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Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL72785_cuf3 >transcript:BL72785_cuf3-protein ID=transcript:BL72785_cuf3-protein|Name=transcript:BL72785_cuf3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=147bp
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ADVDVRITDNLLTSLGFTVKQLLNKSAQQTLIGEQFLQEMFRMQGGF Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000458:107348..121540+ Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL72785_cuf3 ID=transcript:BL72785_cuf3|Name=transcript:BL72785_cuf3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14193bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000458:107348..121540+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GTCTGGAATTCATGTGAGAAGGTGACACAGTCAAGTGGCTGGCAGATTCA
TACAGCATTATTAACTTTGTTCCCTTTGCACCATGGCATTGATGCTGGGT
AGCACCCTTGAACATTACTCATCATTGATCATAGAGGCTTGTTAGACTGT
CAAAAGGCTGGTAACACATATTATTAAATGTATGTTTCTCTTCCCTTGAC
TGCTACCAGTGGGAGTGGTGACACCAAATTAACCTCTGGTCCTAGCTAGA
GGTCCATCTTTCTCAAGCCATACCTGCCATGTACATGTAAGGTGCACAGT
ATGGTCACTTAAGGCCCCCTCTCATTGGGCTGCGGTACTGTGGCGGTAAC
GTGCGGTAGCTTGGAAATGGCTACCGCCGCAGTGCCGTGCACAGACCTCA
GCGTACCGTCCTAGTGACGTCTCAGTGCCGTACCAGTGCCGGTCCACACC
GCCGGCGTGCCGGTTGAAATGGCGATTTTTTTCAAAATTTGAAAAAAAAC
GCAAGTGGCAAAGTGCCGCGCGCTCGCCGGGAGCTTACCGGGAGCTCACC
GCGCGCGCTATTGTGTAAAAGTGATATGTCAGTTTCAAGGTTATACGTAT
ATTCTATAACATGTTACCTTTGTTGCACCAAGTGTCATAAGTGAAAATCC
TTTTATCACTTGAAATCAATTTTTGATGCATTTTTCTATTATAATTTTGC
ATTGTAGTTTGATCCATTGACAGCACTGCGATTTCTGATTAATTGATATT
GCTTAATCCCACTGAAAATTAGATCTCTGCATTGTACATTTATTCAGTAA
GGAAGTTGATAGACTAGTCGCTCAGGACAGGAATCAGACCACTCGTCTAA
TACAGAAATACAGTGATAAACTGATTCAGAACTTGATATACCAGTCAGGC
ATTGTATCGCAAATTTTACTCAATGTTTCGCCGTAAGGGGTGAATGAGAA
TAATTCCTATTGATCGTTGATACTAGTAGTCAAACATAGTTGATTATATA
CTATCGCTAAGATTAAATAATTTACCTAATAACAGGATTATTAAAAAAAA
CATACGACGCTTCATCATTCGAAGAAGAAAATGACTGGGCTACTCAAGTT
CAGGACATGTTACGTAGACATGTTTGGCTTAGCCCCGCAGTTAACGTTAA
TACCAACCGTTTTGGATATACATTTAAAGAAAGTGTGAAACTCACGTTTC
TCCCTGGCTGGAGGGAAATATTAGTTAACTCCACACATATTATAAAATCA
AAAATCACTTTGGTAGGGAAAATATATCACATCAAATCATAATAAACCAA
TAAGCATAACTACACTGAGAATCAGCGCACGTTGTCTAGCAGTTGAAAAG
AATCAACACCACAACACACAAGGCACTCACAGATTGTGTCCCACATGTAA
