Blg14160.2 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14160.2
Unique NameBlg14160.2
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000080:650014..677522+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14160.2 ID=Blg14160.2|Name=Blg14160.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=27509bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000080:650014..677522+ (Branchiostoma lanceolatum)
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AATCCAATATCGTAATTGCACCCCTATAATTAATGCTATGTCCCACTGCC CTGCCATAGGGACCATGTTATAATCCGTTATGCATGACTGGAATACTTCA GGCAGATACGGGGTATAAATCTTCCTTACTTGCTGTGATCGTATAGTCAC TGTTACATTGAAAAATAGACAACGTGCATCACCACACGCAACCTAGCAAA CGATATACCAAGTTACATACCAATGCGGCAACGGGAATTGTGAGTTTTAG CTGCGAACATGTGCATAGTGACCTCCAGTCTGTGTATTAAGTATGCCTTG TCCACTCGCAACTCGCTTACAGTATGCGCGCACGGGACGGACGATGCACT TTTACGCACAGTGTGAAAATGGGAAATCTCTGGACCTTCAAACTTACCAC ACTTGTAGTTNTTTTACGCACAGTGTGAAAATGGCAAATCTCTGGACCTT CAAACTTACCACACTTGTAGTTTATAATACGGAGGCTGTGACAATGTAAA AAGTTTACGCAGGGGATGAAAGATTGTTGAGAAATATCTCTCAGAAAAGT GCGCGCGCCAGTGTCACTTCCGGGTGGTTAGATCCGGTGACCTTTGACCT TCGTGAAATGTTACGATAATATAAATCAGCCTTTTTTATTGCAAATAGCT TGATAGCTATAGATCAGGCCGGCCTGCAATAAATTGTGGAAAGAGGATTT ACTGCATATTTGTGATTTCTGATACATCTTAGTTGTAAGGCTGAATGGTT CGTTGATAATTGAAAAGGGGCCATCTAGATCTAACTTTGTGACTTTTCCC GGAATTTCTAGATCCCATCTATGTCATGCTGTAAAAACATACTTTTCAGC AGGTTGACCACTCCTGTATTGAAAGAAAAAGATAAACAAACACTTTTTCT TTACTTGCTCTAAAACACTACTTGGACTGTGCAGAGATGCAAAGTTTGTG TGGGTTATACTTGTACATACTATAAATACTTCACGGAGAATTGTGTCCTA CGGACTCTTGTTAGCTTTGCGAGTTGATTTTACTTAAAGTCAGCGCTACC TTGTGTACTGTAAGCTCCAGATTTGGTTGATTGAAATCATTCTACCTCAA AATATTGGTGTTTTTCATTAACAAAGGCTTCGAAAACCATACTTTTTTTG ACAGAAAATAATATTAATCCTACTCCACTGAATCGTCATATTCTGAGCTG AAAAAGTATAGAAAAGAAAATTACTGACAGTGTACAATTTTAGCTAGTAA TACATTTTTATCATGCAGCACTAAGTCTTGTAAATTTTCTACTGTACCCT TTTCCAGTGAAGGTATGTGCCTCTATGGCCCCGCTCCAAAAAAAAACAAG AGTCTAAACCTTTCAATAGATGGGCTATAACCTGCAGCAATACCACAACA ATTTGTTGCAAATTTAGAACTTTTTGCGAGCCTTCCAAAAAGCTATCATA ATGATAGAAATAGGTAGTATGTTGCAACTGTCATGAAATGTGCGAAAAAT ACATGGGCCTATATATGTCGTGAAAAGTCCTATTCAGCACAAATTTTACA CTCTTTTTCCCTCGTGTGTCAGAGTGGTGTTTCATCCATACAATTAGGTC TGAACAGCCTTTCGCAGAAAAACCAAGGAAGGATGACTAGTATGTCTACT TGCTGAAAGGTTGCAATTGTTATAAAATGCTTGAAAAATCGGCCCATATG