Blg14241.11 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14241.11
Unique NameBlg14241.11
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000201:236028..277623+

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg14241.11 ID=Blg14241.11|Name=Blg14241.11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=41596bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:236028..277623+ (Branchiostoma lanceolatum)
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ATTTTTATTGCCTGAGTATGGCAAATTAGCAGCCCATTCATCACCCTGAC ACTGATTATACCTGCACAAGGCAGGAGACAGCTCTATAATGAAGCAATAA ATGAAACGTAATGAAGCACAGAAGAGACTGCACTTGGTAAATTTGATGGT CGCCAACGTTGGACACGAAAATTGGACACACCTGCCGGCTTCACACCCGG CCGGTTCCCGCGCCGGGAGAGGTCGCGGGAGCGCACGTGAAGTAGCGCTG TGACATTTAGACTCCGCGTCAACAGTTGTTTTGTGGGATAATGGAGCAAT GATAAAGAAAGGTTGTGGCCCGCCCACCGCTGGAAATAGAGGGGATGCTC GGCACTTAACTGTCCGTGCGGCTTGTAATGGCCGCGACCTCCTGACACAT GACAGGTAGTCCTGTCACACCTTGTCAGCAAACGGCCATGGTCCAGGTTT AAACAAAGTCAGGTTCACGTGAAGATGACAGAATGTAGCAATACTGCTTT ATTAAACTGTGTGATAAGGTGCGAAGGCAAATCAGTTATGAGTGTAGGTT ACTTTATGGGTGACTCTCACTCAGCCAACAGTGGACCCATGTTTCAAAGT TTGACTGCTAGGAAACCCTGCCATCTTAAGTAATAAAAGAAATGAAAGGT GTTCAAATAATTGAATTATTTCAACTCCTAGTCATTGATGTTATCATCAG CAAGTTTTGTCCATCAACTTAGATAAACAACTGTTACAGCACTATTTTCT GCTGCTGAGTTTGATGAACAGTAAGATCTGCAAGTACAAAAAGTTTTGCA GCTGTTAGTCTTGATGTGTGCATAGTCTCCAATTTTGTTGTTTAAATTTG TAAATTGAATGTACAATGTGTACATAGTGCTTATAATCTTGACCTTATAA AGGTCACCTCTTTACCTTTCAGGTGAAAACAAAAATGATTAAGATGTTGT GATTAGGCTATAGGGGAGTCACTACATGTACTTATCACTTTGGTATTGTT TCGGTAGAAAGTAACAACTGGATTCTCATAGGCTAAGGTCATGGTTAAAA AAAGAAAATCAATTCAAAATAAGGTAGGATGTATGTAAACTAATAACTGT GAAGAAATGCTAATTGTGCCCAAACTGTTTTCTGCAAGTTTGGTAAATGC AATATACATGAGAGGAAAGATTGCATAACATACCAAAGCAGGAAGAAAAG CCTTGTCTTTTCCCCTGATTTAGTATGCATGTATGTAGCAATAAACTTTA CTGTGACCCCATCACAAGCGTTATCATACATTCTATTCCACCTTTAAGTT AATTGTTTCTTTGGACATTTAATGTTATAGGTGACATTTGCTCCATGTAA CAATAAAAGGGTAATGAAAAGGTAGACTCCTCCCTTGCAGTTTATGGCTC ATGTTTTATGACTGCGGAATGATGCTTTACAGAGCTTCCATGCCATTGAT TTTGGCTCTTGAATGTTATGTACAGAGAACAAGTTGTAGAGTAGCCTTAG GTCAAGTCATGAGAGGCACTACTGTCCATTTGTAGGTTCAGGAAGACACA GCGCATGCCCAAAATCCTAGTGGTGTATTCCTAGATTGGCATGAGGCCCT CTAAAGCCGATGTTACACTGTCAATGACCTGTGAACAAACTTGGTCATCA CCATTAGGTTTTCCAACGTAAAAATCATCAGAGATCCGAGTATATTTTTG GTTGAAAATCACATGACCTGCAAATATCAGCCGATACTTATAAATATGCA GTAAACGAGAGGCATATAGTTCCAAAGGTGTCCTTTTAGAGCTCTCAGAC