Blg14243.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14243.0
Unique NameBlg14243.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000201:4719..27306+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14243.0 ID=Blg14243.0|Name=Blg14243.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=22588bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:4719..27306+ (Branchiostoma lanceolatum)
NNTTGTGCCAGTTTCTGTGCTAAGTAGGTATTACACAACGCACATGTCTC TAGTCTAGTCACCGCCAAACGTTGTGACCGGCTTTGTTTACCCGAATACC AGGAAGAATTATTTTGTCGTGACGCCCAAACTCGGTGATCCTTTTTCATC CGTCGTGAAGTTTTTCTACGACAGACATTTGACGGAGCGGATCGACATGG ATCAGAAACCCGGTTCATTAGAGAAGACATACGTGACATTTGCAGTTGAG GACTAAGGTACTCAGTATCTGTCCAGCCCCGCATAGCATTTATTAGTCAC GTTTCCGTTCCCAAGAAACAATAATAGATTGATTCGATATGCAGACGGTC GGCTAGTTGCCTGGTGCCAGATCAAGGATTAGGATGTAGGAAGATGGTTC AATCATTATCACAGAGATTAGAGTCAGTTTTCCGCATATGCTATGGTGAT TAGTTAGGTTGGATTATATCAAATGTGCTCTCCTGTACTTACTCATGTAT GACAAAAATTCACTGCTATTATTATTAATGTTTATGTTACTTTGATGCTC AGGACTTGTGTTCATAATTTGCTCTCAGTCTCTGCTCCTACATGGATGTC CATGATGTAATAGGGAAGTGTGATAGCCACCACAGTTACCTTGGACATGT GAAAACAAATCTTCTCATAATTTGCATACCCTACTCATTGTATTTTATCA CTTGTCAAAATTCCACATTGGCATATATATCATATGTGCAACAGTGCAAC TGAACTAACATCAATCCACAACCACGCCCCTCCCCCTCCCTCCATCTTTG TGTCCCTCCCACATTTGTATATTTTGTGTACCTATACTGGTATACACTAG CTTGAGCCAGTAATGACGTACATGTAGTAATAATGACGAGCCTGCCATTG TCTATCCTGTTGCTTCTCCCTGCCAATCTGTGTTGCCGCTCAGTTCCTTA 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TACCTGGAAATGCTCAGAATAGAGGGAATCAAACAAGAAAAAAGTAGAGT GAAGGAATTAGGTGGTGAACATTTTAGATAAAAAATTTTGTTCCAAATAG TGATTACTGTATCCTAATACTAGTTCATTCATTTGTCCTCAGGCATGTTC AACACTGTCACAAGCAATGCCAACTCCTCGGCAAAGAAGAAGGAGGACAA TGGGACCATCACGTTGTCGGGACCCAACAAGCGCAGAACCCACGGGAAGA AGAACCCCCTGTCCATGCTGGGGAAGTGCCAGTTGTTGTGATGTCTCATC CCCACCCACAGGCCCATCATATTCAATGCTGCATTCTGATGGGATAACAA GATGGTTTCATATTTTCCAGAGAGACCCTCTGTACAAAATATATCCAGGA ATGGGGCTCTTGAAAAGGCTTCTCAGTCGGAGAACAGGGCAACATTTGCA TACTGAGCTTTTTGTACATGTGCTGTAAGCTTTGTAGTCACTGAGAGTTT TTGCTAGGATCTTTCATTATGCAACTAAAACAAAGTGCAGTTGTCCCACA TTTTGTACAATGGACTTATTATACAGTTTCAAAGTCATCTTGTAATTTCT AAATCTTTAACCTTCATCAAAAAAGAATATTTTTTATTTGAATTAAATTG ATTGTACATTCCACATCAATGAAAAAACAGTAGTTCTTGATGAAATATAA AGCAGACTTTGAAGCTGTGTTCAAGCAGCATTAGTTGGGACCAGTTAAGT TTAAGGCTTATTGTATGAACAAAAGAAAAGGAAGATGAGTTGAGAGAAGG CTTGCCAGTCAGGTACAATTGATCTATTGGTGGACCCAGATACTGCAGTA CATGTGAATATTGTTATAGGGGGACTCAACTGGAGAGGAAAACTTAAAAT