Blg14228.14 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14228.14
Unique NameBlg14228.14
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000124:248679..265411-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14228.14 ID=Blg14228.14|Name=Blg14228.14|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=16733bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000124:248679..265411- (Branchiostoma lanceolatum)
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CAGACACCATGGCGGGTGGAACTATGGCGTTGGACAGCTCCCTGGTCATC GATGGCATAATATCAATGCCACCACCTCGATCCCTCTCAGCAGGTTAGCA TCTTTTACATTGTCATTTGTTCCAGTTGACATATTTTTGTGTGTTGTGTA AGTGTTATAAGTCTGAAGCTGGAATATTTATACGCTTCGAGATGCACGGG AAAACCCTTACAAATTGGAGTGTCGCAGTTTCATGGACCATTCAATTCTT TTCCTTAAACTTAGGTAATGTTCATGTTAGTATTGTTACCTCTGAATTGT GCAGGAATCCCACAGAGGGCTTCAGGAATCAGGGTTAGCTTGGTGACCAA ACAAAGACTTACTAATGGCTGCTGCATGTCCCTGGCCGATAGCATGTCAA TACCACACTGGGAAATTAGCGCCCCAGTTCTGACCTCTGTACAGTACATT TATACCACTTCAGTGTATAAAATGTAATGTGATAATATCTAACAATTGTA TAATAGCATGCATGCGTTTTTCTAGATGACAAGGTTTATTTGGTTAACTT GCTTTTGCTTATCTTCCTTTAAGTACTTTCAGCATAGCAATTATTGATAT TATTCTAGCATGATGTTGGACTTTGGAGGTAATATTGACTCATCCTGCTT TAAATGGTCCATGATGTATCCGAAGCATGATTGAAAGGATGGTTGCATCA ACCTCTATCTGACCTTACCGTGCCAAAATAGAACTTACGCAGAAGTGCAA ATGTGAGGCCACACATCTGTTGGTATATTCATGCCCTAAAACAGGCTGTC GAATCAATGCTAAGATACTGTAAGTCTGATCCATGTCTGTAGTACACATT TGCATGAAAAAAGATGGGGAAAGTGGTCATCATTTGTAGCACAATAAAGC CCACTGAACTTGTCATGAGAAACTATTTCCATTGACTCGTGATTCAGTGT TTGTTTATTCAAATTGCAGACTTTATTCTGGCAGCTCTTTTGAGGCTCAA AATTCTTCTCTTTAAGTTTAACACTGCGGGTCCTATGGCCATGAAATTTC TGGTCTTGTTCCAAATTTATGGGGCACCATTTCTGAATATCTTACGTAAC AACATGAGCATGTGTTTCCTTTATATCACAATGTTATATCTATTGAGGAG AGGACAAGACCTGGACTTCTGGTGTCATGAATGTGATATAGTTAGACAGC TAGACTTCTAGTTGACTTGGAGTTTTCTGTAGATTCTATCGTAAGAATCC TCCATTGTTTATTACCTTCGTCGACGAAATGGTTTCGTCGACAAGGTTAT TCGATGGTGCTTGTCTGTGTGTCTGTTAGTGAACAGAATAAGTCGAGAAC GCCTGGATGGTTTGTTGTCGTAGTTGGTGTGTCGGTGTGTATGTGGGAAA TCTCAAGATGATTAGATTTTGGGCGAAGTGTTTTGCATAATTAACGAGAA AAGTGTAAAAATGTGTTATATTGTATGCTGAAGTATGTGTACGTGTTGGC TGTGTTGTTCCAAGGCGTCATGGATAGGGGTAGGGGTCCTGAGGGGTCAT GTTGAAGGCAGGAAACGTCAGTTACACAAATTGGCTGTCAGCCAGCTGTA GGCATTGGTAAGGTAGTCTCCAAGCAGACCTATGGGTTGGCTATAGCAGG GGCAGGTTTTGCTTCAGACTTTGAAAGGGAATTACTCAAGAAGGGCTTGG TGGATGGTCATAAATTTTTGTAAGTACATAGCTTGAGTGCTGATGTACAT