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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000020:152110..161015- Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Blg03292.0 ID=Blg03292.0|Name=Blg03292.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=8906bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:152110..161015- (Branchiostoma lanceolatum)
GTTTCTGAGACTGTTTTATCCAGCCGAACCATGTGACATCAGACAGAGGA
GGCGTGATTGGCCGACGTGGACGCCCAGTCGGCAGTATTTAGATGGCTAC
CTCAAGTTTATGGCTGTTCCAAAATGGACTTTTCCTTTATGCAGGTTAAT
ACTGGTTAGGTTTATACATTATTTCTATAATTGGGAGTGGCATTGTTTTT
TTAAACAGTTTTGAAAGAGATTTTTATCAATCTGCTGAACAATGATGACA
GAAAAGATTGATGGAAAAAATGTGTCAATTTTTGAGCTGTATGTATTTTT
GATATCATACCCAGGCCATGATATCCTTCAATACAGGTTTTCAGACAAGT
CCTTACTTTATGGTATGGCCTGGGCTTCCCTAGTTCGATTTGAACAATTT
AAGCTCGCTTTGAGTGCGCCGGTTGTGCCCGAAAATTCAAATACCTGTTT
CGGACGTTGAAATTGATGTTGTTACAATTTTTTTTTCGAAGACACAAAAC
TCTCTCATCTTCTGGCGCATTTCACATTAAATGTGTTTTTTTTTTGGTGG
GTATGACTTAATTAAAACACAACACGGTGTATGCCGTGTCACCCTCGGCA
CCACTCCTCTCGTGGTCAGACCGGTTCCTCAGGCAATACGGAATGCCGTA
AAATTCCTATTAACGTACGCACCCCTCCTAACGTACGCACCCCCGATTTG
GGGACGATTGCGGGCCAGACTCAGTGAGTTGAAACGTTCAGGGGAAAAAC
CCTCCTAACGTACGCACCCCCTCCCCAGCATTTCGGTGGATTATGGATTT
AAGTTAGAGGTTGACATGATCGTCCTTCCGATGATGTTTACCGACTTAAA
GGGTTACTGAGAAAATATTTCTGGGTAGAAAATGTCAAACAATTTAGATA
TATGTGTTATTTATTATTTATTACTGATTGATTGTGTGGAAGCATTCCAC
ACTTCATTTGCATGAAGATGTACCGTACTCATATGCAATTTTTACGAGGA
AGAACCCCTCCTAAGGTACGCACCCCGACTTTGGTGTCGGCCTGGAGCAC
CTGCTTGCGACTTGAAAAGTTTTAAAAGTGCGTATGTAAATAGGGATTTT
ACTGTGCACCGTGTTGTATTCTATATATACACACGAACCACACTACTTGC
TATTAAAAGGAAGCAAGTTGGTATGGCTTTAGGTAGAGTTTTTAAAGGCA
ACCAAAACAATATTAGGGCCAAAAAATGGAAATAAAGAAAATGCTGATCT
TTATGGTAGTGACATTTACTAACACTGTTTAGCACGTTTGCGTAATAACT
TCATACTTTGAGCATTTTAAAACGTCTCAAAAACGTGCCATATGATGATT
TCCTTTAGTTAGTTTTGCGAGCCTACAAAAACCTCCCGCGATGATTTTCA
GTGAGTTCTCACATCACAACGACGTCACATTTTTGCATTACGGATGTCGC
TATACATTGTGATAGTGTTGTTTGAACTAATCATGTATAGAAATGACTAA
ATAAATTGACTTTTCGGGCCCTAATATTGCTTAGGTTTCCTTTAAGTTGA
AAATTGCTTTGGTTTCCTTTAAGTTGTTTCGTTGTCTTTCCTCCCTGTAG
GTAACCCCAAGGTTCCAGCCATCCTGGATGCTCCACTGTTAAAGCAGGAA
ACTCCATCCAAGTTCCCAGTCATAGTTTTTTCCCACGGTCTGGGTGGACA
GAGAACAACATACACTGTTATATGTTCAGAGATGGCGTCTAGGGGATATC
TTGTTGCTTCTATTGAGCACAGGTGTGTGATTGTTTGTTTGTTTGTTTGT
TTGTTTTTGTTTGTTTTAATCAGATCTCCATTAGTGTTCAATTTTCACAA
TTTCTACACTTTTCTTCGACCGTTGTGGTCGGAGATCGAGCGTCACAGGA
AAAATCACCACAAGTGAACAAACTTCAGAACGTCGCGCGTTCGATCGCGT
GTTCGGTGGTTCATCGGAATGTTGGACAAAATGGCGGGCGAGTCAAGCGG
