Blg03372.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview


Name	Blg03372.1
Unique Name	Blg03372.1
Type	mRNA
Organism	Branchiostoma lanceolatum (Amphioxus)

Full-screen view

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000618:9714..29552-
coding sequence from alignment at Sc0000618:9714..29552-

mRNA from alignment at Sc0000618:9714..29552-

Legend: exonpolypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>Blg03372.1 ID=Blg03372.1|Name=Blg03372.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=19839bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000618:9714..29552- (Branchiostoma lanceolatum)
CGGACTTTGAAACACCCAGAGCTAAAACCGCATATCGCTCTACAGACAAG
AAAAACCACGATGGCGTTGTTGCTGTTTTTCGTCGTGCTGTCTACACCGG
GGGTGTTGGCTCAGTTTTCCATCCAGGGATGCCCCATGTGGGGCTGTAGC
TCCCAGGGTACCTTCTCTATATTAATGGACAATCCTCCTATGGAGAACGT
ATCAGTGCTGTGGAAGAGAGACTCTACCGGGGAGGGTCCGGAGCTCCCCC
CGCCCCAAGGCTGTGCTTCAGACGGTGACAATGCCGTGTGCCTAGTACCT
GGCGCCACGTCAAAGTATGTATTCCGAAATAACAGCAGATAGAAAAACGG
ACACATACAAGACTTAGAGTTGTATGAAAATATCAGTAATTGACAGTAAA
TCGCTGTATGCAACACACCATACTGTAATATTCACAAGTAATTTTTGCCT
CCAAACGTTGGTATCAGGCCGTTACAAAGATATCTGAGCACTATCTTTGA
AAGTATTTGCCTGAAGAAGTGTATATAAAAATGTATAAAACGTATCATAA
CCTTTTTTCACAAAGATTATCTCAAACACGAAGTTTGTAGACGTTCGTAA
AGATAAAGTATTTGCTACTTTGTAAGAAAGAAAAAAGTCAGAGTTAACAA
AAGATGCATGCTTTTTAGCAAAATTGTGGAGCATTGTGAAGGGGCGTGTC
AGGCCCAGACTGGTCCATGAATAGACCTGGCACAAACGGACGGTTTGTCT
ACAGCAAACATGTTCTTTGGTTCAAAGGTCCAAAGATCAGTTATAGGGCA
TAGGGCTTTTCATATGTTTAACCCGCAAACACCCGAACCTATTTTTGTGA
CTAAAATGACTGAACGGGGTCAAAAATGACCCCAAAATATTTTGTTCAGT
ACTAGTAAAACCCCCCTTTTCACTTTTTTCGCTGATTGTTATCCGTACAT
TGCTTCATCAATGTAAGAGGAATGTTTTGGCATGTTTTGGTATGAATAAT
TCCCGTTCATTATCATAATTTATGCAAAAAGATCAGAAGGACCACGCCTT
GAACTATTCCTATTTAGACCGGGAGGGGATTTTTTAAGCCAACTCCAAAT
TTCATGTTGCATGAACGGCTTACGCGAGAGCCACCAAACTTGGTAACTTC
TAATAAAATGTCCTTAACAAAAATTTCAAATTAATAAAGTAAGTTCATCG
TTTTTTGTGTTGCCATGGCAACGGGTTTTTGACTGGCATGTTTTACAAAA
TCTTCTAATTTCAGTTCAAACAATGACGTTTCAAGGCTCTGTTGGTACGC
CAAATTTATTTTTTATCATCTTATGTAATCCAATGTAACTTTTATGATTT
AACATTGATATTTTAAGCTGATTTGATTACGTCATCGGTCAAAATCCAAG
ATGGCGGATAGAATCACATAAAGTATGTCATAATTACGTCACATTACGTC
ATTATGACATAAAATTTGTTATGGTAATATTGATTCACATGTGCATCATC
