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The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL95670_evm0 >transcript:BL95670_evm0-protein ID=transcript:BL95670_evm0-protein|Name=transcript:BL95670_evm0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=1783bp
MRVLCVLLVAFAVGLVPRSSACPKYCNCNDFENEYTVFCRGENITSIPRD
IPKNTSRLDVCFTPITMLRKGDFVDMPKLKQLNVWWNLNLTTVEPGTFDN
LPTITSLGLFNNSFTKLPTGLFDSLKNLEKFDAHNTIWTIYLSNNNLTEL
SPSLFHGLTELWWLDLSNNQLSHLDSDMFFGLDKLRSLSLSGNNLTNMAH
VAPAIANLPFLLYQTLDDNPFVYLGRESFSMPMKHVNSFSVSSTHIRVIE
EGTFSDVTFPNLTRLELEQDDSLHFLPGNTLEGLNNLTAMIAYDDPFHCD
CQLKAFVTWLRERVNPPYVSATCASPPSLKGKDLTDVPLASLTCDCQQVE
APSIDTSGSDNSTREGQTAMLNCKISGCPEAEFFWTTPTGAMLAVESGFP
RMEVLGSGTLVVTEAREEDTGVYTCTAVNYRGKTXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
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XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
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XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXIFHLGSQICSCLTLPV Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000091:344788..351927+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL95670_evm0 ID=transcript:BL95670_evm0|Name=transcript:BL95670_evm0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=7140bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000091:344788..351927+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAGGGTGCTCTGTGTCCTTCTGGTGGCTTTTGCCGTGGGCTTGGTACC
CCGTTCGTCTGCCTGTCCAAAGTACTGCAATTGCAATGACTTTGAGAACG
AATACACGGTGTTTTGTCGTGGAGAAAACATCACCTCTATCCCACGGGAC
ATTCCAAAGAACACGTCACGGCTGGATGTCTGTAAGTATACTGTATATTT
TCAGGTCTCTACTATGCGTCTTCGGTTTTATTTTGCAACAAAAGAGGCCC
GTCCCATGTTTCCAATTTCCGATTGGAGAAGCATTCTTTGATTTACCATT
CAAGTACTGCAATTGCAGTACTCCAGTCCAAAGTANCGTCTGCCTGTCCA
AAGTACTGCAATTGCAATGACTTTGAGAACGAATACACGGTGTTTTGTCG
TGGAGAAAACATCACCTCTATCCCACGGGACATTCCAAAGAACACGTCAC
GGCTGGATGTCTGTAAGTATACTGTATATTTTCAGGTCTCTACTATGCGT
CTTCGGTTTTATTTTGCAACAAAAGAGGCCCGTCCCATGTTTCCAATTTC
CGATTGGAGAAGCATTCTTTGATTTACCATTCTAACACAGCCAACTTAAA
AATACTTCATCGAATTTTGTAGTCATTAACGTCGTTCTCCGGGTTATGTT
TCTGTCACGGTTTAAAGAATGTCACAATGTCTAAGTCTCATCGTTTGCTC
ATATAAACGTTACCACATCTTATTTTTCCAGGTTTTACCCCTATTACCAT
GCTACGGAAAGGCGACTTCGTTGACATGCCCAAACTGAAACAGCTGAACG
TTTGGTGGAACCTGAACCTGACCACGGTCGAACCAGGGACCTTCGACAAT
CTACCGACCATCACGTCACTCGGGCTGTTCAATAACTCCTTCACCAAACT
ACCGACCGGACTGTTCGACAGCTTGAAGAACCTGGAGAAATTTGACGCTC
