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protein sequence of transcript:BL91369_cuf0 >transcript:BL91369_cuf0-protein ID=transcript:BL91369_cuf0-protein|Name=transcript:BL91369_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=181bp
EPDLDSWGCDFDAGQCNSTTTAPGNFRWIRHSNSTPSFSTGPPADHTDGS GFFMYTDARNSSFGATASLKLPIIRSNGHHCLQWFYHMYGSSMGTLNVYV SQPQYPDMLVWTRSGNQGNQWLPALSPISSNSTAFQIRFQGVRGWDIFSD IAIDDVVVTPGPCPCRPDQLQCNDSQCVPLS Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000116:382755..398480+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL91369_cuf0 ID=transcript:BL91369_cuf0|Name=transcript:BL91369_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=15726bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000116:382755..398480+ (Branchiostoma lanceolatum) AGAACCAGACTTGGATAGCTGGGGATGTGACTTTGATGCAGGTCAGTGTA
ACTCCACGACGACTGCTCCAGGAAATTTCCGATGGATTCGACATTCAAAC
AGCACCCCATCATTTTCAACAGGACCACCAGCAGACCATACCGATGGATC
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ATAGATTTTCCTCATTAGCTATGCAAATAAAGTCCCAATTAGCATAATTT
GCACTTCATTGTGTACATCTCTGTCTAAGCTACCTGCATACTAAATGTCA
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TCTTTATCTGTTCCGACTGTTTCTCGTCGTCTTTTGAATGAAAGGGTTTT
GAAATGTAAAAATGCGATAAATGTTATTCATTAGACAGTACAAGCCTGCT
AAACATTTTATCATTTTCGACATACAATTCGCAGTATTATGACCATGATA
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AAGTGACATGGCGATTGATGACATCGATGTAGAATCTGGTCCCTGCAGTA
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GCATAATTGGTATCTGTTGAAGCTCCACTTACCATAAAATACATACGTTA
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TGCACTTCATTGTGTACATCTCTGTTTAAGCTACCTGCATACTAAATGTC
ATGGAAATCCATTGTTCCTTTGTTCAGTTATTCTCCTTAGAAGATTTTCA
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CACCACTTCTTTATTACATCACAAGCTATATGCCACCCAAAAATCAAGAC
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CAACACCCGCCCACGTACCAAATATCATCGTAATCCATCAAGAGGTTCTT
GAGTTATCTGTATCTGTATCTGTATAGCCGGTATAACCGCCCTTCGGCGT
AACACACCAGCTTTATGCTGACTGGAGTGGTGCGGAAACACAAACAGACA
AACAAACAAACAGACGGACAGACAGACAGACAAACAGACACACCCAAAAA
AATATCTCCATTTTTCATGGAGATAATTATAGTTTGTCTTCTAACGTAGA
ACCAGACTTGGATAGCTGGGGATGTGACTTTGATGCAGGTCAGTGTAACT
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ACCCCATCATTTTCAACAGGACCACCAGCAGACCATACCGATGGATCCGG
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ATGGAAAAAGTAAAAGACTAGGAAGTATCTTTATACTTTGGCACATTTAA
ATTTTTCATGTGTTATTACGTCGACGGCCGTTGGATCAATTTTAACCATC
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AACAAGTTATGGTCGTGATATTTTAGTGTCAGATAGTGACGATTATATAA
ATAAACACATATAATGCAAATCTGTAGTTAATTTGCATGATAAATAAGGA
AAATGTATCAATCCAAAATAGGACTCTCAAACATATGACATATATAACTG
