Blg14241.12 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14241.12
Unique NameBlg14241.12
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000201:251325..277623+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14241.12 ID=Blg14241.12|Name=Blg14241.12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=26299bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:251325..277623+ (Branchiostoma lanceolatum)
CCTATTTCTAAAAACAAGTAAGACAGTTTTGTTTTCTTGTTAAAGGTCCT CACTTTTGAACTGCTCTCACTATAACTTTGCAAAATTTACAAAGCTGTTG TTCTTGATGGGAAACAGAGGAATCCACCTGTTTAAAGGACTTAATATTCA TTGCTTGATTTGATTGGATTGTCAAGAGACTAAATAGAATTAGATCCGGA GAATCAATTAATTATGAATTAATGACGTACTTAGGTATCGCGTATCAGAT CTGATATGAATTATTCATACATTCAGTGTCACTCATTTTCCTGTCAGAGC ACAAGACGGGGTTGTATTCATAAAGTAGAAAAACAACATTTATTAGAATT TTTTTATTATTCTTGACAAATGAATATTAGTGGTAATTTTGAAAGTTGAG TCCTCTGTACAACCTGACAACCAAGACAGAAAATAGAAGATGGACTTAAA AAAAAAAATTACATCCCTCTCCCTCAGTTATTTTTGGTCCATCCCATTCA TATCCAGACTACGTAGCTCTTGTTTATGTTTATTGTTTTTCTAGTCATTG CTCATGCGTAACTCCCTGGTATTGTGAGGCAGGCCCTGGTATTATTTTGT ATTATGGCTAGCAGTAAGAAACCCAAATTTCTTGTGCTTTGTTTATACAT TCATAGCAGTTTTATGAATGGAAATATTGATATTAGTGTTTAGAGAGCAG AAAATACAGATATAGAAATATGATGATGATGATATAGAAATATGTATGAA TGGAAAGTATTTTTGACCCAAGTTTATGACAGCTGTAAAGTATTTGAGCT AAGAGGGACCCAGGGACCTCTCTCACACCAGCTTTGTAGTCTCAGGGTGC CGTCAGTTTGTCTGAGACAGTTTGGAGAGTTGTGTTGAGGTGTGTGCAGC GGTGCGTGCAGCCAGGAGAAATCAGGTACAGGTGGGAGAGAGAGGTTGTT 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ATTATGATGTTGAAGATTCTGAAGTAAAGCTGTGATGTGTTAGGAACACC CTTATTTACATTACACTGTAAATTTATAAAAGATAGTTTCAACTTATTTA CTATGCAAGAATGTGTGAAGAATCATGTCATCAATTGTTCAAAAGATAAA AGTGATCACTACAGGTGCAGAGGGCAAAAATCACAATGTCTAGCATTTGA AGCCATTGTGCTAACTTTTTATTTCTTTGTCAAGATATGGGATCACTGTT TGTAAGTCAATTTCTGCATTCTCTACAACATCAAAATCACAAAGTATGGT AGAAAATTAGTGATGCAATGTATTTGTGCTGATTAAGAAAAAAGCTGTCA AACTGCCACCTTAAAAGATTGGCAGTTAACATCTACCAACATAATTCCAC CAGGGTACATAATTCCGCCACCCTGAAAAGATACTTCCAAACAGATCTCC AACCCAACATCTAGTATAATGCACTCCTGTATGTTTAAACTGTGCATACT TGGGGGGTGCTGCAGTACAGATCTCTAAAACCCACTGTTCTTCAAAGTGG TAGGTTTATCTAACCCCGTGGATTAATGTTAATGGAGTTTTGTTCTAACT GTGGAACATGCATTATCTTGATTCACCTCCGACTCAGTAAAGCATCTCTG TGTTAATTTGTTTCATTGATAAATGTGTGCCGTCAAAAATTGCATGTTTT ACTGCTATAACCATCTAACGGGTGCAACTGTCATTAAAAGCAATGAATGT GTCTATTACTTATCAGACTTAACTTCCATTGAGGGAACCATTACGTCTTT AACTTCATGTCAGAGAGAAGGGTGTCTTCGCGCTGCTATTGATTGAATCA GTCATTTTTATTGCCTGAGTATGGCAAATTAGCAGCCCATTCATCACCCT GACACTGATTATACCTGCACAAGGCAGGAGACAGCTCTATAATGAAGCAA 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AAAAAAGAAAATCAATTCAAAATAAGGTAGGATGTATGTAAACTAATAAC TGTGAAGAAATGCTAATTGTGCCCAAACTGTTTTCTGCAAGTTTGGTAAA TGCAATATACATGAGAGGAAAGATTGCATAACATACCAAAGCAGGAAGAA AAGCCTTGTCTTTTCCCCTGATTTAGTATGCATGTATGTAGCAATAAACT TTACTGTGACCCCATCACAAGCGTTATCATACATTCTATTCCACCTTTAA