TCCTGTTGATCAACTAATCTTGCTCAGTGTCACTGACAAAAAGAAGTGGA TGCTACTTGAAACGTTTGACCATTTCCAAAATCACATCCAGTTGTTTGAG TAACTTCTCTTTGGTGTCTAACCTTCATCGACATAGCAGAGGAAAATGTT TTGGTTCTGTAGGAAATGTTTTTCAGAATTAGAAAAATAATTGTATTTGC AACTTGACATTGAATTTGTCAACTTGACATTGAATTTGGACCCCCCTTTA AGAACAAGCACCAGATGTCTAAACCACAACAATCTCTCCCCATCTTTCTC AGATATATTGATGGTATAATGAACAGAAAAGTAAACTCTATTTGAGCCTT TGGATCAAAAACAAAATGTGCATGAAACAGGCAATAACAAAAAGATAAAC TTTTGGAGATATTATCCTCAATAACTAACCCATGACAACAGGATTTGATC AACCTAATGCTGATAGGAAGATGGAGCATTCCAAAAGTCTTCTTTTTATT TTTGAAAAAGTACACAGAGGACCAAATGATACACTCTCTTAGCCTGGTTA ACTTTCAAATTTATGACTTGATTTTATGGTTCCAAGTGCAGACGTTTTAC TTATGGTATTTTGTGGTGATTCACGCAATACATAACCCTGGTTGTTGAGG AAATGTTTTGATTGGCAGTTGTGAAGTTTTCTTGTTCATAAATACATGCT TAGTGTTGAAAAATGAAACTTAAGGGTCACTTAAATGACACTTAAAGGTC CTTTCCGTCCAGGTACTTACTTCACATTTTTTCCAAGCAGTTTGCCAATT TCATGGGATTTACAATTCAAAAGTATCAATTCTGTGAGGTATCCAACTAC ATGGTACAAATCATTGCAGTTTTACAAAATGTACATGAAGTTTTGACTAT TCCACTTGACACTCTAGGAAAGGTGGAAAAGATGTTTTTAAAAGGACTTA TGTTCCGGTTTGTTGACTTATTCATGGGACCATTCTTGTCCAAAAGTGTA AATGTTTTGAAAAAAAATGGATGCAACATCCTTGACAATGAGATTGTATA ACCTGACGTTCCTCGCAAGGAGGGATACAGATTGTAAGGAGGAGAGAAGG AATCTTCCATCTGATAATGTAAAGATGATATTTTGATATGCTGTATGTAT GTGGTGACTGATTGATACTTATTAACCCTAGGTAGACGAGGCTGCTAGTA GCAGAATGTTTGGATTCTTTTGTCAGTGTTAATCCCATACGAGGGTGGCA AGTCGACTATTTACAGGTTTGCGATAGCAAAACCTGTATTATGTCATAGT CTGTTTTACTCAATGGGGACAACTGGTGACATAATTTGTAGGTTGTGGAA ATATCACGGAGTGTTTCTTTTTTCCAAATGTACATGAAATGAAAATATCT CCATTGCCCGCCCTCTATACGGATTACACTGACAGATCCCCTAGAAGAGT AGTTGTGTTTTTAAAAGTTTAAACGTGTAAACATTTGTTTTTAGAATTTT TGCATCATTTTGTAACTAATTCATGGTATGACATTGATGTAAGTACAAGT ACATTCCTAGGTGGCCACTAGATAAAGTGCTATAGTACCTTTGTAAGATG TTACACTGTGCTGAGTTAAGATTCCATCTGTGAGATACCTTTGCCATCTA AGACAGTGAAATTTGTTCCTCAAATTGAAACTCATATGGACTCAACATTC TAAAAGAAGACAATGCACAGAGACCAAAGAAAATGCTAGGAGGTATGTTT TCTATAAACTTTGATAAAGATTCTTTAATGATGGTGGTCTACATAATGTT TCATCACATCCAAGGAATACCAGGTTTTTCAATTGTTGCTAGAAAATCTG GGGAAAAATCATACCCTTCAATGAAAGGAAAAATCTTTCCCTTTCAGACC AGGGTGCTGAATTTCTTTTTGCATTGACTTGTGTACAAACACTTCATCTG GATATGTGTTTGGTCATTGAACAATCCAACATTGCCAACTCTTGCAGTGT TCATTACTAATTGGAACTGTTGAAAAAATGATTTGAGATCCATTACTTAT TATATCAGAAACTTTCTGTGTGTTGACATGATACCTAAGAAAGCAAGGCA TCGTTACCTTAGAGGAAATTTTGTAGATGTGTGGTCTCAACCAGTGCCAT GTTAGAAGTGACCTGGCATCAGCTATGTAGATAGGGACTATCATTGATTT CGCTATTTTTGCAGTGTCTTCTATAGATATATTACTCTAATGCTGCTATT TAACTATACATCCCTGTACTAATAGTATCTGTACAAGGACTCACTGTGTG TGGTAGTCCTTTATTATGCAATGTATTTCAAGTCCTGTCTGTCTTTGTCT