Blg14307.4 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14307.4
Unique NameBlg14307.4
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000089:856085..866771-

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14307.4 ID=Blg14307.4|Name=Blg14307.4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=10687bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000089:856085..866771- (Branchiostoma lanceolatum)
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TAAGCAGTTGAACCTCAAATTGAGGACAAAGCATGACGCATCTATGAGTG AAATGAAGCAAAAAAAAAAGATATTGTTCTAAAAAGCATAGTTTACTAAC TTGGATTCTGTGTTAAAAGCAGAAGGCAAGGAAAATATGTAGACAAAGAG GGAAAGTTTTTGCAAATCACTGCAAACAAGTTGACAGTTTGCAGTCAAGT TTTGTACTAGACACAAAGTTAAATCTCTTTGCCCAAGTCAAACCCCTTTT CATGCCTCACCCCACAGATGACAAGATCCGGCTGTACAACACATCACATG GCAGCTTCATGGAGAAGAGATGTATCACAGCACGAGACGTGGGCTGGAGT GTGCTGGACACAGCCTTCAGGTGAGGACTAACCTACAGCCATGTCATACA TTGTACTTGTATACATGATATGGCACATTTGATACATGTAGTACAGTCCA TTTGAATGTACACATCTTAGCATTTTCGACCATATTTTTCATGATCTCTT TGACTTCCATTTGTTTTTTTCTCTCCCCAGTCCTGATGGCACCTGTGTTA TATACACCAGTTGGTCAGACTTCAGTGAGTAGACACCCAACCTTTCTGCT TCAGTCTGCTTTTCTCTTCCTGACTGTCTTAATGAAGTAAAATGTGTACT TTCTTAACATATGTTGTTTGCAAGATAAAAGCTTGATTTGTCTTTGTTTT ATACGGTGGACAACAAGTGACTAAACTGCACTTGAAATAATCTAAGAAAC TTTAAGATAATAGGTCCTTGTTAGACTTAGAACTGTGTGATTATTATTGA TATTGAATTCATATCATACTTCTTAATAAAGTATGGAATATTTCTTTGAT TTACAGTTCATCTTGTTAATATATCGTCAAAGGGTGTGGAGTCACATATG GCCTTGGACCTCAGGTAATAGGAATTTATGTTGTGTTAAATTGTGTATGT GGGATTACAACCCTTGTCAAAAGGAAATATTTTAAAGAGGAATGATTACA TGCATGATATATAATATAGATGTAGGGGGTATTTTCAAAAGCAAGAAAAG GCACAGTTTTTATTCCGATAAACATATTTGCTGTCTACAAATGATAACTT GAAGAACAGCTATTTTTTCAGCCAAATCTGTAGACCTGTGACAAAAATTC GTGACTCAGTAACTACACCTTTGTTAGAGGTGTGCCATAATTGAGTTAAA AATAGCAGTGTACATTGTATAACACTACAATAGCATGCAGGTGTAGAGCA CGTGTGCCATACTAGGCACAATGGCCGATGTGAACATCCTTTCATGTTTT GTTATTTTAGATAAAGTATAATTCACATTTCTAAAAAAAGTCCCAACCCA ATCCAATCATGTTAACACTGCATGTAAGTCTTACCACTAGCTGTTTAATT TGTTACAGTGCTAATGATCAAATTGATAATGAGTAAAACAAATAGCCTCA TAATACAGTGCTAAACTCTCTTCCAACACTCAGGTATTCTTAGGAATAAA AAACGCCATGTTGCTTTTCCTTTCTTTTTCCAGCCCCCTTGATCGAGACT TTGCCATCTTCTCTGTGACCTTCTCTCACGATGGCAAGGAAATCCTTGGA GGGTGAGAAGCATAATACAAGTCTGTATTAAAAATTTAATTCAGAATTAC ATGTTAAAGGACGAAGAGAAAACCAACTTACCAAGGCATGTAGTCATGTC TCCAAATGTTTCAAAAAGAGAGAAGAAATTACTGGGTGATCAATCATTAG TTTAGCAATAGTCCACAGTTTGTCTGTTTTTCAGTTTTCAATGTTAGATT GAAGCATTTTATCAATTTATGTTTTGCACTATGCTTCTTATAGACCACGT GTGGTCATCTGTGCATTTAGCCCTTCTGGGCAGGAATATGCAATAAAGAC 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TGGTCATATATTGGATTTTATAACTTGATTTAATTTGAAATTTCTAATGT TACTTGTGTGATTTCTCAACAGAGATATATCTACACTGGATGTGGCACTG GTGCTATCATCAGTAAGTACTTCTGTTGTTGTTTTCCCTTCAAAAGTTCC AGACACACACTTCATTACATGTTGTGACATCAAGAGATTGTTGATTTGCA GCTGCTAGTATACAACATTTTGCATCTAGATCTAGTGGCTGCTATGTGTT TGTATGCTAAGAGAGCTTACCTGCCTACCATGCATACAATGTATATATCT TTGAAAATTGTATTACATCATAATGCAGATCATACCATAGGTGTACCTTG