Blg03413.21 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg03413.21
Unique NameBlg03413.21
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000130:307346..372677-

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg03413.21 ID=Blg03413.21|Name=Blg03413.21|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=65332bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000130:307346..372677- (Branchiostoma lanceolatum)
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AGAAATCAGCTCTTCCAACAGCGGCAGTAATCAGCAGATGTCCACTGACA GCACTTCCTCCCCCGCTTCAACCCCCAACACCCCCCCACCCCAGACCGTA GCGCCCAACGGTTACGTCCCGTACGTGCAGCCCATGCACGTGCCCTTCTA CCCCATCATGATCCAGGCCACAGACAACCTGACAGGTCCCGTCAACCTCA ACTTTGGGCCCTCCAGGGATCCGTATGGGAACGATTTGCCACATTCAGGT GAGTTTTGGTCAGATTTGTGAATACTTCTGTGAATAGTTAAATCAGATTG GTTAGTCACTGAATAAAAAGACTCTTTGTACAAAATGTACAGTCAAGTGA TTTAATCAACCAACGTTTCAGTGACCGTCTGTCACCTTCCTCAAGGCAAT TCTGACTGGTTCACATCGCACTGCACACAGGTGTCGCTGCTTGTAGATGC GTTCCCAGATGCAAAGTATTTCCCGTTCCCTGTAATAGTATGATATATAT TATCTATAAGCAGCGACACCTGAGCTGCAGTGCAATGTGAACCAGTCAGA ATTGCCCTGAGGAAGGTGACAGATGGTCACCGAAATGTTGGTTGAATAAA TCCCTTAGTTCTGTAAAGGGATGTTCTTATTCCGATTTGTATGCTGTATA ATACTTCTATTTTCAAACACACTATGTCTATGTCTTCCATTGCTTTTGCT TAATACTGTGTGTGAAGATTTTCTTGCATAAAGCTACTGATCAAGCTTGG CTGATATTTGAAAATACACTGATATTTGTTGTCAATTTCATTTACAGATG TGTCCACGCTTAGATTCTTCTACAATTTGGGCATCGAGGTAAGGAAACTT GTTGGCTGAAGCTTCAAACTAGTAGATCTATTTGAACATGATATGTATTG AAGGAAATTTAAGAATATGATCCATCAGAAAATACCCATGTTACAAGCCT ATAAGACAACAATAACAGTAGAATCAGATCATTTTCCATCTCAACGACCT TCACAGATACACTGGTGTGAAAACTGTGGGGAAATCCATTGATGCTCAGA GTGTGCATTGCATTCGTTGAACGTTTTGTTTTCACTGAGCCCTTTTTTGT TGCAGTACTATCGCTGCTGCATGAGCATGATGGCCATACAGCACCAGCAA CAGGAGGCAGCCATGGCCAATGCTTACTACTACAACCAACAGGCACAGGG GCAGGTACTGGAGTTTCCTTGGCTAGGAAAGTTGCCTGACATGTATAATT TTGTTTTCCATGCAGTTTTCTGTGTCTCTGTGTTTGTCAACAGTGTCCTG GAATCCATTGTATCTTCCAGTTTATGACATTTAGTTATAATAATAGATGT TGGCAAAACAAAGGACAATTTGTTGTTGGGTTGGTTCAAAATGATTATTG AAAAAAAAGGAAAACTTTGAGTATGGGCCTTTGCAAGTGGTTTTCTAAGA TACTGCAGGGGATCTTACAGTTTTAGTTTGTTTGCTCATATTGACTGGTA CATACCATTAATTTCACAATTCAAATATGTAATATAAATTATTCGCTGAA ATTTACAATCATAGATCTCAGTTTTTATGTTGTGTTCTGGACAAGCTACA GGGATGATTTTGCTCAAGCTGTTCACAATGCCAATTTTGGATTAAGAATT TAATAACAATTCTTGTTTCCCAGCCACAGTACCAGCCATCCAGCAGTACT GATGGACCGAGTAGCAGTCAGCAGGCCCAGGAGGGGGAAGACCTGCAGCA GGAGGGGTCCGACCAGCTGCCGCCCAACGGTCAGTCCCAGGACAAGCCCC TCCCCCAGGGGCAGGGCGCTCATGTCTACACTTCCACCAGCTCCTTCAAT CCCGGCAATCAGCCTGTCGATTACCATAGCAGCGCTGGGTGTGATTACCC GCTCAGTAAGACTAAGTCGTGCAGCAACGATAATTCTAATGATTCTGTAG GTAAAGATGTGTCCGTGTCCAGGAGTAACTCCATGACTAGTGTACAGTCT AGTGGTGACAGTGCGATGAATGTACAGTATGGTAGTGATAACGTGTGTGG TAGTGTTTCCTATGTGCAACCGTCCCCCAACGCCCTTCAGCAGACGTCGT CGAGCACGACGGTCGGTAGCGAGGACTCGTCCCCGGACTACACCGACTCG