Blg03211.3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg03211.3
Unique NameBlg03211.3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000020:3207570..3220716+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg03211.3 ID=Blg03211.3|Name=Blg03211.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=13147bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:3207570..3220716+ (Branchiostoma lanceolatum)
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AGAGTGTATGCAAGCTATCTGATTCGGGTCTGTAGTTGCTTCAATTGTGT TGCAATGCTGCATTACGTATACTGATTGATTTTTTGCTAGATATCCATAT GCTCAAAACTCTCTGTACATACTAGACTCTACATGCACAACACAGAATTG AAACTACTATGTGTCGTTTGCACAGTTCCAAGTTTGCTGATGTTTAGCAT GATTTTTACAACGTAATTTCACTCAGGTCAAATACTGTATGTTGTAATGG AGTTTATAACTTCAGAGGGAAAGTCTTGGTTGTTTCCCTTGATGAATTTG TGTACTTTGGTAGCAGGAAAATGCCAGGTTTATGTGTATTTTCACACTTA TTAGTGATTCACACAGTTCAGCAGCTTTGAGGACTGCTTGTTAATTGCTG ACTGAAGAGTTATGAAGCACCTGAATTGTTTCATGCCTTGCTGTTAACTG ATGGAGGATAGGAAATATAGGTTGTGAAATGATTGAATAATCAACTGTTG TAATGAGTTGATTAATGCTTGTGATTAGAGCTAGAGCTAAGCCAAGGAGG AGAGACACTCGGACTTGGAATAGTAAATTTTATATTGTCAGCACTTTCTA CTATCTTTTGTGTTCAGATATTACCTGACCACAAACTTGTAAAAAGAGCA AACCTGCTTGTATTTTCTTTACACTTTTGATATGCATTTCCATACTTTTA CACAGTTTCAGTAACCTATACTGATAATAGTTGTATTTCTAGTTGTAATG CTTTACCTCTTGTTCCAATGCCCACCTATTGCAGACAGTATTGCAGTTCT CCACCTCCCTCTTCTAAACAATTGTCTTCTGGCAGTTGGCAAGTTAAATC TTGACCCTGCATGTTTAGACAAATGGTTGTGTCTATCAATTTCCTTGTCT GGACAGGCCTTTCTGACAAATCTGTTTTCACCTTTTGGTAGTGTCTTCTA TTCTAGAGGAAATAATGTTATTTTCTCAATTAAGACATTTGCCTTGACAT GTCCTTGATTTTCTTTGATCTGCAAAAAAGTATTGGTTTATGGTCTGAAA TAGATTGTATTATTGGGGGCCCAATATGTTACTCTTGTCACGTTCTTGGC AATCAGGCTGTCCCACCTAACAATAACAGTGATGGAACAAAGGAGTTATG ACCAACCGACAAAGGCAAAGACAACTGGTGTCAATCCCACACAATCTAAA CTGCCCGGCCACTTCGTACCTTGGTCCATTCACACTGGGATTAATCATGT AATTTGTTAGCACCGATGTTGTCTTGGCTATTATCACTTGGCACTGGGAT GTGGAGGTGTGAACACTAGGGGCTGTACAGTTCATTCATGGGTAGACAGA GGGTGGTCCATATGTGTCTAAATAAAGTAGTCTCCTGTCCAGGCTTTGTC TGGGCAAGGCCTTTCTTGTAAGGACAGGACCATTAGTTACAAAGGGGAGG