CTCTGAAAATTTGGTGGTCATACAATAAGTAGTTTAGGAGTTACAGAGGG
CAGGTCTCAAAAACAGCACATTATTTTTGCTGTGGTCAAAAATGACCTCA
GTGGACTCAACACAGACTTTCCTATATAATGTCAAAAGTATTGTGCCGAC
CTTCCTAGAAAATTAGGAGAGGTTAGAAAAGATGTCTACTGACAAAGTGA
CGGAAGGAATTTTTTTTCAAATCAAACATGTTCAAGTAGCACGTCAAAAT
CCACGCCTGGGGTCAAAAATGACCCCGTTCGGGAGTTTGAGGGTTAAGCT
ATACGATAACAGCATCCACACTACTTTCTCATTAGGCATGTTGATTAGTG
ATCATGGAAGAGTGAACAATCGGAGTCAGCTCACAAAAAAGTCTCAATGG
TGTCGTTAACTGGGCATGAACGAGAATTAGCATACAACAGAGAACAACAG
TGCCCCTTCCCTTGAAAACATGTTGTTTCAGCCTAGTAGAGCGCTTCCTG
GTTTATGTCAGGTAACGTAGCAGATAATAGATATCACAGCCTTATATCTT
TAGTTGGTACGTAAAACTCACAAAAGACTTCCTGCTAACAATGACGCGGA
TATTGATGGATGATGCGAACTGTCACGCTTTGAAAGTTTGATGATGATAC
TCAGATATAACGTTGGGTAACATAAATTCGCCATTTTTCCGATAATGGTT
GACTGAAATCAATCTAGCAGAATAATAAACCATCCTTTTTTTCTATTATT
CTGTCAGTATCATGTACTATCTTTGCACTAATCATATATATGGTAGATTT
TGTCTCTAGTCGTGCTGACACCATAATATTTCAACTTGAAACTACCGTCC
GCCGCACGCACAATTACGGTGCTGTCGGACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AAATATCGTCTTCAGTCCACTATGGCGGCGGGAAAATACACGTGCCGTAG
GTTGTAGCAACAAAGAGGAGTTTTGATGATTGATCACACTTAGANATTAG
TGATCATGGAAGAGTGAACAATCGGAGTCAGCTCACAAAAAAGTCTCAAT
GGTGTCGTTAACTGGGCATGAACGAGAATTAGCATACAACAGAGAACAAC
AGTGCCCCTTCCCTTGAAAACATGTTGTTTCAGCCTAGTAGAGCGCTTCC
TGGTTTATGTCAGGTAACGTAGCAGATAATAGATATCACAGCCTTATATC
TTTAGTTGGTACGTAAAACTCACAAAAGACTTCCTGCTAACAATGACGCG
GATATTGATGGATGATGCGAACTGTCACGCTTTGAAAGTTTGATGATGAT
ACTCAGATATAACGTTGGGTAACATAAATTCGCCATTTTTCCGATAATGG
TTGACTGAAATCAATCTAGCAGAATAATAAACCATCCTTTTTTTCTATTA
TTCTGTCAGTATCATGTACTATCTTTGCACTAATCATATATATGGTAGAT
TTTGTCTCTAGTCGTGCTGACACCATAATATTTCAACTTGAAACTACCGT
CCGCCGCACGCACAATGACGGTGCTGTCGGACAGGGGTGAACATTAATTC
GGGAGAGAAGATTCGTCTTGAATATCTTACCGCTAATTACATTNGAATAA
CAATTATACGCCAAATAACAGAGTCAAGCAACTGGATACAATTTGAAAAC
TTTCACATTCTATCAAGTTCCTTTAGTAACTGTTATTTGGCGAAAGCTAA
ATTACCTGGATTTGTAACCTTCATCAACAAATAAATAAAAGTACGTATAT
GATGATCTCAGGAACTGTTGGCGTGCTAAATTTATACATAAATGCCAAAA
TAAAGAATAAACTTGTTTTCTAATTTCACAGAGGTATAAGATGTTCAATT
TCTTGTTTTCTTCCTGTTACCAGTGAGGTAGGTTTCGAAGCGTCTACTGG
TGACCTTGTCTTCGCCGATAAGGAGCTCCGTGACCCCACCGTTCCTGTGA
TAGCGCTGGGCGGTCTGACCTTCTCCATGGACAAGGGACACTTACAGTGC
CGGATTCCCAACGGGACGGTGTGTGGTAAATCCATACCACTCGAGGACTT
