transcript:BL96238_cuf7 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL96238_cuf7
Unique Nametranscript:BL96238_cuf7
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL96238_cuf7

>transcript:BL96238_cuf7-protein ID=transcript:BL96238_cuf7-protein|Name=transcript:BL96238_cuf7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=387bp
QLICLMLWMLTTGTDIQILCLKLVVSQASATPSAALLLASWVSQPLFSSL
EVQCQSTLYSSLPTIMKSVTAAKFKAFLEDCALQTFVVEEPDPKLCQSVT
NGLLAALKVPDPPQMATQLLYHTVEKVCKEIRLSSGTHEVLSTISECLAE
LPEDLADKITQAHGQADLLKSCYLRGHLVSHGHVPMAWYNACINVAIEAI
EEIEGDEVIQHLTKSFYQCTRFKSRHTGDAARIQWLLEVMGQCRNIAYGK
IPLLQAQSTGSALNKVTQFLVDVFCAAVTCWSCVSLPLLWGVTGTGCQTE
ASSESRMLETVPVLPYAILQLVSSEPWTHVVDKLVDWLMEMYQAPVDLPD
KYKIALMGSVLALRHTTVFKKSSVWTRAYQMLSAVKL
Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000179:178768..189153+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL96238_cuf7 ID=transcript:BL96238_cuf7|Name=transcript:BL96238_cuf7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=10386bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000179:178768..189153+ (Branchiostoma lanceolatum)
CTCAGCTAATATGTTTAATGTTGTGGATGTTGACTACAGGGACAGACATC CAGATCCTGTGCCTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTACACCCAG TGCAGCGCTGCTCCTGGCCTCGTGGGTCTCACAACCTTTGTTTAGTAGCC TGGAGGTTAGTCTGCATGTTCTACTTCTACTTCTATACGTTACTCAACAA AACCCCGCGAGGGGCATAGCGTTGAGGATAAAGTGACAGGGTNCCAGGGC ATGCTTGACAGTTTGTACATGTATGTAACATATGAAAGAGTCTAAAAGAT AATTCAACATTTTATACCCCTAAAAATGATCTCATTTTGGATGTTCTGCC TACAAATTGTATATGATGGACTTGTTGTGGGGTTTTGACTACAGGGACAG ACATCCAGATCCTGTGCTTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTAAT ATGTTTAATGTTGTGAATGTTGACTACAGGGACAGACATCCAGATCCTGT GCCTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTAATATGTTTAATGTTGTG GATGTTGACTACAGGGACAGACATCCAGATCCTGTGCCTGAAGCTGGTGG TGTCCCAGGCCTCAGCTAATATGTTTAATGTTGTGGATGTTGACTACAGG GACAGACATCCAGATCCTGTGCCTGAAGCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGCGGTGGGTATTGCAATCAG CTTGTGGACTGCCTTGTACATAAGAGTGAGGCGGGCAATGTGTCTGCGTT GTTGCAGAGTGGCCCATCCTAGGGAGTGTTGTAGTGAGGTGTTACTGGCA GTGTAGTTGTAATTACCTGTGACAAAACGTGCAGCTTTCCTCTGTACAGA TTCTATCTTGGTGGCTAGCGTGTTGGACTGAGCATTGTGTAGTGTATGTG GATCCCAGACTGAGGAAGCATATTCAAGTTTAGGGCGGACTAATGATGTA TAAGCCTTCTCTCTTACCTCTTTACTTGCCCCCCTTATATTTCTCCTCAC GAACCCCAGGGTTCTGTTGGCCTTGGTTGTGATATCGTTGATGTGTGCCT TCCACTTGAGGTTGTGAGTGAGAATGACACCTAGGTAGGGATGTTCGTTG TTGTGGCTTAGGGGTTCATTGAACATTGTGTACAGGAAATTTGGTGAGCT TCTGGGCTTGTGGATGTGTAGAATAGAGCATTTTTTCACATTGAATTTCA ACTGCCAAGTGCTTGACCATTTGCAAAGTTGGTCTAGGTCGCCTTGGAGT ATGTATTGGTCTTGGTCAGATAGTATGGAGCGGTAAATCAAACAATCATC TGCGAAGAGCCTCAGCTGTGATGTTATATCCTTGTTGATGTCGTTAATGT AGATAAGAAATAACAGGGGCCCCAGAACAGTACCCTGCGGGACTCCTGAC TTGACCTTGACGGGGTNCTGAGGATTTCAGCCTTCCCCTGTCCATCCACG ACTAGTTCGCCGTGGTCCGACAGGGGGGCCACCCCAGAGGCAGTCTGCTT CCTACTCTTCACGTATTGCCAAAACTTTTTGGGGTTCTCTAGCGCCTCAT CTAGGATTTCCTTGAGGTAGTCATTGTGTGCCCTTTTAATTTTATGTTTG