Blg14160.4 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14160.4
Unique NameBlg14160.4
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000080:652103..677522+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14160.4 ID=Blg14160.4|Name=Blg14160.4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=25420bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000080:652103..677522+ (Branchiostoma lanceolatum)
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AAACGAAAACCTAATATCTCAGCTATAGCTAGCCACAGACTTATCTTTTA GTGTGTTTTCAGGAATGTCATTGAGTGGACGGTAAATTTTGTCTTCATTT TCCACCAATCTGCCTTTTCCTTTTGCCCGAGGCACTCAGAAGATAAAATC AACGAATTAGCATAAGTGAGGACCATCTGTAATGTTCCTAACAGTTTTAC AACATCATTGTCGAAACCTTAGGACTTGTTTGTGTGCCTTTGAGTTTTAG TACGCAGCATTCACTATGATTGTGCATGGTTGTTTTGTTTTATGCAACCG ACAAAGATGCCATATTTGTTTACTGCCGTTGCTGCGAAAAATGAAATTGA ATTAAATCAGCCCTAATTAGGACTAATTACAGACATGGGGTAATTGAGGG GATGAGGTTGGCTCCATGGCCTCGGGCGTTCGGCTCCCAAACCAAATTAC TCAGACAATTGAAGAATTGGATTGGTTTGATATAAGATATGCTGTATCTA TGCTTCACCTGCTTAGTAGCTGTTCCATGGGTAATATAATATAAGCCTCT ACAGTTCATAGTCAGTGCAATGGAAAAAGGCATTAGGTATAGTGTGAAAG AATAATAGTTAACGTTGTAGCTTTGTAATATCTAGTCTAACATGTGTTAG GCATATAGGCATTACTGCTGTTAACCTCAACTGCTTTGTCTTTTTTATTC AAAGCGTGTTCCAGTTAAAGTCATGAATATCAACTGTATGTAGTGGACTG GAATTCAAAATGTTTTCAAACAGAACTTATTTCTTTTACCACTAGTGTAG AAACAAACAAAAACAACTAGATTCTACAGTCTGTGTTAGATGGGTCTTAT CAAGTCTGGATTTACAGATTTTCCTGTAAATCCTAGAAAGTGTACAATGT CATTTGAATATTTCTTTTTCCTAAGTTTGGGTTTTCACGCCCCATTCTTG 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AGTTTGAGAATCATACTTATTTTATCTAAGGAGGTTAAAGTACCTATTTA TAAACTTCTTGTTTTATCATTCTTCTTCATTATGTTTTACACAATGCTTC ATGCAACATTATATTACAAAGAACTTTATTGCACGACAATTTTACACCGT ATAATGTATAGCAGCAGCTATCAAACATAGTACAAAATAGAGGAATAGAA TAAAACTTAACATCCTAGTTACTAATACAATAAGGGCTAGCATAAGTCTT TGATATTACATAATAGTGTTACAATTGAGTGGGGCTAATCATGAATTTCG TTTTTTTTTTTTCTAATGATGAAGCAGTCTTTTGTAATTATGTTTACCTA TTTTTGCATTGTAGCGGTTGTTGCATCTAAAGATATATTTATAGCTGTCT GTAACATTGATATTTATATTATACAAAATGTACTTGTCTAATAGTCCCCA ATGAACGTACAGTGAGAATGATAGTCTTCATGGTACTGGGTACTGGTTGG TTGTATCGCCTGAGGTGTGAGCATTGCGGCTGACTGGGGTTGACCCCATG GCGGCTCGACGTAGCCTGACTGTCGCCTGACGCCAGGCCCCGGGGGGACA CACGAGACATCGCGACTGGCTGACATGGTGACAGCCAAACAATGACACCT TGCACCACCTGAGGTCTGACGGACACTCACTTTACGGGTCGACCTACAAA CTTGCCTAACTCTACAACACAAAGTGATTGATTGTTGTACGATGTATTAC ATTATCATATCCCTTCCAGGTATTAACATATGTACTCCTTTCTGCCTAAC TATATGCAACAGTACTACACAACCACAACTTTTCAACCAATTCCTCACCT TTACAAAGCAACAAAAATACCCTTTGTCAACAAAAAGTAAGAAAAGATAA CCTGATAGGTACGACATAATTATGCTACTTGGGTTAAAGAGGTCTAAACA 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CAAAAAATTGCCAGAGAGTCCAGCATATTTTTCATCTAAAGATCTACCCA ATCACATTGGACGGGTCTCAGGAACCTACATACATTGGACGACCTCTAAA AATGGTGCAATGATCGAGAGAACACCTGTCGTATTTCTGCCCAAAATGTA