TAAAAATATTGAAGATAAATTTCAATTTGTAATGGCCATGGCCTGTCCCA
CTTATGGCAAAGAGACAGATGTGATGTTACAAAGTATTACATGTACTACT
AAGACAAACTTCACCCTATCTGGTACACAGAACGATATGTCCCATGTATG
GTTGTCATGTCCAACTCCTATACCACCTACATAGGTCAATTTCATTATAC
TTCATCCTAAAAGCGAGGGAAAAAATCATCCATACATGGCTTTATTGTAA
TTCATGCACTGTTATCGATAATGTTTTGTACTTATAATTGAAGGATAGGT
TAGCCTTGCAGTATTGTTGATTTAGTGCCATATATTGTACCATATACGAT
TGTCGAACAATAAAGTTCATTCAATAACTTGCTCATCTGGGCTTCAAACG
CAAATGCGCCGCATGTCAGTGAGAGTGCAAATGAAAATTGGTTAAAGAAA
CGCGACGGTGCCGTAAAAATCTGCCGTGGCAGTGCCGCCGCAGTGCCGGA
GCCCAATGAGAGGGGGCCTTTAGTGCTACTGGTTATATGTGAAATGCTGC
AGGAAATTTGTTTTGGAACAAAAAAAAGAAGTAAAATTGAATGCAAATAA
AGTTAACCTGATAAATCATTTGTAATAGTTAACACTGTGTTAATTGTTGG
TTTGTATCAAGATAAGAGAAGGACAGGATCAGTGGTGCCAGAGGGAAGTC
CTCGGGGTGGCGTGACCTTGGGACTGCAGCCGTCCTCTCTGCAGTTCTTT
CACAAGGTTTCCCAGGTAGGAAGTTACTTACCTTCACCAAAGGGTTGGTA
ATGTTTTTAGTTGCATTCATTAACTTTGTGGTTTTGTATCAATGTATCTC
AGAAAGTTATGGATAGATTATGAGTCATGATATTTGCTTGACTAATTGAA
GAAATTATTAGATTTTTGGTCCCTCGGCAGTACTTTGGTACTGTTACGGT
AGCAAAAACTTCAAATATCACAATTTCTTCTCATTGATCGGTATAACTGA
AAATCAGCACTTTAACATTGTGGGATTTAATTTCGTGGAAGGGACAAATG
GAGTGTTTGAAGTATAATTATAGTAACATTAGCGCTGCAGTCACAGAATG
CCTTTACAAACAGCCAGTCGCGAACCAATATATTGCACGGCCTCACTACT
ACTAGTGAGTGGGCAAGGGTGCTATAGACATGTAGACAGAACAATCGCTT
TTGGCAGTGATGGCATCATTACCTTATCTGTGACTATCTTGGTATAGAGT
ACTACTGTAACAGTACGGTAACTGATCTCTGGATAGTACTTTTATTTAAT
TAGTACCAAAGTGTTGGCAAACTTATCCTTGCATCAGAGAGGACATTATT
AATACCTTGTTAGTAGTCATGATATTTGCTTGACTAATTGAAGAAATTAT
TAGATTTTTGGTCCCTCGGCAGTACTTTGGTACTGTAGCAAAAACTTCAA
ATACCACAACGTGCATATTCATCGTAAAAGGTGCCTCAAATACATCATAA
TTACAATACTGTAGAGTGCGTAGACAAGGGGATAGGTGGGCGGAAAATGG
CACAGAAGTTTTTGCGATCAAGAGGTCACCATAAAAACCACTGCAAAATT
TCTACCGTTAGTTAGCAGTATCCTGGATGTCTGACGTGATATTACCTCGG
GGATTACTGATGCTGCATCCATTCAGTAGATCTCTTCAAATTCCCCTTTT
TCAAAATTTGGCAGTCTTAATTATAAGGTGCTTAAGACATGACATTGAAA
TTTGAGGTCAATGTAACTTGTATTTAGCACTTGCCAGAGGTATGTGCATG
TTTAAGGTATATAATATGACAACAAAACAAGGATTTCATTGTGTCAACAT
CATCATCATCATCTTCTCACTGAGGCGGCCATCAACATATATAGCTGAAC
ATCAAGCTTGAAGACTAATGTTTGTATGTGCCGCAGGGTCCGTCAGTCTA
CCCGATGGTGACAACTCCCCGGGGACATGCCCTCATCGTCAACAACTCAG
TATTTGATGGAGACCTCTCGGACAGAAAGGGTGCTGATGTTGATGTACGA
ATCACTGACAACCTGTTGACAAGCCTGGGTTTCACTGTGAAGCAGCTTCT
