Blg14158.3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14158.3
Unique NameBlg14158.3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000080:456895..509050+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14158.3 ID=Blg14158.3|Name=Blg14158.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=52156bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000080:456895..509050+ (Branchiostoma lanceolatum)
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>Blg14158.3 ID=Blg14158.3|Name=Blg14158.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2736bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000080:456895..509050+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GCCATGCGGCACCAAAACACGCCACTCCCGCCGCAAATTCTACTGCTGCC
TGCGGGCGGACAGCGACAGCGATGCGAGAGAGTCGCCCGAGAAGAAGCCG
TCGGTTGCGGCGGTGGTGGGGAGGTCTGCGCCCGCCCAGGCATGCGACAT
TGACTGGCAGCCGCTCTCACCACGCATGTTGTCTTCTTCCCCTGACAGAT
CCGGCTACAGGACTGAGAGAGTGATGGAGGCGGGGGATGTGGAGCCGGGG
TCCCGCTGTACGGGCACGGACGCTGCAATGTCGGACTGTGCCCTGACCAG
AACACTTGCTGACACGACCTTGGAAACATCTCTCGACACGGTACAGTGGC
ACACACCGTCTGACGAACAGGCGAGCCCCGCGCCTTCGACGGGTTGCCCT
TTCTCACGACTAACCCGCGAGCACATCGTGTCACCACCATCGCCGGGGGG
AGAAGCGAAGGGAGCGGGCGAAGGAGACGCCTCCGCCGCCGGTACCAGAC
CGTTCCCCAGCTCTCCACACGAGAGGAAAATGTCAAGGTCCGAACTCTTG
CCGTCCGACGCGACGAGGCGGGTTAGCAGCGAGTCTGGGCTAGGGCCCGA
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CGGATTCGTGGGGGGACGTCGACGCAAGTTCTACCCGCAAGCCTTTGAAC
CTGGCCAGCCTGGTTGAAGGAGTGGGTGCGTTGATCATGCCTTCGCAAAA
TTTCATGACTCTGGCCCTCCGCCGACTGCTGATGTCATGGGGTCTCGAAA
AGTGGGAAGCCATACGCTCCAAACTTGGCCTGCAAGATGATCAGTGCTAC
TACAACGGCATAGAAGACATAAGCTGTACAAGGTCCTCGGCCGCCTACGA
CCCCCGGCTCATCAACAAGTTGGTAGACATCGCTCCGGACATGATTGGAG
TGGATTCGCCGACACTGATGAAAAACTTTGGGAGTGAGTTCTTCCGCCTC
TGTGATCAGGAGTACGGCTACATCTTGCGCTCGCTGGGCGCCACCCTTCA
CGATTTTCTAAGTAACTTCGACTCTCTGCACGAACAGTTCAAAGCTCATC
CCATCTACAGCACCAGAACGCCGCCATCTTTGCGCTGCATCCCACGTGAC
GACTGCAGCCTCGTTCTGAGCTACGCCTCTCCATCCGGGGACTTGGAGAT
GTTCATGGTGGGACTTTTACAGGAGGCCTCTCAACAGATGTACAACGTGT
CAGTAACCGTTTCACTTACACAGCCTTGGGACAAGAGCGCCCAGCTCTGC
TTGTATATCATTGAACCCAGAGAGCGAAAACGCTCTATTGGAAAGACATG
CAATAGGGCGACGGACATGTCATTGAAGCCAGCAGACTCCAAAATTTCGA
CCCAATTGTTCTGCCGCACCTTTCCGTTCCACTTTATGTTTGACAGAGAA
CTGAAGATACAACAACTCGGCATCGCTCTGCAGAGAAATCTACCGCCAAC
GATCGGCCTCGCTGGGCTTAAAGTCACCAACACGTTCGAATTCACCAGGC
CCCTTATGTCTAAGGATGACGTCACGTTCGAAGGAATGTTAGCGCGGACT
AATCTATTATTCGTCTTAAGAACTTGCGTGACATCCAATAAGGTTGACAA
CATTGTGGAGGGCACGGAGCTGAAAGGTCAGATGCTGTACCTGAAGGAGA
CAGACTGCATGCTGTTCCTGGGGTCACCACGGGTCAACAAACTGGAGGAG
ATGATGGGGAGGGGCATATATATCTCCGACGTGCCAATTCACGATGCCAC
GCGAGATCTGGTGCTGGTGGGGGAACAAGCTAAAGCACAGGATGGCTTGA
AGAAACGCATGGATAAGCTGCGCGCACAGCTTGAGGAGGCCCACATCGCA
CTCGAAGAGGAGAAGCAGAAAAACGTCGACCTACTCTACGCCATCTTCCC
ACCAGCCATTGCGCGCAGGCTCTGGCTGGGGCAGTCCGTTCCTTCGCGAA
GGATAGAGAATGTGACCATGCTGTTCTCCGACATTGTGGGCTTCACGGCG
ATATGCTCGTCCTGCACGCCCATGCAGGTTATCAACATGCTGAACGACTT
GTACACCAGGTTCGACATCCACTGCGGGGCGCTGGATGTGTATAAGGTGG
AGACGATTGGAGACGCCTACTGTGTCGCGTGTGGGTTGCACAAGACCTCT
CTTACGCACGCGCAGAGGAACGCGTTCATGGCCATCAAGATGATGGAGTC
TGCGGAACAGGTGTGCTCTCCTGACGGCACACCTATCAGGATGAGAATAG
GCTTGCATACGGGGACAGTTCTAGCTGGGACCGTCGGCCAGAAGATGCCG
CGATACTGCCTGTTTGGAAACAACGTCGCCCTGGCGAACAAGTTCGAATC
CACCAGCTTTCCCTTAAAGATTAACGTCAGCCCTACTACCTACAGTTACC
TTATCAAGTCAAAGGGTTTCCACTTCACTCCTCGGTCCCGTGAGGAGCTG
CCGGAAGGGTTTCCTTCAGACGTTCCCGGAATCTGCCACTTCCTGGAGAA
GTATGACGTACAACCTGCCGATGACGTCGAGGAGGACCTGCAAGAACCCA
ACCTGTACATGCGCAGTGAGACGACCCGGCGAACCGACGTCACCATCCAA
GTGGGGGCCGAATCTCCCTCATTGTTGTCTAAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14158.3Blg14158.3-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:492606..493318Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:492606..493318Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:495491..495670Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:495491..495670Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:496206..496366Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:496206..496366Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:501253..501397Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:501253..501397Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:502433..502576Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:502433..502576Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:504478..504632Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:504478..504632Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:505400..509050Blg14158.3-exon-Sc0000080-1570713199:505400..509050Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000080genomeSc0000080:456895..509050 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14158