GTTAGTCTACGCATCGTTTTAAAATTTTCCCAGTCCTGTTCTTCCATTGT GCTTTTGGCCTTCTTGTAGAGTTTCTTCTTCTTCTTGATTAGGCGTTTGA GTGCCTTGGTCACCCAGGGACAATGGTTTCTGTTTGATAGTTGTTTCTGA GGTTTATATTTGAGAATTAGCTGTTTAAGACCCTTGACAAAATAGTTCCA GTTTTCTTCTACTGAGAAGTTAGATGGTTCTCTATCCTTGAATTGTTTCT CTAATTTATGTAGCCCTTCTGTGAAGGCTACTTTGTCCGTTTTCTTGTAT ATGTATACTGTACGTGGCTTTTTCTTGTTTGGTTTCACTTTAGTTTTCAT GCCTACCGTGACTGCATCATGGTCACTTATTCCTGGTAAGATGCCAGTGC CAAGTCCAGGATGTTTTGCCCACGTGTCGGGGACGACACTACCTGGGACA GGCCAGAGCTCTGCACTACCTCCAGGAACTTTTCGTTCAGTCCCATCCCA TATTGGGGTGAGGGTTTGGCTGAAGGCGTATCTGAGCTCCAGCAAATGTC TGGCATGTTGAAGTCCCCGAATAGTGCAATGTTAGGCGGTGAGGGTTTAT CAACAATGTTACTCAGAGACGTCCCTAATTCATCCACATACACAAGCCCA GAGGTAGGAGGTCTATATGCTGACCCCACACATAACGGTCTATATCCTGC CTGTTGAATCATAGCCCATACAATTTCTGCATTTGTGGAATCCTGAACAG GTGAAGAGACTAGGGAGGTTCTCACTGCAATGAATACCCCCCCTCCTTGG CTATTCCAATCCTTTCTGTATATATCGTAGCCTACAGGGAATATCTCAGC ATCAGTATGAACGGAGTCTAAATGTGACTCGTTGCCACATATGATGTCTG GATTTTCTGTGGCTACTAGTGCCCTGAATTGTGCATTTTTGTCTACACCC CGCAGACTCCTACAGTTCAATGAAAGTATATGTAGGTGTTGTAAAACTCC CTTACCTTTGCCCAGGGGTTGGGTAGTGCAGGGAGAAGAAGTGGAGGTAG GGTTGAATGAGGGAATGCTGTCATTGAGGGTATTCTGTGACAGGCGGGTT GAAGATGGGGATTCTGCAATGAAATCAGATGACATGTGTGAGTTGTCACT GCTATTACTATCATTCCTATCCAGCAGGGGCTCATAAAAGGACCCCTCTC TGTCACTGACCCATGAATGAAAATCAAACAAACTGGATGTAAAACTGGGC ATTCCACAGTTGTTGCAAATCCAAGAGCAAGAAGAATTTTGGTAGTATTT GTACATCTTGTCGCCCACTCCGCAGCATTTGATGTGGACCCATTGGTCGC AATTATCACATTGCATGGCTCTGTGATTAGAGGCTACTGCTCGGCCACAG CCACCGCATGGGAACTTCACTGGGCCGGGGTTGCTGTGGACATCACCAGA TAATAGTATGATAGCCATCAGCAAACCCTCGGGGCCCCTGAAGCCCACTG GGGCCGGCGCTCCGTAGCCTCTGATTAATTTAGGCCTCTGTGATTTACCC AGTAATGAGAGTCCTAGGCCCAGCAGGCTGGGGGAATGGGGCATTATCGT GCCTCTAGACAGTAGTACATGTTGTCTTAAGGATATTTGACGGACATGCA GTTACTCTCTCATTGGTCGAACCACTAATTGTGATGGACAGGCAGGATCA GTCTACTAGAGCTTGGATTTTCTATCAGTTCTCACCGCGCCATCGTAGCT TTGCTCCTTTTATGTAGATGTGTAATGGTATAGTGTTATTGAAACTTACT ATGTGTAGGAATGACTAGAAATCGGATTTTTTTATTCATGTCAGTACGTC TGTACCGCTGGAATGAAAGAAGGGGGAAGAGAAAGGAAAAAAATACACAC CAAATGATAAAAAAATCATAAGAAGGTTGATGGAAAAGCACATAAAGAAA TCTGGAGCATATAACGTTATCGTACCTACAGAACAAAATTCTACAAAATT TTGTACAAACTTTTGTCCATGAGCTAGCCATTCTTGTCTTTTTGAGCAAA ACTAAATTAAAAGTTTTTAAATGAATAGCCTCAAATTTTTCTCAGCACAC AGCTATGTTATACAGAGGTGCTGATTTGTGTGTAAGAAACCAACCAAGTT ATGTTGATGAAGGTTAGACATCCAGGTAACAATATTTAAAGACAATTCCA TCTCAACAACTGGATAAGATAATTTATGGAGATCACTTCCAGATGTTTTG AGTTATGTTTATCACTTTTGTTCCATGACATCGGCGTGACGTAACAGTTA GAGCGTTGAACTCGGAATCAACAGGTCCCGAGTTCGATACTCACCATGCC CCGACGTTGTGCCCTTGGGAAAGGAACTTAGCACTACCTTCCCGGACAGT GTAGTAACGCCCACCGAGCCTATTTGGCTAATCTGTCAAACTGTGTGCCA AAAAACACACTGCGGATTTGGTTGCCGATGTGCCAACATCTAGCACATTT GCCACTGAGAACCGTTAAGCTGTCTTCAGCATCATTAGATTGATTCTATT TTGTTTGCCATAACAGGTGCAATGCCAGTCCACACTCTATTCTTCACTCC CTACCATCATGAAAAGTGTGACTGCTGCCAAATTCAAGGCCTTCTTGGAA GATTGTGCCTTACAGACATTTGTAGTGGAGGAACCAGACCCAAAACTATG CCAATCAGTGACCAATGGCCTTCTGGCTGCACTAAAAGTGCCAGACCCAC