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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000150:201024..215322- Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Blg13933.3 ID=Blg13933.3|Name=Blg13933.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=14299bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000150:201024..215322- (Branchiostoma lanceolatum)
AAGTACATAGTACAAATATAACAATTATCTGTTTTTCTCAAATGTCACAA
GGGTCTTTGTCATCTATTATTCATTAACGTTACGTTCGTTTCCGAACGTA
GTGGTAATTTGATGTCCTTGAATTGCGATGACAACAACTTCCGAACTTGC
GCAAACAAGCGCGCGCAAGACGAAACCAGTCTTACGCTACCCACAGTGCC
CCGCGTCGTCACGAAAATAGATGAATGATCTCATCCTCCCATATATGGTG
CGCCATTTACATAAGAATGCCCAAATATGGAGGGTATGAGTCATGCTTTC
CTCTGCAGCATAAATAGTGGTAAGCGGAGACGGTTCACCTGGTGTCACTT
TACGGCGTCTGTGGAGTACGATTCTGGGGTCAAAACTGCCTCACGAAAGG
ACTTTAGGACCCGACTTGGAGCACTAAACTACCAGGAGAACCACCCTACA
TTCCAAAGGACCGCTCGACGCACTTTAACCGAGTCTCCGGCGTTTTTGCG
GGCTCGACAAGACCAGCAGACGAGAAGGAACAGTTTCGGGCCGAGTAATT
GTTGTCAAAGCTTTGAAAAGGCCAAAGGTTTCCTGAACCTCTTGTGGGAC
GTTTTGTCGTTGCGGAGTTAGCTCCGCGCTGGTAGAAGGAGAGGAGGAAA
GTTTTATATATTCTCTGTCCAGCAAGTTGGTCTCCGACCACCCCGACTTT
TTAATGTCTGGAGGGCTAGCCCTGTTCCCTGCCGCAGAGTTAGGATTGGA
ACGCCTTCAGCGCTGTGGTACCGACACTTTGCGGCGGTGTTCCCGAGAAC
TTCCCAACACTCTCAACATGGCGGCCAGCAACCTCGCCCGCACCGCCTCC
AACCCCAACCTGCTGGACTCCGTCAGGACCATAGGCCCCGAGGAGCTGGC
CCAGAGGCTGGCCGGCATGCAGAAACAGCCGATCATGCTGGACTGCAGGT
CGTTCATAGACTATAACCTGAACCACATAGACGGCGCTCTGAACGTGAGT
TGTTCCGACAGGTTTAGTAAGAAGAGACTTCAGCAGGGCAAGGCTTCTCT
AGCCGACCTGGTGCCCAACAAGGAGGGCAGAGACATACTCATGAACAGAT
TGTCCAGAGAAATTATCGTTTACGACGAAAGCACGAGTGAACCAGAACAG
ATCCAGCCGTCACAGCCGCTACATGTCGTGTTGGACTCCCTCTTCAAAGA
AGGGAGGCAGGCCGCCATTCTAAAAGGTGAGTCACCATTGGTTGATCATC
AACTTCCTTGGAACTATGTCTCATCAACCTAACATTTGTCATCACACAAA
AGTCGCCAAGTTGTTGTTTATAGTTGTTTTGTTTGTGCAGATTATATAAT
CATAGCCGTTTCGGCCTTACCAGAGTGGCTAAAATTGGATCTTAGGTGGC
CTTATATATTTGCTTGATTTGCCTAAGTATATGAATTGCTAAATCATCCG
AATGATCTGGAAAGTCAACATTGCAGGAGTCTAAACTGAGTCATGACACT
AGAAAAATCATGACAATGATTTATTTTCAGCAACATCACTGCCCATCCCC
TTTCTGTATATATGTTTAAAGTTTTGCACTATCATCAGTAAAACTGAATA
TTTGTTGGGTCTAAGTATAACGTTATAAACATACCACCATCTTCAGGAAT
AAAGGCAAGGTCTGTACTGTAAAAGTCCAAGTCTTGTCCCTGTCTATATT
GTGTTGCACTTCTGGCTTTGGCACTTCTGTGTTTGTACAACTTTGCTTTA
GATTCAGTGATACTTTTCTCAACTCTAACAAAACATTTGGGACTGAGTCA
