transcript:BL90078_cuf2 (mRNA) - B. lanceolatum

protein sequence of transcript:BL90078_cuf2

>transcript:BL90078_cuf2-protein ID=transcript:BL90078_cuf2-protein|Name=transcript:BL90078_cuf2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=160bp
MYYNDCDFTLCCSFVGNSSIRPTSRQLWLVATHNILPFIGFGFLDNAVML
VAGDYIDVTIGTALGISTLAAAALGNLLSDLFGLGAASYVEVLALKVGLP
SPEMTPQQLDMSSSKWASNLGRVFGVTVGCLLGMLPLYFLPKREKHGKKD
DSQEAPPKTE

mRNA from alignment at Sc0000057:551354..558934+

>transcript:BL90078_cuf2 ID=transcript:BL90078_cuf2|Name=transcript:BL90078_cuf2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=7581bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000057:551354..558934+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATAATCAAAACCAATAATCAAAATGTATCCTGATAGCAAAACAGTTTTTG
TTTTTTTGTGCCAAGTTTCCTCTTGATTGATCAAGCGACAACTTCATGTG
AATCACAGTTTATGTGTATGTCTTTTCTTCTTGCTGTTTGAACTTAAAAC
TAAAAGCATGTTGAAATATATGATATGTATTACAATGATTGTGACTTTAC
CTTATGTTGTTCCTTTGTAGGGAATTCATCTATTAGACCAACATCCAGAC
AATTATGGCTCGGTAAGTGTGTCGAAACAAAATAACAGTCACTCTCTCAA
TGCATCAAGCTCACTTAGAACTGTTACATGTGTATGATTACACAAGGCTT
TCTGACTTTTAGCAAGGTTACATCCAGCCATGATAAGTTGATAGTCTGCC
TTATGAACCCATGCTATTCAATCTTTATTTTATTTTTTCTAGTTGTTTGT
TAAATATGGTAACATTGAACAACCTTCATGACATGAAAAAAAAGTCATAC
ATGCATGTGCTTTATGTATTGTTTAGGATTACTTTGACGTGAAACTAACA
ACAGGTACTAGTACTGATATGTATATATTTTCTATTCCTTCCAGTTGCCA
CACACAATATCTTGCCGTTCATAGGCTTTGGCTTTCTGGACAATGCTGTT
ATGTTAGTTGCAGTATGTATGGTTCTTATTGTATTCAGTATTGTAGATTG
TTTTCATTTGTATTTGCATACATCATGATGTGTGACCATTTAATATTATT
TAAGATATATTTTGATTGTGATCTGTGCATCATGGGTATTATATTTCATA
TCAAGTGAAAGGCTTTATATAAAGATAACATAGAAATAGGCCNATTTCAT
ATCAAGTGAAAGGCTTTATATAAAAATAACATAGAAATAGGCCAAAAATA
GTTACTCATGCAACTGGATAAAATTTTTAAAAAGACGTTTCAGACAGCAT
CCGCTGTCTTTCGTCAGTGACTGGATACGGATGCTGTCTCAAATGTCTGA
CTGTTTGAGTGTTTCAAAATTTTTCCAGTTGCATGAGTAACTATTTTTGG
CGTATCTTTTTACCTGGATGTCTAACCTTCATCAACGACGGTTACGTAAC
ATAGAAATAGAATACCTCTTACTTGGAACAACGTATGGTTAAAACAGCAT
TGTGTGCAAAGTTCTAGGCTTTTGTTAAGAATGTTGAGTCGTGAAAATTC