GAACAAAAGTGCACAGGTAAGCATTCAAGTCGGTAGCTAGTGCCTGACTT
GCAGCAGGTTTTACATGACTATTGTGTATATCACTTTACATCTATTTCTC
TTTTAAATCTCATTGTACTATTTTGCATTGCTTTCCAAGTCTTTAGTGAT
TTGTTCAAAGAATGTATGAAACCAAAATCCAGTATTGTATATTATATTTA
CTGATTATTTTCAGCAATGAAATCATGTAGTATATTCAATTAACATTATG
TACTCATTTGCACCAAATATACACCATTTTCCTTGATTGTTATTGAACAT
CAGTCACACACCATCAACAACATTGGCAATGATAAAAAGACATTGCCATG
GCGGCTGCCCCCCCCCCAAAATATGTTTGGGGGCCGTCGCCCCCCCCCCC
CCCCCCGGGGATTTTCTTAACTTAGCTTATTCTACCAGCAAAATTTGTCT
CTCAAAATGCAGGAAATAGTGTTTCAGCGGGTCAAGATTTCAAAATTTTC
TCCGACGTACGTTAGCATACTAGGATTGTTGCGCCTTTGAGGCATTGCCA
AAAATTATTCTTTAGACTGAAGGTTTTTGTCGCAATTATGACTGCCGATT
GGAACCCTGGTGAGCAGCGGCTAAAGAAAAAACCTACAGATGATTAAAGC
TTCTCAAAAGCTATGATAGGATTACCTGACAAAAACATTGAGTCCGATTT
TTTGATGGACAGGTGCAATGTTCAATAACAGGTGACTATGAGTGTACAAT
ACCATGTACATTTTGGTGCAAATGCATGTGTCACTCTATGGTCACTGCTG
TTGAGTATAATAAGAAAATGTTGTATTTTGTTTTAATACAATCTCTAAAG
GAAACTAAAACATTTGGATGGAAAACCACTATATACCATGCTAAATATAC
CCCAAAGTCAATTCTCACCTGTATTGCACAAATTGTTCCTAATTTGCGAC
ACCCGAAGCCGTTTGAAAATTGCCCTGTAAGCTGCCCCGTGACGTCACTT
GGGACATCCGACCCGCGCAAACACGAAGGGGGTTATAAATAGCTTTCCAA
TAAAATGCTACCATGCCTGCTTGTGTAACTAGTAAAAATTCTACCTGTAG
CCAGACCAAAGCAATATATTCTTTTTCACATTCCAAAAGGATGACAACAG
GTTCAACAGCGCAGAACGCTTTTGCTCCCCCTCCCTACCTCTGCGTGTTG
GCGCGCCCCAGGTGACGTCATGAAACAGCAACCAGACATAGTTGGCCGCT
TACAACGCAATCTTAAAATGGCTGCAGAGTTGCAAATTAGGAAGAATTGG
TGTGATATGGATGAGAACGTGACTTTGGGGTATATGTAGCATACTATATG
GTAAGTCTTCTTACCGAACCTTTTTGTTTCCTTTAAGTCTAAACTTTACA
TACTCCAAAGATTTTTGACTTCTTACAGGAAATGCTCAAGGAACTTGAAT
ATTTCTCTAAACTGGATGATCACAAAGACGGTAGTTGTTGTATTGTCTTC
CTAATGTCTCATGGCCAGGAGGGCTGCATCATTGGAAGGGATGGCCAGAC
GGTCAGGCTGAAAAAAATATTTGGCCTTTTTGATAATATTCATTGTCAAA
AGCTGCTGGGAAAACCGAAGCTGTTCTTCATTCAAAGTTGTCGTGGAGGT
AATTATAGCCTGTTATGTTAATCTATACTTTAAAAGAATCTCATTTCATT
TTTGGTAATTCCACAGACTGCACACAATCTTGCTTTAGACTGAAAACTTG
GCAATGCTTTTTACATTATGCAGAAATGTACAATTTTCTTCGTAGCAAAC
GTTGATCGGGGAACAGTTTCTCCAAGAGATGTTCCGGATGCAGGGGGGGT
TCTGAATGGACAGAGTCTTTCCTGTCAACTTTTTGGACCTACGGGAGCGG
GTGAGGATGTCCCAGATGCTGCTAGATGTGTCGATCAACCAACTAGGACA
GACATGTTCTTTGGATATGCAACACAGGAAGGTAATTGATAAGTACAGGG
AACATTATTAGATATAGATTATGCAAATCAGGGTCTCATTTACATAATCT
ATTAGGAAATGCTACAATAGTCTTCTTTGCTAAGATAAGACATTTCATAC
TTTGAACATATTGTATTATTTGGGTAGAGAAGATTATCCACTGATATAAT
