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Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL72677_cuf0 >transcript:BL72677_cuf0-protein ID=transcript:BL72677_cuf0-protein|Name=transcript:BL72677_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=630bp
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IYSVQDRAFSALNGLKTLNLRDNRIVFVTWNTFTSLENLRELRLGRNPIM
CLGTNTFAYLPLLESLDLGELFRLNAISKGAFSRLSRLLYLNISGSNLTE
VPFLGYLHSLEELDISHNVIRAITGNDFQSVSTLRKLLLSNNGLSVIEKY
AFDPLKFVYKLDLSDNNLRGLHRGMFKRMDSLAKVNLKRNPWKCTCKLAW
LAKWLREHIHNESQRVCGACKSPRKLRGQYLCSVPLSNLTCEETPTGSAS
VSTNVTSDAEHKSRCIQGHVPSSSVVSSNGTTIVKGSFRVRMALSRDQPQ
GSDPNGSDSVPIVYRCPTENSAETEEFAKISGIILPVTPTRKPLGTDTLP
EDFDVKMCAKMYGFNIDATKESPIQGDETIPNAFEHEHVFTTKAYSEPTT
NSEYASQDEQRTSKNTEYIVGATVCFIVLGILIWGSFFLLIRCKRTKNRK
FKSRRCKTASCWCHLPRRPSKVDEENQVDMPDVNVPEVQSEETFNDLKSS
KKTDLYTLPTLRIKSTNLYIISGAQDVTYL Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000151:102794..115267+ Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL72677_cuf0 ID=transcript:BL72677_cuf0|Name=transcript:BL72677_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=12474bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000151:102794..115267+ (Branchiostoma lanceolatum)
GAAGGTTTATAGCTGAGTAAGGATACGGCAGCGTTCTGTAACGTCAGGAG
AGCTAGCGCGCTAAGCTACGGATGGTCGTTTGATTGCGAGGAAGGAATAA
AAGCCGTTGCTAGCAGTGAATGAACAGGGTCGACGAGGTAAGCTACTATA
ACGTATACAAGTAAAATATCATGTTCCCTCTGTCGTATGTGTATAGTTAA
TATACGTATTGTGGCTAATGTTTTATGCCGTATATCATACCAAGTATCCA
GTATAAGCATATCGCTTGGATACAACGTCAAGGTTTATTTCCATGTGTAT
GTACGAGGTAAAAATATATATTGTACAATATGGTATTATGGATGTTTCCG
TGGAATGTCAACGTTGGAACTATTAGATTCATTTGGTAGGCTCCCATGGC
GGCCTCAGTTCGTAACGTTATGCCAACTCATTTGATGTATATGTATGGCT
TACTTACTTGGTCAGGAATTCACTGATAAGAAAATACTGTACGATACTAG
AGTCAGAATGAAGAAAACTTCATTTTTCCTGTAGTGTGTTGTCTTTGTGT
ATTGTACTAAAATAAAGCAAGTATCTAATGTATGCAAACCACTAGATGCA
TATCCTTATGAGGTATCGAGTATTTTAGAATTGTTTCTGTAGTGGTAGTC
ATTCAATTTTTAAATTGCACTTTATAATTTACAGATTTGGCGTTACAGTT
TGTTTATCTGGTCCATTGATGTCTTCACTGTAAACAGATATTGAACCGTG
TAAACGCCACAAGACTGTTTGTGCGATAGTTATACATGGAAATACGCCAG
