGTCTGAAAGAGCGCAGAAGAACGGAGTAGTAGATTGTTGATCAAC
AGCTCATTGATTAAAGCAAGGAATTTTTGAGATAATTTTTAAATTTGCAA
AGCACTTCTTCTACATCTGATTTGAAGAAAATCTATCGTCTGCTGTTTCT
TAATCCTTTTAAATCAAGACCTTTTAGTGAATGGAGATGACCACAAATTG
GCCCCTGTGTGACCGTGATGCGAACACAGATAGCTGTGTCCCCCTGTCGC
CTGCAAATTTGCCTGACAAACAGAAGACAGAAGGGTGGTTTTCTCGGGTG
TTGTCTTCCAACATGCATGTTTTTGTCGCGATTTTAATTTGAACTAGTCG
TATGGATGAGCGCGGCGACATGAAACGCCGCGCGACCATTGCACGCGCCG
ACTTTGATCAAAGCCTGTGTAATTCCATTGTCTATATGGATCAATCGGCC
ATGGATACCTGAACGCTGGGGGACCCAGAATGGCTTCCTCACCCAGGGGA
ATACACACGTAGTCTTGAAATTAAACTCCCACCAAATTTGTTTCTAAACT
ACCAAAATTACCCCAACACCACAAAGAGGTTAATTTTCCACCAGTTGTAA
AGCTGTTATACGGTTTAACAAATGGGCAAATAGCGTGCGAGAAGCGTGTT
GCACTTGTGTTGTGTATTTACAGCGGCAATGCTATCCTCTAGCGTCCACA
TGCGGGCACTATCCCCCCGCTCAGCGATGGGCCTGCCCTGCTTTTGGCCT
GTAGTGAACTCTAAGCACGGGAAGGGAAACCCCGAGCCCAAAATAAACAC
GGGGGGAAGGCTTCCCCCCCACTCAAGGCTGTCAAAGAGAAATTGATGAG
TGTGGGTCGGGAACTGAAACCTTAGGTGTCAAGGGTCAAACGCGAGAGCA
TCAGTTATACTTAGACAATCGCTACTACAATATGTCACAATCTCGGCAGG
GAGAGGTCACCCCGGTACCGTGTTAGGACGGGACTTGAACGGTAGCCAAG
TCGGCAGGCGCCCTCCTCTGCAGGTGCGCGTTACGTATGCCTGTCGGAGA
GAGCGCCTGGCACTAGACAGCTACTTGTGTTACATACAGATAGAGGTGGT
AGTCTCTCGGGGACACCAAACCCATCTGCTACCCATGTACTATGTACCTG
TGCATGTTCTTATCAGTTATGTATAATAGGGCTGTACGCACGGCCCGGGA
CGGATGTAAAATAGGAATATTTCCTCCCTAACACTGCGGACTAACACCAC
GCTGTAGTTGTAGATGTTTATTATGATGTTGTTTTGTTGTGTAGTTGTAA
ACATGCACACCAACGGTGACACGCCTAGGGCGGGCGTGTGTGAGGTTATC
GCCTCTTGACCTGGCCTAGCGACCGGCACGGGTATTGTACCCACCGCCCA
ATAACACTGAACGCACTCTATAAAACGAGAGTTTTTTACGACTAACATTT
ATATATGTACTGTATATACACATTGATTGTCGTAACGTTATATATACCTG
GCGAGGAGCCAGAGAGCTGGTATATTCAGCCTTCCTGCTTAGAGCAGGAT
TTATCACAAGCGTGATATGATTTTCCAATTTAGTCGTTAAAACGACATAT
TTTATCATAGGCACGTTGCCGCCGTCACTTACCGTAAGGCTGGCGGCTGA
GAGTATTATACTGTGATTTATGACTTGTGTGTTTAACGTGCCATTGCCTA
TGCACACTTACATGCTTTGTTATAGCTTATGTATTTCTTAACGATGTATT
GATGCAAAGCTATTGGGCCTAACACATCTTTAAAGGGACGTTAAATCGCC
CAATACGCCGTCCCGGTTATGATATAATCTATGTGCTACTAACACTCACA
GCCACTTGAATGCGTTATTGTAGATAAACCAGCGGGTAAACATGTGCTTG
AGTTGTAGTGCTACGCGCGCTCCTTAAGTGCTGTTACCCCTGGTTTCTAA
CATTTAGGACAACATTGTGGCGATAATAGAAGGCTTTAAGAGGATGCTTA
TTTGCTCTTTGATAAAGAAAACTCCAAGCCACAGAGTTTTGAGAGCATAC
CAGCCTTCCGTGGTATCTATTATGTGCCCTCATTTGTATTGTTTGTTAGA
AAGGGCATTCATGTGATGCTTACGTATCTACCAGTCACTCTAGTTTTTCA
TCTAATTATGTCGTAAGCCGAACACGCCCTACTATTGGGATGTGCCTTGT
TGACACCGTTTTTAGCATGTTTTGAAGCGTAGTTAGTGATGTGTAAGTTA
GAGTGAAGTTTTATCAAGACGACATCTGCTCCTAGAGTCGCATAGTTTCA
TGTTTGCGACATTGTTTTGTGTGGAGCTAGGGCTGTGTCAATAGTGGTCC
GGCAGCTATTATTTAGATTGGCCACCGTAACGGCCACTATTGAATATTCC
GGGCTGACCGGCGGATGACCCCACGAGTGTCACTCGCTCGGAACGTGTTT
