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protein sequence of transcript:BL97416_cuf16 >transcript:BL97416_cuf16-protein ID=transcript:BL97416_cuf16-protein|Name=transcript:BL97416_cuf16|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=250bp
PCQPNPCDPINAQCIPEGDNFRCICRPGFQLAPDGRTCTEIDPCENNNCD SVNGRCLPTYAAGGVISFRCECNPGFQGDGIRCLRQDPCLNNNCDTANAR CIPQGNTFTCQCNPGFQGDGRTCLRIAPPEPADPCENNDCSVNGRCIPQG DSYTCECNPGFQGDGRTCTGIAPPEPADPCENNDCDANARCNPQGNSYTC ECKDGFQGDGRTCTRIAPADPCANNDCDPINGQCVPLGSPFTCICNAGFA Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000221:283356..293762- Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL97416_cuf16 ID=transcript:BL97416_cuf16|Name=transcript:BL97416_cuf16|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=10407bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000221:283356..293762- (Branchiostoma lanceolatum) CCCTGCCAACCCAACCCATGTGACCCAATCAATGCCCAGTGTATCCCAGA
AGGAGACAACTTCAGGTGTATATGTCGGCCAGGATTCCAGTTGGCTCCAG
ATGGAAGGACTTGTACCGGTGCGTCATCTTAACATTGATTCATAATCCAT
GCTGTCAGCTATGGTGGCTTTTCTGTCTCTGTGTTATAAGGATATAGAAA
ACATTGAATCTTTTTTTCTCATGAAATGATTCAATGAGTAACTACTGAAA
TTCAGATATTTTCATTTACAGAATGATAGTTTCCTGCGTTTCAGCACACT
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CCCACCACTTAACCCTTGTGTACCAAACCCGTGCGATCCATTCAATGGCC
TGTGTACTCCGGAGGGAAGGAACTTCAGGTGTAGCTGTAGGGCAGGGTTT
CAGTTAATGCCAGATTGCAGGACATGTACTTGAAAGTTGTAATGTACCGG
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CCTACAGCCAGCTAGAAAATGCTACCACTACACTTTCTTTCAAGTCTGAC
GACTCAAGCTATTTTTTCTTTTACCCGCTCAGATCTAGATGGTGCAAGCT
TTCTCCTAGTATTACTGCTGACTTTGGAGATACCATGTGCTCCTGACTTT
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AGAGAAGAAAAGCTTACAACTTCTGTTCCTTCTGGGTTTCACTGTGTAAA
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GCTAGTCCAGTTTTCATCAATGCCTCTGGTCCATGGGTCGAAATGCTGAC
AATACTGGGGCTTATACTTGTATTCCTTCATGTACAAGTAATAAAAGTGT
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TAATAGACAATATAGACTTCAAAAGCTTTTCTGTAGTGCTGTATGCAACA
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TAAGTGCTTTCATTATTGACAAGTCTGCTATCTGCCACCCTGGGGCCAAT
TTTGTGGTCATCTGTGAATTGCTGGGGCAATTTTTTATCATTCATTGCAT
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TGACTCTGTTAACGGCAGGTGTTTACCCACCTATGCTGCTGGAGGGGTCA
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CTTAAACAGTATTTCATTCAATTTGATAGCTTGAAATCATCTACAATGAG
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CTGTGACACTGCCAATGCCAGATGTATTCCACAAGGAAACACCTTCACCT
