transcript:BL97221_cuf11 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL97221_cuf11
Unique Nametranscript:BL97221_cuf11
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL97221_cuf11

>transcript:BL97221_cuf11-protein ID=transcript:BL97221_cuf11-protein|Name=transcript:BL97221_cuf11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=252bp
RIGAEISLTLPSILPHRRTLTRASLPQTERSMNPAALCAWGVAALVLMSA
QAAPTGDSKKHKDIFEINQEAGLLGRACPGFKCDIDCDFGYDTDKDGCFV
CRCIPEDKESVYQGDMVLGRQGKRRFLHGDSGNRAAITSWQWPGGVIPYV
IDQSIGSDGRSAITQAIADFHKHTCLRFIPRTDEEAYIKFYYGHGCFSPV
GYYGRSHEISLGAGCWYKGIAIHEIMHSLGFYHEQSRPDRDDYVEIVWDN
IQ
Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000031:1036919..1048991-

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL97221_cuf11 ID=transcript:BL97221_cuf11|Name=transcript:BL97221_cuf11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=12073bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000031:1036919..1048991- (Branchiostoma lanceolatum)
GGCGGATCGGCGCTGAAATATCCCTGACATTGCCGTCAATTTTGCCTCAC AGGTGAGAATTCATTCACTTTACAGATTCTAGATCTCTGAGACAGTTGCC TTCTGTCGCTATGAGCACGGTTCTACTCGCTACGTTGCAGATTATTTACA CATAGCGCCACCCAGGCGACATCCGTATCGACTCGTCGATAAAGGTTGGA CATCCAGGTAATACGATACGTCAAACAACAGTTACTCAAGCTACTGGATA TGATTTAGGAAACGGGCAGACGTTTCAAGTAGCATCCACTACACAGTCAC TAACGAAAAGTAGTGGATGCTACTGTAAACGTCTGACCTTTTAATTTTCC AAAACCATATCCAGTCGCTTGAGTAACTGTTATTTGGCGTCATCAGTGTC GAATGATGTGCCATCGATGTTGGGCAGGGCAGGGTTAAGCAAATGTTGGT AAATTATCGCTTAGATTTCAAAACTTATGCGTCTGTTGTTTCGCGCGCTT GCGTCAGTTAGACAACAACATGATATCCTGATGCACGCTCTTTTTTAAGG CCACCGTTTCTGTGATTGACTTTCTGTTATAACGCCCCGATGTCAAGGAC TGATGAGTTTAGGTGCGGTTACAAATGCCCCTATGTCATGACGTTTTAAG AGTACAGAACTACATCTGATAATGGTCCCTCTCAGCTGGTCCCTCTACAA CGTCTACGGTTTTCTCCTCCGGTCAAAATTCAACTACGGCGTCGTTTACC ACACTACAGCGTACCCTAGCCAACTATGACGCAAGCAACTGTGATGTCAC CCGTCTCGCCCGTACGTTACCTCCCGTGACCTCGGGATGGAATTTGGATG GCTCAATGTTGCCAGCTTTATGTCTCAGAGTCTTCGTTTCTTTTTTGATA TGTCATCAATGTTATTTTGTTTGTTTTATTCTTAAGTTATATCATCATCA TTGTCACGTGTATGTAACGTTAAAACGTGAAGGCAATTCTGCTTTCTGTC TAATTCTCCAGATACAAATGTGAATAAGATAAAGAAATGCAATTGCACGC TAGTGAATTAGTAAGAAAGCGTTAACAAACGTCGTTCATGTTTGCGATGC GACACCAGACGAACGTTGACTCGTGCCTCCCTTCCCCAGACGGAGAGAAG