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protein sequence of transcript:BL96925_cuf4 >transcript:BL96925_cuf4-protein ID=transcript:BL96925_cuf4-protein|Name=transcript:BL96925_cuf4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=307bp
PPELIYLRDGLDPDKDARYSASTTELTANWMFIDEETGVDYLELQVYQKH GGTRSPIGQSVTLDGGSQNWTSTQPLTLNIGALYTIRVHAINAAGLTAVH ETDGVLIDPTPPEILFIHAGVLSGMDEELTNSFVVVANTGILAASWLGLD GESGIDAYWIGLGTTHGGDDVVGFYNVGEVTDIILTELTLNLFENGSPIY YVSVRAQNGAGAFSTTVTSSPIKVVAADVSGIVFDGAGSKELSEMASTAI DVDFQLETTTASLHFEGFESAQHGIAAYEWGIGTSPGSDDVQPFTDMGIV SLEVSGQ Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000014:2353082..2358142+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL96925_cuf4 ID=transcript:BL96925_cuf4|Name=transcript:BL96925_cuf4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=5061bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000014:2353082..2358142+ (Branchiostoma lanceolatum) TCCTCCAGAACTGATTTACCTTCGCGACGGCTTGGACCCTGATAAAGACG
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ACAGTCTAAACCTACACAAGCCATGTCAAAGTAGTTCCATAGATTTTCAT
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GCTCTATTTGTCTAGTAATATCTTGTTAATACCAATCAACATATTTTATG
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TAACAGACATCATTCTAACAGAGCTTACCCTTAACCTTTTCGAAAACGGA
TCCCCGATCTACTACGTTTCAGTCAGGGCACAGAATGGTGCTGGGGCTTT
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TGTCTTCCTTTACAACAGTATCACATTATTGCTCTCTTATCTAACAATCT
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ATTGAACACTTGATCCTTAACTGTTACTGTAACAGTGAAGTTGACTTTAC
TCTAATTCCTCCATTGGTTTGTCATTGTCGGTCAAAGATGTTTGACTTAG
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AGTCCTATCAAGGTAGTAGCAGCTGATGTCAGTGGAATAGTGTTTGACGG
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AGAATGGACCGTAGGAGACAACGAAAGTTCCATTGCGGGGGGGTGGTTTG
CCATTGGGTCTTCACCAGCCAGTGCTGACGTGTACAATAGCACGAACACG
AACAAGAGAACCAGTCTTCCAGCTGGCCTTCTAACACCTTCTACTGATGG
CACTCCAAATATAGTGACTGTGTCTGCAATAAACAAGGTAAGGGTCATGT
AACTTACAACTTTTTTTTTTACTTCGATGTAATTGATTATGTTAAGGACA
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ATTGTGGCCCTACAATTAGTACAAACGTTAATTTCGCTACTTACATGACC
ATTGTTGCTCAGACAGAAAGGCCAGCCAAACACTGCAGCTATGACCAGTA
GCTGGTGTCATGGGGTTTGCAGACCAACTTTATTTATTTAAGTATTACAG
ACATGACAGATGAGTTTGTAACAGGGCATCCTTTAGATGGTGTATTAGTT