TGAAAGAGAGGAATATTGATTGACGTCATTATGCAAATGAAGACATAATT
TGCATGTTTGATGACAAAATGATATACGTCGGAGTTTTCATAGTCGTAAA
TGATGGAATTTTGATGGTTAGGACAATAGGAAGCTAAGCAAAGGTAAACA
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ATTTGGGTAGAGAGAACAATCACTGATGTCATGTGTGCAAATGGTGACCT
TATTTGCCTAACTTAAGCAAAAATATCCATAATACGCCACTCAAAAATAT
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ATTATGCTACATCGTGGTGTGTATTGATTTGTTAACCCCGGGCTTTCTTT
GTTTATATGTTTAACTACAGGGTTCTTTATGTACACGGATGCTAGGAATA
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GGTCATCACTGTCTGCAGTGGTTTTACCACATGTATGGATCGAGCATGGG
AACACTGAACGTCTATGTCTCCCAGCCTCAGTATCCTGACATGTTAGTAT
GGACAAGGTCTGGAAACCAAGGAAATCAGTGGCTGCCAGCTTTGTCTCCC
ATTTCATCAAATTCTACTGCATTTCAGGTAAGGTATGATGAACTGTTATA
AGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAAAAATTTCTTTTATATAGACC
TTTAAAGTGATTTTATTGAGGCTTTAATGCTATTTTTAGACCAAAAATGT
ATATCTTGGTCTCACGCGCCCTGGTATTTCAACCGAATGACCTGAAATTT
GGTGTAGATGCGCCTTGAACAAATATTTAAAGGACTACGTTCCCATTTTT
GGCATATACCTCTTCAGGGTATTTATTTTGGGCTTTTCGACAATATTTTG
CCACTTCTGTCACTTGCAATACCATATAAATTGATGGAAGTGACAGCCAA
TGGGAGCACTGCATTTCAAACTGCGACCGCCTGATTGGCCAATTGAGTTA
ATCAATTTATCTTGCATCTCTGGCTCAGAGCGCTAGTATTCATACTGAAT
GTGGTATGGGACTGCCTAGGACATGTGCGTACAGGGCTTTATTCACTCTT
TTTTGGCATATCACTTGGCAATAACAAAGATACACATCTCCAGTTCCTAT
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GAAATATGTTGTTTTGGGTCATTTTCTTCTTCTCATGTCAAATCTTTCAT
ATATATCATTATTTATAATATGGAAGAGTCCATTTTCCCCAGGGTTAATC
TTTTTAAATTCAATTTTGGACTGGATTGATTATGCGCAAGTGTATTTTTG
AGCGGATATATTTCGACTAGTCTAGTTTACGTGGAGATGGCACTGGAATA
TTCCATTCTTGCATGGGGGAATCTATTATTTATTTCAATTTTGATCAGGA
GTGATTATGAAAAAGTCCATTTGTTAGCAGAAGTGTATTTGAACTGGTCT
ACTTTACACGAGGGTGGTGCTGGAAGAGTAATTTATTGAACGGGGGACAA
TTTCCAAATTATATTTTGGACTGGGGTACTTATGCAAAAGTCCATCTGTG
TAAGTGGATCTGGTTTTGGACTGGTCCATATTGTGTGGAGGTGCCACTGG
AAGACTCCATTCCTGTATGGAGGGACTAATTGTTTTTAAACTCAGTTTTG
GACTGGGGTGATCCATTTTTTTAGTGGAAGTATTTTAGAATGGTCCATTA
TTATTTTGGGACAGTCCATTTTTTGCATGGGGAGGAGTATGGCTAAACAT
GCTGTATTTGCTCGCAAATGTTGCCTTCCTAGTTTAATAGCAAACCTTAT
TTGTTTACTTTCATTTTTTGTCCGGCCACTTTATATTCGTAAGGGGAAAT
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CAGCGTGTCGACCTGACCAGCTCCAGTGTAACGATTCGCAGTGTGTACCA
CTCTCAGCGAGGTGTAACCGTCATGCTGACTGTCTGGATTGGAGCGATGA
AGAAAACTGCAGTAAGTAGCCACCTAAATCTATTGACTTTAACCGTAACC
GATGATCATGTTTTCTGTCTTCTCTGTCAATATTATTGAAACGTTAAGCC
CCCTTCTCACTGGATCCGCGGTACGCCGGCAGCGTCCTAAACTGGAATTG
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GATCAGCCACAGCGACGCCGCCAGTGTGCCGCGGGTCAAGTGAGAGGGGG
GCTTTAGCTAATCTAGTCTTTGATTTTATTTGAGGTAAACTTGTCCCAGA
TCACTTAAAACCCATAATTTTCTTATAATTCCAGAATGCAAAGTGGCTCC