CATGAACCCCGCAGCGCTGTGTGCCTGGGGAGTGGCCGCCCTGGTGCTCA TGTCCGCTCAAGCAGCTCCTACAGGTCAGCAAGTAGATTTTATTCACAGC TGATGTTGATGCGATGTGCCGTCTTGTCTAACTGTTATTCCAGATTGTTT GATTTTTATTTTATTTGTTACCTACATTGACATCTTGAGCCATTGATATT TCTTGTTAGGTAACATTGTTGTCAAAGTGTGTCACCTATGTTGCTCATAA TATCTCTTTACCTATCACTGCTGTTGCCCTCCTCTTCCGCAAACATTGTT CTTCTGTCTTGTTTATGTTACCAAACGTTTTTGTTTGAATATCACCAAGC CTCGTACATAAATACATACCTCGATGTTGCATGACATTGACCCCGTTCAC ACTCATTTTTTTCAATCGCGATTGAAGTATAATCGCGATTGAATCGATCC GATCGCGATTGATTTTTTCAGTGTGAACGCTCCCAATCGCGATTGGAACG ATCCAAAACGATCCAATCGCGATTGGATTGTAACTACCTCCGGAGGTAGT TTGATTGGATTAATCGTGATCGGATCCAATCCAATCCTATCAAATTTTGA GTGTGAACACAACTACGATTCATTCCATCGCGATCGGCGGAGATTTCGGC TGGTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAACAACAA CAACTTTTCATCGTCAACAATGCCCAAGAAGAAGAATAAAACTCCGTCAG CAACTTCAGCTGGTGGCAGATGGCGCGATGAGGAGACCAGGGTCCTCATC GCAATCTGGGGGAGAGAGGAGGTGCAGGCCAAACTGGGGAAATGTCACCG AAAGAGGGACATTTACCGCACCAAGTGACAATGTCTAGCGGAAAAATAGA CACAAAACAAGGACAACAAGGACAACAACAACATTTACCAGATGATCGCC GATAGCATGCTTCAATCGTGCTTCAATCGCGATCGGATCACGGCGTACTT TAATCCACTTGGCGAAAAGCAGTGTGAACGCAAAAGTTTCTTTGCGTTCA ATCGCGATCGGATCGAACAATCGCGATTATACTTCAATCGCGATTGAAAA AAATGAGTGTGAACGGGGTCATTGTTCTTNTTGTCTCTGTTATCGACAAG TTACATTTTTCTGCACCTCATGAGAGACAAACTTATTTCTGTTCCGCTTG AAAAGTGACAAGCTGAGGTGGTAGCGGGGTGAAAACTGTTTATCGCATTT GTCTAGTCCTGCATTGGTCTTCATTCCCACATGAGGACCCACCTTGCCAA ATGACTTGTATGCCTACACATCTGTCTAGTCGACAGTAGAATCCATCAGC AAAGTAAACTTGAAATCACTCCGAAGCTGATTTGGAATATCTTTAACTTG AATAACATTTCACTTTCTCTCGTCGTTCTTTCTCCAGGAGACTCCAAGAA GCACAAAGATATCTTCGAGATCAACCAAGAGGCGGGTAAGACGATGCATT TACGTATTGATGAAAATAACTGTTTTATAATATGTCTTGAATGAATGGGT GTCTATCACATATATCCTTATATTCACTGGTACCATTCAATTTGTTAAAT GTGTCCACATGCATGTTTCCTTCACCGTTACCATTCAATTTGTTACATGT GTCCATATGCTTGTTCATTCACTGTTGCCAATAAATTTGTTACATGTCAT TAAAAGTCAAGTCAACTTTATTGCGCAATAATTGCATCAGATACAACAAT GTATGGCAAATAACATGGAGTTTTAACAACTACGTACGAAATGAACAATT ATATCACAGGTAACATTGATCTAGAATATAAGTGCTTAAAACGTGTTCTG ATAAACTTATTCGACAGGGTTGCTTGGACGAGCCTGCCCTGGCTTCAAGT GCGACATCGATTGCGATTTTGGATACGACACCGACAAAGATGGCTGCTTC GTCTGTCGGTGCATCCCAGGTAAGACCTCTACAATAATATACACTATATT CCCCACCCTCTTCCAACGAGGTTACGCAGGATACACCCCCACCGACTTTA AATGGTCTTGTGGCGTGGCGTTGGCGTATCGGCTAGGCTGTTTGGCCCAG AACCCAGAGGTCCTGGGTTCGAATCCCCTGACATGCCACCGATTTTGTGC