GAACCTCTTTGGTAACGTATTGTTGACCTGGCAGAAGTTAATCTGACATA
CAAGTTTGCTAGGTAGTACATGCGTGTACTTTACATCTACAGTAGTGGAA
AGATTCTGCCCAGAAATTTAGAGCAAGGTGTTAGGTGGTACTGTGTAGTT
CTGGGGAGTGAGAAAGTAGGCACAAAACAAGCAGATTTTAATGAATTCAA
AATCGCCTACGTTTGAAAATTGGTGAGTTAGTGCTGAGGAAGTATTCCTT
CGCGTGATAGGGAGAGCCCTGAGGACTCGAGGGAGAATACAAGAGCCTAG
CGTAATACTGTAGTAAAGCAGGAGATATCTTGTGCTTCCCCTTGCAAATG
GTGTCCGCTTGAGTGGGCCTAGACCATTACATCATCGCCGAACACCTGCC
TAGCCTAACAACCTGGTCCCGGAAGATTTCCTCTAACCAGGCAGCTCATC
AGCAGATCCCGGCGAGTGCACACGAAATGAAGCTGTTCTCCCCCACTCTC
ATCACCATCATATTAGAATTACAGTCGTGTCATGTCCAAAGCTCAGAGGA
GAGATGGTAGCTGTAATGTATTGGAGCCGACCTATCACAGGCATTGTGAT
GGATGCGTTACAAGTAGGATTTTTGTACAGCTGTATTGCTGCCGGGGCAG
GTATTGCTAAAACACTTAAGGACCTGGAGATAATGACAATAACCACACAT
CATGAATAATGAAGGCAGGGCCTTTCAGGACACGTTGAGAGTGATTTCTG
CAGCCAATCGGCGGTGGCTGGGTGATAAGTATGTCCAATTGCGGGTAGAA
ACATCAGCGCGTTGTGTGTGATCACTTATTGCATCTCCCACCACCCGGTG
GAGGAGGCAGCGGCCATCAGTTATGCGCGCGACGACGCTCCGTGGGTGAA
GGTGGTTGGGGTTCGGATGGAGACACGTAGACAGAACGTGCAGAATCAAT
ATCCTCGGGGTGCGATATTGAGGAGTAAATCTTTGCCGACGTGCGTGTGC
AGACGGCTCGGCTCTCTCAGGAGATGAAAGTTAGCTGTTGAGCGTGGAGT
GTTGTGCGGAGCCGCGACGCCTCCCTCCCTCCCGGGGACCGTGTGATGTT
CTGCTTCTGCCAGCAGGAGTGTAAGAATGAGGACGGGCGTAAGTTGTCTG
CTGTATAGCATCATACATGGTGTCTTTCCCCTGAAAATTTGTACCGCCCC
CGTGTTAAACGGGGTCGGCATCATCCCCAATAGTTTTGCTATTTGTTGGT
CGTTAGCGAAGTGCCCAGACATATTTCATACCCTGCCGTGTCCGTAGATG
GAGGTTTTGAGGTCAGTTTCCGTGCGGAGACGGGTGCTCGTTACACTGCA
GAGTGTGGACTATGATTATGCCATCGGCGCATGAGGTAATTGTTATGATG
GCTGGGTGTCAACAGACTGGTTCTGCCAGGGCTGTTTTCATTGTCGGGCT
GCAGTGTTTTGCAGTGCAGAGGGGTGACGTCATGTTTGCTCTGCCAATTC
ATGATTGCCCCCGGCGAGATTAGAAGGTTATGTTTTCACCAGAGCCGTCC
CTCGGCTGGATATTAGACTTGATCTATATCTATGTTTAGATGTTGTTAAT
CGATTGTCATGATTTTTTATGCTTGTAAGATAACATAAGCAAGGATTTTA
GTGTCTTGACTAAGGAAAGGGGTAGTGAAATCAGACCCTGAAGATGTTTT
AAAGCCAATAAAGGTTGTGGTGAGAAATTTACAGTTCTAAATTATTACTT
ACGGTGAGAATACAAGCATGGTCGCAACATTACTTGGTAAGGCATAAGGT
TTGTCAGGCCGATCCAAGCAAATTACTTGTTTTTCAGCAAATTGAAGATT
ATGAATTGTATGTTGATAGCTATTACATCTCTATGTAACAAGTATGGTGG
CTGTAGATTTCTTCACATTGAAGTGGAGGGGTTTTCTAGTTTCGTCTGTC
CTAACTATTCTTCTTCAGGCACAAAACATTCTGACAGAACATATGTGTAT
GTCTTATTTCATTTCACGCAGGGCCCTAGCAAACCTTAGGAATCAGCATA
ACTGTTACATCTCTACACAACTGTTGAACATGTGTGTAGTTTTCTTCAAA
TTGAAAAGGAGAGGGATTTTCTTTCTATTTCCCTCTGTCAGATCCAGTCA