GGTGTGGCGTCCGAGGGCAGCGGGTCGCAGTCGTCCATACCCCGCCCCAC GAGCCTTGGCCCGGGGTTGCCCAAGAGGCATTACATGGAACACCGCGGGT CCCCTAAACTCATCCCCGGGAGGTGGAGCACTCCCGAACGGTCGGGCAGT AGTGACAGCCTGAACCAGGATATGTTCCATACAGGCAGACCGTCATACGG GCCGAAGCGAGGTCCACGAGACAGGCAGGCCGCTTTCTACCGTCCCTCGT ACTTTCCCACGCGCCCATACATGTCGCAGCCCCCCCGCCGTCCGTACGAG GGCCAGCCCCTGTACCACTCGCAGCTGTACAACCCCGTCCGCTACTCCAA CCCCGCACACATGTCCCAGCCCCAGCAGTTCTACACCAACCAGTACACCG CCCCCTCCCGCATGGCCCTGCATGGCAGTATGGGTAACCAGGCCGCCAGC ATGTACGGCCGGGCAGCCGGCATGTATACACACCCCTCCCAGCAACTTAA CGTTCCCCAGGGTGTTACGTCCGTCCCCTACCCCCCTATGTCACCCAGCT TGCATGTACCCGCTGCCTCCTTGCATGCGCCTAACATTGCTTCCTCCCCT TCCACAGGTCAGTATTACCCCGCCCAGGCCCCCGGGCCGGTGGACCCCAA CCCCCAGGCCCCCATCCCCGTGCCCTCCTCCGCAGCCAATGCCACCTACT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000130:307346..372677-

>Blg03413.21 ID=Blg03413.21|Name=Blg03413.21|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=3894bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000130:307346..372677- (Branchiostoma lanceolatum)
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AGCCCAGGGACAGAGATAGAGAAAGGGAGTTTCAGAGGCCTCCACATGGG
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GCCTCCCATGAAGCGAGTCATGACCCCCACCAAGGAGTTTGTGCCACGTT
CCTCCCGAACACCGTCCCCATACCAGAACCCCACCCCCCCACTGCAGAGT
CAAAGTGCCAATGCAGAAATCAGCTCTTCCAACAGCGGCAGTAATCAGCA
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CACGTGCCCTTCTACCCCATCATGATCCAGGCCACAGACAACCTGACAGG
TCCCGTCAACCTCAACTTTGGGCCCTCCAGGGATCCGTATGGGAACGATT
TGCCACATTCAGATGTGTCCACGCTTAGATTCTTCTACAATTTGGGCATC
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CAGGCCCAGGAGGGGGAAGACCTGCAGCAGGAGGGGTCCGACCAGCTGCC
GCCCAACGGTCAGTCCCAGGACAAGCCCCTCCCCCAGGGGCAGGGCGCTC
ATGTCTACACTTCCACCAGCTCCTTCAATCCCGGCAATCAGCCTGTCGAT
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CAGCTGTACAACCCCGTCCGCTACTCCAACCCCGCACACATGTCCCAGCC
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CGTCCCCTACCCCCCTATGTCACCCAGCTTGCATGTACCCGCTGCCTCCT
TGCATGCGCCTAACATTGCTTCCTCCCCTTCCACAGGTCAGTATTACCCC
GCCCAGGCCCCCGGGCCGGTGGACCCCAACCCCCAGGCCCCCATCCCCGT
GCCCTCCTCCGCAGCCAATGCCACCTACTACACCGCTCATCCCGGAGGGG
ACATGCCCTCTCAGCAGCACTATGCATCAGCCTACGACAACCAGGCCAGC
TACCAGTACCCTGCCACCATGGGCTCCTGGCAGCCTCCGCACGGCGTGCC
CTTATACGGCAGCCCCAACAAGGTCACGGTCGCTTACGCCACCAACTCTC
CGCCGGTAGGGTATCAGGGATACGCAGGGGCCCCTCAGATGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg03413.21-exon-Sc0000130-1570713199:311990..312030Blg03413.21-exon-Sc0000130-1570713199:311990..312030Branchiostoma lanceolatumexon
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03413.21Blg03413.21-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000130genomeSc0000130:307346..372677 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg03413