AGATGTTACTGTTTTTTAAACCTTTGCCCTGGATAATGTCAGTCATTTTC CTACAGGAATTCCATGCCATTTTACCAGGGCTAGTTTTAAGGCACCACTC TGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAAATGGATGCAACATCCTTGACAA TGAGATTGTATAACCTGACGTTCCTCGCAAGGAGGGATACAGATTGTAAG GAGGAGAGAAGGAATCTTCCATCTGATAATGTAAAGATGATATTTTGATA TGCTGTATGTATGTGGTGACTGATTGATACTTATTAACCCTAGGTAGACG AGGCTGCTAGTAGCAGAATGTTTGGATTCTTTTGTCAGTGTTAATCCCAT ACGAGGGTGGCAAGTCGACTATTTACAGGTTTGCGATAGCAAAACCTGTA TTATGTCATAGTCTGTTTTACTCAATGGGGACAACTGGTGACATAATTTG TAGGTTGTGGAAATATCACGGAGTGTTTCTTTTTTCCAAATGTACATGAA ATGAAAATATCTCTATTCCCCGCCCTCTATACGGATTACACTGACAGATC CCCTAGAAGAGTAGTTGTGTTTTTAAAAGTTTAAACGTGTAAACATTTGT TTTTAGAATTTTTGCATCATTTTGTAACTAATTCATGGTATGACATTGAT GTAAGTACAAGTACATTCCTAGGTGGCCACTAGATAAAGTGCTATAGTAC CTTTGTAAGATGTTACACTGTGCTGAGTTAAGATTCCATCTGTGAGATAC CATTGCCATCTAAGACAGTGAAATTTGTTCCTCAAATTGAAACTCATATG GACTCAACATTCTAAAAGAAGACAATGCACAGAGACCAAAGAAAATGCTA GGAGGTATGTTTTCTATAAACTTTGATAAAGATTCTTTAATGATGGTGGT CTACATAATGTTTCATCACATCCAAGGAATACCAGGTTTTTCAATTGTTG CTAGAAAATCTGGGGAAAAATCATACCCTTCAATGAAAGGAAAAATCTTT CCCTTTCAGACCAGGGTGCTGAATTTCTTTTTGCATTGACTTGTGTACAA ACACTTCATCTGGATATGTGTTTGGTCATTGAACAATCCAACATTGCCAA CTCTTGCAGTGTTCATTACTAATTGGAACTGTTGAAAAAATGATTTGAGA TCCATTACTTATTATATCAGAAACTTTCTGTGTGTTGACATGATACCTAN ATTACTAATTATATCAGAAACTTTCTGTGTGTTGACATGATACCTAAGAA AGCAAGGCATCGTTACCTTAGAGGAAATTTTGTAGATGTGTGGTCTCAAC CAGTGCCATGTTAGAAGTGACCTGGCATCAGCTATGTAGATAGGGACTAT CATTGATTTCGCTATTTTTGCAGTGTCTTCTATAGATATATTACTCTAAT GCTGCTATTAAACTATACATCCCTGTACTAATAGTATCTGTACAAGGACT CACTGTGTGTGGTAGTCCTTTATTATGCAATGTATTTCAAGTCCTGTCTG TCTTTGTCTAGATGTTACTGTTTTTTAAACCTTTGCCCTGGATAATGTTA GTCATTTTCNATAATGTCAGTCATTTTCCTACAGGAATTCCATGCCATTT TACCAGGGCTAGTTTTAAGTCACTACTCTGTGTTAAGACAGTGATAAAGT TGTGGATTTGAGAACTTATGCGAAAAGAAGCCATGACTTTTTGATCAAGT ATGTCACGTCTGAGACTGGAACTTGTATACCACTAATGGCTTATGTGTTG ATTTGTTTGGCATATACCGCTTGGAGGATGCCTATACCACTTGAAAGATG TCATCAGATTTAAAAGTGGACCAACTGCTCATCTCTTGATGCCTAGAATT CGAAATTATTCTCTAACATCCACATTTCATGCTTCTCTGATTTTGTACCA ACACTAACCAAATTGATGTTTCTTGTATATGTATGCTGAGGTCATTCTGT GTCATGCAGCCAGTTGAATGTACATGTATTCAAACTGAAGGCCTACTTTG CTGTAGAACTACAAATTTCCAACCTGGAAATGTATTATAGTGAGTTCCTG TGCACTGTACAAACCACTGATTTTCAATTTGATATATTATATGACTAGTT CTCTGGAGCAACTTGTTTGTAATTTAAGAACCACTTGATCATTAGGACAC ATGAATGATACCACCTGTTTTAAACAAACATAGCTTTCTTATGTTTTGCA ATGGACATGCCCACAATATATCTACATGTATGCTGATG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000201:4719..27306+

