transcript:BL96725_cuf3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL96725_cuf3
Unique Nametranscript:BL96725_cuf3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL96725_cuf3

>transcript:BL96725_cuf3-protein ID=transcript:BL96725_cuf3-protein|Name=transcript:BL96725_cuf3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=475bp
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Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000514:44964..75428-

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL96725_cuf3 ID=transcript:BL96725_cuf3|Name=transcript:BL96725_cuf3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=30465bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000514:44964..75428- (Branchiostoma lanceolatum)
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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000514:44964..75428-

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CCGGTTAAAACGTAAACTCTTACGCCCACTTGAGGATATGCTTGAGGATT
TACTTGAAGATGAAGAGCCCAACGAGTATGGCCTGAAGATTGGTGATGAG
GTAAAAGTGACTGTCGACAGGGATACCTTCAAAAGACTGCAGGAAGAGAA
CGGACTTCCTTGGGATGGTGACAATGAAAAGGTCATTGGAATGCCTGGGA
AAATAGTTGGAGTTGATGGGAAAAATGCTTTTGTGCGCTTTCAGAATGAA
GAGAGGGAGCTTATTTTCTCTGGATGTTTGACCAAGACCTCGGGTGGGAA
ACAGGATGAACAAGGTCGCTTAAAAAAAGGAGACATTGTTAGGTTGATCA
AGGATGAGGACGAATTGAAAGAACTTCAAGAAAAACATGGGGGCTATGTG
GATGACATGCAAAATTGTCTTGGTAAGACAGGCTGTGTAAAAAAGTCTAA
AAAGCGACGAGTCCAGGTGGAGTTTATGCACACGATAAGATCCTGGTGGT
ACAACCCTGCAGCTCTCACCAAAGTTTCCTCAGACTGCCAGGAAATTGTT
CATCAGCTTAAGACGGGAGACTGTGTAAAGGTGAATGTGGATGCAAACAC
CTTGAAAGTCAACCAACTGGGTCATGGTGGATGTACAGAGGATATAACAG
AGGTGATGGGAACAGCTGGAGTTGTTCGTTACATTGACCTTGATGGAGAT
TCTTTCATCTGTTTCCTGAATGGCTCCAGATTTCTTGTCAACCCTGCAAG
TCTGGAGAAAGTAAGTCCAGAGGACTACACGGAGGACGACAGTGGTGAGT
TGAAGGAGAAGGAGTGGGTCAAAGTTGATTCTGACAAGGCAAGGATCAAG
CAGGTTCAGGAATCAACAGCACATATCAACTGGGATGATGGGTTTTATGC
TGTAAGTAATTACGTAGTAAATACATTATTGTGATTTGCCCCTGCTGCCT
TGCGGAAAGCGAGAAAGCCTTCCATAAGTTCAGCAGCCATCTGGGAGGGT
GACCTGGTGGAAATAGCAACAGACCTTGAGAAACTCAAGAGTGCACAACA
AGAGAAAGGTCTTTGGGAGGACGGCATGGAGAAGACCCTTGGGAAGATTG
GTAGAGTTAGATTTGTGAGACAAAATGGTGACATTCTTGTGAGGGTGGCC
GAGGAAGACTGGACATTCAACCCTAAGGTTGTTCATAAGACAGAGACCCA
AGGAGAAATGTGTGACCAGGGTCTTCACCATTGGAAGAGAGGAGTCTCCA
AGGTGTGTGTGAAGTGTGGTGAGTGTACTGCAGCAGGAGCCAAGTGCAGT
ATGAAGGGCAAGCCACTTAGGCCCCCTCTCAGCTGCTGTGGCTGTGCAAG
