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Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL26414_evm0 >transcript:BL26414_evm0-protein ID=transcript:BL26414_evm0-protein|Name=transcript:BL26414_evm0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=919bp
MKIIVKRPAGHQSGEWGGVGLRGQRXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGSYTRYPVAWVPSAYYRG
SYTRYPVAWVPSAYYRGAYTHYPVAWVPSAYYRGSYTRYTVAWVPSAYYR
GSNTRYPVAWAPSAYYRGSYTRYPVAWVPSAYYRGAYTHYPVAWVPSAYY
RGSYTRYTVAWVPSAYYRGSNTRYPVAWAPSAYYRGSYTRYPVAWVPSAY
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YYRGSYTRYPVAWVPSAYYRGAYTHYPVAWVPSAYYRGSYTRYTVAWVPS
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SAYYRGSYTRYTVAWVPSAYYRGSNTRYPVAWAPSAYYRGSYTRYTVAWV
PSAYYRGSNTRYMHSVDIL Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000068:1093248..1096200- Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL26414_evm0 ID=transcript:BL26414_evm0|Name=transcript:BL26414_evm0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=2953bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000068:1093248..1096200- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAAGATCATCGTAAAACGGCCCGCGGGTCATCAGAGGTGACCCCGTGA
CGGAAAGTTTCCTACCACTGATCAGCCCCAGGCCGAGGAGAAACATGAGA
ACCTGCAAACAACGTTAGACTGGGTGCCATCCGCTTACTACCTACCCTGG
GAGACCAGACACCGTATATCGGCGCGCCACCAAGCACCGCACGCGCGCCT
AAGCTTTCGCTAGCGGAGCTTGGGTTTACAGCGGAGAGTGGGGCGGGGTC
GGTCTTCGGGGGCAGCGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCTCCTACA
CTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCGCCTAC
ACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCTCCTA
CACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCTCCA
ACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCATCAGCTTACTACCGGGGCTCC
TACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCGC
CTACACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCT
CCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGC
TCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCATCAGCTTACTACCGGGG
CTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGG
GCGCCTACACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGG
GGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCG
GGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCATCAGCTTACTACC
GGGGCTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTAC
CGGGGCGCCTACACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTA
CCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACT
ACCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCATCAGCTTAC
TACCGGGGCTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTA
CTACCGGGGCGCCTACACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTT
ACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCCGCT
TACTACCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCATCTGC
TTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCCG
CTTACTACCGGGGCTCCAACACTCGTTATATGCACTCTGTAGACATACTG
TAA Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000068:1093248..1096200- >transcript:BL26414_evm0 ID=transcript:BL26414_evm0|Name=transcript:BL26414_evm0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=5520bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000068:1093248..1096200- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAAGATCATCGTAAAACGGCCCGCGGGTCATCAGAGCGGAGAGTGGGG
CGGGGTCGGTCTTCGGGGGCAGCGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGC
TCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGG
CGCCTACACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGG
GCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGG
GGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCATCAGCTTACTACCG
GGGCTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACC
GGGGCGCCTACACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTAC
CGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTACTA
CCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCATCAGCTTACT
ACCGGGGCTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTAC
TACCGGGGCGCCTACACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTTA
CTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTT
ACTACCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCATCAGCT
TACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGC
TTACTACCGGGGCGCCTACACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTACCATCCG
CTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCC
GCTTACTACCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCATC
AGCTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCAT
CCGCTTACTACCGGGGCGCCTACACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTACCA
TCCGCTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACC
ATCCGCTTACTACCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCAC
CATCTGCTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTA
CCATCCGCTTACTACCGGGGCTCCAACACTCGTTATATGCACTCTGTAGA
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CTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACCATCCGCTT
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TACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTACCATCCGC
TTACTACCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCATCAG
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CCGCTTACTACCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGCACCA
TCAGCTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGTACC
ATCCGCTTACTACCGGGGCGCCTACACTCACTATCCTGTAGCCTGGGTAC
CATCCGCTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTGGGTA
CCATCCGCTTACTACCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGGC
ACCATCAGCTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCCTGGG
TACCATCCGCTTACTACCGGGGCGCCTACACTCACTATCCTGTAGCCTGG
GTACCATCCGCTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAGCCTG
GGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTAGCCT
GGGCACCATCAGCTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACCCTGTAGCC
TGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCGCCTACACTCACTATCCTGTAGC
CTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGTAG
CCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCTCCAACACTCGCTACCCTGTA
GCCTGGGCACCATCTGCTTACTACCGGGGCTCCTACACTCGCTACACTGT
AGCCTGGGTACCATCCGCTTACTACCGGGGCTCCAACACTCGTTATATGC
ACTCTGTAGACATACTGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000068 | genome | Sc0000068:1093248..1096200 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL26414_evm0 |
| Biotype | protein_coding |
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