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protein sequence of transcript:BL97312_cuf6 >transcript:BL97312_cuf6-protein ID=transcript:BL97312_cuf6-protein|Name=transcript:BL97312_cuf6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=617bp
VGGWTEWTPWSACAVTCGAGTSLRSRSCTNPLPSLPDLTCEGSAVQTTTC MAESDCEGCPAGQVYHSCLPCPWTCLDKQNNVECVQQECVPGCGCPSGHL MSGDSCVEEDSCPCSYVDPADSGASPILYSDGDVVSDSCNNCTCTAGHFS CSQLVCDVDCTWNSWSTWSACTKSCGVGERSRHRTYNPAQGSGAQCASLW YTTETQDCNTQACSVNGEWGQWSAWTPCDANCDGGSSYRSRACDNPPPKN GGNDCEGEHSEMSLCNTDPCGGTCPDGQVYDTCATTCGHRCSDFHQDVAC VDAEECTPGCRCPQGWYLQNGECVLRSQCECVDSQGQQWAPGSTQMQGCN NCTCADGKVTCGTDSCPVDCVWSAWSSWTSCSATCGSATRTRYRSDNNPP ASSGGAACEGVSVETQGCELPLCPAVCYGPNGEVAQVGDTYQPHPCTECQ CTANDWSCQIIPCSQAGSWSAWSEWSVCPVTCGSGHQSRVRTCSDPAPLY GGADCEGSSTEVQPCGQEACPAPEQCSLQTEVRNLTRGDCVATGVEVQFC SGACPSYTDIVFTEPYVVTVCECCSYVLDALQPTRFVAMTCGGGGEDSLV LPRIASCGCASEHCPDK Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000038:1608460..1622298+ Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL97312_cuf6 ID=transcript:BL97312_cuf6|Name=transcript:BL97312_cuf6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=13839bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000038:1608460..1622298+ (Branchiostoma lanceolatum) CTGTAAGTACATGCAAATACTCTTTACTATAAATTTCAAGTCTTTACATT
TCATTACTGACCAATATCAAAGATATACGTTTGCAATTTCGACCAAACTT
ACCAGATTTTGTTAGTGCAAAATGTTGCGAACAATGCATGTGTTGAATCT
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GCGCAGGAACATCACTACGGTCTAGGAGCTGCACCAATCCCCTGCCTTCA
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ACGGTTCCTTGGCAACGATTGTACTTTTGGTTAGTCCAGATGAACATGAC
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AGGTCTTTGTACGGATCAATGTTTTGTTTGACTCCATACTTCAGCATTTG
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GAATCTTCTGGAAGTTGTCACAGTGACTGTGACATTAACAAGCTGACAGT
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GACGACGCGACCGGCTGATTCCACCATGCCGATGGTCAAGCCCGTGTACA
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GAGATCTGTGGGGCAGCCGAGAAGATCGCCGGCTACGAAACAATGGAGGG
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AGTTGCCCCAGGGTGGTCAGCTTGGGAAGTCTGGACCCCCTGCTCTAAGT
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CGTTATTGCACCGATCCACCGCCCTCCGCTGGTCAGGACTTCTGTGTCGG
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GTGACTGTGAAGGTACATACAGCAACATGATACTATAATGCACTAGCAGT
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GTACCACTTCTGATCAGTTTTCTTTTCTGTACTGTGGTTAGGAGGTCTTT
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TGCGGCCTCAGTAACTTATCCACTATGGTATTTACGTAATCCCTTTGGAA
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AATTTCATAGTAAATTGCCATGATTGATGTACCCTTTAAAAGTGATATCT
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ATAGCTTCTTTCACTCCTCTTGGAAAAAAAGATTTGTACTAATTGCATAT
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TGCAGCTACGTGGATCCTGCTGATTCAGGTGATATTCCTCCACTTGGCAG
