transcript:BL96547_cuf3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL96547_cuf3
Unique Nametranscript:BL96547_cuf3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL96547_cuf3

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Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000009:4249589..4273249-

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL96547_cuf3 ID=transcript:BL96547_cuf3|Name=transcript:BL96547_cuf3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=23661bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000009:4249589..4273249- (Branchiostoma lanceolatum)
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GATTCGATTTCTTTTTGGAAAAGAGGTAGATATGTATTGGCCTATGTACA AGGAAATTTCGTCAGGAAATGACATGAGTAAATTAAAAGTTTCTGAGCTT GTCTAAGATGGTACGGTTATGTTTGTATTTCGGGTGACATTCATAAGTGT CTGTCTTTCTTCAATATACATGGGATATGTTAAAAGAAAGTGGAATTCAA ATTGAAATGTGTGTTTTTTCGGGTGATCGGGCGATCCTACCCGTGGTCGG GCTGGAACCTCGAGCTCGGGTGATACGGAATACTACTATATTTATCGTAC GAAGAAACTGCACAGACCAGAATCAAGATAAGAAAGTGAATGATTTCAGT GTACTTCCAAATAAATTTGTTTGCAACATTTATACAGTTATCTTCACATG ACGATTGGCTTACATTGAGGATATGTCCACATTTGTTTTGCACATTCTCA TCCTATATCAGTATCATAGAACTGTTGTCTCTATATGGTCATCTTGAAAT ATTTGCAAGTGTGTATCTACATTGGTAAGCATTAAGGATGCCTTCTTGTG CAATCAGAACTTCTGCTTAAATGTCATACACTATTTCACCCAATTACAAA ATAATGATAAAAAAATTATTTAAACGTTCTGCTCAGCCCGCACTCAGATA ACCGTGCCACCCCAAGATGACATAAAAAACGCTGGGCAAACCGCCACTTT CACCTGTAGAGGAGTGGGACATCCGACACCTGTCATCACTTGGAACCACA CTGGGATCATCTCAAACGATGATAGGATTACCATCACTGCCACTACCGGT GGTGTAAACGAAAACAAGTACACAGAAAGCACCCTCACCATCACCAACCT GGATAGAACCGACCATGGAACCTACAGCTGTCAAGCAAGCAACAGAGGAG GGAGTCAAGAAGAGACTGCCATGTTGACAGTAAGAGGTAAGAAAATAACG 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ATTGGGCATTCCAAAACATACATGCATTTCTTTGTCTCCTACGCACCACA GAACTAGAAATTCCTAGGCATGCATCTCCTACTCACTTACAATCAACAGG TTTCTGAAACCCTGATGAAACCCTAGTAACGTTGAGTTGAAAATCGTTTA TAATTAAATCGAAATTCAAAATATTTATTTGCAGAGTTACAGCATATGTG AAAATTGATCCCTAATACCTGTCAATGAACATGTACACACATGATCCCCA AAACGCTTAAATCTCTTCTATCCCCCTGTAATTTCAGCACCAGGCAAAGT TGAGAATCTGACCGTACAGGGGATCTCTGGTACCGAGGTGAAAGTAATGT GGGATCCACCAGACCCCAGCAAGCCTAAAGGAATCATAATTCAGTACAAG GTGACGTACAAAAGGGCAGATCAGACTTCAGAAAGTTCTCCGGACACAAC AAATGGAAACTCTACATTCTACTCCATCGACGGACTAGAAACAGACAAGA ACTACACCGTTAATGTCTGGGGTGTGACGTCGGCAGGGCCTGGGCAGGCG