ACAACAGTAGGCTTGAGATGATCCAACACGGTCTATTCACCGATCATCCT
TCTTTACAACAGATCACGTTGTTCTTCAACAACATTGCCGAGCTGGAAGA
TGGCGCATTTGGTGGCCTTACTGACCTGACAATCTTGTATCTCAGTTCTA
ACCGTCTTACGTCTCTTAACCCGTCCGTTTTCAAGGGTTCGTCTAAGTTG
AAAACCTTGTATGTTAGCGAAAACTCCATCACTGCTATTGGCAAAGATGC
TTTTGCTGGCACCAATTTCGAGTTGTTGTACCTCAGTAGCAATGTTATCG
ATACCGTAGATATCGACGCCTTCTCCCCACTGAAAAGGCTCCAGTATATT
ACTCTGGACCAAAACAACATCAAGGGCCTGAAGGGTGTCTTTAAAGACCT
GCCCAATCTTCAATCGGTTTCCATGTTTCATAATCAGCTCACCAGCATCG
AGGGTGTCTTCCAAAATCTCCCTAAGCTTGAATTTCTTTCGTTGAATGGA
AATCAAATCGCGAAGATCAGCAACACGACATTTGACAGTGTCCCTGCCAT
GACCTCTTTGAGCATAAGTAATAACGCCATCGTTGAGGTTGAAAGTGGGG
CGTTCCGAAACCTGGACAGCCTTTCAACACTTTACATTGATAATAACCAG
ANAAACCTGGACAGCCTTTCAACACTTTACATTGACAATAACCAGATTCC
GGAAATCTCCTTGGCCGGCTTGCATTCACTTACGCGTCTTACCATGAACG
TCAACAACTTGCAGAGTTTCCCCACCAACTTGGAAGATGCCAACCAGCTT
GAGTACCTAACCTTGAACAGCAATCCAATCGAAGAACCGCTGGACGAGCA
ATTTTCAGTTTTGCACAGGTAAATTTCTCCGTGATTCAAACTGAATATAT
TTTGTATTCGACTCATAAAACATTTATTTGCTATTTGTATTTCATTATCA
TAATTTTCTTACTTTATATTTTTCATCTAGGCTCTCAGATCTGTTCCTGT
CTAACATTACCAGTCTGAGGTCAGCGGGGACACTGAATCCAAAGGCGCTA
TGTGGTTCTGATGCCCTTGCCGCTGTGTGGATACAAAACAATGATCTACG
TTCAATCCCACCCACGACCTTCAAGTGCACGCCGATGATATCCGCAATAT
GGCTTTCGAACAACAACCTGACAGAACTGAGCCCCAGTTTGTTCCACGGT
CTCACAGAGTTGAGTTCCCTGTACTTGTCCGATAACCAACTCAGCCATCT
GGACNATATATCTTTCGAACAACAACCTGACAGAACTGAGCCCCAGTTTG
TTCCACGGTTTGACGGAGTTGTGGTGGCTGGATCTGTCCAACAATCAACT
CAGCCACCTGGACTCGGACATGTTTTTCGGTCTTGACAAGCTCAGGTCCC
TTTCTCTGAGTGGAAATAACTTAACCAACATGGCACATGTAGCTCCGGCA
ATAGCAAACCTTCCCTTTCTTCTGTACCAGACCCTAGACGACAACCCGTT
TGTGTATCTTGGTCGCGAGTCCTTCTCAATGCCTATGAAGCATGTCAACT
CGTTTTCGGTGTCCAGCACTCACATTCGTGTGATAGAAGAGGGAACATTT
TCCGACGTTACATTCCCCAATCTGACTCGACTGGAACTTGAGCAGGACGA
TTCCTTGCACTTCCTACCAGGTAATACCCTAGAGGGCCTCAACAACCTTA
CTGCCATGATCGCGTACGACGACCCTTTCCACTGTGACTGCCAGCTCAAG
GCCTTCGTCACCTGGCTACGCGAACGAGTCAACCCGCCGTACGTGAGTGC
GACCTGCGCCAGCCCGCCAAGTCTCAAGGGCAAAGACCTGACGGACGTTC
CCCTGGCCAGTCTGACGTGTGACTGCCAACAGGTGGAAGCTCCTTCTATC
GATACGAGCGGCAGTGATAACTCCACCCGTGAGGGCCAGACCGCCATGCT
GAACTGTAAGATCTCCGGCTGTCCCGAAGCCGAGTTTTTCTGGACCACCC
CAACTGGAGCCATGTTGGCTGTGGAGTCGGGGTTCCCCAGAATGGAGGTA
CTGGGCAGCGGTACCCTGGTGGTGACAGAGGCGAGGGAGGAGGACACAGG
GGTGTACACTTGTACCGCTGTCAACTACCGCGGGAAGACNNNNNNNNNNN