CACAAATGGCAACCCAGCTCCTCTACCACACAGTAGAGAAGGTGTGCAAA GAGATACGTCTCAGCAGTGGGACCCATGAAGTGCTGTCCACCATCAGTGA GTGTCTTGCTGAACTGCCAGAGGATCTGGCAGACAAGATCACTCAAGCAC ATGGTCAGGTACGTTTGCTCATAGAAGTAGTAGTAGTTGTAGTAGTAGTA GTTAATAATAGTATTCGGTATTTGATTATACTGCTGCGGGGTTCCCTGAC TCTGGGGTGGGCAGCAGTCGGCTAGTCTTCACACCATGCTTCCTATAGCG GCTCTGTCCAACGGGTCCACACTCATCCCAACTGAAAATCCCTATAGCTT GGAAATCTAGAGAACGATGTACTGTGCCTTAGTAAAGGATACTGCAGTTA AGACTACACAATCAGAGGAATCCAGTATCACATCTGCTTTGACAAATTTA GATAATATTTAACAGTCAACATGCTATTAGCAGCTCCAAACTTCTGCGCT TATAGAATGGCTCCCCAAGTTTCCTGAATACAGTTACTGCCTTGTACAAT AGTTTCAACCACTTTAAAGGACATATGATTTATAAAAAATTTTTCTTTCA GGCTGATCTTCTGAAGTCTTGCTATCTGCGAGGTCACTTGGTGTCTCATG GCCATGTGCCTATGGCATGGTACAACGCCTGCATTAATGTGGCTATAGAG GCCATAGAGGAGATAGAGGGAGATGAGGTGATACAACACCTTACCAAAAG CTTCTATCAGTGTACTCGGTTTAAAAGTCGGCACACAGGTGGGTCTTTTT GTATATAATTTGAGAAATTTCTTGCTAATACATGTACAAGTAGAGTACAA GTACAAGTAGAATTAAGAGTACATGTAGGGGTCCTTCCCGGTATGAGTGG ATCAAACCTTACAGTCTTGTGTACGTCTTAAGTACCGTGCTTGGAGTCCT CAACTTAATGTAACAATGAAGAAGAAGAAAACAAACTATGTATAGCATCA TTATGGAAAACCTTACTCCTTAAGTACACCCAGTTCTGGTTGAATTGATT TTAGCAGTCCTGAACTGTGAAGTTGCACAACATGTAACAAGCCAGTTGAT TACCTTCACCAAGAAGGTTATGTTTTTGCTTTTGCTGTGATGGAGTGGCT ATGGATGTAGACAGAATAAGTCAAGAAGCTGTAAGTCAGTTCATGATTTT TAGTAGATGGGTAGGGGCCGGGGAGACAAAGGTCATATTTGAGAATGGAC CTCCTTAAGGCTTCCTATGTTTCTGCATTGGAACTTTTATAAAAGAACTT TTATTTATTGCACGACAATTGTACATGGTACAATATAAGTATAGAATAAA ACTTAACATCCTAATTACTTTTACAATGAGGGCTAGCATACATTTTGATA AAGTGTTATAATCAAGTGGGGCTAATCATAATCATTGGTTTTGGTACTTT TTTTAATGATAAAGCAGTCGTTTGAATATTTACCTATTTTTGCATTGTGG GGATTGTTGCATTTAAATACATACTTAAAACAGTCTGTAACATCGAGACT CTTAAAGCTTGCTGTACTTGTTTTGAGAAATGTAAATAACTTATTACGTA AAGCATCATATTTAGAGCATTCCATGACAAAGTGAAATTCATCTTCAATT TCCATTTCCATTGGACAAAATGGGCGAAACCTTTGGCCAGGGGCTACAAT ATAATATCTACCCGTCTCTATTTTCAACTTATGACTGCTGATTCTTAACT GAGTTATCGCTTTACGAATATCAAACTTATCTATGTCTGTGTTGTCACCA GGATAACTTGAGATGCTGTGGATAGATTGTCATGATATTTGGCAGGAGGG TAGGGTTTGGGAAAACGAAGGTCAAGTTTGATTATGGGCCTCCTAGCTCC TATTTTTTACACTGTTTTTTGTTTTCATTCCTTTCCCCAGGTGATGCAGC CAGGATCCAGTGGTTGCTGGAAGTGATGGGACAGTGCAGGAACATTGCCT ATGGGAAGATCCCACTCTTACAGGCTCAGTCAACAGGGAGTGCACTAAAC AAGGTTAGCACTCGTCTTACACTCTCCAGTCTATGTCACTACAAAATTGT AATTCTTCATTATTCCTGCCATATTAACAATAACTTCTCTATATCAACAC AACTTACACAAGTATGTACTGCAACTTTTACATACGTTTCCATTTTCATA TATTATATTATATACATGTGTATAAAGAGCCTTCCCTATACTTTATACAT TGTGGAGGCTCTGCCAAACCATGAGATTTCCACTTTTGTGGGGGTAGCCT CTAACCAGCTGTGAGCCAATCAGAGAATTAGTTTTACCTAAAGAAAACAC TAAGACTCATTCCTGTGATTGGCTGACAGCTGCTTGGAGGCCAAAGCCAC AAAAGTGGAAATCTCAGTACATGTATATTGTATAGGTCGCAGGTGAGGCT CTGCATGGGGGAAGTTTCTAGAGTCTAGACTGACCAGAATCTTGTATCCA GTTTGTCTGTGACTGAATGTGTGTAAAGATCATATTCATTTAATCCATTG TTGTTTATATGTTGAAAATGAAACCCACTTTTTACTTGATTGTTCTTTAT ATGAAGATGAGCGCCAATCGCTGTTTAAGACAATAGGATTAGACAAGAAA TGTACAAAAACGTCAAAGCAGGACACTTTTATATACCTGATGTCATGTGA GAACGAACATATAATAGACAAAATATGTAGTCATGTTTCCAAATGTTTCA AGAAGAGAGAAGAAACTACTAGGTGATCAACATTAGTTTAGCAATAGTTC