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transcript from alignment at Sc0000000:1732807..1740753+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >BlTCONS00000269 ID=BlTCONS00000269|Name=BlTCONS00000269|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=transcript|length=7947bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000000:1732807..1740753+ (Branchiostoma lanceolatum) CCTGTTTCTATATTGAAGTAGTCCATCATTTTTCCAGAGAATTTTCCAGA
AAAGAATATATCCACCATCTTTGATGGTTTCTCGCAACAACAAGGGCTTT
GTGAGACGCCAAGGTAACCTTTACCAAGTGTCTTAGACGTCTACATGTTA
TGTCGTCCGGTTTGTGTTAAATCCTGGGAAAGACGCGTGTTACTATTTTT
AGCTCGGCTGCTGATTGGTTGCTATTTTTATCCCATTGTTTAACACGTTG
TTTATCTATTCATTACAGCTTTCCTTATGTTATAACAATGCCAATCTAGG
AACAAACAATTAAGGTGGCAGGTTTGTTTGTTAATGTTTTTTCTGTGTTA
TGTGTTGTAAATTTTGGACTTAAAGATAATTTAATAATTTGTTCCTTCAT
GCCATATGTTCAAAATTTTGTGTTGAGGTTCTTGCAATTAATGGGCAGAG
GAAAGTCTTCCATTTTACATCTGTATCCATATCTGTATAGCCGTTATACC
CGCCCGTTGGTGTAACACACCAGGCACAGGCACAGGAGTTCTTGTTATAA
GAAATTGTAAGGAAAGAAACAGGTTTAGCAATCAAGAGAACCATGATTGA
ATAAATCGTTCCACTGTTTTTTTGTGACAAAGTTTTAGTGACGGAGTAAA
ATGAACTGCTGTTAGCCTAATTGCAATGTGAAACAGGAGTCCATAGGACA
CACGCCTCTGTGATGTAATTAATTCACAGGAGCTTGATAATCAGTTGTGA
TAATAATGTATGAGAGTCTTTTATACTTAATGGTGTGAACGATTCTTTCA
TTAGAATTTAGATCATGTATAGATATTTGTATTTTATCTAAAGGTATCTT
AAAAGCAATCTTAGTTTAAAGATTCGGTACATTCAAAATGTTTGTTTGTT
TGTTTTGCATATCAGGTAAATCAACTGTTACATTATAGATATGCTATTGT
TAAAAAGTAAATGCATCATTTTTNACATTATAGATATGCTATTGTTAGAA
AGTAAATGCATCATTTTTAGCATTCAGTGTCAGTATACTAGTAAGTACAA
CCAAGGTCCTTGGTACAACTCACAGCTTCCACAGCCCAACTATCATCAAC
TGTGGGCGGCGTCTTACGTGATTCGTAACTTTGAAACCTTACTCTGACTG
CAAAGCATGCTGGGAGGTCATAAAAAGGACAGGATGTGGCGCTATGATTA
ATGGTCCCTGCAGAAGTCAACAAGGCCTCTCTAATCTGATATCTAATAGC
TCCCCGATCTATAACGTAATTTGAAAAATAATTGAGGTATGAAATCGGAA
AGGCTGCAGCTCGAGGGGTGTAATATGGAGGAAATAGCATTCCGTGCCGG
TATAGCTTTCACTTTTTATTCGGCGGCGTCAATCGAAGGATAATTCCATT
GTTTTGCCGTCGCAGGTTTCCACCGTTGGGATGTTAGGATTGATGCCTCG
AGTATACGTGAAAATATGCTTACCATCCAACAAACGGAAGAGCAACTATC
TGAAAAATACCTCAGACTATCTTCAAGTGATTTGTCTTCATTTGCTGGAG
AGTTAATCCCGTCCCTAGTGTAAGAAGATAGAGTTAGTATAGTACTTTCA
TTACAGTCCACATTCAATCTGAAAAACGGCTTATGATATTGGTGGTCGCC
GCCAAATTACAGAAATGCTTCGTTGATGTAATTTTGGGGCGGTTTAATAA
CATTTGGTGATATTGACAGTGTAGGGGTGACAATCTCTATTCTATTGCAT
CAGGACTGTGTTTTATCATTGGTACCATAATTCTAGACACTGCAACAGCA
TACATGTGCGACAAAAGCCACGCAAAATATCTTCAAAATATGTACATGTA