AAATAGTTACTCAAGCAACTAGATAAGATTTGAAACAGTCAGACTAAGGA
CAGATCTGGTAGAACTAGGTTTTTATACCAAACCTCTGAATAGATATGTT
AATGAAGTTAAGACAGTTTCAGATAGTTCAATAGAATAGCAAGTTAAGAA
AATGTTGTATGCTAATGAAGCAATTAGTTCCTGTTGTTTTAGGAGCTAAT
GTTGCTCGTCGGGGGGGGGGTGTCCCAAGTGCCTGAACATACATAGAAAT
CCTCTTTTTTTTTCCAAAAAAAAACGGTGATGAATATGATGCTAATCTCA
CAAGTGTCTGTAAAAACATAACATCTTAAAAATAGGGTTATGTTGCCACA
GGCAATGACATAAACACTCTTACACTATATTCGAATCACAACCGTTTTAG
ACTGTTTATATTTTGATGTCTTTTCATTCATGCTTTAACTACTATGGCAT
TGTATTCAAATTATGAAGTCACGGGTTACACAGAACCACGATAGTTTGCA
GCGATTTCGCAGCGCCATGTTGTGCAATGGGGACACAAGCTTGTTCATCG
TGTGTTCAAAAAAAATACAATTACTTTTAGCGGTGAGAATGCATCTCCAC
AAAGATGCTTCTCGAAATCGGATTTCCTTTATCTTGAGTAGAATATCTTT
CCAGAGTGTGGGTGTGTGACAGGTATCTGTTTACCAGACGTCGCACCGCA
GCAGTCTCTTTTAGTGTTCAGGCATCCATCAAGATTTACCAAGACAAAAA
TTGGCATAGTAGAAAGGCAGGTTGTTTACCAGAACTTTTAAAAATGGTCT
TATGCTTCTCTTGAAAGGATACGCCGCGCCGACTGAAATTGATTCACATC
CTTCAATCTTCTTTACGGAAGTAAAATCCCCCAAGAGCAGATGTGCATAC
ATGTCGGTAGGTCCACACCAAGACTAAGTGTTCCGTCACAAACGAGTGGG
TGGTTTATCAGTGTACGTTGGGAATGATGGCAGTGGTTAGGGCAGACGTG
GTGTGTTTGCAATTCACGGCAAGAGCTCTTTTTTCCGAAATACAGTCAGA
AAGTGATACAAAACATGGGCGTGCGAACACAAACACACACAAAGATACAC
ACAGACACAAATAAATAAATATCTGCATGCATGCATAAAAACATACATAC
ATACAGCCACACGCAGGCACATCTATTTTTATTTTATCCATTGGTTCAGC
ATGTACATGCCAGGGTTTCCCAACTAGCCGGAGGCTATCATTACTAAGGG
CGAACCCATGTGCGGTTTTAAAGCGGGAAGGGTTTGGTACCACTCACACC
GGGAAGGACCCCAACTCTTTTCGATAAGTGCCGTGGGTTCTTTAACGTGC
TCGAGGTGTGGCTCCCCTCCAACACGGAACCTCCATTTAACGTCCTATCC
GAGGGGCTTCCTTAACCGAAGCTAGGTACTCATTTACACCTGAGTGAAGT
GAGGAAAGTCGCTTAGAGTGCTTTTCCCAAGGGCACAACATCAGGGCATA
TCGGTGGTTTCGAACCAAGGACCTCTCGGTTGTGGGCGAAGCACCCTACC
GATTGCGCCACACGATGCCACATTTAACATGCATGCACGCGCGCACACAA
ACAGAAACTGACATAAACATTGTTTTGTTTTGTACTGGTGGTGTCTCCGT
GATTATCAGCCCCCGTCATTATGCCTGTTCACGCAGATTCTCGCGATGCT
TCCCGCCATTGGCTGCCCGGATCCAACATTTCGTTGGAAAATTGGAAATT
ATTGAATTCAAGGCTTGTGGAAAAGATGCGTTTTTCTCAACTCGTTTTCT
TACTGGAAAAGAATAATCAATTTGTCAGCGTCTTTTCAGTGAGTTAATCT
GTCACCTCCGAAATGGTATACTAAGTGATAGATGAAAGATAGGATGACAG
ACATGGCAGAGTTATAATGACTTTTTTTAATATCAGCATGATGGTTATTT
TTTCTCCCTACGGGGGTACGGATCGCAGATTTCGGCAAAAAAGGTCAATC