TCACAATCAGTTTATCTATCTTTTAGTTTTTCAATGTTAGAATGTAGCTG CTTATCAATTCATGTCTTGCATTATGCTTCCTATAGACCACGTGTGGTCA TATGTACATTTAGCCCATCTGGGCAGGAATATGCAATAAAGACTATTATT ATTATTATTGTGTTTTTTGATCAGGTGACCCAATTCCTGGTTGATGTTTT CTGTGCTGCTGTGACATGTTGGAGCTGTGTGAGCCTGCCTCTACTGTGGG GAGTCACTGGGACTGGCTGTCAGACAGGTATCATCAGTTTAATAATATAT ACCTTAAGTTCCACAGTAACTCCTGATGATGTTAAGGCAATACAAAGCCT CGAAAAATAACAGTACTGCTTAAGTTGTTTTCTGGAAATCTTGAACTGTA TTTTTCCATGTGCAGTAAATGTCGTAGTCTCCCAAGACTCACTGACATTA GTTGTAGTATGATCAATTGTTGCATTCAAAAATCATGACAACACTGAACT TGATGGTTTGTTTGTTTTGTGGTTGTTTGTATAATATTTGATGCCAAATT ATGATGTTGAATGACAAGTTGTCCTTGGTTAGTATTTTCTTTCCAACTGG TAAATACTTGCTAATTTGACCCCACATAATTGGACAGATTATACTCATTA CCTGACAAAGGAATGCTAAGTAAAAAGCTAATTGAACCAGGGAGACAATA AAGCATAACTTTGGGATATGATCACAACTGTAAAGTTTGAATCTTAGAGC TATACCGCAGCTATCACTTCAGTACCATGGAGAACCATTATCTACAACAA CACTCAGGTCATGCCTAAAGCTTTCAAGTCCTTTAAATATGTGATTTTTT TCAAGCTCTGAGGCCCAGATACAGTTACTCTTGCAGCTCTTGTGTGCTCT CGTGTGTTTTCGTGAGATCTCTCCCAGTTCTCGTGTGACAATTCCGTCAT ATGCTGCGGCGACTGTCATCATATGTGCCTAAGTGCACCTAACTGTTCTT TTTGTAAAAATCCAGACACTGCAGAAGCATCCTCAGAAAGCAGAATGCTG GAGACAGTGCCAGTCTTGCCGTATGCCATTCTTCAGTTGGTATCATCAGA GCCTTGGACCCACGTTGTGGATAAGGTACAAGATCATGTCCAGCACTAGC CTGGGTGCCATCCTCTGTTGTAACCGCTGGTTCAATCTTTTAGCATGCTA ACCACAGAGAGCCAGCGGTCACTACGGAGGATGGTGCCCAGGCTACTTCA GCACCAAAGGAAGCTTTTGAATATTCTGCAAAGCCAAATACAATGGGTAG TAATATTTAATTGTTTGTGTTCTTTGTAAAAGCAGTGATGTGGTGTCGCG GTGGCGTAGTGGCAGGGGGTTTGGCCCCAGAACCCAGAGATACCGGGTTC GAATCCGGGGTTCCCTGCAGCTGATTTGTCCTGTTGACGTTGTGCCCTTG GGAAAGGCACTTTACATGACTTTCCCCACTCTACTCAGGTGAAAATGAGT ACCTAGCTTAGGTTAGGGACGTCCCTCAGATAGGACAAATGGAGGTCCAG TGTTTGAGGAGAGCCACACCTCAAGCATGTTAAAGAACCCAGCACACTTA TCGAAAAGAGTAGGGGTCCTTACCGGTGTGTGTGGATTATATGAATCTGT CCGAATATGCAGGTTGTACTCTTCAGTACAAACCTGGTGTGTTACGCCTT GATGCGGTTTACCGGGTATGCAATACAAACAAACAATCTACTTTATACTT GTATGGTTTTCGTTGCATCAAGAAATGTGTTTTTGTTGTTTGTGGTTAGA GGCATGTTAACGTTAATAAATGAATTACATGATGCCCCATTTTAGAATTC ACTACTATTGTACCATCCAGCTACATGTACTAGAGTATTATGGGCATGAA CTTTGACCTAGTCTNAATTCACCACTATTGTACCATCCAGCTACATGTAC TAGAGTATTATGGGCATGAACTTTGACCTAGTCTTTCTTACTATTTCCAG CTTGTTGATTGGCTGATGGAGATGTACCAGGCTCCCGTGGATCTTCCTGA CAAGTACAAGATAGCACTGATGGGTAATCACAGCTGTCACTGTAATCAAC AATCTTAGACAAAGTACTGTCAATGTGGAAATGTTTGCTGTCTTTGCAGT GACCTCTTCATTTCAAACTTGAAAGTTTAACCACTGCAGAAATGCTTGTT CTGTATCCTGCCCACCCACCCCTTTGTTTCAACTGCAAACTTAGAACCCC TGCAAACACTCCATTTTCTTCCTACCACGAAATTGAAGGCATCCAGAGCA TTTTATGAGGCTTGAAACTTGAATTCCAAAACTCAAATTTCTAGTCATTC CTACACATAGTAAGTTTCAATACCATTACATATCGAAATTAAATGAGCGA AGATACGATGTTGTTGTGTGGTGAGAACTGATAGAAAATCCAAGCCCTAA TAGACTGATCCTGGCTGCCCATCACAATTAGCGGTTCGACCAATGAGAGA GTGACTGCATGTCCGTTAAACATTTGCATTTTTACGTTTAAATTTGCATT TCTACGTTTTGGCGGAGGTGGGCAAGGCTATAGTATCTACAGTATTTACA GTAGGCGCGTGAAACTAAAAGATCACCATGTAGATCATTTTTGTGCCGTT TCTGCACACTTTTGATAAGAGATCCGAACGCAAATGTGGTAAACAGTAGC ATTAAATGTCAAGTTCATAAAGATTACAGCAACTAGAATATTTCCAGTTT TCAAGTCTCATAAAATACTCTGGTTGCCTTTAAATCCCCACAAGTGTAAA