GCACTCCAAAATAATGTCGGTTATGGTATCTTAGTTTGATTTATATGTGA
TATTTGACAGAACAGGTTCGTTGAGCTATCTTATAATCATCAGATGTATA
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TTCGATATCATCAATGTATTTGATTGCGTTTAGTATCAAGAGAAATTTAC
CGTCATAGTATTCTTGATATTATTACTTTGTCTCTCTCCTGCAAAGACCG
AGACGAGGATGGCTGGAGGTGTGACTTTGATGCGGATCAGTGTAACTCCA
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GTCGACTATTATTTAGAATGGCATTAATGCCTTGAAAAGTCGAAATTTTG
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GAGAGCGCCATGCGCGCCAAGCGCGCCGTCACCTCGGCGATGGTTTTGGA
TAGGCCCAAAACAATCGCCGTGAGATCGCCGAGGATGGCGATGGGATCAA
AGGGCCGCAGTGAGGGATCAAAGGGCCGCAGCGACCGTGCAGCGACCAAA
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AAGGGTCGCCGTAGAGATTCCACTTGAGCACATTTTCCAGGAGTTCGGCG
CTCTCACGGCGATCTGGAAAACTTTATGTCGCCATGAGATCGCCGTCCCA
GTGGAATGGGGGCCTAACAAAATATCAGACTTGTTTTGCCTTGCCGTATC
TTTATCATTCTAGCAAATATACAGAAACTAAAAAAAATATAAGATGGTAC
ATTACAATGTTTTGAAGCATCTAGCCATTCAAGATGTTACAAAATCAACC
GATGTAGCTCCTCGTCGACATTAAGGTATTAAACCGAATTATCGAGGGTT
TTAACTAGATATATGTCTTGTTAACTCCAGGATTTAACATTTTGTTAACT
TCTTCAAACGGCAGGGTTTTATATGTACACGGAGGCCAGTTCTGGTTTTA
CTGGGACAACTGCCAGTCTGACGTTACCCACCATTTCCTCTGACGGTCAG
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GAACGTCTATGTCTCCCAACCTCAGTATCCTGACATGTTAGTGTGGACAA
GGTCTGGAGACCAAAGAAATCGGTGGCTGTCAGCCACGACACCTGTATTC
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GTAAAAATGCGATAAATGTTATTCATTAGACAGTACAAGCCTGCTAAATA
TTTTATCATTTCGCAGTATTATGACCATGATATGTTGTAATGTACAAAGG
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CGCTTTGAAGGCGTGAGAGGATCTAGCTTTACAAGTGACATGGCGATTGA
TGACATCGATGTAGAATCTGGTCCCTGCAGTAAGACTGTTTTGCATTAAT
CAACGCATTGCGTTCTCTGTTTGATCAAACTATTCAGAATTATACATTTT
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GCCACTCTCAGCGAGGTGTAACGGTCAGGCTGACTGTCTGGATTGGAGCG
ACGAAGCAGATTGCAGTGAGTACAGTTAGATTGGTACGGATGACAAATAA
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CCATTAATCTTGGTATTGGAGAGTCAGGTTCTTTAGATATTCTTTTTTTC
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AGAATTCGGCAAACAATTGTCAAGTTCGATGATGGCCCCTTAGTGGCTTT
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GGATAGAGAGAACAATCACTGATGTTATGTGTGCAAATGGTGACCTTATT
TGCCTAACCAATGCAAAAATATCCATAATACGCCACTCAAAAATATTAAC
ATCACTAAGGGTACTTATAAGTCACGGAACTCTACTTCCTAGCGCTATTA
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TTTTGGTGCGACTGCCAGTCTGAAGTTGCCGATTATACGCTCTAACGGTC
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CTGAACGTCTATGTCTCCCAGCCTCAGTATCCTGACATGTTAGTATGGAC
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TGTCGTTTTTACGTATAACAAGTATCTTTGTACACGGAAGTACCTCTTAA
ATTTGATTTCCCCCTAAGGCCATGTTGATTTGATTATTTGGGATGACATC
