transcript:BL96372_cuf11 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL96372_cuf11
Unique Nametranscript:BL96372_cuf11
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL96372_cuf11

>transcript:BL96372_cuf11-protein ID=transcript:BL96372_cuf11-protein|Name=transcript:BL96372_cuf11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=170bp
QYFYFQGEGEFVLARDTYVPRHFEVRGFNVQCTVEPITTCTKEIKVIYNG
HTVELKAGHQVFVNGSQWSVPFKFGGMKVTTMGFPLKLEIPSRNVTVVYD
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EWKVDTPDNPSNSCIPEPKP
Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000465:102963..117439-

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL96372_cuf11 ID=transcript:BL96372_cuf11|Name=transcript:BL96372_cuf11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14477bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000465:102963..117439- (Branchiostoma lanceolatum)
CTCAGTACTTCTACTTCCAGGGAGAGGGCGAGTTTGTCCTGGCCAGAGAC ACCTATGTTCCACGTCACTTTGAGGTCCGTGGTTTCAACGTTCAGTGCAC TGTTGAACCCATCACCACCTGCACCAAGGAGATCAAGGTCATCTACAATG GACACACTGTAGAGCTGAAGGCTGGACATCAGGTAAAGTACCAACAATCA GTCAATTTTGTAAAGAAGTACACATGTATTGGCAGCTGTATTGTGGCATC AAATGGCCAACTGGCTAGACTAGTGGACACGAAATCTAGATATCACAGGT TCAATTCTTGGCTCGATACTGTGTCCTTGGGAATGGAACTTTTCACGACT TTCCTCACTCAACCAGGTGTAGAATTGGTAATTAACATTGGTTATTGAGT TAAAAGGTATTGGAAAGAGATGGATGGGCTCTGCCTTCCAATACCATGCC CTACATACAGTGGATTAGCAATGGGACCTTTACCTTTTATTGTCAGCCAT GCTAAATCGTAGATTTGTATATATTGACCAATATACAGACTGTCATACAC TATAAAGTTCAGCAAACCAGTGTGGTGGCTGTATCCTGTGCAAACACCCT TTATTTTTGCTCAATTTTTAAGATTCATTTGTCTCACTCTTGTCCATTAT CTTCATCCCCTCTCAGGTGTTTGTGAATGGATCACAGTGGAGTGTACCGT TCAAGTTTGGTGGTATGAAGGTGACTACAATGGGCTTCCCCCTGAAGCTG GAGATCCCGTCCCGGAACGTGACAGTGGTGTATGACTGGCTGAGCAGTGG CTTCTACATCAGTGTGCCTCCATCCATGTATGCAGGCAAGACTGAGGGAC TGTGTGGTAAGTACAGAATGTTTATCTGGAACTTCTATGCCAGCATGTTG TCACTGCTGCACACTGTAACTCCATGAATTTATTCTACTTTTACCTCAAT GTTTCTACTTTTAGTTTTGTCGTTCCATGCCCAAAGGCAGTCATAGTTGT TCTACAGCCTGTAGATGTAGTGGGGTCTTGGCGAATCCCAAACCATTGTA TGAAATACATTTTTATATAAGATAAACCATATTGTATTAGGAAGCTGCAA CATAGTCATGATATTAGCCAATTCTTTTGATATTTCATTGGACAGGAATT TGAGCTTTTGAATGAAATATGGGGTTCATTCAAAAGTTCAAATTCCTGTC CAATTGAATCAGTTCATTTAAAATTCTGCAAACAATCATTACGTGTACCT