TGCAGTTACACCATTTTTGCCTGCTTTCTATGATTTTTGTAGTCATTGAT AAAAGTTGGGGGTTTTTTTTTCAGTAAACGTATTCGATTGGCCTTTGAAA CTCAGTAATATCCTTAAGCTTGTTGTACAGTGCAAGACTTTATGCATTAA TTTCATTATCAGCTGTTTGTAATAGAACATACTGTCATAACTGTTTGAAG TCAAGATGCTGATTGTTCCCATGTTTGCTTCCTGCAGGGTCTGTGCTGGC CTTACGCCATACAACTGTATTCAAGAAGTCTTCAGTCTGGACAAGAGCAT ACCAGATGTTGTCTGCAGTCAAGTTGTGATCTTCTGCCATAGACATGATG CACTTGCATTCACAAGTATAAATCCATAGATTTGAG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000179:178768..189153+

>transcript:BL96238_cuf7 ID=transcript:BL96238_cuf7|Name=transcript:BL96238_cuf7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=9312bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000179:178768..189153+ (Branchiostoma lanceolatum)
CAGCTAATATGTTTAATGTTGTGGATGTTGACTACAGGGACAGACATCCA
GATCCTGTGCCTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTACACCCAGTG
CAGCGCTGCTCCTGGCCTCGTGGGTCTCACAACCTTTGTTTAGTAGCCTG
GAGGTGCAATGCCAGTCCACACTCTATTCTTCACTCCCTACCATCATGAA
AAGTGTGACTGCTGCCAAATTCAAGGCCTTCTTGGAAGATTGTGCCTTAC
AGACATTTGTAGTGGAGGAACCAGACCCAAAACTATGCCAATCAGTGACC
AATGGCCTTCTGGCTGCACTAAAAGTGCCAGACCCACCACAAATGGCAAC
CCAGCTCCTCTACCACACAGTAGAGAAGGTGTGCAAAGAGATACGTCTCA
GCAGTGGGACCCATGAAGTGCTGTCCACCATCAGTGAGTGTCTTGCTGAA
CTGCCAGAGGATCTGGCAGACAAGATCACTCAAGCACATGGTCAGGCTGA
TCTTCTGAAGTCTTGCTATCTGCGAGGTCACTTGGTGTCTCATGGCCATG
TGCCTATGGCATGGTACAACGCCTGCATTAATGTGGCTATAGAGGCCATA
GAGGAGATAGAGGGAGATGAGGTGATACAACACCTTACCAAAAGCTTCTA
TCAGTGTACTCGGTTTAAAAGTCGGCACACAGGTGATGCAGCCAGGATCC
AGTGGTTGCTGGAAGTGATGGGACAGTGCAGGAACATTGCCTATGGGAAG
ATCCCACTCTTACAGGCTCAGTCAACAGGGAGTGCACTAAACAAGGTGAC
CCAATTCCTGGTTGATGTTTTCTGTGCTGCTGTGACATGTTGGAGCTGTG
TGAGCCTGCCTCTACTGTGGGGAGTCACTGGGACTGGCTGTCAGACAGAA
GCATCCTCAGAAAGCAGAATGCTGGAGACAGTGCCAGTCTTGCCGTATGC
CATTCTTCAGTTGGTATCATCAGAGCCTTGGACCCACGTTGTGGATAAGC
TTGTTGATTGGCTGATGGAGATGTACCAGGCTCCCGTGGATCTTCCTGAC
AAGTACAAGATAGCACTGATGGGGTCTGTGCTGGCCTTACGCCATACAAC
TGTATTCAAGAAGTCTTCAGTCTGGACAAGAGCATACCAGATGTTGTCTG
CAGTCAAGTTGTGACAGCTAATATGTTTAATGTTGTGGATGTTGACTACA
GGGACAGACATCCAGATCCTGTGCCTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTC
AGCTACACCCAGTGCAGCGCTGCTCCTGGCCTCGTGGGTCTCACAACCTT
TGTTTAGTAGCCTGGAGGTGCAATGCCAGTCCACACTCTATTCTTCACTC
CCTACCATCATGAAAAGTGTGACTGCTGCCAAATTCAAGGCCTTCTTGGA
AGATTGTGCCTTACAGACATTTGTAGTGGAGGAACCAGACCCAAAACTAT
GCCAATCAGTGACCAATGGCCTTCTGGCTGCACTAAAAGTGCCAGACCCA
CCACAAATGGCAACCCAGCTCCTCTACCACACAGTAGAGAAGGTGTGCAA
AGAGATACGTCTCAGCAGTGGGACCCATGAAGTGCTGTCCACCATCAGTG
AGTGTCTTGCTGAACTGCCAGAGGATCTGGCAGACAAGATCACTCAAGCA
CATGGTCAGGCTGATCTTCTGAAGTCTTGCTATCTGCGAGGTCACTTGGT
GTCTCATGGCCATGTGCCTATGGCATGGTACAACGCCTGCATTAATGTGG
CTATAGAGGCCATAGAGGAGATAGAGGGAGATGAGGTGATACAACACCTT
ACCAAAAGCTTCTATCAGTGTACTCGGTTTAAAAGTCGGCACACAGGTGA
TGCAGCCAGGATCCAGTGGTTGCTGGAAGTGATGGGACAGTGCAGGAACA
TTGCCTATGGGAAGATCCCACTCTTACAGGCTCAGTCAACAGGGAGTGCA
CTAAACAAGGTGACCCAATTCCTGGTTGATGTTTTCTGTGCTGCTGTGAC