CTATGCTAATGAGGACCTTATTTGCATAATCAATTGGAAACATTTATAAT
ACATCACTCGAAAAGGTTAAGGCGAAAAGATAATCATTTGGCGAAGGTCT
GAAGTCGTGGAACTCTAGTTGTTGATGTTCTGCTTTGAAAATTTGAACGA
TTTTTTGGAAGGTTGTTGAATCTCAGGCAGTTTTAACTGTATGATTTATT
GATCTGGGTTTGACGCCTTCCTTGATGTTGATCTTGATGACCTTTTTCAG
GAAACATGGCCTTCCGAAATGAGACACAAGGCAGCTGGTATATCCAGGCA
ATTGACCAAGTGTTCCGGCAACGCGCTAAAGACACTCATGTGGCAGACAT
GATGACAATGGTAACCCCTATACAGTTGTACATCATTTCTATCATTTCAA
ATCATGACTAGGTGCCCTGTAGTTGCCTTATATCTCTTTGTATTTATTCC
AGGAGTAACTCCACAAAAAAAGTCAAGTAAGATCATAGGAAAATAATAGC
CATACAAAGTTTACTTCAAATACCCATCACTTAGAGCAGGGCACTCTGAA
TATCTAACCACAGGCCAACTGTGTCAACCTTTAAGACTCCTTTGAAATGA
GACATTGAACTCATAATCACCCTTCCAAGTGATTCCTGATTATTCATTTC
TTGATTGCTACATGTAATATTTATCTAGGTATAGGGTGAATATCTATTGT
TACATCATGACTTTTGTCCTAAAATGGAATATTGTTTTCAGCTACCATTT
ACAGAGACCCAAATTTGATGATATAAACCTTCATTTGTACATGTTTGTCT
AGGTGAACAGAATGGTGGCTGAAAAGACAGCACAAAGTGAGAGCTTGAGG
TACACAGGAGGCAAGGAGGCATCTGAGTATCTTTCCAACTTACAGAAAAA
TCTCTACTTCTTTCCAAGCCTTTAAGTCTTCCACGAACAAGATTTTCATA
CATTGGACAACTTGTGTTATTTTGGTAGAGAAGGTGATCGACTGATATGA
TTTATGCAAAGTCCTTATTTGCATGTGGGCTAAAAACGAAAACGTTAACA
GAGACCACCGTCGCCATGGCAACATCTTTTTATGTTGCCAATCTTGTTTA
ATTTACTTTATCTCAGAATTGGTTACATAAGACACCAAAATACAACATTT
TCTTATTATCTGAAATAGGAATAGCAAGGAATTCAAGGAATACCGGTATA
TTTTTTAAAACAAATACACACCCTTCTGATGTTATTAACATTGAACCATC
AGAAAACATACTTCCATGGATTCAGCTCTTTATTGTTATCTGATCTCCTC
ACCAGTTGATTTAATACATTAATCAGTGACTAATGCCTGCTCATGCATGA
CGTCACAATGAACACGGCAGCCGGTTCCGAACCTTACGCTAGCGTGCATA
GTCCAGTGGTTTGCGATCTTGCCTCTGGAACTAGAAGCCCCGGGTTCGAT
CCCGGCTGTGTCGCTCACCCGACATGCACGCTACCGGTAAAGATCGCAGT
CCTTAGGACGGGACGTTAAGCCGTGGTCCACTGTTCATTATGCTTGTCGA
AAAGAGCTAGGGGAATTTCCCCGGTACAATGAACCTGTAAATACTGAACA
TAGCGTCTGTCTTCTCTGTCACGACCAGTGGAAGAGTAGCTCATCTGTTC
ATTGAGTTCATTTGAGCTAGACTGGTTCGAGATCCCTTTCCTTTTCCTTT
CCTTTTACACAACGGCTTGCGAACATTATTTAATGAGCAAACAGTGCTTA
ATTATCGTGATAACATTCAATTAAAGGACATAACAATATATTTTGTTTGC
TTGTAAAAATAATGCTCTTTCTGAGCCGTTGTGCAAAGTTCTAAATCGGC
TGCCATGTTCGTTGTGACAACCATGAGTGGGCAAGTCACTGATTAATGTA
ATTAACTGGTGGGAAGAATCAAAAGCTGGAGGTATGATGTTTTGATGGTT
CGATGTTCAATAACATCCAAAGTGTGAATATTTTGTGAAAATTTCTATGT
TATTATACAATAGCATTTATGTTTTATGTAATTTCCGGAAATTCTTAATG
TTGATGTCATTGGTGTCTTATGCCCTTTAAAGAGGTATTATAGTTACTAA