CCCCGGAGTTTACAAGTAGGGCGAAACGTTGTTTTTAGCACATCAATCTT
CAAGGAATGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATGAATGGT
TCATGTTATAAACATAAAACTTTGAATTGCGATACATTCATTGGAGTTGC
AGTTTGACCGAATGACATTCAGTTGGATAGAAAGAATTGCGCTATTGGTA
AACAAACAATGTCGCTCGGAAACTTGCTGCTGCATTGAAATAGCTATGGC
AGATTACTGACTCCGTTTTATATAAAGGAATAGGTGGTATGTAAAACTAA
CAGAAGACTGCTGTTTTAACAGTTTCTAAACATTTGTGATAGTTATACAG
TAGTTACTGGCACGCAGCAGTTAGCACGTTTACACATTGGGGTGACAATT
GCATATATTCCGTAAACTTTCAGAATCATTATGGTTATTTTCCTTGGAGG
GGATATTGAAATACTCCCAACTTGGTGCATTCTACACGTAACGTAACATG
ACCTATTTACGTGCGGGAGTAGTTTACGTCCAAATTGGGTCATGTCCACA
TGTCGCGGTGTATTATGCCAAAGCCTGTTCTCATGAGCAACAAAGAACGT
CATAAGTATGATCCTCAGCCATCTCTCTCTATTATACAAAACATTTAAAA
GGGTTTACGTCGAGCGACATAACAGAATAAGCTCCTGAACCAGTAACAAC
AAGTTGCACGGAAGCGTCATACATGACGCATTTCATATGTAATTCGACAC
CGCGTATTCCATCATGTTTTTCTAAGTTACACGATAGCTAGTATCTTTTA
AAAGTAGCTGACGTTAAACCTTTCTTTGATATGCAGACTATCCATGGTGA
TTCGAGGTTTGAAACTCTTGCCAGTTTTAGGAAGGTTTGATACAACCAAG
CGACCCCCGCTCAGATGATACATTTTTGTACGACATAACATCATGGCCAT
GCGTTTATCACGTGAACGCCACGTGCTGCCGATTTCGGGCAAATTCACAA
TACAAAAATTGTTTTCTTCCATCGCGTCGGGCAAGCGGACGGACAAACAT
AGTGACTTTACTGTCATTTGTCTTTAGACTACTTTCGACAGTAACTGTGC
ATTTTTTTTCCGGTCTATGTTCTTCAAGCATAGCGCTAGAAGGGAAAATA
CTAAGGTGGACGATAAAGGGTAAGCCTAGCACAATTCTACACCATATACC
CCAGTATAAATATATGCTCGTACGGCGTTAAACAGGCGGAGAAAAACTTA
CAGACCATGCATTTTCTTGTTAGAAGAGCTGATATTTCTACCCATGGGTT
AAACATTTGGCTCTGTCCGCGCGGTTTTAGGATAAATAACGTTTTGAATA
AATCGGACGTAAACTGGTCATGTTAAGTTAGGTGGAAGACGCTAATCCAT
GTGTTATGCTGGTATGACAAAACGTCTTGTCAATTTCTTTGCACACTTGA
TTGAGTGCAAAGTGAGTGCAACACTGCTGAGACTTCTTTGCCAATTACCC
GTCAAGATGTCTAAGTCTAAGATCGTCCCATATGTGCAGAATTGTTTATA
ATCATCCCGCAAAGGTTTAGACCATGACGTCCACGTTGACCAATGAGTAA
AAGACAGATGTCACGTTTTATAAAGCATAACGTACATTTTCTCACATAAG
CAACTTTTTATTAGCCCCCAAGGACCAATTAAACTGCTTCCTTAAAACTG
GCCATGAAACATACGCAGTTTTAAATCAGCAGGGTATTTCAAATGCTTCT
GTAGTTCCATTTGCATCCTCTACTAGACACAGGTGACTTTTTTGTTCCTT
GACAGCTTGGTGGTTTCTGATGACGGATTTCTTCTTATAACTGTACCCAT
CTGGGGGCTTCTCGTCGTATACCTTACCGGTAAGTGTCCCATCTGACCTA
CATGTTAAGAAATATGGGTGTACATATATATATAAAGATTAATCAGGTCA
ATGTTTTTCATATGTTGACGAAGATAAAGAACGATGAGCTTATAGTGTCT
CGGTAGACCTATCCTTACATATCCCTCATCCTGTCATCATAAATGAAGTT
TACGATCAATCACGCTTACCTTTTTCCAAACTACAGCTACCACTCGAGCT
