Blg14241.13 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14241.13
Unique NameBlg14241.13
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000201:237105..277623+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14241.13 ID=Blg14241.13|Name=Blg14241.13|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=40519bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:237105..277623+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GATGTATGTAAACTAATAACTGTGAAGAAATGCTAATTGTGCCCAAACTG TTTTCTGCAAGTTTGGTAAATGCAATATACATGAGAGGAAAGATTGCATA ACATACCAAAGCAGGAAGAAAAGCCTTGTCTTTTCCCCTGATTTAGTATG CATGTATGTAGCAATAAACTTTACTGTGACCCCATCACAAGCGTTATCAT ACATTCTATTCCACCTTTAAGTTAATTGTTTCTTTGGACATTTAATGTTA TAGGTGACATTTGCTCCATGTAACAATAAAAGGGTAATGAAAAGGTAGAC TCCTCCCTTGCAGTTTATGGCTCATGTTTTATGACTGCGGAATGATGCTT TACAGAGCTTCCATGCCATTGATTTTGGCTCTTGAATGTTATGTACAGAG AACAAGTTGTAGAGTAGCCTTAGGTCAAGTCATGAGAGGCACTACTGTCC ATTTGTAGGTTCAGGAAGACACAGCGCATGCCCAAAATCCTAGTGGTGTA TTCCTAGATTGGCATGAGGCCCTCTAAAGCCGATGTTACACTGTCAATGA CCTGTGAACAAACTTGGTCATCACCATTAGGTTTTCCAACGTAAAAATCA TCAGAGATCCGAGTATATTTTTGGTTGAAAATCACATGACCTGCAAATAT CAGCCGATACTTATAAATATGCAGTAAACGAGAGGCATATAGTTCCAAAG GTGTCCTTTTAGAGCTCTCAGACATATCGCGCAAGCTATTGTCCTGCTCT GTGACACTGGCTTAATGTCAGCAACCCAATAGCCTGCAGAACTTTAATGG TCGGACTGGGATTTGAACCACCAACCACTTGGTCCAGACGGCTTACCACA CAGAAGACTCCAGAAGGCTATAGCGTAGAAATTCTATTATAGTCTGCATG TACATGTCATGTGATTGCACACATTTTAATTGACCCAACTATTATTTTTC CTCAAAAGGTATAAACCTTTTAGTTAGTATCATGCAGAAATTTTTAAAGT ACAGGGCCAGGAATCTATTGCCATAATGTTTTTTTCTTACATTGCACTTT CTGTGTCTTCAGGAGGCAGAAATGCGGATGGCTATGTTGCCAGTGTGGAG TGTTACAGCCCTGACAAGAATGAGTGGAAACATGTCACCAACATGGAGAA GCCCTGTGCTGCTCACGCGGGCACTGTGTGGGACGGAAAAGTCTTCATAT CAGGTAAACCAAATATGCCTTAAGTTTGCTAATTTCCCTACTATCCACAC TTCTTGTGTCAGATTTGAATGTATGCCTCAGATTAAAAGTACAATTTTGT GTTTGTGCAAGTACAGTAGGTTTTAAACCTCCTTGGTTTGTGGTAGGGTG TGGGTTGTCACTGCAATTCAACAAAACATTGCTAGAGGTCATGTATGAAT TCATAAAGTTGCACTTCTCGTCAAATTGCCTAACAGTTGCAGTTCTCAAA AAGGGAAGGTGTTTGCACTAAACAGAACTTATTGTCACAGCCTGGACATA ATCACGAGACAGTTTACATTTAACATTAAAGGCAGCTTCTTAAAACTTTA CCAACTTTGTTAACCATCATCATCATGTCGGGCGGGTTGCCCGGACTAAG TCAACCCTCTTCCTCCAGTTGCTACGGTCCACCATTAAGTGCTCTTTGTC AACCAAGGAGTGAATTTATTAGTCAGCTGGTAATAAGGATGAAATGCTGC TCTTATCTACAGGAGGGGCTGTGTATGGGGACTTTGTGAACACCATGAGC ACCTACGACCCCACAGAGAACCAGTGGGACACCAAGGCTGTGATGGGGAC