transcript:BL96226_cuf5 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL96226_cuf5
Unique Nametranscript:BL96226_cuf5
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL96226_cuf5

>transcript:BL96226_cuf5-protein ID=transcript:BL96226_cuf5-protein|Name=transcript:BL96226_cuf5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=455bp
GESYTDPSEPCVRCTCNRGVVTCQVEECLPLTCMDGLMNFQPPDRCCEEC
RDDAMPCMYLGESKLPGEEWLLDECTMCSCVGGEVMCMTERCPPTHCESD
ETPTLSPGMCCPRCMPRPATCTTFGDPHYRTFDGKMIHFQGTCVYTLAAD
CDGGDFEVLVQNDDRGAFGAVSWTQESKINVKGVEIELLQQWVVKVNGQE
VNLPYLRDPVLFIEKSGTTILVNTEIGLKVLWNGHSYLEVSVPGTYKRKT
CGLCGNFNNFPQDDMRLRNGQITNSAAVFGNSWKVNTPGSPACEDSEDLD
PCVKAGYRARKEANAKCLVLKSDKFLPCHRVINPEMYFASCVYDLCACGS
NDQCLCDALSAYAAECSAAGVVLNWRSPSMCAIGCPSERGLMFDECGPIC
PRTCANKHTVLGDVPTPCFKPCIPSCQCPAGQVLWDNQCVTPGQCPDTGL
YNIFR
Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000003:5662896..5669535+

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL96226_cuf5 ID=transcript:BL96226_cuf5|Name=transcript:BL96226_cuf5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=6640bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:5662896..5669535+ (Branchiostoma lanceolatum)
GGAGAGTCATACACAGACCCCAGCGAGCCGTGCGTGAGGTGCACCTGTAA CCGCGGGGTCGTGACCTGTCAGGTGGAGGAGTGCCTCCCTCTCACCTGTA TGGACGGGCTGATGAACTTCCAGCCTCCGGATAGATGCTGTGAGGAGTGC AGAGGTCAGTTTTGTATTATGTCTATCCATCAACTGTGCCACAACAAAGT CAGCTGCGCTACTTTCAATGCTTTGCTTTAAAAGAAATATGATCTTACCT ACCTGTTAATGTCTCTTTCTTCTGCAAATGATAATATGTTTCATGAGCAT TTGTTGTTTTAGATAGGTAATTGTTAAAGAAATTTGAAAGGATTTTAAAG ACATTTGAAAGGATTTTAAGGATGTCATAGGAAATACATTTTGTATATGG AACCTATGGTATCTTGAATTCTTGATCCAGGGATAATTTGTACAACTCAT GTGGTAACTTATAATCCACTCTAAGTACAGAATCAGTGGGTCATCCACAT TGGAACTATGTTATTGATAGATTGATTCATTCTGTAATTTTTATCTTTGA CATTTACCCCATGTCTCCAGATGATGCGATGCCATGCATGTACCTGGGTG AGTCCAAGCTGCCCGGCGAGGAGTGGCTGTTGGATGAGTGCACCATGTGC TCCTGTGTGGGAGGGGAGGTCATGTGTATGACAGAGCGATGCCCGCCGAC GCACTGTGAGTCTGACGAGACCCCCACCCTGTCACCCGGCATGTGCTGCC CAAGATGTATGCCAAGTGAGTGTAGATTTCCAGCAAACTTTGCAATGTTT AAAGGATGCAAAAGTAGCATTGTCTTTTGCAATTTTAGCAAGTAGTGTCT GCATTCTAGATTGTTATTTTGAATGTGTTACAGTAATGTGTGACATTTTC ATCTTCCTTATATCCCTGTCACACAGCATGAAAGGAAAAACAAGTCTGCG AGATTGAAATTACATTTTTTTGCAGTAATATGCCTGGTGTTCTCTCAATT ATCGCCCGTTTATTTGGGATCAGCTGATATTCACAGGTCACTGAACCCTG TCAATTTTAAAATTGGTTGATCCTCTGCAGTCAGGAAATACAGTCAAAGC TAGTCAACTGTGTGATGGGTGTAAAGGTTGTTTGACATATCGTACCTTCT CCTTTCAGGACCAGCCACATGTACAACATTTGGTGACCCTCACTACCGAA CGTTTGACGGGAAGATGATCCACTTCCAGGGCACCTGTGTGTACACCCTG GCCGCAGACTGTGATGGAGGAGACTTTGAGTAAGTGGAACTAGGGCCACA GTTCATCACTTCACTCATTAAGGATTTTGATATTTTACTGTGATGGCAGA GATTTTGAGTAAGCGGCCTGTGTGGCCAAACAAGCATACAAAGGAAAATA AAGGCTTTGACTTGGCTTAACCTTCTACCTGATGTCTAGCGCCGTATCCA ACACAAATCTGTAGCCAACAGGCTATCTCAGAAGGGAGAAGGTTAAGATA GGAAAGGTTTTGATGTTCTTAGTTTTTTCTGGTTTGATAAAGAGAGTGTG