GGCTTATGTAAATCTTGTTCGTTTGTTTCTTTCTTTGTTTGATCACGAAC
AGCTACTAAATTACTAGCTTTTTATATTCAACATATTGATTTGTGTGTTA
ATTCGTTATCTATGGATTCCTTCACCTAAGTTACCTTGATACCTATTTGG
TGAATGAGCTGATTGCCGAGACTGTGACATGTACAAACGTCCAAGTTCAT
TGTTCCCTCATTTAACTACAGTGAAATGGGTAACATGTTTTTCAGCCGGT
ATACCCCACGCCTCGATTTACCTGGACCAGACCGTGGCAGGAGTCAATGG
CACCTTCCTGCCGGTTGCACAGCCTGTCATGGACGGACGACGGGCGTACT
TCCTCACCAAGTTTGGTCCCTCGCACTGGGAAAAACCATACCCGGGACCG
GTAAACATCTATAACTTACAAAACAACACTAAAAATACAACTGTAACATG
CCAATTTATTTCCTGCAGCAAGTAAAGTAATGAGTTGTTAATCTTGATTA
AACTCAATTATAATACTCTCCCGTAGAAGTAGTTTAAAGCACGTATAATT
CTACTATCATCACCACCATCCAAACGGATTACCCGGTACCACTATCCGGT
ATCCAAGAGTAGCTATAGCATTTCAGGGCCAAATACTTATACAGACTATA
CAAGATATCTGATAAAGACTTCCTTCTAAAATGTCACATATATCGCGGAG
CATTGACGACAGGATATCAATCACTGTGGTGCACTGATGACGGCTATGCA
TCCAGGTAATAAGATACGCCAAACTTAGTACCTCAAGCAACTGGATAAAA
TTTTGAAACAGTGACTGATGAAAGATAGCGGATGCTGTCTGAAACGTCTG
ACTGTTTCAAAATTTTATCCAGTTGCTTGAGGAACTAATTTTGGCGTAAC
AATCACTTTATGTACGGATTCTTAAAATATCGACCAATGGAAAATTCCGA
TTCAAATTCATTAACCCAATTGTTTGTGCCTTGTTCCAGTATCCCTTGGA
GTACCGTGTGTACCGTGTGGATCTGACTACCCAGATGGCACCGCGGATGG
TCATCCGATGGTACTACCCTCTCGTGCCGAACAGCCAGGGTCGTCTGGTC
CCGAAAGAACCAGTCATCGTTGACGACTCCAACTACAATAGTGATGCTAG
TGGTGATAGTAGTGGTGATAGTAGTACTCAGGAGTACTTGAAACATGCGA
AGTGGGAATGGTTACCTGGTCTAGGTAACGATGAGCAGGTAGAGCACAGG
AAGTTGTTTGAAAGTGAATATCTGAGTAGTAGAAAGGGAAAAGGCAACGA
TCAGTCTAAGAGGGTGGGTGAGCAGACTTTGGTTGACTCCTTCTGGAATG
ATATCACAAAGTTTTTGGATCGTAGTAATGGGGAAGATCTCAAAAGTAAC
CAAAAAGATTACAAGCAAGAAAGTAAAGAGACATTTGGTTTTCGGGATAA
ACAAAATCAAGAACCGNGATGAGCAGGTAGACCACAGAAAGTTGTTTGAA
AGTGAATATTTGAGTAGTAGGGAGGGAAAAGGCAGCGATCAGTCTAAGAG
GGTGGGTGAGCAGACTTTGGTTGACTCCTTCTGGAATGATATAACAAAGT
TTTTGGATCGTAGTAATGGAGAAGATCTCAAAAGCGACCAAAAGGATAAC
AAGCAGCAAAGTAAAAGGACATTTGGTTTTCGGGATAAACAAAATCAAGA
ACCGCCCAAAAGCGACCCATTTAATATCTACCACAACCTGTTACTTGCCG
ACAACGGACGTATCTATGTTAGCTTTATAGCTAAGGACATGGGAGACGAT
CAGGCTGTCTTACCACAGTTGTTTCTATTTGAAGAAAGCCCCAAAGAAGG
AGAACCTCCAACTGTTGTAAAAACCATTTCGGATTCCGTAGCATCTCTTG
CAATGCGTCAGGAGATAAGTTACCAAGACACCGTTGAGTGTACGAAGGGT
GACACTCAGCAAAAGATTTCTACCAAAGACAAACCCTTCGGCCCCCTTCT
TGATTCTGAAGATAAGAGATATATTTGGTCACTCATGAGCAACGATGTGC
TCGTTGCATTGGACCCAGATGACTTGTCATATGCTAGAACGGGAAATTTG