TCTTCAGACACACGGAACGTATGTTTCTGTCTACTTTGATTACAGGCAGC
ACCCTTGTTGCAGACCTAGGAATGGGGATGTGTTGATGGCTGTTACATCT
CATTGCTACTACATGTGCGAATATGATGTCTGAAGTTTACATAAGAAGTA
GAGGTTGTTTTTTGTACAGTAGTTCCCTCTGATCCATTCTTCTTCAAACA
CAGGGAACGTATGTAAAATTTGTAAATGTCTTTTTTTATTACAGGCAGCA
CCCTCGCAGTCCAAGGAGTGCTGTTGGCTGTAACATCTTTTTGCTTTGTG
TATGAATATGATGCCTGTGACTCTCTTCATGTAAGAAGTAGAGGGATTTT
TTGTCTGATCCATTGTTCTTCAGACGCAGGGAACGTATGTTTATGTCCTC
TTTGATTCCAGGCGGTGCTCCAGCATCAGTGCGGCGGCTTACCCGGGCAG
ACAGCGTGTGTTGTACTCATCCATCACGCCGGTGCTGCATGTTTTATCTG
CGAGGAGCAGGCAGCTCACAGATCTGACTGGTCCAATAACTCTACGTGTT
CTGTCTTTCAGGTGGGCTTAAGGAGTTCAAGGAGCAGCACGAGAGCCTCT
GCGCCAACAGTCTCAGGAAAGTCAGCAGCGCGTTCGGCGGCGTTCCCGTG
GAGGAGTGCGAAACTCCGGACATTGATTCCGAACCCCCGTCGCTCGTCCT
CCCGTTCATGTACCTTGGGAACGAGCGTGACGCGGCGGATATCAGGACGC
TTCTGAGACTGAACATCGGGTACATCCTGAATGTGACGTCACACATTCCC
TTGCACCACGAAGGATTCTGTGGGATTAAGTACAAGAGGCTACCGGCCAC
CGACAGTCAGCACCAGAACTTGCTACAGTACTTCGAGGAAGCTTTTGAAT
TCATCGGTATGTATACAAGATATTTGAGGGGAGCATGGTTATGTAAACAA
GAAATAAGGGGCCCATGATTAATCATTTCCTCCTTTTTCCAAAATATACT
AAATACATACCAAATATAGTAAAGATCCATCTACAACTTCTCTAGCTATG
CTGTTCAAAAACACACACACACACAAACACACAGACCCGGAAACAAGAAA
CCTAGAAATTGTAATAATGCTTTAAGGTACGCATCTGTGCATGTATGTAG
TTAATTGTAATTCCAGCTGAGTAATCTGTGTATAAGGTATGATTCACTTA
TTCAGTGCAGTTCAATGAGTAACCGTGGATAAAAGTTTTAGTGCTGGTGC
AGACTATTGTAGCATGTCCTACAATCTGGACATGCCTTTGCCTTAGCTGT
GTGACATTTGCTGACATTTTGCCAACCATCCTGCCATTGTTGATGTTTTG
TCATGCAGACGAGGCCAGGTCAAGTGGGAGGAACCTCCTGATCCACTGCC
AGGCGGGCGTCTCTCGCTCCGCCACCATCGCCATCGGTTACATCATGAAG
CACACGCGCATGACCATGATGGACGCCTACAAGTTCGTCAAGAACAAGAG
GACGGTCATCTCCCCGAACTTGAACTTCATGGGACAGCTGGTGGAGTACG
AGACGGCCTTGAACATCGGACTCACGCCCAGGGTCCTGTACCCGAGGCTA
CGCGGCTTGGAAACGAGCGTTTGAGACGATAATGCGTTTTGTTATGAGAC
TCGCCGATGTCTGGACCTTATCCTTGACTCTGTCCATCCATCTTGCTCCC
CGACAAGCAGACAACAGGAGACCCCTCCCACCCCCTCCCCCAGGGTCGGA
CCGAGGGTCCCGGCAGAAGAATAGACTTTTCTCTTTTTGTGTTGTGAGTC
TCAAGGCCGCCTCCATTGAGGAGTTGTCAGGCTCCTGCTGAAATTACAGT
GGGGTGAGGTCAGTCCATTCCTTTCATGCTGAGGGTCCTTCTGGAGTAAA
CATCTGTGCCTCCAAACAGGAACAGGGCTCGAAATACTTTATACTGTAAG
CCTGGGCTGGTGCAGGTAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTGCTGGTGCAGACTATTGTA
GCATGTCCTACAATCTGGACATGCCTTTGCCTTAGCCGTGTGACATTTGC
TGACATTTTGCCAACCATCCTGCCATTGTTGATGTTTTGTCATGCAGACG
