Blg14241.15 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14241.15
Unique NameBlg14241.15
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000201:238916..277623+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14241.15 ID=Blg14241.15|Name=Blg14241.15|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=38708bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:238916..277623+ (Branchiostoma lanceolatum)
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ACCACACCATGGCTACTGTCAGGGACAAAATATATGTCATCGGTGGGAAC CATACGAAGGGTTAGTATGTCTGTATACAGTGTACTAGTTTGCAAGAAAA ACCGTATTATCATTAGTAACATCATAATTTCAACATAACTGTTTGTTTTT TTGCCATGTGGAAAGTCTGAAAGTTTTGATTATGATTAGATTTGAATATA ACAGTGTTCTTGTTGACTGCATGGAAAAATGGTCACTGTTGTTACCTCCC TCAAAATGGAGTTACTGTTTCCAGTCTGTGTTTGTTCATGTTGATGTGTG TCTGTAGTTATTTGGATACTGTTGTGTGATAGGATGTAAGGCGGAAGATG GTGCAACCAGAGATTGTCAGGATGGTAATTTTTGCTTGGCCTGGCTCCAA GGTTAGTCCCCACAGGCTGTCAGGAAAAAGCATCATAACTAATATTTGAC AGTGGTCTTGTGGGACCACTTTTCGAAGTGGCTGCCCAGGGGTGGAAATG GGTCTGTTGGCAAGAAATTCACAATTTGTGAATAAAGAGAGAAGTTCACA AAACACAAATATTTCTCAGAGGTATATGAGATCTTTGATTTTTGTGTTTG TGCAGGTAACCAGTGTATAGATGTGCTGATTGTGGAGTCTTACTGCCCAG AGAGCGACACCTGGTCCACAGTGGCTCCCATCATGGAGGGGCGGACAGGG CCGGGCATTGCTGTGCTAGATCGCAAGGTTTGTTTCTTCTGTTCTTTAGA TTTTGATCTCAGCATCATTGGGTGTCATGATTTTTACTGTAAAGGAATAT AAGACACTCTTAAGACAATGTATTGTTGAGGAGAGCCATGAAATGTGTAC GAGTTACTTGAAAACATGTGGTGAACAGATACTGCTAGAATAATGGTCAT TACCAGACTACTGTACCTGTAACATTTTGCCCTCCTGTGTAAACTACGGG AGCTAAGTAAACTTGCGATGGACCGGGCAAAGTGGAGAGATTTGAAGAAA GACTGAATGCAGCTGCAGGGTGTTCAGACTACTGAAGCAGCAGAACAAAG TGGACTACTACTGTAACACATCTGTGATGTTTCTCCCATATCAACAGGTG TTTGTAGTGGGAGGGTACAGCTGGAATGATGGGCAGTACCAGACCACTGT CCAGTACCACACTTATAACATTTTTCCCTTCCTATGTAACACATCTGTGA TATTTCCCCCATGTTCCCAGGTTTTTGTAGTGGGCGGGTACAGCTGGAAT GATGGACAGTATCAGACCACCGTGCAGTGCTACAACACGGAGGACGACAA GTGGGACTATGAGGGGGAGTTACCCGAGGCCCTGGCGGGCGTGTCCTGCA TGACCCTTGACCTTCCACATCATCTCGCTGCATTTTAAGAGACAGCAGAA GAAAGTAGCTGGACCACATGGAAGGGGTCCAATACCTTTCTTTGTTTTCT CCCTTCATGAGTTTAACCTTCTCCCTGCTGCCTAACCTGGTAACCAAATG GCTACCTGTTAGCAGTTGAAGGTAAAGTAAGTTGCTTTTGTGTATGCACT TAAGTTTACATTGTTATCCCCTACCACCTGCTTGATTTTTTTTTTAAATC CTTAGCGTCTTTGCATGTCTTTCTTACCACAAGTGCAAGGGGGCGCTTTT GATCCATGACAGCAGCTCCCTTATAAGAGTTGTACCAGGTTTATCCATTC AAGTTTCATGTTTTGCAAACATGATTAATATTTAATCTAACCCATTGTGG AAACATTTTGTGTTGTTCTGGCTGCCCTTGGTGCAGCTAACTGTTGCATG TCTGAATTATGTTATTAAACATCGTTTGATATCCCTGAAAGTTATACCAA AGAGTCTATATAACCTCCTTGGTTATACCTATGAACATTCCATGAGTTGC TCAAGACATTGAAGAATATATATGGCTGAAGTCCTGTATTGTATTGTTTA TTGCAAATAGTAGATACCATAGGATAGGACTTTCATGTGTTTTCCTTATT