transcript:BL83171_cuf0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL83171_cuf0
Unique Nametranscript:BL83171_cuf0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL83171_cuf0

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DLKKSSCSC
Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000365:189642..203833-

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000365:189642..203833-

>transcript:BL83171_cuf0 ID=transcript:BL83171_cuf0|Name=transcript:BL83171_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=4410bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000365:189642..203833- (Branchiostoma lanceolatum)
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TACAGCAGGACAGGAAAGGTACCGCACTCTAACAACAGCGTACTACAGGG
GTGCTACAGGTATCCTACTGATGTACGACATAACAGGGGAGAATTCTTTC
ATCGACCTGGCAAAATGGTTAAGAAATATTGAACAGAATGCGTCCACAGA
TGTACAGTTATTACTGGTAGGGAACAAGTGTGACATGGACAACAGAGTGG
TGGAGCTGACAAGAGCGCAAATGCTTGCAGATAGCTTTGATTTGGAGCTG
ATAGAAGCCAGTGCCAAGGACAACATCAATGTGGAAGAGGCTTTTTTGGC
CTTGGCGAAGAAAATGAGCGAATCTCGATCACGGAAACTGTCACACCGAC
ACAGCATTCGTGATGTCATCAAATGGGACAAGCTCGACCAATCAGACGAA
GACTTGAAGAAGAGTAGCTGTAGTTGCTGAATGGCGGCCGCCGGTCCAGC
AGACGAACCTCCGATCTTCAAAATCCTGGTTTTAGGCGACGTCGACGTCG
GAAAAACCTGCTTTATACACAGATTCTGCGGTGGAGGATTCCTAGAAAGC
TACATTTCAACAATTGGCATAGATTTTAAGGAGAAAATGGTCAAATTGGA
CGGCGAGCCATGCAAGTTGCAGATATGGGATACAGCAGGACAGGAAAGGT
ACCGCACTCTAACAACAGCGTACTACAGGGGTGCTACAGGTATCCTACTG
ATGTACGACATAACAGGGGAGAATTCTTTCATCGACCTGGCAAAATGGTT
AAGAAATATTGAACAGAATGCGTCCACAGATGTACAGTTATTACTGGTAG
GGAACAAGTGTGACATGGACAACAGAGTGGTGGAGCTGACAAGAGCGCAA
ATGCTTGCAGATAGCTTTGATTTGGAGCTGATAGAAGCCAGTGCCAAGGA
CAACATCAATGTGGAAGAGGCTTTTTTGGCCTTGGCGAAGAAAATGAGCG
AATCTCGATCACGGAAACTGTCACACCGACACAGCATTCGTGATGTCATC
AAATGGGACAAGCTCGACCAATCAGACGAAGACTTGAAGAAGAGTAGCTG
TAGTTGCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL83171gene:BL83171Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL83171_cuf0transcript:BL83171_cuf0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BL83171_cuf0-E1BL83171_cuf0-E1-1564476830-449682Branchiostoma lanceolatumexon
BL83171_cuf0-E2BL83171_cuf0-E2-1564476830-449680Branchiostoma lanceolatumexon
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BL83171_cuf0-E4BL83171_cuf0-E4-1564476830-449675Branchiostoma lanceolatumexon
BL83171_cuf0-E5BL83171_cuf0-E5-1564476830-449673Branchiostoma lanceolatumexon
BL83171_cuf0-E6BL83171_cuf0-E6-1564476830-449671Branchiostoma lanceolatumexon
BL83171_cuf0-E7BL83171_cuf0-E7-1564476830-449669Branchiostoma lanceolatumexon
BL83171_cuf0-E8BL83171_cuf0-E8-1564476830-449667Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000365genomeSc0000365:189642..203833 -
Properties
Property NameValue
Transcript idBL83171_cuf0
Biotypeprotein_coding