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The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL96372_cuf11 >transcript:BL96372_cuf11-protein ID=transcript:BL96372_cuf11-protein|Name=transcript:BL96372_cuf11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=170bp
QYFYFQGEGEFVLARDTYVPRHFEVRGFNVQCTVEPITTCTKEIKVIYNG HTVELKAGHQVFVNGSQWSVPFKFGGMKVTTMGFPLKLEIPSRNVTVVYD WLSSGFYISVPPSMYAGKTEGLCGLCNNNKTDDCQDREGNIMNDYNNCSC EWKVDTPDNPSNSCIPEPKP Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000465:102963..117439- Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL96372_cuf11 ID=transcript:BL96372_cuf11|Name=transcript:BL96372_cuf11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14477bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000465:102963..117439- (Branchiostoma lanceolatum) CTCAGTACTTCTACTTCCAGGGAGAGGGCGAGTTTGTCCTGGCCAGAGAC
ACCTATGTTCCACGTCACTTTGAGGTCCGTGGTTTCAACGTTCAGTGCAC
TGTTGAACCCATCACCACCTGCACCAAGGAGATCAAGGTCATCTACAATG
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ACGTCCTCTCAGTAAGTACATATCACTCAGTATGTCTAACTTTGATATAA
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GCAGTGTTCCCTGGCGTTCATGGAGACAGAAGGCTGCTTCTGTCCGGACG
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ATTCATGTAGTCCAAACCTCTATACCTCAGATCACTGAAGAAGAATGCAA
GATAGCATCTGAAATGTCCACAGAAAACCTTATCCACCATTCAGTGTATA
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CAGTTAGACTTCTTTGGTTCCACTTTTTTTGCCTGCTGCCGATCCTTTGG
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TCCCAACTTGCCATTTATCTTCTATGCCTTCCATATAGAAACATAGATTT
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AACACCCTCTGACCCAATACCCTTGTGATGTCCTTTCAGTATAACCGTCA
TATCACTTACTCAAACTACATGTACAATATACATACCTATACTACAGCAA
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TTATCTGTCATGATTCTATATGCTATATTGATTTTTATTCCATCAGATAA
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GGATTCCGTACGATGGCAGCTGCCAGGAGTGCACATGTACAGGCTACAGG
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GCCCCACCTATGAGTGCGGTAAGACTATCAAAGACGTTCTCAGACTTTGT
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ACTTTGTTTCAAAACAGACACCTCCCAAAATTTTGCACATACGGAGAAGG
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GTTGTGGTTCAATTTTGATACTATATGCAACACAAGTGGTATATGATCCA
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TATTCTTTTGTATCTGCTAACTGTACTTGTATTATTTTTTGTTGTGACCT
GTACTTAGCCAAGTGTGGCAGAAATGTGCAATAAAGGTCTTCATTCATTC
ATAAAATCTTTGATTCTCCTGTAGAAGGAGTTATCATAATGATTGCAGAT
ACAAAATGCATGTAGCATCTCTAAACACTCCCACACTTTCTGGCATGTCA
GTACTGTTTCAACCCTCATCCTCTCCCCTTTTCGCAGGTCTTTGTAATAA
CAACAAAACGGACGACTGCCAGGACAGGGAGGGGAACATCATGAACGACT
ATAACAACTGCTCCTGTGAATGGAAGGTGGACACGCCCGACAACCCTTCC