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TGCATGGGAACTGATCCAGATTTTATGGCCATACTTCTTATACATATTAG
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AGTGCAACCCTGGGTTCCAGGGAGACGGGAGAACCTGTACAGGTAAGTTA
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GTTTCTTGTAGGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGATCCATGTGAGAACA
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CTGTCCACTTTTATATTTGAGCAAGACAATAGATATATACCAGCTGATTT
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GTCCAGCAGTATGGCAACACTTCACATTTCCCTTTTACCTATCCTAGGCA
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TCACAACATAGCTACTTCTCTTTTCTGTGCTTCAATGTTTCTGTCTTTCA
ACACTCCCACCTTCTGTGTTCCATCCTTTAGCCGTTAATCCTTGCCAGAT
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ACATGTGTGAGTGTAACCCTGGGTACAGTGGCAATGGAAGAAGCTGTACC
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GTTTGCTGTCTTCTTCTCACACCTTGTGTTACATGTTTCAGCATCACATA
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CTTTTCATTACCTGATTATGCAGAGGCTTTCCCCAATAGCAGTTTTTCTA
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CCTGAACAATGCCTGTGACCGTAATGCTCGCTGTCAGGAGGATGCACTCA
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TATTGTTTTCTACTTCCAGGACAAGTAGTCGACCCCTGCAGCCCAAACCC
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GCACATGTAACCCTGGCTATCAGCTGTCATCAGACAGAAGGACATGTACT
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CAGAAAGAGAGTGTCTTTAAGGACGTTATCGATGATACTAGTAATATTCT
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GCATTCCACAAGGATCTACGTTCAGGTGCACTTGTAGTGCAGGGTTCCAG
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CCCAGTGTATCCCAGAAGGAGACAACTTCAGGTGTATATGTCGGCCAGGA
TTCCAGTTGGCTCCAGATGGAAGGACTTGTACCGGTGCGTCATCTTAACA
TTGATTCATAATCCATGCTGTCAGCTATGGTGGCTTTTCTGTCTCTGTGT
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TGAGTAACTACTGAAATTCAGATATTTTCATTTACAGAATGATAGTTTCC
TGCGTTTCAGCACACTTAATGTTGACCACCTTTACGTGTATATCACACTC
TTACAGCCGTTGTTATCCCACCACTTAACCCTTGTGTACCAAACCCGTGC
GATCCATTCAATGGCCTGTGTACTCCGGAGGGAAGGAACTTCAGGTGTAG
CTGTAGGGCAGGGTTTCAGTTAATGCCAGATTGCAGGACATGTACTTGAA
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AGATGTACTACTTCACTCTAATGACTGTTTTATCATTTACAGCAGAACTG
TTTTCTACACTTTTTTCTTTAATAGCTTTCTGATCTATCTATTTTGTCCT
ATTCTTTCAGCAATTGTAACAAACCCTTGTTAAGCAGCTTCTAGTGTTAT
TGTAGCGGCCTCTGTGTATTTATCCTGCAAGAATGTTGCACACATACCTT
TGTTTAGACTGACAACCAAGGAAAGCACCAGAAAGCTGTTAAGATGATTT