TAGTATCTCAGCAATCAAAACATGAAATTAAAGTCACTGTTTTCAATCAT
TTTGGCATATTGTAGAATTTGGTGGGCAAAAACTACAAATATTCAGAATT
TGAAAAAGCTACATTCAGATTCACATTATTTTGTAACTTATTTCCAACAT
ATTCCCGTCATTTTGTCACATTTCCATCAGTAATAAACAACGAAAACGCA
AAATCTGGCTTATTTGCATATTACTTATCGGCCCCCATTTTATGATATGC
AAATAAGCCAACGTAGAACGCTAAGAAATAACCGAATCGACCGTTGCGGT
CGGAGATCGAGCGTCACAGTAAAATCACAAGTGAACAAACTTCGTGTGTT
CGGTGGTTAGTAGGAATGTTGGACGAAATGGCGGACAAGTCAAGTTTTTT
CAAGACGTTCGCACGACACTACAAAGTCGCATCCATACGTGATGAATATT
GCTGTGCAGTGTAATAAGGTACATTCAAATAATGATGTAGAAAAAATAAC
CAAAAACAGTGAATTTTGTTTTCTGTTCCTATCACAATATGCCCCTTTAA
ACTGCCTGCCTATTGCCTACATGCTCAGGCCAGAAACTGGCCCCTTGCTT
TCCAGGAGGAATTCCTCCAAGCAGTCCTGTCCCTTGCCCTACCCTCTGCT
TCCAGACTGTTTAAGTCCGTGTCCTTTAACCTACTTTACCATAAAAGTGC
TCTGATTGTGGTGATTTTCCTGTGACGCATGTTCTCCCACAAACCTTTGA
ACACCTCTGCAATGGTCGATTCTGGTATCTGACTTCTACGGCTGGCTTAT
TTCTGGTAGGATACCTTGAAATAGGGGGGGGGGGGTCGTGCGGCTTGCTT
TCGTGTTGTTTATTCACCATGGAAATCTGACAAAATGACTCGAGTTTTGT
AAATTAGTTACAAATGTGTTACTAATGTCGAGCTGAATAGAGACTGTAAA
ATTCAGAATAGTTGCAGTTTTGGCATATGTGCCTTTGAAGTGGAGCTAGA
AGACAAGTGACCATCTAGTAGGCTTTTTGGATGTAATGAGCGACCTACAT
GTTGTCACCTGTTATGTAATTAGTGTGTTGATTAAGTACAGTCATGTAGA
CCATATGGGAGGTGCGGCTTGCATAGATTAATAAGTGAGCCCTGATTGGT
GACAGCAATGATTGGTCAGGCAAGTTTGGCTTGGTTACGTGCTTGGATAA
TTAGTTAGGGCCAAGGCCTGGAATAGAGGCGAGTCAAGACGTGTGGATTC
TACTCTAGATTATTAGTTGTAATCCCAAGTCCAAAATGTATCATTCTGTA
CCATAAACTTAGCCTATCTGTAACTTATACTCAGTCTGTATAAACTATGT
AATGACCTGTGATAGCCGGCTGAGATGATGATAGCTGGTGTACAAGCTGA
TATAAAATGCCAGTTGAGGATATCACTAGCTGCACACATATGGGAATGTA
TTAGTTTCCAGGTCTGACCACGTTCTGACAAGAGTTGGACAGTACAGGCA
GGTCAATGATCCAGGTTGAGGCCGGTGTGTTATGCCAAATGGTAGTGACA
CTATCACTACCATTTGGCATAATTCATACTGGCCATATAGATACAGATAC
AATGTACAGATACAGAGGCAAACTACTGTAAATGCAGAAATGTTCACGGT
TTTCACGATGAGCTCTTTACCACGAACATTAAACCACCATGAAAAGCCGT
TTGATTGTGTGACTGTAGCGCTACTAATTGTTTCAAACGCAAACTCAAAA
CCACCACGAACACTCCATTTCTCCCTACCTCAAAATTAAATCCCTGTGAA
TATTTCTGAATTTACAATAATAAAAAGCAAAATAGAAACTGCCACAAAGC
AAAATATCTGAATGCAAAACCTGACAAGTCAGCATTATAGAATGTATCTG
CGTATCAAATCAAAGAATGTTTTTCGCAATTTGCAGTATGAAGTTCCGAA
TGGACTACCGTGTTTACGATGACGTGATGAGCCGGAAGTTGATTATCTGG
TGGCAGGAATCAAGAACTGGAAGTATGATTTGTAAGATTCGATGTTGAAT
TAACACAAAGACGACGACACATATTTTGAACAAAACATTCCTTAAACATA
GCCGGGTTTGCGGAAAAAGCTGGCTACCTACCAGGCCAGGCCACCAGGCC