TCAGAAATAATCGGCACAAAGTTAAACGTGACGTCCAAGATCATGGTCTT
GTGGTCAGGAGGTTCAACCACGAAAGCAAAAGAGATTCTGGTATTCGGTG
TCACTTTCAAAAGTCCTCCTGGATGGAGGAATATGAAAAAAGGCCAGGAG
CATTGGTCTGAACACAAAAAGTTAGAGTCAGATTCTTTGAATTATGTTGT
TGCTGTCGACCAGTACCTGAACCTCTTGTGGAAGCTAGCCGTACCCGACG
ATAGCCCAGTTGTTGGACAGATGGCAGGTTATTCTGGTCCCTCTGACGAC
GGTTTAGTCATCGCTACCAGTGCAAAGGGAACTGTCTTTGCCATCAAGGG
CTAATTGCATTGTTCTGGGACTAACAAAGAAGTCATTTGTCTTAGTACAG
TTCCTAAAAGGGGGGCTATAATTGCTTGTTTAACATACCAGGCTAGTTAT
CTCTATTGTTTACTGTATGTGGTGGTTAGAGAATCTATCCATTTCAATCG
ACTTCTAAGCAAGTTTGGCTTTTATCTAGCCGGTACAGATCCGCATGTAA
TCCTATTAGCCGATTGACGTCGTGTCAAAGCAGGCGATCAACATTTCAAA
AAACTGTCGCCTGTTTAAGAGGTAAATGTGATATGTATGGACGTTAATTC
GAACCCTTGGGCGTCATCGACAGCGTAATGATACGTTCCGAACATCCCAC
GTGGGATTCAAGCCAATTTCATAGTGATCTAGTGGCTCTACTTTGATATA
AAACATTATAAGATCAAGGCATCAAGGGCAGTAATTGTCCTGAATGAGAG
ACGCTTTATTAAGTTCATTGTTCCAATTCATTTCAATTGCTCACTTTCAA
TCAGCTAGACAAATGGCATATTGATGATTCGGTACGATGTCTACACCATA
CAAGTCAGTATGCCTACCTCGTGAAGGGTGTGCCACGACTTTCGAAAGTC
AGCAACTTTTCAACTTCTTTTTACAGAGAATTTCAGTCGTTTGCTAGCAA
AGTACTGTTTAATGCAAGATAATTAGCTATTTCTGATGTTAGACCCTTCA
GACTTATCGTGCGATCAAGCATCACATGAAACAGACCTTGACATAACGAG
ATCTTTAATAACGATATCACAGCATCAGTGCGTGGGCAACTCAAGATTAC
AGACTTAATGACGTCAAAAAATGATTGTGGCAAATCCAACCATGCATATT
CGTTCTACTTGAGTTCAATGTGCCTCAGTCTGCCATCAATCACATTATCG
TCCATAAAATCACACTTGCATTCTATATTCTCTCATTCTCGATTAGCTAT
CTTTACCTTGAGATGTCAATAATGTAGAGACAGCATCACCATGCAAGAAA
CATGAAATTACTCATAATGTTTGCGATGAAACAGAAAATATAGAAAACCC
TACGAATAGGTGTTATCTTTGTTAAGTTTCACCATCTAACAACACGCTGA
ACATACTCAGTACCCTGCTGCAAGTTACACCGCTCCAATGTCAACAGCAT
AATGTAACTGGTTAATATGCATGAAATACAACAATTAAAACTATGAACAA
ATGCTATGTATTAGTAAGATAAATCACTTGATAACATTGTAAACATAAGT
TCAACCTCATGTAATGAAATTCTTTTGATATGATTAGTGATCAATAAGTA
TGCAGTGAAGGAGTAAACGGGAGTACTCCACGGGTGTGTTATTATTCAGA
TTCATCATTTGATAAACATAGTAATATCTAACATACCACACCACAATAAC
GTCAATAGTGAATGGTTCAGACTGTCATATATGCAGATNAGTGAATGGTT
CAGGCCGTCATATATGCAGATATAGGTAGCCTAGTGTCATCCTGTTTTAG
TTCCAGGTTCTGCCTTCACCGTACTACAGACTAGGAGGTCATATATGGTA
TTTAAACACTAAACACACATATATATATATATTACAATGAGAAAAGCGTC
GCCTATGAACAGGTGATATCTGTTAACAAGTTTCATCATCTGATAGCATT
CTTTACGTACGTAGCTATTCTTAACACACTACACCACAGAACGTCAACAG
TTCAAGTTTGTAGATTTCAGTCAGCACCCGATGCTTGAATATGCTCTAAC