TCCTGATGATGGCACTTTACACTACTGTCCTCAGTGCATCCAGGTGTAAA AATGGGTACCTGACTTCGGTTGGGGAGGTAAAAGACAGTGAAAGGAGAGG GATAGGCTCCACCTTCCAATACCTTGTCCTACACACAGTGGATAAAAGCC CACTACCCCTACGGCCTCGAAAAAGCAACTACCTTTAACTTATCAAGCTT AGTGTTCTTTGTAGGTGGCGCTGTTAGAATAAGTTAGTAATTTGAGAGCT GGGTCGTATTATTCTTGTCTCTGTCCAAGTCAGAACTCGTGTGTAATCGT AGTTTTGAGTGTGGATAGGAAGGATCTGCAGAGAGACGATTCTTATTCAT TTTGCTTGTTTATTAGAGAGCGGAGTTTTATTCATCTTTGTCATCTATGT CCAAACACACACACACACACACAGAGGATAAAGAGTCGGTGTACCAGGGA GACATGGTGTTGGGCCGACAAGGAAAGCGCAGATTCCTGCATGGAGACAG CGGGAACCGTGCTGCCATTACCAGCTGGCAATGGCCCGGAGGAGTCATCC CTTACGTCATTGACCAGTCCATCGGTATGTACAAACCTTCTAACATGTTC TGAAGTTGACAAAAATTGGATCTTACGGTAATACCCTGATTTTATACTTC CAGTCTTTGTCACGAAATGAGCCGTCCACTGGAATCCCTTTAAAATACAT TTACCTACAATCAAAACCTGAAATCTTTACCACACCTGCAAAAGTGAATT TTGTTAGTTTTGTTTAGGTAAAGAAACAGGAGGTCAATGCCGGCATTTTA ACGAGCTACAGTCCGCAGTTTTACATGAGACCAGGATTCACCCCCTGTCC TAATGGATCAGTCCAACCAGTGGCGAAATATTGAGGGTCAATCATATGTC AAAACATGCCAAACGTCACATATTTGGGGCAGAATTTAAAATGCTTCTAG GGAGGACAAAAAAATGTGTCTTTTAAATTTCTGTAGCTGTATAGATTTTN AGCTGTATAGATTTTTTATACAGCCGCTAGGGTGAAGTGGAGCCGGGAGA ATGAAGAACGATCATCAGGGTCCTGAATACGTGGTCTGTTCAGTAAAGTT TTCGAATTTTCGTCGTCAGAAGAAGAGGAATGGAACTTGACACCCGTGAT AGATATCGAAGGACTAAGTAGTGTGTCAAGTTTGAATTTCATACTCCACG TCTTCGAAAACCGTTAAGGAGCCTACTTGTTTCTCATAAGGCTTACTGAA CTCTAGATCAACACCTTTCCTTTTAACATTAGGATCAGATGGAAGGAGCG CAATCACTCAAGCTATCGCAGACTTCCACAAGCACACCTGTCTCCGCTTC ATCCCAAGAACCGATGAGGAGGCCTACATCAAGTTCTACTATGGCCACGG GTAAAACTGTTGCTTGTTTTCGGGATCAGGACGATTCGGCCCTTTACCAA CTCTGCCCTACACCCTGGTCAACTTCTTGGATTAGGTTAGGGCTAGGATG TTGGGCAGAGTTGACCAGGGTGTTGGGCAAAGTTGACCAGAGTGTTGGGC CGAGTTGACCAGGGTGTTGGGCCGATTTGGTCTGATTAACCATGGGCCGA GTTGATAAAGAGACGAAGCGTCCGGCATCCCTTGCGTCCTCATAGACTTG TTTACTAATAAGTAGGATAGCCTTGGGCTCGGATAGGTTTCAAAGTTGAG GTATGAGGAAAATCTGTTAATTTTCTAACAATATACGCTGTCCTGAACAA CTTTTTGTCGATACTTAAAGTGAAATCTATAATTGTTAATTATTGGGAGA CAAACAGTCGTATAGCATTCAAAGTCCTTTGATATTCCGTGTGTTTACAG GTGCTTTTCTCCTGTCGGCTACTATGGACGTTCTCACGAGATCTCCCTTG GTGCCGGCTGCTGGTACAAAGGCATAGCGATCCACGAGATCATGCACTCC CTCGGCTTCTACCACGAGCAGTCGCGCCCCGACAGGGACGACTACGTCGA GATAGTGTGGGACAATATTCAAT

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000031:1036919..1048991-