TGGTGGGGATTGCATATATAATTTTTTTTTCAAGACGTTGGCTAAGGTAT
ATTCAACTAATGATATAGAAAGATAACCAAAAACAGCGAATTTTGTTTTA
TGTTCTGCCACAGTTCCGGTTACAATACATCCCTTTAAGGTCTAAGGAAA
AATCAAGTATTTGCAGTACTAGTGTTTTAAATTTAAAACCGCAAAATAAA
ACTACCACAAAAGTTGATGAATCTACAGTATATCTATATCCACTGTTTCC
CTATTTCTACAGAGATGGCTCAGCTTCTGCAACATATGTGACCAGGCAGG
ATGATGATGGGAAGACTCAAACAGTAGAGTGGATCCCGATGACACCTAAA
CCAGAGGGGGACGAGTATCCAGTCAGGAACAAACAGGTAGGGATGGTCTC
AAGTTCACATGTTGTTTCAAAACAAACTTCATTTTGAGCTCAGCCATTTC
AGTCATGTGCATGAAGTGGTGGTGAATTACTCATTCCAAGGAGGTCTCCC
CATAAATTCCTTGCTTATTCCTAAAGTGTTGCATCTATGAATAGTTTCAT
GAGGTTTGTAGATAGCAGGAAGTTTAGTGAAGTGTGCTTAGTTCAGTCAA
TAGCGGCCCTGCTTCTAGAACTAGAAGCCGTGAGCTCGACTGAGGCTGTG
TCATTCACCCAACATGTACGCAACCGGAAAGGGTGGCAGTCCTTAGGACG
GGCTGTTAAGCCAGGGCCCGCTGTTCATTGTAGTTGTAGAAAAAAGTAGG
GGGATTTCCGTGGTACAACGAACCTGTAGATACAATGCATGCTGTCTTCT
CTAACTCTTCAGTGAGTTAAACTGGATTGATATCACTTTGAAAATTCGCT
CTTTCACTTTCAATACATTTGAATAGGTGGTAGATTTCTCTGTCACACAA
CAAAAAGGAATTTACCCTCCAAAGTTTTGTCAGTCTGTTTAATACTTTTC
CCAGGGCAATAGTTACATTTGGGACCGCATGCTTATAGCTACCTTGCCAT
CTGTCCAGTCATTATTGCTGTAAGAAAGGTAACAGAGGCACTATGGACAT
GATGGTAGGTAAGACCTATGGAAAAAAATGTTGCGTTTCTAGTTACCCAA
CTGACCATAGCAAAAAAACTGGTGACCCTACATTTTTTAGGGGTTTGACC
GCTAGCAAGGTGCATAAGATTTTCGATCTGACATCTGAGTGATGAAAATT
CAAACTAGAATCCAACAAATCTTTCACACATTCTTCCAGACTTCCTGTTT
TTCATACTTTATTAACAGATCGTCTAGTTGATGGAAGGAATGTGTAAATA
TTGTACTTCCTGTAGTTTATCAATATCCTTGTGCTTATGTTTTCACAATG
CACAATATGATTTTGAAAACTACCAATGTACAGATGCATTCATGTTTTGC
AATACTATATTTCTTGGATCAAAATCTAAAAAAGAAAAAATAGAATCCCT
ACCTTAATAGCTACCGACCCTAATTTTTTTAGTACACAGTAACCAGAAAC
ACAGCAGTTTTTCTTAGGCCTTTTTGGTTGTGTAACAGAGAACTTTGTCA
TATCACCTTTACACCCTTACATTATGATGCTTGTGCCACAGGTTCACCAG
CGAGCGGATGAGTTGGGTCACATGTTGGACCTCCTCGTAACGATGGACCA
GGGTAGTAACATCAACAACTTGTGCAAGACAGGCATGGACCTATCACAGT
TCAAGGTTAGGGAATTTTGTGCTTGAACTGCTTTGAGTTTTGCTTTCAGA
AACCTTTTGTCTCTTATATATGCCGTAAGTTGCAAAAAGATATTTCTGAA
AACGGATACTAATGTCAAAGAATGCCAAAGTCAAAGAAGAAGATGTGAAT
GGAAAAAAATGAAGAATCATTAATTGGTATGCCATTCTCTGTGTGTTGAG
TAATTTGTTCAACCTTGTTGACCATGTAAATTTCATAATGAAGGTAACGT
TTTTTTTGCCAAACTTTTTTTTGACAAACCTTTTTTTTTATTTGCACGCT
CGCATCAGTTTTGGGGTTCCCGGAGGATGTCATCCATATAATCAAATCAA
CATGGCCTAAGGTGATTTTTGTTAGGATACACTGTTAGGTTTTAGATGAT
GTTTGACAGTATTGTATCCACCAATCAGAATGTGTGATTTAAGAATGTAC
CATTTCACAAGGGGTAATAAATTTCTGATATTTCTTACAGGACAAACTGG
ACTTGGACAGGGTTGCAGCTATGGGCCACTCCTTTGGTGGTGCCAGTTCC
CTTGTTTCTCTCTACAGAGACCCCAGGTTGAAGTAAGTTACACTTGTGGT
CATGTATGTCTTTACGTTGTATTGCTGCATACAGTGAAAATGTAATTACA