TTACATTCATGGTTGTCGTGTTTATATACATGTCTGTCCTTGGTGCTGAA ATGTGTGTAATTGCTTTCCCCTGTTGAGAGTCTGCTTGTCAGATGTTCAA TCGCTTTTAGATCCACTATGAAATGTTACTAACAGTTATCAAAGCTTGTG TTTTCAAGCCCGGAATGATTTCATTTTTTGATGGACCAACTTTTTTTTCT TTACCCTCTCAGTCTTGTTACAGGTATTAACTTCTTCTTTGAACAATAAC TAAGGTGACAAATCTTACTGTTAGCACTTGCCTTAAAACTGTGACTTACA ATTCATATGACATAACTAATAGTGCTAAAAGTGTTGCTGTGTTCTTACTG TTCCAGAGTGCTCGTTCAGAATGATGACAGAGGTGCTTTTGGTGCTGTCT CCTGGACACAGGAGTCAAAGATAAATGTGAAGGGTGTGGAGATTGAGCTT CTCCAGCAGTGGGTTGTCAAGGTGAGCACTTTGTTCTATCATTTTATTTG CTGTGCTTTGCCAATTTGAATTTATCAATTTCAATCCAAATACACCAATT CTTGTTTTCTGCATATAACTTTATGTCAAACCAAATTTGATTTGAATGCT ATTTATCATGAATTATAATTTATATCATAAATGTGAATTAACCTCAATAT TTTTCAATATGTTTCAATACACCGCTATAATATGAATTATAATTTATATC ATAAATGTGAATTAACCTCAATATTTTTCAATATATTTCAATTCACCGCT GTCTCTTGCCTTAGCTACATTAGTTCAATTAGTTCAATGCTTAGAAGTGG CCCCTTATCGCCTTGCATTGAGCGAGATTTTTTTTTAAATGTTCACTAGT CATACTCTGCTTATGGCAACAAAGGATGATCACATAGGTAAGATAAGAAA TTTGAAGGACTCACCTTTTAGGATTAGGATTTTACTGTACAGTTCTGTTT TAAAAATTGTTTTTGATTTGCCCACCAGGTGAATGGACAGGAGGTGAACC TGCCGTACCTGAGGGATCCAGTACTGTTTATAGAGAAGAGCGGCACCACC ATCTTGGTCAATACTGAGATTGGACTCAAGGTATTGGGTTTTGACTAATC TCCAAGCAGATCTACACCAGTACCAAAATTGTATAAGTTAGCCAGAGAAG GTCCAATCAGGCACCGGTATACGATTTTGGCGCCAGTGTAGATCTGCTTG GAGATTAGGTTTTGCCATTGTGCAGTATACTTATTGTTTTTATGTTAAAG GTTTGCTCGGAAAATAAAAATGTTGTTCTTTGTTCCATTGACCCGCATTC TTTTTCTCTTATAATATAACTATAGCCTATGGGCACTTTACTGAGGACTA GTACAATGTATGTGTCATAATGATGTGAGCTTTTCTTCAGATAAGTCACT TCAACTTCAGCTATCTTCATTGAACTTTTCAACCCAAAGTTGAAAATGTA ACATTCATTTGGTATTCCAGGTCCTTTGGAATGGCCACAGCTATCTGGAA GTCAGTGTTCCAGGTACGTACAAGAGGAAAACCTGTGGGCTGTGTGGGAA CTTCAACAACTTCCCTCAGGACGACATGCGCTTACGGAACGGACAGATCA CTAACTCGGCCGCCGTATTTGGGAACAGCTGGAAGGTGGATATTCATTAA CTTTGTATTTACAAGTCCACGGGATAAAATCTGTAATATAATGGCAACCT GAAAATGTATTGATTGTTCCTCTACTGGCATAGGACTAATCAAAATGCAT GATAATGTGTACACTGAATAGATACAGACTGTCAACAGATGGCTATAGCA GTAGTAATTAAGATCATAACAGACATAAATGGAATCAAAATGTAATGATG ATTATCAAATATTCTGTTAACCTTTGTATATAGCATACCCAATGTAATCC CTTTGTTGTTTTGTATTACAGGTTAACACCCCTGGTAGCCCTGCGTGTGA GGACTCTGAAGACTTGGACCCCTGTGTCAAGGCAGGCTACCGGGCTCGCA AGGAGGCCAATGCCAAATGTCTGGTGCTGAAGTCTGACAAATTCTTGCCT TGTCACAGGGTAAATATCATTGATATCAATCAGCAGATCATAATTTGTTG ATTTATGATTGAATGAATATTTTTGAGATTTTCTGCAGGAAACTACTGGG TTAAAAGCAAAAAATACATGATCAAAATAAATTTTATTCAAAGCCATTAT AAGATTATGTCTCTATTCTTGATATGATACCTGTATTTCTAGTAGTCGTG TAGGGCAAATGGGCACCCTTGAGTAGAAATTGTTATTAGATATTACATAA ACCAAATGAGTTATGTTGGTCTTCTACATACATACCCACACACATACAAA TGCTACCAAAAACATAACCATTTTGGCGACACCCTTGACGGTCGAATTTA TAAAGCTAAAAGCTTTTCCTTTTGATGTGAGCCAAACATTACTTTCTGAC TTCTTGATTCACACTTAATACTTTTCCTTATGAATTTTCCCCCACAGGTG ATCAACCCGGAAATGTACTTTGCGTCCTGTGTGTATGACCTGTGTGCCTG CGGTTCCAACGACCAGTGCCTGTGTGACGCCCTGAGTGCTTACGCTGCTG AATGTTCAGCAGCAGGGGTCGTACTGAACTGGAGATCGCCCTCCATGTGT