CAAGCGGGCCCACCACACCATGGCTACTGTCAGGGACAAAATATATGTCA TCGGTGGGAACCATACGAAGGGTTAGTATGTCTGTATACAGTGTACTAGT TTGCAAGAAAAACCGTATTATCATTAGTAACATCATAATTTCAACATAAC TGTTTGTTTTTTTGCCATGTGGAAAGTCTGAAAGTTTTGATTATGATTAG ATTTGAATATAACAGTGTTCTTGTTGACTGCATGGAAAAATGGTCACTGT TGTTACCTCCCTCAAAATGGAGTTACTGTTTCCAGTCTGTGTTTGTTCAT GTTGATGTGTGTCTGTAGTTATTTGGATACTGTTGTGTGATAGGATGTAA GGCGGAAGATGGTGCAACCAGAGATTGTCAGGATGGTAATTTTTGCTTGG CCTGGCTCCAAGGTTAGTCCCCACAGGCTGTCAGGAAAAAGCATCATAAC TAATATTTGACAGTGGTCTTGTGGGACCACTTTTCGAAGTGGCTGCCCAG GGGTGGAAATGGGTCTGTTGGCAAGAAATTCACAATTTGTGAATAAAGAG AGAAGTTCACAAAACACAAATATTTCTCAGAGGTATATGAGATCTTTGAT TTTTGTGTTTGTGCAGGTAACCAGTGTATAGATGTGCTGATTGTGGAGTC TTACTGCCCAGAGAGCGACACCTGGTCCACAGTGGCTCCCATCATGGAGG GGCGGACAGGGCCGGGCATTGCTGTGCTAGATCGCAAGGTTTGTTTCTTC TGTTCTTTAGATTTTGATCTCAGCATCATTGGGTGTCATGATTTTTACTG TAAAGGAATATAAGACACTCTTAAGACAATGTATTGTTGAGGAGAGCCAT GAAATGTGTACGAGTTACTTGAAAACATGTGGTGAACAGATACTGCTAGA ATAATGGTCATTACCAGACTACTGTACCTGTAACATTTTGCCCTCCTGTG TAAACTACGGGAGCTAAGTAAACTTGCGATGGACCGGGCAAAGTGGAGAG ATTTGAAGAAAGACTGAATGCAGCTGCAGGGTGTTCAGACTACTGAAGCA GCAGAACAAAGTGGACTACTACTGTAACACATCTGTGATGTTTCTCCCAT ATCAACAGGTGTTTGTAGTGGGAGGGTACAGCTGGAATGATGGGCAGTAC CAGACCACTGTCCAGTACCACACTTATAACATTTTTCCCTTCCTATGTAA CACATCTGTGATATTTCCCCCATGTTCCCAGGTTTTTGTAGTGGGCGGGT ACAGCTGGAATGATGGACAGTATCAGACCACCGTGCAGTGCTACAACACG GAGGACGACAAGTGGGACTATGAGGGGGAGTTACCCGAGGCCCTGGCGGG CGTGTCCTGCATGACCCTTGACCTTCCACATCATCTCGCTGCATTTTAAG AGACAGCAGAAGAAAGTAGCTGGACCACATGGAAGGGGTCCAATACCTTT CTTTGTTTTCTCCCTTCATGAGTTTAACCTTCTCCCTGCTGCCTAACCTG GTAACCAAATGGCTACCTGTTAGCAGTTGAAGGTAAAGTAAGTTGCTTTT GTGTATGCACTTAAGTTTACATTGTTATCCCCTACCACCTGCTTGATTTT TTTTTTAAATCCTTAGCGTCTTTGCATGTCTTTCTTACCACAAGTGCAAG GGGGCGCTTTTGATCCATGACAGCAGCTCCCTTATAAGAGTTGTACCAGG TTTATCCATTCAAGTTTCATGTTTTGCAAACATGATTAATATTTAATCTA ACCCATTGTGGAAACATTTTGTGTTGTTCTGGCTGCCCTTGGTGCAGCTA ACTGTTGCATGTCTGAATTATGTTATTAAACATCGTTTGATATCCCTGAA AGTTATACCAAAGAGTCTATATAACCTCCTTGGTTATACCTATGAACATT CCATGAGTTGCTCAAGACATTGAAGAATATATATGGCTGAAGTCCTGTAT TGTATTGTTTATTGCAAATAGTAGATACCATAGGATAGGACTTTCATGTG TTTTCCTTATTTTTTAGGAGTCTATAGCTTCTTTTAATGCTGATTCTTTG AAGGAATACAATCTCAACCATGGCATTGAATAAACAACATGCACTTTCAA ATTTTGAACACTTATGGCTATTTATACAGGGACCCATACATATATATCTT ACTTCAAACATTTGTCAAATATTCTCACTTCTATGGGCATGTATAAGACA ACAGAATCATTCAGTATATCTGTGAAATCTACAAGAATAGGTTGTACCAC