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GATGTTTCTCCTCCAGTTGTTTTTGACGCGACTCCACCGGAGCATGTCGA
TGACATGGCATGTCCTCAGCACATATCCGGCGAGGTGCCGTTCACATGTA
GCTGGGACGGCATCAACGACCAAGAAAGTGGCATTCAACATTACATCGTC
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AATGTATTTCTATCATGTACTGTATCTAACTCTGTATCTCCACAGGCCAA
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TGACTGAACTTATTTTTTACCTTATTACAATTACATGATTATAATCTTGT
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GACATCAAGTCCTATCAAGGTAGTAGCAGCTGATGTCAGTGGAATAGTGT TTGACGGTGCTGGATCCAAAGAACTGAGTGAAATGGCATCTACAGCGATA GATGTCGATTTCCAATTGGAAACGACGACAGCGAGTCTGCATTTTGAAGG GTTTGAGAGTGCCCAACACGGCATTGCCGCCTACGAGTGGGGAATAGGGA CCAGTCCTGGCTCTGATGATGTTCAGCCTTTCACAGACATGGGAATTGTG TCACTAGAAGTGTCAGGGCAATAACCTCCAGAACTGATTTACCTTCGCGA CGGCTTGGACCCTGATAAAGACGCACGATATTCAGCAAGTACCACAGAGT TGACAGCAAACTGGATGTTTATCGACGAGGAAACAGGTGTGGACTACCTC GAGCTGCAGGTGTACCAGAAACATGGCGGTACGAGGAGCCCTATTGGACA AAGTGTTACTCTTGATGGAGGATCGCAGAACTGGACGTCAACTCAGCCGC TAACTCTAAATATTGGTGCCCTCTACACCATCAGAGTACACGCCATCAAC GCCGCTGGACTAACAGCAGTTCATGAGACCGACGGTGTTCTTATTGATCC AACACCCCCTGAGATCCTATTTATTCATGCTGGAGTCCTCTCCGGAATGG ATGAAGAGCTGACAAACAGTTTCGTTGTCGTTGCGAACACGGGAATCCTC GCTGCCAGTTGGTTGGGTCTGGATGGGGAAAGTGGAATAGATGCCTACTG GATAGGGTTGGGAACTACCCATGGAGGAGACGATGTAGTGGGATTCTACA ACGTAGGAGAAGTAACAGACATCATTCTAACAGAGCTTACCCTTAACCTT TTCGAAAACGGATCCCCGATCTACTACGTTTCAGTCAGGGCACAGAATGG TGCTGGGGCTTTCTCAACTACAGTGACATCAAGTCCTATCAAGGTAGTAG CAGCTGATGTCAGTGGAATAGTGTTTGACGGTGCTGGATCCAAAGAACTG AGTGAAATGGCATCTACAGCGATAGATGTCGATTTCCAATTGGAAACGAC GACAGCGAGTCTGCATTTTGAAGGGTTTGAGAGTGCCCAACACGGCATTG CCGCCTACGAGTGGGGAATAGGGACCAGTCCTGGCTCTGATGATGTTCAG CCTTTCACAGACATGGGAATTGTGTCACTAGAAGTGTCAGGGCAATAACC TCCAGAACTGATTTACCTTCGCGACGGCTTGGACCCTGATAAAGACGCAC GATATTCAGCAAGTACCACAGAGTTGACAGCAAACTGGATGTTTATCGAC GAGGAAACAGGTGTGGACTACCTCGAGCTGCAGGTGTACCAGAAACATGG CGGTACGAGGAGCCCTATTGGACAAAGTGTTACTCTTGATGGAGGATCGC AGAACTGGACGTCAACTCAGCCGCTAACTCTAAATATTGGTGCCCTCTAC ACCATCAGAGTACACGCCATCAACGCCGCTGGACTAACAGCAGTTCATGA GACCGACGGTGTTCTTATTGATCCAACACCCCCTGAGATCCTATTTATTC ATGCTGGAGTCCTCTCCGGAATGGATGAAGAGCTGACAAACAGTTTCGTT GTCGTTGCGAACACGGGAATCCTCGCTGCCAGTTGGTTGGGTCTGGATGG GGAAAGTGGAATAGATGCCTACTGGATAGGGTTGGGAACTACCCATGGAG GAGACGATGTAGTGGGATTCTACAACGTAGGAGAAGTAACAGACATCATT CTAACAGAGCTTACCCTTAACCTTTTCGAAAACGGATCCCCGATCTACTA