ATCGGCCAGGAGATTCAGTCCATGGGAAGCTTCATTATTCTCCTAATAGC
CAGGGTAGTCAATTCTATATAGAGTCTAGATATGAACGTACGTGGGTGCA
TGTGTGAAAGCAACGAATTGAAGAAACGTATAATTGGTATCGAAGACAAA
TTAGCGTCGACTGGCTCCTAATTTCTACTGAATTAATTCGGATTCCGATG
TAAACATAAGCCTAGTAATACTCGCAACAGTCAGCAAAAAAAGATCCATA
ATCAATTACCAGGTGTACTCTTAACTTTTAAGTCTTCTCGTTTGTTTCTT
TCCTGTATGCTTAATTAACCATAATAACATGACATGACTGATCAGCCAAG
GATTGATGTGTTCAGAAATTGGGATTTTCCGAGAACCATAGTAAAATAGA
ACTAGTTTTCATCAAGTACTGTAGGAGCATCTTCACTAAATAGCTTTAAA
GACAGTTTGGTGTAATATAGCCAGCTGCTGCCAAGCCGCGTGCCTGCAAA
GTTGGTGTGTTACGCCTAACGGCGGTTTTACCGGCTATATAGATACTGAC
AGATACAGACGTTTGGACAAGGCAAATTGTGAAGGTCTGCTACATGTGTT
TGTAATCTCCACTGGTGAGAACATTTGTATTCCTCTTTGGCGTTCTCGGA
TGAAGTGCCACACGCGCGCCCTTGATAAGCTACAGGCCCTGTTGGTACAC
TTACACCACACCTCATTCTTCTTTCTTGAGCAACTCACTTTGAACTACAT
TCCTTTTTGTACTGGAGATGTAATCTGTTCACACTGCGGCACTAAGGGGG
TTCTTCACACCAACATGTTTCTTCAAGCAAATCAAGTGATATGTGATTAC
TTGCATTAACGATTGTATTTGACACATTTCTCGACAAATGTGCCTTACTA
TTCAAAGTGAGCTAATGCATAGTCTAAGGAAAAGTACGGTCTGTAATACT
ACATATGAATTAGTTGTATATCCGTTGCAATTATTGGTGTCATGTGTATT
TGACTATTAATATATATCGCCTAACGCTGGACATCTTGAGTCGATATTTC
AGCGCTTGACAATCCTTACGCCTTTATCTTTAACATGCTATATTCTAAAT
ATTGTATCTAAAACGAGTATACGGTTGTGTGCGGTTTAAGGATTATATCG
ACCGTTAGGAAGTAATATTCTCTATGCAATTATTCTTTAAAATTTCAACC
ATGCACTGTCTATGTAACGCCGTTTCTGCGACAATATCGTTCGAGCGAAA
TATCATTCCCAACTAGTAGTTTTTTTAAAATTCTATCAGACTGTAACGTC
GCTTTTTAACTAGTACTTAAAGTTTTGATTGGTTGGAAAATGTTCTTTAA
TGTATCAGTAAAGAGCTTTGCTGAAAGACGATTCATCCTCTATAGATCCT
TTAAGTTAATGGACTTAAGGGCGTCCCAAAGGTCAAAGGATTTCCAATTC
TTTTTCTTTATTACTTCCGTTGGGACAGCACAATTTCTTATTGATTGATG
TTTGTCGATTCCAATTACTGTTTCTGCCTTCTTTTTTTTTTTCAATTCAC
GCATTCTGAATTCAAAGTCCAATTCCCAGTAGAAGGGGATTGCAGAGCAA
CAGTACGACGATCAAATATTGAATTGTTTCCCCCTGATTTTATACATGAC
AAATGTCAGAGGGCGGTCTCAGACATTAAGAAATTTTCATAATTGTGTTA
ATTCTATATGGATCAGTCTTGAGTTAGAATTTAAACTTAGAAAATGTCAT
TCGACTGTTGCAAACGAGGAAGCTTATGCAGGCAGAGAAACGTGATTCTC
GCAGTGTTCATGCAGGCAACTATTGGCTCTGCACGGCTGCACCCATATTG
GGTCGCCCACAGACCACTGCAAATTGTTAATGTCTATTGGACAAAACTCA
CGCCCATGATAAACAATCGTAAAAGCTTCAAGTCATATTGGGTTATTGTC
GGTTATACCAAATCCGTGTCTGCGGCTGCTAAATCTGTACGCAGAGGTGT
CCAGAAGTACCTTTACGCTTTGATATTTTTCATCTCTCTGAATCCCGAGG
