Blg14280.3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14280.3
Unique NameBlg14280.3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000201:319944..333954+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14280.3 ID=Blg14280.3|Name=Blg14280.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14011bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:319944..333954+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TGTATATATTGAGTTTGGCTGGAGAATCATACCACATTCCTTCTGCTTAA TCTATAAACCAATCTGCCCTCCAGATTGCGAAAGAGCACGGGATTCGGTT CTATGAGACAAGTGCCAAGGCAAATATCAACATCGAGAAGGCCTTCATGA CTCTGGCAGAGGACATACTTAGAAAGGTGAGCAGAGTGAAGTTGTGAAAT TTATTTTTTAGATTTTTTTTGTTTATGAATCGTTAGGGTGGTCCCTTTGG TTAACTTAATAACTGATTATCAAGGAAACCCTTGTTGAACACTGGAAGAA TGATATGTCTTCCTTTGAGTGTGAAGATATCCAAAGTATCAGTGTTTGAT TCAGTTGTTGTATCCCACTATGATAAGCTAGTTCACGGTTAGAAGTATGC ATTTGCAGTGTGATGCCTGTTCACAGCTGCACATGAGCATTGGGATGCAT TGTAAAAGATGTAGGTCATATGTCAAGGTTAGGCCTCTGAGACATTGTAT TAAGCATGGTCTAGACAAGAACTGTTTATAAGTCAGGGGCCTTTACGTTT GACATATTACCCACGATGCATCTCAGTTAAATCTGCGAACAAGCTTGTGG GGCCTCCAAGTTGACATGTTGCCCACGATGCATCACACTACTCACACAAA CTTCAAACCTTGAATTAGCTTATTGTTGTTCATTTGCACATTAAGTATAT ATAAAGGTATGCATGTACCTGTTTTGCCTTCCCTTTCATGTTGTGAAGCA TTCAAATAAACAAATAATAGAATAGTGGAATACTTACGAGTGCACTGTCT ATGTGCAATTTGCAGACACCAAGCAAAGACTCCGGCCCGGAGGCTGGTTC TGTTGCTGTGGGCAGGGACCAGTCGTCAGGGTTCAAACCCAGGTGCTGCA ATACATGAGGCTGTCGTGTCACCCAGGAAAAATCCCCCTCCCCTCTCCCC 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CAATTATGTTAAAAATTCTTTTATGTAGTTGAAATGACAGGATAATTAAT TACTTGTTCTTGCTATTGTAGCAAATTCTACAAACAACTTTTGGATGAAT ATGTGTTAGTTAAAGAAATACTTTGTACTTTTTCCTGTCATCTTATCTTA TTCACAAGAATTGGTGTATTGTATCTTTATAAGGGGTTGTTTGACGGGAA CATAAGAACGGTAATGTTGTTTTACAAAGCAGTTCAACATACTTTATGAC ACTATTTAGTATATACACTGATTCTCTAATTTGTCTTCAGCAGCTATGCA TTTTCTATCTTAAATAGACGACCAGCTAGCTTTGGTCACCACTTTTCAAT GTTAGATGTATATGGAAGAGCCAGGGCTGTGTGGTGACATTGTAAATGTG TCTTGCATCAATATTTCTGTGTCTGACAATGGACAACAAGCTATGGGTAG CAATGCCTGGCTGTTAAAACTTAACTCCATCTGGAGATTGATGCCTTTGT ACTGATAGTTCTTTGGGGGAGGGTACTGGTACATTGTAAATTTAACTGCA GCTTTGTTGTCAAACTACCATCGTTTAAGCGTGTATCTCACTGGACTGCT CCTAACAGACCCAAATTGTGAAAGGCAATCGGAAAGTGGTGCAAACCAGT GCCAGTCGGCAGCAGTTTGTGGCCTGAAATTGCGATTTTTTTTTCAAAAA TTCTCAATTTGCAAAATGGGTGCAATCACTGCACATTCATTTTTGATGAA TTTTGATCATTGTACATTGGCTTTTAGGTCAATGGCAACGCCTGTGCATG GCATGTCAGTTTGACTGCAAGGGAAAATTAGCGAAAATTCTCAAAGTTTC CTCAGAATTTGGCACGATCAGGGGCAGTCCAATGAGGTACCCACTTTACT AGAATTGTGAAATTTATGAGTGCATGAAAGAGCCTTGAATTACCTGGGTT 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AGCTCATATCTTTTTCTGGAGAGCCACTCTCAAGTTCAGAAAATTTTCTG CAGCATATGCTTCTTTTGTTCCTCCTTGTCCATACTGTTTTTTGTTGTTG TTGTATATACATGAGATTACAGTCCTCTAAAAACGCTAATTCTGTCGGCA CCTGATCAGAGTCTGAAAGATATTCCCTTAAAAGACAGAACTTTTCAACC TGATGTCAATGGATTGACTTGAAATTCAGGATTTATAAATGGAACGCTAC