GGTGAGTTCTTGAAAAAAATGTCTTCACTTTCCACTATAGCAGTCTCTAC CTAGCACTTTTGTGTTGATGTTTTTTTGCTGCCTATTTCACCAAAGCACG ACAGCAGAATTGCAAAAAAAAAAAATAACAATGAGCTTTGATGTGTCATT TTACCTCAGTCTGTGATTTTTTTTCACCCATGTGGTATCTTTCTGTTACC AACACAAGTGAACATGTGTCTAACTTGTTAAAAGGCAATGTATAGGCCTA TAGGCTATACTGGTAAAGTCATACTCAATTGTGAGATGACATTGAATAGA TTTGATCCAAACTGCACAATTGAATCCCTGTTCTGAGCCAGGAAAAGGTT TAGAAATTGCTATTTTCCCATTTGCTGAATGGGTTAATTTGTTAATGGCT TTGCAATGTCTTCTTTTTCTACAGCGATTGGCTGCCCATCGGAGAGAGGA CTAATGTTTGACGAGTGTGGGCCGATATGCCCGAGAACATGTGCCAACAA ACACACAGTATTAGGGGACGTCCCCACACCATGTTTCAAACCCTGCATCC CCAGCTGTCAGTGTCCCGCGGGACAAGTGTTATGGGACAACCAATGTGTC ACACCCGGACAATGTCCAGATACCGGTTTATATAATATCTTTAGGTGATA GAGTATATTTCTGTTTAGGTCATAAGATATAGTGAAATATGCAGGGATGC GTCAGGTTTTTTGCTTTACACATTCAAGGGGTACTTGTGTAATATCCAAG CAGATGTAGAAGTCTGGCTTGTTTTAAGCGTATTTGTACGCTTTTTTGGA GGTGTATTATTTTTACAGATACATGTACCAGTGCCAGTCGGATATCTGCA AAAAGCAAGCACCCACAGAAAAACGTATGTTCGAATATACTCAACACAAG CCTGACTGCTACATATGCTTGGAGATTTCTACTTGTCCATTCTTAGTAGA AATTTACTAGAAACAGGCGATTTCTACCCCTGGCCGAATTCTCTGGACAT ACAGTCTATGATAGCATCCAATATTTGGACAAAATGTGAAAAAATGTAAA AAAAAGTAAGAATGTATGTGTTTAAGAATTATGACAATCTGAGATGGAGT GCTTCAAAGACCATTCTTAGAGTCCATTTGTAGGCTTTATTGTATGATAT GATAGTGCCTAAATGTTAACATATCGTGATATATTTTAGATTCCATTGAT TTGAGAGATGCACAATCATGTAACCAAAATAAGGCACATCTTGTATTTCA TCTCTCTCTCTTTTTGTACATAGCTCATTCCAATATACGACATTCATGCC TAACATGAAATGTTATGTACAGTTGATAATCGATATTTCAATATTATTGA TACTAATAACTAGAAACTTTTGAGAAGTATGATGTATCTAGCCTTGGTAT AGAATAGTTTTCAAAGCCTGATCATAATATTTTGTTCTTCCACAAGCTGA GCTTGTGGTGATGTAAACAACTACATGTAGTTAACCTTCTCCTAGCTTCC TAACCCCATAACCAATAAACATTTGATGCCAGACAGCTACTTTAGCAGGG AGAAGGTTAAGCAAAACTGTGTGCTACATTGTGTTCGCTGATTCTTCTTC AACATTCTCTGAAGAGGTACATGTAGCAGCTAGAAATTTAGACATCTCTT CTTAAGTTTCCAATTTTCACTGTGTTATATGGAGTAAGACAAATGTCACT ACTACCTCACAATCTCAAGCCATATCCAGTGTTGGAAGTTGAAGTTAAGA ATTATTTTCTTAATGACTTCTAAAAACACAGGTAAAGTTCATACTAATGT CAAGAAAGCCATCATCTCTTGTTAGATAGTATTTACCATTCCTCAACAAA TGTACAGAAAGAACTGCTTACTCAGATTCAGATATCTCTAAGACTCAGAT ATCTTTAATGTTGTTTTTGATGTACAGTCAAAACTAATCAAGAAGACAAC TTAGGGGGCCAATAGAATCTGGTCTATGTCAATGGGAAAATTATCTTAGG GACCACCAAATAAATGGTCACATTCACATTGGCCAGGTGGTCCTTATGTA GAGGTGGTCACTTGAACAGGTTTGACTGTATTTACCAGTTTGCATTGTGT TTCGTTTGGTGCTTTAATCATAACACATTTGGTGCTTGACTTTTTTGTAT TTACAGTGTATTTATAAATCAAGAACAATCATGGTGCCAGGTAAGGGAAG ATAAGGTGTTACTATGCAAAGTTCCAGAACAGGGATATAGGTTTTGTAGT CACAATATTCCCTACATATGTATATGCCTTGGTCATCCATACTCAGACCA AAGACTATGCTCATATTTTTGCTACACAAATACAAGTCATTTCTTACATA ACGTTACATGTCATTAGTCATTGTGTCTGAAAACATTAGTATCTATGCAT CATGATAGCATCTTCATGGGTGATAGTGAGACACACTCAG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:5662896..5669535+

>transcript:BL96226_cuf5 ID=transcript:BL96226_cuf5|Name=transcript:BL96226_cuf5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=12312bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:5662896..5669535+ (Branchiostoma lanceolatum)