AACTGTTGGGCATATAAGGCAAAAATCAACCCATACAGTTTGAGAAATTT
TTCTTATCAAGGGATGTGTATTCCTCGGATTTGACTTGAATAGAAAGCAT
TCGTTGAGATTTTCCTTTGAATGCATGACAGCTTGCTATCAGGGAATGCT
TGAGGAACTTCCTTGATAATGATATGATACCAGTTTCTTCATTGATAACA
TAACTATCCAGATAAGGTGCTTAATGGGTCTGCAGCTGCATTGTGTTGAA
ATAGTCATTTCCTTTAGAAATAGAAGGAAGTAGTTCTATAGGATAAATCA
TTCTCCCAAGGCAAGAGAATTTTCATTGCAGTATAGTTATAGCCTGAGTG
TCACCCTGTTTAGTTCCAGGCTCTACCTTCATGAAGTTTGGTGATGGTAG
AGCCTGGAATGAAACAGGATGACACTCAGGCTAGTATAACTATNACAGGA
TAACACTCAGGCTAGTATAACTATGACTGCCATGCTGTTTATTTCCTGTT
ACATGGTGTGCTTCAAAATAACATCATTAATATTGCTATTGGAGCTTCAA
AAGTGTTTTATATGGACAACAGAATCTTTGGTACGCTTTATATTAAAACT
GCAGGCTACTGTATTTAGAATGGCACAGAAGAGAAAATAAATGGGAAAGA
TATGGGATTTTCCAGGAGATTCAACGAATGTGATGTATGAAAATAGAGTA
CATGTAGTGTTACATAAAAGATTGATGCTGTGGCCCCTTGACTCATGGGA
TGAAGGAACCATTATAAGATAACTATTGACTCAATTTCACAGGGAATTTT
TTCCATTTCAGGGGGATTATATTGATGTGACAATAGGAACTGCCTTAGGC
ATCTCAACATTAGCAGGTACTTAATCTTTGTTTCTCTTGGATTAAAGTAC
ACTTTAAACAGTAATTATCTTTCTGTAGGCAAAGACTGATTTCCTCATTT
CTAAAAGTACTGTAATTTCTTTGACCATACAGTAATACTTTCTGTAAATC
CTTTTTGAAGATTGTAGAAGGTATCAGGATGACATAGATTAAGGAGAAGA
TATGTATGTAAGCTGTTTCATGTATTTTTTTCTAGCTGCCGCATTGGGCA
ACTTGTTATCAGACCTATTTGGACTGGGGTAAGTTATTTTATCATGTGAT
GTACTCTATATTCGAATGCACTTCAATCTGTGTGGCAGCGAAGTGTTACT
CTGTAATCTTTGCAAGAGCATCCAGAGCAATTCAATGGTTAACTAAAAGA
CAAGCTGAGACAACAAGACCCTTTATGTATGTGCTAAGTTGAAGCATACA
ATTTGTATCCCAATAGACAGTATACCATATCTATACATCCAGTTTCAGTT
GTGAGTGTTGTGTCATTATTTTACCTTACAGAGCAGCAAGTTATGTTGAG
GTGCTTGCGTTAAAAGTGGGGCTCCCCTCACCAGAGATGACTCCTCAACA
ACTGGACATGTCTTCTTCAAAATGGGCTTCAAATCTGGTATGTTATCAGT
ATTCTTAATGATGTTATCAGTATTCTTAATGTAACTAGTAGTTTGTTCCA
GCTGTACATAGGTGTCAACACAGCCTCACTCTAGCGTCTGTCCATCCGTC
TGTCCCAGAATTTTGTTGCCTGGGACCGACAAACATTTCAACCATACATA
CATGTTTCATACTCTTAACTCTTAACAAGTTGGAGTGTACACATAGTTTA
GCTTCCAGTATTCTCTGTTATACATCATTTCAGTCAAGTCTTTTCTATTC
AAACCAGTTTCCGACTTGATAAGGTTCTTTAATGTCAAGTATGGACGGCC
TCTTCCCCTTCTGATTTCTGGAGACCAAAGAAGCAGTTTAACAGCTTTTA
CTAGTTTTTCAACCATACTGTCCCCATTGATGAATACAAATCTGAACTTC
ATGAGGTTATCCTCATGCCATCAACAGTGTCACAAAATAAAGATAAATGA