TCTGTTTCAATGCTAGAAATTATGTTTTCTTTAGCTATGAAATAGATACC
TAAAAGTACGGGAATAAAGGAAATACAATAATAAAATCTACTGTACTGGA
AAAAATCACACCCCTATAGCCTAACTTAAAAGGCCAGGGCCAACCATACC
TGTTTTGGTCAATTTCAATCATTACAACTGCCCTTGATGCAATCTAGTCT
GGGCACCATCCTCTGTAGTAACCACTGGCTCAAAATTTTTGCTTGCTATC
CTTTGTAGTAACTGTGGATAGCAAGCGAAAAGATTGAGCCAGCGGTTACT
ACGGAGGATGGTACCCGGGCTAGATACAATAACCAGCATTGAACTACAGT
CAAACCTGTAAAAGAGAACACTTCTATATAAGTGGTGGTCCCTTGGATAA
TTTCCCCATTGACACTTGTAACCCTGTTTATAGTGACCACCTGTCCACAT
AGACCAGCTTTTCTCGGTCCCCTGGGTGGTCTTCTTGGGAAGGTTTGACT
GTAATAACAAATGTTTACACTGATGATAATCTCTTCCTTATTCAGAACAC
ACTGAACACCTACTGAAGATAGACGTAAGCCAGTATGCTGTGATGACAAC
CGAACAGTGCCTGTTCAGCGCCATGTCCATCTGCTCAGTCCTGGAACATT
GGGACGCAGATGGCCATGGCACTGGTCAGGTATCTGCGAGGTGGCCGTGG
ATCACAAGAAGGAACACGAGAAACTGACCAGGATCACCGAGCGCTGGTCT
CATAGCAAACTGAAAGCAGTCAAGGCACTGGCGATGATAACGGTAATACA
ACTGATCCAGTGGTTTCCCGTGGCGATCGTTGGACTCCTAGCCAAGGCCA
CACCAATTTGATTTGTTGTTTCTCGGATTGAAAAAAAATATGCTTAACTG
GAAAAACATAATGAACACAAATAAACCTTGGTACGCTCAGTTTTATAGTG
ATTACAAACAGACATATCAAAGTTCTCCTCCCTGCCCTCTGCTTTTATGA
CCTCCGCTTTCTATACTCTTCCCTTAAAATGTCCGAGTACCAAGTGAATA
AATTGCTGTGGCCTAAGGTTTGAGCCATCACAAAGGACAGAGGACCCTTT
TCTTGTGCTTTTTCTAGACAATGGAGTCCGTGAAGGTTTTGGTCTCCCTA
ACCTTTTCGATTCCATCGTGTACACAGAGCGCAAGGATATCCACCATAGA
GCAGTGGACAAGGTTAACCACAAGATCAGGAAACGCTAGATATGCTCAAG
TCCTACATCTCTGAGCATAAGACTTACTGAGCGAGGTGTAAGTCTTGAGC
ATACAGTCATCCCCATACATATACATGTGTTACAGTTGACTGAAAGCAAC
TAAAATGTGTATTTATGAAGGTTAGACATCCAGGTAAACAGTATATGTTT
AGTTGTATGTAAAGACAATTTAAACTCTACAATTGGATATAGATTTGGAG
ATTTATTTTCGTAGATAAATCTCAGAATCTTTATCCAGTTGAAGAGTTTG
AATTGTCTTTATATACAACTAAAAGGTGGTGTGTTGTCTTTCTAATACCA
TTTTTGATTCGGCTGTTCTACTTTCTTAAAATTTGATGTCAATCCATTGA
AAACTAAGAGCTTGAATTGATTAAATGTGGCAAGGTATTAAGCTATCAGC
ATTTTGTCTGACAATAGAAAAATTGAAACCTCTGTATTACAAGATAATTG
CCTGGATTATAAGTAAACAAAGGAGGCGGATTGATATTGATGGCAGGTAA
GCATGATAAAATTCACTGTCAAAATTGGTACTAGTATACAAAGACCTTAA
TGAAAAAAAATTGTATTTTTTGTCATATTTTCTACTGAAATTCTAGTTTC
CTCCAAATGAGTGACAAACAATCATTCATTGTATTTTTGCCTATGGCAAG
AGAACGAGAGAGGAAGATAAAAAACATGCAGTTGGCGGATCAATTTTTCA
CGTCCAATCTTTCTCCTCATCATCCTCCCTTATCAATGGGTCTATCAGCA
CATCATATACTACTGAAGGAGCATGATAGGTTGGATTAATCATGTATTCA
CCTGCTTTTGTGGGCCAGAGCTTCGGCAATCGTTGTGATAAGAATGACCA
TCCATCTACCAGTCCCACTCGGCTCTGCAACAGGAAAAATCTCTGCTTCA
GCAAATCTTTCTTAAGTTAACCCTTCAGCTATTCTGGAAACAATTCTTTC
TTATGAATGCTTTAACCTTGAACTTAGTGTGGTTTTCTTAGAAATCTCTG
TTTGGTTCAGCAAATCTTTCTTAAGTTAGCCCTTCTGCTATGCTGGAAAC