GGAGAGTCATACACAGACCCCAGCGAGCCGTGCGTGAGGTGCACCTGTAA
CCGCGGGGTCGTGACCTGTCAGGTGGAGGAGTGCCTCCCTCTCACCTGTA
TGGACGGGCTGATGAACTTCCAGCCTCCGGATAGATGCTGTGAGGAGTGC
AGAGATGATGCGATGCCATGCATGTACCTGGGTGAGTCCAAGCTGCCCGG
CGAGGAGTGGCTGTTGGATGAGTGCACCATGTGCTCCTGTGTGGGAGGGG
AGGTCATGTGTATGACAGAGCGATGCCCGCCGACGCACTGTGAGTCTGAC
GAGACCCCCACCCTGTCACCCGGCATGTGCTGCCCAAGATGTATGCCAAG
ACCAGCCACATGTACAACATTTGGTGACCCTCACTACCGAACGTTTGACG
GGAAGATGATCCACTTCCAGGGCACCTGTGTGTACACCCTGGCCGCAGAC
TGTGATGGAGGAGACTTTGAAGTGCTCGTTCAGAATGATGACAGAGGTGC
TTTTGGTGCTGTCTCCTGGACACAGGAGTCAAAGATAAATGTGAAGGGTG
TGGAGATTGAGCTTCTCCAGCAGTGGGTTGTCAAGGTGAATGGACAGGAG
GTGAACCTGCCGTACCTGAGGGATCCAGTACTGTTTATAGAGAAGAGCGG
CACCACCATCTTGGTCAATACTGAGATTGGACTCAAGGTCCTTTGGAATG
GCCACAGCTATCTGGAAGTCAGTGTTCCAGGTACGTACAAGAGGAAAACC
TGTGGGCTGTGTGGGAACTTCAACAACTTCCCTCAGGACGACATGCGCTT
ACGGAACGGACAGATCACTAACTCGGCCGCCGTATTTGGGAACAGCTGGA
AGGTTAACACCCCTGGTAGCCCTGCGTGTGAGGACTCTGAAGACTTGGAC
CCCTGTGTCAAGGCAGGCTACCGGGCTCGCAAGGAGGCCAATGCCAAATG
TCTGGTGCTGAAGTCTGACAAATTCTTGCCTTGTCACAGGGTGATCAACC
CGGAAATGTACTTTGCGTCCTGTGTGTATGACCTGTGTGCCTGCGGTTCC
AACGACCAGTGCCTGTGTGACGCCCTGAGTGCTTACGCTGCTGAATGTTC
AGCAGCAGGGGTCGTACTGAACTGGAGATCGCCCTCCATGTGTGCGATTG
GCTGCCCATCGGAGAGAGGACTAATGTTTGACGAGTGTGGGCCGATATGC
CCGAGAACATGTGCCAACAAACACACAGTATTAGGGGACGTCCCCACACC
ATGTTTCAAACCCTGCATCCCCAGCTGTCAGTGTCCCGCGGGACAAGTGT
TATGGGACAACCAATGTGTCACACCCGGACAATGTCCAGATACCGGTTTA
TATAATATCTTTAGGTGAGGAGAGTCATACACAGACCCCAGCGAGCCGTG
CGTGAGGTGCACCTGTAACCGCGGGGTCGTGACCTGTCAGGTGGAGGAGT
GCCTCCCTCTCACCTGTATGGACGGGCTGATGAACTTCCAGCCTCCGGAT
AGATGCTGTGAGGAGTGCAGAGATGATGCGATGCCATGCATGTACCTGGG
TGAGTCCAAGCTGCCCGGCGAGGAGTGGCTGTTGGATGAGTGCACCATGT
GCTCCTGTGTGGGAGGGGAGGTCATGTGTATGACAGAGCGATGCCCGCCG
ACGCACTGTGAGTCTGACGAGACCCCCACCCTGTCACCCGGCATGTGCTG
CCCAAGATGTATGCCAAGACCAGCCACATGTACAACATTTGGTGACCCTC
ACTACCGAACGTTTGACGGGAAGATGATCCACTTCCAGGGCACCTGTGTG
TACACCCTGGCCGCAGACTGTGATGGAGGAGACTTTGAAGTGCTCGTTCA
GAATGATGACAGAGGTGCTTTTGGTGCTGTCTCCTGGACACAGGAGTCAA
AGATAAATGTGAAGGGTGTGGAGATTGAGCTTCTCCAGCAGTGGGTTGTC
AAGGTGAATGGACAGGAGGTGAACCTGCCGTACCTGAGGGATCCAGTACT
GTTTATAGAGAAGAGCGGCACCACCATCTTGGTCAATACTGAGATTGGAC
TCAAGGTCCTTTGGAATGGCCACAGCTATCTGGAAGTCAGTGTTCCAGGT
ACGTACAAGAGGAAAACCTGTGGGCTGTGTGGGAACTTCAACAACTTCCC
TCAGGACGACATGCGCTTACGGAACGGACAGATCACTAACTCGGCCGCCG
TATTTGGGAACAGCTGGAAGGTTAACACCCCTGGTAGCCCTGCGTGTGAG
GACTCTGAAGACTTGGACCCCTGTGTCAAGGCAGGCTACCGGGCTCGCAA
GGAGGCCAATGCCAAATGTCTGGTGCTGAAGTCTGACAAATTCTTGCCTT
GTCACAGGGTGATCAACCCGGAAATGTACTTTGCGTCCTGTGTGTATGAC
CTGTGTGCCTGCGGTTCCAACGACCAGTGCCTGTGTGACGCCCTGAGTGC
TTACGCTGCTGAATGTTCAGCAGCAGGGGTCGTACTGAACTGGAGATCGC
CCTCCATGTGTGCGATTGGCTGCCCATCGGAGAGAGGACTAATGTTTGAC
GAGTGTGGGCCGATATGCCCGAGAACATGTGCCAACAAACACACAGTATT
