Blg03211.1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg03211.1
Unique NameBlg03211.1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000020:3209406..3220752+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg03211.1 ID=Blg03211.1|Name=Blg03211.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=11347bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:3209406..3220752+ (Branchiostoma lanceolatum)
GATACTCAAAAATAACCATCCTTGTATAAACATGCCATGATGATCTTGCG TATGTAATTAGACCCCTAAAATTGATGTGTATCTTGTTTTTCTTGGTTTG ATGTCATCTCTGTTTTAGCCTTGTCCTGTCTCTGCTGGAAATTAGCGATA TGTCCTTATATTAAGGTGCTGTTAATGGTAATTTGCATGAAGTGCGTATC TAGTTTTTTTGGTTTGACGTCATCTCTGTTTTGGCCTTGTCCCTGTCTCT ACTAAACGCAGTATGTACGTCCTTATAAATATTAACGGTGCTGTTCGGTG TAATTTGCGTGAAGTGAATATCTATTTTTCTTGGTTTGACATCATCTCTG TTTTAGCCTTGTGCATGTCTTCACTACATTGAGGTGCTGTTGGTGGGTAA GATTTGCATATATTCAGGTTATTCTTGAAGTTATGTATTCCCCTTACTTA ATCGGACTTACCTTCATTTTTATATGTTCATATCATATAACCATGTCATG ATGTCACAGTATGTTTTGATAACTTTTTGCATGATGATTTATCATTCCTG GTAGGTCATACATGACAGCTACTGCGTTCCCATGCCTACAAGCTACGGCT TCTCTGCATGGAGTGACGTTATACTGGAAATGATGTATTGTTAATGTCCT TAATCAGACGTTCATTTTTAGATGTTTTTATAACCATGTCACGATGTCTC GGGATGTTTTGTTAACTTTTTCCATGGTGATTTATCATTTCTGGTAGGTC ATACATGACAGCTACTGGGTTTTCTTACCTACAAGCTTCACCCGTCTTGT ATGAAGTGACGTTATTCTTGAAATGATATATTGCTCATTACCTCACTTAC CTTCCTATTTAGATGTTTCTATGACCATGTCACGATGTCTCAGAATGTTT TTGTAACTTTTTGTGTAGCAACTTATCATTTCTGGTCGATCATATTTGAC 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CAATTTCCTTGTCTGGACAGGCCTTTCTGACAAATCTGTTTTCACCTTTT GGTAGTGTCTTCTATTCTAGAGGAAATAATGTTATTTTCTCAATTAAGAC ATTTGCCTTGACATGTCCTTGATTTTCTTTGATCTGCAAAAAAGTATTGG TTTATGGTCTGAAATAGATTGTATTATTGGGGGCCCAATATGTTACTCTT GTCACGTTCTTGGCAATCAGGCTGTCCCACCTAACAATAACAGTGATGGA ACAAAGGAGTTATGACCAACCGACAAAGGCAAAGACAACTGGTGTCAATC CCACACAATCTAAACTGCCCGGCCACTTCGTACCTTGGTCCATTCACACT GGGATTAATCATGTAATTTGTTAGCACCGATGTTGTCTTGGCTATTATCA CTTGGCACTGGGATGTGGAGGTGTGAACACTAGGGGCTGTACAGTTCATT CATGGGTAGACAGAGGGTGGTCCATATGTGTCTAAATAAAGTAGTCTCCT GTCCAGGCTTTGTCTGGGCAAGGCCTTTCTTGTAAGGACAGGACCATTAG