TATGTCATATTAGTTGTATAACTTTTACAAAAGGACGAAGTATTTTTTAA
ATTTGCTTTTGGACAGACAGGGACAATGTTACTCAAGTTAATGATTTATT
TCAACAATGCCACATGTAGCAAACAATACGGTATCTGTATCTATATAGCC
AGTATAACCGCCATTAGGCATAACACACCAGCTTTGCAGGCACGTGGCGC
GGCAGCAGCTGGTTATATTACACCGAACGGTCTGTTACACCTAGTCTTTG
CACATCTGAATGCAACCGTTCTTTAAAGCTACTTAGTGAGGATGCTCCTA
CGGTACTTGATGAAAGGTAGTCCCATAGACTTTTTGAGGCCATCGGGGCA
GTGGGTCCAACCCTCTCCTTCCACTGCCTTTTAGTAGTTTTACCTCCCCA
ACCGAAGTCAGGTACCTATTTTTACACCTGGATGAAGTGAGGAAAGTATT
TGTTGAGTTGCCTCCAAGTCTGGCATAGAGGTTTTAGCCATTGGCATTTA
GGGGGTGATTTTCAATACCTTACTGTTGTTGTTATTGGATAGGCCGAAAA
CTCGCTCTTCGCAGCCAAGGGCTGAATTGCGAGGAGTGCACAATTGGCGG
GGCTGAATCGCAAGGGTGTCTAGCGACTGCCATTCGGCGCGCAAGTGACC
TCAATACGACAATTGCCCCATGTGCGGCCATATAGGACTTAAGGTTTTCA
ACAACTCACACCGGAATGGACCTCTTCTCTTTTTGATAAGTGCGATGGGT
TCTTTTCTTATTTTTTCTATTTCTATTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTT
TTTTTTATTGCATTTTCACATTAACATGAACAAAACAATATGCGAAGAAC
AGAATAACATACTATAAAGAACATAAATACATAAATACCACGGATCCATG
GAACACAAAAAGACGTCAACATAATATATAAGCAGAAAGTGCGGTGGGTT
CTTTAACGTGCCCGAGGTGTGGCTCTCCTCAAACACGGAACCTCCATTTA
AGGTCCTATCCGAGGGATGTCCCTAACTAAGCTAGGTACTCACTTAGTAA
AGTGAGCACAGTCGTGTAAAGTGCCTTTTTCAAGGGCACAAGATCGGGGC
ATATCGGTGGTTTCGAACCCGGGACCTCTCGGTTGTGGGCGAAACACCCT
ACCGATTGCGCCACACAATGTCCAATAGTCAGGCTATGCTAGTCACAACG
GGCATACAAGATGATGATCTGCTGTGAACTGAGTTGTGATGATGACATTG
TACCTTGTTCCCTAGATGTGCAGTTATACTGGATGGCTGGATGTTACCCG
TCGACAGAGAGATGTACCCACAGATCAGCCAACCAATCCTCTTTATCAAC
ACGGAGGCCTTCCATTGGCCGGGGAACATCGTACGCATGAACAGACTCAT
GGGAATGGACGGGGTGGACCGTAAGATGATCACGATAAAGTGGGTGAATT
TTCAACAAACAATTATCTATTTCTGTGGTAGTTTATGATGTAGAGAAATT
ATCTTGAATATTTGGTTGCACGTACATTTGCAGTTGTAAATTGATTTGGT
TTGAACTGTCTAGAATACACATCTGAGTTGTTTCAAGTGTAAAATGGTAT
GTGATTGTTGAACTTAAGTTTAATTTCTTCATACAGAAGAAAGCAACAGA
CTGGAATTTAAGCCATTTTTGTTTTATATCGGGTATATGTATATAAATAT
TATTGGTGTACTGACCATACCCATCAAACTAATGTAATTGCCATTACAGT
GGTGACCATGGTATGACATTGGGACTAATCTGCCTGACCGTTAACAATAT
TGCATGAAATATGCATTCACTTAAAGGAACATTTGCAGACTTTGAGGTTT
TCTGCCATAACACTTTCTACAAATGACTATTGACTATAAATGCAAGTCTG
GTCAATACCTGGTCAAACTCACTGTTCAAATATTTGATACACATTTGATA
ATTCACATTATATCATACCTGGGCCACGAAAACATTTGATACGGGTGTTC
CATACCATAGAATATTTAGAATGCATTTCGAGTGTGCCAAGTGCACCGCT
GTCGAAAATTCGAATACTGAATTCAGACGTTGGCTTGTGCGGCTGTTACA
ATTTTTTGTTCGAGGACGCCAACTTTTCTCAATTTCTGGCGCATTTTGCA
TTGATATGTGTGTTTTCTCGGGTGGGTATGACATAAATAAAATACAACAT
GGTGTATTCCGCTATTCTCCAAGCAGAGGTCGAATGGGCAGATCGTCACC
GTTTTATCATATGCCTTTTTTTTTGTAGCTAGCCCATTCTGACTAGCTAA
AAAAAAAGGCATATTTTTATTATGATAAAACGGTGACGATCTGCCCATTC