CTGTCCAAAAATCTCTTAATAGACAATATAGACTTCAAAAGCTTTTCTGT
AGTGCTGTATGCAACATTTGGCTGTTATGGCAAGGAAATAAGGGAAGTCA
GCCTCCTGTATGGAGCTAAGTGCTTTCATTATTGACAAGTCTGCTATCTG
CCACCCTGGGGCCAATTTTGTGGTCATCTGTGAATTGCTGGGGCAATTTT
TTATCATTCATTGCATTTGACGATGGACACACGTCACACTAAGAATATAT
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AGTTAATCAAACGTATTTTCTGTCCTTCTTTTTTATAGAAATTGACCCTT
GTGAGAACAACAACTGTGACTCTGTTAACGGCAGGTGTTTACCCACCTAT
GCTGCTGGAGGTGTCATATCCTTCAGATGCGAGTGTAACCCTGGCTTTCA
GGGAGATGGCATTCGGTGCTTACGTAAGTCCATTTAAGACTGAAATGTCT
TTGAATTTTCTAAGTTGTGCAAATTTCATGAGCTGCATGTCAGAAGGTCA
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CTGTACAGGTAAGTTACTGGATAAAACAATAGAGTAAAGCGTTAAAAGAC
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AGGGTGATGGGAGAACTTGTACCAGTAAGTTGACTGTTTTGATCTGTGTG
TGTAGTTAGCCAGTTGTCTTTGTTCAATTGAATTTTTCCTTTTTTGCTTT
ACATTAATTTTGTTTGTAAAAGGTTGGAGCGACGTTGATTTGAGTTTCTC
ATGTTAAATTGCATCACGGCTGTCCTAGCTGTCCACTTTTTTATTATGCC
CTGTGAGCAAGAGCAAGACAATAGATATATACCAGCTGATTTAGGCATAA
TTTGAAAAGGAGAAGGTGAAACATTGTGTTGATTTAAAGACAGTCCGGGA
GTATGGCAACACTTCACATTTCCCTTTTACCTATCCTAGGCACTTTCTGT
TTGTTCCTCATCTTTTTTCAATGCTTCAGTCTTGAACAGGGTTCACAACA
TAGCTACTTCTCTTTTCTGTACTTCAATGTTTCTGTCTTTCAACACTCCC
GCCTTCTGTATTCCATCCTTAAGCCGTTAACCCTTGCCAGATAAATGACT
GTGACTTGGTCAACGGGCACTGTGTCCCCCAGGGTCGCACTTACATGTGT
GAGTGTAACCCTGGGTACAGAGGCAATGGAAGAAGCTGTACCCGTAAGTC
ACACGCTCCAAGCCCTTTTCTTTCTCCTTGCATCTTCACTTGTCTGTTTG
CTGTCTTCTTCTCACACCTTGTGTTACATGTTTCATCATCACATACAACC
CAATAGTGATTTAATGTAGTCAAACTGTACAGTATTTTTCCCTTCTTTCA
GTTTTTATGTGATTCAATTGGTAAATTCTTACTCAAGGTGTAAGAAAACT
ATGTTTGTGTAATTTGAATTTAAGATAACTACTTAATTCTTGCTTGCAGG
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TTCGCAC Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000221:283356..293762- >transcript:BL97416_cuf16 ID=transcript:BL97416_cuf16|Name=transcript:BL97416_cuf16|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=4500bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000221:283356..293762- (Branchiostoma lanceolatum) CCCTGCCAACCCAACCCATGTGACCCAATCAATGCCCAGTGTATCCCAGA AGGAGACAACTTCAGGTGTATATGTCGGCCAGGATTCCAGTTGGCTCCAG ATGGAAGGACTTGTACCGAAATTGACCCTTGTGAGAACAACAACTGTGAC TCTGTTAACGGCAGGTGTTTACCCACCTATGCTGCTGGAGGTGTCATATC CTTCAGATGCGAGTGTAACCCTGGCTTTCAGGGAGATGGCATTCGGTGCT TACGACAGGACCCATGCCTTAACAACAACTGTGACACTGCCAATGCCAGA TGTATTCCACAAGGAAACACCTTCACCTGCCAGTGTAACCCAGGTTTTCA AGGGGATGGAAGAACTTGTTTACGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGACC CATGTGAGAACAATGACTGCTCGGTGAATGGCCGATGTATCCCACAAGGT GACAGCTACACCTGCGAGTGCAACCCTGGGTTCCAGGGAGACGGGAGAAC CTGTACAGGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGATCCATGTGAGAACAACG ACTGCGACGCCAATGCCAGATGTAACCCACAAGGCAACAGTTACACCTGC GAGTGTAAGGATGGTTTCCAGGGTGATGGGAGAACTTGTACCAGGATTGC TCCTGCAGACCCATGTGCAAACAACGACTGTGACCCTATCAATGGCCAGT GTGTGCCGCTGGGATCGCCTTTCACCTGTATCTGTAACGCTGGTTTCGCA CCCTGCCAACCCAACCCATGTGACCCAATCAATGCCCAGTGTATCCCAGA AGGAGACAACTTCAGGTGTATATGTCGGCCAGGATTCCAGTTGGCTCCAG ATGGAAGGACTTGTACCGAAATTGACCCTTGTGAGAACAACAACTGTGAC TCTGTTAACGGCAGGTGTTTACCCACCTATGCTGCTGGAGGTGTCATATC CTTCAGATGCGAGTGTAACCCTGGCTTTCAGGGAGATGGCATTCGGTGCT TACGACAGGACCCATGCCTTAACAACAACTGTGACACTGCCAATGCCAGA TGTATTCCACAAGGAAACACCTTCACCTGCCAGTGTAACCCAGGTTTTCA AGGGGATGGAAGAACTTGTTTACGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGACC CATGTGAGAACAATGACTGCTCGGTGAATGGCCGATGTATCCCACAAGGT GACAGCTACACCTGCGAGTGCAACCCTGGGTTCCAGGGAGACGGGAGAAC CTGTACAGGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGATCCATGTGAGAACAACG ACTGCGACGCCAATGCCAGATGTAACCCACAAGGCAACAGTTACACCTGC GAGTGTAAGGATGGTTTCCAGGGTGATGGGAGAACTTGTACCAGGATTGC TCCTGCAGACCCATGTGCAAACAACGACTGTGACCCTATCAATGGCCAGT GTGTGCCGCTGGGATCGCCTTTCACCTGTATCTGTAACGCTGGTTTCGCA CCCTGCCAACCCAACCCATGTGACCCAATCAATGCCCAGTGTATCCCAGA AGGAGACAACTTCAGGTGTATATGTCGGCCAGGATTCCAGTTGGCTCCAG ATGGAAGGACTTGTACCGAAATTGACCCTTGTGAGAACAACAACTGTGAC TCTGTTAACGGCAGGTGTTTACCCACCTATGCTGCTGGAGGTGTCATATC CTTCAGATGCGAGTGTAACCCTGGCTTTCAGGGAGATGGCATTCGGTGCT TACGACAGGACCCATGCCTTAACAACAACTGTGACACTGCCAATGCCAGA TGTATTCCACAAGGAAACACCTTCACCTGCCAGTGTAACCCAGGTTTTCA AGGGGATGGAAGAACTTGTTTACGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGACC CATGTGAGAACAATGACTGCTCGGTGAATGGCCGATGTATCCCACAAGGT GACAGCTACACCTGCGAGTGCAACCCTGGGTTCCAGGGAGACGGGAGAAC CTGTACAGGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGATCCATGTGAGAACAACG ACTGCGACGCCAATGCCAGATGTAACCCACAAGGCAACAGTTACACCTGC GAGTGTAAGGATGGTTTCCAGGGTGATGGGAGAACTTGTACCAGGATTGC TCCTGCAGACCCATGTGCAAACAACGACTGTGACCCTATCAATGGCCAGT GTGTGCCGCTGGGATCGCCTTTCACCTGTATCTGTAACGCTGGTTTCGCA CCCTGCCAACCCAACCCATGTGACCCAATCAATGCCCAGTGTATCCCAGA AGGAGACAACTTCAGGTGTATATGTCGGCCAGGATTCCAGTTGGCTCCAG ATGGAAGGACTTGTACCGAAATTGACCCTTGTGAGAACAACAACTGTGAC TCTGTTAACGGCAGGTGTTTACCCACCTATGCTGCTGGAGGTGTCATATC CTTCAGATGCGAGTGTAACCCTGGCTTTCAGGGAGATGGCATTCGGTGCT TACGACAGGACCCATGCCTTAACAACAACTGTGACACTGCCAATGCCAGA