transcript:BL96215_cuf4 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL96215_cuf4
Unique Nametranscript:BL96215_cuf4
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL96215_cuf4

>transcript:BL96215_cuf4-protein ID=transcript:BL96215_cuf4-protein|Name=transcript:BL96215_cuf4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=198bp
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Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000003:8628282..8667116+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL96215_cuf4 ID=transcript:BL96215_cuf4|Name=transcript:BL96215_cuf4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=38835bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:8628282..8667116+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GACGGCGACACCGTGACAGTCTACATCAGAGCAACCGACATTCTGGAAAA CCAGCAGACCGACGAAGTGTCCATCCACATTGACAGCTCACCTCCAGTCA TCGAAGACTTTTGGCTGGAGAAAAATGGCGTGGAAGGCATTACTGTCCAC AATGCCATAGAACTATATGACTGCCTGTAAGTTAAAAACCGTTGCAGCCA CAGTATTCATAGCACAAAGCAAAGGTTATGATTGTCTGCTTTGGTTACAC ATTTATCACCCTAAACAAAGCCAAATCTACGAAGGCACAGTGCCCATAAT TTGTACCCACCCCTGTACATGTCCGTATGCCCTTTTGTTCGCCCAACCTG AACCTAACAAAGTTATGCAGCCATTTCTGCAGCCAATTCCAGTACCCGAT CCCAGTAGCCGATTCCAGTAGCCGATTCCAGTAGCCGATTCCAGTAGCCG ATTCCAGTAGCCGATTTAAGCATGCTAGCAGCCGATTCAGTACTGGAATT CAAATCCTGATGGTATAACATGATAACAATCTAGTCACCAATGCCTGCTT TTATAAATACTATTGTTTCATTGATTGCAGGGTAAAGTTCACCACATATG ACATCCACAGCGGTCTGTACACAATTTCCTGGCGGTTGGTGGACATGGCG GACGAGTCCATTGTCCATGGGAGCGGCAACTTGGCTGTTCGCGTGGAATC TGTAAGATCTTTGCAACATCAAGTCTATAATACTATCACTGATGTATTAA GCTATATTCTTATGTATATCATTATGGTTACTATACTGCTCAGCAATTGT ATATGATACAACGTATGGCAAACAAGCTCTACAAAGAATTTTAGTAAACT TGTGTATGCTATAAAAGACTATGCAGTATAGAATTAGGCTATATACCTCC TGATATCCTGTACGTTTGCTCGGGCATCAAAATTGTTTTCGCTTGTTTGT TTCATTTCAATTTAGCTCGTCATGATAACTAGAATTTGCAAAAATGAACT TAAAATAGCATATCAAATCTTGGACATCATAAATCTTACAAAAACACGAC ACTGTTTTTACAGAATTCCGAACCCTGTACTGCAGACACTTGTAAGTGTA CCCCCATGCAACCCTGCTACATGACCAAGTACGAGATAGTGCCGGACGCC TCCAAGATGGACATCCCCCTCGGGGAGCACGACAGCGACTACTACTTCTA CGTCACTGTCACAAACCGTGCTCGACTGGTCACCACCGAGAGGCTACAGG TTTGTGTAGCCTTTTGGATGATTTCTCAATGACGTCACTGTAACCTGCCT TGTAACCGAGTGACCTAACCAAAAATTTAACTCATCATCATCGAATACTG AGGTTTAACCCTATCTAGACTGGGCTTTTTGGGGGATATATGGGAGTGGG GGGGATCATTCGCCCCCCCCCCTCATAACTTCAAAACGGTATGTCTCTTG GTTTACTACGGTATGACTACTGAGGTTTAAAATTACTGTCTGGAATCCAT AACGACGTTTCTTTTTTCACGTGTTTTGCCAATAGATCACGATAGACATC AGTCCACCGGAACCGGGTCACGTGATGAACAACTTTGCCGGCCAGCCTGA CATCGACTTTCAGGTAAGGCAGTCCTTTGTTGCAAACAAGGCAGCAAACA AATAAATATATAAATAAACAAACACGCACACAAACAAGTCGAGAATCTTA ATTGCGTGTAATCCAAGTCAATATGCAAAATGCCACTTGTCCTTGGCCTT GCTTGTCTCAAGAGATGATAAATAGCTGTATCAATAATTGTATAAACAGA AAGAAAACTTAGAAAAAGTAATGATATTAATGTCAAATGGGAAACAATAA AGATATGACAAAAGCCATACCTGTATTTCAGAGTGATCCAAACATGCACT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:8628282..8667116+