AATTCTTTCTTATGAACGCTTTAACCTTGAACTTAGTGTGGTTTTCTTAA
AAAACTCTGTTTCAGCAAATCTTTCTTAAGTTAGCCCTTCAGCTATGCTG
AAAACAGTTCTTTCTTAGGCCAAGGCAATTTAATTTGTTGCTTCTCGGAA
TAGCCTGTCCTGTTTTTCCTACTTTGAAAAAAAAAATTGGGTCACAAATT
TCAACTCCCAATTTTACTATTTGTTCAGTTGTAAAACTCAATAGCCACCA
AAATAGATTATAAAGGCCTGAATGTACCTAAAAGTGTGGTCATATTGATC
ATAAGTTATAATTTTTCATTTAGTAAAACTATTTCTCAGTATCAATAGTG
CGGTGCTGCACTAGAGATCTCTCAAACCCACTGTTTTCAAAGTGGCAGAT
TTATGTACCTCGGCGGATTAATCTCAATGGAGGTTAGATGATAAATCAAA
ACTTAGCAACTCTACGCTCAAGTTCCTTCTTTACTACCTTGAATTTGTTT
TCGTCACGACAAACAACAAGCTGCATTGTGCCAGCCCTCACAACCTTATT
AACCTTAGGAAAGACCCCATCCCTTCACCCATCCATCCACCCACCTCCAG
CCGATGATGGGGTCCCAAACAGATTGGATTAAACAATTAAGAATGTAGGG
TGCCACCTCGCTGCTCTGTGTGACTGAAGATGTGCCCTGCTGTACAGAGA
TGTTATCAGAGTTGACTCTTGTTCGGACTACTTGTATCTGTGTGGTGATC
CATCATTCCCCGGGCAAGGTGTGACCGGCGAAGGTTTCCCTGATTGGGAG
TTCTCACCTGTGAGAGATGTTAAGCCCTTAAGAAACACCTGTCCGAGGTG
AACAGGAGATGAAGCCATGATTGGCACTTGGTTTACTTCCTGTTGACTTT
GTTGCAGCCACGATGCCTTTTGGAACATGTACAGTACTATATACATATTG
ATGGACCCAAACCTGGGATAGGGTTGTTTTTAAATCTTTTTAAACAATCA
TCGCACCCAGGATATATGGTTCTTTGTAGAAACAAAGAACTTCATTACGT
TGATGAAGGTTAGACATCCAGGTAATAAGATACGCCAAAAATAGTTACTC
AAGCAACTGGATAAAAACAACAGGAGCTAATTGACCTACTAGCATACCAC
CTCCCAGTTCCTTTCCTTTAGTCACTGATGAAAAATAGCGGATGCTGTCT
GAAATTTTATCCAGTTGCTTGAGTATCTATTTTTGGCATAAAGAACCCCA
TTATGTAGTCATTTACCAATCGGACGAAACTATTCACGGAAATTATCATA
CCCAGTTCTGCTAAATTATAGTTCTTGCCATACTTGTCCATATTAAGAGT
TACTTTTTTTCCAAATGCATGTTGCTGCTACACTATCCGCTGCAGTTAAG
CCATGATCACCATGAAGCTGGGGACTCTTCGCCGTGCTTGCTTTAGACAA
TTGAATCGGTGAAGGTGCTAGTCTTTGCATCCTTAACTGACTCCATTGTA
TTCACCAAGCACAGACTTTACATCTACCACAGAGCATTGGACAGGAGATA
GTGTCACGGCTGCATGTTCATTTTTTGGTTTGTTCATTCAGATCCTTGTA
GTGCAAAGTGGCAAATATAGGTCAGCATATTGGTAGCGTGCGTAGCCCAG
CGGTTAGCGATCTTGCCTTTGGAACTAGAAGTCCCGGGTTCGATTCCGGC
TGTGTTGCTCACCCGACATGCACGCTACCGGAAAGGGTTGCAGTCCTTAG
GACGGGACGTTAAGCCGTGGTCCACTGTTCGTTGTGCTTGTCGAAAAGAG
CTAGGGGAATTTCCCCGGTTCAATGAACTGTACATAGCGTCTGTCTTCTC
TGTCACGACCAGTGGAAGATTAGCACATCTGTTCCTTGAGTTCATTTGAG
CTTAACTGGTTCGAAATCACTTTCCTTTCCAAGTTTCCTTGCTGTTTCAG
TAGCAGGGTATATATTTACAGGTAGGGGTTGCTAACCCTTCGCCTTGAAC
ATGCTCAAGGCACCTCCTCAAACACAGGGTCCCCATTTTACGTGCCTGCC
AAAAGCAAGTGCAGCACCAACCAAATGATAGATAAATGCTAGAAATAGCA
CATCAAAATCGGAAAACTGTCATAAGTCTTTTTCAGCGGTAGCCTGTTTT
TCGTATTGTGCTCTTTGTGACTATAAATTCATTTGGAGCACCGGTATACA
GATAGCAACGCCTCACTATAGAATCACAGGTGCATCAAAACCACATCTTA