ATTTGGCACTTTCAGACTTGTTGTAGGCCAATCTATTTTCCTGCTATGTG ACCAAAGCATTGAATTGCTTATTACATTTAAATCTTTTCTTCTGTTTTTT TTTCCTATCTCCAGTGTTTGAAGGAGAGCTATGTAAAGGCTCTGGGTGTG GGCATCGGGTTTGAGCTCCAGAGAATAGACTTCCACCTGAAGACCCCACA GGTGAGGACAGGTGAGGTGTCACAGGACACACAGGTGTACATAGACAGGA CCCACCAACCTGACTGGCTGTTCCAGGAGTTTGCCCTCGACGACACACAC TGTGCAGCTGTAGCCATTCAAGGTCTCACACAGGTAAAGTCTGTTGTTTC AAGCTTCCATAATAGTTAAGCTGACGTATATCTGTAAAGTCTGTGATAAA TGTTTGGGATTGAGATGTATTTTAGCTGGAAGGCGGAACTGCAGAAACTC TGCAGGAATACTGTTTGCCGACCAATGCATTTTATGATAAGTGTGGAGGG ACCTAAGGTAGACACAGAAATCTGTACAGTACGTTCTAAATGGTACAAGA CAATAGTTACCTCTTGGTGTAGAATTACACAAAATGCATGTCATAAAGTA GCCCTAAAAGTGTCTGTTTTGCTACGTATGTTTGAACTCATTGGTTACCT GCTAAGCCTGATTGTCATGGACTTAATCACGTCTTATACTACTACTAAAC ACAAATCAGACTTTACATTCAATTTGCTCTTAATCTTTCCTACAGATGTA ATTATGATGTAATGAAGGCCATTTCCTTCATATTCCTGGCTAAGTTGAAG CAATCATGCCAATTGTTTTGAAACCCTGGGTGGGGAGTCAACTCCTGACC TTACAGCCACGAGCTTGGCAACTAACCACTTAAATCGTCCAGTTTAATAT GGAACGTATAACAGTGTGTCTGATCGAACCAGAAGTAGCTATAACTCTAT TGGTTAAACCTGCGTCTTGCTTCCGCAGGCCGTCTCGGATCCCCCGCCGT TCCGCGTCCTCGAGTTCTCGGAGCTGACAGGAGTCGCTCAGCCCCTACTT CCGGAGGATGTCTCCTACTGGGAAAGCTTCCGCAACAAAAAGGAGAGGCC GCAACTTACGAAGAGATGACCTTGATGTTGTTAAATTTTATTCTAATGGA GTTATTCCAAATGACAGTTACTCATTGCAACTGGATAAAATTTTGAAAGT TGCTTGAGTAACTGTCATTTGGCGTATCATATTACCTGGATGTCTAACCT TCATTGAGTAGTTTGTATATACAATATACCGTAGTTGACAAAGAAACTGG TCAGTAGTCTTGTTTGCTGAAGGCATTGTTCAGTAGCACTTAGAGGCATT AGGGTAATAGGGTTTTATGTCTTTTTATTTACAGTTACAAATGTCCAATT GAAGGGAATGTATACTGGATTGGGATTGTACATAACCAGCGAGCACAATT GTTATGAACGTGCAACAATTTTTTTGTCAATTGTGACCAACTAAACCAGG AGAATTGTTGTCAACTTGATAACTCAATATTGTCAAGCACTATTGGCAAG ATAGGTAGATGCTTGTAACGCTTATGTATCGGAAGTTAATGTTCTGTAAT ATAGCTCAACTGTTGAGTGATAGACAACAAAAACATAATTCATGCTTGTG GCCTTGTGGGAAGTGTGTTGGTGTTAGCTGTATATTCAGGGCTTGAAATA CTGGGGGCATAATACTACTTGCACCCAAAAATGGAGCTGTGCACCTAATT GTTGACTGAGGGTGCATCGGTGCACCTAGATATTTGTGTAGGGTTATGTA TACGAAAAGGTACCATAATGATACACTAGTATACAGCGTATTCTTGACAT TTAAGTGTCAGAAACAATAATCAAAACTTTGGTGTGCGTGTACATGTATT ACCTAAGTTAGTACTTTTTTCAAGTTTTATTTTAAAGTATAGAATTTGAG ATTCATGATTAGATTCTGCTGACAGTCTACTTTGTATTAATGGTGTGCAC CTGAATTGCTAGGTTCTTCTTAAAAAGAAATTTCAAGCCATGATATTGTA CAGAAATAATGATACCGTAATCATGGGAAATTATATTAATTTTGGACAGA AAGAAAGAAATAATAATAAAATCATAACACAAATGAAGTAAATTTTGTCT CAGCTATTTTATTGAACTCCTTTCCCTATAGTCACACAACCTATTATCAT GAATTGAATCATACTCTTCATTGTGTAATTCACAATTCTTTACATTATAT ACAGACCATTTGAAAAATCATTTAATTGTATTCAATGAGTGGCAGTAACC TAACAAGTATTCATCTGCATTGTAGAGGATTTCTTCCAACATTTCTGGGA GTTCACAAAGTAATGATTATGCTATACAGCCTTATACAACATTCACTTTA GAAAACTACTTAATAACAATAGAGATAAAAACGATACTATCTTAACACTA TTCATGCAAAAGGCTACCACTATAAAAAAGCAAGTGCAGAAAAATCGTTG AGATTTTCTACAAATTTTCTCATATCTTGTTGTTATACATGTATACTGCA TATACTTGGCACATTGAATGTGCTTGATGCACATTATTTACCCATGCACC AACATTTATAAAAGAAGCCTAAAATGCCTCTATACATTCCTATATATTTC