GACCTCTGCTTGGAGAGTATATTCACCCTCCATCAGGTCAAATCGGCCTA
CCGCCATAGAGCGATCCTGACCTGCGGTTGGGCTGGTACCTCGGGTGATA
CGGAATACCCTGTGTTGTATTCTATATGTAAATGAACATTGATTACATAG
AACAAAAACATGTAAGAAAGTTTTATATGTATTTGATATGTTTTCCTCTT
CCTTGACAGGGGGTCTGTTCACCAGAGTCAGTCAGACTTCACATTCCTGT
TTGGCGAGTTCTTTGGAACACGAGTCCACAGCAGGGGTCCACTAGACCCG
CATGTAGTCATAGATATCAACAATGAAGCTTCCCTGGCCTTTCTGGCTAA
ACATCTAGGTGAGTGTTCTGATTCCTATATGTTTTTGGCGATGCCTCAAG
GGCGAGCCTAATGGCATAGTATTGTATGAAGTTTGCAAGAATTCTAGAAA
TTGCATAGGAATTTGTCCACAGGAATTTGTAATCTCTGGTATGTTTGAAT
CAATTGGATGTTAGCCCCCATGAGCTCGGGAATGGTGGAAGGTGGGCCAT
CCATACACACTCACACAAACACACAAACCACAACAGAACAATACATGCTA
CTATTACATTAACACATCACCCACAACAACAACAACCGTCACCATGGCAA
TGTCTTTTTTTCCATTTGCCAATCTTGTTGTAACAGCCAGTTAATTTGTG
TGTTTGGGAGGATGCAAAATCAAGTAGGGAGGTTGGTAACAAGAATGCCT
TTACCCCTTAGATTTTGAAATGGAACAACCACAATCAACATTATCTACAA
AGCATGGTGTATACATCCTCAAGCTACTTAGTTATATAGGTTTCAAATGA
CAAATGTTTTTTACATTGGTAGCGTGTGCAGTCCAGTGGTTAGCAGCCTT
GCCTCTTGAACTAGTGGTCATGAGTTTGATCCCAACTGTGTCACTCAACC
AACTTACACGCTACCGGAAAGGGTCGCAGTCCTTTGGACAGGACGTTAAG
CCATTGTGCTTGTCGAAATGGGGAATTTCCCCGGTACGATGAACCTGTAG
ATACTGTACATAGCGTCTGTCTTCTCTGTCACGACCAGTGGAAGAATAGC
TCTCCAGTGAGCTAAACTGTATCAAGATCACTTTCACTTTGGCTTTACGC
ACTCACTGAAAGTAACATTAAGATATCAGTGCGTCCTACTGTAGATTGTA
ACTGTAGGTAAGGTACATGTGTCCTGTCTACTATCTTTTTCCATACAGTG
ATACCACCTACCTTTTTCCCTTTTTTTCAGATTTACCAGGAGGTGACTAC
AACAGTGCTTTACTGGAGGGGGAGGGGGAACATCTCATCAAGGGAACAAA
CGTCAAACTGGACCCCAGACCAGCTAAGGAGGAACAGGTGGATACAAGTG
TGCAGAAGCCGACTCCAGATGAGGCCAAGTTGTGACCTTTCTCTTCAATC
GTGTAATCTAAGGTCATTATTGCATCAAAGTTTTATGAAGAATGCTGTAT
TTCTTATATAATTTCTATACAATCCACTGTTTCTTGATATGTTATCATAA
TGATAATAATGATAATGGTTTATTGGTCAGAAATTACCTGTGCAATGGCA
GCCAGTGCTGGATTGCTGCAGGGTTTACAATCATATAATACAGAACAGAT
ACATATTTGCTCCACACTGACCACTTGTCATTATGGTCTTGTTCCTGTAT
TACTCCGAGTGGGTACCCTAAAAGAATCTGTACCCCAAAAAATGAATGGC
TGCATGAACATGTGTTTAAATCGGTGGGAAATTCCCTTTTAGCCAGCCCG
ACTGATCTCAAGTGTCAAACTGATGAAAGCTTGTTTGTAACTGAAGAAAT
CAGCAGGTAAACTTCAGCAGCCACGCGTGAGGTTGGACGTGTACACCCAC
AATATTTTAATGTTATTGATATTTCAATGAACAAAAGAAATATGTTATTT
TAATTGAAGGAAGGTGTGATCACTGACTTAACAAATTTGTAAAGACCTAC
TAACACTTTTAACAATTAGCTAGGTATATAGATACATTTGAATGATATAT
TTTTGTTTGTTTTTTCATTTCTGCATTTCTTAAAATTCATTCATTATAAA
CAAGGGGAATCATAATACTCACTCACTCACTCACTAGTAGATTGAAAATG
TAAAATCTAAAAATGTAAAAATGTAAAGTTTTTGCGTCATGTGCTTGGAA
