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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000211:89939..100156+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Blg14404.2 ID=Blg14404.2|Name=Blg14404.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=10218bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000211:89939..100156+ (Branchiostoma lanceolatum)
GCAACATTTAGAAGATCCTTTGTGGTGCTCCAGCGGCCATATAGTCAGAC
TATCTATATCTATATCCGTATAGCCAGTATAACCCAGTTTACCTTTTGTA
TATTTTCTTGTCGTTTAAATCATACTTTTACATCAAGGGTTACAAAAATT
CAATTTTGGTCGCTGTACGGTCGCTTAGCGATCTAGTGAAAAGGCTGCCT
AAGACAGTTTTGAGTTCAACGTTTTTTATTTCCACAGAAGCATGCCCAAA
ATGACAGGCGCCGTCGGCTGAATATTGCAATCACAGCGGCAGTCGTCGTG
ATGGCATTTGTGATGTTAGGCGCCATACTGATGAGTACCCGTCTCTCACG
ACACTCCGTGGTCACGGTGAGCAATCCATTTTTTCTTATTTTCTTTTTAC
CCGCTTTCGTTGTCAACATATTTCGCTCAGGTTTGTTGTTTGAATATCCA
TTTGACAAGAAGGAACGCATACGAATTAAGATTGTTGACACAAATGTGCC
ATAATTCAAAAATTAAATTTATGATGCTGCAATTTAAACGAAACCCTCGC
GTTAACAACAGCAATTTGATACGTCACAATGCATCATGATAACGTGTAAT
CAGGTTTTTAGAGCCGGACTTCTTTCCTCTGCAGTGTTCGCTGAACTTCT
GGACGGGAAAACAGCTCTTGCATGAGACTGTTGAGACCGACAGAGACGCC
GGGACGGACGCCTTCTACACCGAGGGGTCTACAGGGGGAGGTGCGGTCAT
GTATGACCATCACAAGGTAGGTGTGCGTTCGTTCATAACAGGGTGCGTTT
CTGTCGACACCAGCCAATGCATGTATCTACCAAAACGTCGGCACACAAAA
AAGAAATAAAACCCCAAAACAATTGTTTAGTTTAGAAGTAGCGATAGTTG
ATGAAATAAACTTTGTGTTTATTTCATAACTATGTACTTATTATTATCAT
TATCTCATTTCCTTGTTTTCTTGCAATTAGCCTCCAGTCACTAATTTGCG
ATAAAGTTATCATTATTACTTATTGGAAATTTTAAACTATAATCCAACAC
AAAGAAGTTGAACTAACCATAAATTTTCGGCTGGTAACTCCAACCTTCGT
CAGATGTTCGAATCACTGCGTTGAACGCCGGGAAGTCGGAGACGTGATGA
CGTCAGCAGTGAATCGAAAGCAGCGGGCAGACGGAATCTTCCACCGTCGC
GGTTCAGGGAGGGGTGATGAGCCCTGATGTAGATTGCCTCCTTCACGCCC
CTCACAAACCAGTCCTGTTCCAGATTCCGTCTGCCCGCTGCTTTCGATTC
ACTGCTGACGTCATCACGTCTCCGACTTCCCGGCGTTCAACGCAGTGATT
CGAACATCTGACGAAGGTTGGAGTTACCAGCCGAAAATTTATGGTTAGTT
CAACTTCTTTGTGTTGGATTATAGTTTAAAATTTCCAATATGTACTCTAC
CAACACAGATGAGCTTTCATGCGATTATCATTATTACTTGTAAGCATAGT
ACAATTAAAGGTATGTCCTTGTAGCTCAGCCTCCCAGTTGAGTTTCTGGT
TCCAATCAGTTGGTAACTGGGAGACCCGATTCAAATCCTGGGATAGGACA
TCCCGGTTGGGGCTGCACCCGTCTTTCGGAAGCCACGTAAAATGGGTCCC
GCGTGTTTAAGAAGTGTCTCGAGTATGTTTTAGAAGGGAAATAGCGATTC
CTCCCTATAGAAATATACCCTGCCACAGAAACAACAAGGAATATTGCTGA
CCCATGTGCTACTAGGCACTGCAAGGTGAAAAGCAACCCACAAGTTAGAA
ACCCATATCCATCAGCAACTTCATTTCAAAAACAACTTATTCTTTTCTTT