AGGTCTGCTTGCAGCCTAGCTGCAAGGGCGGAATTAGGAAGATACCCAAT ACAAGTGGATGCTTCGCTAAATGCCGTCAAATATTTCCTTAGACTTCGCC AGAATGTGTCAGCCGACAGTTTTCAAGCAGATGCTTTCTGCTGTCAGTTA GATCTAGACAAATCTGGTGTGAAATGTTGGGCGACAGGAATACGTAAGTC TTTAGAGGAGAGCGGGTTTGCTTTCTTATGGCACCTACCAATTTCATATA ATTCAAATACGTTACAAATTGTTAGTTCCATTGGCCAGCGGATAAAAGAC ATTTACTTCCAAACGTTTCTGAAAGAAATACATAACGACAACAAAGGTGG GGCTTCCAAAAATAAGTTAAGATCATATAGATTATTCAAAACTACTTATA ATGAAGAAAAATATCTAAGTAATTCAAATATGAGGGTCAGGAATGCAGTC ACAAGACTAAGAATCAGCTGCCACAAACTACATATTGAAACGGGAAGACA TACCCGCACTCCTCTAGAACAACGATTATGTAAACATTGTACTTTGAATA GAGTAGAAGACGAATGTCATTTTGTGGTAGAATGTGTATTATATACCAAA GAAAGAAATGAACTGTATAAACTTGTAGAAAACCTATTTCCCTACTTCAC ACATTTAAGTACTGTTCAAAAATTCATATTTCTAATGCGACTAGACAAAC CTCCCATTGAAAAACACGTCTGTTCTTTTATATCTACTATAACCGAAAAG CGAGGAGAAGTAGAATTTATTTAATGATAGTCATATTCTTTTGTATCTGC TAACTGTACTTGTATTATTTTTTGTTGTGACCTGTACTTAGCCAAGTGTG GCAGAAATGTGCAATAAAGGTCTTCATTCATTCATAAAATCTTTGATTCT CCTGTAGAAGGAGTTATCATAATGATTGCAGATACAAAATGCATGTAGCA TCTCTAAACACTCCCACACTTTCTGGCATGTCAGTACTGTTTCAACCCTC ATCCTCTCCCCTTTTCGCAGGTCTTTGTAATAACAACAAAACGGACGACT GCCAGGACAGGGAGGGGAACATCATGAACGACTATAACAACTGCTCCTGT GAATGGAAGGTGGACACGCCCGACAACCCTTCCAACAGCTGTATTCCCGA ACCCAAGCCCACTGCCACACCCCCAACACCTTGTGACCAGACCCCTTGTG ACGTCCTCTCAGTAAGTACATATCACTCAGTATGTCTAACTTTGATATAA TTATCCCTGAACCACTCCCTGTGACCAGCCCCTTTGTGACGTCTTCTCAA CATGTATATGTCCCTTAGTCTAACAGTATCCCAGGCCTGTACCACCCCAA CACCCTCTGACCCAATACCCTTGTGATGTCCTTTCAGTATAACCGTCATA TCACTTACTCAAACTACATGTACAATATACATACCTATACCACAGCAACA CTCTGTGACCAATACCCTGGTGATATCTTCTCAGTATTACTCAGTACTAA ATATCATTTATAATTAGTCTTAATAGTCTAACTGCAATACATGCATCCCT GTACTACCTAAGCACCATGTGACCCCGGCAATGTCCGACCAGCATAAGTC AGTCCAACTACAACGTGTTCTTTGTGGGAACTAACCAGGACAAATTTGTC TCTTTTATAAGAATTACTGCACCATTCAATGTCACCTTCCTGTGCTAAGA ATACAGGAAACAGATCTGTAGTCAGTACACTGTATGATTGAATGATTTAT CCTGATGTTTCCCCCAGGATCCAGAAGGCCCATTTGCCGCATGCCATGAT GCTGTGGACGTCGAATTCTTCTACCAGTCTTGTCGCTATGACAGAGGAGC CTGTTACAGCGAGTGTCAGGCCCTGGGAGCGTACGCCTATGTGTGCCAGC GTATGGGTGTCTGCGTGGACTGGAGAGGGAAGGGCAACAACTGCTGTAAG TTACATTTGTAACAACCAGTCCACATATAAAATTATCACTGTACTGTCAA CTATTATCTATATTACTTGTGAGATATGTAGAAATTTTAGGCTTTTAGTC AATGACAATGAAGTTTATTGCATATTCATGCCCAGCAGCGGGCTAAATGC ATTACAGTATTATAAGAATACTATATTAAAAAATGCTATGTTTTAATTAT