CTTTCCCTACCCGTAGGTTACTAACGACATTAATAAAGGTTTCAAAATGA
ACTGAATACGTGCAGGCTGATACAATACAATACAATACTTGATATGTATG
CCACAGAACCTACAGTTTTCTAATATTTCTCTCTTCCTGAGAAACATTGT
TTCCCTACACTTAGGTAACGTTAAGAGTAGGTGAACATTGTTTGAAATAG
CAATCTGTTGATAGATATAAAAAAGGATACAAGAAACGATTATATATACA
GAATAAAAGAAAGAGATTGATAGAACCAGTAATATCAGACGAGACTTGAT
ATGTTACATGTAATTTGCGTAAAACAGTCTGATTGGCATGTACTATATGC
TTTCAGATACGCCGTTTTGAAGTGAAAATGAGCTATGGTCTTTGCTTGTA
ATGTTCCCTATATGAACTCAATTATGATAATAGATAAAGAATAGGCTTGA
GCGTCCCGGTAGTAAAGTACCTTTCAACACAATCCCAGCAGTCGGCAGCC
CCTTATCAGCAATTTGTCTCTAGTATCCCCCGCCGACTCATTAATGAGCA
GTTTACAGCAGCTGACGCAGTGCTTGGAACATCAACACAGGAAACAAGTC
ATTTATTCTGCCAAGATGGTAGTTTTGTTAGCTTAATTATTAATGTGCCT
GCGGATCTTGTGTACATGTTATTGTGTGTTGTAAATATTGGATGATCGTA
TGTTATTGTAATCTATACGACCATCCATACAATTACATGACGACATGACG
CGCAGACACACTTCTAATTAAACTAAAACAAAACTACCATTTTGGCAGAA
TAAAGTTTTGTGTTGTCTCTTGAAAGTTGCATATGATCACAGAAAGTAAC
GCAGTTTTTGCCAAAAAGACATTTTTTTGTGCTTTTTGTTTACAGCTGTT
TCAGTCAGTTTTGCATTTGATAGTAGAGGAAGCAGCCTTGTTTTGACAAA
GAAGACATTTTTTATTTATTTCGTCAGGTTTGTATAATGGTTCAGAGAGC
AAGTCAACTATCTGCCAAAAATAGAGGACTCAAAATATGTTACTTCGATG
AAGGTTAGAGATAAAGAAAATAAGATACCCAAGGTAACAGTTATTCAATG
ACATGCAACTGAATAGTTTTTCAATAATAATAACCTTTATTGCACATCCA
CGCCGTATCACGGACTAAGTACAGGCATATAGATACAAAGAACATGTAAA
CGTTCATATGATGACACTGACAGGATTTCTTATACTAATCTAAAATAATT
GTTCTATAACTACTCTAATGCATAGGTTCGGCTTCTTCTCATTTCTTTGT
GATGTTAGTAAAATAAGTTGAGATGGACTTGTATGATATCATATGGTCAA
AACTCATAAAGGGTCAGACGTTTTAGGTAGCATTCATTACCTTTTGTCAG
TGGCTGATGACGTTGTTAGCTTACTAGCTTACAACTATATCGGTTGTAAA
TTGAAACCTAGAGTTAAGTATTTGTGCTACACATACTTCAGGTTTGCTAT
GTTAGTTTTGCGATTACGGGATCTTTTTGAATTTTTTTTTTGTATTGAAT
TTTTCTTACGCTAAAACGCTAGCGACCCCCAAAAAACACCCCTCCCAATA
AAAGTGACATCACAATTCAAGATGGCGGCCACCACACATGTCAACGGATC
CAACAAAGGTTTTGCTACGCAAACCTTTAACAGAAAAGTAGTCAGCTCTG
CTCACTTACCCTTCAAAGACAGTCTCGATACACCACTATTATGACTAGAT
TGAACTAGCAGAACTAACTAGTACTAACATACAATAAACTAAAAAAACAT
CCCTGTAGTAGAATTTAGATTATAAATTAGTATCATTTACATGGATGTCT
AACCTTCATAAACGTATGTGGAAACTATATTCACGTTCTAAATTGCATCT
GAACCCCAGTTTTCATAATAGCATTTCAAATATTTCAAAGTGATACATTG
GGTCTACTACTCAGGATTATTTTATGTTTTATTACCATAATGCGATTACG