AGTCTACCAGGCCTGTCTACCACATCAGGCTTTTCAGATACCCTATTCAT
ATCCCCACAAACTTTCATGAAGATGAGATACAAAACTCAGCAGATGCTTC
TGCAATCACTCTCCCATGGGGTCCACCATGCGGTGGGGCTGGCCCAGGCC
GTCCAGTCAGAGCTAGCCTGGAGTCGAGCCTTCTTAGCTCTAGTCCGCTA
CCCAAGCTCCGCTACATGCCAGCGTAGCAGTGTATTTGATTGTTTCAGCT
ATGACAGGCAATCAGTGAAGCAACATAAGTTGCTTCCTATATCTGCCCTG
ATGTGATAATCCTTAGATTTTTATATATTTACAAAGCATTGATCTACCCT
TCCATTTAGACCTAATGGGCCAGTCCACTGTAGAATACTACGTTTAATCA
GTAAATAGCTCTGTCTTAGGTCAAAAATTTGTGAATCTGGTCAATATTCA
AAGTGACTTTAGGGTCTAATAGATACTCTAGAATATCATTTTGTATGTTT
GTGGATATTTGTCATTAGTGTAGTCCTTTATATTGCACGTTTTCAAATTC
AAACAAAACTGACCCTGTGCCGGCCTGGCCTTGGTGGACCCCATCGGAGA
GATTGACAGCAGCATCTGCTGAGTTTTGCATTTTATCTTGGTGAAAGTTT
GTGGGGATATGAATGGGGTATCTGAGAAGCCTGACGTGGTAGACCCCTGG
TACCTAAGGGACCTCACTATGTGGATTTAATCACAAGAAATACACACTCC
TGATTGGCTGAGGAAAGAGGGTCATGCTCTAACCATGAATGCAGGACCTG
CATAGCTGACATCAGCTTTTCAATTCTAATCATGCACAGAACTTGAAGTA
CCTGTTGTTACACTGTCTCATATTGATAATGTCAAAGTGTCATGAAGTAA
TCTTTGTTTGATTTTTATTTTAGAAGCATGTTATAATATCTATTTGCTTT
CACTTTTCACAAATGTGAAGACAACTAATGTATGAAAGCAAATTAAAATC
ATCTACATATCCTTCCTGATTTAGTTTTGAGTCGTACAACACTTTTCTGT
AAGCATATAGCTAAGATAAACCATTTATCAATAGTCGGCCATATAAATCA
ATGAAGAAACTCTCCAGTTTGCAATCCACTTTTTGTTAGGAGTCTGTTAT
CCACTGACGTGTACTAGATGGATTGTAATGATATGTGGGTAGGTGTTGTG
AGGAGAAAGGTCAAGGTCGATTTTGGGCCCCCCTGGTATGTGTCACTGGA
ACAGCAATGGCGTATTTGTAAAAATATTCTAAGGAGAATATTATTACTGA
AGAAAAGAACGATAGATTTAGGTGCAAGGAAAGATAGACACACCTGTTGC
AAGGTCTTGGTTTAATCTCAGGACAGTGGAACATTTATACAAAGAGCTGA
TGGATATATATGGGTAGTAAGGTGGTGATGATAATCTAAAGTTTCATTGT
TGCAACTGATTCCAAAGCCTGTCACTATTCGGTTGTTATTGCTGTAGCAG
CACCTGCTATAAAACATCATATATATAAAAACAAATTTCATGGAGATTTT
GGGTCTTCAGACTCTTGTTTATCAAGAGATGTCGAAAATATTTCCGATAA
GTAGACAGAGTTTTGTTGATGCTAATTGTGTCGTTTTTTCGTTACGACTT
TGTTAGTAGGCCTAGTGCCGCAGCATTTAGTGCATTCAGCCCATTTCCCA
AATCTGGCTGTTTACTTAAATTCACCACCGACTTCTGAAGAGAGCAAAAG
TACAAAAGTGTGCTATTAGTTAGGGCACACTGGCACAAAATTAGAAGGTA
CATTCACGAAAACATCTCACAGTGTTTGCACCTCGAAACGCAGAGCATGA
AGGGCTCATGAACAGTATGAATACAAAAATTCCTATCCAAGTATGTTCTT
TACATGAATGACTGTTCAAAATGCATTCATCAAAACCACTCTTTAGCTAC
TATATATAGTGATGGAGTGCTGTGAGTTGGAGGGTGTGAAAAGGTGTGCT
ATGACAGGGCAGCCTCCGTTATAATCCTGAGGACAGCCACAGTAGTTCAG
GCGAAGCATTGGTGCATTTGTTGGAACAAATTTCGGCCATCTACACTTTG
TTCGCCAATGAACTTTCTTCTTTTGCAAGTATCCAAAACATATGTGGATG