TGAGAACAAGAAAACACCATGAATAGCTGCTATCTTTATTATTAAGTTTC
ATCATTTGATAACATTCTGAACATAGTAGTACTCTTCTATACCACAGTGA
CATCAAGAACATGTTTTAGAGGCCATATCTGATGTTCTAACATATAAGAA
TACCTCGAGCTGGCCCAAACGCTAAGCTAAATATCATCTTCGTGTACGTT
ATAGCGTTTTGTCTTGATATTTGTGATAAGATGTATGAGCTCTATCCATC
GGGCTTGGTGCTTCTCACAGCTTCTGTTACAATGGCTCCGTTGGCAGGGT
CTCCATCCCGTCCTTTCCGGTTAGCCAATACGTCATTTCCGCCCGTCCTT
TCTGCAGAACAAATGTGTTGTTAACAACTACAGATACATTGTCTTTACAT
TAGATAGATTCCCTGCATCTGACAAGATTTAACCCAACAGCGAGCTAGTA
TGGATTTCGTTTACTGTGACAAAATTAGCAATCTTTTAAGATAGATCTGC
AAAATGGGTGCAAATCGGACGAAGAGCAAAACTTCAGTTGCTAGCTCTTC
CATGAAAACTTTACGCTAGAGAGTCTTTGGGGGCAGATTCCATAACCTTC
CGATAAGATAAAGCATGCCAACCGTTGTTACTGAGTAACATGAATTGCTT
TGCGTTCACTAAACTACACCGTGGCAACGTTAGAGAGAATGTGAAACTCC
AACAGCGGCCAGGTACCAGGTAATAGGCCACAAGGCACTTATCAACAGCA
ACGATTTATGCGTCTTTCTATAGAAAAGATCTTTCTTCCATGCGCTTTTA
GATACTCCCATATTTCAATGAATTACTAACTCACAGCCAGCTCAGAGGCT
CCATTAATTGCTTATGAATAGAAACAGAAATCTCAGAGCTGTGATNGGCT
CCCTTAATTGCTTATGAATAGAAACAGAAATCTCAGAGCTGTGATATGAT
CTTACGTAACGTCTACATAAGTCTTTACATAAGAACGTTAACAGCAAATT
TATCGTTCCTCTGAACTCGTACTTTTTTAATGTGGCCGAAAGTATCACGG
ATGGTTCCTTGGAGCTACGTTGTAATACTTTTATCAGCTAACTACTGATT
ATATTTATAATGTCTGGCACTCGAATCCACGGGGCATGTTTCTGGGGGCA
GAGCAAAAAAGGTGCCGTCGTTAGTAATCCCATCTGGTTGACCAGTAGGC
GGATGTGTGAAACCTGTCATCTTGTGGTGGGTGCACATAAAAGAGGCACT
ACAAAGATTAGCCCACTAATTGGCCCACGATCTTGTCTTATACAGTGAAG
TCTTCAAACCTTTGAATCTTCGTTCGCGAGTCGAAACCAAGCCAAGATAT
ATATGTATATGCCAATACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTTTGAATTTATGTTCGAAAAATGTACAGAGATAAGAATGCGC
GTACATCCTTATTTTAGGTATTAAACCATTGTGTCGGGACACAAGTTAAT
AAGCCCGTTGGGTGTATCTGGTTCTTTCATACTCACGTTGTGTTCGCTCA
TTGCGTCGTCCTGGATTAAGAAGGTGGGAGATAGAGGAACACGTCTATAT
CAGAGCTAGAGGGACAATAAACACACGGCCCTGAACACTGATGTGGGCAT
GGGGGTCCCTTTCAATCTTTTATATTCATATATTTTTTTATCAGCTGTTG
TAATAGATAACTTGCCTATATTCCTTGATGTTTATAAAATCGAAATACAT
TCATGAAACAGGTGTGTTACTATTCTTGGGAGTAGCATAAAAGAAAGCAA
TCATGTTGTTTGTGTGAAGTCTGAAAAGCTTGTAAATAATTGATATTAAA
AGGGTGTTTGGACATTCATGTTAAGTTAGGGATTCTACAAATGCAAGGCC
ATTTAGCATGAAAACATTTACAGTCTTTTCTTGAGCGCTCAATGTTATTC
AATGATTTCAACGATCCTTCTTCTTGCAATGGTATCCAATAAAGGACTTT
TCAATTATCTCAATAACCAATGACTTTCGGTCTCTCATCTGTTGCCCAGC
GCGCGGGTTCTGTCCGAAGGACATGGGGCCTAAGTCTCGCTTGGAGTCCC