ACGAACAATTAATTTTTACCGTATTACTAGTTTACTGCCTTCAACGGGAT
GACTTGGTAATACACATAAAACATAGCAAATGTTCCTTCACAGCAAGTAT
TATTACATTTTCAAAACGTAACATGAACTTTGGTATTACCGGAGAAAGGC
TTTCTTTGACTCTTAAGGCGAAGATTAAAGCATTACTTTGAGTGTTCTTA
TAAAAACGAAGGCATGAAGAAAGGATCTTGATAAAGAATCAAATACGGGT
GTTGTGTAATGAATAGTATGCATTCCCGGGGGCGACTGAAAGGCACTTCG
GCTTTTAACTGACAATACTCCCAGTTCTGGTAAGGTTAAATTTTTTAAAC
AATCAAAGCATTGAAGATCTATACTATGAAACTCAGACAAGTTAAAACAA
CAAGATGTAGAACTAGCCGATACAGAAACGGCTATTCCGTTCTTTTTTTT
TTAAATATCTTAAACACGCAAAGCTGAACACTAACTGAAGTACAAAGCTT
CCGCGATTATCATATGTTCGATCCTAAGCTTTATCCATTGTAATTATACA
AATCTGATTTTAATTCCATGTGCGGTATTTACGGTAACTTGTACGCAAGG
TATCCTATGATTCTATCATTCATACGTGATTTATCTTTCTTCTCTTTTCT
ATGAAACAACATGAACGGTCGCATTAGGAGAAATGTGCAGAAATCGGTTA
TTCTACCCAACGCTCTATTCTACCCTGGAGATAATGCGGAATTTCAGGAT
TTCAATAAATAATATCTACACAAATCAAATAACTCGTTTATTAAATGATT
GTCTTGAGAAATCAACTTCTGAACTCTGGATTGCCGGCTCTGTGCATCTA
GCAGATACGGCCAAATCTGCCAACAATTGTCGCCTTACTTATTGTCGAAC
ATTTATCATGGACTTCATGCTGATTGACGTCATCGGCAATAGTTCTGCAC
CAATGTGCAGCCTTAAATAACTACCAGCCGCTGAATACAGCCTCGTCTAT
TTCAATTAAGATTGTCCTGATTTGATATAATCAAGTATCCATGAAAACTA
TGGGTTTATGTAGCTTCAGTCCCGTCGTTTGTGTGACAGAGGCCTAACTT
TTTGCAATGATGTTGGGAACCTAATAGACCGCTGAAGATTGTATCCTGCT
TTCATAATTTAGTTTTATTGTCATGACAGAAAAGAGTGAACGTGTATGGG
TGAATCATATTTATTGCACAACAATTTCATCAGTGACGAATATATGGCAA
TTTACAGACAACAAAGGTAACATTCCATTTTTATAAAATAATATTTCTAG
TTATTGTAAAACTATATAATTCCAGTATGATCTACGGCAATTGCAACATG
GAACTAATATAGACTTAGAGTCGCGTGTTTCTAGGCGTGTTGTATAGGTA
ATAATGTATAGCAATTTACAGGTAAGGTAGTAACAATCTAGTTCTATCTA
AGAATATTTTCAATTACCATAAAGTTAAATCAAGTGCAATCTACGGTAAT
TATCACATGGCACTATAGCTAATGAAGATATTGTGTAGCGTGTTTCTAGG
CCGATTTGCGACTTAACATTTGTCAGTTCAGAAACTGTGTGTGTGTGTGT
GGTTTGGGGGGGGGGAGTGATATTGTTAATAATCTGGGTCCCACATGGCT
GACAAATGAATACTGAGTCGAGTCAGTCAAGGGATTCAAAGTCTGACCCG
TGCGTGCGTTGAGTGTTCTGGGAAGCATGGAGAGTGCTGTGGTTACTACG
TGAGCTAGGTGAACAGTCCTGTTCACATTGATAAGTCTGACTAATGTAAG
GCAGGACTGCTCACATAGTTCACGTAGTTATCACTAGCCTAGAAACCATC
AGTCGGTTTCCCTACGGTGCTGGGATTGATGACGCCCGTCCAGATGGATT
AGCCCACCCGGGACCACTGACTTCATGTCCAGCCAGTCAGAAGGTAGATA
TATGATAGGGGTCACCGCAGTCAAATGAGAAAATAGGTATTGAGTGCATT