CTGTTGTTCGAGCTAACAGCAGAGCTGTGCAAAATGCACTGCCTCAGGGC
ACGTTGGGGTCTCCATGTGGCCCGTACAGTTCTCTCTCTGTTGTTGAAAA
TAGATTACTAGTCGGTACATCCGACCCGTTGTGCTGATTTCCACACTGAC
TTACTGCATGCTTGATGTGATGTTTCTTGTAGTGGGTAATGTGGGCCATA
TTGCTCGGCCCGGAGTGCCGTACCAAATCGGCTATTACTCAGTGAGGGGT
GTTTTTTTCACCCCGAATGTATGATCACATTGACTAACCCGTATGTCCCG
CATCTTGTGTTTTATGTCGGCCCACTGGGCTTTATATCGCGGGTTTAGTG
TATGATGATGCACAATTTAACCAATGTACTTACTGAAGCTAATATTTAAT
GTTTTAAATAATACATCATGTCGATCTGGGGTGTACCTTTCCTTGCCGAG
ATTGTAAAGACTACATAAAAAAACATAAAATTTTTAAAAATCCAATAAAC
ACACAGGACCTGAATTTTAAATTCCTTCAAATGTTAAATATTTTGACCCA
TACGTTTGAAAGCCTCTCATAACATCCCTGAGACACGCTCTGACACAGGT
TTCAAATGACCCTATCACAAAAGAATAAAAAAATGTTTCTAATTTTTAAA
GCAATTTGGCCTGAGAGTTGTTTAGTTTGCTGAATGAACTCTACTCTACT
CTGATACCAGAACAAAGAAGTCATATCGGAGAAGCCCTGCGCGCGACGAA
GCCATTCTGTGATCACTCAAGAAATTTATCTGAATTGATTTAGTTATTTA
GAGAGAAGTAATAGTCCCTGAGTAGTGGCTGATGAAATTATAACACCTCT
AGACGGGATGTAAGATAATGTAGAAGCGCATCTTTCAGGTGTCCCAGCGC
TGGGTATCATCTAATGATGTAGACTTACACGGTGGCATAAGATTAACGGG
ACGTTTGGATGCGTGTGTCAGTCAAACCGCCCTCCTCTTGCTAACGATAT
TCTCTCTCTCACACACTCTCTCACAGAGAACGTGCGCTGGGCCCCCACAT
GTTCTACAGAGGACTCCTCCTTTTCGGTACGTATTAGAGATTGCACAAAC
AAGATTCCCTCCCCTTGAATCACTGCAGACGACACGCAGGAATTAACAAA
AAGTACAAATCAGAAGCCTGCTACCGTCACCCCATGACCTGACCTTCCCA
AAGTCACAGCAATTAATAATGTTCTACGTTGATACCTGACAAGATAGGTC
ACCCGGGCTACAATAACCGCGTGGTAAACGGGACAGGCTCGTTAGTACTG
ACGTATTTAACACAGGCAGCCGGCAGATTAAAACTCGCTTTACGCTCTCT
ACTTGGCTTTAAAGTAGCGAATCCACACATTTATCTGTATAAGTTATTGG
GGGATGAAGCTACATGCTGGAAAAGTGTAATCTATGCAATATCTCTGAAT
AAATATGGTAAAAGAAAACAAACATGTCTTAATCTTAATATGCGATTGCG
ATTTATTTTGTTTTTTCTCTCTCTCATCAAGAATTCACTACTATCTTAGT
GATTTTTTTCGGTCTAAGAAACATACATAACAATACTGTGCTTGAGTCCT
GCCGTCAAAAAACATTATTTTATATCACAAGCCACTGTACAGTCGAACCT
TCAATATAGAGAAGTATGAAGTTCGCTTTGAGAATTTTTACCCTGTTCTC
CGATTCTTTGATTGTTAAATTACACTTCTCGAGATATGTACAGATGCCTA
CATCTCCTCAACTTTCATCATACAAACGTCTCTCACTCATACAAAGTAAT
AAATAACAATATAAATATAGACAAGAACCAACCTGACGATACTTTCACCT
GTATAACTTAAAAGAATATTCCACATATGACGTGAGTTCTAAAACGTGGG
GTGGGGGGTTTTGGAGGGAATGGAGAAGAAATGGTGGTATAGTGAGTTTT
CAGTCTTACGTCGACTTCGACGGGCTATCTTCACCGGCCGGAGACCCGCC
GCTACCCGGGGTGGAGAATCCGTTCTCTTTCTCCCGTTTCTTCTGTTTCA
TCCTGCGGTTCTGGAACCAGATCTTGACCTGAGTTTCGTTGAGGTTGAGG
GCTGCGGCGATCTCGACTCTTCTCGCCCGCGTGAGGTACTTGTTGTAGTG
AAACTCCTTTTCCAACTCCGTCAGTTGTTTGGTGGTGAAGTTGGTCCGTC
CGTTGTTGGGTCCGGACGTCGTGAAGCCATACTCTCCGGGCTTGCCTGGA
GTGAAAACACAACACCAAAACCTTCAACTTACGACAAAGACGACTCCTGT
TGGTGCTAAATCTTACGAGAAATTTTGGGTGTCCTATCAAATTTTATGTA
ATCGTAATTTCATGCATAAGGCAGGAGCCCCGTATTAGGCACAGCTTGCT
CCACTAAGGCATGGACGGTTTGTAGTACAAACACAACTTGTAAGCTGTCA