ATGTTGGAGCTGTGTGAGCCTGCCTCTACTGTGGGGAGTCACTGGGACTG
GCTGTCAGACAGAAGCATCCTCAGAAAGCAGAATGCTGGAGACAGTGCCA
GTCTTGCCGTATGCCATTCTTCAGTTGGTATCATCAGAGCCTTGGACCCA
CGTTGTGGATAAGCTTGTTGATTGGCTGATGGAGATGTACCAGGCTCCCG
TGGATCTTCCTGACAAGTACAAGATAGCACTGATGGGGTCTGTGCTGGCC
TTACGCCATACAACTGTATTCAAGAAGTCTTCAGTCTGGACAAGAGCATA
CCAGATGTTGTCTGCAGTCAAGTTGTGACAGCTAATATGTTTAATGTTGT
GGATGTTGACTACAGGGACAGACATCCAGATCCTGTGCCTGAAGCTGGTG
GTGTCCCAGGCCTCAGCTACACCCAGTGCAGCGCTGCTCCTGGCCTCGTG
GGTCTCACAACCTTTGTTTAGTAGCCTGGAGGTGCAATGCCAGTCCACAC
TCTATTCTTCACTCCCTACCATCATGAAAAGTGTGACTGCTGCCAAATTC
AAGGCCTTCTTGGAAGATTGTGCCTTACAGACATTTGTAGTGGAGGAACC
AGACCCAAAACTATGCCAATCAGTGACCAATGGCCTTCTGGCTGCACTAA
AAGTGCCAGACCCACCACAAATGGCAACCCAGCTCCTCTACCACACAGTA
GAGAAGGTGTGCAAAGAGATACGTCTCAGCAGTGGGACCCATGAAGTGCT
GTCCACCATCAGTGAGTGTCTTGCTGAACTGCCAGAGGATCTGGCAGACA
AGATCACTCAAGCACATGGTCAGGCTGATCTTCTGAAGTCTTGCTATCTG
CGAGGTCACTTGGTGTCTCATGGCCATGTGCCTATGGCATGGTACAACGC
CTGCATTAATGTGGCTATAGAGGCCATAGAGGAGATAGAGGGAGATGAGG
TGATACAACACCTTACCAAAAGCTTCTATCAGTGTACTCGGTTTAAAAGT
CGGCACACAGGTGATGCAGCCAGGATCCAGTGGTTGCTGGAAGTGATGGG
ACAGTGCAGGAACATTGCCTATGGGAAGATCCCACTCTTACAGGCTCAGT
CAACAGGGAGTGCACTAAACAAGGTGACCCAATTCCTGGTTGATGTTTTC
TGTGCTGCTGTGACATGTTGGAGCTGTGTGAGCCTGCCTCTACTGTGGGG
AGTCACTGGGACTGGCTGTCAGACAGAAGCATCCTCAGAAAGCAGAATGC
TGGAGACAGTGCCAGTCTTGCCGTATGCCATTCTTCAGTTGGTATCATCA
GAGCCTTGGACCCACGTTGTGGATAAGCTTGTTGATTGGCTGATGGAGAT
GTACCAGGCTCCCGTGGATCTTCCTGACAAGTACAAGATAGCACTGATGG
GGTCTGTGCTGGCCTTACGCCATACAACTGTATTCAAGAAGTCTTCAGTC
TGGACAAGAGCATACCAGATGTTGTCTGCAGTCAAGTTGTGACAGCTAAT
ATGTTTAATGTTGTGGATGTTGACTACAGGGACAGACATCCAGATCCTGT
GCCTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTACACCCAGTGCAGCGCTG
CTCCTGGCCTCGTGGGTCTCACAACCTTTGTTTAGTAGCCTGGAGGTGCA
ATGCCAGTCCACACTCTATTCTTCACTCCCTACCATCATGAAAAGTGTGA
CTGCTGCCAAATTCAAGGCCTTCTTGGAAGATTGTGCCTTACAGACATTT
GTAGTGGAGGAACCAGACCCAAAACTATGCCAATCAGTGACCAATGGCCT
TCTGGCTGCACTAAAAGTGCCAGACCCACCACAAATGGCAACCCAGCTCC
TCTACCACACAGTAGAGAAGGTGTGCAAAGAGATACGTCTCAGCAGTGGG
ACCCATGAAGTGCTGTCCACCATCAGTGAGTGTCTTGCTGAACTGCCAGA
GGATCTGGCAGACAAGATCACTCAAGCACATGGTCAGGCTGATCTTCTGA
AGTCTTGCTATCTGCGAGGTCACTTGGTGTCTCATGGCCATGTGCCTATG
GCATGGTACAACGCCTGCATTAATGTGGCTATAGAGGCCATAGAGGAGAT
AGAGGGAGATGAGGTGATACAACACCTTACCAAAAGCTTCTATCAGTGTA
CTCGGTTTAAAAGTCGGCACACAGGTGATGCAGCCAGGATCCAGTGGTTG
CTGGAAGTGATGGGACAGTGCAGGAACATTGCCTATGGGAAGATCCCACT
CTTACAGGCTCAGTCAACAGGGAGTGCACTAAACAAGGTGACCCAATTCC
TGGTTGATGTTTTCTGTGCTGCTGTGACATGTTGGAGCTGTGTGAGCCTG
CCTCTACTGTGGGGAGTCACTGGGACTGGCTGTCAGACAGAAGCATCCTC
AGAAAGCAGAATGCTGGAGACAGTGCCAGTCTTGCCGTATGCCATTCTTC
AGTTGGTATCATCAGAGCCTTGGACCCACGTTGTGGATAAGCTTGTTGAT
TGGCTGATGGAGATGTACCAGGCTCCCGTGGATCTTCCTGACAAGTACAA
GATAGCACTGATGGGGTCTGTGCTGGCCTTACGCCATACAACTGTATTCA
AGAAGTCTTCAGTCTGGACAAGAGCATACCAGATGTTGTCTGCAGTCAAG
TTGTGACAGCTAATATGTTTAATGTTGTGGATGTTGACTACAGGGACAGA
CATCCAGATCCTGTGCCTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTACAC
CCAGTGCAGCGCTGCTCCTGGCCTCGTGGGTCTCACAACCTTTGTTTAGT
AGCCTGGAGGTGCAATGCCAGTCCACACTCTATTCTTCACTCCCTACCAT
CATGAAAAGTGTGACTGCTGCCAAATTCAAGGCCTTCTTGGAAGATTGTG
CCTTACAGACATTTGTAGTGGAGGAACCAGACCCAAAACTATGCCAATCA
GTGACCAATGGCCTTCTGGCTGCACTAAAAGTGCCAGACCCACCACAAAT
GGCAACCCAGCTCCTCTACCACACAGTAGAGAAGGTGTGCAAAGAGATAC
GTCTCAGCAGTGGGACCCATGAAGTGCTGTCCACCATCAGTGAGTGTCTT
GCTGAACTGCCAGAGGATCTGGCAGACAAGATCACTCAAGCACATGGTCA
GGCTGATCTTCTGAAGTCTTGCTATCTGCGAGGTCACTTGGTGTCTCATG
GCCATGTGCCTATGGCATGGTACAACGCCTGCATTAATGTGGCTATAGAG
GCCATAGAGGAGATAGAGGGAGATGAGGTGATACAACACCTTACCAAAAG
CTTCTATCAGTGTACTCGGTTTAAAAGTCGGCACACAGGTGATGCAGCCA
GGATCCAGTGGTTGCTGGAAGTGATGGGACAGTGCAGGAACATTGCCTAT
GGGAAGATCCCACTCTTACAGGCTCAGTCAACAGGGAGTGCACTAAACAA
GGTGACCCAATTCCTGGTTGATGTTTTCTGTGCTGCTGTGACATGTTGGA
GCTGTGTGAGCCTGCCTCTACTGTGGGGAGTCACTGGGACTGGCTGTCAG
ACAGAAGCATCCTCAGAAAGCAGAATGCTGGAGACAGTGCCAGTCTTGCC
GTATGCCATTCTTCAGTTGGTATCATCAGAGCCTTGGACCCACGTTGTGG
ATAAGCTTGTTGATTGGCTGATGGAGATGTACCAGGCTCCCGTGGATCTT
CCTGACAAGTACAAGATAGCACTGATGGGGTCTGTGCTGGCCTTACGCCA
TACAACTGTATTCAAGAAGTCTTCAGTCTGGACAAGAGCATACCAGATGT
TGTCTGCAGTCAAGTTGTGACAGCTAATATGTTTAATGTTGTGGATGTTG
ACTACAGGGACAGACATCCAGATCCTGTGCCTGAAGCTGGTGGTGTCCCA
GGCCTCAGCTACACCCAGTGCAGCGCTGCTCCTGGCCTCGTGGGTCTCAC
AACCTTTGTTTAGTAGCCTGGAGGTGCAATGCCAGTCCACACTCTATTCT
TCACTCCCTACCATCATGAAAAGTGTGACTGCTGCCAAATTCAAGGCCTT
CTTGGAAGATTGTGCCTTACAGACATTTGTAGTGGAGGAACCAGACCCAA
AACTATGCCAATCAGTGACCAATGGCCTTCTGGCTGCACTAAAAGTGCCA
GACCCACCACAAATGGCAACCCAGCTCCTCTACCACACAGTAGAGAAGGT
GTGCAAAGAGATACGTCTCAGCAGTGGGACCCATGAAGTGCTGTCCACCA
TCAGTGAGTGTCTTGCTGAACTGCCAGAGGATCTGGCAGACAAGATCACT
CAAGCACATGGTCAGGCTGATCTTCTGAAGTCTTGCTATCTGCGAGGTCA
CTTGGTGTCTCATGGCCATGTGCCTATGGCATGGTACAACGCCTGCATTA
ATGTGGCTATAGAGGCCATAGAGGAGATAGAGGGAGATGAGGTGATACAA
CACCTTACCAAAAGCTTCTATCAGTGTACTCGGTTTAAAAGTCGGCACAC
AGGTGATGCAGCCAGGATCCAGTGGTTGCTGGAAGTGATGGGACAGTGCA
GGAACATTGCCTATGGGAAGATCCCACTCTTACAGGCTCAGTCAACAGGG
AGTGCACTAAACAAGGTGACCCAATTCCTGGTTGATGTTTTCTGTGCTGC
TGTGACATGTTGGAGCTGTGTGAGCCTGCCTCTACTGTGGGGAGTCACTG
GGACTGGCTGTCAGACAGAAGCATCCTCAGAAAGCAGAATGCTGGAGACA
GTGCCAGTCTTGCCGTATGCCATTCTTCAGTTGGTATCATCAGAGCCTTG
GACCCACGTTGTGGATAAGCTTGTTGATTGGCTGATGGAGATGTACCAGG
CTCCCGTGGATCTTCCTGACAAGTACAAGATAGCACTGATGGGGTCTGTG
CTGGCCTTACGCCATACAACTGTATTCAAGAAGTCTTCAGTCTGGACAAG
AGCATACCAGATGTTGTCTGCAGTCAAGTTGTGACAGCTAATATGTTTAA
TGTTGTGGATGTTGACTACAGGGACAGACATCCAGATCCTGTGCCTGAAG
CTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTACACCCAGTGCAGCGCTGCTCCTGGC
CTCGTGGGTCTCACAACCTTTGTTTAGTAGCCTGGAGGTGCAATGCCAGT
CCACACTCTATTCTTCACTCCCTACCATCATGAAAAGTGTGACTGCTGCC
AAATTCAAGGCCTTCTTGGAAGATTGTGCCTTACAGACATTTGTAGTGGA
GGAACCAGACCCAAAACTATGCCAATCAGTGACCAATGGCCTTCTGGCTG
CACTAAAAGTGCCAGACCCACCACAAATGGCAACCCAGCTCCTCTACCAC
ACAGTAGAGAAGGTGTGCAAAGAGATACGTCTCAGCAGTGGGACCCATGA
AGTGCTGTCCACCATCAGTGAGTGTCTTGCTGAACTGCCAGAGGATCTGG
CAGACAAGATCACTCAAGCACATGGTCAGGCTGATCTTCTGAAGTCTTGC