TAAGCCATTTGAAATTCACTCCTCAAAATACGAAAAAATCAGGGTCAACA
AGGTCAAAATTTCCAGAGAGAGCATGCCTATGGACCCCCAAGATTCCAGG
CTCCTTTGGCACTCAGCAAAGAGCTTTGTCTCCTCAAACCGATAGGACAG
AGAATAAGGAATAAGTTGGAGAGAGCCCAGTGTCAACCTGGGTTTCAGAA
TAGTAACTTTTGAATTACAATTTTACATTGACGCTACTTTTTTGTATCTT
TTCTTCAGGGTCGTGTTTTTGGTGTGACAGTAGGCTGCCTCCTGGGGATG
TTGCCACTCTACTTTCTCCCAAAACGAGAGAAACATGGAAAGAAAGATGA
CAGCCAAGAAGCTCCACCGAAAACAGAATAAGATCAACTAGACAAAATCA
GTTGTCTAAGCTGACTGAAATACTTAAAACGTTTTTAGGAAAAGCAGGTG
CTGGTACAAACCATGTGTAGTGAGGGTCCAAAAAAAGTGCCATGCACAGG
TGTACTGTACCTGTAGGGACTCAGCCATAGGGTAGAATAGATGCTAGTCT
TAATATTAACTGNGTCTTGATATTAACTGGAGTTTTTTATAGAACAGAAA
CATGGAGATTGATGACTGTGTTACAGATGAACCCAAATACAGTGGAACAA
ATCTGCCCAATGTAGCAGGGCTTAGTGTTTTGTTGGGCAGCTATCTTTAC
AAACAACTAGTATTTATAGTTGGTACGAATTGTGTGTGATTTTTAATAGT
TTTTGTCATATTTATTTATTTTGTTACTGTGTTTTGTCCTTGTCTAATGC
TTGAGTATCCTGTAAGAATGATTTGTCCCCTTTGGTCAACCTCTGTAGAT
TATGAGCACCCTTTGGTGATGAGTTCACTGCTCCTTAGCATGTAGAATTA
ATGCCATTCTAGTGCTTGAATTAGAAGAAAGAGGAACTTACTGAAGTCTT
AATGTCAACCCCTAAGAATAGTTAAGGAGGCCTACCACTGAAAAGATCAA
AACCACCCAGATTTGTTGCCAAATATGAAGACAGTGGGATAAAATGGGAG
ACCAGAAGTAAACTAAGGGTTGAGAACTAAGAAACTGCTCTTTAATTTTT
ATTGGCCTTGCAGCATATGTAGCCTGTAAATGCTACAAAAGAAGTAGGTT
TTTTTTACATTGTGAAAAGGGAACATTTTATCCAGTAATTGCTTGAAGTG
TAGTTTGTAAAAGTGGAATTCATTTTTAGACATGCATGAAAATAGCTGGA
CAGTTATTATCTAGGATAAATAACAACAGGAAAGTAGAGGTAGATTGGGT
TGATTTTTTAATCTTAAATTGTAAGCAATGCATTGGAAGAAGGGTTTCCA
AAGTTAAGGTAGATGTTTTTAGGAAATATACACTGTTCTAAGATGTCAGA
ATTGTTGACTTTTGACAAGAATTATTTGTATAACGTTATACCTGCTCACT
GTACTTTGTAATGTTACATGATAGAGATCAAAGCATCTGGTAATATCATA
CAGTATGTATGGTACTGTATATGGGAAGTTATGTTTGCCATTATTTTGCT
GGGAACAGTGCAACTTAGTCTTTTACCCTCCTCTTCCATTGTCACATTAA
TATATTGTGCAATAGTCAACAAAGTGTGGATGTTTTTACATTTTTTCAGT
AGAAATGTCACTTGAGGCTGTCAATGATGGGATAACAAAGCACAGACACA
GATGTTGTTTTCACAGACAGATTACATAATCTTCATTTCACATTATGTCT
GGTTTTCTTGAAGTGCGTCACACAGTAATGTGTTCTGACTGCACCATTAG
CTCCATAAACATGATAGCTTAACCAGTCAGGTGTTCTCTGGCTGTACTCC
AGAGAGGTCTGGAAAAGAACTTGTGTTTGGGGAAGTGTGCATTATTACTG