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AATATTTTGGAAATGGATACTAATTTCGTAAAAGCGCAAAGTCAAAGAAG
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CTCTGCGTGTTCATTTTTGCCCATTCTTCCTGACCACGTTGATTTCATAT
TAAAAGGAACTTTCCTTTTTGCGAAACGCTTTTTTTTCGCACGCTCGCAT
CAATTTGGAGTCCCCAGAGGATGTCATCCATATAATCAAATCAACATAGC
CTAGGTTTCTGTAACCACTCACTTTAACTTGAAAAAAAGGTCAAAATTGT
GAAAATAGACCAAAGGATATTCATTCCTTAAGTCACTGCAATGTAATCAA
TTCAATATGATGATGAATCTTTACTTCTGATCAATGTTTTCCTACCTGTT
ACTTTTTTCTTATTGGTTCTTCAATATTCTCCCCGTAAAAAATATTTAAA
AAAACAAAGAATAGGAAAAAATAATTTTGTTATTGTCTACACATCCCATT
TCATCCTACAGATTCGCTTTCAAGGCGTTAGAGGATGGGATATCTTCAGT
GACATAGCAATAGATGACGTTGTTGTAACACCGGGACCCTGCCGTAAGAT
CCATAAGTTTTGTATGAGCAATCGTTAACCTTCGTCAATTTACGTTATAT
TGTAAACAGGCAAAGCATGATTATTTTTAGCCATATCTAGTATGGCTAAA
CATATTGTTTTTGTCAGGTTTCTTCCCCTTCGAAGCTTCTCCTCTTTCTC
CTCTTTCTCCTGTCAAATCGATTCATCTCTGTCATTTTTGGACCAAGTGA
CCTGAAATTTTGCACAATGATAGTGTTGGCAAATACCCCCGGGCGTTTTT
TAAAATTTCTTTTATATAGACCTTTAAAGTGATTTTATTGAGGCTTTAAT
GCTATTTTTAGACCAAAAATGTATATCTTGGTCTCACGCGCCCTGGTATT
TCAACCGAATGACCTGAAATTTGGTGTAGATGCGCCTTGAACAAATATTT
AAAGGACTACGTTCCCATTTTTGGCATATACCTCTTCAGGGTATTTATTT
TGGGCTTTTCGACAATATTTTGCCACTTCTGTCACTTGCAATACCATATA
AATTGATGGAAGTGACAGCGAATGGGAGCACTGCATTTCAAACTGCGACC
GCCTGATTGGCCAATTGAGTTAATCAATTTATCTTGCATCTCTGGCTCAG
AGCGCTAGTATTCATACTGAATGTGGTATGAGACTGCCTAGGACATGTGC
GTACAGGGCTTTATTCACTCTTTTTTGGCATATCACTTGGCAATAACAAA
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CATGTGTCTGCCCTGGTCATGTATTCCTCATTCAAATGTTTGGCATGCAG
CCCTTCAAAACGATTTTGGACATAATCAATTTTTTCGTCGTTATTTTTAA
ACCAAAAATGCATACTATGGCTGAAATATGTTGTTTTGGGTCATTTTCTT
CTTCTCATGTCAAATCTTTCATATATATCATTATTTATAATATGGAAGAG
TCCATTTTCCCCAGGGTTAATCTTTTTAAATTCAATTTTGGACGGGATTG
ATTGTGCGCAAGTGTATTTTTGAGCGGATATATTTCGACTGGTCTAGTTT
ACGTGGAGATGGCACTGGAATATTCCATTCTTGCATGGGGGAATCTATTA
TTTATTTCAATTTTGATCTGGAGTGATTATGAAAAAGTCCATTTGTTAGC
AGAAGTGTATTTGAACTGGTCTACTTTACACGAGGGTGGTGCTGGAAGAG
TAATTTATTGAACGGGGGACATTTTCCAAATCATATTTTGGACTGGGGTA
CTTATGCAAAAGTCCATTTGTGTAAGTGGATCTGGTTTTGGACTGCTCCA
TNGTTGAGGTGCTACTGGAAGACTCTATTCCTGTGTGGAGAGACTAATTG
TTTTTAAACTCAATTTTGGACTGGGGTGATCCATTTTTTAGTAGAAGTAT
TTTAGAATGGTCCAATGTTNATTTTGGGACAGTCCATTTTTTGCATGGGG
AGGAGTATGGCTAAACATGCTGTATTTGCTCGCAAATGTTGCCTTCCTAG
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ATATTCGTAAGGGGAAATAACTTTACGAATGGCTTACATACTTGCTGATT
GTACTTCATACATATCTGCAGCGTGTCGACCTGACCAGCTCCAGTGTAAC
