Blg14243.7 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14243.7
Unique NameBlg14243.7
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000201:11626..27352+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14243.7 ID=Blg14243.7|Name=Blg14243.7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=15727bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:11626..27352+ (Branchiostoma lanceolatum)
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AATAGCTAACTTCAAAATCTTAAACAAATAATACAACAAGGGTTTGATTA TTTTTTCTGGCAATTGAATGTCAAGAATGTGCTGGAGAACAATGTAGTAC CTCTACCTACAAAACCCTGCACAACAATCTAGATGCACTGGTGCGCCCAC AGTCCAAAATGAGATGGACCGTTTCAAAATTTGGTGCACCCGTGCAATGT ATTTGGAGCCCTGAAGTCTTGGCCCTACAGCATCAAAGAAGTTTTGGGAG TAAACCAAAACCTTTTGAAGTCTGTTGACCCTGTCATGAAATCCCCCTGG TCCTCCTCTTGTCCACACCTGCACAGGTAAACAAAACACAGTTAGGTAAG CATCTGGCTTTTACAAGTACCTGCACCGACTGCTAAGATTAGACCACATC TATTTATTTACTTCTTTTCTGACATTTTAATGTAAAGTTTTGAAAAGAGG ACAAAGTGGAAACAGATGAGTTTGAGAAAAACTTGAATCTGACAATGTGC ACTCTCTGAAACTGTATGTACTAAGGTGAAGACTCTCCCCTTAGGCTATT TCTTAAGTTGTTCTTCCAGTTTAGCATTTTTTTAGTGTATCCAAAACCCA ACAAATACAATTATGTGAGCTAATATTTGCAATAGCAAGCCTTCATCACG GGAAACTATGGCTAGAATATTGAATTTGTAAAACCTGCTGTTATTTTTGC AAGACCGAGAGGTTTAGAAAATAAAAATGCTCAGAACGAAGATACAAGCT TTGTCCTCCCGCTAAGCCTACCCTCGTTGTTGTTGTTGTTGCCAAGTTTT AACAATGTAAAGAGGCCAAGCATGAAGTTTGGAGTAAAGCTATGTTGCAC CAACAGTGGTTGCCAGGAGAATGGCATGTGCTTGCATACTGCATGCTAAG CCACGGCAGAACTTGCCTCAGGCTGTTCAACGGTCATCAGGTCACTGCAA 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ATATTGTTCTGTCCTTGGCCTCTTTCATGACTTCTCTGTATGGATAACCA GTAAAATTGTGGGTGGATAGCTTGTTGGTTTTAATGCTGGTACATGGTAC AGCTACAAAGCTACAAAACCAGAAATTAAATATGTTTTCAATCAGTAGTG CAGAAAGTTTAGAATGTACATCACCAACACATTTTTGTAGAATACATTTT TGTAGAATGGAAACATATTTTTCCCTTCATGATTAGTTATGTGTACATAT TTGTAGAGTACCACCAAATTGAAGGACTTTTGTAGTGTACAGAGGCCTCC TGAACAAACTGTAAACAACTTCACACCTGAGAAGAATGCTGTTGATGTAG CTAGTAGGTTTCCTTACTGTTCAAGTTACATTTCTTCACAAAGTTTTTCA TACCATGGAATATATTTAATTTTGTTCATGTTTAGTCATACTCGTAGTCA TAGTGAAGAATTTGTATTCCAGCACTAAATGAACGTTTTGCCAAAAAAAT TAATCATGCAAAAAATTGAACATCTTGATGTTTACCTTTTTGTTTATTCA AAACATTTTTTGAACATCTTGGCAGGTACCTGTTTTGTTTATTTAGAACA CAAATATGTCTGTCGATGGAACATTTATTTTCTATCACTGATAAAAGATG TCAGATGACATCTGAATTGTCTGATATTTTCATATTGTAATCCAATGGTA