TAGTTATGAACATAGACATGGGAAAGTCTGTGAACATCTGCAGTTACAAG
GTTCACCACTGGCTAGCCCCCCCCCCCCCCAAAATCACACAGCCTTGCTG
TCAGGACAAGAACGTTTTTGTCACAGTCCCTGTCCGTTCTCTCTAGTCTC
TAGCAGGCTCTCTTGGAAGCTTCAGAGCCAAAGACTGTCTCTGTGGTGCT
TGTGCATCTTTTGGACTACAAAAATCCATTTGTTGTGACTACATAACATT
ACTTGCCATAGCACTGTCCTTGGTGCTGATTGGCCACTACAAGCCTCAAC
TGTAAATCTGATTAGTTGCTGCAAGTTAAAACCATCTGAGTTCTGTGAGC
TTATGCTTGATATTCTAGTAGCCTCCTTATAAGGCTCTGTGCCTGCTGGG
TTTATTCTGTGCTGTTTTATGATTGATACCAGTTTTCTGATGGCTGCTGG
GGTCTGCTGGCTTGCCATGCTAAGGAGGCTGCTTCTAGTTTTCGGTTGGT
TCAAGCCCCAATCTTCATGCTGATTGGTCACTACTAAGCTCTTTGATGCT
ACACTGAACGAAAATGTCCCATCTGATTTGTTTGTGCATTGACAGAGCCA
CCACTAGAGTGCAAAGACTTACTGTCCTGGATTCATTCATTCAGTTAAGC
CTATGTGTAGTTAGACCATAGGTTAGAAGAAGATTTTTGTAGGCTTGTTA
CTTATTAGTGTGCAATGCTGATGAAGAAATAAAGGAGGTAGAAGCTATGG
CATTGCTGGGTCTGTGACAAAAAGAACATTTTATTGGCATATTGCTGGCC
CAGTTCCTACTGTGATGAATATTACTAATGTATAGAGGTTTGTTTTAATG
TAGCAAAGAAAGTTTGAGATTGTGCAATGCTAACTTTACATGTAAGGTGT
ATTTGCGTACTTATTAGTTGTTTTGTATGGTAACTACAACATATTTCTGT
GTAAATATGATTTGGAAAATGTAAGCATTCTACTTTGATGATGCAATATC
TGAAGACGTAAAACATTTATGGAGTAGCACATTAACGGTGTTGTAGTAGT
ATATACACTAAACATGTTTGAAAGTTTTTACTGCGATGTAGATGTGGCAA
GGGTTCAGGGAGTGTGCTAATGAGTCTTGTACATCTGTTGGTGAATATCG
TACAGTAATGAACACATGGTATTGAGTCATGTGTGTAATACACTGTACCA
AATTTACTTTCTGTTTGTACCCTGCACCACCAAGTGCCTGTTTTTGAAAT
CTGTGATTTTGGAGGCTAATCAGATGTATGAAATGGTAGTGCTTTCACTA
AACACCATATAGTCATGTAAAACTAATGTATTTTTGATCGAATGGAGGGA
AGTTTAAGCTCCGAGAGGAGGTCTTGAGAGAAGTTCTGAAGAAAGGAGGG
TTGGGAAGGGGTATTTATCCAACGAAAATTTCTGATTGTCTTTGGGGATC
ACCCTTGTCATCAAGATTTTTGGAGTCTAGCACATATATTTGTCGGAGCT
GCAGTTTACTGTGGGCAGGTATGGCAGAAATCTCTTGTCAGACATATTCA
AAGCAACACTTATGTGCATTTTTATTTTATTAAGGATGTTTTGAATACAT
GTAGAAATGAAAATTGCCATTTGTAAAGCCATGGAGTTTGGCTTATGGAG
TAGTGGAGACCATTTTTGTGAATGTCAGCCAACATGTATACAAACAGTGG
CATTAGTCCTGCAATGTTTCTAGTGGCAATGTGTTGATGACAGAAGCACT
ACCCAATAACAAATAATGTGCTACCCTTAACATAACTATCAATCAAAGTA
GAGATGTAAAGAACCAAAGTTACGGACAACCTGCCCTTGTACAAGCATAA
GAGATCATGACTGAATGCTTGGTAAAAGGTTCAATATGTGGAATGTAGAG