AGGGGACGTCCCCACACCATGTTTCAAACCCTGCATCCCCAGCTGTCAGT
GTCCCGCGGGACAAGTGTTATGGGACAACCAATGTGTCACACCCGGACAA
TGTCCAGATACCGGTTTATATAATATCTTTAGGTGAGGAGAGTCATACAC
AGACCCCAGCGAGCCGTGCGTGAGGTGCACCTGTAACCGCGGGGTCGTGA
CCTGTCAGGTGGAGGAGTGCCTCCCTCTCACCTGTATGGACGGGCTGATG
AACTTCCAGCCTCCGGATAGATGCTGTGAGGAGTGCAGAGATGATGCGAT
GCCATGCATGTACCTGGGTGAGTCCAAGCTGCCCGGCGAGGAGTGGCTGT
TGGATGAGTGCACCATGTGCTCCTGTGTGGGAGGGGAGGTCATGTGTATG
ACAGAGCGATGCCCGCCGACGCACTGTGAGTCTGACGAGACCCCCACCCT
GTCACCCGGCATGTGCTGCCCAAGATGTATGCCAAGACCAGCCACATGTA
CAACATTTGGTGACCCTCACTACCGAACGTTTGACGGGAAGATGATCCAC
TTCCAGGGCACCTGTGTGTACACCCTGGCCGCAGACTGTGATGGAGGAGA
CTTTGAAGTGCTCGTTCAGAATGATGACAGAGGTGCTTTTGGTGCTGTCT
CCTGGACACAGGAGTCAAAGATAAATGTGAAGGGTGTGGAGATTGAGCTT
CTCCAGCAGTGGGTTGTCAAGGTGAATGGACAGGAGGTGAACCTGCCGTA
CCTGAGGGATCCAGTACTGTTTATAGAGAAGAGCGGCACCACCATCTTGG
TCAATACTGAGATTGGACTCAAGGTCCTTTGGAATGGCCACAGCTATCTG
GAAGTCAGTGTTCCAGGTACGTACAAGAGGAAAACCTGTGGGCTGTGTGG
GAACTTCAACAACTTCCCTCAGGACGACATGCGCTTACGGAACGGACAGA
TCACTAACTCGGCCGCCGTATTTGGGAACAGCTGGAAGGTTAACACCCCT
GGTAGCCCTGCGTGTGAGGACTCTGAAGACTTGGACCCCTGTGTCAAGGC
AGGCTACCGGGCTCGCAAGGAGGCCAATGCCAAATGTCTGGTGCTGAAGT
CTGACAAATTCTTGCCTTGTCACAGGGTGATCAACCCGGAAATGTACTTT
GCGTCCTGTGTGTATGACCTGTGTGCCTGCGGTTCCAACGACCAGTGCCT
GTGTGACGCCCTGAGTGCTTACGCTGCTGAATGTTCAGCAGCAGGGGTCG
TACTGAACTGGAGATCGCCCTCCATGTGTGCGATTGGCTGCCCATCGGAG
AGAGGACTAATGTTTGACGAGTGTGGGCCGATATGCCCGAGAACATGTGC
CAACAAACACACAGTATTAGGGGACGTCCCCACACCATGTTTCAAACCCT
GCATCCCCAGCTGTCAGTGTCCCGCGGGACAAGTGTTATGGGACAACCAA
TGTGTCACACCCGGACAATGTCCAGATACCGGTTTATATAATATCTTTAG
GTGAGGAGAGTCATACACAGACCCCAGCGAGCCGTGCGTGAGGTGCACCT
GTAACCGCGGGGTCGTGACCTGTCAGGTGGAGGAGTGCCTCCCTCTCACC
TGTATGGACGGGCTGATGAACTTCCAGCCTCCGGATAGATGCTGTGAGGA
GTGCAGAGATGATGCGATGCCATGCATGTACCTGGGTGAGTCCAAGCTGC
CCGGCGAGGAGTGGCTGTTGGATGAGTGCACCATGTGCTCCTGTGTGGGA
GGGGAGGTCATGTGTATGACAGAGCGATGCCCGCCGACGCACTGTGAGTC
TGACGAGACCCCCACCCTGTCACCCGGCATGTGCTGCCCAAGATGTATGC
CAAGACCAGCCACATGTACAACATTTGGTGACCCTCACTACCGAACGTTT
GACGGGAAGATGATCCACTTCCAGGGCACCTGTGTGTACACCCTGGCCGC
AGACTGTGATGGAGGAGACTTTGAAGTGCTCGTTCAGAATGATGACAGAG
GTGCTTTTGGTGCTGTCTCCTGGACACAGGAGTCAAAGATAAATGTGAAG
GGTGTGGAGATTGAGCTTCTCCAGCAGTGGGTTGTCAAGGTGAATGGACA
GGAGGTGAACCTGCCGTACCTGAGGGATCCAGTACTGTTTATAGAGAAGA
GCGGCACCACCATCTTGGTCAATACTGAGATTGGACTCAAGGTCCTTTGG
AATGGCCACAGCTATCTGGAAGTCAGTGTTCCAGGTACGTACAAGAGGAA
AACCTGTGGGCTGTGTGGGAACTTCAACAACTTCCCTCAGGACGACATGC
GCTTACGGAACGGACAGATCACTAACTCGGCCGCCGTATTTGGGAACAGC
TGGAAGGTTAACACCCCTGGTAGCCCTGCGTGTGAGGACTCTGAAGACTT
GGACCCCTGTGTCAAGGCAGGCTACCGGGCTCGCAAGGAGGCCAATGCCA
AATGTCTGGTGCTGAAGTCTGACAAATTCTTGCCTTGTCACAGGGTGATC
AACCCGGAAATGTACTTTGCGTCCTGTGTGTATGACCTGTGTGCCTGCGG
TTCCAACGACCAGTGCCTGTGTGACGCCCTGAGTGCTTACGCTGCTGAAT
GTTCAGCAGCAGGGGTCGTACTGAACTGGAGATCGCCCTCCATGTGTGCG
ATTGGCTGCCCATCGGAGAGAGGACTAATGTTTGACGAGTGTGGGCCGAT