TACTTAGCCAAACAAAGGCCAACGTCTGAATACAAACGTTAGAGAGTCGT
AGTTGGTACGATTGACGAGATCTTGTTGACGCCGATGGTTTTATACCGGC
ACTACGAGCGATAACAGGCGGGGAGTCGCACGCGCCTGGTCCGTAAACAT
GTGCGCGCGGCCCCGATGACGGGGGTAGTGGTAGCGTAGGTTTGTAGGGC
AGGAGTAAGGACGGTTTTACCTACCTGTTCTTGGAGGGTTACGCTTTAGT
TTCATCCAGTCGTATGTGGCAACAGGGGGGGATGGTGCGGGAGGGTTGCA
GCTCGTGGAAATCATGGGGTCCTGCCCCGTATGGTGGTGCATGTATCCGT
ACTGAGAGTCCAAGGGTGGCGGGGCCACCGTCCCGTTCATTCCTGAGTTG
TACGACGAATAAGAACCGGCAAGCTCTGCCCCGAAACTCCCCGAGTACAT
AGCAGCGTGGTTGTTCGTCCCGTAACCATTGCCCATGTGGTGGCCGCCGG
GGTGAGAATAGTGGTTATACGAGTACGTTGTAAAATTCTGCGGGTCGCCG
TTCGACATGATCACCGGCGGGTCGTAAGGCGACGGGCCGGGGACGGGGCC
TGGGCCTGGCCCGGCCGACGGTGGGAGTTGCCCGCTCGGTCCCATCGTTA
CGTGTCGGTCAACATTGTTCATCGCGCACGACTGGTACGCGGGCACACCG
TAGTCTTGGCCATAGCTCCTCGGGGAGCAAGTGTTTTGGTCGCCGTTACA
CAGAGAGTAGTCCACGTACGAGTTCATTCTTGCCGTGTCCATTTGCTCCA
TCTGTCAAGCGAACGTTTCGATTTCGCCTGTCGAATTTGTCGATAAATGG
TGCTAAATTGCTCACTTGCTCTTCACATAGCCTGACACTGATATGGTTAC
TTTGTTACCCACGTGACAAACAGCGACCAATCAAAACAGCCAGAGCCTAT
TTGGTATGTTTATCAAGGTGATCCATCACGGAGCCTGACATCTAAATCAC
TGATGTTAAATTTATCAACCTAGGGCAAACCAGAGGCAAGCCGGTAAATT
GTATGCCAAGTTCAGTGAGTGTGCCGTGATTTTCCAGTACTATGGGGTGA
ATCGTACTGTAAAGGAGAGACGAAAGTCACCGGGACAAACCGGAGGATGT
CTCGGAGGACCCTACCACCGCTCCCGCCTGTGCTCTACAGGTAAACCCGT
CTTTTTAGGCCTCAAAAGTCTGACGACGATCGAGCTAGGTCTTGATCACG
ATCATTGCGTCTTCAACGGGGATGGGGAGGGGCGGCAACCGTAGTACACC
CCTGGCCACCTTTTTAAAATTTTTAAACCGTTTCTTCGAGTTTTGGTTGC
TTCTAAACAACTTCTAGGAATCAGAGTTGAGTGGAGTAACGGCAGTTTTT
TTATTTGAGTCGCTAGAGACCAGGATTTATTAAATATTTGCAGTATCCCA
AGCTCTTGTATGCCGAAGCTTGCGGTCATATCGACTGAAAGGCTCACCGA
AAGCCGCCTTGTGTTTGGGACGTTCTAATCGTTAGAAAAACCAGAGTAAT
CTAGCTAAGAAATAGGCTAAGACTTCGACTACTTCTTAAAAATGTGGGGA
GAGATTTGTCCCCAAACAGGACAAGAATCGGAGGATGTGGTTGGCCGGTT
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CGCGAGGCCTGCAGAAGACCTACACGTTCGGCACAAAACAAACACGTTTT
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TGAGAAATTAATTATGTGCCATTGATCCCCACGAAAAGTGTTACTTTGGG
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ACAGATCCTACCGCCCTAGGGGCTTCATTTTTTCCTCCTCGCCAACCATG
TCCCGTTCCCTGTTTTAAAATGTCAACCGTTTCCCTTCAAACACACGCCT
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CCTTCACAAGTGAAAACCTATGCATGCTTTCGCACCGTGCATATTGTCAC
AACAACTCAACAAAATTCACACAAAAGTGTGGCCTTTTTTGTCCCGTCTG
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CAAACGTTCTACAAGACTTTCATACGAAACTCCTTGTATTATCATGCATG
AGATGCTTTCTTTTTAACAGAAAGGTCATAATTTGTATCAATGGCTCTGC
AATCTTCTATTAACAAGGTTTGAAAGAGGAGTTTTCAACTTCTAATGACA
TAACACCGAAAACAACATCACCTATATGCACGCACACGTTTTATCTGTGC
TCATTGATCAGAATGCAGAGAAGAAAATTACGTTTGCAATGGGTGACAGT
