Blg14005.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg14005.1
Unique NameBlg14005.1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000361:78026..95247+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg14005.1 ID=Blg14005.1|Name=Blg14005.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=17222bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000361:78026..95247+ (Branchiostoma lanceolatum)
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CTTGACTTGATTTGGGATCCACAATTAGCTTACAATATGAATTCAGCTAT TCTTTCTGTGATGCAATCGGGTTGATTACTGAGTTCAAAGTCATTATTAC GACCATACCACATGCTCCAGTTGGGAGTGGGCAATTCTTACTATTGCAGC ATAATGAGATGAGCATTAGAGATAGAATATGAGAATTAGACATTCCCGTG ATCAGGGCTACACTAATTGGAAAGCTTTATCCTTTTAAGCTTTTGCACTC TGAAATAGCCATTTTGCACCCAATTCCCTATTGGTTACAGAGTTAGGCAG CAGGGAGAAGGTTAACAAAGGTGGGGATATCTCTATAATGCAAAACTTTT TCAAAATGTACAGTCAAATAATAGGTACTTCAGATCGGAGTAGTTCCTAT TGAGATTGTTATTCAGTCATCACATTGTGAATGCATTTAATTTTACAGTT GAGTCAAGGCAGTTCTGTATCAATAACACTTCTTCCATTTCAGAAGACTG GTCCAAAATACTGTACTAGACAATGTACAAGTCTAGAGAATTTTCATGGT ATCATGACCAATGCAGCATTTCAATTAATTGTAGCTCAATGACATCTAGA GGACATCTTTGCTCTCTCAAATAACCTCTATTAAGTGTGTATAGCTCACT GGAGATCAAATTAGAAGAATACAGAAAGCTTGCTGATTGTATACACATAA TATATATATATAATGGTCATGTACTTGCCATTGCCGTGAAGGTGGTACAC CAGTTGTGTATTTTGTTTCTCCTGTGTAGCTCTACAGTTCTCTCTCAGTG TTCAGTTATATATAGGCAAGTTCTACCATGACAAAATTTTCAGTGTTCAT CGCTTGGGGTGAAACAGTTTGAGGCCCTGCCATGGCCAGGTTGACAGGGG TATTGCCATATTCTACGGTGGGCTGATCTGCCGATGTGTTTTGTACAGCA 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TACAATGTTCATTCTGCTGTACAGACTGGTAGCTTCCATCTGGCCTACTA TAGGATAGCACAAAAGAGCAATACCTGCAAGAATGTCCGCAGAGGCAATA TTTGCCATGTAAAAGAGGTAAGGCTTGTGGAGTTCTCGGTTTCCGATGAT TCCCCAGAGCACAGCAGCATTGGTGATGATGATGAAAGCTGCTGCCAGCC AACAGAGTACAGTAATCTCAGTCCCAAACTCTTTTATGTACATGGAGCAT GCTTCTTCAGCCTGGTTGTAGGGCATAGTCTTGTTCTGCATGTGCCACAG GATACAGAGGAGCCGCCCAGGAAAATCGTGAAGTGACGTCTCGTTTAACT CCAGCGGAAGGACAGAGCTGTTGTTGAACATGGTGGAGCTGTTTCTGGTC AGACGCAGCCGGAGGGACGGAATTCAGCGGAATGTGAGATCACTGAGTCT GTTCTGCAGTTGGTGACCAGAAAAATGCTGGACACAGAATGTAGACGCAC CTGATCAAGAAGGCTGTCAGTTCTGTTTGTGCCAGNTACTGGGAGACGCC ACTGTTGGCGCCTGTGCCGAGACCCCACAATGACAGAGCTAAAAAAGGTA GCTTAAAGCATTGAAAAGTCTTTCTTGGGGAAATTTTTGGTGAAATCTTG GCATTTTTAAGGTGGCTACGACAAGACGTACTTTAACCTTAATACGTTGA TGAAAGTTAGACATCCAGGTAGTAAGATACGTCACTGACGAAAGACAGTG GATGCTGTCTGAAACGTCTGACTGTTTCAAAATTTTATCCAGTTGCTTGA GTAATTATTTTTGGCGTACTTTAACCTTGTTGAATTAGTTCTAAAAATCA TCTTGGTGTTTTCAGCACCCTCAAGAGATAATGGAATGATCATGAGGTGG GTCTTTGAAACCAAAAGGATGATTGCAAGCACTCTGAATGGGGGGTGGGC