AATGAGGCGGTACGGGCAATGGGATCTCTGTTGACTTCTGTTGTATCCAA
TATAAAGTTAGAAACATGGATGTGGTCACAGCAAGGGGGAGGTTAAACAG
TTGAGATGTGATATAGGAATAAAGACAGATGGTGAAGAGTGGTGATATAG
TGTATACTTAAAGACCAAAAAGAAGCACATATTGAACAAAAATGTATGAG
ATGGTCCTATCATGACCAGCGGTGTGGTGCTTTATGCCATTCGTTTATTC
AATATTTGAAAGTGACTGGAAGAGTCAAGGAAGTATATTTTCTTCCTATT
ACCTCCTTGGAGGGGTGTTTTACAGGGCATGTCAAAACAGTCAAGCTACA
TACTTGCCATTGAATTAGCAGAGGGTGACCCGGTGATGACTGTCATTTAT
GCCTCATTTGCTTCAAGATTACTTATTTCAAAGGCACGGAAAAGTTCAAG
TGTGTCTGTATTGGTCCCAATCATTAAAAGCAATAATATGGCATGTGGGA
TTGGTGTGTTGCTTGTATTGAAGTTTGTTTTATCTTTATTCTTCCATTGA
TGTCTTGAGTAGTCTTACAGTACTGACAACTGAAAGATGACATTATCACA
AATGGAAATAGCTCACAACAGCCTACCGTGG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000057:551354..558934+

>transcript:BL90078_cuf2 ID=transcript:BL90078_cuf2|Name=transcript:BL90078_cuf2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2898bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000057:551354..558934+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGTATTACAATGATTGTGACTTTACCTTATGTTGTTCCTTTGTAGGGAA
TTCATCTATTAGACCAACATCCAGACAATTATGGCTCGTTGCCACACACA
ATATCTTGCCGTTCATAGGCTTTGGCTTTCTGGACAATGCTGTTATGTTA
GTTGCAGGGGATTATATTGATGTGACAATAGGAACTGCCTTAGGCATCTC
AACATTAGCAGCTGCCGCATTGGGCAACTTGTTATCAGACCTATTTGGAC
TGGGAGCAGCAAGTTATGTTGAGGTGCTTGCGTTAAAAGTGGGGCTCCCC
TCACCAGAGATGACTCCTCAACAACTGGACATGTCTTCTTCAAAATGGGC
TTCAAATCTGGGTCGTGTTTTTGGTGTGACAGTAGGCTGCCTCCTGGGGA
TGTTGCCACTCTACTTTCTCCCAAAACGAGAGAAACATGGAAAGAAAGAT
GACAGCCAAGAAGCTCCACCGAAAACAGAATAAATGTATTACAATGATTG
TGACTTTACCTTATGTTGTTCCTTTGTAGGGAATTCATCTATTAGACCAA
CATCCAGACAATTATGGCTCGTTGCCACACACAATATCTTGCCGTTCATA
GGCTTTGGCTTTCTGGACAATGCTGTTATGTTAGTTGCAGGGGATTATAT
TGATGTGACAATAGGAACTGCCTTAGGCATCTCAACATTAGCAGCTGCCG
CATTGGGCAACTTGTTATCAGACCTATTTGGACTGGGAGCAGCAAGTTAT
GTTGAGGTGCTTGCGTTAAAAGTGGGGCTCCCCTCACCAGAGATGACTCC
TCAACAACTGGACATGTCTTCTTCAAAATGGGCTTCAAATCTGGGTCGTG
TTTTTGGTGTGACAGTAGGCTGCCTCCTGGGGATGTTGCCACTCTACTTT
CTCCCAAAACGAGAGAAACATGGAAAGAAAGATGACAGCCAAGAAGCTCC
ACCGAAAACAGAATAAATGTATTACAATGATTGTGACTTTACCTTATGTT