ATGCCCGAGAACATGTGCCAACAAACACACAGTATTAGGGGACGTCCCCA
CACCATGTTTCAAACCCTGCATCCCCAGCTGTCAGTGTCCCGCGGGACAA
GTGTTATGGGACAACCAATGTGTCACACCCGGACAATGTCCAGATACCGG
TTTATATAATATCTTTAGGTGAGGAGAGTCATACACAGACCCCAGCGAGC
CGTGCGTGAGGTGCACCTGTAACCGCGGGGTCGTGACCTGTCAGGTGGAG
GAGTGCCTCCCTCTCACCTGTATGGACGGGCTGATGAACTTCCAGCCTCC
GGATAGATGCTGTGAGGAGTGCAGAGATGATGCGATGCCATGCATGTACC
TGGGTGAGTCCAAGCTGCCCGGCGAGGAGTGGCTGTTGGATGAGTGCACC
ATGTGCTCCTGTGTGGGAGGGGAGGTCATGTGTATGACAGAGCGATGCCC
GCCGACGCACTGTGAGTCTGACGAGACCCCCACCCTGTCACCCGGCATGT
GCTGCCCAAGATGTATGCCAAGACCAGCCACATGTACAACATTTGGTGAC
CCTCACTACCGAACGTTTGACGGGAAGATGATCCACTTCCAGGGCACCTG
TGTGTACACCCTGGCCGCAGACTGTGATGGAGGAGACTTTGAAGTGCTCG
TTCAGAATGATGACAGAGGTGCTTTTGGTGCTGTCTCCTGGACACAGGAG
TCAAAGATAAATGTGAAGGGTGTGGAGATTGAGCTTCTCCAGCAGTGGGT
TGTCAAGGTGAATGGACAGGAGGTGAACCTGCCGTACCTGAGGGATCCAG
TACTGTTTATAGAGAAGAGCGGCACCACCATCTTGGTCAATACTGAGATT
GGACTCAAGGTCCTTTGGAATGGCCACAGCTATCTGGAAGTCAGTGTTCC
AGGTACGTACAAGAGGAAAACCTGTGGGCTGTGTGGGAACTTCAACAACT
TCCCTCAGGACGACATGCGCTTACGGAACGGACAGATCACTAACTCGGCC
GCCGTATTTGGGAACAGCTGGAAGGTTAACACCCCTGGTAGCCCTGCGTG
TGAGGACTCTGAAGACTTGGACCCCTGTGTCAAGGCAGGCTACCGGGCTC
GCAAGGAGGCCAATGCCAAATGTCTGGTGCTGAAGTCTGACAAATTCTTG
CCTTGTCACAGGGTGATCAACCCGGAAATGTACTTTGCGTCCTGTGTGTA
TGACCTGTGTGCCTGCGGTTCCAACGACCAGTGCCTGTGTGACGCCCTGA
GTGCTTACGCTGCTGAATGTTCAGCAGCAGGGGTCGTACTGAACTGGAGA
TCGCCCTCCATGTGTGCGATTGGCTGCCCATCGGAGAGAGGACTAATGTT
TGACGAGTGTGGGCCGATATGCCCGAGAACATGTGCCAACAAACACACAG
TATTAGGGGACGTCCCCACACCATGTTTCAAACCCTGCATCCCCAGCTGT
CAGTGTCCCGCGGGACAAGTGTTATGGGACAACCAATGTGTCACACCCGG
ACAATGTCCAGATACCGGTTTATATAATATCTTTAGGTGAGGAGAGTCAT
ACACAGACCCCAGCGAGCCGTGCGTGAGGTGCACCTGTAACCGCGGGGTC
GTGACCTGTCAGGTGGAGGAGTGCCTCCCTCTCACCTGTATGGACGGGCT
GATGAACTTCCAGCCTCCGGATAGATGCTGTGAGGAGTGCAGAGATGATG
CGATGCCATGCATGTACCTGGGTGAGTCCAAGCTGCCCGGCGAGGAGTGG
CTGTTGGATGAGTGCACCATGTGCTCCTGTGTGGGAGGGGAGGTCATGTG
TATGACAGAGCGATGCCCGCCGACGCACTGTGAGTCTGACGAGACCCCCA
CCCTGTCACCCGGCATGTGCTGCCCAAGATGTATGCCAAGACCAGCCACA
TGTACAACATTTGGTGACCCTCACTACCGAACGTTTGACGGGAAGATGAT
CCACTTCCAGGGCACCTGTGTGTACACCCTGGCCGCAGACTGTGATGGAG
GAGACTTTGAAGTGCTCGTTCAGAATGATGACAGAGGTGCTTTTGGTGCT
GTCTCCTGGACACAGGAGTCAAAGATAAATGTGAAGGGTGTGGAGATTGA
GCTTCTCCAGCAGTGGGTTGTCAAGGTGAATGGACAGGAGGTGAACCTGC
CGTACCTGAGGGATCCAGTACTGTTTATAGAGAAGAGCGGCACCACCATC
TTGGTCAATACTGAGATTGGACTCAAGGTCCTTTGGAATGGCCACAGCTA
TCTGGAAGTCAGTGTTCCAGGTACGTACAAGAGGAAAACCTGTGGGCTGT
GTGGGAACTTCAACAACTTCCCTCAGGACGACATGCGCTTACGGAACGGA
CAGATCACTAACTCGGCCGCCGTATTTGGGAACAGCTGGAAGGTTAACAC
CCCTGGTAGCCCTGCGTGTGAGGACTCTGAAGACTTGGACCCCTGTGTCA
AGGCAGGCTACCGGGCTCGCAAGGAGGCCAATGCCAAATGTCTGGTGCTG
AAGTCTGACAAATTCTTGCCTTGTCACAGGGTGATCAACCCGGAAATGTA
CTTTGCGTCCTGTGTGTATGACCTGTGTGCCTGCGGTTCCAACGACCAGT
GCCTGTGTGACGCCCTGAGTGCTTACGCTGCTGAATGTTCAGCAGCAGGG