TGGATTGAATTGGATTTTTATTCTTCAATTTCCTGGATGACTAATATTCA CAAAATATTAATCAAACAGTTTTGTGAAGAGGGAGTGCTTTTTTCTCCCC CCCCCAGGTGCTCAGGCATGCGTGCTCGTCTTCTCCACAACAGACCGCCA GTCGTTCGAGGCGATAGAATCTTGGAAGGGAAAGGTCGAAGATGAGTGCG GCGACATTCCCACGGTCCTAGTACAGAACAAGATTGATCTGGTAGAGGAC GCCAAAGTAGAGACGTAAGTCCTTTAGTACGATTGGTAGTGGATAAGTCC ACGATTCGGCCCTTTAAGAAAAATAAAACACTTCGAAGAAAAGTAAAGTC TTTGACTTGACTTGAGTTGACTTTACCGTCAATGAAATAAAGACCTGATA AGGATGACTTATTTTATGTTTTTGTAATATGTAAACTGTAATGTGATATT ATGTAATGCATGCATCACAACACCAGCAGCAGTTGCCTGTGCTCCACTTG TATTGTACTGTGGCAATCCAAATAAAGCTAAAATCAAATCAAATGTACAT TCTTTGACCATGTGAAGTACATGTATTTAGAATGACAGTTTCTGAGAAAT ATTATAGATGATGGTTATGATTATTGCAGAAAATTTGAGATGATACAGTT TTCCTGGAGGTAACATGTGTTTGTTTGATGATTTCTTGCAGGGAGGAAGC AGACACCTTAGCAAAAAAGCTCAAACTTAGGTTTTACCGGACATCTGTCA AGGATAATCTCAATGTTGAAGACGGTAAGTAAGAACATAATTACAGGTGA AGTGGGACAGATTGCTGCTTCAAAATGTGGACGATTATTTACTGCTTACC TTTTATCTGTTCTATTACTGCTTTACAACCATGTTATCTCTTGTCTCAAG AGGCAGCAGAAGCAGGGTTTCTGGACTGTGTATATAGTACATTGTAGACT GTACTCTTGTGACCTGATTCAACAATTAATTGTCACAACACTCACATGAT TATAATTGATAGGAAAACACTGTGGTAACAAAATGATGACAGCCAGACAA AAGAATACCCAGCAATATCGCCCAGTTAGAATACCTGACAGTAAAAATAG TTGGTCATTGGAGAGTTCTCATTTAGAGATCTCTCCTGTCATTCGAAAGG AAGATGGAACAGGACATCTGAAGATGAATTGTTCTCATTCTAAAAAAGAT AGACAGTTATTTTCATTTATTTATTCATTGGTTTGGCTGTTCAACACGCG CAGCCAGGGCTGCCCAACTAGCCTGTGGCTATCACAAAGGGCTAGCCTTG CTGACAAAGACAAGACATTACAATGGAATTTTGACATGGACAACATAACG AGCTATAACAATATTCTAAGTACATGTACATGAAAAACTATGTGGCAAAT GGCTTAGTTCATGACATTGTTTGTTCATCATTTCTCCAGTATTCAGGTAT CTGGCTGACAAGTACCTGGAGAGGGTCCAGGCCATGGTGGAGGAGGAGCC ACAGACCAACCAGCCCAAGATTGGTATGTTACTGAGGAGGGCTAGGGGAG GGGTGAGGGAGGGGTGAGGTGATGAGAAGAGGGGGGTGAAGGGTAGCCTG GGTGCCATCGCTTTTAGATTTTTCAGGGTAGCGAGTGTAGGAGCACCGGT AGTTATCGGATGGCACTAACTGAAGGGGTGAGAAGGGTGGGGAGGGGAGG GAAGGGGTGAGGAGAGGAGAGGAGGGAAGTGAACGGACGTGAGGGTAGGA TTTGGTACAAGTGTCTGTAATGTTTCTTCCCACTGTTAGAATTAAGTGCT GTGACCTACTCCATTTCCCCTAACCGCCTTATTTTCATGCCGCTATATTA AAGTGATTTACAGTATTATAATAATGAAGAGGTGGACAAAAATTACCTGG AAATGCTCAGAATAGAGGGAATCAAACAAGAAAAAAGTAGAGTGAAGGAA TTAGGTGGTGAACATTTTAGATAAAAAATTTTGTTCCAAATAGTGATTAC TGTATCCTAATACTAGTTCATTCATTTGTCCTCAGGCATGTTCAACACTG TCACAAGCAATGCCAACTCCTCGGCAAAGAAGAAGGAGGACAATGGGACC ATCACGTTGTCGGGACCCAACAAGCGCAGAACCCACGGGAAGAAGAACCC