ATATCGCGCAAGCTATTGTCCTGCTCTGTGACACTGGCTTAATGTCAGCA ACCCAATAGCCTGCAGAACTTTAATGGTCGGACTGGGATTTGAACCACCA ACCACTTGGTCCAGACGGCTTACCACACAGAAGACTCCAGAAGGCTATAG CGTAGAAATTCTATTATAGTCTGCATGTACATGTCATGTGATTGCACACA TTTTAATTGACCCAACTATTATTTTTCCTCAAAAGGTATAAACCTTTTAG TTAGTATCATGCAGAAATTTTTAAAGTACAGGGCCAGGAATCTATTGCCA TAATGTTTTTTTCTTACATTGCACTTTCTGTGTCTTCAGGAGGCAGAAAT GCGGATGGCTATGTTGCCAGTGTGGAGTGTTACAGCCCTGACAAGAATGA GTGGAAACATGTCACCAACATGGAGAAGCCCTGTGCTGCTCACGCGGGCA CTGTGTGGGACGGAAAAGTCTTCATATCAGGTAAACCAAATATGCCTTAA GTTTGCTAATTTCCCTACTATCCACACTTCTTGTGTCAGATTTGAATGTA TGCCTCAGATTAAAAGTACAATTTTGTGTTTGTGCAAGTACAGTAGGTTT TAAACCTCCTTGGTTTGTGGTAGGGTGTGGGTTGTCACTGCAATTCAACA AAACATTGCTAGAGGTCATGTATGAATTCATAAAGTTGCACTTCTCGTCA AATTGCCTAACAGTTGCAGTTCTCAAAAAGGGAAGGTGTTTGCACTAAAC AGAACTTATTGTCACAGCCTGGACATAATCACGAGACAGTTTACATTTAA CATTAAAGGCAGCTTCTTAAAACTTTACCAACTTTGTTAACCATCATCAT CATGTCGGGCGGGTTGCCCGGACTAAGTCAACCCTCTTCCTCCAGTTGCT ACGGTCCACCATTAAGTGCTCTTTGTCAACCAAGGAGTGAATTTATTAGT CAGCTGGTAATAAGGATGAAATGCTGCTCTTATCTACAGGAGGGGCTGTG TATGGGGACTTTGTGAACACCATGAGCACCTACGACCCCACAGAGAACCA 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GTACCTGTAACATTTTGCCCTCCTGTGTAAACTACGGGAGCTAAGTAAAC TTGCGATGGACCGGGCAAAGTGGAGAGATTTGAAGAAAGACTGAATGCAG CTGCAGGGTGTTCAGACTACTGAAGCAGCAGAACAAAGTGGACTACTACT GTAACACATCTGTGATGTTTCTCCCATATCAACAGGTGTTTGTAGTGGGA GGGTACAGCTGGAATGATGGGCAGTACCAGACCACTGTCCAGTACCACAC TTATAACATTTTTCCCTTCCTATGTAACACATCTGTGATATTTCCCCCAT GTTCCCAGGTTTTTGTAGTGGGCGGGTACAGCTGGAATGATGGACAGTAT CAGACCACCGTGCAGTGCTACAACACGGAGGACGACAAGTGGGACTATGA GGGGGAGTTACCCGAGGCCCTGGCGGGCGTGTCCTGCATGACCCTTGACC TTCCACATCATCTCGCTGCATTTTAAGAGACAGCAGAAGAAAGTAGCTGG ACCACATGGAAGGGGTCCAATACCTTTCTTTGTTTTCTCCCTTCATGAGT TTAACCTTCTCCCTGCTGCCTAACCTGGTAACCAAATGGCTACCTGTTAG CAGTTGAAGGTAAAGTAAGTTGCTTTTGTGTATGCACTTAAGTTTACATT GTTATCCCCTACCACCTGCTTGATTTTTTTTTTAAATCCTTAGCGTCTTT GCATGTCTTTCTTACCACAAGTGCAAGGGGGCGCTTTTGATCCATGACAG CAGCTCCCTTATAAGAGTTGTACCAGGTTTATCCATTCAAGTTTCATGTT TTGCAAACATGATTAATATTTAATCTAACCCATTGTGGAAACATTTTGTG TTGTTCTGGCTGCCCTTGGTGCAGCTAACTGTTGCATGTCTGAATTATGT TATTAAACATCGTTTGATATCCCTGAAAGTTATACCAAAGAGTCTATATA ACCTCCTTGGTTATACCTATGAACATTCCATGAGTTGCTCAAGACATTGA AGAATATATATGGCTGAAGTCCTGTATTGTATTGTTTATTGCAAATAGTA GATACCATAGGATAGGACTTTCATGTGTTTTCCTTATTTTTTAGGAGTCT ATAGCTTCTTTTAATGCTGATTCTTTGAAGGAATACAATCTCAACCATGG