>transcript:BL97221_cuf11 ID=transcript:BL97221_cuf11|Name=transcript:BL97221_cuf11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=5292bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000031:1036919..1048991- (Branchiostoma lanceolatum)
CGGATCGGCGCTGAAATATCCCTGACATTGCCGTCAATTTTGCCTCACAG
ACGAACGTTGACTCGTGCCTCCCTTCCCCAGACGGAGAGAAGCATGAACC
CCGCAGCGCTGTGTGCCTGGGGAGTGGCCGCCCTGGTGCTCATGTCCGCT
CAAGCAGCTCCTACAGGAGACTCCAAGAAGCACAAAGATATCTTCGAGAT
CAACCAAGAGGCGGGGTTGCTTGGACGAGCCTGCCCTGGCTTCAAGTGCG
ACATCGATTGCGATTTTGGATACGACACCGACAAAGATGGCTGCTTCGTC
TGTCGGTGCATCCCAGAGGATAAAGAGTCGGTGTACCAGGGAGACATGGT
GTTGGGCCGACAAGGAAAGCGCAGATTCCTGCATGGAGACAGCGGGAACC
GTGCTGCCATTACCAGCTGGCAATGGCCCGGAGGAGTCATCCCTTACGTC
ATTGACCAGTCCATCGGATCAGATGGAAGGAGCGCAATCACTCAAGCTAT
CGCAGACTTCCACAAGCACACCTGTCTCCGCTTCATCCCAAGAACCGATG
AGGAGGCCTACATCAAGTTCTACTATGGCCACGGGTGCTTTTCTCCTGTC
GGCTACTATGGACGTTCTCACGAGATCTCCCTTGGTGCCGGCTGCTGGTA
CAAAGGCATAGCGATCCACGAGATCATGCACTCCCTCGGCTTCTACCACG
AGCAGTCGCGCCCCGACAGGGACGACTACGTCGAGATAGTGTGGGACAAT
ATTCAACGGATCGGCGCTGAAATATCCCTGACATTGCCGTCAATTTTGCC
TCACAGACGAACGTTGACTCGTGCCTCCCTTCCCCAGACGGAGAGAAGCA
TGAACCCCGCAGCGCTGTGTGCCTGGGGAGTGGCCGCCCTGGTGCTCATG
TCCGCTCAAGCAGCTCCTACAGGAGACTCCAAGAAGCACAAAGATATCTT
CGAGATCAACCAAGAGGCGGGGTTGCTTGGACGAGCCTGCCCTGGCTTCA
AGTGCGACATCGATTGCGATTTTGGATACGACACCGACAAAGATGGCTGC
TTCGTCTGTCGGTGCATCCCAGAGGATAAAGAGTCGGTGTACCAGGGAGA
CATGGTGTTGGGCCGACAAGGAAAGCGCAGATTCCTGCATGGAGACAGCG
GGAACCGTGCTGCCATTACCAGCTGGCAATGGCCCGGAGGAGTCATCCCT
TACGTCATTGACCAGTCCATCGGATCAGATGGAAGGAGCGCAATCACTCA
AGCTATCGCAGACTTCCACAAGCACACCTGTCTCCGCTTCATCCCAAGAA
CCGATGAGGAGGCCTACATCAAGTTCTACTATGGCCACGGGTGCTTTTCT
CCTGTCGGCTACTATGGACGTTCTCACGAGATCTCCCTTGGTGCCGGCTG
CTGGTACAAAGGCATAGCGATCCACGAGATCATGCACTCCCTCGGCTTCT
ACCACGAGCAGTCGCGCCCCGACAGGGACGACTACGTCGAGATAGTGTGG
GACAATATTCAACGGATCGGCGCTGAAATATCCCTGACATTGCCGTCAAT
TTTGCCTCACAGACGAACGTTGACTCGTGCCTCCCTTCCCCAGACGGAGA
GAAGCATGAACCCCGCAGCGCTGTGTGCCTGGGGAGTGGCCGCCCTGGTG
CTCATGTCCGCTCAAGCAGCTCCTACAGGAGACTCCAAGAAGCACAAAGA
TATCTTCGAGATCAACCAAGAGGCGGGGTTGCTTGGACGAGCCTGCCCTG
GCTTCAAGTGCGACATCGATTGCGATTTTGGATACGACACCGACAAAGAT
GGCTGCTTCGTCTGTCGGTGCATCCCAGAGGATAAAGAGTCGGTGTACCA
GGGAGACATGGTGTTGGGCCGACAAGGAAAGCGCAGATTCCTGCATGGAG