TCCAAGGGAACATCATAGGAGTTTGCTAGGGATTCGAATCTAGAACATTT
TAGTTATATTGATCAGCAACTCTAGGCATAAGACCATATTGCTTTTTTTT
TTATTTGACAAGTCGGCTACAGCTCCTTTCTTCATTTATTGGAAGTATGG
CCTTGTGATGTCAGATTGCCTTCGGGCTCCAATAAGATACGTTTTATGAT
ACACTTTAAGCCCCAGTTCATCACTAATGACATCCTGTTTCCCTTTTAGA
CACGGCGACTCCAGCCTGAGCCACTCCACAACCTATTGAAAAAGTGTTGG
ATACATTCTGCCAGAAGACAAATGTGCTGGACAGCTTTGTCATGAAAAAT
GACGTTCAGGTCGATTACATCCGCACAAAGCTGTCCCTAAGGGCGCAATA
AAGAGCGGCTGTGTGCAAAGCTGATGGAGGTTCCCACAGCTTCTGATTGT
ATCTATGTGATGCGAGCCGTTATCTCCACAATCACGCGTCCAGGCGTTAC
AGATCTTCATAATAAATCCATCAAGGACGTATGACGCGGGGCGTAAGTAA
CAAATCGGTACCGCTATGCGATTCAGGAAAAACTCACATCCCTTAAATGT
TAAACAGCCTGAGAACCTGACGGCGGTGTGGTTGGTAAAGGTACGGAGGA
TACCAGCCTCGTTTCCAATATCGCAGCCTTCATTTTTCAGCGGATCTGAA
GACTTTACAAAAGACCGGCGGCTGTGGTTGAATCGTGTTCACGTCTTCGT
GGCCGGGAGTCAATTATGCGACGAAGAAAAGAGTCAACGACATCAATAAT
GACGCCCTGCTTTTCCCGAAGCTTCTGGACCTTGTTGTTTACGATAAATA
CAGTTCAAGTGAATGCCCACCCTTGCTCTGTATGTGTTTGTCGTCTTTCC
CCGGAACGCGTCTTTTGCGAAGACCTCGGTCTGACAGAAATACCTGAGGA
TATACCGGTAAACACCAAAGTACTGAGGATACACGGGAATAACATTTCGA
ATGTACAATATGGACAGTTCCTAAACTTCCCTGCCATGGTAGACTTGGAT
TTAAGCAAAAACTTCATATACAGTGTTCAAGATAGAGCTTTCTCTGCTCT
CAATGGACTGAAGACCCTCAATCTACGAGACAACAGAATCGTCTTTGTCA
CGTGGAATACCTTCACAAGTCTGGAAAATTTACGCGAGTTGCGATTAGGA
AGAAACCCCATCATGTGCCTGGGAACGAACACGTTTGCGTACCTCCCTCT
TCTGGAATCTCTTGATCTCGGGGAGTTGTTTCGTCTGAATGCTATTTCCA
AAGGAGCATTTAGCCGCTTATCCAGATTGCTTTACTTGAACATTAGTGGA
TCAAACCTGACAGAAGTGCCTTTCCTGGGCTATCTGCACAGTCTGGAGGA
GCTAGACATTTCCCACAACGTTATAAGAGCAATTACTGGAAATGATTTTC
AAAGTGTTTCGACATTGAGGAAATTGCTTCTATCAAACAACGGGCTCTCT
GTGATAGAGAAATATGCGTTTGACCCTCTCAAGTTCGTGTACAAGTTGGA
CTTATCGGACAACAACTTGCGAGGATTGCACAGAGGCATGTTTAAGCGGA
TGGATTCCTTAGCAAAAGTCAACTTGAAAAGAAATCCGTGGAAATGCACG
TGTAAATTGGCATGGCTGGCCAAATGGCTGCGAGAACATATTCACAATGA
GTCTCAAAGGGTGTGCGGAGCTTGCAAATCGCCGAGAAAATTACGTGGCC
AATATCTGTGCAGCGTTCCGCTCAGCAACCTGACGTGTGAAGAAACTCCC
ACCGGCAGTGCGTCGGTCTCTACAAATGTCACCTCTGATGCAGAACACAA
ATCACGGTGTATTCAAGGACACGTTCCAAGTTCAAGTGTGGTTTCTAGCA
ACGGAACGACGATAGTCAAGGGTTCGTTCAGAGTTCGGATGGCTCTTTCG
AGGGACCAGCCGCAGGGATCCGACCCGAACGGTTCTGATTCCGTACCGAT