AACAGCTGTATTCCCGAACCCAAGCCC Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000465:102963..117439- >transcript:BL96372_cuf11 ID=transcript:BL96372_cuf11|Name=transcript:BL96372_cuf11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2040bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000465:102963..117439- (Branchiostoma lanceolatum) CAGTACTTCTACTTCCAGGGAGAGGGCGAGTTTGTCCTGGCCAGAGACAC CTATGTTCCACGTCACTTTGAGGTCCGTGGTTTCAACGTTCAGTGCACTG TTGAACCCATCACCACCTGCACCAAGGAGATCAAGGTCATCTACAATGGA CACACTGTAGAGCTGAAGGCTGGACATCAGGTGTTTGTGAATGGATCACA GTGGAGTGTACCGTTCAAGTTTGGTGGTATGAAGGTGACTACAATGGGCT TCCCCCTGAAGCTGGAGATCCCGTCCCGGAACGTGACAGTGGTGTATGAC TGGCTGAGCAGTGGCTTCTACATCAGTGTGCCTCCATCCATGTATGCAGG CAAGACTGAGGGACTGTGTGGTCTTTGTAATAACAACAAAACGGACGACT GCCAGGACAGGGAGGGGAACATCATGAACGACTATAACAACTGCTCCTGT GAATGGAAGGTGGACACGCCCGACAACCCTTCCAACAGCTGTATTCCCGA ACCCAAGCCCCAGTACTTCTACTTCCAGGGAGAGGGCGAGTTTGTCCTGG CCAGAGACACCTATGTTCCACGTCACTTTGAGGTCCGTGGTTTCAACGTT CAGTGCACTGTTGAACCCATCACCACCTGCACCAAGGAGATCAAGGTCAT CTACAATGGACACACTGTAGAGCTGAAGGCTGGACATCAGGTGTTTGTGA ATGGATCACAGTGGAGTGTACCGTTCAAGTTTGGTGGTATGAAGGTGACT ACAATGGGCTTCCCCCTGAAGCTGGAGATCCCGTCCCGGAACGTGACAGT GGTGTATGACTGGCTGAGCAGTGGCTTCTACATCAGTGTGCCTCCATCCA TGTATGCAGGCAAGACTGAGGGACTGTGTGGTCTTTGTAATAACAACAAA ACGGACGACTGCCAGGACAGGGAGGGGAACATCATGAACGACTATAACAA CTGCTCCTGTGAATGGAAGGTGGACACGCCCGACAACCCTTCCAACAGCT GTATTCCCGAACCCAAGCCCCAGTACTTCTACTTCCAGGGAGAGGGCGAG TTTGTCCTGGCCAGAGACACCTATGTTCCACGTCACTTTGAGGTCCGTGG TTTCAACGTTCAGTGCACTGTTGAACCCATCACCACCTGCACCAAGGAGA TCAAGGTCATCTACAATGGACACACTGTAGAGCTGAAGGCTGGACATCAG GTGTTTGTGAATGGATCACAGTGGAGTGTACCGTTCAAGTTTGGTGGTAT GAAGGTGACTACAATGGGCTTCCCCCTGAAGCTGGAGATCCCGTCCCGGA ACGTGACAGTGGTGTATGACTGGCTGAGCAGTGGCTTCTACATCAGTGTG CCTCCATCCATGTATGCAGGCAAGACTGAGGGACTGTGTGGTCTTTGTAA TAACAACAAAACGGACGACTGCCAGGACAGGGAGGGGAACATCATGAACG ACTATAACAACTGCTCCTGTGAATGGAAGGTGGACACGCCCGACAACCCT TCCAACAGCTGTATTCCCGAACCCAAGCCCCAGTACTTCTACTTCCAGGG AGAGGGCGAGTTTGTCCTGGCCAGAGACACCTATGTTCCACGTCACTTTG AGGTCCGTGGTTTCAACGTTCAGTGCACTGTTGAACCCATCACCACCTGC ACCAAGGAGATCAAGGTCATCTACAATGGACACACTGTAGAGCTGAAGGC TGGACATCAGGTGTTTGTGAATGGATCACAGTGGAGTGTACCGTTCAAGT TTGGTGGTATGAAGGTGACTACAATGGGCTTCCCCCTGAAGCTGGAGATC CCGTCCCGGAACGTGACAGTGGTGTATGACTGGCTGAGCAGTGGCTTCTA CATCAGTGTGCCTCCATCCATGTATGCAGGCAAGACTGAGGGACTGTGTG GTCTTTGTAATAACAACAAAACGGACGACTGCCAGGACAGGGAGGGGAAC ATCATGAACGACTATAACAACTGCTCCTGTGAATGGAAGGTGGACACGCC CGACAACCCTTCCAACAGCTGTATTCCCGAACCCAAGCCC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000465 | genome | Sc0000465:102963..117439 - |
Properties
Property Name | Value |
Transcript id | BL96372_cuf11 |
Biotype | protein_coding |
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