GATTCCAAAACCTACACTCAATTATTGTAACATAGTAGTCTGGGTACCCT
CCTCTCATAAGTTTTCCACTGGCTCATTCTTTTTGCTTGCTAACCACGGT
GGTATTGAAAAGACTGAGCCAGCGGTAAACTACAGAGGATGTCATGATCA
CCAACTGACTACATAGTGCAGCAGATTGTAACACAATGGAACAAAGTTGA
ACATCCTTCATCAAGAATTCAAGATTAATATTGTGATATAGACATTGTAC
AAAATCTATTTACACAGTTCTACATGATTGTACATGATTGTACATTGCAA
TGGTGTTACTGAAATGTTGTTCCTGTCCAGTATTCTGTTTAATNTTCTGT
TCAGTATTCTGTTTAATTGTTGACATCGTCTGTAGGCTGTGAAATCCTGG
TGATGTTTATGCTTGTATGATGTGGAGGTGCTGAGTCCTGTCTGATGCAG
GGTCCCTCAGTGGTGTCAGATGAGGATGAGCCGATGCCAGGGTTGAAGTA
CAGATTCTTAGTCAACATATTGACAGGTGCTGGCATCTGCCGGTATGACA
TTGAGGCACCTGTTCTTTGGCTCACTTCATGGTTGACCTGAAGAACATGC
AAGTTTGTCGTAGTTCACAAGAAGCCATTTATTTAGTGTTAATCTGCATG
TAGGCTTTGGCTGACAATAGAGGACCTGAATAGTAATATTGTTGCATACA
TGTGTCCCATTTTTAACCAGCTTGCTCCTCAATTTGGCAATGGTGTTATA
CATGGCAAGAAATTGGACATACAAATGTAGAATTACAAGGTACATGTACA
TTTTAGAATCTTTCAGAAAATCTTACATCAAATAAAATTGTACCCAAGAA
TTTTCTGTACAAATACTTCGTGTTATAAAAATATCTTAGATACAACATCT
GGATATAGATGTTGCTTGAATAATATATTATTCAAGCAACATCTATATCC
GTTCTTACAACTGTACTTGGATCACATCAATTATGTTCGGCAACTACGTT
CCCTGATTCCCTTTTTTTAAGATGTTATAAAAGCATGGCTATCCTTGCAA
TACAAACCTCCCGAAGCTTATCAAGAAATACAAGGAGAAATTATATGGTG
TAATTCTAACATTTTAATCGATGGTAAGCCAGTACTGTGGGAACGCCCGA
TATCATGTGGAATTATTTATGTTAATGATCTATTTATTGAGGCAAAACTG
GACGATTTTTACCATATGATAACATGTTGTCAAAATTTGGTAAAGTTTTT
GGCATAATAGAATGCTTTAGCAACTGACTTTTAATGTCTTGGCACCCCAG
GCAGTGTAACATTATGATGATGTTATACCACTCGCTTTGTAAGATTTGCT
GTAAGATTCCTAAATGTGCCTTGTTTTTTTAAGTCCAATTCTTGGCCACT
ACTGAATGGTGTCATTTCTCCTGTTTTGATCCAAAATAATTACTTAGTCT
TGTTATAGTTTGTTCATCATCATCATCATCATCATCATATCTATTACTCC
AAAGAGTTGAAGCATACACAAAGTTTTTAATTGATTGTTGTGTGATGTAG
TCGATCCAGGTACTGATGCAGAGGTCATGATAAGGAAATGTGAATACAGA
GGAAAAATGCCCTAACATGAAGAATGGCAAAGATTCCCTCTTTTGTCAGA
TTGCTGCCATTTCAAGTACTAAGTAAAATGACTTCAAGACCCAAATACCA
TAAATTTTGGCTATTATTAAACATCAACTGTTATTGTCCTAATTCCGCCG
TGTATCCCATGACTTTCATTTCAAGAGATCTAATAAATACAGCATCCGAG
TATTCCCCGAGGTGTGCACACTTCACATATCCAGGTGTTCAAGACATTCT
TGAGAAGGCCTCTATAAGACCTGATTATGATTTTTCTAATGGGGCGATTT
TAGTGTACTTGGCAGAATTTTGAGAGTTGACAATGCACATTCTTAAGTAC