AGGCCAGGTCAAGTGGGAGGAACCTCCTGATCCACTGCCAGGCGGGCGTC
TCTCGCTCCGCCACCATCGCCATCGGTTACATCATGAAGCACACGCGCAT
GACCATGATGGACGCCTACAAGTTCGTCAAGAACAAGAGGACGGTCATCT
CCCCGAACTTGAACTTCATGGGACAGCTGGTGGAGTACGAGACGGCCTTG
AACATCGGACTCACGCCCAGGGTCCTGTACCCGAGGCTACGCGGCTTGGA
AACGAGCGTTTGAGACGATAATGCGTTTTGTTATGAGACTCGCCGATGTC
TGGACCTTATCCTTGACTCTGTCCATCCATCTTGCTCCCCGACAAGCAGA
CAACAGGAGACCCCTCCCACCCCCTCCCCCAGGGTCGGACCGAGGGTCCC
GGCAGAAGAATAGACTTTTCTCTTTTTGTGTTGTGAGTCTCAAGGCCGCC
TCATTGAGGAGTTGTCAGGCTCCTGCTGAAATTACAGTGGGGTGAGGTCA
GTCCATTCCTTTCATGCTGAGGGTCCTTCTGGAGTAAACATCTGTGCCTC
CAAACAGGAACAGGGCTCGAAATACTTTATACTGTAAGCCTGGGCTGGTG
CAGGTAACATACAAAATGACCAGACATACCGGAAAAGTAGATTTGAGGAA
TCAGATTTGAATCTGCTTCTAAACTACAATTCTTTTTGTTTGTTTGGCAC
TTAACATGTGGTAGACTCTAAAATCCACATACACTCATATACCCAATACA
TTTTAGTGCAGGTTAGGTACAGGTAGACATCAGAAATACCTGCACAGCCT
CTATTTTACCTGCATGATATGCAGGTTGTATTTCAAGCCCTGAGGAGGAA
GCGTTTAGTTCCAGGCAGTACAATGTTGACATGATGTCATACTCTGTGGT
CGGGCCAGTTCTCTTTGTGTTGTTTTGCGTATCTGTAAACAAATAGTTTC
TCATTGTTGTTTAGCTGGTTCCTATTCCCCCTGGTACTTAGCTGTGGACT
GTATATTTTTGTACACTTATATGAACTCGCTGTCAATCGTGCAGACGGTA
CCAGAATGTGTATTTTGTATTGTTTTCTCTTGTTACAACCCTGTCAGTGT
CCGCTTGTGTCATGTCTGCTTCCGAGACAGAGAGGTGATACATGTGGCCA
GGTGTGGGACATTCTTGTCAGATGAGTAAGGCTTTCAGAGGAAACCAAAC
CTGGGTCTCCTACATTTTCTTTCAGGGCTCGATATACCTAACCTGCGATT
TACTGAAAATATTGAAAGAGTACAGGTAGAAATAAAAGCAATTTGCAATT
TTCAGGCTATAAAATTAAAAAGCCAATGCTTTGAAGGTACTGTATGTACC
AGCAAACAAAGCTTGTATCATTTTCACCCCCTTTCCTCAATTCCTGTTGT
GACTGTACTGTGACAACTGAGCAACAAAACATTTGACGAATTGCTCATCG
AATGTCATAAATAAAGAAAGAAACTTTTTATGTTTTGTTGTATTTCAAAG
CATTCTTTTACATCATGGAACTTGTTCCAGTTATAAAATCAAGGGTCACA
CAAATCCTATTTTGGTGGCTGTACGGCCACTCAGTGATTACTGTGTACTG
GAAAGAGGGGCCTTTTTTATTACTTTAGTAAAACATGACTTGATGAGATG
ATTTTACTCAGCTTTGCGTAATGATGATTTAGGCTTCATTGATGGCTTCA
GTATTTGCAGAATTTTTTTTTCAAAATGCAGGTAAACTTTCTGACAGCTC
CTGCACTGAACAAGTAAAAAGTATTTCGAGCCCTGACTTTTGTTTTTGTT
GTTATGTAACTGTACTGTACTCTTATCTCCCCTCAGCTGGACCAAACCTG
CTACTATCCCAGGTTGTTTGTTTCCCACCTTAGTTAATATTCAACCCTCT
GACATGGCCTTGTTGCTGAGATGTTAAAATGTCATGTGGAAATTTGCCAA
AGACCAAATCTAAAGGGGCCATTTTGTAAATATTGTTGACCAGAGCTCAG
AGCGGGGATTTTAAATGCCTTCAGAAGAGTCCTCCTTCCCCATTGACTGT
CAGATTTTCAGAATAAAGGTTCTTTGTAATTTCCAATGATGGTTGTTGTT
TGTCTAATTTCCGTCATTTAGTCATTGCAGACTGACTTAATGCAAATGTA
TTCGAAAATAAAAGTGAACATTAGGAAGACTTATTGTTTTAGATAAAGGA