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TTCATGTACATTGTATGACACACCAGTATATTCTATTTTGAACAATATTG
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GGCATCTAGCTTATTAGTTTATGAATGCAGGTTGCTTGATGAGCAACCCA
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TTTTTATTGCTGTTCAGTTAAGCTGTTGTAGATGTGTTTGTTTTGTTAAG
TATAAGCTTAAGCAACTATTGTGTTAAGGTGGAGCTTACCTTGTTCAGAA
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GGCTAACAGTGTTTTTATCATGAAATGTACACATGTGTACTATACATGTA
TGTATTGTAAACTTGATGGGCTATAAGCAATTATCATTGTTTATAATCAA
TGTATATCAATCATTGATTAATTTCTTGTCAGGTGCCAGCCCAATCTTAT
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TGTATCATCGATAGCTTTTTCCTTTATCATGTACTGTATGTATTGTACCC
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GCTTGGAAATCTTTAGTGATGAGTGTTTAAAGGGACATAATTATTGTTAG
AAATAGCCTCAACCAGGTTTCACTATTTCAGCACCTGCACAGCTGGGCAT
TTCAGCTGCAGCCAGCTGGTATGTGATGTGGACTGCACCTGGAACAGCTG
GTCGACCTGGTCTGCCTGTACCAAGTCCTGCGGGGTCGGTGAGAGGTCAC
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CTGTGGTACACCACAGAAACACAGGACTGTAACACACAAGCCTGCTCAGG
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TTAACCCATACAATACTGGTGTGCATTGAATCGTACAGTCTGCATATACC
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TAGCTTACGTGATGTTCAAATTCATCCAACAAAATTGTGTATACATAATA
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CGACCCGGCCCCTCTGTACGGAGGCGCCGACTGTGAGGGAAGCAGCACGG
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ATTATACTCTTATCAACAGAGAACTATTGTACAATGTATGTTCGTTTGCA
TTGAATACCATTAGATTGCCTCATTGCATTAAGTTGGTTTTTATGTGACC
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CAGCGCCAGAGCAGTGTTCCCTGCAGACCGAGGTGCGTAACCTGACCCGT
GGGGACTGCGTGGCTACTGGAGTGGAGGTGCAGTTCTGCTCGGGGGCGTG
CCCCTCGTATACCGACATCGTGTTCACCGAGCCGTACGTGGTGACGGTGT
GCGAGTGTTGCTCCTACGTGCTGGATGCCCTGCAGCCCACGCGGTTTGTC
GCCATGACCTGCGGCGGCGGTGGGGAGGACTCCCTGGTGCTGCCGCGCAT
CGCCAGCTGCGGCTGTGCCTCCGAACACTGTCCTGACAAGTAAGGACACA
TCAATAGTCATGTTACTGTAAATGTCTTTAAGTTAGAGTGGTTTTTATTA
TGTGGTAGGGAGAAAATGGAGTGTTCACGGTGGTTTTTAGTTCAAGTTTT
GGACAATAGTAGACAAGGCGGTGGTTTTAAGTTCACAGCAAAATATCTGC
GTTTACAGCATTTTTTTGTTTTAATGTCTCACATATCATGATATGCGTAA
TGATATATACATAATATATACATGTACATCTGTTGCCTTCTAAAAGGAGT
GAAAATTATTTGGCATGATATTCATCAGACATCATTGATTACCCCTGCAT
TGTAGATATACATCTGGGACAGTACATTGAAATAGTGGCTAGACGTTAGA
AACTCTACAAAATAACTTTTTTAATGAATCGCTGTGCAAATTATCTTCTG
TCATCATATACAGTCATGCATTACTGATGATCAGTGTACATTAAGTAATT
GATTTGTTTTGTGTTGATTAATGATACAAAGCTAAACTGTTGTGCCAATA
AACAATCAATTGAAAATGTGCCAAAATTGATATTATATTAAACTGTAACA
TGCAATATTCTTTGATCAAGAAGAAAAAAATGTCCGAATTACACAATGTT
ACTGCTAACTCTTCCCTAATTTCTTAGTCCCCCTGCAAATTGTCTAAATC
TGCAGTCAGACATTGATACCTTTACCTTTGTGTTACAGGTAACAAACAAA
TCCAGATGGCCTGGACAGGACATGGACAGGACAAATGATGAAATAGTCTG
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000038 | genome | Sc0000038:1608460..1622298 + |
Properties
Property Name | Value |
Transcript id | BL97312_cuf6 |
Biotype | protein_coding |
|