Blg13968.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg13968.0
Unique NameBlg13968.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000150:714568..751787+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg13968.0 ID=Blg13968.0|Name=Blg13968.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=37220bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000150:714568..751787+ (Branchiostoma lanceolatum)
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AGGAATGTTCCGTTTTTGTTCATTGTTGATTTGCGTTTAACAAAACGTGG CAAGATTGCATGTAGCAACCTTATTCTCCAAGCAGATGTTGGGGGGAGGG TTTATAATGTTTTCTGACTACCAGGATTCTGTAACAACTGTGGGTGGGTA GCAGTCGAAAAACCTATCAATTTTTCACCCCAACATCTGCTTGGCTCAAG TTGAAGATTAGCAACCCGGACATCTCAATCCAGGTTAGTGTCTATTATAT GTTTCGTTGATGAAGGTTAGACATCCAGGTAATGAGATACGCCAAAAATA ATTACTCAACCAACTGGATAAAATTTTGAATCAGTCAGTCACTGACGAAA GATAGCGGAGGCTGTCTGAAACGTATATTCCAAAATTGTAGTCATTTGCT TGAGTAATTATTGTTGGCCCTTCTATATGTTGGTTCTCTCTGTTTTCTCT CGGCCTAGTGTAGCGTGCGTAGTCCAGTGGTTAGCGATCTTGCCTCTGGA ACTAGAAGCCCGGGGTTTGATCCCGGCTATGTCGCTCACCCGACATGCAC GCTACCGGAAAAGATCGCAGGGACGTTAAGCCGTGGTCCACTGTTCATTG TGCTATTCGAAAAGAGCTAGGGGAATTTCCCGGTACAATGAACCTGTAAA TACTGTACATAGCGTCTGTCTTCTTCTCTGTCACTACCAGTGGAAGATTA GCTCTTCAGTGAGCTAAAACTGGATCGAGATTACTTTCCTTTTTTCTCTC AAGTATTAAACTGTGTATCTCAATTACGAAGCAGGAGACGAAAATCTTCC TGGAGGAGGACTATGCAGACATCAAGTGGAACTCCGAGATCAGCATGGAG GAAGCTATGAGGAGCCTGGAGCTCAAGATGTACCCATTTAAGAAGGTAAA GAAATACTGTAAATTACTGGGTAACAAAGTTCTTATGACACAGCCCTAAT CCCGGATATATGTTACCCTGTGGATTTAGGTGGAGTAGCGTTGATGTTCC TGTGTGTCTTTCCAGGTGCCATATTACAACTTCACCGAAGCCTTCAGCCG AGCTGAGTCGGAGAACAAACTGGTCCATTCCATTCTGCTGTGGGGGGCGC TGGACGACCAGTCCTGCTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000150:714568..751787+

>Blg13968.0 ID=Blg13968.0|Name=Blg13968.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1293bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000150:714568..751787+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCGTCGGAAGGGACAAGGGAGCCGCCGGACAAGACAGGCGGTGGCGG
GGACGCGACGAAGAAGCGCTCGAAACTGCGCTCGTGTTGTCTCTGGGTGT
GCGCGCCTGCCGCGGTGCTGCTGGCCGCCCTGGGGGTGGGGATGTACCTG
GACTACCGGCGGTGGGAGCGGAGGGAGGTGGGGATGATGTCCCTGGGTCC
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TGAGCATGGAGGAGTTTCAGCCCCTGGTGGACAGGGTACTCGGGAATGAG
ACGAGTTACCCGGTAGATGAGGAAATAGATTCGGCGGGAGAGATTATCGT
GCTGAAGACTCACTTTGAGCCTTTCGTTCTCGCCTCCATGTCCAAGAACA
AAAACCCTTTCGGGTTTATGAACAGCGGTAACTTGAAGGGGCTGAGGTCC
TGGACGGAGCCGGTGCGAGAGTTGTCGTCCTTCGGCGCGAGCCACTTCGC
CCCCTTCCTGCCCCCTCCCGCCGGCTACTCCGTTCTGGGGGCTGCTTATG
AGATCATCCCCTCAAACCTCAACATGTTCTCAGGAACACTGTCGAGTAAC
CGGTACTTCCCCCCGAAAGTGTCCAACAAGGAGGTGATCCTCCACCGCCT
GCTGGGCCTGTTCCACCCGCGACCGTTTGTCTGCATCCGCTTCGCCCCGC
AGGGCGCCGTGGCAACCGTGCGGGCAGAGAACGAGCGCTGGGTGGACGTG
GTGTTCAGGATCCATGCGGAGTTTCAGCTGAACGAGTCGCCGCAGTACCC
CTTCTGGTTCATGCCGGCCCAGTTCACCGGGAACATCGTCCTCACCAGGG
ACGCCTCGCGCGTCAGGCACTTCCATCTGTACGTGCCTACCAACCGGCCA
GTAAACGTGGTCCTGGAGTGGCTGGACGCTCCCGGGAACGAGAGCCACGA
GGTGGACGCCGGGTACATCCCTCGGATGGAGCTGACCTCTGTCGCCCCGT
CCTCGCCCGTTCTCATCCACCAGGAGGACGGCTCCTACATGGACCAGCGC
CAGGCTCAGCTCACCGAGGAATGTTCCGAGACGAAAATCTTCCTGGAGGA
GGACTATGCAGACATCAAGTGGAACTCCGAGATCAGCATGGAGGAAGCTA
TGAGGAGCCTGGAGCTCAAGATGTACCCATTTAAGAAGGTGCCATATTAC
AACTTCACCGAAGCCTTCAGCCGAGCTGAGTCGGAGAACAAACTGGTCCA
TTCCATTCTGCTGTGGGGGGCGCTGGACGACCAGTCCTGCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:728898..729066Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:728898..729066Branchiostoma lanceolatumexon
Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:729504..729538Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:729504..729538Branchiostoma lanceolatumexon
Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:749636..749775Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:749636..749775Branchiostoma lanceolatumexon
Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:750048..750199Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:750048..750199Branchiostoma lanceolatumexon
Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:750512..750678Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:750512..750678Branchiostoma lanceolatumexon
Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:751452..751562Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:751452..751562Branchiostoma lanceolatumexon
Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:751683..751787Blg13968.0-exon-Sc0000150-1570713199:751683..751787Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg13968.0Blg13968.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000150genomeSc0000150:714568..751787 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg13968