GATTTACATGCTTCTTCTCTCTTCTTGAAACATTTGTAGACAAATTCACA GAGTTTTTTCATTACATCGTAATTGGCTGTTGACATAACATGTGCGAACA TTTCCTCCTTTGTTAAATGTGCATATCTTTGGTCTAGCAATATGTCACTA ACAGGAGAATTGCGTATATCTTTATAAAGAGAGCATTCTAGAACAAAGTG TACTTCATTTTCTATATAGTTCTCATCACAAAATATACACAGTCTGTCAC TAGGAGGAGTCCGGTTATATCTACCAGCTTCAATATGTAGTACGTGATCA CTAATCCTTAGCTTAGTCATGGCGCGGCGATGGTTAAAGTTTGTTATATC AAGATATTTCTCTCTTTCATATGTATGTTTAAATGTATGCATACATGTAC ATGTATCTTCAATGTGATATTTGAAAATGCCTGATGTAACGTTATTGTTA TGATTTATTCTTGCCTAGCTTTCGAATGTGAGGCTGGATTGGAGTACAAG GCCTGCAGCTGTGTGAAGACTTGTGAGAACATGGACATGTTCAACTCCTC GCAGTGTTCCCTGGCGTTCATGGAGACAGAAGGCTGCTTCTGTCCGGACG ACATGGTTCTCCATATGGACTCAGACCAGTGTGTTGAAGAAGATACGTGC CGTAAGTACTCTACACTTCTGTACTACTTCCAAACTTGCAATTATACAAA ATTCATGTAGTCCAAACCTCTATACCTCAGATCACTGAAGAAGAATGCAA GATAGCATCTGAAATGTCCACAGAAAACCTTATCCACCATTCAGTGTATA GACTGAATCAAAATATTTTTACTCATTCATGGATACCTAACCTGCATCTA TCTATCTACCACCATAAATATACTACGGTATAAATTTATCTGTCATGATT CTATATGCTATATTGATTTTTATTCCATCAGATAAAAGCATGGTCAGGTG TGTTCACCATGCCAATAAGTGCACATATTAATGATTCATGTTCAACTTGA CTGTTGAAAGTAGGANTTTCTGTAACGATAAATTGAACATTATTCATCTA CAGGTTGGTGACACATGGTATGACCCAGAGGACAGATGCTTCCGGTCGTT ATACCAGTGTCGTCAATGTGGCGAGATTTCCATTTCTCGTCGCACCTGTG ATGTCGTTGAGCCACCAACCTGTACCAATGGTCTGCAGCCTATTGATGTG GGGTCGTGCTGTCCAGAGTACGAGTGTCCATGTATGTACAGGATTACTAT CAGTTAGACTTCTTTGGTTCCACTTTTTTTGCCTGCTGCCGATCCTTTGG CATATAGGCCATCAACTACATGTAGATCCCTCCATCTCATGCAGTCCAAG GCCCTGAGTCTACCAGCTGTTTCCATGTGGGGCCCTTACATCAGCATCAA GGTCCCACCTCTGTGTATCAGACTGACAAATGAATAAACCATGAGTGTAA CCATCAGTTAGACTGACAAATGAACAAAAACTAACTGTAGGGCAACTAAT TTATTTGTTTAGTTCTGGCTCAGGTGTTTATTGTTTTATTATTCATTAAC ATATAGCAACAGAACAAACAGCAGATAGGAAGAACAAGTTGAATCTGCCA ACATTTATTCTGACAATTAAACTGTGTGTACCAAGGTACTGTGTGTACTC TCCTCATACTCATGTTAATGATTATCCAGTTTCTATAATTGCTTTCATCC TTGGGCCACATCAATTTGAATCAACCTCTGAAAGCGATAGAAACTCCTTT TTCTTTTCTTATATAGATTTTTGCCCCGAGTAGAAAATGATAATGATTTT ACTGCTGAAACTTTTTGTAAGAATTATGGAAGAGAAAAGATGCCTCATGA AGAAGTGCAAGACACACAAAACATCATGAAATTTGCTACTCTCATCTCCC AAATAAACATACCCCCCGGAATAAACATACCCCCTGGACAAATCTTCAAA ATCTAATAAACGTACCCCCCGGAATAAACATACCCCACGGAAATTGACCA AATTTACAGATAAACTGTGTCCATGCTACTTCTGTCCGAGGGACAGAAGA TGATTAGCAGGTTCTCTTTATTCATTTATTGACTATTTATGCCTGTCTGA GGACCAAACCAATTAAGTGTATAACTATTGAACAGAATAACTGTACACAT