GTTAATTGTTTCTTTGGACATTTAATGTTATAGGTGACATTTGCTCCATG TAACAATAAAAGGGTAATGAAAAGGTAGACTCCTCCCTTGCAGTTTATGG CTCATGTTTTATGACTGCGGAATGATGCTTTACAGAGCTTCCATGCCATT GATTTTGGCTCTTGAATGTTATGTACAGAGAACAAGTTGTAGAGTAGCCT TAGGTCAAGTCATGAGAGGCACTACTGTCCATTTGTAGGTTCAGGAAGAC ACAGCGCATGCCCAAAATCCTAGTGGTGTATTCCTAGATTGGCATGAGGC CCTCTAAAGCCGATGTTACACTGTCAATGACCTGTGAACAAACTTGGTCA TCACCATTAGGTTTTCCAACGTAAAAATCATCAGAGATCCGAGTATATTT TTGGTTGAAAATCACATGACCTGCAAATATCAGCCGATACTTATAAATAT GCAGTAAACGAGAGGCATATAGTTCCAAAGGTGTCCTTTTAGAGCTCTCA GACATATCGCGCAAGCTATTGTCCTGCTCTGTGACACTGGCTTAATGTCA GCAACCCAATAGCCTGCAGAACTTTAATGGTCGGACTGGGATTTGAACCA CCAACCACTTGGTCCAGACGGCTTACCACACAGAAGACTCCAGAAGGCTA TAGCGTAGAAATTCTATTATAGTCTGCATGTACATGTCATGTGATTGCAC 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GTAGATACCATAGGATAGGACTTTCATGTGTTTTCCTTATTTTTTAGGAG TCTATAGCTTCTTTTAATGCTGATTCTTTGAAGGAATACAATCTCAACCA TGGCATTGAATAAACAACATGCACTTTCAAATTTTGAACACTTATGGCTA TTTATACAGGGACCCATACATATATATCTTACTTCAAACATTTGTCAAAT ATTCTCACTTCTATGGGCATGTATAAGACAACAGAATCATTCAGTATATC TGTGAAATCTACAAGAATAGGTTGTACCACAACATTGCATTTTGTCCATT CTCAACCACGACATACCAACCAGTACAAAATGCTCATTTAACAACTACAA TACTGTACTTATAACTATAGTGTACAAGCTGATCTCAACATACAGGGTAC ATGTAGTTATTGCTCAACCATGACAACAATGCCTCTTTATTATAAAGCAG GATCCAATCTGTCATATTTATTAAGAGTATGAATCATGACAACAGACTTG ATTTGATCAATATCAGTATTCCATTATCCTATAGTAAAATGTATCTTGTC ATTCACATCAGAAGCAGGCTTACCATTTTTGTACTATTTTTGGGAAGAAA AGTTGCTATTTTGTGAAAAGTGAATCGAGAGAAGTAATGATTATGTAGCA GTGACAAAGTTTGTGCAACATTTTGCTGCAGTACAAACAACTGACATTAG TTCTAGTAGTTGTAGGAAATTCATGTAGTTATTATATACGGTGAAAATCT AAAGTTGCAATGTTGATGTTGACTAATGCTGTCAGAACTGGACTATTGCC TCCATGACAAAGGTTAAAAACCATATTATATGTTTGGACATTTATAACAT ACAGGCTTAGACATTGACATGGGAAGAAGTATGGAAAGTGGTGGTAATAT TAGATATTTCAATNCAGAACTGGACTATTGCCTCCATGACAAAGGTTAAA AACCATATTATATGTTTGGACATTCATAACATACAGGCTTAGACATTGAC ATGGGAAGAAGTATGGAAAGTGGTGGTAATATTAGATATTTCAATATGTA CATACACAAAATTGCAAGTACGACACTATAATTCCATATGCCATTTGACT TGAACATTAAATGGTACATTTGTTCAAGTTGCTCAGTCTCCTTAGAATAC TTTTGTTGAAGGTGAACAGACAGCTACCACAGTCTTCATTTCCATTGTCA TGTCTTTTGTGAGATGTTTGCCTTCAATACCTGTCTTTCCTTGACCTGAA CACAATTAACAAAATTGCCAAAACCCAGGAATCTGATAACCTTGTCTTGT CAGTATGTTGACTGGAGAATATAGTTGTGCAAAACAAAAATATTGTGCTT TCACTAAGCCATTTAAGGAACCAAAATGGGCATCTAATCTATGTGGATTG AAATGGATTTTCTGTGAAATTTGATATTGTACATTGTACCTAAATACACA CTTGGGAGAGGTATTTGTTTGTCTGTCTTCTAAGAAGCTTTTAGCTTCTT CTGTAAGTGGTACCTTCATTGTATAAATGTTCAATAGTAATATTGAAGTA CCTATGTCTGTATAAATGTGTAATAAATATATTATACCCTTGTACTCTA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000201:251325..277623+

>Blg14241.12 ID=Blg14241.12|Name=Blg14241.12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1917bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:251325..277623+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCAGGGCGACTCGGCAGACACCACCACCGGAATCATCGCCCAACAATG