GGAGAAGTAGCCTCAGACCTTCAAGATTTTATTTAACTTGTAATTACCAG
GTATGAATTACAGATTGAAGTTCTTAAGAGAGGGTTTGTAATTATGTTTT
GCTGACGTTGTGATTTATGTCATGTTGTGCACCCAAAATTTCTGTGCACC
TAACTTTATAGGTTATGTGCACCAGTGCACCTATTCCCAAACCTGAATTT
AGAGCCCCGTGTCTCAGTAAAATGTCTGAAGCTATGAATAATGCCTTGCT
TTTCTTCCATATTGTTTCACAGCTTGCTTTGAATCCTGACATCATATATT
AAGCCTTTTCACTCCTCCCATTAATTATGGTAATGACAATAATTACATTT
TGCCAGAAGGTACTTTTTGTTACTTATCTGACAAATACTGTTTTTTTTGT
TATTCGATATATATTTGGTTATTTGATGGTTTTGAAGAAAAATCTAGACT
CAATATGTTGCAAGCAGCTTTTGCACTTGTCTTAATGTTGGTAAAAATTA
CACGCACAAAAAGCCTCTTTTTGCAGTAACATGGAAAATTTAGTCGCCTG
TGCCTTTTAAAGGTCTGAAAATTTAGAATAAAAACAGTATTTCATGTCTC
AGTTTTGCTGAGATTTCCAAACAACCACATGATCCTCTACTTTATTCCTT
TCCAGGCTTCCTAGTAACCAGCATCATGCATTTGTATGAGATTGGAAAAC
TGGCTTCCTGGCACCTGCAGTACCGAGTTTTTGTCCTAGAGGTCTCTTCC
CCTCCTGTGCAGGGCTGTGTGTTGGTGGATGGGTTAGGCAAGTTTGCATG
CAGCCAGGTTAGGGAGAAAGTCCCTCCATTTGTCTTCATCATTATTAATG
CACTGTTATGTTGTAATAATTGGGGTGCTCCATGGCAAGTATTTGTCACC
ATGAGGATCGCTTTCCAGCTAAGGAGTAAATACGCCCTATAATGGCGGCA
TTGTACGCTCGCGGTGGCGATACGTGCGCGTCATCTGTCTCACTTTATCT
ACCTGCCTCGCTTCTCAATTTCCCAACGAGCGCCAGAGGAGTATGCTGTA
ACGTTCTGGATGTCACAGAGCGAACATCGTCTATTGGGGTTGTGATATTT
CACAGGGTAGTAATAGAGTGTGCTGCGACTTATCAACCTCCGTGTCCCTA
AATCACCGGGATTTGTTGGGCCTCCTGTAGAAAGTGAGAAAGATGGACTT
GCTCAGGAGATAGGTTGATAGTAAGGTCATTTTATTAGCTATTGTATGGA
GCCTTATATAGAGGACAAGTAAAGGAACTAGGATTTTTTTGTAAAGAATC
AGATTACAGATGACAGAAAGCATGTTTTATTTAGAGATATGCCAAATTGT
TTGAAGCACAGTATCATACAATCTCAGTTCATCAGAATTATTGTAATAAA
CATAATGAAATAAGACCCTTAGTATTTTTCCTGAACATTATTTTTCATAT
AGAATTTTACAGTGTAGATGTAGATATAGAATTTTAAGGTTTGACTGCAA
AGGATGAGCAGATTGGTGACTAATTAACGTTTTATTTTCACAAATTC
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
BlTCONS00000269-exon-Sc0000000-1564993656:1732807..1732919 | BlTCONS00000269-exon-Sc0000000-1564993656:1732807..1732919 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
BlTCONS00000269-exon-Sc0000000-1564993656:1735202..1735448 | BlTCONS00000269-exon-Sc0000000-1564993656:1735202..1735448 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
BlTCONS00000269-exon-Sc0000000-1564993656:1739862..1740753 | BlTCONS00000269-exon-Sc0000000-1564993656:1739862..1740753 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000000 | genome | Sc0000000:1732807..1740753 + |
Properties
Property Name | Value |
GeneID | BlCUFF000142 |
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