ATACATAATTAAGTAAGAACAGATTCTCGAATACAGAAGGCACTAAGATC
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CATGTAACAATGTTTTCGGACATTGAATTTGTTCGAATCTGTAAAGCTTT
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GCGATCACGTTATGGCTTCATTTGATAAGTTTGTGCTTCACAATCAAACA
AGACTTTTGATATTTTTATATTATTTTTGCACCAAAGGTCTATACCTGTT
TTTATTTTTACATACAACCCTTGTATGAGCGAGTTATAGTAGACATATCC
TCCCCTTCCCTGCCAATGCATGGCCTGTTTCCCTACATTTCTAAAGGAAT
TCGGTGTTTGTTGATATTCTAAACACCCCCATGTGTTCCCATGTGCCTGG
AAGGCTTGAAAACAACACACTGGTCGACCTTATTGCAAATATTGAGATCG
ACATGGCCTGAACTCTGACATGACCCTTGTGTCGATAAGACTTTGCCCGG
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TTCATTTATTTCACTCAAGCCGGCACCCAACTTACAACTTGGCTTGCAAA
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TACCTGGCAACAACATGGCAGAGTTTGAAATAAACATTGGGGAATATTTT
AGAATGTTTTTGTGATGTTGTGTTTCTGGCAGCTCTCTCTACAGCTGTCT
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GCAGGGGCCCTGAAGTCACTCCTCGGACGTCACAAATCTTACGAGAGTTA
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TTCCAACAAAGAGACGGCGAGTGTCGATCGTCGGAGCGATAGCAGAGGGT
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ACGTTTGTGTAGGATAAAAGCCAGAAATTTTGACAAGAATTTATAAAAAT
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GAAAAATTAAAATTCTCTGTGAATGTGTGTGCCATATTTTTAAGTCTGTC
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ACCTTTACTAATCAAATCATAAGCTACAAATGAAGATATGAGAAACAAGA
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ATAACCTACTATTACAAATGATGTTTCGCCTGGTTTAACGGAGTAAAAAG
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TGTTATAATAGCTTCCTGCTACTTCATATGACATGCAGTTGTCAAAATNT
TTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGTCGGACTAACGTTCAATAAGT
TCTTCTGTCATTCACATGTTTAAGTATATCGTCAATATTTTATTTTCCAT
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CATTTATAATGATAAACACATCCATCAGTGTTGTTAGGACAAGTGTATTG
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Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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|---|
| BlTCONS00000287-exon-Sc0000000-1564993656:1802999..1803113 | BlTCONS00000287-exon-Sc0000000-1564993656:1802999..1803113 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
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| BlTCONS00000287-exon-Sc0000000-1564993656:1814000..1814173 | BlTCONS00000287-exon-Sc0000000-1564993656:1814000..1814173 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000000 | genome | Sc0000000:1802999..1814173 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | BlCUFF000158 |
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