TGCATTTCTAGCATGGTAAGTTGAGTGTCTGATCAGGATCTCTACCCTGA CATACATATCACATCACTTCAATTTATTTCTCTGATTTGTGACCCAGACA TCTAGAGAACTGGCAGAACAGTATTTCCCCCTGTATCCGTCGGTAACCTC GAAACAATGATTGGGAAAGGTGTCCTGATAATATTGTACCGAGAAATTTG AATTTTGACTTATAATTTGTTAATCTGCCAGCTCTTTTTTGGCTGTTGAC AGAAGTGTTCTTGCTCTACAGGGAGGTTACTTTAGATGTGTGTTCTGAAG CGGTATCTAGATTTGAACTCTGGGTTCTGAAGGGGTATTTTAGTTTGAAC TCTCCATACATGCAAACATGGGTGCTCAGAGAAGGCCACCTGCTTGAGTC GGTGTCGGAACACATGTATACTTCAACGTCAACTTAGGACTATCCCCAGA TGACCCCGCGAGGTAGTGGTATCCAGTAGGAACAACTTGTATGGTGGCCC AGAACTAAGCCGGCTACATCTCTAGCCATTTTTGTTGCCAGTTTCTCATT GGTTCTATTACTATTCTAAGAGTAACCTTTTAACATTTTTCCCAAAGAAA ACCTGATGGAAATTCTTTTCATTCATTTGGAAGTACATGTAATTACATGT GTATTTTGTTAACTAATAGTTGTGGTACAGGTGCATTAGAAACAGTACTT TTCAGAAGTTGGCCAGTTGTAGATAATATTCTATGTTAAACAGACACGGT ACACATCAATGTGATTTGTAATAGATCCTGATCTAACAAATTAAGGGGCA GAAGCCTGGTAATATCTTCTAACATGATGGCAAAAGTGACAGCCTTAAAA GATTTGCTACTGTTCAGTCACATTGTGTATTATGCTGCTATGTTTATACA TTGTACATGGACCAGGCATTCATGTTACGTAACAAGGCCATCATGGTAGT CTGTTGTACTGTGCTTATGTGCTACATGTATACGTATTGGCTTTATGTAG GGCTCAACCTCATAGTCCTTGCAAAAAATACTTGCTATACGCTTTGCTAT GGGAAGGTTTAACAAAATCTAGATGTGGTAAGGGGGTGCGGAAACTCTAC TCGTCATGTTGTTTGGTTGTAGTAGCAGGGCCATGGTTTCATGCCTTTTT TTGCTCCAGCTAGATGAAGCAGACTTAAAACTTAAAGTATTTAATTTTTA ACAAAATAAAATATAAACTGGTGAAACCGTGTTTGTATAATAATTATGTG CATGTTTCCTTGCCTTAATTCCTAGTCAAATGATGATGTGCAACCAGTAC CCCACAATGGAGGCAAATCAGATTATTATCATTATATAATACTGTAAATG CATTTAAGTTTGCGTGGTTTTAATTTCGCAGTAGGGAGAAAATTGTGTGT TCGCGGTGGTTTTAAGCTGGCATTTGAGACAATAGTAGACAAGAGGGTCC TTATTCGCGCCGTAGAGCTTACCGCAAAAAACGCAAACATAAAACCACTG CAAACATTTCTGCATTTACAGTAGTCTACGAAGTGAATAGATAAGTCTCA TTGCTGCATAATGATTATTTCATAAACAGTCATGACATACTGTTATCTTT AAAAAATGGGCATTCATACCCCTGTCTGCTATCAAATTTGATTTTTTTTT TCAAGAATGAAATGTATAGTGGTGTGTCAGTTGAAAATTAAGCACAATTG TGGCTTGATCTCTTTGCCAAGAAGGTGTTGATGTTGTTTGTTTGTGGTTG GTTGTGAGTGTTTGTGGACAGTATAACTCAAGAAGTTTCGAATTGATCTG CATGATTTTTAGTATGTGGATAGGTCATGAGTGAGTGAGTGAGTGATAGG TCTTGGCAAGACGAAGGACAATTTCGAATATGGACTTCCCAGCGGCTTTC TATGGTATTGCAGCAAAATGTCCAGTTTTCGTATCTTGTTTTCTGGGCAT GTTGTGATCATGATTTTCCAGAAAGATTGATAGTTGTTAGGCTCGTGAAG GGGCGTAGGTTTGGGCGCCCATGCAGCTTTTTGGAACTTCAGAGGTCAAT TTTGTTTGAGACTTTGCATAAAGTAACTCAAGAAGGGGTGGGCAGATCGT CATGATTTTTTGGTTTGATGGATGACATAATCAAATGCTAATCATGCAAT TCAGGATCTAATTTGCACAATTAATGAGGACAATTCACAAACCCAATGCG TCCCATGATAGGACTATTCAAATGTATAAATGAGAGGAACATCGATAGAT ATCAATTATGCAAATGAAGACCTAATCTGCATAATCAGGGAGAGAACTCA ATAATCCCATCATACGAGCAGGTCGCTAAGAAAAAGTGCCGAAATTTCCA TGGATCATATGTCCGTTGTTTTTCAGTGATCAGCATAATGTATTATATCA CTGAAAAGCTTGTGCAATTTCCCATAAAATTATGCCTCATTTGTTATGAT CACGCTTTTTTGAAACAAGCACCAAAACTAAGGTCGTTAGTGGTTTGGTA AAAAAAATCCCCCGCCAATGTCTGCCGCTGTGTTGGCAGGGGAATTTCCG CACATTTGTTTTGTGACTCACTTGTTCAGCTCTGGTGGTCGACTTGTGAA TGTAAGATCTTGACACATTTGGTATAATTGTAAAGGGTAATAAACAGCCT