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AGGCTCTCAGATCTGTTCCTGTCTAACATTACCAGTCTGA Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000091:344788..351927+ >transcript:BL95670_evm0 ID=transcript:BL95670_evm0|Name=transcript:BL95670_evm0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=16056bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000091:344788..351927+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAGGGTGCTCTGTGTCCTTCTGGTGGCTTTTGCCGTGGGCTTGGTACC
CCGTTCGTCTGCCTGTCCAAAGTACTGCAATTGCAATGACTTTGAGAACG
AATACACGGTGTTTTGTCGTGGAGAAAACATCACCTCTATCCCACGGGAC
ATTCCAAAGAACACGTCACGGCTGGATGTCTGTTTTACCCCTATTACCAT
GCTACGGAAAGGCGACTTCGTTGACATGCCCAAACTGAAACAGCTGAACG
TTTGGTGGAACCTGAACCTGACCACGGTCGAACCAGGGACCTTCGACAAT
CTACCGACCATCACGTCACTCGGGCTGTTCAATAACTCCTTCACCAAACT
ACCGACCGGACTGTTCGACAGCTTGAAGAACCTGGAGAAATTTGACGCTC
ACAACACCATCTGGACNATATATCTTTCGAACAACAACCTGACAGAACTG
AGCCCCAGTTTGTTCCACGGTTTGACGGAGTTGTGGTGGCTGGATCTGTC
CAACAATCAACTCAGCCACCTGGACTCGGACATGTTTTTCGGTCTTGACA
AGCTCAGGTCCCTTTCTCTGAGTGGAAATAACTTAACCAACATGGCACAT
GTAGCTCCGGCAATAGCAAACCTTCCCTTTCTTCTGTACCAGACCCTAGA
CGACAACCCGTTTGTGTATCTTGGTCGCGAGTCCTTCTCAATGCCTATGA
AGCATGTCAACTCGTTTTCGGTGTCCAGCACTCACATTCGTGTGATAGAA
GAGGGAACATTTTCCGACGTTACATTCCCCAATCTGACTCGACTGGAACT
TGAGCAGGACGATTCCTTGCACTTCCTACCAGGTAATACCCTAGAGGGCC
TCAACAACCTTACTGCCATGATCGCGTACGACGACCCTTTCCACTGTGAC
TGCCAGCTCAAGGCCTTCGTCACCTGGCTACGCGAACGAGTCAACCCGCC
GTACGTGAGTGCGACCTGCGCCAGCCCGCCAAGTCTCAAGGGCAAAGACC
TGACGGACGTTCCCCTGGCCAGTCTGACGTGTGACTGCCAACAGGTGGAA
GCTCCTTCTATCGATACGAGCGGCAGTGATAACTCCACCCGTGAGGGCCA
GACCGCCATGCTGAACTGTAAGATCTCCGGCTGTCCCGAAGCCGAGTTTT
TCTGGACCACCCCAACTGGAGCCATGTTGGCTGTGGAGTCGGGGTTCCCC
AGAATGGAGGTACTGGGCAGCGGTACCCTGGTGGTGACAGAGGCGAGGGA
GGAGGACACAGGGGTGTACACTTGTACCGCTGTCAACTACCGCGGGAAGA
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GAATGAGGGTGCTCTGTGTCCTTCTGGTGGCTTTTGCCGTGGGCTTGGTA
CCCCGTTCGTCTGCCTGTCCAAAGTACTGCAATTGCAATGACTTTGAGAA
CGAATACACGGTGTTTTGTCGTGGAGAAAACATCACCTCTATCCCACGGG
ACATTCCAAAGAACACGTCACGGCTGGATGTCTGTTTTACCCCTATTACC
ATGCTACGGAAAGGCGACTTCGTTGACATGCCCAAACTGAAACAGCTGAA
CGTTTGGTGGAACCTGAACCTGACCACGGTCGAACCAGGGACCTTCGACA
ATCTACCGACCATCACGTCACTCGGGCTGTTCAATAACTCCTTCACCAAA
CTACCGACCGGACTGTTCGACAGCTTGAAGAACCTGGAGAAATTTGACGC
TCACAACACCATCTGGACNATATATCTTTCGAACAACAACCTGACAGAAC
TGAGCCCCAGTTTGTTCCACGGTTTGACGGAGTTGTGGTGGCTGGATCTG
TCCAACAATCAACTCAGCCACCTGGACTCGGACATGTTTTTCGGTCTTGA
CAAGCTCAGGTCCCTTTCTCTGAGTGGAAATAACTTAACCAACATGGCAC
ATGTAGCTCCGGCAATAGCAAACCTTCCCTTTCTTCTGTACCAGACCCTA