TCAGCTGATGAAAGCATTCAAGCTTTCACGAAGCAAAACTTGCTTCATCA
TCGAAGAAACACCAAAGGAGACAGATGGCGTGAAGAAGACTGCAAAGGAA
CTGGAAGAGAAACAGGTATCAGAAACAACTTCAGTCAAATATGTCGGTAA
AACATGTCGGTATCGTATATAATGTAGCTCATCTCAAAATGTTCACAACG
GAAGAAATGTTGTATCATAGAGTTCCATGCAGACAAGGCATGCTCAAATC
TCAGATGGTTTCTAGAATACAAGGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATTCCGTCTGCCCGCTGCTTTCGATTCAC
TGCTGACGTCATCACGTCTCCGACTTCCCGGCGTTCAACGCAGTGATTCG
AACATCTGACGAAGGTTGGAGTTACCAGCCGAAAATTTATGGTTAGTTCA
ACTTCTTTGTGTTGGATTATAGTTTAAAATTTCCAATATGTACTCTACCA
ACACAGATGAGCTTTCATGCGATTATCATTATTACTTGTAAGCATAGTAC
AATTAAAGGTATGTCCTTGTAGCTCAGCCTCCCAGTTGAGTTTCTGGTTC
CAATCAGTTGGTAACTGGGAGACCCGATTCAAATCCTGGGATAGGACATC
CCGGTTGGGGCTGCACCCGTCTTTCGGAAGCCACGTAAAATGGGTCCCGC
GTGTTTAAGAAGTGTCTCGAGTATGTTTTAGAAGGGAAATAGCGATTCCT
CCCTATAGAAATATACCCTGCCACAGAAACAACAAGGAATATTGCTGACC
CATGTGCTACTAGGCACTGCAAGGTGAAAAGCAACCCACAAGTTAGAAAC
CCATATCCATCAGCAACTTCATTTCAAAAACAACTTATTCTTTTCTTTTC
AGCTGATGAAAGCATTCAAGCTTTCACGAAGCAAAACTTGCTTCATCATC
GAAGAAACACCAAAGGAGACAGATGGCGTGAAGAAGACTGCAAAGGAACT
GGAAGAGAAACAGGTATCAGAAACAACTTCAGTCAAATATGTCGGTAAAA
CATGTCGGTATCGTATATAATGTAGCTCATCTCAAAATGTTCACAACGGA
AGAAATGTTGTATCATAGAGTTCCATGCAGACAAGGCATGCTCAAATCTC
AGATGGTTTCTAGAATACAAGGAAAATCAATTACAAGCAACTAACAATCC
GCGAGCTTCTTACTGAAGAAAATCATCATCATCATCAACTAAATTCGCGA
TTCAGATAGCATCTGCCGTATGTATCTTTCATCTATCTGACGAAATGTTG
TTGAGGCTATCTGAAACGTTTCACTCTTCAGAGAATGTATCAAGTTGGTT
GATTTATTTTGGATGGTGTGAAGGAAAGGATAGATGCTCAAACTCTGGAT
GTCTGGTCAATAATGATTACACGGACACTGGGTCCCTGCCCTTTATTGCG
AACTAATCAGTAACAGATGTTCTACTCACTATGTGGTCTACAGTTACTAT
CTCCTACAGATGTAATGTTCTACTTGAATGTCAAACCTTCATCGGCACTC
AAATATTTTACTTCACATTTAGGACGGCTCCGTGCAGTTTGCTCAGACCG
GAGGCGCCATGCTGATGTCTGTGGATGCAGACCGGCCGGATCGCCCCGTA
CTGAGTGAGAAACTGGAGAACTTCTGCGGACAACTGGAGCCGCGCTGGGC
TAAACTCACCCCGGCTTCTGAGGACGAGCAGGAAGGAGACAGAGTGGAGA
TCATCATGCCTGCCGGTAAGATAACTGTAGCAGAAATCTACATCAAGATT
CTATGCTTATCCAGTGCCCGTTGCATATCCACCCGGAAAATTATACTAGT
AATTTTCAACTCAATAATCGTTTAACCCCCCCCCCCAAAAAACGCTGGAC
GGTTCGTTTATTGTACTTGCTTTTTTTTTATTAAAAAATCGTACACGGGC
AGGGAAGACCACCGCGTGCCTCTTCCCTACGGTTTATTACACTTTTAGAA
GAAAAGCAAATTATGTTCATCTGTACAAGGACAAAAACGAAATTACCCTG
CAATTCATTATACAATAGAAGTGAACGTGTTGTGTTTTATGAAAATGAAA
TAAAATAGAAACAGAAATAGTATCCAAACCTACTATATCTCCCCTTTCCT
CTCTCTATTTGCGGAGGGAACTCGGAAGCTATAACAGGTTTGGATACCAG