GATTCGCAGTGTGTACCACTCTCAGC Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000116:382755..398480+ >transcript:BL91369_cuf0 ID=transcript:BL91369_cuf0|Name=transcript:BL91369_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2172bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000116:382755..398480+ (Branchiostoma lanceolatum) GAACCAGACTTGGATAGCTGGGGATGTGACTTTGATGCAGGTCAGTGTAA CTCCACGACGACTGCTCCAGGAAATTTCCGATGGATTCGACATTCAAACA GCACCCCATCATTTTCAACAGGACCACCAGCAGACCATACCGATGGATCC GGGTTCTTTATGTACACGGATGCTAGGAATAGTTCTTTTGGTGCGACTGC CAGTCTGAAGTTGCCGATTATACGCTCTAACGGTCATCACTGTCTGCAGT GGTTTTACCACATGTATGGATCGAGCATGGGAACACTGAACGTCTATGTC TCCCAGCCTCAGTATCCTGACATGTTAGTATGGACAAGGTCTGGAAACCA AGGAAATCAGTGGCTGCCAGCTTTGTCTCCCATTTCATCAAATTCTACTG CATTTCAGATTCGCTTTCAAGGCGTTAGAGGATGGGATATCTTCAGTGAC ATAGCAATAGATGACGTTGTTGTAACACCGGGACCCTGCCCGTGTCGACC TGACCAGCTCCAGTGTAACGATTCGCAGTGTGTACCACTCTCAGAACCAG ACTTGGATAGCTGGGGATGTGACTTTGATGCAGGTCAGTGTAACTCCACG ACGACTGCTCCAGGAAATTTCCGATGGATTCGACATTCAAACAGCACCCC ATCATTTTCAACAGGACCACCAGCAGACCATACCGATGGATCCGGGTTCT TTATGTACACGGATGCTAGGAATAGTTCTTTTGGTGCGACTGCCAGTCTG AAGTTGCCGATTATACGCTCTAACGGTCATCACTGTCTGCAGTGGTTTTA CCACATGTATGGATCGAGCATGGGAACACTGAACGTCTATGTCTCCCAGC CTCAGTATCCTGACATGTTAGTATGGACAAGGTCTGGAAACCAAGGAAAT CAGTGGCTGCCAGCTTTGTCTCCCATTTCATCAAATTCTACTGCATTTCA GATTCGCTTTCAAGGCGTTAGAGGATGGGATATCTTCAGTGACATAGCAA TAGATGACGTTGTTGTAACACCGGGACCCTGCCCGTGTCGACCTGACCAG CTCCAGTGTAACGATTCGCAGTGTGTACCACTCTCAGAACCAGACTTGGA TAGCTGGGGATGTGACTTTGATGCAGGTCAGTGTAACTCCACGACGACTG CTCCAGGAAATTTCCGATGGATTCGACATTCAAACAGCACCCCATCATTT TCAACAGGACCACCAGCAGACCATACCGATGGATCCGGGTTCTTTATGTA CACGGATGCTAGGAATAGTTCTTTTGGTGCGACTGCCAGTCTGAAGTTGC CGATTATACGCTCTAACGGTCATCACTGTCTGCAGTGGTTTTACCACATG TATGGATCGAGCATGGGAACACTGAACGTCTATGTCTCCCAGCCTCAGTA TCCTGACATGTTAGTATGGACAAGGTCTGGAAACCAAGGAAATCAGTGGC TGCCAGCTTTGTCTCCCATTTCATCAAATTCTACTGCATTTCAGATTCGC TTTCAAGGCGTTAGAGGATGGGATATCTTCAGTGACATAGCAATAGATGA CGTTGTTGTAACACCGGGACCCTGCCCGTGTCGACCTGACCAGCTCCAGT GTAACGATTCGCAGTGTGTACCACTCTCAGAACCAGACTTGGATAGCTGG GGATGTGACTTTGATGCAGGTCAGTGTAACTCCACGACGACTGCTCCAGG AAATTTCCGATGGATTCGACATTCAAACAGCACCCCATCATTTTCAACAG GACCACCAGCAGACCATACCGATGGATCCGGGTTCTTTATGTACACGGAT GCTAGGAATAGTTCTTTTGGTGCGACTGCCAGTCTGAAGTTGCCGATTAT ACGCTCTAACGGTCATCACTGTCTGCAGTGGTTTTACCACATGTATGGAT CGAGCATGGGAACACTGAACGTCTATGTCTCCCAGCCTCAGTATCCTGAC ATGTTAGTATGGACAAGGTCTGGAAACCAAGGAAATCAGTGGCTGCCAGC TTTGTCTCCCATTTCATCAAATTCTACTGCATTTCAGATTCGCTTTCAAG GCGTTAGAGGATGGGATATCTTCAGTGACATAGCAATAGATGACGTTGTT GTAACACCGGGACCCTGCCCGTGTCGACCTGACCAGCTCCAGTGTAACGA TTCGCAGTGTGTACCACTCTCA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000116 | genome | Sc0000116:382755..398480 + |
Properties
Property Name | Value |
Transcript id | BL91369_cuf0 |
Biotype | protein_coding |
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