GACGACAACCCGTTTGTGTATCTTGGTCGCGAGTCCTTCTCAATGCCTAT
GAAGCATGTCAACTCGTTTTCGGTGTCCAGCACTCACATTCGTGTGATAG
AAGAGGGAACATTTTCCGACGTTACATTCCCCAATCTGACTCGACTGGAA
CTTGAGCAGGACGATTCCTTGCACTTCCTACCAGGTAATACCCTAGAGGG
CCTCAACAACCTTACTGCCATGATCGCGTACGACGACCCTTTCCACTGTG
ACTGCCAGCTCAAGGCCTTCGTCACCTGGCTACGCGAACGAGTCAACCCG
CCGTACGTGAGTGCGACCTGCGCCAGCCCGCCAAGTCTCAAGGGCAAAGA
CCTGACGGACGTTCCCCTGGCCAGTCTGACGTGTGACTGCCAACAGGTGG
AAGCTCCTTCTATCGATACGAGCGGCAGTGATAACTCCACCCGTGAGGGC
CAGACCGCCATGCTGAACTGTAAGATCTCCGGCTGTCCCGAAGCCGAGTT
TTTCTGGACCACCCCAACTGGAGCCATGTTGGCTGTGGAGTCGGGGTTCC
CCAGAATGGAGGTACTGGGCAGCGGTACCCTGGTGGTGACAGAGGCGAGG
GAGGAGGACACAGGGGTGTACACTTGTACCGCTGTCAACTACCGCGGGAA
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CTGAATGAGGGTGCTCTGTGTCCTTCTGGTGGCTTTTGCCGTGGGCTTGG
TACCCCGTTCGTCTGCCTGTCCAAAGTACTGCAATTGCAATGACTTTGAG
AACGAATACACGGTGTTTTGTCGTGGAGAAAACATCACCTCTATCCCACG
GGACATTCCAAAGAACACGTCACGGCTGGATGTCTGTTTTACCCCTATTA
CCATGCTACGGAAAGGCGACTTCGTTGACATGCCCAAACTGAAACAGCTG
AACGTTTGGTGGAACCTGAACCTGACCACGGTCGAACCAGGGACCTTCGA
CAATCTACCGACCATCACGTCACTCGGGCTGTTCAATAACTCCTTCACCA
AACTACCGACCGGACTGTTCGACAGCTTGAAGAACCTGGAGAAATTTGAC
GCTCACAACACCATCTGGACNATATATCTTTCGAACAACAACCTGACAGA
ACTGAGCCCCAGTTTGTTCCACGGTTTGACGGAGTTGTGGTGGCTGGATC
TGTCCAACAATCAACTCAGCCACCTGGACTCGGACATGTTTTTCGGTCTT
GACAAGCTCAGGTCCCTTTCTCTGAGTGGAAATAACTTAACCAACATGGC
ACATGTAGCTCCGGCAATAGCAAACCTTCCCTTTCTTCTGTACCAGACCC
TAGACGACAACCCGTTTGTGTATCTTGGTCGCGAGTCCTTCTCAATGCCT
ATGAAGCATGTCAACTCGTTTTCGGTGTCCAGCACTCACATTCGTGTGAT
AGAAGAGGGAACATTTTCCGACGTTACATTCCCCAATCTGACTCGACTGG
AACTTGAGCAGGACGATTCCTTGCACTTCCTACCAGGTAATACCCTAGAG
GGCCTCAACAACCTTACTGCCATGATCGCGTACGACGACCCTTTCCACTG
TGACTGCCAGCTCAAGGCCTTCGTCACCTGGCTACGCGAACGAGTCAACC
CGCCGTACGTGAGTGCGACCTGCGCCAGCCCGCCAAGTCTCAAGGGCAAA
GACCTGACGGACGTTCCCCTGGCCAGTCTGACGTGTGACTGCCAACAGGT
GGAAGCTCCTTCTATCGATACGAGCGGCAGTGATAACTCCACCCGTGAGG
GCCAGACCGCCATGCTGAACTGTAAGATCTCCGGCTGTCCCGAAGCCGAG
TTTTTCTGGACCACCCCAACTGGAGCCATGTTGGCTGTGGAGTCGGGGTT
CCCCAGAATGGAGGTACTGGGCAGCGGTACCCTGGTGGTGACAGAGGCGA
GGGAGGAGGACACAGGGGTGTACACTTGTACCGCTGTCAACTACCGCGGG
AAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNATATTTTTCATCTAGGCTCTCAGATCTGTTCCTGTCTAACATTACCA
GTCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000091 | genome | Sc0000091:344788..351927 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL95670_evm0 |
| Biotype | protein_coding |
|