GTGGATGATACATAATTCTATACAGCTGATAAAGTAACAACGGAGAAATG CTTGAACTTTGTGCGCCAAGTTTATACAAGGAGGTTGCCTTATTACGATC TTGGTTTATACAAAGGTCTGTCAACATCATTGTTTTTCTCCTAGATTTCC ATGCATAAATGTAAGCAATAAAGCATATCGTTCCTACCAAAGTGAGAATA TCCTGGGGTTTTTTTTGTACATTTGTACTTGACATACTCGACGACGGGGA ACGAGCCATCACTTGACACACTGAGGTAATCCGATTGGGAGTTCACAAAA TTGTCTGGACGGTGCGACCTGTGATGTCGGAGCCTCATCCAGTATGGTTT GCTTTCATGTTTTCTTTTCTATCTTTGAAAATAAAGATGAACGTAGAAAA TTTGCACATTCTCCTACGCAGAGCTGAACCCGCATCCTCGACCGCCGTGA ATCCAAGGAGGTCTAGCTATAGGGCGCGTGTTCGGCTGTGCGTAGGAGAC TGTGCGTCTCAAGCTAAGCCTAGCTTAGCTGTGAAGCTGGTGATACACCG AAGGGCGGTTATATACCGGCGGAACAGTACAGACGACACAGAAATCGACA AACAACTTTCCTGGTGAAGGGCGTGTTTTTGCTGTCCAGAAGCCTGATGT CAAGTGGCATN

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000201:319944..333954+

>Blg14280.3 ID=Blg14280.3|Name=Blg14280.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=612bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:319944..333954+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCGAAGAAGACGTACGACTTGCTCTTCAAACTATTGCTGATCGGTGA
CTCTGGTGTGGGCAAGACGTGTATCCTCTTCAGATTCTCAGACGACGCAT
TCAACACGACCTTCATATCAACAATAGGTATTGATTTCAAAATCAAGACG
GTTGAATTACATGGGAAGAAAATCAAGCTTCAAATATGGGATACCGCTGG
CCAGGAGCGGTTCCACACCATCACGACGTCGTACTACCGCGGCGCCATGG
GCATCATGCTGGTCTACGACATCACCAACCCCAAGTCATTTGACAACATT
TCCAAATGGCTCAGAAACATTGATGAGCATGCAAATGAAGACGTAGAGAG
GATGTTAATAGGGAACAAGTGTGACATGGACGACAAGAGAATTGTGGGTA
CGGACAGGGGCGAGAACATTGCGAAAGAGCACGGGATTCGGTTCTATGAG
ACAAGTGCCAAGGCAAATATCAACATCGAGAAGGCCTTCATGACTCTGGC
AGAGGACATACTTAGAAAGACACCAAGCAAAGACTCCGGCCCGGAGGCTG
GTTCTGTTGCTGTGGGCAGGGACCAGTCGTCAGGGTTCAAACCCAGGTGC
TGCAATACATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14280.3Blg14280.3-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:319944..320434Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:319944..320434Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:324429..324489Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:324429..324489Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:325606..325744Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:325606..325744Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:326189..326278Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:326189..326278Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:326668..326769Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:326668..326769Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:327409..332466Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:327409..332466Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:332493..333954Blg14280.3-exon-Sc0000201-1570713199:332493..333954Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000201genomeSc0000201:319944..333954 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14280