GCTGCACAGATGTAAAATTTTCTATTTTCCTCTCTCCCACAGTCTATGAT GTTCTCTCAGGAAATATGGTTGCCAAGCTGATTGGTCACATATCCTTTCA AAGTTACAATGTCAGATATGCAGCCCCGTGATGCTCAACAGTTGGAATAG TATTGCTATGGTTAAGACAAATTGGTATCCCTTTCCAATAGATTTAATTG ATGAGTGGGTTATATTTGCATCTGGAGCTTACACCTGGAGTATTGTAAAT GCTTTGGTAAATGATTCAGGATATGAGCAAGTGCCTTTTCTGATTAATGT AATGATTAATGTAATGTTTGAGGGTTCACCAAAATTGAATGTGCAGTTAC AGAAATTGAATATGTGAGACGCGTGCTCTTTGCTATCCAATATTTCCAAC ACAGTGTCCAGACATTTGGAATATGATATAGTCAGAGAAAATTACTTCTA TTTTCCTTCTGTCTTGTGTTACTTCAAATACATCATAAGAATTTGAAGTG TTAACACATAAGTTTGGCTGCCCTTTTGATTAACCTTAACAGTTCACACA AAGCCTGTGTTAGGGACGTGTCGTGGCACCCGACTGATGTGCGGATTGTC 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ATGAATAAACATAAACATAAACATGAAGATATTGGTGTAATAGCAAAATA TCATTTTAGCCATGAATGGTTACCACGATAATGCCAGTGCACAATGTTTT TTTTAAGAAAGCTGACACAATGTGAAGTATATGTGGCAAATGGTTTGAAT TATAAGTGAGAAGGAGTTCCTGTTGGATAGATGCAAATCATTGAGATCTT AATGGTCATGTTACTTTTTTACGATAGCAAATAAGTTCACAAAAGATGTA ATATATCTGTTCTGGTGGCATTCATGAAACAGTTGTGTAGAGGTAGCAAG CTATTGGTGTCTTTTGGGACATCTATTAAATGTATGTATGTTTCAGCTTA TGGTTTTTCTTACATTCGTGATAATTGTCGCATATTGCACTTTTTTGGTG TTAAGATTTTTTTTCTCCCCAGAATTTGCTGCTGGATAGATTTTGCTACA TTCTGTGGAGTTTGCCCTATGAATATCAAATTGCAAGAATTGCTTAAATT TACTGCTTACTTGCGCCATTGCTTAGTTTCCAACATATGTGTTTGATTTT GCATTTTATTTGTAAGGGATTATAACATAACATAACTTTATTGCAAGTTC ATGCCCGAAGGCTAATTGCAGACAAACAAGTACATGGAAATACATGGGAA TCGACATAGTTATCTAGTCTACAATGAAAGTTCTATGTTAACTAAGCTTA AGGTTGACTATAGTTGGGTTTGACTTCTTTTTTGAAGGCAGTGGAAAATG AAGAGACCCACGTTTTGTATCGTAAGAGGGTTGGTGGATTTTAGTAGTAA GATTGATTTTTGTAAGTTAGTCAAATGGTGAAAGCTAGGGGAATTCATGT CAGTTTCACAGACACGAAGTGCATTGTTTGCTTTTTTATCAGTCCTGTGA ATTGCGGCTGCTTTTGGTTATGATTTGCTTTCTTCACCCACATTATTCAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000089:856085..866771-

>Blg14307.4 ID=Blg14307.4|Name=Blg14307.4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1218bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000089:856085..866771- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAAAACAGTGGCAGCATATGGTGAGAAGGCTTTTTGTGGAACATTCTC
CAAGGATGGATCAGTTTTCCTGAGTTCATCTCAGGATGACAAGATCCGGC
TGTACAACACATCACATGGCAGCTTCATGGAGAAGAGATGTATCACAGCA
CGAGACGTGGGCTGGAGTGTGCTGGACACAGCCTTCAGTCCTGATGGCAC
CTGTGTTATATACACCAGTTGGTCAGACTTCATTCATCTTGTTAATATAT
CGTCAAAGGGTGTGGAGTCACATATGGCCTTGGACCTCAGCCCCCTTGAT
CGAGACTTTGCCATCTTCTCTGTGACCTTCTCTCACGATGGCAAGGAAAT
CCTTGGAGGTGCCAGTGACTGCTACATGTACGTCTTCAACCGAGAAAGAA
ACCAAAGAACACTAATGATGGATGCCCATGAAGATGACATCAACAGTGTG
AAGTTTGCGGACGAGTCCTCCCATATCCTGTACTCAGCAGGAGATGATGG
CGTGTGTAAGGTCTGGGACAGGAGGATTCTGGAAGAGGAAGACCCACAGC
CTGTCGGCATCTTCGCTGGACACAGTGATGGCATAACTTATATTGACTCC
AAGGGAGATGGTCGCTACCTCATCACAAACTCTAAAGACCAAACCATCAA
ACTCTGGGACGTCAGAAAGTTCTCATCTTCAGAGGGATTGGAGGCCACAA
GACGAGCCATCACAAACTACAGATGGGACTACAGATGGATGGCAGTACCG
AAGATAGTGCGTAACAGCAGGAGGAAGCTGAAGGGGGACACATCTGTGAT
GACTTATCGAGGCCATAGCATCACCAAAACCCTCATCAGGTGCAGGTTTT
CACCTGTACACACAACTGGACAGAGATATATCTACACTGGATGTGGCACT
