Blg14243.2 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14243.2
Unique NameBlg14243.2
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000201:7180..27352+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14243.2 ID=Blg14243.2|Name=Blg14243.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=20173bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:7180..27352+ (Branchiostoma lanceolatum)
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AACCTGACGTTCCTCGCAAGGAGGGATACAGATTGTAAGGAGGAGAGAAG GAATCTTCCATCTGATAATGTAAAGATGATATTTTGATATGCTGTATGTA TGTGGTGACTGATTGATACTTATTAACCCTAGGTAGACGAGGCTGCTAGT AGCAGAATGTTTGGATTCTTTTGTCAGTGTTAATCCCATACGAGGGTGGC AAGTCGACTATTTACAGGTTTGCGATAGCAAAACCTGTATTATGTCATAG TCTGTTTTACTCAATGGGGACAACTGGTGACATAATTTGTAGGTTGTGGA AATATCACGGAGTGTTTCTTTTTTCCAAATGTACATGAAATGAAAATATC TCTATTCCCCGCCCTCTATACGGATTACACTGACAGATCCCCTAGAAGAG TAGTTGTGTTTTTAAAAGTTTAAACGTGTAAACATTTGTTTTTAGAATTT TTGCATCATTTTGTAACTAATTCATGGTATGACATTGATGTAAGTACAAG TACATTCCTAGGTGGCCACTAGATAAAGTGCTATAGTACCTTTGTAAGAT GTTACACTGTGCTGAGTTAAGATTCCATCTGTGAGATACCATTGCCATCT AAGACAGTGAAATTTGTTCCTCAAATTGAAACTCATATGGACTCAACATT CTAAAAGAAGACAATGCACAGAGACCAAAGAAAATGCTAGGAGGTATGTT TTCTATAAACTTTGATAAAGATTCTTTAATGATGGTGGTCTACATAATGT TTCATCACATCCAAGGAATACCAGGTTTTTCAATTGTTGCTAGAAAATCT GGGGAAAAATCATACCCTTCAATGAAAGGAAAAATCTTTCCCTTTCAGAC CAGGGTGCTGAATTTCTTTTTGCATTGACTTGTGTACAAACACTTCATCT GGATATGTGTTTGGTCATTGAACAATCCAACATTGCCAACTCTTGCAGTG TTCATTACTAATTGGAACTGTTGAAAAAATGATTTGAGATCCATTACTTA TTATATCAGAAACTTTCTGTGTGTTGACATGATACCTANATTACTAATTA TATCAGAAACTTTCTGTGTGTTGACATGATACCTAAGAAAGCAAGGCATC GTTACCTTAGAGGAAATTTTGTAGATGTGTGGTCTCAACCAGTGCCATGT TAGAAGTGACCTGGCATCAGCTATGTAGATAGGGACTATCATTGATTTCG CTATTTTTGCAGTGTCTTCTATAGATATATTACTCTAATGCTGCTATTAA ACTATACATCCCTGTACTAATAGTATCTGTACAAGGACTCACTGTGTGTG GTAGTCCTTTATTATGCAATGTATTTCAAGTCCTGTCTGTCTTTGTCTAG ATGTTACTGTTTTTTAAACCTTTGCCCTGGATAATGTTAGTCATTTTCNA TAATGTCAGTCATTTTCCTACAGGAATTCCATGCCATTTTACCAGGGCTA GTTTTAAGTCACTACTCTGTGTTAAGACAGTGATAAAGTTGTGGATTTGA GAACTTATGCGAAAAGAAGCCATGACTTTTTGATCAAGTATGTCACGTCT GAGACTGGAACTTGTATACCACTAATGGCTTATGTGTTGATTTGTTTGGC ATATACCGCTTGGAGGATGCCTATACCACTTGAAAGATGTCATCAGATTT AAAAGTGGACCAACTGCTCATCTCTTGATGCCTAGAATTCGAAATTATTC TCTAACATCCACATTTCATGCTTCTCTGATTTTGTACCAACACTAACCAA ATTGATGTTTCTTGTATATGTATGCTGAGGTCATTCTGTGTCATGCAGCC AGTTGAATGTACATGTATTCAAACTGAAGGCCTACTTTGCTGTAGAACTA CAAATTTCCAACCTGGAAATGTATTATAGTGAGTTCCTGTGCACTGTACA AACCACTGATTTTCAATTTGATATATTATATGACTAGTTCTCTGGAGCAA CTTGTTTGTAATTTAAGAACCACTTGATCATTAGGACACATGAATGATAC CACCTGTTTTAAACAAACATAGCTTTCTTATGTTTTGCAATGGACATGCC CACAATATATCTACATGTATGCTGATGAACTGAGTGTGGTTTGACTTCAT TTCTGGACTCTTTCATATGCAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000201:7180..27352+

>Blg14243.2 ID=Blg14243.2|Name=Blg14243.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=714bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:7180..27352+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCGGGAGGAAGATGTGGAGACAGCCATCAAGGTTGTCGTCGTGGGCAA
CGGGGCCGTGGGCAAGTCCAGCATGATCCAGCGCTACTGTAAAGGCATCT
TCACCAAGGACTACAAGAAAACCATCGGGGTGGACTTCCTAGAAAGACAA
ATAGAGGTGAACAATGAAGACATACGGTTAATGCTGTGGGACACAGCTGG
CCAGGAAGAGTTTGATGCTATCACAAAAGCATACTACAGAGGTGCTCAGG
CATGCGTGCTCGTCTTCTCCACAACAGACCGCCAGTCGTTCGAGGCGATA
GAATCTTGGAAGGGAAAGGTCGAAGATGAGTGCGGCGACATTCCCACGGT
CCTAGTACAGAACAAGATTGATCTGGTAGAGGACGCCAAAGTAGAGACGG
AGGAAGCAGACACCTTAGCAAAAAAGCTCAAACTTAGGTTTTACCGGACA
TCTGTCAAGGATAATCTCAATGTTGAAGACGTATTCAGGTATCTGGCTGA
CAAGTACCTGGAGAGGGTCCAGGCCATGGTGGAGGAGGAGCCACAGACCA
ACCAGCCCAAGATTGGCATGTTCAACACTGTCACAAGCAATGCCAACTCC
TCGGCAAAGAAGAAGGAGGACAATGGGACCATCACGTTGTCGGGACCCAA
CAAGCGCAGAACCCACGGGAAGAAGAACCCCCTGTCCATGCTGGGGAAGT
GCCAGTTGTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:7180..7713Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:7180..7713Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:14466..14682Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:14466..14682Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:16585..16670Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:16585..16670Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:20033..20189Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:20033..20189Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:20617..20699Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:20617..20699Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:21365..21448Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:21365..21448Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:21961..23745Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:21961..23745Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:25208..27352Blg14243.2-exon-Sc0000201-1570713199:25208..27352Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14243.2Blg14243.2-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000201genomeSc0000201:7180..27352 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14243