ATTTTTATGAATGATTTATTGTTTGACACCTGAAATAATACTACCTATTG AATTACTGAAGCACTTGAAAAGTACAGGTGTGCTGTTTTGTTTGACTTAA CGCAACAACCGTACTAGAAGCTCTCTTCACGATCTTCACATTTTTGTTAC AATACCTTATCCATGCCTAAAGAGTTCAATTCTAGCATTCTAAAACTGGT GGCAAACAATAGCTGTAGGCATCAGCCATAGACTTTCTCCCCCGCTGTTA TAGTGGACTCTTCCAATTAGATCATGTGACCTAATCTGCATGAGGGGCCC ATTGTACCCTGACCAGGGCCCCCTTTTTGTTGTCCAACTGGCATTGTTGC CCTCTAGTGTGCCAGATGGCCTCAGACCTTGGTGGGAGTAGGGTGTGTTC AGGTGCATTTGAGGAGATCCAGGCCAGATTCTCACAAGTCTAGGATGGTG GTAAGTGCTCTTATTTCTAAAGATCCTCCCCAGACATATCCTTGGTGCTG CCCTTGGCATAAGATTTATGTAGGGTAGCTGATGTGAAATAGTCACGTAT CTCTAGATACATTTTCCTTTACGTCAAAGCAACTTCTCTTTCAAGGCCTT TATTTGCATAGGATTCTCTCTGCATGATTCAGATCTTGAGTTGCATTGTG TGCAAATTTTATAATCATCTCTGAAATTGATTCTTTAGTGGAAAGGCATA CAGTTTCCAGCTGCTAGTCATGGCTGTAGGTTTAGGGTGGCTAAATTTTG ATCAGCTTGTGGTGTCTTACCTTAAAATTTATCCCCAATGCCCCCCTCCC CCACTTGACAAAAGCTTCCTTACCTATATAACAAGATTTTGTGCAATTTT AGTAAAATGGGTCTATTTCATGGTCTCAAACACACATATTTTTGAAATCT GTGTCAGTTGACCCAGTCCTAATGGTGTGAGAGCAGAACTGGGAAGGCAC ATCCACATCCCCATTTTTGGAGGGAAAACGTAGCCCGTCAGCCATTGGTA ATCAAAACAGCCTCCCAAACAAAGGTCATAGCACATTCTTTGGTCTTTCT GCCCCAAAATCTACCACAGAGCCGTCCCACCTTGCATACTAATGGTGTAT TTTCCCTGTCAGACACATGCGTCATCTTACCAGGGGCACTGATAGGGAGT TTCAGTCAGTCACCAGTTTTGGAGGGAAAGACTAGGTCACGTTTCCTGCT AAACTGTGCTCACTTCACGTACATCCCTTGATCAAACAGGGGTTTTAGAC AGATTCTGAAGTACAGGGAAGGTTTTTCTGTTGTAGTATGTCAGGACAGG GGTGTCTGAGTTTCTCAAGGTTGATAATTTGTGACCAGGAGTCCGGATGT TGTCCTGTTTTGTGTTGGGCAGACAGTTTCCGGGACGTCCCGTTTCCCTC CAAAATTTACATAAGGGGGGTAAATACACCAAGATTAGCCATTTGTCGCT AGGTGTGCCATTTGGAAAAGGTCTGTATGATTTTTTGTATGATTATCAAG CCTATGTGAACATTTTTTTGCAGAAGATAGGGGAAATTGCTGATTTTAGG CAGACTTTTGTCTTTGAGGGAGGGGGGCAAATGATTCACTGATGACATGA TACCTTGCCTTGGGCCATAGAAGAGTTGATTACTGTGTAAGCAAATTGAC TGCATGGCTGTTGTTACATCGAAGTTCCTCATTAAACTAGGGAAATTGAA AAGTATTTCTTTGTTAGTTTTCATGACAGGAAATGATTCGTTAATTATCA CAAATTAATTGGAAAAGGAATAGTTTTCATAGAGTGATAGACTCTTTTCT TCAGATTCTTACCTTATTCCAAAATACAATTTTCAATACATATGTTGACT GTAAGAAAATGATAGATACAATGATTTAGCTGAATCGGTGTGATTATTTG TCCCCTTTGATTTGTAGGTGTTGGATGTCTCTTAACCATTGACACACAAT