TTCCGTATGTTAATGATGTTTTATAGAATAGTTTACCGTGAGCTCCACCT
TTCCTCTGGGCTCAATGTGATACCCAGTCATGGTCATGAGGGCTGCTCTG
GTTGTGCTGCTGATGTGGACACGATGTGCTGAAGGAAAAAAACCCAATAA
ATTGTTAACATTAGACCGATTAACACACTCACTCACTCGCTGACTCGCTC
TCAGTCTCATAGAGCTTGTTGAAAACCAGTCCATACATAACTCTGCCTCT
CCAATTCTTCATGCACCCCATAATGTCAGCAATTCATCAAAAAGCAAAAT
GATGCATCTTTATACATTATCATACACAGTGTTGCCAGAAAAGATCAACC
AATCAGGATCCTGCATTTGATAATGATTATCAGGCTGTCATACCATTGGC
CAGCAAGCCATGGTTCATAGATTTTAATGTTTGTTTTTAAAAGGTAGATT
TTTGTATAAGTTAGGTTATAGGTATCTTCTTATGTATTATTGTGTAGTCC
CTTTGTTCTTTTCTGTATGTGTTCATATGGGCCAGGTGCCTGAATTAAAT
TGAATTGAAATNAGTCAGCAATTCATCAAAAAGCAGAATGATGCATCTTT
ATACATTATCATACACCGTGTTGCCAGAAAAGATCAACCAATCAGGATCC
TGCATTTGATAATGATTATCAGGCTGTCATACCATTGGCCAGCAAGCCAT
GGTTCATAGATTTTAATGTTTGTTTTTAAAAGGTAGATTTTTGTATAAGT
TAGGTTATAGGTATCTTCTTATGTATTATTGTGTAGTCC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000618:9714..29552-

>Blg03372.1 ID=Blg03372.1|Name=Blg03372.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1902bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000618:9714..29552- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCGTTGTTGCTGTTTTTCGTCGTGCTGTCTACACCGGGGGTGTTGGC
TCAGTTTTCCATCCAGGGATGCCCCATGTGGGGCTGTAGCTCCCAGGGTA
CCTTCTCTATATTAATGGACAATCCTCCTATGGAGAACGTATCAGTGCTG
TGGAAGAGAGACTCTACCGGGGAGGGTCCGGAGCTCCCCCCGCCCCAAGG
CTGTGCTTCAGACGGTGACAATGCCGTGTGCCTAGTACCTGGCGCCACGT
CAAATGAGGTAGGTTTCGAAGCGTCTACTGGTGACCTTGTCTTCGCCGAT
AAGGAGCTCCGTGACCCCACCGTTCCTGTGATAGCGCTGGGCGGTCTGAC
CTTCTCCATGGACAAGGGACACTTACAGTGCCGGATTCCCAACGGGACGG
TGTGTGGTAAATCCATACCACTCGAGGACTTCCCCGGAGTTTACAACTTG
GTGGTTTCTGATGACGGATTTCTTCTTATAACTGTACCCATCTGGGGGCT
TCTCGTCGTATACCTTACCGCCGGTATACCCCACGCCTCGATTTACCTGG
ACCAGACCGTGGCAGGAGTCAATGGCACCTTCCTGCCGGTTGCACAGCCT
GTCATGGACGGACGACGGGCGTACTTCCTCACCAAGTTTGGTCCCTCGCA
CTGGGAAAAACCATACCCGGGACCGTATCCCTTGGAGTACCGTGTGTACC
GTGTGGATCTGACTACCCAGATGGCACCGCGGATGGTCATCCGATGGTAC
TACCCTCTCGTGCCGAACAGCCAGGGTCGTCTGGTCCCGAAAGAACCAGT
CATCGTTGACGACTCCAACTACAATAGTGATGCTAGTGGTGATAGTAGTG
GTGATAGTAGTACTCAGGAGTACTTGAAACATGCGAAGTGGGAATGGTTA
CCTGGTCTAGGTAACGATGAGCAGGTAGAGCACAGGAAGTTGTTTGAAAG
TGAATATCTGAGTAGTAGAAAGGGAAAAGGCAACGATCAGTCTAAGAGGG
TGGGTGAGCAGACTTTGGTTGACTCCTTCTGGAATGATATCACAAAGTTT