TTACAAAGGGGAGGATTTTTATGAATGATTTATTGTTTGACACCTGAAAT AATACTACCTATTGAATTACTGAAGCACTTGAAAAGTACAGGTGTGCTGT TTTGTTTGACTTAACGCAACAACCGTACTAGAAGCTCTCTTCACGATCTT CACATTTTTGTTACAATACCTTATCCATGCCTAAAGAGTTCAATTCTAGC ATTCTAAAACTGGTGGCAAACAATAGCTGTAGGCATCAGCCATAGACTTT CTCCCCCGCTGTTATAGTGGACTCTTCCAATTAGATCATGTGACCTAATC TGCATGAGGGGCCCATTGTACCCTGACCAGGGCCCCCTTTTTGTTGTCCA ACTGGCATTGTTGCCCTCTAGTGTGCCAGATGGCCTCAGACCTTGGTGGG AGTAGGGTGTGTTCAGGTGCATTTGAGGAGATCCAGGCCAGATTCTCACA AGTCTAGGATGGTGGTAAGTGCTCTTATTTCTAAAGATCCTCCCCAGACA TATCCTTGGTGCTGCCCTTGGCATAAGATTTATGTAGGGTAGCTGATGTG AAATAGTCACGTATCTCTAGATACATTTTCCTTTACGTCAAAGCAACTTC TCTTTCAAGGCCTTTATTTGCATAGGATTCTCTCTGCATGATTCAGATCT TGAGTTGCATTGTGTGCAAATTTTATAATCATCTCTGAAATTGATTCTTT AGTGGAAAGGCATACAGTTTCCAGCTGCTAGTCATGGCTGTAGGTTTAGG GTGGCTAAATTTTGATCAGCTTGTGGTGTCTTACCTTAAAATTTATCCCC AATGCCCCCCTCCCCCACTTGACAAAAGCTTCCTTACCTATATAACAAGA TTTTGTGCAATTTTAGTAAAATGGGTCTATTTCATGGTCTCAAACACACA TATTTTTGAAATCTGTGTCAGTTGACCCAGTCCTAATGGTGTGAGAGCAG AACTGGGAAGGCACATCCACATCCCCATTTTTGGAGGGAAAACGTAGCCC GTCAGCCATTGGTAATCAAAACAGCCTCCCAAACAAAGGTCATAGCACAT TCTTTGGTCTTTCTGCCCCAAAATCTACCACAGAGCCGTCCCACCTTGCA TACTAATGGTGTATTTTCCCTGTCAGACACATGCGTCATCTTACCAGGGG CACTGATAGGGAGTTTCAGTCAGTCACCAGTTTTGGAGGGAAAGACTAGG TCACGTTTCCTGCTAAACTGTGCTCACTTCACGTACATCCCTTGATCAAA CAGGGGTTTTAGACAGATTCTGAAGTACAGGGAAGGTTTTTCTGTTGTAG TATGTCAGGACAGGGGTGTCTGAGTTTCTCAAGGTTGATAATTTGTGACC AGGAGTCCGGATGTTGTCCTGTTTTGTGTTGGGCAGACAGTTTCCGGGAC GTCCCGTTTCCCTCCAAAATTTACATAAGGGGGGTAAATACACCAAGATT AGCCATTTGTCGCTAGGTGTGCCATTTGGAAAAGGTCTGTATGATTTTTT GTATGATTATCAAGCCTATGTGAACATTTTTTTGCAGAAGATAGGGGAAA TTGCTGATTTTAGGCAGACTTTTGTCTTTGAGGGAGGGGGGCAAATGATT CACTGATGACATGATACCTTGCCTTGGGCCATAGAAGAGTTGATTACTGT GTAAGCAAATTGACTGCATGGCTGTTGTTACATCGAAGTTCCTCATTAAA CTAGGGAAATTGAAAAGTATTTCTTTGTTAGTTTTCATGACAGGAAATGA TTCGTTAATTATCACAAATTAATTGGAAAAGGAATAGTTTTCATAGAGTG ATAGACTCTTTTCTTCAGATTCTTACCTTATTCCAAAATACAATTTTCAA TACATATGTTGACTGTAAGAAAATGATAGATACAATGATTTAGCTGAATC GGTGTGATTATTTGTCCCCTTTGATTTGTAGGTGTTGGATGTCTCTTAAC CATTGACACACAATTTGTTTGTATCTCCGGTTGTGCATATTTGAGAGCCT