CTTGTTCAAATTATAATATTCCTTGCCACTTCAAAAAGATATACTGTAGT AGCAATGTTGAAAAAATTGGGCATAGGTTCCCCGCTATGACCCCGTACCG GGGGCCAACGGTGCTTCAAATTCAACAAGTTAAAATGTACATGATCATTG ATACATGCATTTTCTGCTTGGAACTTGAAGCAAGTAAATTGTTGTATATA CATGTACTGACATATAATCAAAATATGAAAAGTAGTCGCCAAACTTCTCA GTTCACTTGGATGGGCCACACTTTGAAAGTCTACTCTTTTTCTATACAAA TGTATCAACATTTAGAAGATGAACAGAAAATTACAATATCCTGAATATAT GGTCATCACAGGTAACGTTATTACTTATATTTTGTAAAAGTCATGATGGA GAAAAGGAAGACTATGACAATCACATGTATATGATGTAACTTTTTGTCTT TCCCAACTTGCCATTTATCTTCTATGCCTTCCATATAGAAACATAGATTT GTAAACATTACATGCCACAAATCATTGTGTTGTGTCAAGGACATTTAATA TCATATAATATCAAGGACAATATTATATAATGTTCTTGNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCAACACCCTGTGACCAGACCCCTTG TGACGTCCTCTCAGTAAGTACATATCACTCAGTATGTCTAACTTTGATAT AATTATCCCTGAACCACTCCCTGTGACCAGCCCCTTTGTGACGTCTTCTC AACATGTATATGTCCCTTAGTCTAACAGTATCCCAGGCCTGTACCACCCC AACACCCTCTGACCCAATACCCTTGTGATGTCCTTTCAGTATAACCGTCA TATCACTTACTCAAACTACATGTACAATATACATACCTATACTACAGCAA CACTCTGTGACCAATACCCTGGTGATATCTTCTCAGTATTACTCAGTACT AAATATCATTTATAATTAGTCTTAATAGTCTAACTGCAATACATGCATCC CTGTACTACCTAAGCACCATGTGACCCCGGCAATGTCCGACCAGCATAAG TCAGTCCAACTACAACATGTTCTTTGTGGGAACTAACCAGGACAAATTTG TCTCTTTTATAAGAATTACTGCACCATTCAATGTCACCTTCCTGTACTAA GAATACAGGAAACAGATCTGTAGTCAGTACACTGTATGATTGAATGATTT ATCCTGATGTTTCCCCCAGGATCCAGAAGGCCCATTTGCCGCATGCCATG ATGCTGTGGACGTCGAATTCTTCTACCAGTCTTGTCGCTATGACAGAGGA GCCTGTTACAGCGAGTGTCAGGCCCTGGGAGCGTACGCCTATGTGTGCCA GCGTATGGGTGTCTGTGTGGACTGGAGAGGGAAGGGCAACAACTGCTGTA AGTTACATTTGTAACAACCAGTCCACATATAAAATTATCACTGTACTGTC AACTATTATCTATATTACTTGTGAGATATGTAGAAATTTTAGGCTTTTAG TATGCATACATGTACATGTATCTTCAATGTGATATTTGAAAATGCCTGAT GTAACGTTATTGTTATGATTTATTCTTGCCTAGCTTTCGAATGTGAGGCT GGATTGGAGTACAAGGCCTGCAGCTGTGTGAAGACTTGTGAGAACATGGA CATGTTCAACTCCTCGCAGTGTTCCCTGGCGTTCATGGAGACAGAAGGCT GCTTCTGTCCGGACGACATGGTTCTCCATATGGACTCAGACCAGTGTGTT GAAGAAGATACGTGCCGTAAGTACTCTACACTTCTGTACTACTTCCAAAC TTGCAATTATACAAAATTCATGTAGTCCAAACCTCTATACCTCAGATCAC TGAAGAAGAATGCAAGATAGCATCTGAAATGTCCACAGAAAACCTTATCC ACCATTCAGTGTATAGACTGAATCAAAATATTTTTACTCATTCATGGATA CCTAACCTGCATCTATCTATCTACCACCATAAATATACTACGGTATAAAT TTATCTGTCATGATTCTATATGCTATATTGATTTTTATTCCATCAGATAA AAGCATGGTCAGGTGTGTTCACCATGCCAATAAGTGCACATATTAATGAT TCATGTTCAACTTGACTGTTGAAAGTAGGAATTCATCGACTTTTGATGGC