ACAGCGGGAACCGTGCTGCCATTACCAGCTGGCAATGGCCCGGAGGAGTC
ATCCCTTACGTCATTGACCAGTCCATCGGATCAGATGGAAGGAGCGCAAT
CACTCAAGCTATCGCAGACTTCCACAAGCACACCTGTCTCCGCTTCATCC
CAAGAACCGATGAGGAGGCCTACATCAAGTTCTACTATGGCCACGGGTGC
TTTTCTCCTGTCGGCTACTATGGACGTTCTCACGAGATCTCCCTTGGTGC
CGGCTGCTGGTACAAAGGCATAGCGATCCACGAGATCATGCACTCCCTCG
GCTTCTACCACGAGCAGTCGCGCCCCGACAGGGACGACTACGTCGAGATA
GTGTGGGACAATATTCAACGGATCGGCGCTGAAATATCCCTGACATTGCC
GTCAATTTTGCCTCACAGACGAACGTTGACTCGTGCCTCCCTTCCCCAGA
CGGAGAGAAGCATGAACCCCGCAGCGCTGTGTGCCTGGGGAGTGGCCGCC
CTGGTGCTCATGTCCGCTCAAGCAGCTCCTACAGGAGACTCCAAGAAGCA
CAAAGATATCTTCGAGATCAACCAAGAGGCGGGGTTGCTTGGACGAGCCT
GCCCTGGCTTCAAGTGCGACATCGATTGCGATTTTGGATACGACACCGAC
AAAGATGGCTGCTTCGTCTGTCGGTGCATCCCAGAGGATAAAGAGTCGGT
GTACCAGGGAGACATGGTGTTGGGCCGACAAGGAAAGCGCAGATTCCTGC
ATGGAGACAGCGGGAACCGTGCTGCCATTACCAGCTGGCAATGGCCCGGA
GGAGTCATCCCTTACGTCATTGACCAGTCCATCGGATCAGATGGAAGGAG
CGCAATCACTCAAGCTATCGCAGACTTCCACAAGCACACCTGTCTCCGCT
TCATCCCAAGAACCGATGAGGAGGCCTACATCAAGTTCTACTATGGCCAC
GGGTGCTTTTCTCCTGTCGGCTACTATGGACGTTCTCACGAGATCTCCCT
TGGTGCCGGCTGCTGGTACAAAGGCATAGCGATCCACGAGATCATGCACT
CCCTCGGCTTCTACCACGAGCAGTCGCGCCCCGACAGGGACGACTACGTC
GAGATAGTGTGGGACAATATTCAACGGATCGGCGCTGAAATATCCCTGAC
ATTGCCGTCAATTTTGCCTCACAGACGAACGTTGACTCGTGCCTCCCTTC
CCCAGACGGAGAGAAGCATGAACCCCGCAGCGCTGTGTGCCTGGGGAGTG
GCCGCCCTGGTGCTCATGTCCGCTCAAGCAGCTCCTACAGGAGACTCCAA
GAAGCACAAAGATATCTTCGAGATCAACCAAGAGGCGGGGTTGCTTGGAC
GAGCCTGCCCTGGCTTCAAGTGCGACATCGATTGCGATTTTGGATACGAC
ACCGACAAAGATGGCTGCTTCGTCTGTCGGTGCATCCCAGAGGATAAAGA
GTCGGTGTACCAGGGAGACATGGTGTTGGGCCGACAAGGAAAGCGCAGAT
TCCTGCATGGAGACAGCGGGAACCGTGCTGCCATTACCAGCTGGCAATGG
CCCGGAGGAGTCATCCCTTACGTCATTGACCAGTCCATCGGATCAGATGG
AAGGAGCGCAATCACTCAAGCTATCGCAGACTTCCACAAGCACACCTGTC
TCCGCTTCATCCCAAGAACCGATGAGGAGGCCTACATCAAGTTCTACTAT
GGCCACGGGTGCTTTTCTCCTGTCGGCTACTATGGACGTTCTCACGAGAT
CTCCCTTGGTGCCGGCTGCTGGTACAAAGGCATAGCGATCCACGAGATCA
TGCACTCCCTCGGCTTCTACCACGAGCAGTCGCGCCCCGACAGGGACGAC
TACGTCGAGATAGTGTGGGACAATATTCAACGGATCGGCGCTGAAATATC
CCTGACATTGCCGTCAATTTTGCCTCACAGACGAACGTTGACTCGTGCCT
CCCTTCCCCAGACGGAGAGAAGCATGAACCCCGCAGCGCTGTGTGCCTGG
GGAGTGGCCGCCCTGGTGCTCATGTCCGCTCAAGCAGCTCCTACAGGAGA
CTCCAAGAAGCACAAAGATATCTTCGAGATCAACCAAGAGGCGGGGTTGC
TTGGACGAGCCTGCCCTGGCTTCAAGTGCGACATCGATTGCGATTTTGGA