CGTGTACAGGTGCCCAACGGAAAACTCGGCAGAAACCGAGGAATTTGCAA
AGATATCCGGCATTATTCTGCCCGTGACACCTACACGGAAGCCACTAGGC
ACTGACACCTTACCAGAGGATTTTGACGTGAAAATGTGCGCGAAAATGTA
TGGCTTTAATATAGACGCCACCAAAGAATCTCCAATACAAGGCGACGAGA
CCATTCCCAATGCGTTTGAACACGAACACGTCTTCACCACAAAAGCATAC
TCCGAGCCAACGACAAACTCTGAATATGCTTCTCAAGACGAACAGAGAAC
TAGCAAGAACACGGAATACATTGTTGGGGCTACAGTCTGCTTTATTGTTC
TTGGTATATTGATTTGGGGATCGTTTTTTCTACTCATAAGGTGCAAGAGA
ACGAAAAATAGAAAGTTTAAGAGTAGACGATGTAAAACAGCATCTTGCTG
GTGCCATCTCCCCAGACGTCCGAGCAAAGTTGACGAGGAGAACCAGGTAG
ATATGCCAGACGTGAACGTTCCTGAAGTTCAATCTGAAGAGACCTTTAAC
GATCTTAAGTCTTCGAAAAAAACAGATCTATACACTCTTCCGACTCTTAG
AATTAAAAGTACTAATTTGTATATTATCAGCGGTGCACAGGATGTAACAT
ATCTATAATATAATTCGATCTTCGACAAAGGCAAAAGAATTCTGTTTCGT
TGAAATGCTGTTTGTTCTTACATGCTCTTACGAAGATAATATGCTAACCG
ATAGATATCTGTCCAGTATCTTCTTCTTTTTTTCAACAATGTGTCGGCCG
TTTGTTTTTCATGAAATTGATTAAATGTGAAAATAGGCAAGTCAAAATAT
GGACAATAATGTCATTGTCACCATTAAGGAATCTCAACCACCAAATCTCT
CATACACATGAAAACAACAAAGTAAATATATTCTACCAGCTAGGGTTTCA
TGTCATTCTAGTATGTTAGAGAAATACCTCCCCACCTGACAAGTCTGTTA
GGTATTTATGTCGTTTTAACCCTTTCTAAACTGGGGAGGTGCTTAAATTG
TCCACGCTTACTTTGTTATCGTGTAACAGCCACACGACGTATGCTAGTAA
TACCATTGAAACTTAGTGACTTCTCCTGAAATTTCATTTCCAACAATTTT
ATTATGATAGTATACGTTTATCATTATTGTTCGTGTTGCAGTAGCAACGG
GTTTCGGCAATGCATTTTATACAAAATTCACTAATTTCTGTTTAAACAAT
GATGTTTCTAAGGTTTTCTTGCTCAACCACACTAGTTGTCCTACATGTAT
ATGTAATTTAATGTAACTTTCAAGATTTGATATTCTTAAAGTAGATAATA
AAAACATCCAGATTAACGTTTCTAGCCTATTACCATTGTGTTTTACGTTT
ATAAGTGGAAAAAAAATCAAAATGGCCGATCCAAGATTGCCGATCCGAAG
GAATTTTGACGTCAACGTAGTTATAATTGACATCAAATGTCTTGGCCTAC
CTTAAGATCATTGAGACACTTTGTTGTTTGATACCTTTAAATATTAGGGA
AATTTCCTATTTAGCCAATAAGATAACATCGATGATGTCATAATAACTTC
ATAATGTTCCAAAATTTCAGAAAT Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000151:102794..115267+ >transcript:BL72677_cuf0 ID=transcript:BL72677_cuf0|Name=transcript:BL72677_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1893bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000151:102794..115267+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCGACGAAGAAAAGAGTCAACGACATCAATAATGACGCCCTGCTTTTC