CTTCCAGTAAGCTATTTACTTTGTTAATTAACTTTCTTATCTTGTGTTCC AGATGGCTGTGAGGATGAGAATGGCATGCCTCATGCCATCGGTGATACCT GGATTCCGTACGATGGCAGCTGCCAGGAGTGCACATGTACAGGCTACAGG AAGACTGAGTGCTACCCCAGAGCCTGCCCTACCAACCAGCCCATCCCCAA GTGTGGTGTGTGCGAGTCTCAGAGGATGGTGGAGGGGTCTGACCCCTGCT GCCCCACCTATGAGTGCGGTAAGACTATCAAAGACGTTCTCAGACTTTGT TAAGAGAGCTCTCCTTTTTCTGTGCACTGTAAGAGTCCCTTTGCTTAGTA GATTTTAGTGGTCGGGTTGTAAATCATACCAGAGGTCTTAAAGCTTTTCT ACTTTGTTTCAAAACAGACACCTCCCAAAATTTTGCACATACGGAGAAGG ATTCTGTGTACAGTAAATTTTTCTCTTGAATTGTTGCACAATACATTTTT CGTTTCCTGTAAAGCCTTTAAAACTCAAAGATAGCCCTCTTCAGGTCCTT GTTGTGGTTCAATTTTGATACTATATGCAACACAAGTGGTATATGATCCA TCTACTCTATGCAACTCCGTACATGTATGCGACCCCAGCACATCTTTTTA TATAGTAAAGAAATGTCCGAGAAATGTTTAGAATTTCTGCAGGCACTGCT GTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTTCAAAAATTCATATTTCT AATGCGACTAGACAAACCTCCCATTGAAAAACACGTCTGTTCTTTTATAT CTACTATAACCGAAAAGCGAGGAGAAGTAGAATTTATTTAATGATAGTCA TATTCTTTTGTATCTGCTAACTGTACTTGTATTATTTTTTGTTGTGACCT GTACTTAGCCAAGTGTGGCAGAAATGTGCAATAAAGGTCTTCATTCATTC ATAAAATCTTTGATTCTCCTGTAGAAGGAGTTATCATAATGATTGCAGAT ACAAAATGCATGTAGCATCTCTAAACACTCCCACACTTTCTGGCATGTCA GTACTGTTTCAACCCTCATCCTCTCCCCTTTTCGCAGGTCTTTGTAATAA CAACAAAACGGACGACTGCCAGGACAGGGAGGGGAACATCATGAACGACT ATAACAACTGCTCCTGTGAATGGAAGGTGGACACGCCCGACAACCCTTCC AACAGCTGTATTCCCGAACCCAAGCCC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000465:102963..117439-

>transcript:BL96372_cuf11 ID=transcript:BL96372_cuf11|Name=transcript:BL96372_cuf11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2040bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000465:102963..117439- (Branchiostoma lanceolatum)
CAGTACTTCTACTTCCAGGGAGAGGGCGAGTTTGTCCTGGCCAGAGACAC
CTATGTTCCACGTCACTTTGAGGTCCGTGGTTTCAACGTTCAGTGCACTG
TTGAACCCATCACCACCTGCACCAAGGAGATCAAGGTCATCTACAATGGA
CACACTGTAGAGCTGAAGGCTGGACATCAGGTGTTTGTGAATGGATCACA
GTGGAGTGTACCGTTCAAGTTTGGTGGTATGAAGGTGACTACAATGGGCT
TCCCCCTGAAGCTGGAGATCCCGTCCCGGAACGTGACAGTGGTGTATGAC
TGGCTGAGCAGTGGCTTCTACATCAGTGTGCCTCCATCCATGTATGCAGG
CAAGACTGAGGGACTGTGTGGTCTTTGTAATAACAACAAAACGGACGACT
GCCAGGACAGGGAGGGGAACATCATGAACGACTATAACAACTGCTCCTGT
GAATGGAAGGTGGACACGCCCGACAACCCTTCCAACAGCTGTATTCCCGA
ACCCAAGCCCCAGTACTTCTACTTCCAGGGAGAGGGCGAGTTTGTCCTGG