CTTATGAAATGGCAGCCGAGCTGGAGTTGTAATATCAGTGCTG Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000458:107348..121540+ >transcript:BL72785_cuf3 ID=transcript:BL72785_cuf3|Name=transcript:BL72785_cuf3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1776bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000458:107348..121540+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TCTATCTCCCTTGGAACAGCCTACGTCACTTCAAGCTGCATGTGAAGGAG
ATAAGAGAAGGACAGGATCAGTGGTGCCAGAGGGAAGTCCTCGGGGTGGC
GTGACCTTGGGACTGCAGCCGTCCTCTCTGCAGTTCTTTCACAAGGTTTC
CCAGGGTCCGTCAGTCTACCCGATGGTGACAACTCCCCGGGGACATGCCC
TCATCGTCAACAACTCAGTATTTGATGGAGACCTCTCGGACAGAAAGGGT
GCTGATGTTGATGTACGAATCACTGACAACCTGTTGACAAGCCTGGGTTT
CACTGTGAAGCAGCTTCTGAACAAAAGTGCACAGCAAACGTTGATCGGGG
AACAGTTTCTCCAAGAGATGTTCCGGATGCAGGGGGGGTTCTGACTCCTG
GGTATCGAAGGTGATCTAAAACAGTTACAAATAGATGACAAACTTCTATC
TCCCTTGGAACAGCCTACGTCACTTCAAGCTGCATGTGAAGGAGATAAGA
GAAGGACAGGATCAGTGGTGCCAGAGGGAAGTCCTCGGGGTGGCGTGACC
TTGGGACTGCAGCCGTCCTCTCTGCAGTTCTTTCACAAGGTTTCCCAGGG
TCCGTCAGTCTACCCGATGGTGACAACTCCCCGGGGACATGCCCTCATCG
TCAACAACTCAGTATTTGATGGAGACCTCTCGGACAGAAAGGGTGCTGAT
GTTGATGTACGAATCACTGACAACCTGTTGACAAGCCTGGGTTTCACTGT
GAAGCAGCTTCTGAACAAAAGTGCACAGCAAACGTTGATCGGGGAACAGT
TTCTCCAAGAGATGTTCCGGATGCAGGGGGGGTTCTGACTCCTGGGTATC
GAAGGTGATCTAAAACAGTTACAAATAGATGACAAACTTCTATCTCCCTT
GGAACAGCCTACGTCACTTCAAGCTGCATGTGAAGGAGATAAGAGAAGGA
CAGGATCAGTGGTGCCAGAGGGAAGTCCTCGGGGTGGCGTGACCTTGGGA
CTGCAGCCGTCCTCTCTGCAGTTCTTTCACAAGGTTTCCCAGGGTCCGTC
AGTCTACCCGATGGTGACAACTCCCCGGGGACATGCCCTCATCGTCAACA
ACTCAGTATTTGATGGAGACCTCTCGGACAGAAAGGGTGCTGATGTTGAT
GTACGAATCACTGACAACCTGTTGACAAGCCTGGGTTTCACTGTGAAGCA
GCTTCTGAACAAAAGTGCACAGCAAACGTTGATCGGGGAACAGTTTCTCC
AAGAGATGTTCCGGATGCAGGGGGGGTTCTGACTCCTGGGTATCGAAGGT
GATCTAAAACAGTTACAAATAGATGACAAACTTCTATCTCCCTTGGAACA
GCCTACGTCACTTCAAGCTGCATGTGAAGGAGATAAGAGAAGGACAGGAT
CAGTGGTGCCAGAGGGAAGTCCTCGGGGTGGCGTGACCTTGGGACTGCAG
CCGTCCTCTCTGCAGTTCTTTCACAAGGTTTCCCAGGGTCCGTCAGTCTA
CCCGATGGTGACAACTCCCCGGGGACATGCCCTCATCGTCAACAACTCAG
TATTTGATGGAGACCTCTCGGACAGAAAGGGTGCTGATGTTGATGTACGA
ATCACTGACAACCTGTTGACAAGCCTGGGTTTCACTGTGAAGCAGCTTCT
GAACAAAAGTGCACAGCAAACGTTGATCGGGGAACAGTTTCTCCAAGAGA
TGTTCCGGATGCAGGGGGGGTTCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000458 | genome | Sc0000458:107348..121540 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL72785_cuf3 |
| Biotype | protein_coding |
|