GTCGTACTGAACTGGAGATCGCCCTCCATGTGTGCGATTGGCTGCCCATC
GGAGAGAGGACTAATGTTTGACGAGTGTGGGCCGATATGCCCGAGAACAT
GTGCCAACAAACACACAGTATTAGGGGACGTCCCCACACCATGTTTCAAA
CCCTGCATCCCCAGCTGTCAGTGTCCCGCGGGACAAGTGTTATGGGACAA
CCAATGTGTCACACCCGGACAATGTCCAGATACCGGTTTATATAATATCT
TTAGGTGAGGAGAGTCATACACAGACCCCAGCGAGCCGTGCGTGAGGTGC
ACCTGTAACCGCGGGGTCGTGACCTGTCAGGTGGAGGAGTGCCTCCCTCT
CACCTGTATGGACGGGCTGATGAACTTCCAGCCTCCGGATAGATGCTGTG
AGGAGTGCAGAGATGATGCGATGCCATGCATGTACCTGGGTGAGTCCAAG
CTGCCCGGCGAGGAGTGGCTGTTGGATGAGTGCACCATGTGCTCCTGTGT
GGGAGGGGAGGTCATGTGTATGACAGAGCGATGCCCGCCGACGCACTGTG
AGTCTGACGAGACCCCCACCCTGTCACCCGGCATGTGCTGCCCAAGATGT
ATGCCAAGACCAGCCACATGTACAACATTTGGTGACCCTCACTACCGAAC
GTTTGACGGGAAGATGATCCACTTCCAGGGCACCTGTGTGTACACCCTGG
CCGCAGACTGTGATGGAGGAGACTTTGAAGTGCTCGTTCAGAATGATGAC
AGAGGTGCTTTTGGTGCTGTCTCCTGGACACAGGAGTCAAAGATAAATGT
GAAGGGTGTGGAGATTGAGCTTCTCCAGCAGTGGGTTGTCAAGGTGAATG
GACAGGAGGTGAACCTGCCGTACCTGAGGGATCCAGTACTGTTTATAGAG
AAGAGCGGCACCACCATCTTGGTCAATACTGAGATTGGACTCAAGGTCCT
TTGGAATGGCCACAGCTATCTGGAAGTCAGTGTTCCAGGTACGTACAAGA
GGAAAACCTGTGGGCTGTGTGGGAACTTCAACAACTTCCCTCAGGACGAC
ATGCGCTTACGGAACGGACAGATCACTAACTCGGCCGCCGTATTTGGGAA
CAGCTGGAAGGTTAACACCCCTGGTAGCCCTGCGTGTGAGGACTCTGAAG
ACTTGGACCCCTGTGTCAAGGCAGGCTACCGGGCTCGCAAGGAGGCCAAT
GCCAAATGTCTGGTGCTGAAGTCTGACAAATTCTTGCCTTGTCACAGGGT
GATCAACCCGGAAATGTACTTTGCGTCCTGTGTGTATGACCTGTGTGCCT
GCGGTTCCAACGACCAGTGCCTGTGTGACGCCCTGAGTGCTTACGCTGCT
GAATGTTCAGCAGCAGGGGTCGTACTGAACTGGAGATCGCCCTCCATGTG
TGCGATTGGCTGCCCATCGGAGAGAGGACTAATGTTTGACGAGTGTGGGC
CGATATGCCCGAGAACATGTGCCAACAAACACACAGTATTAGGGGACGTC
CCCACACCATGTTTCAAACCCTGCATCCCCAGCTGTCAGTGTCCCGCGGG
ACAAGTGTTATGGGACAACCAATGTGTCACACCCGGACAATGTCCAGATA
CCGGTTTATATAATATCTTTAGGTGAGGAGAGTCATACACAGACCCCAGC
GAGCCGTGCGTGAGGTGCACCTGTAACCGCGGGGTCGTGACCTGTCAGGT
GGAGGAGTGCCTCCCTCTCACCTGTATGGACGGGCTGATGAACTTCCAGC
CTCCGGATAGATGCTGTGAGGAGTGCAGAGATGATGCGATGCCATGCATG
TACCTGGGTGAGTCCAAGCTGCCCGGCGAGGAGTGGCTGTTGGATGAGTG
CACCATGTGCTCCTGTGTGGGAGGGGAGGTCATGTGTATGACAGAGCGAT
GCCCGCCGACGCACTGTGAGTCTGACGAGACCCCCACCCTGTCACCCGGC
ATGTGCTGCCCAAGATGTATGCCAAGACCAGCCACATGTACAACATTTGG
TGACCCTCACTACCGAACGTTTGACGGGAAGATGATCCACTTCCAGGGCA
CCTGTGTGTACACCCTGGCCGCAGACTGTGATGGAGGAGACTTTGAAGTG
CTCGTTCAGAATGATGACAGAGGTGCTTTTGGTGCTGTCTCCTGGACACA
GGAGTCAAAGATAAATGTGAAGGGTGTGGAGATTGAGCTTCTCCAGCAGT
GGGTTGTCAAGGTGAATGGACAGGAGGTGAACCTGCCGTACCTGAGGGAT
CCAGTACTGTTTATAGAGAAGAGCGGCACCACCATCTTGGTCAATACTGA
GATTGGACTCAAGGTCCTTTGGAATGGCCACAGCTATCTGGAAGTCAGTG
TTCCAGGTACGTACAAGAGGAAAACCTGTGGGCTGTGTGGGAACTTCAAC
AACTTCCCTCAGGACGACATGCGCTTACGGAACGGACAGATCACTAACTC
GGCCGCCGTATTTGGGAACAGCTGGAAGGTTAACACCCCTGGTAGCCCTG
CGTGTGAGGACTCTGAAGACTTGGACCCCTGTGTCAAGGCAGGCTACCGG
GCTCGCAAGGAGGCCAATGCCAAATGTCTGGTGCTGAAGTCTGACAAATT
CTTGCCTTGTCACAGGGTGATCAACCCGGAAATGTACTTTGCGTCCTGTG
TGTATGACCTGTGTGCCTGCGGTTCCAACGACCAGTGCCTGTGTGACGCC