TTGTTTGTATCTCCGGTTGTGCATATTTGAGAGCCTCGTTTATTTTCCTT TTTAATTCAAACCTACACTGTAGTGCAAAAGTAGACATGTTGTGCTTGCA TTCACCAGTGAAAGGAAGCTACAAGAAACATAGAAACATTTGTTATTTCT AGTAATAATCTGGCTGTGAAAAGACTGTTAGTGTTGATTGCCATGCTCTG TCTGTAGATTTTAGTACTTGCCTGTATTTTCTTTGCTTATTTACTGTCAA TGTACTCGTATTCTTATGTAAAATGTTGGTGACAGGTGTGCACATGTTAA ATAAAAGTGCTCAAAATCTATAAAACCTTCTGTATGGCAGCTATGTGTGT AGTTCAAGAAAACATTATTTGCACTTTTTTTTACACACTGCTTCCTACTA TAATTTATTGCATTTCTGCTCAGACCAAATACCAATTTTCGGGTAGCTTC CTTCCAGCTGGTCCAACACAATTGAAGTCAGAACAAAGACTTTCCTAGCC GGTTCTATCTTTGACATGTGTTCCTGGCTCTCTTTCCCATTGTGTGTGGG ACACTGACCAATTTCCCTTGGGATGGAGCCCCTTGCAAGTTGACTATTTT TGTACAATGAACAGGTGAAAAGGAAGATACAGATTTCTGTCTCAAAGTCC TGAACAACAAGGATTAAAGAAACTGAAACTTTACACGATGTTGATTGTAA AACCTGATAGTGGTTTTGTCCTTTGTTTTTTTGTGAAGATTTTAGCTCCA TGCTAAAGAGCAGCTGCCATTGTGGATACAGATTTTCTCTTAAGAATATT AAAGTTTTCTTTTTACACAACTAGTCACTTCTTACTTGGTGACGTTTCGG TGTTTGTCAGACACCTTGTTCTACCAACCTGATGAAATTGTTTTCGGAAC ATTTTCTTTTTGTCTGTGATACATTTATTTAAAACAAACATTTTTTTCTG CTTCCCCGTGCAGCAAACAAGAAGCAGTGGAGCAGCAGTTGCCCATAACA CTCGCCTCCGCAGCCTGCGGGAGTGCAACTGTCTGAGGTCCCGGATACGC CAACTGCGGGAACAGACCCGTCGCCAAGTTTCCAGGATTTCCAGCGCGAA CAGACAAGTGCGGGCCATGGGACAGAAGGTGTCTGGCGGGGTGAAGACGG CCGGGCCAGGACGGGAGCCGTCGCTGAAGGCGCTGAACTCCGACAGGGAC TTGTTACACCCCGATATGCAGAAACCTAGCCGACTAGATATGCTCCTTGA TATGCCACAAGCGGACAGGGAAACGCAGGTCAAACACGCGTGGAACAACG AAGATCGGTCTCTGAACATTTTTGTCAAGGAAGACGACAAACTCACCTTC CACAGACACCCAGTTGCTCAGAGTACGGACTGCATTCGTGGGAAAGTTGG GTACACAAGAGGACTTCATGTATGGGAGATTCACTGGAGCACGAGACAAC GGGGGACACACGCGGTGGTAGGAGTAGCGACAGAGCACGCCGCCTTGCAT TCAGTAGGGTACCAGTCACTAGTTGGGAGCAACGCAGAGTCCTGGGGCTG GGACTTGGGAAGGAACAAGCTCTACCACGATAGTAAAAACAACCCCGGAA TCACGTATCCTAGGACATTGAAAGCGGACGAGAACTTCGTGGTACCAGAC AAGTTCCTTGTAGTTTTAGACATGGATGAGGGCACAATCAGTTTTGTAGT GGACGGACAGTTCTTGGGCATTGCCTTCCGTGGACTGAAGGGAAAGAAGT TGTACCCAATTGTCAGCGCTGTGTGGGGACATTGTGAGATCACTACCAAG TACATCGGAGGCTTGGATCGTAAGTACATTTTACTTAATCCTTTTAATTT ATGTGACATTGTTTTTACAGACACCATGTAAGTACAATGAAACCCTGTCC CATTGTTTAAAAAAATGTTCTGAAAAGTTCCAAAGTTGAAGTAAATTCTT