ACAGACATAACATTCCTGTTTGAATACAGTAAGAATCAACCATTTGTCTA TTTCATGTGTGAATGCAATTCAAAGTCATTGGTTAGATGGGCGTGCTATG TCATATTTACCTATGTTAAATTGAACTACTGTTTACACTACATTCCACCA CTTCATGAGAAATGCACGGTAAATGTCATCTTACGAAACTGATGAACCCC TATAGCTATTAAGAAAGAAATTTTGTATTGTGTTGTGTTGTGTTGTATTG TATTGTATTGTATTGTATTGTATTTATGTATACCAGAATTGTATATGTTT CTGCCCAAACGGATGTGTTCACTGTATCACTACAGTTCCAAGTCCACCTC AAGCCATAGCAGCAGAAAACACCCGCCCCTGTTCCTGTGTCTCCGGGAGT CAAACCGACACATCAACAGTACGAGTGTCCTGGGATCCACCCGCACAGCC AAACGGAAAAATTCTAGGATATCGAGTGTTCTACTCCACTGATGAAGGGA CTTGGACAAGCATCGAGGCTGCCAACAGTCCCAAAGAGATTTCTAACCTC CGACCTCACAAGATGCATTCTATAAAGGTGATCTTGTTATGTTATTCCAT AAACACAACCATCTGTACTGGCACAACAAACACACAAGTATGGTATCTAA TATGTATCAACACCAACATCTTCACATGAATACCTATCTCTTCATGATTT ATTGCAAAGGCTAGAACAAACCATGGCCTGACAATATTGATGACAACATC GGTGTTATTAGTGTATCTAAGTCAATTTACGTAAGTTCCTCACTTATTTG ACATTGCTTGGTATTTCAGGTCAAAGCTTACAATTTGCTTTTCCAAGGAG TGGACAGTGACGTGTTTCCATTACAGACCAGCCAAGGATGTAAGCAGATT TCTTCGATATTATAACATCAGAAGGATATATTCAACATGTATGCAGGGAA ATGTTTTCCTTGCTTCTGTACTTTGCATTTGACATTTGACCTGCTGATAT TGTCAGTTTACTTCATTCAGTGTATGTACTGTGATTACCACACATTATCC TTATACACTGTTTAGCATAAAATGTTCCGCATTGGGTACATTTAGTTGCA CCTTTTACATGATTTGTCCCTTTGGATGATACTCCAACCATACTGGTTTT ATTTCAACTTTCAGGCCCAGGCCCACCTGAGAATCTTCAATCTGACCAGA TTGGAGGCATGTGTAACATCAGCTGGTCTCTACCCAACATCATTAACGGC GATCTCAACAGCTACAAGGTACACTTCAGTTAATCATACTAACCTTGATT GCTTATATGCCATTTCCCTTGTTCCAAATTGAATATTCGTCTTCTAAATA ATTTATGATTATTCTGCTATTAAACACACACGAACTTACAGTAAGTGGCT CACTAACTCTGGTGATCTAAACAGCGTCACTTCAACAACGATTATCCTCC TACAACTTCAATTAATGAAAGTTGGAATTAATGAAAAATACTTTAAACGC CATTTCCTCACCGAAAAAACTATGGTCAATTGCTGACTTGTGAATTTTAG ATCCAAAGATGTGTGCGGCAACTGGTTATAACAAAACACATAAAGATGGA GGACATAAGTGTACCTGTATTTCTAAAGGAACAGTTACTGATTTTGCCCT TTAGGTTGAAGTTAGTGCCACCTGGCTTGGCATGGACTCTGTAACAGACA TTGAGGCTGAACCAGTCAGCACGTCAGAGGTGTCAAGCCTAACATGGACG TCATCCTTAAACGATCTCCCGGCCAATTCATTGGTCCACGTCACGATTCG GGCTAGAACCTGTGCGGAGGGAGAAAGGAGTGAGGCAAGAACCTGCATGG TTGAGAGGATAGGTGAGTGAATTTTGCAAGATCATATCATATACTTAATA TGTAAATTCGGTACTTACAAACATTGGAAGACGATAATGGAATCTATCCA AGAAGCATGCCGTTGCAAGTAATAGACTACGCGTTTTCTTAATATCTGCT TGCTATTATTTGTGCTTACTTTCACTTTTGAAATCATAAATCAAAGACTC AAGGGCTGATAGACATCTTCTGTTTTAACCATTCTCTTGTATCCAATGAC ATCACTTACAGAGCCACCTGATACAGTCCCGAATGTGACCGCTGAAGAGG CAACGTTAACATCCAGTACCTTCAGTGTGCTGCTACCAAGCATAAGCCAG AGGAATGGGCC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000009:4249589..4273249-