CTGAGTGCTTACGCTGCTGAATGTTCAGCAGCAGGGGTCGTACTGAACTG
GAGATCGCCCTCCATGTGTGCGATTGGCTGCCCATCGGAGAGAGGACTAA
TGTTTGACGAGTGTGGGCCGATATGCCCGAGAACATGTGCCAACAAACAC
ACAGTATTAGGGGACGTCCCCACACCATGTTTCAAACCCTGCATCCCCAG
CTGTCAGTGTCCCGCGGGACAAGTGTTATGGGACAACCAATGTGTCACAC
CCGGACAATGTCCAGATACCGGTTTATATAATATCTTTAGGTGAGGAGAG
TCATACACAGACCCCAGCGAGCCGTGCGTGAGGTGCACCTGTAACCGCGG
GGTCGTGACCTGTCAGGTGGAGGAGTGCCTCCCTCTCACCTGTATGGACG
GGCTGATGAACTTCCAGCCTCCGGATAGATGCTGTGAGGAGTGCAGAGAT
GATGCGATGCCATGCATGTACCTGGGTGAGTCCAAGCTGCCCGGCGAGGA
GTGGCTGTTGGATGAGTGCACCATGTGCTCCTGTGTGGGAGGGGAGGTCA
TGTGTATGACAGAGCGATGCCCGCCGACGCACTGTGAGTCTGACGAGACC
CCCACCCTGTCACCCGGCATGTGCTGCCCAAGATGTATGCCAAGACCAGC
CACATGTACAACATTTGGTGACCCTCACTACCGAACGTTTGACGGGAAGA
TGATCCACTTCCAGGGCACCTGTGTGTACACCCTGGCCGCAGACTGTGAT
GGAGGAGACTTTGAAGTGCTCGTTCAGAATGATGACAGAGGTGCTTTTGG
TGCTGTCTCCTGGACACAGGAGTCAAAGATAAATGTGAAGGGTGTGGAGA
TTGAGCTTCTCCAGCAGTGGGTTGTCAAGGTGAATGGACAGGAGGTGAAC
CTGCCGTACCTGAGGGATCCAGTACTGTTTATAGAGAAGAGCGGCACCAC
CATCTTGGTCAATACTGAGATTGGACTCAAGGTCCTTTGGAATGGCCACA
GCTATCTGGAAGTCAGTGTTCCAGGTACGTACAAGAGGAAAACCTGTGGG
CTGTGTGGGAACTTCAACAACTTCCCTCAGGACGACATGCGCTTACGGAA
CGGACAGATCACTAACTCGGCCGCCGTATTTGGGAACAGCTGGAAGGTTA
ACACCCCTGGTAGCCCTGCGTGTGAGGACTCTGAAGACTTGGACCCCTGT
GTCAAGGCAGGCTACCGGGCTCGCAAGGAGGCCAATGCCAAATGTCTGGT
GCTGAAGTCTGACAAATTCTTGCCTTGTCACAGGGTGATCAACCCGGAAA
TGTACTTTGCGTCCTGTGTGTATGACCTGTGTGCCTGCGGTTCCAACGAC
CAGTGCCTGTGTGACGCCCTGAGTGCTTACGCTGCTGAATGTTCAGCAGC
AGGGGTCGTACTGAACTGGAGATCGCCCTCCATGTGTGCGATTGGCTGCC
CATCGGAGAGAGGACTAATGTTTGACGAGTGTGGGCCGATATGCCCGAGA
ACATGTGCCAACAAACACACAGTATTAGGGGACGTCCCCACACCATGTTT
CAAACCCTGCATCCCCAGCTGTCAGTGTCCCGCGGGACAAGTGTTATGGG
ACAACCAATGTGTCACACCCGGACAATGTCCAGATACCGGTTTATATAAT
ATCTTTAGGTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL96226gene:BL96226Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL96226_cuf5transcript:BL96226_cuf5-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BL96226_cuf5-E1BL96226_cuf5-E1-1564476830-46250Branchiostoma lanceolatumexon
BL96226_cuf5-E2BL96226_cuf5-E2-1564476830-46252Branchiostoma lanceolatumexon
BL96226_cuf5-E3BL96226_cuf5-E3-1564476830-46254Branchiostoma lanceolatumexon
BL96226_cuf5-E4BL96226_cuf5-E4-1564476830-46256Branchiostoma lanceolatumexon
BL96226_cuf5-E5BL96226_cuf5-E5-1564476830-46258Branchiostoma lanceolatumexon
BL96226_cuf5-E6BL96226_cuf5-E6-1564476830-46260Branchiostoma lanceolatumexon
BL96226_cuf5-E7BL96226_cuf5-E7-1564476830-46262Branchiostoma lanceolatumexon
BL96226_cuf5-E8BL96226_cuf5-E8-1564476830-46264Branchiostoma lanceolatumexon
BL96226_cuf5-E9BL96226_cuf5-E9-1564476830-46267Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:5662896..5669535 +
Properties
Property NameValue
Transcript idBL96226_cuf5
Biotypeprotein_coding