CGTTTATTTTCCTTTTTAATTCAAACCTACACTGTAGTGCAAAAGTAGAC ATGTTGTGCTTGCATTCACCAGTGAAAGGAAGCTACAAGAAACATAGAAA CATTTGTTATTTCTAGTAATAATCTGGCTGTGAAAAGACTGTTAGTGTTG ATTGCCATGCTCTGTCTGTAGATTTTAGTACTTGCCTGTATTTTCTTTGC TTATTTACTGTCAATGTACTCGTATTCTTATGTAAAATGTTGGTGACAGG TGTGCACATGTTAAATAAAAGTGCTCAAAATCTATAAAACCTTCTGTATG GCAGCTATGTGTGTAGTTCAAGAAAACATTATTTGCACTTTTTTTTACAC ACTGCTTCCTACTATAATTTATTGCATTTCTGCTCAGACCAAATACCAAT TTTCGGGTAGCTTCCTTCCAGCTGGTCCAACACAATTGAAGTCAGAACAA AGACTTTCCTAGCCGGTTCTATCTTTGACATGTGTTCCTGGCTCTCTTTC CCATTGTGTGTGGGACACTGACCAATTTCCCTTGGGATGGAGCCCCTTGC AAGTTGACTATTTTTGTACAATGAACAGGTGAAAAGGAAGATACAGATTT CTGTCTCAAAGTCCTGAACAACAAGGATTAAAGAAACTGAAACTTTACAC GATGTTGATTGTAAAACCTGATAGTGGTTTTGTCCTTTGTTTTTTTGTGA AGATTTTAGCTCCATGCTAAAGAGCAGCTGCCATTGTGGATACAGATTTT CTCTTAAGAATATTAAAGTTTTCTTTTTACACAACTAGTCACTTCTTACT TGGTGACGTTTCGGTGTTTGTCAGACACCTTGTTCTACCAACCTGATGAA ATTGTTTTCGGAACATTTTCTTTTTGTCTGTGATACATTTATTTAAAACA AACATTTTTTTCTGCTTCCCCGTGCAGCAAACAAGAAGCAGTGGAGCAGC AGTTGCCCATAACACTCGCCTCCGCAGCCTGCGGGAGTGCAACTGTCTGA GGTCCCGGATACGCCAACTGCGGGAACAGACCCGTCGCCAAGTTTCCAGG ATTTCCAGCGCGAACAGACAAGTGCGGGCCATGGGACAGAAGGTGTCTGG CGGGGTGAAGACGGCCGGGCCAGGACGGGAGCCGTCGCTGAAGGCGCTGA ACTCCGACAGGGACTTGTTACACCCCGATATGCAGAAACCTAGCCGACTA GATATGCTCCTTGATATGCCACAAGCGGACAGGGAAACGCAGGTCAAACA CGCGTGGAACAACGAAGATCGGTCTCTGAACATTTTTGTCAAGGAAGACG ACAAACTCACCTTCCACAGACACCCAGTTGCTCAGAGTACGGACTGCATT CGTGGGAAAGTTGGGTACACAAGAGGACTTCATGTATGGGAGATTCACTG GAGCACGAGACAACGGGGGACACACGCGGTGGTAGGAGTAGCGACAGAGC ACGCCGCCTTGCATTCAGTAGGGTACCAGTCACTAGTTGGGAGCAACGCA GAGTCCTGGGGCTGGGACTTGGGAAGGAACAAGCTCTACCACGATAGTAA AAACAACCCCGGAATCACGTATCCTAGGACATTGAAAGCGGACGAGAACT TCGTGGTACCAGACAAGTTCCTTGTAGTTTTAGACATGGATGAGGGCACA ATCAGTTTTGTAGTGGACGGACAGTTCTTGGGCATTGCCTTCCGTGGACT GAAGGGAAAGAAGTTGTACCCAATTGTCAGCGCTGTGTGGGGACATTGTG AGATCACTACCAAGTACATCGGAGGCTTGGATCGTAAGTACATTTTACTT AATCCTTTTAATTTATGTGACATTGTTTTTACAGACACCATGTAAGTACA ATGAAACCCTGTCCCATTGTTTAAAAAAATGTTCTGAAAAGTTCCAAAGT TGAAGTAAATTCTTTTGTTGTATTTTCGCGTGAAAACTATAGTAACATAG