CACTTTAATACAAGCATCATAATCCCATTTTGTAGAAATCGTATTGCCTC ATTGTCTAAGAATAAGTTACTCTACAAGAAAATAGTCTATAGTTGCATTA TAGAATAGCCGATTTTTTAAATTTCATACTTATTAATCAGTATATTTACA GATATAAGAACTTCTATTCATTTCTTTTGATTGACATCTTATTTTGTCGT ACCAAATCAATCATGAGTTGTACATTTCTTCATCGCATTAACAGTTATTC ACACAAATTTGAAGTATTTCCTCTCTCAGGTAGTGAGCACACAAAGAATG ATTTGTTGAAAGCCAATAAACACCATTCCCACGCTTCTAAACTTACTCAC AAAGCTCTCAGCTTTTGGACATTTATCCCCTATATTTAAGTAAAGGAAAG GCCAAGTTCATATTACTTCTTGTCTGGTCAGTGGGAGGTCTACTAAAGGC AGGTACAAACAGCTATGAGGCAAGCTGTGATTGTACATTTCCTCCTGACT ACTGAATTGTGCAAACTTAGTGGCTTGTTTCAAGTGTGGTGGCTTGGAAA AGTACTTATAGCTAGCTTGGGTTTGGCGAGGCAAAAATGTAGTTTTTACA GCATGTCCATTATCATCATATGGGGCGATTTGCGTGGACTCTTTTTTTTC CCAATTGCTTCAAAAACACAAGCTCAGTTGTAAGCTTCAGAATCCCATTT CTCCAATGGTGCCGACTAACTGTGTATTATTCTTGCACCTGCTACAGTTT ATCTTTAAATAAACAAAGGG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000080:652103..677522+

>Blg14160.4 ID=Blg14160.4|Name=Blg14160.4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=750bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000080:652103..677522+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGTGTATCTGACTTTTGACAAACCTTTTTTTCTACAGGCTGGTCGTCT
TCTTATCAGAAAAGCTGTCAGTGACCAGCTGGGAATCCAGTGGAAAGATA
TCCAATTGGGTAGAACAGAGAAGGGTAAACCGTACCTAACTAACACAGTT
GACAACGCTGATCATACCCTCTTCAGTTTCAACGTGTCGCACTCTGGAGA
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TGAAGGTTGACTATCCAAATCGAGGAGACGTTCCTGAGTTCTTTCGCATG
ATGAGAAGGCAGTTCACGGACCACGAGTGGTCCACAATCAAGACTCCGAA
CTCCGAGTGGGAACAGCTCAAGCTTTTCTACAGACACTGGTGTTTGAAGG
AGAGCTATGTAAAGGCTCTGGGTGTGGGCATCGGGTTTGAGCTCCAGAGA
ATAGACTTCCACCTGAAGACCCCACAGGTGAGGACAGGTGAGGTGTCACA
GGACACACAGGTGTACATAGACAGGACCCACCAACCTGACTGGCTGTTCC
AGGAGTTTGCCCTCGACGACACACACTGTGCAGCTGTAGCCATTCAAGGT
CTCACACAGGCCGTCTCGGATCCCCCGCCGTTCCGCGTCCTCGAGTTCTC
GGAGCTGACAGGAGTCGCTCAGCCCCTACTTCCGGAGGATGTCTCCTACT
GGGAAAGCTTCCGCAACAAAAAGGAGAGGCCGCAACTTACGAAGAGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14160.4Blg14160.4-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14160.4-exon-Sc0000080-1570713199:652103..652415Blg14160.4-exon-Sc0000080-1570713199:652103..652415Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14160.4-exon-Sc0000080-1570713199:656136..656257Blg14160.4-exon-Sc0000080-1570713199:656136..656257Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14160.4-exon-Sc0000080-1570713199:674217..674435Blg14160.4-exon-Sc0000080-1570713199:674217..674435Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14160.4-exon-Sc0000080-1570713199:675081..677522Blg14160.4-exon-Sc0000080-1570713199:675081..677522Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000080genomeSc0000080:652103..677522 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14160