AAAAGATGCAGGCTGTGAAGACTGTGGTCATTGCAAGACATGTGTAGGGG
AAAAGAGTGATCAGGAGAAGGTGATGGGCCGGTTAAAACGTAAACTCTTA
CGCCCACTTGAGGATATGCTTGAGGATTTACTTGAAGATGAAGAGCCCAA
CGAGTATGGCCTGAAGATTGGTGATGAGGTAAAAGTGACTGTCGACAGGG
ATACCTTCAAAAGACTGCAGGAAGAGAACGGACTTCCTTGGGATGGTGAC
AATGAAAAGGTCATTGGAATGCCTGGGAAAATAGTTGGAGTTGATGGGAA
AAATGCTTTTGTGCGCTTTCAGAATGAAGAGAGGGAGCTTATTTTCTCTG
GATGTTTGACCAAGACCTCGGGTGGGAAACAGGATGAACAAGGTCGCTTA
AAAAAAGGAGACATTGTTAGGTTGATCAAGGATGAGGACGAATTGAAAGA
ACTTCAAGAAAAACATGGGGGCTATGTGGATGACATGCAAAATTGTCTTG
GTAAGACAGGCTGTGTAAAAAAGTCTAAAAAGCGACGAGTCCAGGTGGAG
TTTATGCACACGATAAGATCCTGGTGGTACAACCCTGCAGCTCTCACCAA
AGTTTCCTCAGACTGCCAGGAAATTGTTCATCAGCTTAAGACGGGAGACT
GTGTAAAGGTGAATGTGGATGCAAACACCTTGAAAGTCAACCAACTGGGT
CATGGTGGATGTACAGAGGATATAACAGAGGTGATGGGAACAGCTGGAGT
TGTTCGTTACATTGACCTTGATGGAGATTCTTTCATCTGTTTCCTGAATG
GCTCCAGATTTCTTGTCAACCCTGCAAGTCTGGAGAAAGTAAGTCCAGAG
GACTACACGGAGGACGACAGTGGTGAGTTGAAGGAGAAGGAGTGGGTCAA
AGTTGATTCTGACAAGGCAAGGATCAAGCAGGTTCAGGAATCAACAGCAC
ATATCAACTGGGATGATGGGTTTTATGCTGTAAGTAATTACGTAGTAAAT
ACATTATTGTGATTTGCCCCTGCTGCCTTGCGGAAAGCGAGAAAGCCTTC
CATAAGTTCAGCAGCCATCTGGGAGGGTGACCTGGTGGAAATAGCAACAG
ACCTTGAGAAACTCAAGAGTGCACAACAAGAGAAAGGTCTTTGGGAGGAC
GGCATGGAGAAGACCCTTGGGAAGATTGGTAGAGTTAGATTTGTGAGACA
AAATGGTGACATTCTTGTGAGGGTGGCCGAGGAAGACTGGACATTCAACC
CTAAGGTTGTTCATAAGACAGAGACCCAAGGAGAAATGTGTGACCAGGGT
CTTCACCATTGGAAGAGAGGAGTCTCCAAGGTGTGTGTGAAGTGTGGTGA
GTGTACTGCAGCAGGAGCCAAGTGCAGTATGAAGGGCAAGCCACTTAGGC
CCCCTCTCAGCTGCTGTGGCTGTGCAAGAAAAGATGCAGGCTGTGAAGAC
TGTGGTCATTGCAAGACATGTGTAGGGGAAAAGAGTGATCAGGAGAAGGT
GATGGGCCGGTTAAAACGTAAACTCTTACGCCCACTTGAGGATATGCTTG
AGGATTTACTTGAAGATGAAGAGCCCAACGAGTATGGCCTGAAGATTGGT
GATGAGGTAAAAGTGACTGTCGACAGGGATACCTTCAAAAGACTGCAGGA
AGAGAACGGACTTCCTTGGGATGGTGACAATGAAAAGGTCATTGGAATGC
CTGGGAAAATAGTTGGAGTTGATGGGAAAAATGCTTTTGTGCGCTTTCAG
AATGAAGAGAGGGAGCTTATTTTCTCTGGATGTTTGACCAAGACCTCGGG
TGGGAAACAGGATGAACAAGGTCGCTTAAAAAAAGGAGACATTGTTAGGT
TGATCAAGGATGAGGACGAATTGAAAGAACTTCAAGAAAAACATGGGGGC
TATGTGGATGACATGCAAAATTGTCTTGGTAAGACAGGCTGTGTAAAAAA
GTCTAAAAAGCGACGAGTCCAGGTGGAGTTTATGCACACGATAAGATCCT
GGTGGTACAACCCTGCAGCTCTCACCAAAGTTTCCTCAGACTGCCAGGAA
ATTGTTCATCAGCTTAAGACGGGAGACTGTGTAAAGGTGAATGTGGATGC
AAACACCTTGAAAGTCAACCAACTGGGTCATGGTGGATGTACAGAGGATA
TAACAGAGGTGATGGGAACAGCTGGAGTTGTTCGTTACATTGACCTTGAT
GGAGATTCTTTCATCTGTTTCCTGAATGGCTCCAGATTTCTTGTCAACCC