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TGCCGTGCACAAGGCCGTTCTGGCTTCAAGTAGCGACTACTTCAAGGCCC
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AAACCTCACCCTCAGTCTGGGGAACGTGGAGGAAGTGCTGGTAGCTGCCA
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AGTTCCAGGACCTCAGTCTGGAGGAGATTCTCGACGTGCTCGAGAGCGAC
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CGAAAATTCGCTTTCCCCTCATCCCCGCGTCGGACTTGGTGGAGCACGTT
CAGACCGTAGACTTTATGAAGAACGAACCCGTGTGTCAGAAACTGCTTCT
CGACGCCATGAACTATCATCTCATGCCGCTGCGGCAAGTGGTACTGCAGT
CGCCGACCACGAGACTCAGATGTCGCAAGCAGGCCATCTTGGCAGTCGGA
GGAATACCAAAGGCTGGGGACCAGTCTGTCAACAACCCTCTCCACTTCTA
CAACGAGGAGAAGCGAGCGTGGGTCCCGCTGACCGTCATGCCGTACAAGA
CGGGACACCAGTGTGTAGCCGTCATCAACAACTTCCTCTTTGTGGCAGGT
GGTGAGGACAGATGGGACCCTGAGGGGAAGTACAGCGTGAACTCTGTCAG
CCGCTACGACCCCAGGTTCAACACCTGGCTGCAGGTGGCCCCCATGAACG
AGAGACGGTCCTGTTTCTACATGGGCAGTGTGGACGGACATCTGTACGCC
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CCCTGACAAGAATGAGTGGAAACATGTCACCAACATGGAGAAGCCCTGTG
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GCTGTGTATGGGGACTTTGTGAACACCATGAGCACCTACGACCCCACAGA
GAACCAGTGGGACACCAAGGCTGTGATGGGGACCAAGCGGGCCCACCACA
CCATGGCTACTGTCAGGGACAAAATATATGTCATCGGTGGGAACCATACG
AAGGGTAACCAGTGTATAGATGTGCTGATTGTGGAGTCTTACTGCCCAGA
GAGCGACACCTGGTCCACAGTGGCTCCCATCATGGAGGGGCGGACAGGGC
CGGGCATTGCTGTGCTAGATCGCAAGGTGTTTGTAGTGGGAGGGTACAGC
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TTTTTGTAGTGGGCGGGTACAGCTGGAATGATGGACAGTATCAGACCACC
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ATCTCGCTGCATTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14241.12Blg14241.12-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:258329..259045Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:258329..259045Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:261218..261353Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:261218..261353Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:266021..266176Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:266021..266176Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:273317..273457Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:273317..273457Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:273967..274125Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:273967..274125Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:274671..274792Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:274671..274792Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:275163..277623Blg14241.12-exon-Sc0000201-1570713199:275163..277623Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000201genomeSc0000201:251325..277623 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14241