AAATTTGAGGAACAAAATGAGGAACTCAAGCTCAGATATATGAGTTTGAA TACTATGATATTGAGAAAGATCCACATGGCTTCACGTTTTTGTCACACCC TGTCCATTAGTCTGGTTGATCTAAGATATACGTATGCGCATGTATATCAT AAATTAGACAAACAGTGATAGATTTGCTTCTGTCTGGTGGGAAACAAGGG GCTCTCTTCAACGTGCTATGTACGTGAAACCCTCACACGTGCTCGTGGTC ATGCATAATGACAGGCCCTTCAGAAAGGCCTGGTATATTTGTGGGATTAC TTAGGAGATGAAGAATTCACATGCAGGGTGCTGTGACAGGGTGGATCGAA GGGCACAGCTGAAGGGACAGCTGGGAAAATAACGGACAGGGCAGTAGGGT CAACAAAGGCCAAACAGTTCACCTAGTGGTCCATTTGGACCTGAAACAAA AAAGCTATTTTGTAGTCATTTCATCACACTGTTTTCAGGAGAAAGGAATT CAAACTGGGTGTTTTACAGACTAGAAAAGAAAACAGTGATTCACTGGTTT TAAAGTTTATTTAGAGTATGTCGTCACTGATTTGGAATTATCTAAAGCTG AACATCTTTGTGCTGAAAACCAAGTAAAATTGATGGGAGGGTTGTAGATT TATTCAGATTACTACAACACCTGACCCATGCTCAGTCAATGTAGGTGGGC CAAGAGTTCCATGGTCCCAAGCTGTAGAGAATCTTCTGAACATCATGAGA TAGACAGCTGCAGTGACAGGTGGTGTCTTCATGTAGCTGTAGGGGTTCAT CTGATTACATCTATATCCATTATCGCCCTATGTGGGTTCTGAACTCATCC TCTACACGCTTACCATTATACTTAGATCTGAAAAAATTCAGTGTTTTCAC ATTTTTGCCAAATGTAGATTTACTTAGTAACAATAGTAATAAAAAACAGA TATTAGAAAATTAGAGAAGGTGTCTCTAATATTAAAACAGATGTAGATTT TGTCAATCTAATGCAGATTATGAAAATTACAATGCAAAAAAGATCATTTT GTATCAATCAAGGTTCTATTATAAAATGTATTTCAGTAAAAACTGCACTA ATGTTTGGACAACATTTGTGTTGGTCAAAGCACTGAAAGTTTCAAATATA TTCCAGCTGCAAGTTCCAAAGTTCGCTCAGTGGTAGACACTACAACAATG TACCTACTATTTAGTCTGTCCGAATTATGCTTTGCATAGCTTTTCATGGA AAGAATGATATGTCCTTGATCAAGGCCAGAGTTATAGGATGGCATTGGAA CTGAAGCCTCTGTGATGAGAGTCTCTGGAGACTGTCATGTTGATCTTGCA GCTGTCACCATAAATTGATAATGAACAGGAGGACAGGATATTTATCTGAG AAATTTGAAATAGAGATCTGAATTATTTGTCTTACTTGTGCTATCAAAAA TTCTTGTATTATGTATTTTTGTGAGAGGGAAAATGGCATGCATCATTATT GTCGTTTATAGATTATTGAACCACTAGAATTAGTTATGTCACTTGTGTAT AATGACAAAGAAAGTGTGCAAGTGTAATTTTTACCATGTGATTGTGAATG TATTTACTTATGATTGAATAAACAGCGACATTTCATACTTCCTTTATTAA TGAAAGGGAATATCTTGCATTTTCTTGAAAATGTTGTCTTTCTAGTTACT CATGATCTGTGTTCTGTCGCCCCATAGCGGAACCCCTGCCGTTGATGGAC CTTTGCAGGCGGACCATTCGGCTTTCGCTGGGGAAAGACCGCCTGAAGGA TGTGCCGAAACTCCCCCTCCCGCAAGCTCTCAAGAACTACCTGCTGTACC AATAACAGTCATGTAGCTCTTCGCGGAAGCCAGATGATGTGTAATGAGGT CAACACGCATTCGTCTCTACCACCCCTATTTTACTGGTTGACACGGGCAC TTTGAAGGAAACTAGTATTTTTGAGATCATAAAATAACAACGTAGGGGTG