TTTTAGGAGTCTATAGCTTCTTTTAATGCTGATTCTTTGAAGGAATACAA TCTCAACCATGGCATTGAATAAACAACATGCACTTTCAAATTTTGAACAC TTATGGCTATTTATACAGGGACCCATACATATATATCTTACTTCAAACAT TTGTCAAATATTCTCACTTCTATGGGCATGTATAAGACAACAGAATCATT CAGTATATCTGTGAAATCTACAAGAATAGGTTGTACCACAACATTGCATT TTGTCCATTCTCAACCACGACATACCAACCAGTACAAAATGCTCATTTAA CAACTACAATACTGTACTTATAACTATAGTGTACAAGCTGATCTCAACAT ACAGGGTACATGTAGTTATTGCTCAACCATGACAACAATGCCTCTTTATT ATAAAGCAGGATCCAATCTGTCATATTTATTAAGAGTATGAATCATGACA ACAGACTTGATTTGATCAATATCAGTATTCCATTATCCTATAGTAAAATG TATCTTGTCATTCACATCAGAAGCAGGCTTACCATTTTTGTACTATTTTT GGGAAGAAAAGTTGCTATTTTGTGAAAAGTGAATCGAGAGAAGTAATGAT TATGTAGCAGTGACAAAGTTTGTGCAACATTTTGCTGCAGTACAAACAAC TGACATTAGTTCTAGTAGTTGTAGGAAATTCATGTAGTTATTATATACGG TGAAAATCTAAAGTTGCAATGTTGATGTTGACTAATGCTGTCAGAACTGG ACTATTGCCTCCATGACAAAGGTTAAAAACCATATTATATGTTTGGACAT TTATAACATACAGGCTTAGACATTGACATGGGAAGAAGTATGGAAAGTGG TGGTAATATTAGATATTTCAATNCAGAACTGGACTATTGCCTCCATGACA AAGGTTAAAAACCATATTATATGTTTGGACATTCATAACATACAGGCTTA GACATTGACATGGGAAGAAGTATGGAAAGTGGTGGTAATATTAGATATTT CAATATGTACATACACAAAATTGCAAGTACGACACTATAATTCCATATGC CATTTGACTTGAACATTAAATGGTACATTTGTTCAAGTTGCTCAGTCTCC TTAGAATACTTTTGTTGAAGGTGAACAGACAGCTACCACAGTCTTCATTT CCATTGTCATGTCTTTTGTGAGATGTTTGCCTTCAATACCTGTCTTTCCT TGACCTGAACACAATTAACAAAATTGCCAAAACCCAGGAATCTGATAACC TTGTCTTGTCAGTATGTTGACTGGAGAATATAGTTGTGCAAAACAAAAAT ATTGTGCTTTCACTAAGCCATTTAAGGAACCAAAATGGGCATCTAATCTA TGTGGATTGAAATGGATTTTCTGTGAAATTTGATATTGTACATTGTACCT AAATACACACTTGGGAGAGGTATTTGTTTGTCTGTCTTCTAAGAAGCTTT TAGCTTCTTCTGTAAGTGGTACCTTCATTGTATAAATGTTCAATAGTAAT ATTGAAGTACCTATGTCTGTATAAATGTGTAATAAATATATTATACCCTT GTACTCTA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000201:238916..277623+

>Blg14241.15 ID=Blg14241.15|Name=Blg14241.15|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1917bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:238916..277623+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCAGGGCGACTCGGCAGACACCACCACCGGAATCATCGCCCAACAATG
GAAGCGGATGCGGCGAGACCTGGGCGACTCCGCCAACCACATGCTCATCT
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GCAGACAAGGTCTTGTGTGACTTTGTCATAGTGGCAGAGAAGCAGAGCTT
TGCCGTGCACAAGGCCGTTCTGGCTTCAAGTAGCGACTACTTCAAGGCCC
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GGGGTGACAGCGGCCGGACTGTTCGCAGTGGTCGAGTATCTCTACACGTC
AAACCTCACCCTCAGTCTGGGGAACGTGGAGGAAGTGCTGGTAGCTGCCA
ACATCCTTGTCATACCCTCTGTCATCAAACTCTGCTCCGAGTACCTCAAC
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GTTCAACCTACGCGAAACCAAAGACTTGGCCACGAAGTGCTTCATCCAAC
AGTTCCAGGACCTCAGTCTGGAGGAGATTCTCGACGTGCTCGAGAGCGAC