GATTAGATACTTATTATGCAAATCAGTATCTAATTTGCATAATTAATGAG GAAAGTTTATACATCCATCAATTTCCATGATAGGACTCTCAAACATGTGA CATATGTAACTGAGGAAGAGAGAAATATTAATAGATATCAGCTTTGCAAA TGAGAACCTCATTGACATAATTAATGAGAAAAACTATAACTCGAGATGGT CTTGATGGATGGTCATGATTTTTGGTATGTAGATAGCTTACGTGATGCTT TGTATGATTGGATGATAATTATGCAAATCAAATTCTAACTCGCATAATTA ATGAGGCAATTTTAAAAATCTGCTGTGTTCCATGATATGACTATTCAAAT ATGTGACATTTGTAACTAAGGAAGAGAGGAATGTTGATAGATAGGAAATA TGCAAATGTGGGCCTAATTAGCATAATTAATGAGAAACTACTATAATTCC ATACTAGTAAATGACGGCAATTTCATAATTGTGGCATTAGGAAGTTGTAT GAATGTGAACACCATTGAATCAAATTATGCTAATAAGGAGGGAGCTTATT TGCATAATTGATGATAAATGTTAGCATAACCTTCTTTGTTAAGCTCATAG TCATAACAAGGAGGTTTGGACAACTTATGTTATTTGGGTGAAGAGGGTCA ACTGGTATGATTGATGATTGATGAAAAACACTCCTAATACGTCAGTCATA AAGGTCAAAATCATTTGACGAAGGTATGAGGTCGTAGAACTCTTGTTTCA TTATGTTGTTTGGCAGGTCAAACATTTGATGCATCAGAATCAGCGGGGCC TACAGCTGCAACAGAGCCGGCACCATCGCTGGACTACACACAAGAGGCGA TCCGACTCTCCAGCTACCGACACTTTCCTGACTCTGTGCCCGTGAGCGCC ACTAGGATGGCCCGAGCAGGGTTCTACTACAGTGGTACCGGCGACCGTGT GGTGTGTTTCTGTTGCGGCGGTGGCGTGGAGGGATGGGAGTACGGCAACA CGGCCATGGGCGAACACGAGAGGCTGTACCCGCATTGTGACTTTGTGAAC GGCCGCGAAACAAGAAACAAGCCGCTGCTGCCGCCGGGGATGTTCCCAAC ACCAGCTCCACAAGCAGCTGCGGCAGCACCACCAGCGGGAAGGGACTTCA CAGATTTCTACTCTCCTGCTCAACTGGACAAAGTTAGAAGAAAAGAAGCT GACCTAAACGACAACAACTACCGTCAGCCTCCGTCAACAGGAGCAAATGG GACTAATCTACACAGACCTGACAACAATAACCCTGTCCAACGTTATGACA ACCCTGACTGCATGTTGACCACAACTTCTCACAATCTTGGCCGTCAGAAT TCATCATCTGTGCTGCAAAATACTAGCTATGACATCCCCGATCCAGGGCC GGGCACACCGCATGAGAGAGACATAGACCCAAGAGAACAGTACAAGAGCG AGCAGCGACGTCTGGACTCCTACATCACGTGGCCCGCCTGGGCTCCCATC CAACCGCGTGAGCTCGCCAAGGCCGGGTTCTTCTACACGGGCTCTGACGA CCGCGTGCAGTGCTTCTGCTGCCAGGGCATCCTCCGCAACTGGGAGGCGG GCGACCGTGCCATGAACGAACACCGCCGCCACTTCTCCTCCTGCCCATTC GTTCTCAACTTCAACGTCGGGAACATCCCAATTGAGGACCAGGACCCCAA CCTCCCTCCGGCCATTCAGCAGTCCATACCCGCTGCAGGTCAGGCTAGCC AATCCTCAGGGCTGTACCAGACTGCAAGGCTTCACCAGCCAGGACTACAG GTACCGACGTACAGAGCATCCAGACCGAAACACCCACAGATGGCAGATGA ACAGATCAGACTCTCCTCCTTCCAGCTGTGGCCGTCATCTACGGCTGTGG CAGCTCAGCACCTGGCTAAGGCAGGCTTCTTCTACACAAGTAAGTGTTGC ATACCATGTACAAAAGCTAAATAACTTTTGCATATTGAATACAAAAGCTA CTTAACACTTCATCAAATGTACTTGTAGTAATCTACAAGCAAAGGCCTTG 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ATTAACAATAGATAGTAATGACATTAACCTCTGTGATTGTACACAATTAG AGATAACTATTTTGTGATCAACTTTAGAAGAAACAAAATGTATAAAGTCG ATCTAATATTAAGTGTTTTACATTTGTTTAAAAGCCTTAACTGATATTTA