CCGAAGCTTCTGGACCTTGTTGTTTACGATAAATACAGTTCAAGTGAATG
CCCACCCTTGCTCTGTATGTGTTTGTCGTCTTTCCCCGGAACGCGTCTTT
TGCGAAGACCTCGGTCTGACAGAAATACCTGAGGATATACCGGTAAACAC
CAAAGTACTGAGGATACACGGGAATAACATTTCGAATGTACAATATGGAC
AGTTCCTAAACTTCCCTGCCATGGTAGACTTGGATTTAAGCAAAAACTTC
ATATACAGTGTTCAAGATAGAGCTTTCTCTGCTCTCAATGGACTGAAGAC
CCTCAATCTACGAGACAACAGAATCGTCTTTGTCACGTGGAATACCTTCA
CAAGTCTGGAAAATTTACGCGAGTTGCGATTAGGAAGAAACCCCATCATG
TGCCTGGGAACGAACACGTTTGCGTACCTCCCTCTTCTGGAATCTCTTGA
TCTCGGGGAGTTGTTTCGTCTGAATGCTATTTCCAAAGGAGCATTTAGCC
GCTTATCCAGATTGCTTTACTTGAACATTAGTGGATCAAACCTGACAGAA
GTGCCTTTCCTGGGCTATCTGCACAGTCTGGAGGAGCTAGACATTTCCCA
CAACGTTATAAGAGCAATTACTGGAAATGATTTTCAAAGTGTTTCGACAT
TGAGGAAATTGCTTCTATCAAACAACGGGCTCTCTGTGATAGAGAAATAT
GCGTTTGACCCTCTCAAGTTCGTGTACAAGTTGGACTTATCGGACAACAA
CTTGCGAGGATTGCACAGAGGCATGTTTAAGCGGATGGATTCCTTAGCAA
AAGTCAACTTGAAAAGAAATCCGTGGAAATGCACGTGTAAATTGGCATGG
CTGGCCAAATGGCTGCGAGAACATATTCACAATGAGTCTCAAAGGGTGTG
CGGAGCTTGCAAATCGCCGAGAAAATTACGTGGCCAATATCTGTGCAGCG
TTCCGCTCAGCAACCTGACGTGTGAAGAAACTCCCACCGGCAGTGCGTCG
GTCTCTACAAATGTCACCTCTGATGCAGAACACAAATCACGGTGTATTCA
AGGACACGTTCCAAGTTCAAGTGTGGTTTCTAGCAACGGAACGACGATAG
TCAAGGGTTCGTTCAGAGTTCGGATGGCTCTTTCGAGGGACCAGCCGCAG
GGATCCGACCCGAACGGTTCTGATTCCGTACCGATCGTGTACAGGTGCCC
AACGGAAAACTCGGCAGAAACCGAGGAATTTGCAAAGATATCCGGCATTA
TTCTGCCCGTGACACCTACACGGAAGCCACTAGGCACTGACACCTTACCA
GAGGATTTTGACGTGAAAATGTGCGCGAAAATGTATGGCTTTAATATAGA
CGCCACCAAAGAATCTCCAATACAAGGCGACGAGACCATTCCCAATGCGT
TTGAACACGAACACGTCTTCACCACAAAAGCATACTCCGAGCCAACGACA
AACTCTGAATATGCTTCTCAAGACGAACAGAGAACTAGCAAGAACACGGA
ATACATTGTTGGGGCTACAGTCTGCTTTATTGTTCTTGGTATATTGATTT
GGGGATCGTTTTTTCTACTCATAAGGTGCAAGAGAACGAAAAATAGAAAG
TTTAAGAGTAGACGATGTAAAACAGCATCTTGCTGGTGCCATCTCCCCAG
ACGTCCGAGCAAAGTTGACGAGGAGAACCAGGTAGATATGCCAGACGTGA
ACGTTCCTGAAGTTCAATCTGAAGAGACCTTTAACGATCTTAAGTCTTCG
AAAAAAACAGATCTATACACTCTTCCGACTCTTAGAATTAAAAGTACTAA
TTTGTATATTATCAGCGGTGCACAGGATGTAACATATCTATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000151 | genome | Sc0000151:102794..115267 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL72677_cuf0 |
| Biotype | protein_coding |
|