AACATTGCATTTTGTCCATTCTCAACCACGACATACCAACCAGTACAAAA TGCTCATTTAACAACTACAATACTGTACTTATAACTATAGTGTACAAGCT GATCTCAACATACAGGGTACATGTAGTTATTGCTCAACCATGACAACAAT GCCTCTTTATTATAAAGCAGGATCCAATCTGTCATATTTATTAAGAGTAT GAATCATGACAACAGACTTGATTTGATCAATATCAGTATTCCATTATCCT ATAGTAAAATGTATCTTGTCATTCACATCAGAAGCAGGCTTACCATTTTT GTACTATTTTTGGGAAGAAAAGTTGCTATTTTGTGAAAAGTGAATCGAGA GAAGTAATGATTATGTAGCAGTGACAAAGTTTGTGCAACATTTTGCTGCA GTACAAACAACTGACATTAGTTCTAGTAGTTGTAGGAAATTCATGTAGTT ATTATATACGGTGAAAATCTAAAGTTGCAATGTTGATGTTGACTAATGCT GTCAGAACTGGACTATTGCCTCCATGACAAAGGTTAAAAACCATATTATA TGTTTGGACATTTATAACATACAGGCTTAGACATTGACATGGGAAGAAGT ATGGAAAGTGGTGGTAATATTAGATATTTCAATNCAGAACTGGACTATTG CCTCCATGACAAAGGTTAAAAACCATATTATATGTTTGGACATTCATAAC ATACAGGCTTAGACATTGACATGGGAAGAAGTATGGAAAGTGGTGGTAAT ATTAGATATTTCAATATGTACATACACAAAATTGCAAGTACGACACTATA ATTCCATATGCCATTTGACTTGAACATTAAATGGTACATTTGTTCAAGTT GCTCAGTCTCCTTAGAATACTTTTGTTGAAGGTGAACAGACAGCTACCAC AGTCTTCATTTCCATTGTCATGTCTTTTGTGAGATGTTTGCCTTCAATAC CTGTCTTTCCTTGACCTGAACACAATTAACAAAATTGCCAAAACCCAGGA ATCTGATAACCTTGTCTTGTCAGTATGTTGACTGGAGAATATAGTTGTGC AAAACAAAAATATTGTGCTTTCACTAAGCCATTTAAGGAACCAAAATGGG CATCTAATCTATGTGGATTGAAATGGATTTTCTGTGAAATTTGATATTGT ACATTGTACCTAAATACACACTTGGGAGAGGTATTTGTTTGTCTGTCTTC TAAGAAGCTTTTAGCTTCTTCTGTAAGTGGTACCTTCATTGTATAAATGT TCAATAGTAATATTGAAGTACCTATGTCTGTATAAATGTGTAATAAATAT ATTATACCCTTGTACTCTA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000201:237105..277623+

>Blg14241.13 ID=Blg14241.13|Name=Blg14241.13|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1917bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:237105..277623+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCAGGGCGACTCGGCAGACACCACCACCGGAATCATCGCCCAACAATG
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GCAGACAAGGTCTTGTGTGACTTTGTCATAGTGGCAGAGAAGCAGAGCTT
TGCCGTGCACAAGGCCGTTCTGGCTTCAAGTAGCGACTACTTCAAGGCCC
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AAACCTCACCCTCAGTCTGGGGAACGTGGAGGAAGTGCTGGTAGCTGCCA
ACATCCTTGTCATACCCTCTGTCATCAAACTCTGCTCCGAGTACCTCAAC
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GTTCAACCTACGCGAAACCAAAGACTTGGCCACGAAGTGCTTCATCCAAC
AGTTCCAGGACCTCAGTCTGGAGGAGATTCTCGACGTGCTCGAGAGCGAC
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CGAAAATTCGCTTTCCCCTCATCCCCGCGTCGGACTTGGTGGAGCACGTT
CAGACCGTAGACTTTATGAAGAACGAACCCGTGTGTCAGAAACTGCTTCT