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CGAAAATTCGCTTTCCCCTCATCCCCGCGTCGGACTTGGTGGAGCACGTT
CAGACCGTAGACTTTATGAAGAACGAACCCGTGTGTCAGAAACTGCTTCT
CGACGCCATGAACTATCATCTCATGCCGCTGCGGCAAGTGGTACTGCAGT
CGCCGACCACGAGACTCAGATGTCGCAAGCAGGCCATCTTGGCAGTCGGA
GGAATACCAAAGGCTGGGGACCAGTCTGTCAACAACCCTCTCCACTTCTA
CAACGAGGAGAAGCGAGCGTGGGTCCCGCTGACCGTCATGCCGTACAAGA
CGGGACACCAGTGTGTAGCCGTCATCAACAACTTCCTCTTTGTGGCAGGT
GGTGAGGACAGATGGGACCCTGAGGGGAAGTACAGCGTGAACTCTGTCAG
CCGCTACGACCCCAGGTTCAACACCTGGCTGCAGGTGGCCCCCATGAACG
AGAGACGGTCCTGTTTCTACATGGGCAGTGTGGACGGACATCTGTACGCC
ATAGGAGGCAGAAATGCGGATGGCTATGTTGCCAGTGTGGAGTGTTACAG
CCCTGACAAGAATGAGTGGAAACATGTCACCAACATGGAGAAGCCCTGTG
CTGCTCACGCGGGCACTGTGTGGGACGGAAAAGTCTTCATATCAGGAGGG
GCTGTGTATGGGGACTTTGTGAACACCATGAGCACCTACGACCCCACAGA
GAACCAGTGGGACACCAAGGCTGTGATGGGGACCAAGCGGGCCCACCACA
CCATGGCTACTGTCAGGGACAAAATATATGTCATCGGTGGGAACCATACG
AAGGGTAACCAGTGTATAGATGTGCTGATTGTGGAGTCTTACTGCCCAGA
GAGCGACACCTGGTCCACAGTGGCTCCCATCATGGAGGGGCGGACAGGGC
CGGGCATTGCTGTGCTAGATCGCAAGGTGTTTGTAGTGGGAGGGTACAGC
TGGAATGATGGGCAGTACCAGACCACTGTCCAGTACCACACTTATAACAT
TTTTCCCTTCCTATGTAACACATCTGTGATATTTCCCCCATGTTCCCAGG
TTTTTGTAGTGGGCGGGTACAGCTGGAATGATGGACAGTATCAGACCACC
GTGCAGTGCTACAACACGGAGGACGACAAGTGGGACTATGAGGGGGAGTT
ACCCGAGGCCCTGGCGGGCGTGTCCTGCATGACCCTTGACCTTCCACATC
ATCTCGCTGCATTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14241.15Blg14241.15-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:255371..255568Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:255371..255568Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:258329..259045Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:258329..259045Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:261218..261353Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:261218..261353Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:266021..266176Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:266021..266176Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:273317..273457Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:273317..273457Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:273967..274125Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:273967..274125Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:274671..274792Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:274671..274792Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:275163..277623Blg14241.15-exon-Sc0000201-1570713199:275163..277623Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000201genomeSc0000201:238916..277623 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14241