CATTGAATAAACAACATGCACTTTCAAATTTTGAACACTTATGGCTATTT ATACAGGGACCCATACATATATATCTTACTTCAAACATTTGTCAAATATT CTCACTTCTATGGGCATGTATAAGACAACAGAATCATTCAGTATATCTGT GAAATCTACAAGAATAGGTTGTACCACAACATTGCATTTTGTCCATTCTC AACCACGACATACCAACCAGTACAAAATGCTCATTTAACAACTACAATAC TGTACTTATAACTATAGTGTACAAGCTGATCTCAACATACAGGGTACATG TAGTTATTGCTCAACCATGACAACAATGCCTCTTTATTATAAAGCAGGAT CCAATCTGTCATATTTATTAAGAGTATGAATCATGACAACAGACTTGATT TGATCAATATCAGTATTCCATTATCCTATAGTAAAATGTATCTTGTCATT CACATCAGAAGCAGGCTTACCATTTTTGTACTATTTTTGGGAAGAAAAGT TGCTATTTTGTGAAAAGTGAATCGAGAGAAGTAATGATTATGTAGCAGTG ACAAAGTTTGTGCAACATTTTGCTGCAGTACAAACAACTGACATTAGTTC TAGTAGTTGTAGGAAATTCATGTAGTTATTATATACGGTGAAAATCTAAA GTTGCAATGTTGATGTTGACTAATGCTGTCAGAACTGGACTATTGCCTCC ATGACAAAGGTTAAAAACCATATTATATGTTTGGACATTTATAACATACA GGCTTAGACATTGACATGGGAAGAAGTATGGAAAGTGGTGGTAATATTAG ATATTTCAATNCAGAACTGGACTATTGCCTCCATGACAAAGGTTAAAAAC CATATTATATGTTTGGACATTCATAACATACAGGCTTAGACATTGACATG GGAAGAAGTATGGAAAGTGGTGGTAATATTAGATATTTCAATATGTACAT ACACAAAATTGCAAGTACGACACTATAATTCCATATGCCATTTGACTTGA ACATTAAATGGTACATTTGTTCAAGTTGCTCAGTCTCCTTAGAATACTTT TGTTGAAGGTGAACAGACAGCTACCACAGTCTTCATTTCCATTGTCATGT CTTTTGTGAGATGTTTGCCTTCAATACCTGTCTTTCCTTGACCTGAACAC AATTAACAAAATTGCCAAAACCCAGGAATCTGATAACCTTGTCTTGTCAG TATGTTGACTGGAGAATATAGTTGTGCAAAACAAAAATATTGTGCTTTCA CTAAGCCATTTAAGGAACCAAAATGGGCATCTAATCTATGTGGATTGAAA TGGATTTTCTGTGAAATTTGATATTGTACATTGTACCTAAATACACACTT GGGAGAGGTATTTGTTTGTCTGTCTTCTAAGAAGCTTTTAGCTTCTTCTG TAAGTGGTACCTTCATTGTATAAATGTTCAATAGTAATATTGAAGTACCT ATGTCTGTATAAATGTGTAATAAATATATTATACCCTTGTACTCTA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000201:236028..277623+

>Blg14241.11 ID=Blg14241.11|Name=Blg14241.11|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1839bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000201:236028..277623+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GGATGCGGCGAGACCTGGGCGACTCCGCCAACCACATGCTCATCTCGGAC
CCCGCACATGCCCAGAAGGTCCTGGAGGGCTTCCACGCACTGCGGGCAGA
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GACAGCGGCCGGACTGTTCGCAGTGGTCGAGTATCTCTACACGTCAAACC
TCACCCTCAGTCTGGGGAACGTGGAGGAAGTGCTGGTAGCTGCCAACATC
CTTGTCATACCCTCTGTCATCAAACTCTGCTCCGAGTACCTCAACCAACA
GATAGCGTCCAACACGTGCATGGAAGTCGCCAGCATCGCCGCCATGTTCA
ACCTACGCGAAACCAAAGACTTGGCCACGAAGTGCTTCATCCAACAGTTC
CAGGACCTCAGTCTGGAGGAGATTCTCGACGTGCTCGAGAGCGACCAGGA