CCTGTCCATGCTGGGGAAGTGCCAGTTGTTGTGATGTCTCATCCCCACCC ACAGGCCCATCATATTCAATGCTGCATTCTGATGGGATAACAAGATGGTT TCATATTTTCCAGAGAGACCCTCTGTACAAAATATATCCAGGAATGGGGC TCTTGAAAAGGCTTCTCAGTCGGAGAACAGGGCAACATTTGCATACTGAG CTTTTTGTACATGTGCTGTAAGCTTTGTAGTCACTGAGAGTTTTTGCTAG GATCTTTCATTATGCAACTAAAACAAAGTGCAGTTGTCCCACATTTTGTA CAATGGACTTATTATACAGTTTCAAAGTCATCTTGTAATTTCTAAATCTT TAACCTTCATCAAAAAAGAATATTTTTTATTTGAATTAAATTGATTGTAC ATTCCACATCAATGAAAAAACAGTAGTTCTTGATGAAATATAAAGCAGAC TTTGAAGCTGTGTTCAAGCAGCATTAGTTGGGACCAGTTAAGTTTAAGGC TTATTGTATGAACAAAAGAAAAGGAAGATGAGTTGAGAGAAGGCTTGCCA GTCAGGTACAATTGATCTATTGGTGGACCCAGATACTGCAGTACATGTGA ATATTGTTATAGGGGGACTCAACTGGAGAGGAAAACTTAAAATTCCTGTT GATCAACTAATCTTGCTCAGTGTCACTGACAAAAAGAAGTGGATGCTACT TGAAACGTTTGACCATTTCCAAAATCACATCCAGTTGTTTGAGTAACTTC TCTTTGGTGTCTAACCTTCATCGACATAGCAGAGGAAAATGTTTTGGTTC TGTAGGAAATGTTTTTCAGAATTAGAAAAATAATTGTATTTGCAACTTGA CATTGAATTTGTCAACTTGACATTGAATTTGGACCCCCCTTTAAGAACAA GCACCAGATGTCTAAACCACAACAATCTCTCCCCATCTTTCTCAGATATA TTGATGGTATAATGAACAGAAAAGTAAACTCTATTTGAGCCTTTGGATCA AAAACAAAATGTGCATGAAACAGGCAATAACAAAAAGATAAACTTTTGGA GATATTATCCTCAATAACTAACCCATGACAACAGGATTTGATCAACCTAA TGCTGATAGGAAGATGGAGCATTCCAAAAGTCTTCTTTTTATTTTTGAAA AAGTACACAGAGGACCAAATGATACACTCTCTTAGCCTGGTTAACTTTCA AATTTATGACTTGATTTTATGGTTCCAAGTGCAGACGTTTTACTTATGGT ATTTTGTGGTGATTCACGCAATACATAACCCTGGTTGTTGAGGAAATGTT TTGATTGGCAGTTGTGAAGTTTTCTTGTTCATAAATACATGCTTAGTGTT GAAAAATGAAACTTAAGGGTCACTTAAATGACACTTAAAGGTCCTTTCCG TCCAGGTACTTACTTCACATTTTTTCCAAGCAGTTTGCCAATTTCATGGG ATTTACAATTCAAAAGTATCAATTCTGTGAGGTATCCAACTACATGGTAC AAATCATTGCAGTTTTACAAAATGTACATGAAGTTTTGACTATTCCACTT GACACTCTAGGAAAGGTGGAAAAGATGTTTTTAAAAGGACTTATGTTCCG GTTTGTTGACTTATTCATGGGACCATTCTTGTCCAAAAGTGTAAATGTTT TGAAAAAAAATGGATGCAACATCCTTGACAATGAGATTGTATAACCTGAC GTTCCTCGCAAGGAGGGATACAGATTGTAAGGAGGAGAGAAGGAATCTTC CATCTGATAATGTAAAGATGATATTTTGATATGCTGTATGTATGTGGTGA CTGATTGATACTTATTAACCCTAGGTAGACGAGGCTGCTAGTAGCAGAAT GTTTGGATTCTTTTGTCAGTGTTAATCCCATACGAGGGTGGCAAGTCGAC TATTTACAGGTTTGCGATAGCAAAACCTGTATTATGTCATAGTCTGTTTT ACTCAATGGGGACAACTGGTGACATAATTTGTAGGTTGTGGAAATATCAC GGAGTGTTTCTTTTTTCCAAATGTACATGAAATGAAAATATCTCCATTGC CCGCCCTCTATACGGATTACACTGACAGATCCCCTAGAAGAGTAGTTGTG TTTTTAAAAGTTTAAACGTGTAAACATTTGTTTTTAGAATTTTTGCATCA