CCAGAGACACCTATGTTCCACGTCACTTTGAGGTCCGTGGTTTCAACGTT
CAGTGCACTGTTGAACCCATCACCACCTGCACCAAGGAGATCAAGGTCAT
CTACAATGGACACACTGTAGAGCTGAAGGCTGGACATCAGGTGTTTGTGA
ATGGATCACAGTGGAGTGTACCGTTCAAGTTTGGTGGTATGAAGGTGACT
ACAATGGGCTTCCCCCTGAAGCTGGAGATCCCGTCCCGGAACGTGACAGT
GGTGTATGACTGGCTGAGCAGTGGCTTCTACATCAGTGTGCCTCCATCCA
TGTATGCAGGCAAGACTGAGGGACTGTGTGGTCTTTGTAATAACAACAAA
ACGGACGACTGCCAGGACAGGGAGGGGAACATCATGAACGACTATAACAA
CTGCTCCTGTGAATGGAAGGTGGACACGCCCGACAACCCTTCCAACAGCT
GTATTCCCGAACCCAAGCCCCAGTACTTCTACTTCCAGGGAGAGGGCGAG
TTTGTCCTGGCCAGAGACACCTATGTTCCACGTCACTTTGAGGTCCGTGG
TTTCAACGTTCAGTGCACTGTTGAACCCATCACCACCTGCACCAAGGAGA
TCAAGGTCATCTACAATGGACACACTGTAGAGCTGAAGGCTGGACATCAG
GTGTTTGTGAATGGATCACAGTGGAGTGTACCGTTCAAGTTTGGTGGTAT
GAAGGTGACTACAATGGGCTTCCCCCTGAAGCTGGAGATCCCGTCCCGGA
ACGTGACAGTGGTGTATGACTGGCTGAGCAGTGGCTTCTACATCAGTGTG
CCTCCATCCATGTATGCAGGCAAGACTGAGGGACTGTGTGGTCTTTGTAA
TAACAACAAAACGGACGACTGCCAGGACAGGGAGGGGAACATCATGAACG
ACTATAACAACTGCTCCTGTGAATGGAAGGTGGACACGCCCGACAACCCT
TCCAACAGCTGTATTCCCGAACCCAAGCCCCAGTACTTCTACTTCCAGGG
AGAGGGCGAGTTTGTCCTGGCCAGAGACACCTATGTTCCACGTCACTTTG
AGGTCCGTGGTTTCAACGTTCAGTGCACTGTTGAACCCATCACCACCTGC
ACCAAGGAGATCAAGGTCATCTACAATGGACACACTGTAGAGCTGAAGGC
TGGACATCAGGTGTTTGTGAATGGATCACAGTGGAGTGTACCGTTCAAGT
TTGGTGGTATGAAGGTGACTACAATGGGCTTCCCCCTGAAGCTGGAGATC
CCGTCCCGGAACGTGACAGTGGTGTATGACTGGCTGAGCAGTGGCTTCTA
CATCAGTGTGCCTCCATCCATGTATGCAGGCAAGACTGAGGGACTGTGTG
GTCTTTGTAATAACAACAAAACGGACGACTGCCAGGACAGGGAGGGGAAC
ATCATGAACGACTATAACAACTGCTCCTGTGAATGGAAGGTGGACACGCC
CGACAACCCTTCCAACAGCTGTATTCCCGAACCCAAGCCC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL96372gene:BL96372Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL96372_cuf11transcript:BL96372_cuf11-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BL96372_cuf11-E1BL96372_cuf11-E1-1564476830-469482Branchiostoma lanceolatumexon
BL96372_cuf11-E2BL96372_cuf11-E2-1564476830-469479Branchiostoma lanceolatumexon
BL96372_cuf11-E3BL96372_cuf11-E3-1564476830-469477Branchiostoma lanceolatumexon
BL96372_cuf11-E4BL96372_cuf11-E4-1564476830-469475Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000465genomeSc0000465:102963..117439 -
Properties
Property NameValue
Transcript idBL96372_cuf11
Biotypeprotein_coding