>transcript:BL96215_cuf4 ID=transcript:BL96215_cuf4|Name=transcript:BL96215_cuf4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2376bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:8628282..8667116+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATAGACATCAGCCCTCCGGAACCAGGCCACGTCATCGACAACTATGCCGG
CCAGCCTGACATGAACTTTCAGAGCGATCCAAACATGCACTTCAGCTGGG
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GCCTCCGACCCGGTGTGTTCTGACGGGATTCTGTACGACACGTCCCCGCC
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TTTTTGACCACGAGAGTGGAGTGAGGAGCTACCAAGTGTTCTTCGGCACT
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AACCAACATCGTCATAGAAAACATCCGTGCAAGGACGGGCGCGATCAAAG
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GTGAACGGGCCATCGTCAGCATGCAGCTCAGCAGCCAGGCAGGTTGCCGA
CCCTGCTATCTTCAACGATCGCCCAACGGTCAACGTCAATTCAGATTTGA
ATGACGATCCAGAAACCGTGAGGATGGCCACGTCTGCGATAGACATCAGC
CCTCCGGAACCAGGCCACGTCATCGACAACTATGCCGGCCAGCCTGACAT
GAACTTTCAGAGCGATCCAAACATGCACTTCAGCTGGGAAGGATTTTTTG
ACCACGAGAGTGGAGTGAGGAGCTACCAAGTGTTCTTCGGCACTCGGTGT
GGGATCTCAAGTGACTTCGGCATTCCCGTACCTGACTCAGCTACTGAAAA
GACGACCACCGAGCTACAGCACAGCTTCACAGCTTCCTCCCCCGGCACGT
ACTACTGTACCGTGGTCGCCTTTAACCGCGCCCTGTCTGCCTCCGACCCG
GTGTGTTCTGACGGGATTCTGTACGACACGTCCCCGCCGTCCATAACCAA
CATCGTCATAGAAAACATCCGTGCAAGGACGGGCGCGATCAAAGATGGCG
GCGGCAACGTTTGGATGGTGGATGATCAACTGAGGAAGGTCGCTGTGAAC
GGGCCATCGTCAGCATGCAGCTCAGCAGCCAGGCAGGTTGCCGACCCTGC
TATCTTCAACGATCGCCCAACGGTCAACGTCAATTCAGATTTGAATGACG
ATCCAGAAACCGTGAGGATGGCCACGTCTGCGATAGACATCAGCCCTCCG
GAACCAGGCCACGTCATCGACAACTATGCCGGCCAGCCTGACATGAACTT
TCAGAGCGATCCAAACATGCACTTCAGCTGGGAAGGATTTTTTGACCACG
AGAGTGGAGTGAGGAGCTACCAAGTGTTCTTCGGCACTCGGTGTGGGATC
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CACCGAGCTACAGCACAGCTTCACAGCTTCCTCCCCCGGCACGTACTACT
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TCTGACGGGATTCTGTACGACACGTCCCCGCCGTCCATAACCAACATCGT
CATAGAAAACATCCGTGCAAGGACGGGCGCGATCAAAGATGGCGGCGGCA
ACGTTTGGATGGTGGATGATCAACTGAGGAAGGTCGCTGTGAACGGGCCA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL96215gene:BL96215Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL96215_cuf4transcript:BL96215_cuf4-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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Position
The following features are aligned
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Properties
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