AATTAT Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000020:152110..161015- >Blg03292.0 ID=Blg03292.0|Name=Blg03292.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1011bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:152110..161015- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGACTTTTCCTTTATGCAGGTTAATACTGGTAACCCCAAGGTTCCAGC
CATCCTGGATGCTCCACTGTTAAAGCAGGAAACTCCATCCAAGTTCCCAG
TCATAGTTTTTTCCCACGGTCTGGGTGGACAGAGAACAACATACACTGTT
ATATGTTCAGAGATGGCGTCTAGGGGATATCTTGTTGCTTCTATTGAGCA
CAGAGATGGCTCAGCTTCTGCAACATATGTGACCAGGCAGGATGATGATG
GGAAGACTCAAACAGTAGAGTGGATCCCGATGACACCTAAACCAGAGGGG
GACGAGTATCCAGTCAGGAACAAACAGGTTCACCAGCGAGCGGATGAGTT
GGGTCACATGTTGGACCTCCTCGTAACGATGGACCAGGGTAGTAACATCA
ACAACTTGTGCAAGACAGGCATGGACCTATCACAGTTCAAGGACAAACTG
GACTTGGACAGGGTTGCAGCTATGGGCCACTCCTTTGGTGGTGCCAGTTC
CCTTGTTTCTCTCTACAGAGACCCCAGGTTGAAATGTGCAGTTATACTGG
ATGGCTGGATGTTACCCGTCGACAGAGAGATGTACCCACAGATCAGCCAA
CCAATCCTCTTTATCAACACGGAGGCCTTCCATTGGCCGGGGAACATCGT
ACGCATGAACAGACTCATGGGAATGGACGGGGTGGACCGTAAGATGATCA
CGATAAAGGGGTCTGTTCACCAGAGTCAGTCAGACTTCACATTCCTGTTT
GGCGAGTTCTTTGGAACACGAGTCCACAGCAGGGGTCCACTAGACCCGCA
TGTAGTCATAGATATCAACAATGAAGCTTCCCTGGCCTTTCTGGCTAAAC
ATCTAGATTTACCAGGAGGTGACTACAACAGTGCTTTACTGGAGGGGGAG
GGGGAACATCTCATCAAGGGAACAAACGTCAAACTGGACCCCAGACCAGC
TAAGGAGGAACAGGTGGATACAAGTGTGCAGAAGCCGACTCCAGATGAGG
CCAAGTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:160862..161015 | Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:160862..161015 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:159244..159415 | Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:159244..159415 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:158630..158753 | Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:158630..158753 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:157311..157424 | Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:157311..157424 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:156734..156825 | Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:156734..156825 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:155227..155400 | Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:155227..155400 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:153958..154106 | Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:153958..154106 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:152110..153035 | Blg03292.0-exon-Sc0000020-1570713199:152110..153035 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000020 | genome | Sc0000020:152110..161015 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | Blg03292 |
|