CAGTTGAATATTTACTACTACTAATGTTTGAGTTATTGTAATGGTTCTTT TGTTGTGTTGCATTCTGTATACACATGATGTAAATGTGACCACAAATGCA CAAATATTATAAAACACCAGATGCGTGTCTGCAGATTGTTGCAAAGTTGA TCAATATGTTACTATTATTGTCATCACTGTGTGATTAAATGCAAAGCATG AACAAAAGGACTTACAGCAAACTTTTTGCTACAACTTCCCTATGAAAGTT TTAAGATTTTATTGTTTTGGGTATTTGCTGTTTCAGTACAATGACTTTCT GCCTGAGACTTTGCAGTATCAATAGAATTTTTTTGCTCTTGCTTTTCATT TTCTTAAGGTATGCTAAAACCTGATATGTTACGTATGACATTGGTCAGGG AGTGAACAATAAATCAAAAAGCATAGAAAAGCTGAGCATACTGCTTGATA CTGCTTAGTCCAAGTCATTTTATCTAAATCTATTTACAAAATATGACAGT ACAGGAAAACACTAGGACTACTCAGCTAAGATCAGCTAACACAGGTGGAA CAGACTAGTTTAGCTACTCATGGTTTGTTTATAAAAAAGATACTGTAAAT GCAGAAATGTTCGCGCTGGTTTTATGTTTTTGTCCAATACTGTAGCAGTA TGTGACTATAGCGCTGCCGCAAACTTAAAACCACCCCAAACTCTCCATTT TCGCCTTAGCGGGAAATAAAAACTATGCGAACTTAAATGCATTTACAGTA ATCTGTGCTTTTATATATTCAAAGTGTACCTCTTTCTAAATGTAAATGGC TGGGCAATCCTGTACGTTGTATGCCCTTAAGGCTAGTTCTGTTGTGACTG TGTTTTCATCAGCAAAGTCTGTGTTGGAATGATGGTAATGCTGAATGCCA TAGTGTCCATGCAATTCTGTGTTCTGATGAATAGGCCTCCCTTGCACCAG ACTGACACCATAGGCTGTTGTGCACATATAATGATGGTAACACCCACGGC AAAAGTGTTCAGGCACCTCAGTGTTCTGACAGACAGGATAACCTTGCACT TCACTGACACCATAGGCTCTACCCATGTTCTCCCGAGTATTGGTGGGAAG ATAGCAACGGTGGATGTTGTAATGTCCAGGGATCTCTGTGTTTTGACAGA TAGGTTTCCTTTGCCTCTCACTGACACCATGGGGAACCTAGCAATGTGGG GAAAATGTGAGATGTAAAGGATGGACAGAAAAATAGAAACTGTACTGGAG GTACCACTCATTGAGCAGTACCTTAAAACTCGAAGTATACTCAGTAACTG TCACACTAAAAGTTCTAAGTCCGAGAGATTCGCCTGCATATGCAGGTTAG TACAGGTACAATTGGAGCTGTGCAGGTATTTCT

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000124:248679..265411-

>Blg14228.14 ID=Blg14228.14|Name=Blg14228.14|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1632bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000124:248679..265411- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCAACAACGAACGGGCTACCCAGTGAAGTTGTGAGTGATGGTGGATT
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ATCCCTCTCAGCAGGTCAAACATTTGATGCATCAGAATCAGCGGGGCCTA
CAGCTGCAACAGAGCCGGCACCATCGCTGGACTACACACAAGAGGCGATC
CGACTCTCCAGCTACCGACACTTTCCTGACTCTGTGCCCGTGAGCGCCAC
TAGGATGGCCCGAGCAGGGTTCTACTACAGTGGTACCGGCGACCGTGTGG
TGTGTTTCTGTTGCGGCGGTGGCGTGGAGGGATGGGAGTACGGCAACACG
GCCATGGGCGAACACGAGAGGCTGTACCCGCATTGTGACTTTGTGAACGG
CCGCGAAACAAGAAACAAGCCGCTGCTGCCGCCGGGGATGTTCCCAACAC
CAGCTCCACAAGCAGCTGCGGCAGCACCACCAGCGGGAAGGGACTTCACA
GATTTCTACTCTCCTGCTCAACTGGACAAAGTTAGAAGAAAAGAAGCTGA