TGTATTCCACAAGGAAACACCTTCACCTGCCAGTGTAACCCAGGTTTTCA AGGGGATGGAAGAACTTGTTTACGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGACC CATGTGAGAACAATGACTGCTCGGTGAATGGCCGATGTATCCCACAAGGT GACAGCTACACCTGCGAGTGCAACCCTGGGTTCCAGGGAGACGGGAGAAC CTGTACAGGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGATCCATGTGAGAACAACG ACTGCGACGCCAATGCCAGATGTAACCCACAAGGCAACAGTTACACCTGC GAGTGTAAGGATGGTTTCCAGGGTGATGGGAGAACTTGTACCAGGATTGC TCCTGCAGACCCATGTGCAAACAACGACTGTGACCCTATCAATGGCCAGT GTGTGCCGCTGGGATCGCCTTTCACCTGTATCTGTAACGCTGGTTTCGCA CCCTGCCAACCCAACCCATGTGACCCAATCAATGCCCAGTGTATCCCAGA AGGAGACAACTTCAGGTGTATATGTCGGCCAGGATTCCAGTTGGCTCCAG ATGGAAGGACTTGTACCGAAATTGACCCTTGTGAGAACAACAACTGTGAC TCTGTTAACGGCAGGTGTTTACCCACCTATGCTGCTGGAGGTGTCATATC CTTCAGATGCGAGTGTAACCCTGGCTTTCAGGGAGATGGCATTCGGTGCT TACGACAGGACCCATGCCTTAACAACAACTGTGACACTGCCAATGCCAGA TGTATTCCACAAGGAAACACCTTCACCTGCCAGTGTAACCCAGGTTTTCA AGGGGATGGAAGAACTTGTTTACGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGACC CATGTGAGAACAATGACTGCTCGGTGAATGGCCGATGTATCCCACAAGGT GACAGCTACACCTGCGAGTGCAACCCTGGGTTCCAGGGAGACGGGAGAAC CTGTACAGGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGATCCATGTGAGAACAACG ACTGCGACGCCAATGCCAGATGTAACCCACAAGGCAACAGTTACACCTGC GAGTGTAAGGATGGTTTCCAGGGTGATGGGAGAACTTGTACCAGGATTGC TCCTGCAGACCCATGTGCAAACAACGACTGTGACCCTATCAATGGCCAGT GTGTGCCGCTGGGATCGCCTTTCACCTGTATCTGTAACGCTGGTTTCGCA CCCTGCCAACCCAACCCATGTGACCCAATCAATGCCCAGTGTATCCCAGA AGGAGACAACTTCAGGTGTATATGTCGGCCAGGATTCCAGTTGGCTCCAG ATGGAAGGACTTGTACCGAAATTGACCCTTGTGAGAACAACAACTGTGAC TCTGTTAACGGCAGGTGTTTACCCACCTATGCTGCTGGAGGTGTCATATC CTTCAGATGCGAGTGTAACCCTGGCTTTCAGGGAGATGGCATTCGGTGCT TACGACAGGACCCATGCCTTAACAACAACTGTGACACTGCCAATGCCAGA TGTATTCCACAAGGAAACACCTTCACCTGCCAGTGTAACCCAGGTTTTCA AGGGGATGGAAGAACTTGTTTACGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGACC CATGTGAGAACAATGACTGCTCGGTGAATGGCCGATGTATCCCACAAGGT GACAGCTACACCTGCGAGTGCAACCCTGGGTTCCAGGGAGACGGGAGAAC CTGTACAGGGATTGCACCACCAGAACCAGCAGATCCATGTGAGAACAACG ACTGCGACGCCAATGCCAGATGTAACCCACAAGGCAACAGTTACACCTGC GAGTGTAAGGATGGTTTCCAGGGTGATGGGAGAACTTGTACCAGGATTGC TCCTGCAGACCCATGTGCAAACAACGACTGTGACCCTATCAATGGCCAGT GTGTGCCGCTGGGATCGCCTTTCACCTGTATCTGTAACGCTGGTTTCGCA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000221 | genome | Sc0000221:283356..293762 - |
Properties
Property Name | Value |
Transcript id | BL97416_cuf16 |
Biotype | protein_coding |
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