CGACGCCATGAACTATCATCTCATGCCGCTGCGGCAAGTGGTACTGCAGT
CGCCGACCACGAGACTCAGATGTCGCAAGCAGGCCATCTTGGCAGTCGGA
GGAATACCAAAGGCTGGGGACCAGTCTGTCAACAACCCTCTCCACTTCTA
CAACGAGGAGAAGCGAGCGTGGGTCCCGCTGACCGTCATGCCGTACAAGA
CGGGACACCAGTGTGTAGCCGTCATCAACAACTTCCTCTTTGTGGCAGGT
GGTGAGGACAGATGGGACCCTGAGGGGAAGTACAGCGTGAACTCTGTCAG
CCGCTACGACCCCAGGTTCAACACCTGGCTGCAGGTGGCCCCCATGAACG
AGAGACGGTCCTGTTTCTACATGGGCAGTGTGGACGGACATCTGTACGCC
ATAGGAGGCAGAAATGCGGATGGCTATGTTGCCAGTGTGGAGTGTTACAG
CCCTGACAAGAATGAGTGGAAACATGTCACCAACATGGAGAAGCCCTGTG
CTGCTCACGCGGGCACTGTGTGGGACGGAAAAGTCTTCATATCAGGAGGG
GCTGTGTATGGGGACTTTGTGAACACCATGAGCACCTACGACCCCACAGA
GAACCAGTGGGACACCAAGGCTGTGATGGGGACCAAGCGGGCCCACCACA
CCATGGCTACTGTCAGGGACAAAATATATGTCATCGGTGGGAACCATACG
AAGGGTAACCAGTGTATAGATGTGCTGATTGTGGAGTCTTACTGCCCAGA
GAGCGACACCTGGTCCACAGTGGCTCCCATCATGGAGGGGCGGACAGGGC
CGGGCATTGCTGTGCTAGATCGCAAGGTGTTTGTAGTGGGAGGGTACAGC
TGGAATGATGGGCAGTACCAGACCACTGTCCAGTACCACACTTATAACAT
TTTTCCCTTCCTATGTAACACATCTGTGATATTTCCCCCATGTTCCCAGG
TTTTTGTAGTGGGCGGGTACAGCTGGAATGATGGACAGTATCAGACCACC
GTGCAGTGCTACAACACGGAGGACGACAAGTGGGACTATGAGGGGGAGTT
ACCCGAGGCCCTGGCGGGCGTGTCCTGCATGACCCTTGACCTTCCACATC
ATCTCGCTGCATTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14241.13Blg14241.13-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:258329..259045Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:258329..259045Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:261218..261353Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:261218..261353Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:266021..266176Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:266021..266176Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:273317..273457Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:273317..273457Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:273967..274125Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:273967..274125Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:274671..274792Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:274671..274792Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:275163..277623Blg14241.13-exon-Sc0000201-1570713199:275163..277623Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000201genomeSc0000201:237105..277623 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14241