CCGTGCATCAGATTGGTGTTCCATGAGGATGTCATCCATACAATTACATC TGAATAGCCTTTAAAAAAAGAAGGACGGCTAGCGTGTCTACTTGCTGAAA GACAGCTGCCAGGTTTAATCCCGTCCTTGGCAGACGTCAATCACTTCCGC TTTGTGGGCACCGCAAATCCACCGGCCACATTGTCAGAAGATAACAGTTT CAACGTCGCTTGGCGCCACGACCAGACGCGTACGTGAGACTCCCCGCCCG CCCTCTGCATGCCGCACTGATGCCGACACTGATAGGAACCCGTCATTGTT CTCCATGGAACGTTCGCGCTGTAAAAATCCTTGTTATGTGATGAGTCTGT GTAATAGATAATGATCCCTTAATGCTATCTAACAAAGGGAAACGAAAACC TAATATCTCAGCTATAGCTAGCCACAGACTTATCTTTTAGTGTGTTTTCA GGAATGTCATTGAGTGGACGGTAAATTTTGTCTTCATTTTCCACCAATCT GCCTTTTCCTTTTGCCCGAGGCACTCAGAAGATAAAATCAACGAATTAGC ATAAGTGAGGACCATCTGTAATGTTCCTAACAGTTTTACAACATCATTGT CGAAACCTTAGGACTTGTTTGTGTGCCTTTGAGTTTTAGTACGCAGCATT CACTATGATTGTGCATGGTTGTTTTGTTTTATGCAACCGACAAAGATGCC ATATTTGTTTACTGCCGTTGCTGCGAAAAATGAAATTGAATTAAATCAGC CCTAATTAGGACTAATTACAGACATGGGGTAATTGAGGGGATGAGGTTGG CTCCATGGCCTCGGGCGTTCGGCTCCCAAACCAAATTACTCAGACAATTG AAGAATTGGATTGGTTTGATATAAGATATGCTGTATCTATGCTTCACCTG CTTAGTAGCTGTTCCATGGGTAATATAATATAAGCCTCTACAGTTCATAG TCAGTGCAATGGAAAAAGGCATTAGGTATAGTGTGAAAGAATAATAGTTA ACGTTGTAGCTTTGTAATATCTAGTCTAACATGTGTTAGGCATATAGGCA TTACTGCTGTTAACCTCAACTGCTTTGTCTTTTTTATTCAAAGCGTGTTC CAGTTAAAGTCATGAATATCAACTGTATGTAGTGGACTGGAATTCAAAAT GTTTTCAAACAGAACTTATTTCTTTTACCACTAGTGTAGAAACAAACAAA AACAACTAGATTCTACAGTCTGTGTTAGATGGGTCTTATCAAGTCTGGAT TTACAGATTTTCCTGTAAATCCTAGAAAGTGTACAATGTCATTTGAATAT TTCTTTTTCCTAAGTTTGGGTTTTCACGCCCCATTCTTGTCAGAATCCCA TAATATATAATATATATTGTATTCTACGCCAAAAGACAGTTACTCTTGAC AAGCAATATTGGATATAATTTTGAAACAGACGTTTCAGACAGCATCCGCT ATCTTTCGTCAGTGACTGTATGTACATGTATTTTAGTTGAAACTAATTTT ACTTTTCGATTTTTCATATCTTGAAAAGGCAAAAGGACTTTGACACATTT ACAGAATAGGCAACCACAGGGATAGAAAGAGAATCTTGCAGTACAACAAA CTCCAGGTCATTACAGTACAACAAACTCAGGGTCATTAAAATTTGAAAGC CCCCCATGGTCAAGTTATCCATCTTTAATATGACGGTCACCACTCCTGAC AAAGTCAACTAGCTTATTTGAAGTACTATAAAATTTTATCATCTATTGTC TACTTTTATCTCATTTTTGATCAGCATTCATTTTGAAATAATTCTTTTTC AGTTAAGTTTTCAAAGGAACCAAATATGCAGGTACTTCAAATGGACATAC GGGTTTTGCCCTCTTTTGAACTTTCCACCTACAACGTTTTGTCGTCTTTA TATAGTTAATCATTTATTCATCGTGGTTGTAAATTTTCACCAAGTAGCCA TGACACAGATATCAATAAGGCATGTGCTAGGTTATGCCAAAACATATTAA TATCATCTTTAGTATTTACTGAGTTGATATGATTGATATTGAGAATAGGA TTGGGGTATAGTAAAAGTAGAAATAACATTCAAGCATTCTGTTGCTATAT CTTATTCAGTATAATAGTTCTAGACTAAGTACATCTACAATTCTGACAAA