TTTTGTAACTAATTCATGGTATGACATTGATGTAAGTACAAGTACATTCC TAGGTGGCCACTAGATAAAGTGCTATAGTACCTTTGTAAGATGTTACACT GTGCTGAGTTAAGATTCCATCTGTGAGATACCTTTGCCATCTAAGACAGT GAAATTTGTTCCTCAAATTGAAACTCATATGGACTCAACATTCTAAAAGA AGACAATGCACAGAGACCAAAGAAAATGCTAGGAGGTATGTTTTCTATAA ACTTTGATAAAGATTCTTTAATGATGGTGGTCTACATAATGTTTCATCAC ATCCAAGGAATACCAGGTTTTTCAATTGTTGCTAGAAAATCTGGGGAAAA ATCATACCCTTCAATGAAAGGAAAAATCTTTCCCTTTCAGACCAGGGTGC TGAATTTCTTTTTGCATTGACTTGTGTACAAACACTTCATCTGGATATGT GTTTGGTCATTGAACAATCCAACATTGCCAACTCTTGCAGTGTTCATTAC TAATTGGAACTGTTGAAAAAATGATTTGAGATCCATTACTTATTATATCA GAAACTTTCTGTGTGTTGACATGATACCTAAGAAAGCAAGGCATCGTTAC CTTAGAGGAAATTTTGTAGATGTGTGGTCTCAACCAGTGCCATGTTAGAA GTGACCTGGCATCAGCTATGTAGATAGGGACTATCATTGATTTCGCTATT 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CATTCTAAAAGAAGACAATGCACAGAGACCAAAGAAAATGCTAGGAGGTA TGTTTTCTATAAACTTTGATAAAGATTCTTTAATGATGGTGGTCTACATA ATGTTTCATCACATCCAAGGAATACCAGGTTTTTCAATTGTTGCTAGAAA ATCTGGGGAAAAATCATACCCTTCAATGAAAGGAAAAATCTTTCCCTTTC AGACCAGGGTGCTGAATTTCTTTTTGCATTGACTTGTGTACAAACACTTC ATCTGGATATGTGTTTGGTCATTGAACAATCCAACATTGCCAACTCTTGC AGTGTTCATTACTAATTGGAACTGTTGAAAAAATGATTTGAGATCCATTA CTTATTATATCAGAAACTTTCTGTGTGTTGACATGATACCTANATTACTA ATTATATCAGAAACTTTCTGTGTGTTGACATGATACCTAAGAAAGCAAGG CATCGTTACCTTAGAGGAAATTTTGTAGATGTGTGGTCTCAACCAGTGCC ATGTTAGAAGTGACCTGGCATCAGCTATGTAGATAGGGACTATCATTGAT TTCGCTATTTTTGCAGTGTCTTCTATAGATATATTACTCTAATGCTGCTA TTAAACTATACATCCCTGTACTAATAGTATCTGTACAAGGACTCACTGTG TGTGGTAGTCCTTTATTATGCAATGTATTTCAAGTCCTGTCTGTCTTTGT CTAGATGTTACTGTTTTTTAAACCTTTGCCCTGGATAATGTTAGTCATTT TCNATAATGTCAGTCATTTTCCTACAGGAATTCCATGCCATTTTACCAGG GCTAGTTTTAAGTCACTACTCTGTGTTAAGACAGTGATAAAGTTGTGGAT TTGAGAACTTATGCGAAAAGAAGCCATGACTTTTTGATCAAGTATGTCAC GTCTGAGACTGGAACTTGTATACCACTAATGGCTTATGTGTTGATTTGTT TGGCATATACCGCTTGGAGGATGCCTATACCACTTGAAAGATGTCATCAG ATTTAAAAGTGGACCAACTGCTCATCTCTTGATGCCTAGAATTCGAAATT ATTCTCTAACATCCACATTTCATGCTTCTCTGATTTTGTACCAACACTAA CCAAATTGATGTTTCTTGTATATGTATGCTGAGGTCATTCTGTGTCATGC AGCCAGTTGAATGTACATGTATTCAAACTGAAGGCCTACTTTGCTGTAGA ACTACAAATTTCCAACCTGGAAATGTATTATAGTGAGTTCCTGTGCACTG TACAAACCACTGATTTTCAATTTGATATATTATATGACTAGTTCTCTGGA GCAACTTGTTTGTAATTTAAGAACCACTTGATCATTAGGACACATGAATG ATACCACCTGTTTTAAACAAACATAGCTTTCTTATGTTTTGCAATGGACA TGCCCACAATATATCTACATGTATGCTGATGAACTGAGTGTGGTTTGACT TCATTTCTGGACTCTTTCATATGCAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000201:11626..27352+