CGTTTCAGTCAGGGCACAGAATGGTGCTGGGGCTTTCTCAACTACAGTGA CATCAAGTCCTATCAAGGTAGTAGCAGCTGATGTCAGTGGAATAGTGTTT GACGGTGCTGGATCCAAAGAACTGAGTGAAATGGCATCTACAGCGATAGA TGTCGATTTCCAATTGGAAACGACGACAGCGAGTCTGCATTTTGAAGGGT TTGAGAGTGCCCAACACGGCATTGCCGCCTACGAGTGGGGAATAGGGACC AGTCCTGGCTCTGATGATGTTCAGCCTTTCACAGACATGGGAATTGTGTC ACTAGAAGTGTCAGGGCAATAACCTCCAGAACTGATTTACCTTCGCGACG GCTTGGACCCTGATAAAGACGCACGATATTCAGCAAGTACCACAGAGTTG ACAGCAAACTGGATGTTTATCGACGAGGAAACAGGTGTGGACTACCTCGA GCTGCAGGTGTACCAGAAACATGGCGGTACGAGGAGCCCTATTGGACAAA GTGTTACTCTTGATGGAGGATCGCAGAACTGGACGTCAACTCAGCCGCTA ACTCTAAATATTGGTGCCCTCTACACCATCAGAGTACACGCCATCAACGC CGCTGGACTAACAGCAGTTCATGAGACCGACGGTGTTCTTATTGATCCAA CACCCCCTGAGATCCTATTTATTCATGCTGGAGTCCTCTCCGGAATGGAT GAAGAGCTGACAAACAGTTTCGTTGTCGTTGCGAACACGGGAATCCTCGC TGCCAGTTGGTTGGGTCTGGATGGGGAAAGTGGAATAGATGCCTACTGGA TAGGGTTGGGAACTACCCATGGAGGAGACGATGTAGTGGGATTCTACAAC GTAGGAGAAGTAACAGACATCATTCTAACAGAGCTTACCCTTAACCTTTT CGAAAACGGATCCCCGATCTACTACGTTTCAGTCAGGGCACAGAATGGTG CTGGGGCTTTCTCAACTACAGTGACATCAAGTCCTATCAAGGTAGTAGCA GCTGATGTCAGTGGAATAGTGTTTGACGGTGCTGGATCCAAAGAACTGAG TGAAATGGCATCTACAGCGATAGATGTCGATTTCCAATTGGAAACGACGA CAGCGAGTCTGCATTTTGAAGGGTTTGAGAGTGCCCAACACGGCATTGCC GCCTACGAGTGGGGAATAGGGACCAGTCCTGGCTCTGATGATGTTCAGCC TTTCACAGACATGGGAATTGTGTCACTAGAAGTGTCAGGGCAATAACCTC CAGAACTGATTTACCTTCGCGACGGCTTGGACCCTGATAAAGACGCACGA TATTCAGCAAGTACCACAGAGTTGACAGCAAACTGGATGTTTATCGACGA GGAAACAGGTGTGGACTACCTCGAGCTGCAGGTGTACCAGAAACATGGCG GTACGAGGAGCCCTATTGGACAAAGTGTTACTCTTGATGGAGGATCGCAG AACTGGACGTCAACTCAGCCGCTAACTCTAAATATTGGTGCCCTCTACAC CATCAGAGTACACGCCATCAACGCCGCTGGACTAACAGCAGTTCATGAGA CCGACGGTGTTCTTATTGATCCAACACCCCCTGAGATCCTATTTATTCAT GCTGGAGTCCTCTCCGGAATGGATGAAGAGCTGACAAACAGTTTCGTTGT CGTTGCGAACACGGGAATCCTCGCTGCCAGTTGGTTGGGTCTGGATGGGG AAAGTGGAATAGATGCCTACTGGATAGGGTTGGGAACTACCCATGGAGGA GACGATGTAGTGGGATTCTACAACGTAGGAGAAGTAACAGACATCATTCT AACAGAGCTTACCCTTAACCTTTTCGAAAACGGATCCCCGATCTACTACG TTTCAGTCAGGGCACAGAATGGTGCTGGGGCTTTCTCAACTACAGTGACA TCAAGTCCTATCAAGGTAGTAGCAGCTGATGTCAGTGGAATAGTGTTTGA CGGTGCTGGATCCAAAGAACTGAGTGAAATGGCATCTACAGCGATAGATG 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000014 | genome | Sc0000014:2353082..2358142 + |
Properties
Property Name | Value |
Transcript id | BL96925_cuf4 |
Biotype | protein_coding |
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