TTGTTGTATTTTCGCGTGAAAACTATAGTAACATAGAAATTTGAGGAACA AAATGAGGAACTCAAGCTCAGATATATGAGTTTGAATACTATGATATTGA GAAAGATCCACATGGCTTCACGTTTTTGTCACACCCTGTCCATTAGTCTG GTTGATCTAAGATATACGTATGCGCATGTATATCATAAATTAGACAAACA GTGATAGATTTGCTTCTGTCTGGTGGGAAACAAGGGGCTCTCTTCAACGT GCTATGTACGTGAAACCCTCACACGTGCTCGTGGTCATGCATAATGACAG GCCCTTCAGAAAGGCCTGGTATATTTGTGGGATTACTTAGGAGATGAAGA ATTCACATGCAGGGTGCTGTGACAGGGTGGATCGAAGGGCACAGCTGAAG GGACAGCTGGGAAAATAACGGACAGGGCAGTAGGGTCAACAAAGGCCAAA CAGTTCACCTAGTGGTCCATTTGGACCTGAAACAAAAAAGCTATTTTGTA GTCATTTCATCACACTGTTTTCAGGAGAAAGGAATTCAAACTGGGTGTTT TACAGACTAGAAAAGAAAACAGTGATTCACTGGTTTTAAAGTTTATTTAG AGTATGTCGTCACTGATTTGGAATTATCTAAAGCTGAACATCTTTGTGCT GAAAACCAAGTAAAATTGATGGGAGGGTTGTAGATTTATTCAGATTACTA CAACACCTGACCCATGCTCAGTCAATGTAGGTGGGCCAAGAGTTCCATGG TCCCAAGCTGTAGAGAATCTTCTGAACATCATGAGATAGACAGCTGCAGT GACAGGTGGTGTCTTCATGTAGCTGTAGGGGTTCATCTGATTACATCTAT ATCCATTATCGCCCTATGTGGGTTCTGAACTCATCCTCTACACGCTTACC ATTATACTTAGATCTGAAAAAATTCAGTGTTTTCACATTTTTGCCAAATG TAGATTTACTTAGTAACAATAGTAATAAAAAACAGATATTAGAAAATTAG AGAAGGTGTCTCTAATATTAAAACAGATGTAGATTTTGTCAATCTAATGC AGATTATGAAAATTACAATGCAAAAAAGATCATTTTGTATCAATCAAGGT TCTATTATAAAATGTATTTCAGTAAAAACTGCACTAATGTTTGGACAACA TTTGTGTTGGTCAAAGCACTGAAAGTTTCAAATATATTCCAGCTGCAAGT TCCAAAGTTCGCTCAGTGGTAGACACTACAACAATGTACCTACTATTTAG TCTGTCCGAATTATGCTTTGCATAGCTTTTCATGGAAAGAATGATATGTC CTTGATCAAGGCCAGAGTTATAGGATGGCATTGGAACTGAAGCCTCTGTG ATGAGAGTCTCTGGAGACTGTCATGTTGATCTTGCAGCTGTCACCATAAA TTGATAATGAACAGGAGGACAGGATATTTATCTGAGAAATTTGAAATAGA GATCTGAATTATTTGTCTTACTTGTGCTATCAAAAATTCTTGTATTATGT ATTTTTGTGAGAGGGAAAATGGCATGCATCATTATTGTCGTTTATAGATT ATTGAACCACTAGAATTAGTTATGTCACTTGTGTATAATGACAAAGAAAG TGTGCAAGTGTAATTTTTACCATGTGATTGTGAATGTATTTACTTATGAT TGAATAAACAGCGACATTTCATACTTCCTTTATTAATGAAAGGGAATATC TTGCATTTTCTTGAAAATGTTGTCTTTCTAGTTACTCATGATCTGTGTTC TGTCGCCCCATAGCGGAACCCCTGCCGTTGATGGACCTTTGCAGGCGGAC CATTCGGCTTTCGCTGGGGAAAGACCGCCTGAAGGATGTGCCGAAACTCC CCCTCCCGCAAGCTCTCAAGAACTACCTGCTGTACCAATAACAGTCATGT