ATTGTCTAATTTCTTTGTATTTATTACCAAGAAAGCATTTTATATTTTAC CTGTGATGGTACAGTATAAAATGAATTATGCTTTTATGCTGTATGATTTT AATTGTCCTATATAGTCTGAAATTGAAATGTAATTGCTAAGTTTGAGAAT CATACTTATTTTATCTAAGGAGGTTAAAGTACCTATTTATAAACTTCTTG TTTTATCATTCTTCTTCATTATGTTTTACACAATGCTTCATGCAACATTA TATTACAAAGAACTTTATTGCACGACAATTTTACACCGTATAATGTATAG CAGCAGCTATCAAACATAGTACAAAATAGAGGAATAGAATAAAACTTAAC ATCCTAGTTACTAATACAATAAGGGCTAGCATAAGTCTTTGATATTACAT AATAGTGTTACAATTGAGTGGGGCTAATCATGAATTTCGTTTTTTTTTTT TCTAATGATGAAGCAGTCTTTTGTAATTATGTTTACCTATTTTTGCATTG TAGCGGTTGTTGCATCTAAAGATATATTTATAGCTGTCTGTAACATTGAT ATTTATATTATACAAAATGTACTTGTCTAATAGTCCCCAATGAACGTACA GTGAGAATGATAGTCTTCATGGTACTGGGTACTGGTTGGTTGTATCGCCT GAGGTGTGAGCATTGCGGCTGACTGGGGTTGACCCCATGGCGGCTCGACG TAGCCTGACTGTCGCCTGACGCCAGGCCCCGGGGGGACACACGAGACATC GCGACTGGCTGACATGGTGACAGCCAAACAATGACACCTTGCACCACCTG AGGTCTGACGGACACTCACTTTACGGGTCGACCTACAAACTTGCCTAACT CTACAACACAAAGTGATTGATTGTTGTACGATGTATTACATTATCATATC CCTTCCAGGTATTAACATATGTACTCCTTTCTGCCTAACTATATGCAACA GTACTACACAACCACAACTTTTCAACCAATTCCTCACCTTTACAAAGCAA CAAAAATACCCTTTGTCAACAAAAAGTAAGAAAAGATAACCTGATAGGTA CGACATAATTATGCTACTTGGGTTAAAGAGGTCTAAACAAACTAGATTTT TTTTAAAGGTTCTTAAGAGTGTGTTACAAATATAAAAAAACTGGTGCTGG AATTTAGTGCGTACAACTTACAAGGAGCCTTCCTTAATTTGACCACAGCT AATTCTTAGACACTCAATGAACATTACAGTTTAGAAAGTAAGAGTGTTCT GTTTATTGAACTTTAGACTGTCTTGGTGTCAGTGAGAGAACAGTAGCCGC CATTGTTAGTAACACCTGTCCTGCATACTGTCACGTTTATAGCGCCTATA AATTTCACCGTTTCCGCCCAAGCCCCGTCCATGTAAATCACGACCTGCTA AGGATGACACTAAGTACCTGCAAAACGCACCGTTTCACCAGTCGTCCATT GTCTGCTAACACCAGCCCATAGGCAACTTCTCAAATCTTCTTCCGATGCA GCTTAAGCATTACTGCATGCTCTGTTGTGTGACTGTACAAATCTTCTAGT GTAGCATACTGTATGTACTGTTGATATGTACAATGATCTCTCTGTAGTTG TCACGTACAGATACATTTTGTGTTTGGGTGGGTTTTGTATGTCAAAGAAT TCACAGAGTATGTTTTTGTTTTACACAGTTCTGTGTGATTTATGGAAGAC TCCAGCATCCTTAATTGTTAACAGTCTGAAGGGACTGAAATAAAGTATGT ATGAAATAGACAATTAGAATTAATCATATTGAGCAAGTTACAATGTCACA CTGTTCGACGGAAAGCAAAACAGATGGTTAGACGAGCCAAGTTTCGCCTC AAGTTCTTTTACTTAATTTGTTTTATCAAGGTTTTTAAGATAATGATTAG CCTTTTACACTTACTATGTTTGCATGTATCTGTGTTGTTGACCTTTTTTA TTGTTTCTTGAATGTATTCTCGTGTATCCTCTTAAATCCCCTGTTTCACA GTTGACAAGCTTATGCCGAATTTCAGAAGATCGCCAAATCAAAAAATTGC CAGAGAGTCCAGCATATTTTTCATCTAAAGATCTACCCAATCACATTGGA CGGGTCTCAGGAACCTACATACATTGGACGACCTCTAAAAATGGTGCAAT GATCGAGAGAACACCTGTCGTATTTCTGCCCAAAATGTAATTTGGCACTT