TTGGATCGTAGTAATGGGGAAGATCTCAAAAGTAACCAAAAAGATTACAA
GCAAGAAAGTAAAGAGACATTTGGTTTTCGGGATAAACAAAATCAAGAAC
CGCCCAAAAGCGACCCATTTAATATCTACCACAACCTGTTACTTGCCGAC
AACGGACGTATCTATGTTAGCTTTATAGCTAAGGACATGGGAGACGATCA
GGCTGTCTTACCACAGTTGTTTCTATTTGAAGAAAGCCCCAAAGAAGGAG
AACCTCCAACTGTTGTAAAAACCATTTCGGATTCCGTAGCATCTCTTGCA
ATGCGTCAGGAGATAAGTTACCAAGACACCGTTGAGTGTACGAAGGGTGA
CACTCAGCAAAAGATTTCTACCAAAGACAAACCCTTCGGCCCCCTTCTTG
ATTCTGAAGATAAGAGATATATTTGGTCACTCATGAGCAACGATGTGCTC
GTTGCATTGGACCCAGATGACTTGTCATATGCTAGAACGGGAAATTTGTC
AGAAATAATCGGCACAAAGTTAAACGTGACGTCCAAGATCATGGTCTTGT
GGTCAGGAGGTTCAACCACGAAAGCAAAAGAGATTCTGGTATTCGGTGTC
ACTTTCAAAAGTCCTCCTGGATGGAGGAATATGAAAAAAGGCCAGGAGCA
TTGGTCTGAACACAAAAAGTTAGAGTCAGATTCTTTGAATTATGTTGTTG
CTGTCGACCAGTACCTGAACCTCTTGTGGAAGCTAGCCGTACCCGACGAT
AGCCCAGTTGTTGGACAGATGGCAGGTTATTCTGGTCCCTCTGACGACGG
TTTAGTCATCGCTACCAGTGCAAAGGGAACTGTCTTTGCCATCAAGGGCT
AA

Gene-mRNA-Prot

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Blg03372.1	Blg03372.1-protein	Branchiostoma lanceolatum	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:29239..29552	Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:29239..29552	Branchiostoma lanceolatum	exon
Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:18888..19079	Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:18888..19079	Branchiostoma lanceolatum	exon
Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:17024..17097	Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:17024..17097	Branchiostoma lanceolatum	exon
Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:16403..16557	Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:16403..16557	Branchiostoma lanceolatum	exon
Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:15371..15813	Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:15371..15813	Branchiostoma lanceolatum	exon
Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:9714..15132	Blg03372.1-exon-Sc0000618-1570713199:9714..15132	Branchiostoma lanceolatum	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
Sc0000618	genome	Sc0000618:9714..29552 -

Properties


Property Name	Value
GeneID	Blg03372

You are here

Blg03372.1 (mRNA) - B. lanceolatum