>Blg14243.0 ID=Blg14243.0|Name=Blg14243.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=714bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:4719..27306+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCGGGAGGAAGATGTGGAGACAGCCATCAAGGTTGTCGTCGTGGGCAA
CGGGGCCGTGGGCAAGTCCAGCATGATCCAGCGCTACTGTAAAGGCATCT
TCACCAAGGACTACAAGAAAACCATCGGGGTGGACTTCCTAGAAAGACAA
ATAGAGGTGAACAATGAAGACATACGGTTAATGCTGTGGGACACAGCTGG
CCAGGAAGAGTTTGATGCTATCACAAAAGCATACTACAGAGGTGCTCAGG
CATGCGTGCTCGTCTTCTCCACAACAGACCGCCAGTCGTTCGAGGCGATA
GAATCTTGGAAGGGAAAGGTCGAAGATGAGTGCGGCGACATTCCCACGGT
CCTAGTACAGAACAAGATTGATCTGGTAGAGGACGCCAAAGTAGAGACGG
AGGAAGCAGACACCTTAGCAAAAAAGCTCAAACTTAGGTTTTACCGGACA
TCTGTCAAGGATAATCTCAATGTTGAAGACGTATTCAGGTATCTGGCTGA
CAAGTACCTGGAGAGGGTCCAGGCCATGGTGGAGGAGGAGCCACAGACCA
ACCAGCCCAAGATTGGCATGTTCAACACTGTCACAAGCAATGCCAACTCC
TCGGCAAAGAAGAAGGAGGACAATGGGACCATCACGTTGTCGGGACCCAA
CAAGCGCAGAACCCACGGGAAGAAGAACCCCCTGTCCATGCTGGGGAAGT
GCCAGTTGTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:4719..4975Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:4719..4975Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:14466..14682Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:14466..14682Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:16585..16670Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:16585..16670Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:20033..20189Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:20033..20189Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:20617..20699Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:20617..20699Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:21365..21448Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:21365..21448Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:21961..24795Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:21961..24795Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:26305..26618Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:26305..26618Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:26639..27306Blg14243.0-exon-Sc0000201-1570713199:26639..27306Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14243.0Blg14243.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000201genomeSc0000201:4719..27306 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14243