CCTAAACGACAACAACTACCGTCAGCCTCCGTCAACAGGAGCAAATGGGA
CTAATCTACACAGACCTGACAACAATAACCCTGTCCAACGTTATGACAAC
CCTGACTGCATGTTGACCACAACTTCTCACAATCTTGGCCGTCAGAATTC
ATCATCTGTGCTGCAAAATACTAGCTATGACATCCCCGATCCAGGGCCGG
GCACACCGCATGAGAGAGACATAGACCCAAGAGAACAGTACAAGAGCGAG
CAGCGACGTCTGGACTCCTACATCACGTGGCCCGCCTGGGCTCCCATCCA
ACCGCGTGAGCTCGCCAAGGCCGGGTTCTTCTACACGGGCTCTGACGACC
GCGTGCAGTGCTTCTGCTGCCAGGGCATCCTCCGCAACTGGGAGGCGGGC
GACCGTGCCATGAACGAACACCGCCGCCACTTCTCCTCCTGCCCATTCGT
TCTCAACTTCAACGTCGGGAACATCCCAATTGAGGACCAGGACCCCAACC
TCCCTCCGGCCATTCAGCAGTCCATACCCGCTGCAGGTCAGGCTAGCCAA
TCCTCAGGGCTGTACCAGACTGCAAGGCTTCACCAGCCAGGACTACAGGT
ACCGACGTACAGAGCATCCAGACCGAAACACCCACAGATGGCAGATGAAC
AGATCAGACTCTCCTCCTTCCAGCTGTGGCCGTCATCTACGGCTGTGGCA
GCTCAGCACCTGGCTAAGGCAGGCTTCTTCTACACAATGGTTGCAGACAA
CGTGAAATGCTTCTACTGTGATGGCGGCCTGCGGAACTGGGAGCCCGGGG
ATGAGCCGTGGACCGAGCACGCCAAGTGGTTCCCGCGGTGCGAGTTCCTG
CTCCAGCAGCGAGGAGACGACTATGTACAGGGAGTACAGGCTCGCTTCCC
TAACCTACACGCCCAGCAACAGGTACAGATACTGCAGCAGGCCATGATGA
GACCTCCAGATGAAGCAGGAACCGGTGAGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14228.14Blg14228.14-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:265347..265411Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:265347..265411Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:261614..261662Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:261614..261662Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:257719..258357Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:257719..258357Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:254123..255295Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:254123..255295Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:253546..253736Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:253546..253736Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:252190..252253Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:252190..252253Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:251406..251804Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:251406..251804Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:248679..250933Blg14228.14-exon-Sc0000124-1570713199:248679..250933Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000124genomeSc0000124:248679..265411 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14228