GGTTATTTGCAGAATAACTGTATAGAATTTGTTGGAAATGCATTTGATGG ACAGTTGTCATAACAGGTTAGCATTTGAGGGTAAGTTTTCATGGTGTGAA GTTTCGATACCTGAGATTATGACACATTTTTGTCCATTTTTCTATAGCAT TCAAGGACCCAGAAAACAGGGTTGTAAATCGTTGGCAGTTGAGATGCGAA AATTTACATTTTCATTAGTTCTGTACAAATACTGCCATATCAAAGGTGCT AATACCTCCAAATGCACCAAGCCATTTTGATTCTGGCATGTAAATATGTT TAAAGAATAGCCAACTGCTGTACCCCCCACCCCCCTATGTCAGGGACACC ACCCCCCAACCCCAGCAGTATAATCAAATACTGGATTATACTTCTACTGT TTCTACAGTACTACAAGATTGTATACTACAACTACTGTAACATTAACTAC TAACTACAAAAACGACAAGGATTCAGAAGCTTCTACAAATTTAAAGTGCT TTATTTTTTATGTCCAAGGTGCACATATCTTCAGCAAACCATTTTGCCAT GGATACATCATACAGACCTGCATGTAGTATCCACTGACATTTTTCTAAAG TATATATACACAAATAGTTAGAGATTGAAAGTCTAAGATGCAAGTTCTAG TGCAATAAGAAGTCAGTAACTTACTTTTTTTCAATCCATTGCAATAGTAA AGGAGGTTTTATACAGATATAAAACCTCCTTGCAATAGTCCAAATTACTG ACACATCAGACAGATAATAATGCGCTGTAGCTACATTTGACATTTTCCTG TAAAGGAATTTCAAATAAATTCTGCTTCACAAATATCTGCAGTACATTTT TGTACATTCATCTTTTTTACTTGAATCTTACAGAACCCTGCAAAATGTCC ATGTTCAGTCTGACATTTCCTTGTGAACCACACAACACATGTTTACAGAC 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CCAATCATGATGTTATAACGTAGGGAGAAGAGATGCCGTCCAAGTCCTCC TTATGTAACCCGTAACCTTGAAGTGGCCTTCGGGTCTTGTTACATTTTGA CCATTAAGTACTAAGTACTAGTAGTTCAATACCTAGAAGTGGTATCTTGG TCTTGCAATTGTACTGAGCAAAATTTAAAAAAAAAAAAACACTTCATCTG TACACTACTAGATGATTTCCCTTCAGTAACTTTACGATCCCTCTAAGAAA TGGTTGTTTTTAGAAACATAGAAGAGGGCAGCCTTAGACAACAGCATTTC TTTTGGCAGCATTCTTGCTTGTTTTTTAGATGGCCGCATGTATCATTTGC AAAGGTGTGGAACATTTGATACCCAGTTTTCCAAGATTTCCCTTCTGTAA CTTTAAAATCACACCTTTCGGAAACATCAGTTTCTGTCGCATAATAGAGG GCAGCATTAGATGAGAGCTCTTCTTTTAGCATCATTTATGTTTGATCAGA GGTAGTATCAATTTATGTATTACTTGTAAAACACTGTATATTACATGATT TCTCTGTCATGACTTTCTGATCATACCATGGTTATTTGGATAGCAGAGAA GAGGGCAGCATTAGACCACAGCTGTGCTATTGGGTAACAAAGTTCTTTGT CCTTTTCAGTGTTTATACCTTGCTGAAGTTTCGATGATCATCTGTCACTT ACATAGGTTCCAACTGTAGCCGGGACTGTCATGCTAGGATTGTGTGTGTA ACCTTCTCACTGCTGCTTAACCACATAACCAATACAAATCCGGTGCCAAA CAGCTACCTTAGCAGGCTGAAGGTTAACGTGCCAGAGGTGTGGTTCTCAT CAAATAAGGGACCTCCATTTCATGTTTTATCCGAGGGACGTCCCTACCCA AAGCTAGGTTATCCTTTAAAACCTGAGTCGAGTGAGGAAAGTTGGTGTAG AGTTGACAACCCAAACCATTTGGCCACTGCCACCTACATCTTCATGTACC TGTGCATCAAGCTGAACATGGCCTCCCGACCGTCCCTCGGTTAGGAGTGA TTCAGCTGGTGTTCGGCTGCGG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000361:78026..95247+

>Blg14005.1 ID=Blg14005.1|Name=Blg14005.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1011bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000361:78026..95247+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCAGTAACAAGAACTTTCGAAGGTTACGGTGCGGCAATTTTAAACAG