TGCAAGTCTGGAGAAAGTAAGTCCAGAGGACTACACGGAGGACGACAGTG
GTGAGTTGAAGGAGAAGGAGTGGGTCAAAGTTGATTCTGACAAGGCAAGG
ATCAAGCAGGTTCAGGAATCAACAGCACATATCAACTGGGATGATGGGTT
TTATGCTGTAAGTAATTACGTAGTAAATACATTATTGTGATTTGCCCCTG
CTGCCTTGCGGAAAGCGAGAAAGCCTTCCATAAGTTCAGCAGCCATCTGG
GAGGGTGACCTGGTGGAAATAGCAACAGACCTTGAGAAACTCAAGAGTGC
ACAACAAGAGAAAGGTCTTTGGGAGGACGGCATGGAGAAGACCCTTGGGA
AGATTGGTAGAGTTAGATTTGTGAGACAAAATGGTGACATTCTTGTGAGG
GTGGCCGAGGAAGACTGGACATTCAACCCTAAGGTTGTTCATAAGACAGA
GACCCAAGGAGAAATGTGTGACCAGGGTCTTCACCATTGGAAGAGAGGAG
TCTCCAAGGTGTGTGTGAAGTGTGGTGAGTGTACTGCAGCAGGAGCCAAG
TGCAGTATGAAGGGCAAGCCACTTAGGCCCCCTCTCAGCTGCTGTGGCTG
TGCAAGAAAAGATGCAGGCTGTGAAGACTGTGGTCATTGCAAGACATGTG
TAGGGGAAAAGAGTGATCAGGAGAAGGTGATGGGCCGGTTAAAACGTAAA
CTCTTACGCCCACTTGAGGATATGCTTGAGGATTTACTTGAAGATGAAGA
GCCCAACGAGTATGGCCTGAAGATTGGTGATGAGGTAAAAGTGACTGTCG
ACAGGGATACCTTCAAAAGACTGCAGGAAGAGAACGGACTTCCTTGGGAT
GGTGACAATGAAAAGGTCATTGGAATGCCTGGGAAAATAGTTGGAGTTGA
TGGGAAAAATGCTTTTGTGCGCTTTCAGAATGAAGAGAGGGAGCTTATTT
TCTCTGGATGTTTGACCAAGACCTCGGGTGGGAAACAGGATGAACAAGGT
CGCTTAAAAAAAGGAGACATTGTTAGGTTGATCAAGGATGAGGACGAATT
GAAAGAACTTCAAGAAAAACATGGGGGCTATGTGGATGACATGCAAAATT
GTCTTGGTAAGACAGGCTGTGTAAAAAAGTCTAAAAAGCGACGAGTCCAG
GTGGAGTTTATGCACACGATAAGATCCTGGTGGTACAACCCTGCAGCTCT
CACCAAAGTTTCCTCAGACTGCCAGGAAATTGTTCATCAGCTTAAGACGG
GAGACTGTGTAAAGGTGAATGTGGATGCAAACACCTTGAAAGTCAACCAA
CTGGGTCATGGTGGATGTACAGAGGATATAACAGAGGTGATGGGAACAGC
TGGAGTTGTTCGTTACATTGACCTTGATGGAGATTCTTTCATCTGTTTCC
TGAATGGCTCCAGATTTCTTGTCAACCCTGCAAGTCTGGAGAAAGTAAGT
CCAGAGGACTACACGGAGGACGACAGTGGTGAGTTGAAGGAGAAGGAGTG
GGTCAAAGTTGATTCTGACAAGGCAAGGATCAAGCAGGTTCAGGAATCAA
CAGCACATATCAACTGGGATGATGGGTTTTATGCTGTAAGTAATTACGTA
GTAAATACATTATTGTGATTTGCCCCTGCTGCCTTGCGGAAAGCGAGAAA
GCCTTCCATAAGTTCAGCAGCCATCTGGGAGGGTGACCTGGTGGAAATAG
CAACAGACCTTGAGAAACTCAAGAGTGCACAACAAGAGAAAGGTCTTTGG
GAGGACGGCATGGAGAAGACCCTTGGGAAGATTGGTAGAGTTAGATTTGT
GAGACAAAATGGTGACATTCTTGTGAGGGTGGCCGAGGAAGACTGGACAT
TCAACCCTAAGGTTGTTCATAAGACAGAGACCCAAGGAGAAATGTGTGAC
CAGGGTCTTCACCATTGGAAGAGAGGAGTCTCCAAGGTGTGTGTGAAGTG
TGGTGAGTGTACTGCAGCAGGAGCCAAGTGCAGTATGAAGGGCAAGCCAC
TTAGGCCCCCTCTCAGCTGCTGTGGCTGTGCAAGAAAAGATGCAGGCTGT
GAAGACTGTGGTCATTGCAAGACATGTGTAGGGGAAAAGAGTGATCAGGA
GAAGGTGATGGGCCGGTTAAAACGTAAACTCTTACGCCCACTTGAGGATA
TGCTTGAGGATTTACTTGAAGATGAAGAGCCCAACGAGTATGGCCTGAAG
ATTGGTGATGAGGTAAAAGTGACTGTCGACAGGGATACCTTCAAAAGACT