TATCTGCGAGGTCACTTGGTGTCTCATGGCCATGTGCCTATGGCATGGTA
CAACGCCTGCATTAATGTGGCTATAGAGGCCATAGAGGAGATAGAGGGAG
ATGAGGTGATACAACACCTTACCAAAAGCTTCTATCAGTGTACTCGGTTT
AAAAGTCGGCACACAGGTGATGCAGCCAGGATCCAGTGGTTGCTGGAAGT
GATGGGACAGTGCAGGAACATTGCCTATGGGAAGATCCCACTCTTACAGG
CTCAGTCAACAGGGAGTGCACTAAACAAGGTGACCCAATTCCTGGTTGAT
GTTTTCTGTGCTGCTGTGACATGTTGGAGCTGTGTGAGCCTGCCTCTACT
GTGGGGAGTCACTGGGACTGGCTGTCAGACAGAAGCATCCTCAGAAAGCA
GAATGCTGGAGACAGTGCCAGTCTTGCCGTATGCCATTCTTCAGTTGGTA
TCATCAGAGCCTTGGACCCACGTTGTGGATAAGCTTGTTGATTGGCTGAT
GGAGATGTACCAGGCTCCCGTGGATCTTCCTGACAAGTACAAGATAGCAC
TGATGGGGTCTGTGCTGGCCTTACGCCATACAACTGTATTCAAGAAGTCT
TCAGTCTGGACAAGAGCATACCAGATGTTGTCTGCAGTCAAGTTGTGACA
GCTAATATGTTTAATGTTGTGGATGTTGACTACAGGGACAGACATCCAGA
TCCTGTGCCTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTACACCCAGTGCA
GCGCTGCTCCTGGCCTCGTGGGTCTCACAACCTTTGTTTAGTAGCCTGGA
GGTGCAATGCCAGTCCACACTCTATTCTTCACTCCCTACCATCATGAAAA
GTGTGACTGCTGCCAAATTCAAGGCCTTCTTGGAAGATTGTGCCTTACAG
ACATTTGTAGTGGAGGAACCAGACCCAAAACTATGCCAATCAGTGACCAA
TGGCCTTCTGGCTGCACTAAAAGTGCCAGACCCACCACAAATGGCAACCC
AGCTCCTCTACCACACAGTAGAGAAGGTGTGCAAAGAGATACGTCTCAGC
AGTGGGACCCATGAAGTGCTGTCCACCATCAGTGAGTGTCTTGCTGAACT
GCCAGAGGATCTGGCAGACAAGATCACTCAAGCACATGGTCAGGCTGATC
TTCTGAAGTCTTGCTATCTGCGAGGTCACTTGGTGTCTCATGGCCATGTG
CCTATGGCATGGTACAACGCCTGCATTAATGTGGCTATAGAGGCCATAGA
GGAGATAGAGGGAGATGAGGTGATACAACACCTTACCAAAAGCTTCTATC
AGTGTACTCGGTTTAAAAGTCGGCACACAGGTGATGCAGCCAGGATCCAG
TGGTTGCTGGAAGTGATGGGACAGTGCAGGAACATTGCCTATGGGAAGAT
CCCACTCTTACAGGCTCAGTCAACAGGGAGTGCACTAAACAAGGTGACCC
AATTCCTGGTTGATGTTTTCTGTGCTGCTGTGACATGTTGGAGCTGTGTG
AGCCTGCCTCTACTGTGGGGAGTCACTGGGACTGGCTGTCAGACAGAAGC
ATCCTCAGAAAGCAGAATGCTGGAGACAGTGCCAGTCTTGCCGTATGCCA
TTCTTCAGTTGGTATCATCAGAGCCTTGGACCCACGTTGTGGATAAGCTT
GTTGATTGGCTGATGGAGATGTACCAGGCTCCCGTGGATCTTCCTGACAA
GTACAAGATAGCACTGATGGGGTCTGTGCTGGCCTTACGCCATACAACTG
TATTCAAGAAGTCTTCAGTCTGGACAAGAGCATACCAGATGTTGTCTGCA
GTCAAGTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL96238gene:BL96238Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL96238_cuf7transcript:BL96238_cuf7-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BL96238_cuf7-E1BL96238_cuf7-E1-1564476830-369989Branchiostoma lanceolatumexon
BL96238_cuf7-E2BL96238_cuf7-E2-1564476830-369991Branchiostoma lanceolatumexon
BL96238_cuf7-E3BL96238_cuf7-E3-1564476830-369993Branchiostoma lanceolatumexon
BL96238_cuf7-E4BL96238_cuf7-E4-1564476830-369995Branchiostoma lanceolatumexon
BL96238_cuf7-E5BL96238_cuf7-E5-1564476830-369997Branchiostoma lanceolatumexon
BL96238_cuf7-E6BL96238_cuf7-E6-1564476830-369999Branchiostoma lanceolatumexon
BL96238_cuf7-E7BL96238_cuf7-E7-1564476830-370001Branchiostoma lanceolatumexon
BL96238_cuf7-E8BL96238_cuf7-E8-1564476830-370004Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000179genomeSc0000179:178768..189153 +
Properties
Property NameValue
Transcript idBL96238_cuf7
Biotypeprotein_coding