TACGACACCGACAAAGATGGCTGCTTCGTCTGTCGGTGCATCCCAGAGGA
TAAAGAGTCGGTGTACCAGGGAGACATGGTGTTGGGCCGACAAGGAAAGC
GCAGATTCCTGCATGGAGACAGCGGGAACCGTGCTGCCATTACCAGCTGG
CAATGGCCCGGAGGAGTCATCCCTTACGTCATTGACCAGTCCATCGGATC
AGATGGAAGGAGCGCAATCACTCAAGCTATCGCAGACTTCCACAAGCACA
CCTGTCTCCGCTTCATCCCAAGAACCGATGAGGAGGCCTACATCAAGTTC
TACTATGGCCACGGGTGCTTTTCTCCTGTCGGCTACTATGGACGTTCTCA
CGAGATCTCCCTTGGTGCCGGCTGCTGGTACAAAGGCATAGCGATCCACG
AGATCATGCACTCCCTCGGCTTCTACCACGAGCAGTCGCGCCCCGACAGG
GACGACTACGTCGAGATAGTGTGGGACAATATTCAACGGATCGGCGCTGA
AATATCCCTGACATTGCCGTCAATTTTGCCTCACAGACGAACGTTGACTC
GTGCCTCCCTTCCCCAGACGGAGAGAAGCATGAACCCCGCAGCGCTGTGT
GCCTGGGGAGTGGCCGCCCTGGTGCTCATGTCCGCTCAAGCAGCTCCTAC
AGGAGACTCCAAGAAGCACAAAGATATCTTCGAGATCAACCAAGAGGCGG
GGTTGCTTGGACGAGCCTGCCCTGGCTTCAAGTGCGACATCGATTGCGAT
TTTGGATACGACACCGACAAAGATGGCTGCTTCGTCTGTCGGTGCATCCC
AGAGGATAAAGAGTCGGTGTACCAGGGAGACATGGTGTTGGGCCGACAAG
GAAAGCGCAGATTCCTGCATGGAGACAGCGGGAACCGTGCTGCCATTACC
AGCTGGCAATGGCCCGGAGGAGTCATCCCTTACGTCATTGACCAGTCCAT
CGGATCAGATGGAAGGAGCGCAATCACTCAAGCTATCGCAGACTTCCACA
AGCACACCTGTCTCCGCTTCATCCCAAGAACCGATGAGGAGGCCTACATC
AAGTTCTACTATGGCCACGGGTGCTTTTCTCCTGTCGGCTACTATGGACG
TTCTCACGAGATCTCCCTTGGTGCCGGCTGCTGGTACAAAGGCATAGCGA
TCCACGAGATCATGCACTCCCTCGGCTTCTACCACGAGCAGTCGCGCCCC
GACAGGGACGACTACGTCGAGATAGTGTGGGACAATATTCAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL97221gene:BL97221Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL97221_cuf11transcript:BL97221_cuf11-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BL97221_cuf11-E1BL97221_cuf11-E1-1564476830-179191Branchiostoma lanceolatumexon
BL97221_cuf11-E2BL97221_cuf11-E2-1564476830-179188Branchiostoma lanceolatumexon
BL97221_cuf11-E3BL97221_cuf11-E3-1564476830-179186Branchiostoma lanceolatumexon
BL97221_cuf11-E4BL97221_cuf11-E4-1564476830-179184Branchiostoma lanceolatumexon
BL97221_cuf11-E5BL97221_cuf11-E5-1564476830-179182Branchiostoma lanceolatumexon
BL97221_cuf11-E6BL97221_cuf11-E6-1564476830-179180Branchiostoma lanceolatumexon
BL97221_cuf11-E7BL97221_cuf11-E7-1564476830-179178Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000031genomeSc0000031:1036919..1048991 -
Properties
Property NameValue
Transcript idBL97221_cuf11
Biotypeprotein_coding