TCAGACTTGTTGTAGGCCAATCTATTTTCCTGCTATGTGACCAAAGCATT GAATTGCTTATTACATTTAAATCTTTTCTTCTGTTTTTTTTTCCTATCTC CAGTGTTTGAAGGAGAGCTATGTAAAGGCTCTGGGTGTGGGCATCGGGTT TGAGCTCCAGAGAATAGACTTCCACCTGAAGACCCCACAGGTGAGGACAG GTGAGGTGTCACAGGACACACAGGTGTACATAGACAGGACCCACCAACCT GACTGGCTGTTCCAGGAGTTTGCCCTCGACGACACACACTGTGCAGCTGT AGCCATTCAAGGTCTCACACAGGTAAAGTCTGTTGTTTCAAGCTTCCATA ATAGTTAAGCTGACGTATATCTGTAAAGTCTGTGATAAATGTTTGGGATT GAGATGTATTTTAGCTGGAAGGCGGAACTGCAGAAACTCTGCAGGAATAC TGTTTGCCGACCAATGCATTTTATGATAAGTGTGGAGGGACCTAAGGTAG ACACAGAAATCTGTACAGTACGTTCTAAATGGTACAAGACAATAGTTACC TCTTGGTGTAGAATTACACAAAATGCATGTCATAAAGTAGCCCTAAAAGT GTCTGTTTTGCTACGTATGTTTGAACTCATTGGTTACCTGCTAAGCCTGA TTGTCATGGACTTAATCACGTCTTATACTACTACTAAACACAAATCAGAC TTTACATTCAATTTGCTCTTAATCTTTCCTACAGATGTAATTATGATGTA ATGAAGGCCATTTCCTTCATATTCCTGGCTAAGTTGAAGCAATCATGCCA ATTGTTTTGAAACCCTGGGTGGGGAGTCAACTCCTGACCTTACAGCCACG AGCTTGGCAACTAACCACTTAAATCGTCCAGTTTAATATGGAACGTATAA CAGTGTGTCTGATCGAACCAGAAGTAGCTATAACTCTATTGGTTAAACCT GCGTCTTGCTTCCGCAGGCCGTCTCGGATCCCCCGCCGTTCCGCGTCCTC GAGTTCTCGGAGCTGACAGGAGTCGCTCAGCCCCTACTTCCGGAGGATGT CTCCTACTGGGAAAGCTTCCGCAACAAAAAGGAGAGGCCGCAACTTACGA AGAGATGACCTTGATGTTGTTAAATTTTATTCTAATGGAGTTATTCCAAA TGACAGTTACTCATTGCAACTGGATAAAATTTTGAAAGTTGCTTGAGTAA CTGTCATTTGGCGTATCATATTACCTGGATGTCTAACCTTCATTGAGTAG TTTGTATATACAATATACCGTAGTTGACAAAGAAACTGGTCAGTAGTCTT GTTTGCTGAAGGCATTGTTCAGTAGCACTTAGAGGCATTAGGGTAATAGG GTTTTATGTCTTTTTATTTACAGTTACAAATGTCCAATTGAAGGGAATGT ATACTGGATTGGGATTGTACATAACCAGCGAGCACAATTGTTATGAACGT GCAACAATTTTTTTGTCAATTGTGACCAACTAAACCAGGAGAATTGTTGT CAACTTGATAACTCAATATTGTCAAGCACTATTGGCAAGATAGGTAGATG 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AAATTTTCTCATATCTTGTTGTTATACATGTATACTGCATATACTTGGCA CATTGAATGTGCTTGATGCACATTATTTACCCATGCACCAACATTTATAA AAGAAGCCTAAAATGCCTCTATACATTCCTATATATTTCCACTTTAATAC AAGCATCATAATCCCATTTTGTAGAAATCGTATTGCCTCATTGTCTAAGA ATAAGTTACTCTACAAGAAAATAGTCTATAGTTGCATTATAGAATAGCCG ATTTTTTAAATTTCATACTTATTAATCAGTATATTTACAGATATAAGAAC TTCTATTCATTTCTTTTGATTGACATCTTATTTTGTCGTACCAAATCAAT CATGAGTTGTACATTTCTTCATCGCATTAACAGTTATTCACACAAATTTG AAGTATTTCCTCTCTCAGGTAGTGAGCACACAAAGAATGATTTGTTGAAA GCCAATAAACACCATTCCCACGCTTCTAAACTTACTCACAAAGCTCTCAG CTTTTGGACATTTATCCCCTATATTTAAGTAAAGGAAAGGCCAAGTTCAT