GTTCCTTTGTAGGGAATTCATCTATTAGACCAACATCCAGACAATTATGG
CTCGTTGCCACACACAATATCTTGCCGTTCATAGGCTTTGGCTTTCTGGA
CAATGCTGTTATGTTAGTTGCAGGGGATTATATTGATGTGACAATAGGAA
CTGCCTTAGGCATCTCAACATTAGCAGCTGCCGCATTGGGCAACTTGTTA
TCAGACCTATTTGGACTGGGAGCAGCAAGTTATGTTGAGGTGCTTGCGTT
AAAAGTGGGGCTCCCCTCACCAGAGATGACTCCTCAACAACTGGACATGT
CTTCTTCAAAATGGGCTTCAAATCTGGGTCGTGTTTTTGGTGTGACAGTA
GGCTGCCTCCTGGGGATGTTGCCACTCTACTTTCTCCCAAAACGAGAGAA
ACATGGAAAGAAAGATGACAGCCAAGAAGCTCCACCGAAAACAGAATAAA
TGTATTACAATGATTGTGACTTTACCTTATGTTGTTCCTTTGTAGGGAAT
TCATCTATTAGACCAACATCCAGACAATTATGGCTCGTTGCCACACACAA
TATCTTGCCGTTCATAGGCTTTGGCTTTCTGGACAATGCTGTTATGTTAG
TTGCAGGGGATTATATTGATGTGACAATAGGAACTGCCTTAGGCATCTCA
ACATTAGCAGCTGCCGCATTGGGCAACTTGTTATCAGACCTATTTGGACT
GGGAGCAGCAAGTTATGTTGAGGTGCTTGCGTTAAAAGTGGGGCTCCCCT
CACCAGAGATGACTCCTCAACAACTGGACATGTCTTCTTCAAAATGGGCT
TCAAATCTGGGTCGTGTTTTTGGTGTGACAGTAGGCTGCCTCCTGGGGAT
GTTGCCACTCTACTTTCTCCCAAAACGAGAGAAACATGGAAAGAAAGATG
ACAGCCAAGAAGCTCCACCGAAAACAGAATAAATGTATTACAATGATTGT
GACTTTACCTTATGTTGTTCCTTTGTAGGGAATTCATCTATTAGACCAAC
ATCCAGACAATTATGGCTCGTTGCCACACACAATATCTTGCCGTTCATAG
GCTTTGGCTTTCTGGACAATGCTGTTATGTTAGTTGCAGGGGATTATATT
GATGTGACAATAGGAACTGCCTTAGGCATCTCAACATTAGCAGCTGCCGC
ATTGGGCAACTTGTTATCAGACCTATTTGGACTGGGAGCAGCAAGTTATG
TTGAGGTGCTTGCGTTAAAAGTGGGGCTCCCCTCACCAGAGATGACTCCT
CAACAACTGGACATGTCTTCTTCAAAATGGGCTTCAAATCTGGGTCGTGT
TTTTGGTGTGACAGTAGGCTGCCTCCTGGGGATGTTGCCACTCTACTTTC
TCCCAAAACGAGAGAAACATGGAAAGAAAGATGACAGCCAAGAAGCTCCA
CCGAAAACAGAATAAATGTATTACAATGATTGTGACTTTACCTTATGTTG
TTCCTTTGTAGGGAATTCATCTATTAGACCAACATCCAGACAATTATGGC
TCGTTGCCACACACAATATCTTGCCGTTCATAGGCTTTGGCTTTCTGGAC
AATGCTGTTATGTTAGTTGCAGGGGATTATATTGATGTGACAATAGGAAC
TGCCTTAGGCATCTCAACATTAGCAGCTGCCGCATTGGGCAACTTGTTAT
CAGACCTATTTGGACTGGGAGCAGCAAGTTATGTTGAGGTGCTTGCGTTA
AAAGTGGGGCTCCCCTCACCAGAGATGACTCCTCAACAACTGGACATGTC
TTCTTCAAAATGGGCTTCAAATCTGGGTCGTGTTTTTGGTGTGACAGTAG
GCTGCCTCCTGGGGATGTTGCCACTCTACTTTCTCCCAAAACGAGAGAAA
CATGGAAAGAAAGATGACAGCCAAGAAGCTCCACCGAAAACAGAATAA