GCAGGAAGAGAACGGACTTCCTTGGGATGGTGACAATGAAAAGGTCATTG
GAATGCCTGGGAAAATAGTTGGAGTTGATGGGAAAAATGCTTTTGTGCGC
TTTCAGAATGAAGAGAGGGAGCTTATTTTCTCTGGATGTTTGACCAAGAC
CTCGGGTGGGAAACAGGATGAACAAGGTCGCTTAAAAAAAGGAGACATTG
TTAGGTTGATCAAGGATGAGGACGAATTGAAAGAACTTCAAGAAAAACAT
GGGGGCTATGTGGATGACATGCAAAATTGTCTTGGTAAGACAGGCTGTGT
AAAAAAGTCTAAAAAGCGACGAGTCCAGGTGGAGTTTATGCACACGATAA
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CAGGAAATTGTTCATCAGCTTAAGACGGGAGACTGTGTAAAGGTGAATGT
GGATGCAAACACCTTGAAAGTCAACCAACTGGGTCATGGTGGATGTACAG
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CTTGATGGAGATTCTTTCATCTGTTTCCTGAATGGCTCCAGATTTCTTGT
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ACAGTGGTGAGTTGAAGGAGAAGGAGTGGGTCAAAGTTGATTCTGACAAG
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TGGGTTTTATGCTGTAAGTAATTACGTAGTAAATACATTATTGTGATTTG
CCCCTGCTGCCTTGCGGAAAGCGAGAAAGCCTTCCATAAGTTCAGCAGCC
ATCTGGGAGGGTGACCTGGTGGAAATAGCAACAGACCTTGAGAAACTCAA
GAGTGCACAACAAGAGAAAGGTCTTTGGGAGGACGGCATGGAGAAGACCC
TTGGGAAGATTGGTAGAGTTAGATTTGTGAGACAAAATGGTGACATTCTT
GTGAGGGTGGCCGAGGAAGACTGGACATTCAACCCTAAGGTTGTTCATAA
GACAGAGACCCAAGGAGAAATGTGTGACCAGGGTCTTCACCATTGGAAGA
GAGGAGTCTCCAAGGTGTGTGTGAAGTGTGGTGAGTGTACTGCAGCAGGA
GCCAAGTGCAGTATGAAGGGCAAGCCACTTAGGCCCCCTCTCAGCTGCTG
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CGTAAACTCTTACGCCCACTTGAGGATATGCTTGAGGATTTACTTGAAGA
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AGTTGATGGGAAAAATGCTTTTGTGCGCTTTCAGAATGAAGAGAGGGAGC
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GGACATTCAACCCTAAGGTTGTTCATAAGACAGAGACCCAAGGAGAAATG
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AGCTTAAGACGGGAGACTGTGTAAAGGTGAATGTGGATGCAAACACCTTG
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GATGGGAACAGCTGGAGTTGTTCGTTACATTGACCTTGATGGAGATTCTT
TCATCTGTTTCCTGAATGGCTCCAGATTTCTTGTCAACCCTGCAAGTCTG
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AGTAATTACGTAGTAAATACATTATTGTGATTTGCCCCTGCTGCCTTGCG
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CAAGAAAAACATGGGGGCTATGTGGATGACATGCAAAATTGTCTTGGTAA
GACAGGCTGTGTAAAAAAGTCTAAAAAGCGACGAGTCCAGGTGGAGTTTA
TGCACACGATAAGATCCTGGTGGTACAACCCTGCAGCTCTCACCAAAGTT
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AAAGGTGAATGTGGATGCAAACACCTTGAAAGTCAACCAACTGGGTCATG
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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