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ACCGCGATCGGGAAAACCGGATGCAGCACGCGGCCACGCTCATGACGAAA
ATTCGCTTTCCCCTCATCCCCGCGTCGGACTTGGTGGAGCACGTTCAGAC
CGTAGACTTTATGAAGAACGAACCCGTGTGTCAGAAACTGCTTCTCGACG
CCATGAACTATCATCTCATGCCGCTGCGGCAAGTGGTACTGCAGTCGCCG
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ACCAAAGGCTGGGGACCAGTCTGTCAACAACCCTCTCCACTTCTACAACG
AGGAGAAGCGAGCGTGGGTCCCGCTGACCGTCATGCCGTACAAGACGGGA
CACCAGTGTGTAGCCGTCATCAACAACTTCCTCTTTGTGGCAGGTGGTGA
GGACAGATGGGACCCTGAGGGGAAGTACAGCGTGAACTCTGTCAGCCGCT
ACGACCCCAGGTTCAACACCTGGCTGCAGGTGGCCCCCATGAACGAGAGA
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AGGCAGAAATGCGGATGGCTATGTTGCCAGTGTGGAGTGTTACAGCCCTG
ACAAGAATGAGTGGAAACATGTCACCAACATGGAGAAGCCCTGTGCTGCT
CACGCGGGCACTGTGTGGGACGGAAAAGTCTTCATATCAGGAGGGGCTGT
GTATGGGGACTTTGTGAACACCATGAGCACCTACGACCCCACAGAGAACC
AGTGGGACACCAAGGCTGTGATGGGGACCAAGCGGGCCCACCACACCATG
GCTACTGTCAGGGACAAAATATATGTCATCGGTGGGAACCATACGAAGGG
TAACCAGTGTATAGATGTGCTGATTGTGGAGTCTTACTGCCCAGAGAGCG
ACACCTGGTCCACAGTGGCTCCCATCATGGAGGGGCGGACAGGGCCGGGC
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AGTGGGACTATGAGGGGGAGTTACCCGAGGCCCTGGCGGGCGTGTCCTGC
ATGACCCTTGACCTTCCACATCATCTCGCTGCATTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:258329..259045Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:258329..259045Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:261218..261353Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:261218..261353Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:266021..266176Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:266021..266176Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:273317..273457Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:273317..273457Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:273967..274125Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:273967..274125Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:274671..274792Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:274671..274792Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:275286..277623Blg14241.11-exon-Sc0000201-1570713199:275286..277623Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14241.11Blg14241.11-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000201genomeSc0000201:236028..277623 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14241