GCTACAAGTGACGCTTCTCTTTTAGGTCCTGTAACGGACGATCATCGGGA
CAAGCGGGGAATCATAATCCGCATCGTGAAGTGTGGTGACTCATACTGCG
TCGTTGTCATCATCTATGGCGTTGAGGAGGGAACTGTACCGACGTCGGAG
GAACACTTGCTCAAACCTTAGATGAAGGATGGATTCACACCATTTATTTT
GCACTTTCTTTGTCAATCATCACGGTCTTCTCGTACTATTTTGAATAGTT
TATCTATAAATAAACGCCATTGTATTCTTGTTGTACCGCAATAAACTTTT
ATAATGTAAAGAAGAAAA Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000211:89939..100156+ >Blg14404.2 ID=Blg14404.2|Name=Blg14404.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=648bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000211:89939..100156+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCATTTGTGATGTTAGGCGCCATACTGATGAGTACCCGTCTCTCACG
ACACTCCGTGGTCACGTGTTCGCTGAACTTCTGGACGGGAAAACAGCTCT
TGCATGAGACTGTTGAGACCGACAGAGACGCCGGGACGGACGCCTTCTAC
ACCGAGGGGTCTACAGGGGGAGGTGCGGTCATGTATGACCATCACAAGCT
GATGAAAGCATTCAAGCTTTCACGAAGCAAAACTTGCTTCATCATCGAAG
AAACACCAAAGGAGACAGATGGCGTGAAGAAGACTGCAAAGGAACTGGAA
GAGAAACAGGACGGCTCCGTGCAGTTTGCTCAGACCGGAGGCGCCATGCT
GATGTCTGTGGATGCAGACCGGCCGGATCGCCCCGTACTGAGTGAGAAAC
TGGAGAACTTCTGCGGACAACTGGAGCCGCGCTGGGCTAAACTCACCCCG
GCTTCTGAGGACGAGCAGGAAGGAGACAGAGTGGAGATCATCATGCCTGC
CGGTCCTGTAACGGACGATCATCGGGACAAGCGGGGAATCATAATCCGCA
TCGTGAAGTGTGGTGACTCATACTGCGTCGTTGTCATCATCTATGGCGTT
GAGGAGGGAACTGTACCGACGTCGGAGGAACACTTGCTCAAACCTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:89939..90014 | Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:89939..90014 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:90176..90304 | Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:90176..90304 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:90573..90704 | Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:90573..90704 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:98541..98651 | Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:98541..98651 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:99211..99403 | Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:99211..99403 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:99864..100156 | Blg14404.2-exon-Sc0000211-1570713199:99864..100156 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000211 | genome | Sc0000211:89939..100156 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | Blg14404 |
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