>transcript:BL96547_cuf3 ID=transcript:BL96547_cuf3|Name=transcript:BL96547_cuf3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1632bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000009:4249589..4273249- (Branchiostoma lanceolatum)
CCAGGCCCACCTGAGAATCTTCTAGCTGACCAGAGCGGTGGCATGTGTAA
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GAGGCTGAACCTGTCAGCACGTCAGAGGTGTCAAGCCTAACATGGACGTC
ATCCTTAAACGATCTCCCGGCCAATTCATTGGTCCACGTCACGATTCGGG
CTAGAACCTGTGCGGAGGGAGAAAGGAGTGAGGCAAGAACCTGCATGGTT
GAGAGGATAGAGCCACCTGATACAGTCCCGAATGTGACCGCTGAAGAGGC
AACGTTAACATCCAGTACCTTCAGTGTGCTGCTACCAAGCATAAGCCAGA
GGAATGGGCCAGGCCCACCTGAGAATCTTCTAGCTGACCAGAGCGGTGGC
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CAGACATTGAGGCTGAACCTGTCAGCACGTCAGAGGTGTCAAGCCTAACA
TGGACGTCATCCTTAAACGATCTCCCGGCCAATTCATTGGTCCACGTCAC
GATTCGGGCTAGAACCTGTGCGGAGGGAGAAAGGAGTGAGGCAAGAACCT
GCATGGTTGAGAGGATAGAGCCACCTGATACAGTCCCGAATGTGACCGCT
GAAGAGGCAACGTTAACATCCAGTACCTTCAGTGTGCTGCTACCAAGCAT
AAGCCAGAGGAATGGGCCAGGCCCACCTGAGAATCTTCTAGCTGACCAGA
GCGGTGGCATGTGTAACATCAGCTGGTCTCTCCCCAGCGTCACTAACGGC
GATCTCAACAGCTACAAGGTTGAAGTTAGTGCCACCTGGCTTGGCATAGA
CTCGGTAACAGACATTGAGGCTGAACCTGTCAGCACGTCAGAGGTGTCAA
GCCTAACATGGACGTCATCCTTAAACGATCTCCCGGCCAATTCATTGGTC
CACGTCACGATTCGGGCTAGAACCTGTGCGGAGGGAGAAAGGAGTGAGGC
AAGAACCTGCATGGTTGAGAGGATAGAGCCACCTGATACAGTCCCGAATG
TGACCGCTGAAGAGGCAACGTTAACATCCAGTACCTTCAGTGTGCTGCTA
CCAAGCATAAGCCAGAGGAATGGGCCAGGCCCACCTGAGAATCTTCTAGC
TGACCAGAGCGGTGGCATGTGTAACATCAGCTGGTCTCTCCCCAGCGTCA
CTAACGGCGATCTCAACAGCTACAAGGTTGAAGTTAGTGCCACCTGGCTT
GGCATAGACTCGGTAACAGACATTGAGGCTGAACCTGTCAGCACGTCAGA
GGTGTCAAGCCTAACATGGACGTCATCCTTAAACGATCTCCCGGCCAATT
CATTGGTCCACGTCACGATTCGGGCTAGAACCTGTGCGGAGGGAGAAAGG
AGTGAGGCAAGAACCTGCATGGTTGAGAGGATAGAGCCACCTGATACAGT
CCCGAATGTGACCGCTGAAGAGGCAACGTTAACATCCAGTACCTTCAGTG
TGCTGCTACCAAGCATAAGCCAGAGGAATGGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL96547gene:BL96547Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL96547_cuf3transcript:BL96547_cuf3-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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Position
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