ATTACTTCTTGTCTGGTCAGTGGGAGGTCTACTAAAGGCAGGTACAAACA GCTATGAGGCAAGCTGTGATTGTACATTTCCTCCTGACTACTGAATTGTG CAAACTTAGTGGCTTGTTTCAAGTGTGGTGGCTTGGAAAAGTACTTATAG CTAGCTTGGGTTTGGCGAGGCAAAAATGTAGTTTTTACAGCATGTCCATT ATCATCATATGGGGCGATTTGCGTGGACTCTTTTTTTTCCCAATTGCTTC AAAAACACAAGCTCAGTTGTAAGCTTCAGAATCCCATTTCTCCAATGGTG CCGACTAACTGTGTATTATTCTTGCACCTGCTACAGTTTATCTTTAAATA AACAAAGGG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000080:650014..677522+

>Blg14160.2 ID=Blg14160.2|Name=Blg14160.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=774bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000080:650014..677522+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAAGGTAACTGCCAGCCTTCTGATGTCTGGGCTAAGGTGGGCCATGAA
GACAGGGCTGTGGCAGCCCAGCAGAGAGGAGTGGCTGTTAGCAGCACGCT
GTGTGCAACAGGAGGAGAAGGACAGGATCAACAAGTTTGTCTTTGCTAAG
GATGCTAAGTATGCCATGGCTGGTCGTCTTCTTATCAGAAAAGCTGTCAG
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AGGGTAAACCGTACCTAACTAACACAGTTGACAACGCTGATCATACCCTC
TTCAGTTTCAACGTGTCGCACTCTGGAGACTACGCTGTGCTGGCGGCAGA
GCACAAACACGTTGTTGGAGTAGATGTCATGAAGGTTGACTATCCAAATC
GAGGAGACGTTCCTGAGTTCTTTCGCATGATGAGAAGGCAGTTCACGGAC
CACGAGTGGTCCACAATCAAGACTCCGAACTCCGAGTGGGAACAGCTCAA
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GTGTGGGCATCGGGTTTGAGCTCCAGAGAATAGACTTCCACCTGAAGACC
CCACAGGTGAGGACAGGTGAGGTGTCACAGGACACACAGGTGTACATAGA
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CACACTGTGCAGCTGTAGCCATTCAAGGTCTCACACAGGTAAAGTCTGTT
GTTTCAAGCTTCCATAATAGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg14160.2-exon-Sc0000080-1570713199:651315..651514Blg14160.2-exon-Sc0000080-1570713199:651315..651514Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14160.2-exon-Sc0000080-1570713199:652187..652415Blg14160.2-exon-Sc0000080-1570713199:652187..652415Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14160.2-exon-Sc0000080-1570713199:656136..656257Blg14160.2-exon-Sc0000080-1570713199:656136..656257Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14160.2-exon-Sc0000080-1570713199:674217..677522Blg14160.2-exon-Sc0000080-1570713199:674217..677522Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000080genomeSc0000080:650014..677522 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14160