GTAAAGAAAATGCAATGCCAGAATAATAAGGAAATGTTAATGTCTGATCT AATATATGCCAACGTATTGCTTAAGAAGCAGTGTTAATTGTTAAGAAAAG GGTTTTCTGATCTCAAACTTGTAAAAATGATAATTTCTCGGAAGACTACA TGCTTGGTACAGGTTGATTTAATTGTAAGTATTTTCAATTTTCTTTTTTA TCTCTATTGTCAGCATCATGATTTGTAGATGTACATGTACTGTTCATTAT GAAATAAGGAGATCTTATAGTCTATTTTTAATTCTGCTTCAAGACCTGTC CAAAAGCATAGTTAATTCTTAGTGTGACATGTCTGTGAGCTTGAGAATAC ACAGCATAAATATAACTTGAGGGAACAGTCACTTCAAAATACCTGTACAA GATTGAAGAAATTATGCAGAAAATGATCTTGCCTCACATAGAAGCCTACA GGCTCTAACAGTAACACGGATCCACCTAGTAAAGCAAGTAATAGCCATTT CTGTCACTTTAAATATTAAATCATCTGTACCATATTGGCATTTGAATTGA GACTCTGCGCAACCCAAAGACAGTTGGTCCAAGAAAGTCAAAGATATTGT TGTATTAGCTGAAAACATTATTTGAAGATTCTACTTTCTTAGTTATGTCT TCCTTCTTAGAATGAAAAAATGTATCTAACGAAGTCATATTTTAAATTAA GTTATAGCTCATTTTTAGGAATTAGAGCTATGTAGATAAATGAAGTTGTG TATAATACCACTTCAGAAATGGACAGAGCATTGTATTGTTATTTTTCACC ATAAAGACGTCCAAAGAGAGTATGGCAATATGCAAGGATGATGATTTGAA ACAGTGCTTTTGATGCAACCTATTTTAAATCTCTGTAACGTTGTAGCGAT TGCTTTTGAAGCTGGAAGGCACGATTGTACTGTTAATACAGATGTTGCTG ACGTTTTAGAGAAAATTTATAGTCGCGCAACCCTGCTTCTCTGTAACCTT TGTCTGTGTTCAACTTAGTTGAAGCTGGACCATATAGAAATTAATTACAA GCAGAGCTCACTCAACTATCAATGGAGATCAAGTTTGGGCATGTTTTACA AAAGACACTCAATGCATTTTAATTTAATCAGTAGTTAGGATACAAACTGT TCATTAACTACCTTCCTGTCGGTTTATATAGTACCCATTACATTTGGTGC ATGTATAGACCTATTAGTTTTACAGTGAGGTTAATGTACAGTTTATTTGA GTAGCACCACATTAATGATGTTTTAAGCAAGATGTTGACAAAGCTGTCCT GCTTGTCAAGTGCCCAGTTTGGCCGGCAGCTTAGCTTATGCCTTGTCCAA AACTCTCCCCATCGGTGCTGATAGTTTCACCCTGTTATGTATTATATGTA GAGAAAATACTATGAACCGTTGTGTACCTGAAGCCACACAAAGCATGTTT CTACTCACACCAGTGGTTGTCTTGCCAAAAATTGCTGACATGATCGAAAA TGCTTCACAAAATTCACAGCTGTACCTTTGTATCAAACCAGTCTGCTGTG ATGGTATGCTTTTCCCTAGCCCCTTGTCTCCGTTGATAGCTCCTTGTAAG TTCTAGGTAAAGAAAAATGATGTATTCTACATGGCAGCCATCACAGAACA GAGATTTAGATCCTTTATGGCTACAAATGTACAAATTTAATTTCGTCCGC TTGTATGTGAATTATACCAACGCGCTGCGCATTGTTGTAATTTCTACATT TAACTGCAGCTGTACCTGTGTACATAGAATGAAAGTTCACTATATTCTCT TAATCACAGATGCAGTTAGAATGTTTGGAATCCGTTCATCGATTGGTTGG TGTAGTCTAATGTAGTTTAATAGTACCGTCATCACAATTGTATTGAGTCA TGGCCAGTAGTGCTGAATAAAAATGTCACTTTTATCATACTCTCTTGTCT CCTGTATCTTCTATAAGTCTGTAAGTGAGGACCATCCTATTATACCT