GGTGCTATCATCATCTATGATGTTCTCTCAGGAAATATGGTTGCCAAGCT
GATTGGTCACAAAGCCTGTGTTAGGGACGTGTCGTGGCACCCGACTGATG
TGCGGATTGTCAGCAGCTCTTGGGATGGACACATCAACCAGTGGGATTAC
CAAGGCTCGGATAACCCTCAGGATTCCGACTCAGACTCAGAATATGGGCC
GGAGCAGAGCGGCGGTCGACTTGTCATCATTAACGTTAACGGTGTTCGCA
GGAGGAGTAAGAGGTTAAAACAACAGGGCCAGGCAAGGCACAAGAGGCAT
CACGCTGAGGAGTCATAG
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:864334..866771Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:864334..866771Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:864107..864203Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:864107..864203Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:863048..863148Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:863048..863148Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:862602..862704Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:862602..862704Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:862398..862441Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:862398..862441Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:862058..862115Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:862058..862115Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:861370..861438Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:861370..861438Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:860767..860824Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:860767..860824Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:860310..860495Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:860310..860495Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:859872..859961Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:859872..859961Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:859642..859705Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:859642..859705Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:859267..859382Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:859267..859382Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:859060..859099Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:859060..859099Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:858733..858779Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:858733..858779Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:858213..858272Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:858213..858272Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:857351..857821Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:857351..857821Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:856085..857249Blg14307.4-exon-Sc0000089-1570713199:856085..857249Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14307.4Blg14307.4-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000089genomeSc0000089:856085..866771 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14307