AGCTCTTCGCGGAAGCCAGATGATGTGTAATGAGGTCAACACGCATTCGT CTCTACCACCCCTATTTTACTGGTTGACACGGGCACTTTGAAGGAAACTA GTATTTTTGAGATCATAAAATAACAACGTAGGGGTGGTAAAGAAAATGCA ATGCCAGAATAATAAGGAAATGTTAATGTCTGATCTAATATATGCCAACG TATTGCTTAAGAAGCAGTGTTAATTGTTAAGAAAAGGGTTTTCTGATCTC AAACTTGTAAAAATGATAATTTCTCGGAAGACTACATGCTTGGTACAGGT TGATTTAATTGTAAGTATTTTCAATTTTCTTTTTTATCTCTATTGTCAGC ATCATGATTTGTAGATGTACATGTACTGTTCATTATGAAATAAGGAGATC TTATAGTCTATTTTTAATTCTGCTTCAAGACCTGTCCAAAAGCATAGTTA ATTCTTAGTGTGACATGTCTGTGAGCTTGAGAATACACAGCATAAATATA ACTTGAGGGAACAGTCACTTCAAAATACCTGTACAAGATTGAAGAAATTA TGCAGAAAATGATCTTGCCTCACATAGAAGCCTACAGGCTCTAACAGTAA CACGGATCCACCTAGTAAAGCAAGTAATAGCCATTTCTGTCACTTTAAAT ATTAAATCATCTGTACCATATTGGCATTTGAATTGAGACTCTGCGCAACC CAAAGACAGTTGGTCCAAGAAAGTCAAAGATATTGTTGTATTAGCTGAAA ACATTATTTGAAGATTCTACTTTCTTAGTTATGTCTTCCTTCTTAGAATG AAAAAATGTATCTAACGAAGTCATATTTTAAATTAAGTTATAGCTCATTT TTAGGAATTAGAGCTATGTAGATAAATGAAGTTGTGTATAATACCACTTC AGAAATGGACAGAGCATTGTATTGTTATTTTTCACCATAAAGACGTCCAA AGAGAGTATGGCAATATGCAAGGATGATGATTTGAAACAGTGCTTTTGAT GCAACCTATTTTAAATCTCTGTAACGTTGTAGCGATTGCTTTTGAAGCTG GAAGGCACGATTGTACTGTTAATACAGATGTTGCTGACGTTTTAGAGAAA ATTTATAGTCGCGCAACCCTGCTTCTCTGTAACCTTTGTCTGTGTTCAAC TTAGTTGAAGCTGGACCATATAGAAATTAATTACAAGCAGAGCTCACTCA ACTATCAATGGAGATCAAGTTTGGGCATGTTTTACAAAAGACACTCAATG CATTTTAATTTAATCAGTAGTTAGGATACAAACTGTTCATTAACTACCTT CCTGTCGGTTTATATAGTACCCATTACATTTGGTGCATGTATAGACCTAT TAGTTTTACAGTGAGGTTAATGTACAGTTTATTTGAGTAGCACCACATTA ATGATGTTTTAAGCAAGATGTTGACAAAGCTGTCCTGCTTGTCAAGTGCC CAGTTTGGCCGGCAGCTTAGCTTATGCCTTGTCCAAAACTCTCCCCATCG GTGCTGATAGTTTCACCCTGTTATGTATTATATGTAGAGAAAATACTATG AACCGTTGTGTACCTGAAGCCACACAAAGCATGTTTCTACTCACACCAGT GGTTGTCTTGCCAAAAATTGCTGACATGATCGAAAATGCTTCACAAAATT CACAGCTGTACCTTTGTATCAAACCAGTCTGCTGTGATGGTATGCTTTTC CCTAGCCCCTTGTCTCCGTTGATAGCTCCTTGTAAGTTCTAGGTAAAGAA AAATGATGTATTCTACATGGCAGCCATCACAGAACAGAGATTTAGATCCT TTATGGCTACAAATGTACAAATTTAATTTCGTCCGCTTGTATGTGAATTA TACCAACGCGCTGCGCATTGTTGTAATTTCTACATTTAACTGCAGCTGTA CCTGTGTACATAGAATGAAAGTTCACTATATTCTCTTAATCACAGATGCA GTTAGAATGTTTGGAATCCGTTCATCGATTGGTTGGTGTAGTCTAATGTA GTTTAATAGTACCGTCATCACAATTGTATTGAGTCATGGCCAGTAGTGCT GAATAAAAATGTCACTTTTATCATACTCTCTTGTCTCCTGTATCTTC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000020:3207570..3220716+