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000020:3209406..3220752+

>Blg03211.1 ID=Blg03211.1|Name=Blg03211.1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=990bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:3209406..3220752+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGTGCAAACAAGAAGCAGTGGAGCAGCAGTTGCCCATAACACTCGCCT
CCGCAGCCTGCGGGAGTGCAACTGTCTGAGGTCCCGGATACGCCAACTGC
GGGAACAGACCCGTCGCCAAGTTTCCAGGATTTCCAGCGCGAACAGACAA
GTGCGGGCCATGGGACAGAAGGTGTCTGGCGGGGTGAAGACGGCCGGGCC
AGGACGGGAGCCGTCGCTGAAGGCGCTGAACTCCGACAGGGACTTGTTAC
ACCCCGATATGCAGAAACCTAGCCGACTAGATATGCTCCTTGATATGCCA
CAAGCGGACAGGGAAACGCAGGTCAAACACGCGTGGAACAACGAAGATCG
GTCTCTGAACATTTTTGTCAAGGAAGACGACAAACTCACCTTCCACAGAC
ACCCAGTTGCTCAGAGTACGGACTGCATTCGTGGGAAAGTTGGGTACACA
AGAGGACTTCATGTATGGGAGATTCACTGGAGCACGAGACAACGGGGGAC
ACACGCGGTGGTAGGAGTAGCGACAGAGCACGCCGCCTTGCATTCAGTAG
GGTACCAGTCACTAGTTGGGAGCAACGCAGAGTCCTGGGGCTGGGACTTG
GGAAGGAACAAGCTCTACCACGATAGTAAAAACAACCCCGGAATCACGTA
TCCTAGGACATTGAAAGCGGACGAGAACTTCGTGGTACCAGACAAGTTCC
TTGTAGTTTTAGACATGGATGAGGGCACAATCAGTTTTGTAGTGGACGGA
CAGTTCTTGGGCATTGCCTTCCGTGGACTGAAGGGAAAGAAGTTGTACCC
AATTGTCAGCGCTGTGTGGGGACATTGTGAGATCACTACCAAGTACATCG
GAGGCTTGGATCCGGAACCCCTGCCGTTGATGGACCTTTGCAGGCGGACC
ATTCGGCTTTCGCTGGGGAAAGACCGCCTGAAGGATGTGCCGAAACTCCC
CCTCCCGCAAGCTCTCAAGAACTACCTGCTGTACCAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03211.1Blg03211.1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03211.1-exon-Sc0000020-1570713199:3209406..3213269Blg03211.1-exon-Sc0000020-1570713199:3209406..3213269Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03211.1-exon-Sc0000020-1570713199:3215733..3216588Blg03211.1-exon-Sc0000020-1570713199:3215733..3216588Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03211.1-exon-Sc0000020-1570713199:3218483..3220752Blg03211.1-exon-Sc0000020-1570713199:3218483..3220752Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000020genomeSc0000020:3209406..3220752 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg03211