CTAAATTGAGGATCTTGAAACACTAAAAAGATGGAAAAGATGTAGCTAAA
GCCTCAATACTAAAATGTACATATTTTTCATTTTTTTAAAGTGTTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000150:201024..215322- >Blg13933.3 ID=Blg13933.3|Name=Blg13933.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1134bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000150:201024..215322- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGTCTGGAGGGCTAGCCCTGTTCCCTGCCGCAGAGTTAGGATTGGAACG
CCTTCAGCGCTGTGGTACCGACACTTTGCGGCGGTGTTCCCGAGAACTTC
CCAACACTCTCAACATGGCGGCCAGCAACCTCGCCCGCACCGCCTCCAAC
CCCAACCTGCTGGACTCCGTCAGGACCATAGGCCCCGAGGAGCTGGCCCA
GAGGCTGGCCGGCATGCAGAAACAGCCGATCATGCTGGACTGCAGGTCGT
TCATAGACTATAACCTGAACCACATAGACGGCGCTCTGAACGTGAGTTGT
TCCGACAGGTTTAGTAAGAAGAGACTTCAGCAGGGCAAGGCTTCTCTAGC
CGACCTGGTGCCCAACAAGGAGGGCAGAGACATACTCATGAACAGATTGT
CCAGAGAAATTATCGTTTACGACGAAAGCACGAGTGAACCAGAACAGATC
CAGCCGTCACAGCCGCTACATGTCGTGTTGGACTCCCTCTTCAAAGAAGG
GAGGCAGGCCGCCATTCTAAAAGGTGGGCTTAAGGAGTTCAAGGAGCAGC
ACGAGAGCCTCTGCGCCAACAGTCTCAGGAAAGTCAGCAGCGCGTTCGGC
GGCGTTCCCGTGGAGGAGTGCGAAACTCCGGACATTGATTCCGAACCCCC
GTCGCTCGTCCTCCCGTTCATGTACCTTGGGAACGAGCGTGACGCGGCGG
ATATCAGGACGCTTCTGAGACTGAACATCGGGTACATCCTGAATGTGACG
TCACACATTCCCTTGCACCACGAAGGATTCTGTGGGATTAAGTACAAGAG
GCTACCGGCCACCGACAGTCAGCACCAGAACTTGCTACAGTACTTCGAGG
AAGCTTTTGAATTCATCGACGAGGCCAGGTCAAGTGGGAGGAACCTCCTG
ATCCACTGCCAGGCGGGCGTCTCTCGCTCCGCCACCATCGCCATCGGTTA
CATCATGAAGCACACGCGCATGACCATGATGGACGCCTACAAGTTCGTCA
AGAACAAGAGGACGGTCATCTCCCCGAACTTGAACTTCATGGGACAGCTG
GTGGAGTACGAGACGGCCTTGAACATCGGACTCACGCCCAGGGTCCTGTA
CCCGAGGCTACGCGGCTTGGAAACGAGCGTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| Blg13933.3-exon-Sc0000150-1570713199:214097..215322 | Blg13933.3-exon-Sc0000150-1570713199:214097..215322 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg13933.3-exon-Sc0000150-1570713199:210467..210811 | Blg13933.3-exon-Sc0000150-1570713199:210467..210811 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg13933.3-exon-Sc0000150-1570713199:201024..203325 | Blg13933.3-exon-Sc0000150-1570713199:201024..203325 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000150 | genome | Sc0000150:201024..215322 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | Blg13933 |
|
