transcript:BL96797_cuf19 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL96797_cuf19
Unique Nametranscript:BL96797_cuf19
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL96797_cuf19

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EAKV
Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000071:960704..977178-

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000071:960704..977178-

>transcript:BL96797_cuf19 ID=transcript:BL96797_cuf19|Name=transcript:BL96797_cuf19|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1386bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000071:960704..977178- (Branchiostoma lanceolatum)
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TCTAAGTGCCCTTGTTGACTACTGCCGCCCAGGCCTGGTTCCTCACTGGA
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ATGTGAAGGAGGATGGACCAGGCTATGATGCTGCTCTCGAGGCCCTCAAC
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GGGGTTGATCTGGACGCTGATCCAGCACTACCAGCTCAGCCGAGGCAGCG
GGCAGAAGGGGTCCAAGTACTCCCCCAAGAAGCACATGCTCCTCTGGCTG
CAGACGGTCCTCCCAGAATGCCGCATCACAAACCTCTCCACAGACTGGAA
TGATGGGATAGCTCTAAGTGCCCTTGTTGACTACTGCCGCCCAGGCCTGG
TTCCTCACTGGAGGAGTCTGAACCGCCAGGATGCCTTACAGAACTGTCGC
AACGCCATGGACATCGCTGAGAGGGAGTTCAACATCCCTCAGGTTGTGAG
CCCAGAGGACTTCTCAGACCCGTCCCTAGATGAGCTGTCTGGGATGACAT
ACCTGTCCTACTATGTGAAGGAGGATGGACCAGGCTATGATGCTGCTCTC
GAGGCCCTCAACAGCCTGGTGCCTGAGGCTAAGGTC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL96797gene:BL96797Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL96797_cuf19transcript:BL96797_cuf19-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BL96797_cuf19-E1BL96797_cuf19-E1-1564476830-264551Branchiostoma lanceolatumexon
BL96797_cuf19-E2BL96797_cuf19-E2-1564476830-264549Branchiostoma lanceolatumexon
BL96797_cuf19-E3BL96797_cuf19-E3-1564476830-264546Branchiostoma lanceolatumexon
BL96797_cuf19-E4BL96797_cuf19-E4-1564476830-264544Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000071genomeSc0000071:960704..977178 -
Properties
Property NameValue
Transcript idBL96797_cuf19
Biotypeprotein_coding