ACAGCGTGACCCAACCGGCGTGCTTCCTTTCATGGAGCCCAACGTCAACG
AACTTCCCCTGGTCCTCGGGCGAGACTGTTCCGGCATCGTCATGGAGACA
GGACTCAACGTGAAGGAATACAAACCTGGGGAAGAGGTTTGGGTAGCCGT
GAACCCCTACAAGATGGGCACACATGCAGAGTTTGTACTGGTCACCAACA
GCGAGATTTCCCATAAACCAAAATCGTTGACCCATGTGCAAGCAGCATCC
ATTCCTTACTCTGGTTTGACGGCCTGGGCCTCACTGGTCACCCAGGGTGG
ACTGAACGAGAAAACAGCGAAGGGGAAAAGGGTGTTGGTCCTCGGGGGTT
CTGGAGGTGTGGGAACGTTTGCTGTACAGTTGTTAAAGGCATGGGATGCC
CATGTGACTACAACATGCTCCAGGGATGCCATCCCCATGATGACATCACT
AGGAGCAGATGACATCATCAACTACCAGGCCCAGGATGTCAAAGAACAAC
TGAAGAGAGTTGACAAGTTTGACCTAATCCTGGATGGAATTGGAGGTGAC
ACAGAGAAGTATCTCTTCAGTACCGACTATCTGAAACCCTGGGCAGGGGC
CAAGTATGTCACCCTCAGAACCCCCCTGCTGAAAAATGCCGACTCACTCG
GCCTTACCGACGGTTTACTCAAATCAGGGATGTCTCTGGCTGGTAATGCA
GTTAAGGGTTTGGCATCTGGCATCCACTATCGCTGGGGATTTTTCACTCC
TGATGGAATGGCCTTGGACAAGATGGCATCTTTAGTGGACCGGGGGAAGA
TCCGCCCAGTGATTGACAGAGTGTTCACCTTCGACCAACTGCCAGCGGCG
TATGAGAAGGTCGAGCAAGGTCATGCTCGGGGGAAGACGGTCATTTCTAT
AGCAGAAAAGAGGACAGAGATCGATGACAGCTCTTCTTTTACTAGCATCA
TTCATGCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:78026..78409Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:78026..78409Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:79875..80038Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:79875..80038Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:82358..82426Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:82358..82426Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:82626..82750Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:82626..82750Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:83235..83283Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:83235..83283Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:84059..84195Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:84059..84195Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:92587..92776Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:92587..92776Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:93521..93613Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:93521..93613Branchiostoma lanceolatumexon
Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:93979..95247Blg14005.1-exon-Sc0000361-1570713199:93979..95247Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg14005.1Blg14005.1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000361genomeSc0000361:78026..95247 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg14005