>Blg03211.3 ID=Blg03211.3|Name=Blg03211.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=831bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:3207570..3220716+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGGACAGAAGGTGTCTGGCGGGGTGAAGACGGCCGGGCCAGGACGGGA
GCCGTCGCTGAAGGCGCTGAACTCCGACAGGGACTTGTTACACCCCGATA
TGCAGAAACCTAGCCGACTAGATATGCTCCTTGATATGCCACAAGCGGAC
AGGGAAACGCAGGTCAAACACGCGTGGAACAACGAAGATCGGTCTCTGAA
CATTTTTGTCAAGGAAGACGACAAACTCACCTTCCACAGACACCCAGTTG
CTCAGAGTACGGACTGCATTCGTGGGAAAGTTGGGTACACAAGAGGACTT
CATGTATGGGAGATTCACTGGAGCACGAGACAACGGGGGACACACGCGGT
GGTAGGAGTAGCGACAGAGCACGCCGCCTTGCATTCAGTAGGGTACCAGT
CACTAGTTGGGAGCAACGCAGAGTCCTGGGGCTGGGACTTGGGAAGGAAC
AAGCTCTACCACGATAGTAAAAACAACCCCGGAATCACGTATCCTAGGAC
ATTGAAAGCGGACGAGAACTTCGTGGTACCAGACAAGTTCCTTGTAGTTT
TAGACATGGATGAGGGCACAATCAGTTTTGTAGTGGACGGACAGTTCTTG
GGCATTGCCTTCCGTGGACTGAAGGGAAAGAAGTTGTACCCAATTGTCAG
CGCTGTGTGGGGACATTGTGAGATCACTACCAAGTACATCGGAGGCTTGG
ATCCGGAACCCCTGCCGTTGATGGACCTTTGCAGGCGGACCATTCGGCTT
TCGCTGGGGAAAGACCGCCTGAAGGATGTGCCGAAACTCCCCCTCCCGCA
AGCTCTCAAGAACTACCTGCTGTACCAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03211.3-exon-Sc0000020-1570713199:3207570..3208084Blg03211.3-exon-Sc0000020-1570713199:3207570..3208084Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03211.3-exon-Sc0000020-1570713199:3215733..3216588Blg03211.3-exon-Sc0000020-1570713199:3215733..3216588Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03211.3-exon-Sc0000020-1570713199:3218483..3220716Blg03211.3-exon-Sc0000020-1570713199:3218483..3220716Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03211.3Blg03211.3-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000020genomeSc0000020:3207570..3220716 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg03211