>Blg14243.7 ID=Blg14243.7|Name=Blg14243.7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=714bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:11626..27352+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCGGGAGGAAGATGTGGAGACAGCCATCAAGGTTGTCGTCGTGGGCAA
CGGGGCCGTGGGCAAGTCCAGCATGATCCAGCGCTACTGTAAAGGCATCT
TCACCAAGGACTACAAGAAAACCATCGGGGTGGACTTCCTAGAAAGACAA
ATAGAGGTGAACAATGAAGACATACGGTTAATGCTGTGGGACACAGCTGG
CCAGGAAGAGTTTGATGCTATCACAAAAGCATACTACAGAGGTGCTCAGG
CATGCGTGCTCGTCTTCTCCACAACAGACCGCCAGTCGTTCGAGGCGATA
GAATCTTGGAAGGGAAAGGTCGAAGATGAGTGCGGCGACATTCCCACGGT
CCTAGTACAGAACAAGATTGATCTGGTAGAGGACGCCAAAGTAGAGACGG
AGGAAGCAGACACCTTAGCAAAAAAGCTCAAACTTAGGTTTTACCGGACA
TCTGTCAAGGATAATCTCAATGTTGAAGACGTATTCAGGTATCTGGCTGA
CAAGTACCTGGAGAGGGTCCAGGCCATGGTGGAGGAGGAGCCACAGACCA
ACCAGCCCAAGATTGGCATGTTCAACACTGTCACAAGCAATGCCAACTCC
TCGGCAAAGAAGAAGGAGGACAATGGGACCATCACGTTGTCGGGACCCAA
CAAGCGCAGAACCCACGGGAAGAAGAACCCCCTGTCCATGCTGGGGAAGT
GCCAGTTGTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14243.7Blg14243.7-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:11626..11662Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:11626..11662Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:14466..14682Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:14466..14682Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:16585..16670Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:16585..16670Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:20033..20189Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:20033..20189Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:20617..20699Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:20617..20699Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:21365..21448Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:21365..21448Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:21961..27352Blg14243.7-exon-Sc0000201-1570713199:21961..27352Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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